Detection of Exudates and Microaneurysms in the Retina by Segmentation in Fundus Images / Detección de Exudados y Microaneurismas en la Retina por Segmentación en Imágenes de Fondo

ABSTRACT This article proposes two methodologies for the detection of lesions in the retina, which may indicate the presence of diabetic retinopathy (DR). Through the use of digital image processing techniques, it is possible to isolate the pixels that correspond to a lesion of RD, to achieve segmenting microaneurysms, the edges of the objects contained in the image are highlighted in order to detect the contours of the objects to select by size those that meet an area of 15 to 25 pixels in the case of 512x512 images and identify the objects as possible microaneurysms, while for the detection of exudates the green channel is selected to contrast the luminous objects in the retinography and from the conversion to gray scale, a histogram is graphed to identify the ideal threshold for the segmentation of the pixels that belong to the exudates at the end of the optical disk previously identified by a specialist. A confusion matrix supervised by an ophthalmologist was created to quantify the results obtained by the two methodologies, obtaining a specificity of 0.94 and a sensitivity of 0.97, values that are outstanding to proceed with the classification stage.

RESUMEN Este artículo propone dos metodologías para la detección de lesiones en la retina, que pueden significar la presencia de retinopatía diabética (RD). Mediante el uso de técnicas de procesamiento de imágenes digitales se logra aislar los pixeles que corresponden a una lesión propia de RD, para lograr segmentar microaneurismas se resaltan los bordes de los objetos contenido en la imagen con la finalidad de detectar los contornos de los objetos para seleccionar por tamaño los que cumplan con un área de 15 a 25 pixeles en el caso de imágenes de 512x512 y se identifiquen los objetos como posibles microaneurismas, mientras que para la detección de exudados se selecciona el canal verde para contrastar los objetos luminosos en la retinografía y a partir de la conversión a escala de grises se grafica un histograma para identificar el umbral idóneo para la segmentación de los pixeles que pertenecen a los exudados al final eliminar el disco óptico previamente identificado por un especialista. Se creó una matriz de confusión supervisada por un oftalmólogo para cuantificar los resultados obtenidos por las dos metodologías obteniendo una especificidad del 0.94 y una sensibilidad del 0.97, unos valores que son sobresalientes para proceder con la etapa de clasificación.

ESTIMULACIÓN DE GERMINACIÓN Y COLONIZACIÓN RADICULAR DE Diversispora trimulares POR FLAVONOIDES DE EXUDADOS RADICULARES DE Nicotiana glauca / STIMULATION OF GERMINATION OF SPORES AND ROOT COLONIZATION OF Diversispora trimulares BY FLAVONOIDS IN Nicotiana glauca ROOT EXUDATES

Los metabolitos secundarios son señales importantes en la interacción planta-microrganismos; sin embargo, los datos que corroboran el rol de los flavonoides como señales entre plantas y la simbiosis micorrízica arbuscular son limitados y aún recientes. Este estudio tiene por objetivo evaluar el efecto de flavonoides presentes en exudados radiculares de Allium porrum L., Nicotiana gluaca y Brassica oleracea var. Itálica, en la germinación de esporas y establecimiento de colonización radicular de Diversispora trimulares. Se detectaron miricetina y canferol en exudados de A. porrum, con un contenido total de flavonoides de 23,80µg g-1, de raíz seca; quercetina, en N. glauca, con 23,35µg g-1 y crisina, en B. oleracea, con 14,71µg g-1. Quercetina estimuló la germinación y la vitalidad de esporas (24%, 40%), a diferencia de crisina, que presentó un efecto inhibitorio (4%, 20%). A. porrum y N. glauca incrementaron la germinación de esporas (54%, 56%) y porcentaje de colonización de micorriza arbuscular (72%, 75%). Los resultados de la investigación mostraron una evidencia sólida del efecto de los flavonoides como moléculas estimulantes en los procesos de germinación de esporas y colonización de micorriza arbuscular.

Secondary metabolites are important signals that could determine the outcome of the plant soil microbial interactions, however, the data available that support the leading role of flavonoids in the communication of arbuscular mycorrhizal symbiosis are recent and limited. The present study examines the effect of flavonoids detected in root exudates from Allium porrum, Nicotiana glauca y Brassica oleracea var. italica on spore germination and mycorrhizal root colonization of Diversispora trimulares. Myricetin and kaempferol were detected in A. porrum root exudates with a total flavonoid content of 23.80µg g-1 dried root, quercetin in N. glauca with 23,35µg g-1 and chrysin in B. Oleracea with 14.71 µg g-1. Quercetin increased the spore germination and vitality (24%, 40%). In contrast, chrysin showed an inhibitory effect (4%, 20%). A. porrum and N. glauca increased spore germination (54%, 56%) and root mycorrhizal colonization (72%, 75%). This results evidence the effect of flavonoids on the stimulization of spore germination and stablishment of root colonization of arbuscular mycorrhizal fungi.

Staphylococcus aureus y la detección de portadores entre el personal que labora en la producción de parenterales / Staphylococcus aureus: detection of carriers among the staff working in parenteral production

En la producción de medicamentos estériles el personal se considera la principal fuente de contaminación, teniendo en cuenta los microorganismos y las partículas no vivientes que esparcen. El objetivo de nuestro trabajo es la detección de portadores de Staphylococcus aureus entre el personal que labora en la producción de parenterales, a quienes se les realizaron exudados nasofaríngeos. Se aislaron 50 cepas, de las cuales 6 fueron identificadas como este microorganismo, lo que representa el 12 porcinto. Se aislaron además otros microorganismos a los que se les considera gérmenes patógenos por alojarse en esa zona. Los resultados obtenidos corroboran que es de suma importancia realizar este tipo de muestreo como parte del monitoreo del personal que labora en las áreas clasificadas de producción de formulaciones inyectables

Staff is the main cause of contamination in aseptic drug production process, due to microorganism and non viable particles. The goal of this paper is to isolate staphylococcus aureus strain from the staff working in clean rooms. Nasopharyngeal swabs were performed on this staff. 50 strains were isolated. Six were sthaphylococcus aureus, (12 percent). Other microorganisms were isolated which are considered pathogen germens since they are located in the area. Results express how important personnel monitoring is as parts of the Environmental Monitoring Program in the Pharmaceutical Industry, mainly in aseptic process

Antioxidant activity in heterogeneous and homogeneous system of the resinous exudates from Heliotropium stenophylum and H. sinuatum and of 3-O-methylgalangin their main component / Actividad antioxidante en sistema heterogéneo y homogéneo de los exudados resinosos de Heliotropium stenophyllum y H. sinuatum y de 3-O-methylgalangina su componente mayoritario

The antioxidant activity of resinous extracts obtained from H. stenophylum and H. sinuatum species, was evaluated through ORAC index (Oxygen Radical Absorbance Capacity) in water phase and in presence of Triton X-100 micelles, using as test molecules to pyrogallol red (PGR) and evaluating their reduction by the action of peroxyl radicals obtained from thermolysis of AAPH. The results show that these extracts protect to PGR of the action of the radicals. This protection is reduced drastically in the presence of Triton X-100 micelles. The same effect was observed with the main flavonoid of these extracts (3-O-methylgalangin). These results show the importance of the media of reaction of pure compounds and/or extracts at the time of to take into account their use as antioxidants.

La actividad antioxidante de exudados resinosos obtenidos desde las especies H. stenophylum y H. sinuatum, fue evaluada a través del ensayo ORAC (Oxygen Radical Absorbance Capacity) en fase acuosa y en presencia de micelas de Triton X-100, usando como molécula prueba a pirogalol rojo (PGR) y evaluando su reducción frente a la acción de radicales peróxidos obtenidos desde la termólisis de AAPH. Los resultados muestran que estos extractos protegen al PGR de la acción de los radicales. Esta protección es reducida drásticamente en presencia de micelas de Tritón X-100. El mismo efecto fue observado con el flavonoide mayoritario de estos extractos (3-O-metilgalangina). Estos resultados muestran la importancia de considerar el medio de reacción de compuestos puros y/o extractos al momento de tomar en cuenta su uso como antioxidantes.

Lipophilicity and antibacterial activity of flavonols: antibacterial activity of resinous exudates of Haplopappus litoralis, H. chrysantemifolius and H. scrobiculatus / Lipofilia y actividad antibacteriana de flavonoles: actividad antibacteriana de los exudados resinosos de Haplopappus litoralis, H. chrysantemifolius y H. scrobiculatus

The antibacterial properties of the resinous exudates from Haplopappus litoralis, H. chrysantemifolius and H. scrobiculatus from Central Chile were assessed against Gram negative and Gram-positive bacteria, and proved active against the latter. The results show that the antibacterial activities of the resinous exudates are independent from the flavonols isolated from each extract that proved to be inactive. The estimated lipophilicity of the flavonols isolated from the Haplopappus resinous exudates were compared with the lipophilicity of known antibacterial flavonols. This analysis showed that lipophilicity is an important variable to predict the antibacterial activity of flavonols.

La actividad antibacteriana de los exudados resinosos de Haplopappus litoralis, H. chrysantemifolius y H. scrobiculatus de la Zona Central de Chile fueron evaluadas frente a bacterias Gram-negativas y Gram-positivas, y resultaron activos frente a estas últimas. Los resultados mostraron que la actividad antibacteriana de los exudados resinosos es independiente de los flavonoles aisladas de cada extracto que no mostraron actividad antibacteriana. La lipofilia estimada de los flavonoles aislados de los exudados resinosos de Haplopappus se comparó con la lipofilia de conocidos flavonoles antibacterianos. Este análisis mostró que la lipofilia es una variable importante para predecir la actividad antibacteriana de los flavonoles.

Comportamiento de malassezia furfur en medios de cultivo con base en los exudados gomosos de spondias dulcis y spondias mombin: producción de lipasa extracelular / Growth of malassezia furfur in media with spondias dulcis and spondias mombin gum exudates: production of extracellular lipase

El desarrollo de las levaduras del género Malassezia requiere condiciones especiales, estos hongos que producen afecciones en la piel, son generalmente cultivados en el medio Dixon. Se ensayaron los exudados gomosos de Spondias dulcis y Spondias mombin como sustratos para Malassezia furfur. Se evaluó también la producción de lipasa. Se determinó la cinética de crecimiento a un determinado intervalo de tiempo (0-168h), y a diferente concentración (0,5; 1%) y pH (4,5; 6,0). La biomasa obtenida para la levadura probada demostró que los sustratos preparados con los exudados gomosos son adecuados para su desarrollo. La mayor actividad de lipasa extracelular se observó al tiempo inicial de estudio (18h) en ambos sustratos, en las condiciones usadas: concentración (0,5 y 1%) y pH(4,5 y 6,0). Estas especies botánicas, ampliamente localizadas en Venezuela, especialmente en los Estados Zulia y Falcón, producen abundante goma. Este hecho, y los resultados obtenidos podrían ser útiles en la obtención de un nuevo sustrato, que pueda competir con el medio Dixon para el aislamiento y la caracterización de especies de Malassezia, y para la producción de lipasa

The development of genus Malassezia yeasts requires special conditions. This fungus, which produces skin diseases, is generally cultivated in the Dixon medium. Gum exudates from Spondias dulcis and Spondias mombin were tested as substrates for Malassezia furfur. Lipase production was also evaluated. The growth kinetic was determined for a given time range (0-168h) at different concentrations (0.5; 1%) and pH levels (4.5; 6.0). The biomass obtained for the tested yeast showed that substrates prepared with S. dulcis and S.mombin gum exudates are suitable for its development. The highest extracellular lipase activity was observed at 18h on both substrates at given concentrations (0.5; 1%) and pH (4.5; 6.0). These botanical species, widely located in Venezuela, especially in the States of Zulia and Falcon, yield abundant gum. Findings may be useful for obtaining new substrates that could compete with the Dixon medium for isolation and characterization of Malassezia species and for lipase production

Incidencia y fármaco-resistencia de cepas de Staphylococcus spp aisladas de exudados conjuntivales / Incidence and drug-resistance of Staphylococcus spp strains isolated from conjunctival swabs

OBJETIVO: Determinar la incidencia de cepas del género Staphylococcus aisladas de exudados conjuntivales y analizar su resistencia frente a diferentes antimicrobianos. MÉTODOS: Se realizó un estudio observacional descriptivo retrospectivo en el que se revisaron 3554 exudados conjuntivales a pacientes que acudieron en el período comprendido entre enero de 2002 a diciembre de 2003 y desde enero de 2005 hasta diciembre de 2007 al Instituto Cubano de Oftalmología Ramón Pando Ferrer por presentar un diagnóstico de infección ocular externa. RESULTADOS: Se aislaron 874 cepas de Staphylococcus aureus para un 47,5 por ciento y 965 cepas de Staphylococcus spp. coagulasa negativa con prueba de patogenicidad positiva para un 52,4 por ciento. En 69 de esos exudados los cultivos presentaron etiología mixta con dos bacterias diferentes, para el 3,7 por ciento. Se determinaron los porcentajes de resistencia a las cepas aisladas pertenecientes al género Staphylococcus. CONCLUSIONES: Se encontró una alta incidencia de las especies del género Staphylococcus en las infecciones oculares, así como se pudo apreciar que la menor fármaco-resistencia para Staphylococcus aureus y Staphylococcus spp. coagulasa negativa correspondieron a los antimicrobianos ciprofloxacina y amikacina. La mayor fármaco-resistencia de las cepas de Staphylococcus aureus correspondió a eritromicina y tetraciclina y en Staphylococcus spp coagulasa negativa fue frente a la tetraciclina

OBJECTIVE: To determine the incidence of Staphylococcus strains isolated from conjunctival swaps and their resistance to several antimicrobial agents. METHODS: A retrospective, descriptive and observational study was performed to review 3554 conjunctival swabs from patients who went to Ramón Pando Ferrer Institute of Ophthalmology in the period from January 2002 to December 2009 due to a diagnosis of external ocular infection. RESULTS: From the total of conjunctival swabs, 874 Staphylococcus aureus strains (47.5 percent) and 965 (52.4 percent) negative Staphylococcus spp. coagulasa strains were isolated, being pathogenecity test positive in 52.4 percent. In 69 swabs, the cultures presented mixed etiology with two different bacteria accounting for 3.7 percent. Resistance percentages of Staphylococcus strains were estimated. CONCLUSION: The incidence of Staphylococcus species in eye infections was high and the drug resistance for Staphylococcus aureus and Staphylococcus spp. coagulasa negative to Ciprofloxacin and Amikacyn was lower. The greatest drug resistance of S. aureus strains corresponded to erythromycin and tetracycline whereas Staphylococcus spp coagulasa negative were more resistant to tetracycline

Derrame pleural: [revisión] / Pleural effusion: [review]

El derrame pleural se define como la acumulación anormal de líquido en el espacio pleural; no es una enfermedad, es el resultado del desequilibrio entre la formación y la reabsorción del líquido como manifestación de alguna condición que incluso puede amenazar la vida del paciente. Es una entidad a la cual el clínico se ve enfrentado con frecuencia, la mayoría de las veces es secundaria a enfermedad pleural o pulmonar, pero puede también ser causada por enfermedades extrapulmonares, sistémicas o neoplásicas (bien sea primarias o metastásicas)...

Derrame pleural: marcadores bioquímicos en el enfoque diagnóstico

Se describieron las principales características del líquido pleural normal y los diferentes mecanismos que conducen a la formación de un derrame pleural. Se presentó una estrategia diagnóstica a partir de la diferenciación de trasudados y exudados. Se definieron sus criterios diagnósticos. Se revisaron los marcadores bioquímicos de uso más frecuente en la práctica médica y se especificó la utilidad de cada uno para el diagnóstico de las diferentes entidades que causan derrame pleural. Se aclararon las limitaciones de estos marcadores y la importancia de su uso racional a partir de los datos clínicos de cada caso.

The main characteristics of the normal pleural fluid, as well as the different mechanisms leading to the formation of a pleural effusion were described. A diagnostic strategy was presented starting from the separation of transudates and exudates. Their diagnostic criteria were also defined. Those biochemical markers that are most commonly used in the medical practice were reviewed, and the utility of each of them for the diagnosis of different diseases causing pleural effusion was specified. The limitations of these markers and the importance of their rational use according to the clinical data of every case were explained.