ABSTRACT
Abstract: The Amazon River basin hosts the most diverse freshwater ichthyofauna in the world, and yet huge areas of the basin remain unexplored. This is the case for the upper tributaries of the rio Negro, especially those draining the Colombian territory. Here we present a list of 224 species derived from the examination of specimens collected in the Mitú region (Vaupés Department, Colombia), the middle basin of the río Vaupés. Of the species identified in our study, 10 species are recorded from Colombia for the first time, and 26 species are newly recorded from the Colombian Amazon. The number of species we present here comprise almost one-third of the known species diversity of the Colombian Amazon and nearly a tenth of the total number of those known across the entirety of the Amazon basin. The most diverse orders were Characiformes (120 species) and Siluriformes (65 species), and the remaining six orders comprised less than 20% of total species. The study area comprised blackwater systems, which are considered to be nutrient-poor environments. We discuss some ecological aspects that might explain how this highly diverse ichthyofauna originates and is maintain in less productive systems. The list presented here adds an important number of new records and complements the information derived from previous studies, carried out thus far with regards to the fish fauna of the Colombian Amazon.
Resumo: La cuenca del río Amazonas alberga la ictiofauna dulceacuícola más diversa del mundo, sin embargo, grandes áreas de la cuenca permanecen inexploradas. Este es el caso de los afluentes de la parte alta del río Negro, especialmente los sistemas que drenan el territorio colombiano. A continuación, presentamos un listado de 224 especies derivadas del análisis de especímenes recolectados en la región de Mitú, cuenca media del río Vaupés (Departamento de Vaupés, Colombia). De las especies identificadas, 10 especies se registran en Colombia por primera vez y 26 especies para la Amazonía colombiana. El número de especies que presentamos aquí comprende casi un tercio de las especies conocidas para la Amazonía colombiana y casi una décima parte del total de las conocidas para la gran cuenca del Amazonas. Los órdenes más diversos fueron Characiformes (120 especies) y Siluriformes (65 especies), y los seis órdenes restantes comprendieron menos del 20% del total de especies. El área de estudio comprende sistemas de aguas negras que se consideran ambientes poco productivos por sus bajos contenidos de nutrientes. Discutimos aquí algunos aspectos ecológicos que podrían explicar cómo esta ictiofauna tan diversa tiene su origen y es mantenida en estos sistemas poco productivos. La información derivada del presente estudio adiciona nuevos registros de especies de peces para Colombia, y complementa la información derivada de los estudios realizados a la fecha en la Amazonía colombiana.
ABSTRACT
Introduction: Seasonally dry tropical forests (SDTF) are one of the most threatened terrestrial ecosystems on the planet as a consequence of global change. They harbor high biodiversity and provide a wide range of ecosystem services; therefore, their conservation is a priority worldwide. Climate warming, as well as land use patterns, are leading to species distribution range shifts. Objective: The objective of this work was to study the current and future potential distribution of a SDTF representative tree species (Anadenanthera colubrina) in the Argentinian Sub Andean Piedmont nucleus and to assess the effects of land use and climate changes. Methods: Current and future potential distribution was modeled with Maxent, using 49 presence points and 20 variables. Climate change effects were estimated in four different temperature and carbon dioxide concentration scenarios. Land use changes were determined subtracting the deforested area until 2017 to the current and future potential distribution of the species. Results: A. colubrina current distribution represents 18 % of Northwestern Argentina. Land use changes decreased almost 25 % of it and climate change will probably cause a retraction in the East and a slight expansion towards the West and South of the current distribution. The synergistic effect of land use and climate change projected to the worst scenario would reduce 63 % of its current distribution. Conclusions: Our data demonstrate the central role of distribution range studies to assess the effects of anthropic activities. Climate change and land use change would have a negative and synergistic effect on the distribution of A. colubrina. Although a possible expansion of the Sub Andean Piedmont nucleus of SDTF would occur, this expansion may be limited by the Sub Andean mountain range that could act as an orographic barrier.
Introducción: Los Bosques Tropicales Estacionalmente Secos (BTES) son unos de los ecosistemas terrestres más amenazados del planeta como consecuencia del cambio global. Estos bosques albergan una alta biodiversidad y proporcionan una amplia gama de servicios ecosistémicos, por lo que su conservación es una prioridad a nivel mundial. El cambio climático y el cambio en los usos del suelo están afectando la distribución de las especies. Objetivo: El objetivo de este trabajo fue estudiar la distribución potencial de una especie representativa de BTES (Anadenanthera colubrina) en el núcleo del Piedemonte subandino argentino y evaluar los efectos del cambio en los usos del suelo y del cambio climático sobre su distribución. Métodos: La distribución actual y futura de A. colubrina fue modelada con Maxent, utilizando 49 puntos de presencia y 20 variables. Los efectos del cambio climático se estimaron en cuatro escenarios que difieren en los niveles de temperatura y concentración de dióxido de carbono. Los efectos del cambio en el uso del suelo se estimaron descontando el área deforestada hasta el 2017 a la distribución actual y futura de la especie. Resultados: La distribución actual de A. colubrina representa un 18 % del Noroeste Argentino. Los cambios en el uso del suelo produjeron una disminución del 25 % del área de distribución actual y el cambio climático probablemente causará una retracción al Este y una expansión hacia el oeste y sur de su distribución. El efecto sinérgico del cambio en el uso del suelo y el cambio climático podría producir una pérdida del 63 % considerando el peor escenario de cambio climático. Conclusiones: Nuestros datos demuestran el rol fundamental de los estudios de distribución para evaluar los efectos de las actividades antrópicas. Los cambios en los usos del suelo y el cambio climático podrían tener un efecto negativo y sinérgico sobre la distribución de A. colubrina. La posible expansión del núcleo Piedemonte de SDTF hacia el oeste y el sur de la región no estaría limitada por cambios en el uso del suelo, aunque las cadenas montañosas podrían actuar como barreras orográficas y limitar la expansión.
ABSTRACT
Introduction: The Black-headed Bushmaster (Lachesis melanocephala) is a large venomous snake that inhabits tropical moist forest, wet forest, montane and premontane wet forest in Southwestern Costa Rica and extreme Western Panama. Objective: We assign a neotype for the species due to the loss of the original holotype and update the information on its geographical distribution, natural history, and conservation status. Methods: To determine the conservation status of L. melanocephala, we modeled its potential distribution using the species` locality records and distribution modeling analysis implemented in MaxEnt. Based on the species' potential distribution, we evaluate the loss of its original habitat and estimate the percentage of its distribution area that is currently protected by the country's protected area system. Results: The potential distribution of the species was estimated at 10 139 km2, including areas where the species currently occurs and historical areas where the species has been registered but is nowadays considered locally extinct. About 29 % of that potential distribution overlaps with protected wild areas, so less than a third of the potential distribution of the species is under protection. Conclusions: During the last decade, accelerated habitat loss and growing evidence of declining natural populations indicate the need for urgent protective measures to prevent the extinction of this species in the foreseeable future.
Introducción: La serpiente Plato Negro (Lachesis melanocephala) es una especie venenosa de gran tamaño, endémica de los bosques lluviosos del Pacífico sur y suroeste de Costa Rica y el extremo oeste de Panamá. Objetivo: Se asigna un neotipo para la especie debido a la pérdida del holotipo original y se presentan datos actualizados de su distribución geográfica, historia natural y estado de conservación. Métodos: Para determinar el estado de conservación de L. melanocephala, reconstruimos su distribución potencial utilizando los registros de localidad de la especie y el análisis de modelado de distribución implementado en MaxEnt. En función de la distribución potencial de la especie, evaluamos la pérdida de su hábitat original y calculamos el porcentaje de su área de distribución que actualmente está protegida por el sistema de áreas protegidas del país. Resultados: La distribución potencial de la especie se estimó en 10 139 km2, incluyendo áreas donde la especie se encuentra actualmente y áreas históricas donde la especie se ha registrado, pero se considera localmente extinta. Cerca del 29 % de esa distribución potencial se traslapa con áreas silvestres protegidas, por lo que menos de una tercera parte de la distribución potencial de la especie está bajo protección. Conclusiones: La degradación acelerada de su hábitat y la disminución evidente de sus poblaciones durante la última década señalan la necesidad de tomar medidas urgentes de protección para evitar el riesgo de extinción a corto plazo o mediano plazo.
Subject(s)
Animals , Crotalinae/anatomy & histology , Costa Rica , Animal DistributionABSTRACT
ABSTRACT We present an estimation of the potential species richness of frogs, and diurnal butterflies distributed in the departments of Norte de Santander and Santander, Colombia, and analyze the implications for conservation of such high Andean species. From June 2012 to May 2016, we sampled across the Almorzadero, Santurbán and Tamá biogeographical units to gather presence data of 7 anuran species and 29 butterflies species from the superfamily Papilionoidea. We modeled the potential distribution of each species, converted every model to binary, and the sum up of unique species per cell allowed to estimate the model of potential richness, generating the total number of species for every 1 km2 cell. Every model was validated against field data, vegetation cover, and altitude. Our results suggest the existence of species' concentration zones, specifically in the places of convergence between biogeographical units; it was evident the high levels of data deficiency in some places. Finally, it was clear the importance of these zones as a continuum of biogeographic conditions to maintain the biological diversity.
RESUMEN Presentamos una estimación de la riqueza potencial y las implicaciones para la conservación de especies altoandinas de anuros y de mariposas diurnas, distribuidas en los departamentos de Norte de Santander y Santander. Durante junio de 2012 y mayo de 2016 se realizaron muestreos de campo en las unidades biogeográficas de Almorzadero, Santurbán y Tamá, para registrar los datos de presencia de siete especies de anfibios del orden Anura y 29 de mariposas de la superfamilia Papilionoidea. Realizamos modelamientos de la distribución potencial de cada especie, convertimos cada modelo en binario, y la suma de especies únicas por celda permitió estimar el modelo de riqueza potencial, obteniendo el número total de especies por cada celda de 1 km2; a su vez, los modelos fueron superpuestos sobre información de campo, cobertura vegetal y altitudinal. Nuestros resultados sugieren que existen zonas concretas de concentración de especies en las zonas de convergencia entre las unidades biogeográficas, así como zonas con vacíos de información. Resaltamos la importancia de estas zonas como un continuo de condiciones biogeográficas para mantener la diversidad.
ABSTRACT
ResumenLa distribución y abundancia de la familia Trochillidae generalmente estan influenciadas por la floración y fenología de las plantas de las que se alimentan, principalmente en bosques primarios, por lo que los cambios en la cobertura de la vegetación pueden afectar a sus poblaciones. Se analizó la distribución geográfica y se caracterizó el hábitat para 22 especies residentes de colibríes presentes en el estado de Guerrero con base en el uso de suelo y vegetación de INEGI Serie IV (2007-2010). Los modelos de distribución se generaron con ayuda del Algoritmo Genético para la Producción de Conjuntos de Reglas (GARP), usando los registros históricos de colecciones científicas y trabajo de campo (2001-2009), en combinación con variables climáticas y topográficas. De las 22 especies modeladas, seis son endémicas a México, mismo número de especies que se encuentran en alguna categoría de riesgo. La mayor concentración potencial de la riqueza (14-20 especies), endemismo (5-6 especies) y especies en riesgo de colibríes (5-6 especies) está en la provincia biótica de la Sierra Madre del Sur. No obstante, la distribución potencial de la mayor parte de los colibríes se presenta en ambientes alterados o agroecosistemas resultado de los cambios en el uso del suelo. Solo en el caso de Campylopterus hemileucurus, Lamprolaima rhami y Heliomaster longisrostris, su distribución potencial es mayor en áreas de vegetación primaria. Las áreas de mayor concentración de colibríes no corresponden con las Áreas de Importancia para la Conservación de las Aves en Guerrero, lo que confirma que pese a su diversidad y su extrema popularidad, desde la perspectiva conservacionista los colibríes han recibido relativamente poca atención.
AbstractThe distribution and abundance of species of Trochillidae family is usually influenced by the flowering and phenology of plants used as a feeding source, mainly in primary forest, so that changes in vegetation cover could impact their populations. We analyzed and characterized the geographical distribution and habitat for 22 species of resident hummingbirds in the state of Guerrero using the vegetation and the land use map of INEGI Series IV (2007-2010). Distribution models were generated with the Genetic Algorithm for Rule Set Production (GARP), using historical records of scientific collections and fieldwork (2001-2009), in combination with climatic and topographic variables. Of the 22 modeled species, six are endemic to Mexico, the same number of species found in a risk category. The highest concentration with regards to richness (14-20 species), endemism (5-6 species) and number of threatened species of hummingbirds (5-6 species) occurred in the biotic province of Sierra Madre del Sur. However, the potential distribution of most of the hummingbirds occurred in disturbed sites or agroecosystems, as a result of changes in land-use. For Campylopterus hemileucurus, Lamprolaima rhami and Heliomaster longisrostris, their potential distribution was highest in areas of primary vegetation. Areas of high hummingbirds presence do not coincide with the Important Bird Areas proposed for bird conservation in Guerrero, considering that, despite its diversity and its extreme popularity, from the conservation perspective hummingbirds have received relatively little attention. Rev. Biol. Trop. 64 (1): 363-376. Epub 2016 March 01.
Subject(s)
Animals , Birds/classification , Ecosystem , Biodiversity , Animal Distribution , Seasons , Population Density , Conservation of Natural Resources , MexicoABSTRACT
Los Andes están considerados como los puntos calientes más diversos de los trópicos, dentro de estos se encuentra el Parque Nacional del Manu, cuyas complejas condiciones climáticas y fisiográficas albergan una mega-diversidad y endemismo. En el presente trabajo se presenta una lista anotada de especies arbóreas y afines a lo largo de un gradiente de elevación desde los bosques submontanos a 800 m hasta la línea de bosque a 3625 m en la Reserva de Biosfera del Manu. En base a una red de 21 parcelas permanentes de una hectárea y exploraciones botánicas se sistematiza la información florística por rangos de elevación, distribución geográfica y endemismo. Estos resultados preliminares se traducen en 1108 especies de las cuales el 39.7% son morfoespecies, el 43% de las especies determinadas son registros nuevos para la región del Cusco, 15 especies son nuevos registros para la flora peruana, 40 especies son endémicas para Perú y 30 son potenciales especies nuevas para la ciencia. Adicionalmente, se resalta la expansión del rango altitudinal para el 45.2% de las especies determinadas (302 especies). Estos resultados son una muestra de la alta diversidad arbórea y afines en estos ecosistemas montañosos registrados en tan solo ~20 km de distancia geográfica, además muestra lo escasamente colectados y poco estudiados que se encuentran. Mas colecciones botánicas son necesarias - estos estudios básicos de florística son imperativos para un mejor entendimiento de la distribución de especies y la función del ecosistemas, además ayudará a responder una de las grandes preguntas en la ecología global moderna, ¿Cómo responderán los bosques tropicales al cambio climático global?
The tropical Andes and adjacent Amazon are Earths highest biodiversity hotspot. Manu National Park in southeastern Peru encompasses an entire watershed, ranging from Andean highlands to Amazonian lowlands, and is a megadiverse landscape on the Andes to Amazon transition. Here we present an annotated checklist of trees and related species is along an elevation gradient in the Manu Biosphere Reserve that runs from sub-montane forests at 800 m elevation up to the tree line at 3625 m. Based on a network of 21 1-hectare permanent tree plots and botanical explorations, the floristic information is systematized by elevation ranges, geographical distribution and endemism. These preliminary results show 1108 species. Of these, 43% are new records for the region of Cusco, 15 species are new records for the Peruvian flora, 40 species are endemics for Peru, and 30 are potential new species for science. Another 39.7% are identified to genus or family level and remain morphospecies. Additionally, we show altitudinal range expansion for 45.2% of identified species (302 species). These results were found in a transect of plots spanning only 20 km of geographic distance, and are a sample of the high tree diversity in these mountainous ecosystems. The data show how poorly collected and understudied these ecosystems are. Basic floristic studies and collections are imperative for a better understanding of species distribution and function of ecosystems, and the basic biodiversity of the tropical Andes. They will also help to answer a major, unresolved question in modern global ecology of how tropical forests will respond to global climate change.
ABSTRACT
Topography is a factor that can significantly affect the diversity and the distribution of trees species in tropical forests. Aniba perutilis, a timber species listed as vulnerable to extinction, is widely distributed in Andean forest fragments, especially in those with highly variable topography. Based on field surveys and logistic regression analyses, we studied the population structure and the effect of highly variable topography on the spatial distribution of this tree in three protected forest fragments in the central Andes of Colombia. Individuals of A. perutilis were mainly found on mountain ridges and hills with gentle slopes; no individuals were found in valleys. Using a species distribution model with presence/absence data, we showed that the available habitat for A. perutilis is significantly smaller than the extension of the fragments and much smaller than the extension of the currently protected areas. Our results have important implications for the conservation of A. perutilis and likely for other threatened Andean tree species, which can also have locally restricted distributions due to highly variable local topography.
La topografía es un factor que puede afectar considerablemente la diversidad y la distribución de las especies de árboles tropicales. Aniba perutilis, una especie de árbol maderable vulnerable a la extinción, está ampliamente distribuida en fragmentos de bosques andinos, especialmente en aquellos con topografía altamente variable. A partir de trabajo de campo y análisis de regresión logística, estudiamos la estructura de la población y los efectos de la topografía sobre la distribución espacial de este árbol en tres fragmentos de bosque en la cordillera central de Colombia que actualmente se encuentran protegidos. Los individuos de A. perutilis se encontraron principalmente en los filos de montaña y colinas con gradientes topográficos suaves; no se encontraron individuos en los valles. A partir de un modelo de distribución de especies usando datos de presencia/ausencia, mostramos que el hábitat disponible para A. perutilis es considerablemente más pequeño que la extensión de los fragmentos y mucho más reducido que la extensión actual de las áreas protegidas. Nuestros resultados tienen implicaciones importantes para la conservación de A. perutilis y probablemente otras especies de árboles andinos amenazados, los cuales pueden estar restringidos de forma similar debido a la variabilidad topográfica local.
Subject(s)
Ecological and Environmental Phenomena , Lauraceae/physiology , Plant Dispersal/physiology , Colombia , Lauraceae/classification , Spatial AnalysisABSTRACT
El presente estudio se llevó a cabo en cinco hectáreas de una parcela permanente establecida en el Parque Nacional Amacayacu, Amazonia colombiana. En éste, se evaluó el efecto de la variación ambiental y la configuración espacial sobre los patrones florísticos de las especies arbóreas (DAP>10 cm) a escala local en un bosque de tierra firme. Se estudió la variación florística y ambiental en cuadrantes de 20x20 m. Adicionalmente, se consideraron diferentes categorías de abundancia (total, alta, media y baja). Se utilizó el Análisis de Correspondencia Linealizado y el Análisis de Correspondencia Canónica, seguido de una partición de la variación, para cuantificar la magnitud a la cual el ambiente y la limitación en dispersión determinan la variación florística. La fracción espacial, representando procesos de autocorrelación como la limitación en dispersión, se analizó mediante dos métodos: Asumiendo un polinomio de tercer grado y por el método de Coordenadas Principales de Matrices Vecinas (PCNM). La diversidad beta de la parcela fue baja. El PCNM aparece como el método de análisis más apropiado para estudios a esta escala. Las diferencias florísticas explicadas a lo largo de la parcela de 5-ha fueron principalmente asociadas con procesos biológicos como la limitación en dispersión. La mayor parte de la variación florística, no obstante, no fue explicada por las variables ambientales o espaciales consideradas. En conclusión, estos resultados sugieren que procesos aleatorios son determinantes esenciales de la variación espacial de las especies arbóreas a escala local en tierra firme en los bosques en el Parque Nacional Amacayacu.
This study was carried out in a 5-ha permanent plot established in the Amacayacu National Park, Colombian Amazonia. We assessed the extent at which floristic patterns of tree species were determined by either the environmental variation or the spatial configuration in tierra firme forests. Floristic and environmental variation was assessed on quadrants of 20x20 m. To run the analysis, four different categories of abundance (all, high, medium and low) were considered. We used Detrended Correspondence Analysis and Canonical Correspondence Analysis, followed by a variation partitioning, to analyze the patterns of species distribution in order to quantify the role played by both environmental filtering and dispersal limitation. The spatial template, which represents dispersal limitation, was evaluated in two different ways: using a third degree polynomial and using the Principal Coordinates of Neighbour Matrix (PCNM) method. Beta diversity was relatively low within the plot. PCNM appears as the most appropriate method to analyze the spatial template at this scale. The floristic differences explained along the 5-ha plot were mainly associated to biological processes, such as dispersal limitation. The largest proportion of community variation in our dataset was unexplained by either environmental or spatial data. In conclusion, these results support random processes as the major drivers of the spatial variation of tree species at a local scale on tierra firme forests in the Amacayacu National Park.
Subject(s)
Trees/classification , Flowers/anatomy & histology , Amazonian Ecosystem/analysis , Biodiversity , Spatial AnalysisABSTRACT
Most surveillance studies have included invasive candidiasis from hospitalized patients. However, no national study has evaluated the species distribution and susceptibility to fluconazole of Candida species isolated from hospitalized and ambulatory patients. Atotal of 166 strains were collected consecutively during a 6 month period. Strains were isolated from vaginal fluid (73.5 percent), uriñe (7.8 percent), lower respiratory tract samples (7.8 percent), blood cultures (4.2 percent), sterile fluids (2.4 percent) and wounds (1.8 percent). Most of the isolates were obtained from ambulatory patients (71.1 percent). The species found were Candida albicans (78.9 percent), C glabrata (8.4 percent), C. tropicalis (6.0 percento), C.famata (1.8 percent), C krusei (1.8 percent), C parapsilosis (1.8 percent) and C. sake (1.2 percent). Fluconazole susceptibility was: 92.3 percento for C. albicans, 85.7 percent for C glabrata (most strains being dose-dependent susceptible), 100 percent) for C parapsilosis and 80 percent) for C tropicalis. Only susceptible strains were isolated from hospitalized children, whereas more resistant strains were isolated from ambulatory adults, mainly from vaginal fluid. In order to identify probable reservoirs of less susceptible strains such as C. glabrata, it would be necessary to include ambulatory isolates in future surveillance studies.
La mayoría de los estudios de vigilancia de levaduras del género Candida se realizan en candidiasis invasora en pacientes hospitalizados; sin embargo, no existen estudios que evalúen simultáneamente la distribución global de especies y susceptibilidad a fluconazol de cepas de Candida aisladas de pacientes hospitalizados y ambulatorios. Se analizaron 166 cepas de Candida, recolectadas consecutivamente en un período de 6 meses, las cuales fueron aisladas de flujo vaginal (73,5 por ciento), orina (7,8 por ciento), muestras respiratorias bajas (7,8 por ciento), hemocultivos (4,2 por ciento), líquidos estériles (2,4 por ciento) y heridas (1,8 por ciento). Un 71,1 por ciento provenía de pacientes ambulatorios. La especies aisladas fueron Candida albicans (78,9 por ciento), C glabrata (8,4 por ciento), C tropicalis (6,0 por ciento), Cfamata (1,8 por ciento), C. krusei (1,8 por ciento), C parapsilosis (1,8 por ciento) y C. sake (1,2 por ciento). Los porcentajes de sensibilidad a fluconazol fueron: 92,3 por cientoo para C. albicans, 85,7 por cientoo para C glabrata (siendo la mayoría sensible dosis dependiente), 100 por ciento) para C parapsilosis y 80 por cientoo para C tropicalis. En los niños, todos hospitalizados, se aislaron sólo cepas sensibles, mientras que en adultos ambulatorios se aislaron más cepas resistentes, fundamentalmente de flujo vaginal. Considerar cepas ambulatorias en futuros estudios de vigilancia permitirían dar cuenta de probables reservónos de cepas más resistentes, como C. glabrata.