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1.
Rev. Inst. Adolfo Lutz ; 82: e39195, maio 2023. ilus, tab
Article in English | LILACS, CONASS, ColecionaSUS, SES-SP, VETINDEX, SESSP-ACVSES, SESSP-IALPROD, SES-SP | ID: biblio-1435630

ABSTRACT

Single nucleotide polymorphisms (SNPs, rs12979860 e rs8099917) in the Interferon Lambda 4 gene (IFNL4, formerly IFNL3and/or IL28B) has been associated with failure in the innate immune response, sustained virological response in hepatitis C, and HTLV-1-associated myelopathy (HAM) development. To search for these polymorphisms several methodologies can be employed, such as sequencing, real-time or quantitative polymerase chain reaction (qPCR), restriction fragment length polymorphism analysis in PCR products (PCR-RFLP), and tetra-primer PCR. The present study compared the performance of the tetra-primer PCR in relation to the PCR-RFLP, both optimized in the Research HTLV Laboratory of the Center of Immunology of Instituto Adolfo Lutz in São Paulo. One hundred DNA samples obtained from patients of STD/Aids Reference Centre in São Paulo, previously analyzed for IL28B SNPs by PCR-RFLP were selected for analysis, after confirming that they represent all IL28B SNPs patterns described in the literature. The results obtained showed concordance between the PCR-RFLP and the tetra-primer PCR SNPs results, and because of the low cost, easy to perform, and minor employment of biological specimen and reagents, the tetra-primer PCR is of choice to be used in routine. (AU)


Polimorfismos de nucleotídeos únicos (single nucleotide polymorphisms, SNPs rs12979860 e rs8099917) no gene que codifica o Interferon Lambda 4 (IFNL4, antigamente IFNL3 e/ou IL28B) têm sido associados às falhas na resposta imune inata e resposta virológica sustentada na hepatite C, e a mielopatia associada ao HTLV-1 (HTLV-1-associated myelopathy, HAM). A pesquisa destes polimorfismos pode empregar diversas metodologias: sequenciamento, reação em cadeia da polimerase em tempo real ou quantitativa (quantitative polymerase chain reaction, qPCR), análise de fragmentos de restrição enzimática em produtos de PCR (restriction fragment length polymorphism in PCR products, PCR-RFLP) e a tetra-primer PCR. Este estudo comparou o desempenho da tetra-primer PCR em relação a PCR-RFLP, ambas otimizadas no Laboratório de Pesquisa em HTLV do Centro de Imunologia do Instituto Adolfo Lutz de São Paulo. Foram selecionadas 100 amostras de DNA obtidas de pacientes do Centro de Referência e Treinamento em DST/Aids de São Paulo cujos SNPs na IL28B foram anteriormente determinados por PCR-RFLP e representaram todos os perfis descritos em literatura. Os resultados obtidos mostraram concordância entre elas, e pelo fato da tetra-primer PCR ter menor custo, ser de fácil execução, empregar menos tempo, insumos e material biológico, é a técnica de escolha para uso em rotina. (AU)


Subject(s)
Polymorphism, Restriction Fragment Length , Polymerase Chain Reaction , Interleukins , Polymorphism, Single Nucleotide , Interferon Lambda
2.
Rev. biol. trop ; 71abr. 2023.
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1449480

ABSTRACT

Introduction: Coral-reef communities are considered one of the most biodiverse, but also most threatened, marine ecosystems, and the accelerating loss of habitat over the past decades warrants active intervention. Objective: The present study demonstrates the successful implementation of a low-impact restoration technique in three Central Mexican Pacific degraded coral communities, using a protocol based on natural fragmentation (''fragments of opportunity") of the branching coral Pocillopora spp., considered the most abundant and primary carbonate-producing coral species of the Eastern Tropical Pacific. Methods: The restoration program was implemented in two offshore and one inshore coraline areas. The relationships between seawater temperature and coral survival, growth, and attachment rate were assessed over one year, with 183 fragments monitored each month. Results: The mean coral growth rate was 3.3 ± 0.1 mm mo-1, with annual growth rates in length and width of 39.9 ± 14.2 and 36.5 ± 19.5 mm yr-1, respectively. Self-attachment efficiency was 78 % and the survival rate was high (84 %). The growth rate differed significantly among reefs. Conclusions: Upon monitoring directly fragmented corals over a year, growth rates were deemed high enough to merit active restoration in the region. However, our data show that structural and abiotic differences and seasonal variability must be considered overall in successful long-term coral community restoration initiatives in the eastern Pacific region.


Introducción: Las comunidades de arrecifes de coral se consideran uno de los ecosistemas marinos con mayor biodiversidad, pero también los más amenazados, y la pérdida acelerada de hábitat en las últimas décadas justifica la implementación de una intervención activa. Objetivo: El presente estudio demuestra la implementación exitosa de una técnica de restauración de bajo impacto basada en la fragmentación natural (''fragmentos de oportunidad") del coral ramificado Pocillopora spp., la cual es la especie coralina más abundante y principal productora de carbonato del Pacífico Oriental Tropical. Métodos: El programa de restauración se implementó en dos sitios lejos de la costa y un sitio cercano a la costa, con comunidades coralinas degradadas. Las relaciones entre la temperatura del agua de mar y la supervivencia, el crecimiento y la tasa de adhesión de los corales se evaluaron durante un año con 183 fragmentos monitoreados cada mes. Resultados: La tasa media de crecimiento coralino fue de 3.3 ± 0.1 mm mo-1, con tasas de crecimiento anual en largo y ancho de 39.9 ± 14.2 y 36.5 ± 19.5 mm año-1, respectivamente. La eficiencia de la auto-adherencia fue del 78 % y la tasa de supervivencia fue alta (84 %). La tasa de crecimiento difirió significativamente entre los arrecifes. Conclusiones: Al monitorear directamente los corales fragmentados durante un año, las tasas de crecimiento se consideraron lo suficientemente altas como para merecer una restauración activa en la región. Sin embargo, nuestros datos muestran que las diferencias estructurales y abióticas y la variabilidad estacional deben considerarse en general en las iniciativas exitosas de restauración de comunidades de coral a largo plazo en la región del Pacífico oriental.

3.
Braz. j. biol ; 83: 1-6, 2023. graf, tab
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1468830

ABSTRACT

Bats are important for the homeostasis of ecosystems and serve as hosts of various microorganisms including bacteria, viruses, and fungi with pathogenic potential. This study aimed to isolate fungi from biological samples obtained from bats captured in the city of Sinop (state of Mato Grosso, Brazil), where large areas of deforestation exist due to urbanization and agriculture. On the basis of the flow of people and domestic animals, 48 bats were captured in eleven urban forest fragments. The samples were processed and submitted to microbiological cultures, to isolate and to identify the fungal genera. Thirty-four (70.83%) of the captured bats were positive for fungi; 18 (37.5%) and 16 (33.33%) of these bats were female and male, respectively. Penicillium sp., Scopulariopsis sp., Fusarium sp., Aspergillus sp., Alternaria sp., Cryptococcus sp., Trichosporon sp., and Candida sp., which may cause opportunistic infections, were isolated. The bat species with the highest number of fungal isolates was Molossus molossus: 21 isolates (43.8%). According to our results, bats captured in urban forest fragments in Sinop harbor pathogenic fungi, increasing the risk of opportunistic fungal infections in humans and domestic animals.


Os morcegos apresentam grande importância na homeostasia dos ecossistemas e são hospedeiros de uma rica diversidade de micro-organismos como bactérias, vírus e fungos com potencial patogênico. Portanto, este estudo visou isolar fungos presentes em amostras biológicas de morcegos na cidade de Sinop - MT, que possui grandes áreas de desmatamento devido à urbanização e agricultura. Foram capturados 48 morcegos de diferentes espécies, em onze fragmentos florestais urbanos definidos de acordo com fluxo de pessoas e animais domésticos, para obtenção de amostras biológicas. Essas amostras foram processadas e submetidas aos cultivos microbiológicos, para isolamento e identificação dos gêneros dos fungos. Dos 48 morcegos, 34 (70,83%) foram positivos para pelos menos um gênero de fungo, sendo 18 (37,5%) fêmeas e 16 (33,33%) machos, e os gêneros isolados a partir das amostras biológicas foram Penicillium sp., Scopulariopsis sp., Fusarium sp., Aspergillus sp., Alternaria sp., Cryptococcus sp., Trichosporon sp. e Candida sp., que podem ser causadores de infecções oportunistas. Desse total, a espécie que apresentou maior positividade para pelo menos um gênero de fungo foi Molossus molossus com 21 (43,8%). Nossos resultados demonstram que os morcegos capturados nos fragmentos florestais urbanos na cidade de Sinop - MT, podem atuar como agentes veiculadores de fungos com potencial patogênico, aumentando assim o risco de exposição e aquisição de infecções fúngicas oportunistas por pessoas e animais domésticos.


Subject(s)
Animals , Fungi/pathogenicity , Chiroptera/microbiology , Chiroptera/blood , Alternaria , Aspergillus , Candida , Cryptococcus , Fusarium , Penicillium , Scopulariopsis , Trichosporon
4.
Braz. j. biol ; 832023.
Article in English | LILACS-Express | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1469046

ABSTRACT

Abstract Bats are important for the homeostasis of ecosystems and serve as hosts of various microorganisms including bacteria, viruses, and fungi with pathogenic potential. This study aimed to isolate fungi from biological samples obtained from bats captured in the city of Sinop (state of Mato Grosso, Brazil), where large areas of deforestation exist due to urbanization and agriculture. On the basis of the flow of people and domestic animals, 48 bats were captured in eleven urban forest fragments. The samples were processed and submitted to microbiological cultures, to isolate and to identify the fungal genera. Thirty-four (70.83%) of the captured bats were positive for fungi; 18 (37.5%) and 16 (33.33%) of these bats were female and male, respectively. Penicillium sp., Scopulariopsis sp., Fusarium sp., Aspergillus sp., Alternaria sp., Cryptococcus sp., Trichosporon sp., and Candida sp., which may cause opportunistic infections, were isolated. The bat species with the highest number of fungal isolates was Molossus molossus: 21 isolates (43.8%). According to our results, bats captured in urban forest fragments in Sinop harbor pathogenic fungi, increasing the risk of opportunistic fungal infections in humans and domestic animals.


Resumo Os morcegos apresentam grande importância na homeostasia dos ecossistemas e são hospedeiros de uma rica diversidade de micro-organismos como bactérias, vírus e fungos com potencial patogênico. Portanto, este estudo visou isolar fungos presentes em amostras biológicas de morcegos na cidade de Sinop - MT, que possui grandes áreas de desmatamento devido à urbanização e agricultura. Foram capturados 48 morcegos de diferentes espécies, em onze fragmentos florestais urbanos definidos de acordo com fluxo de pessoas e animais domésticos, para obtenção de amostras biológicas. Essas amostras foram processadas e submetidas aos cultivos microbiológicos, para isolamento e identificação dos gêneros dos fungos. Dos 48 morcegos, 34 (70,83%) foram positivos para pelos menos um gênero de fungo, sendo 18 (37,5%) fêmeas e 16 (33,33%) machos, e os gêneros isolados a partir das amostras biológicas foram Penicillium sp., Scopulariopsis sp., Fusarium sp., Aspergillus sp., Alternaria sp., Cryptococcus sp., Trichosporon sp. e Candida sp., que podem ser causadores de infecções oportunistas. Desse total, a espécie que apresentou maior positividade para pelo menos um gênero de fungo foi Molossus molossus com 21 (43,8%). Nossos resultados demonstram que os morcegos capturados nos fragmentos florestais urbanos na cidade de Sinop - MT, podem atuar como agentes veiculadores de fungos com potencial patogênico, aumentando assim o risco de exposição e aquisição de infecções fúngicas oportunistas por pessoas e animais domésticos.

5.
Braz. j. biol ; 83: e247993, 2023. tab, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1278544

ABSTRACT

Abstract Bats are important for the homeostasis of ecosystems and serve as hosts of various microorganisms including bacteria, viruses, and fungi with pathogenic potential. This study aimed to isolate fungi from biological samples obtained from bats captured in the city of Sinop (state of Mato Grosso, Brazil), where large areas of deforestation exist due to urbanization and agriculture. On the basis of the flow of people and domestic animals, 48 bats were captured in eleven urban forest fragments. The samples were processed and submitted to microbiological cultures, to isolate and to identify the fungal genera. Thirty-four (70.83%) of the captured bats were positive for fungi; 18 (37.5%) and 16 (33.33%) of these bats were female and male, respectively. Penicillium sp., Scopulariopsis sp., Fusarium sp., Aspergillus sp., Alternaria sp., Cryptococcus sp., Trichosporon sp., and Candida sp., which may cause opportunistic infections, were isolated. The bat species with the highest number of fungal isolates was Molossus molossus: 21 isolates (43.8%). According to our results, bats captured in urban forest fragments in Sinop harbor pathogenic fungi, increasing the risk of opportunistic fungal infections in humans and domestic animals.


Resumo Os morcegos apresentam grande importância na homeostasia dos ecossistemas e são hospedeiros de uma rica diversidade de micro-organismos como bactérias, vírus e fungos com potencial patogênico. Portanto, este estudo visou isolar fungos presentes em amostras biológicas de morcegos na cidade de Sinop - MT, que possui grandes áreas de desmatamento devido à urbanização e agricultura. Foram capturados 48 morcegos de diferentes espécies, em onze fragmentos florestais urbanos definidos de acordo com fluxo de pessoas e animais domésticos, para obtenção de amostras biológicas. Essas amostras foram processadas e submetidas aos cultivos microbiológicos, para isolamento e identificação dos gêneros dos fungos. Dos 48 morcegos, 34 (70,83%) foram positivos para pelos menos um gênero de fungo, sendo 18 (37,5%) fêmeas e 16 (33,33%) machos, e os gêneros isolados a partir das amostras biológicas foram Penicillium sp., Scopulariopsis sp., Fusarium sp., Aspergillus sp., Alternaria sp., Cryptococcus sp., Trichosporon sp. e Candida sp., que podem ser causadores de infecções oportunistas. Desse total, a espécie que apresentou maior positividade para pelo menos um gênero de fungo foi Molossus molossus com 21 (43,8%). Nossos resultados demonstram que os morcegos capturados nos fragmentos florestais urbanos na cidade de Sinop - MT, podem atuar como agentes veiculadores de fungos com potencial patogênico, aumentando assim o risco de exposição e aquisição de infecções fúngicas oportunistas por pessoas e animais domésticos.


Subject(s)
Humans , Animals , Male , Female , Chiroptera , Brazil , Forests , Cities , Ecosystem , Fungi
6.
Rev. inf. cient ; 100(4): e3490, 2021. graf
Article in Spanish | LILACS, CUMED | ID: biblio-1289660

ABSTRACT

RESUMEN Se realizó un reporte de un caso de paciente femenina de 48 años de edad, con antecedentes patológicos personales de hipertensión arterial, cardiopatía isquémica, arritmias cardíacas y neurosis depresiva e ingestión diaria de cuerpos extraños desde hace algunos años, la cual tenía el hábito de masticar fragmentos de espuma de poliestireno (poliespuma), los que diluía en gasolina para poderlos moldear, ablandar e ingerirlos posteriormente. La paciente acudió a la consulta de Gastroenterología por presentar epigastralgia, acidez, sensación de repletes gástrica posprandial, aun cuando solo podía digerir escasas cantidades de alimento. Se realizó endoscopia, donde se apreció a la entrada de la luz gástrica un bezoar gigante de consistencia dura, superficie lisa, no movible, que midió aproximadamente 6-7 cm de diámetro, que ocupó prácticamente el 50 % de la luz gástrica, correspondiente al fundus y cuerpo gástrico, con extensión hacia el antro. Los intentos de extraerlo por vía endoscópica fueron fallidos, por lo que se intervino quirúrgicamente y se extrajo el mismo. La paciente tuvo una evolución posoperatoria favorable y egresó a los siete días, con seguimiento por consulta externa y tratamiento médico ambulatorio.


ABSTRACT A 48-year-old female presented to gastroenterologist consultation with epigastralgia, heartburn, and sensation of postprandial gastric fullness even when she only could intake meal in small proportion. She had a history of hypertension, ischemic heart disease, and cardiac arrhythmias, depressive neurosis associated to the ingestion, daily and since several years, of foreign bodies. She was used to chewing fragments of polyfoam, which she diluted them in gasoline in order to mold them, soften them and ingests them afterwards. An endoscopy procedure was used, which revealed, at the entrance of the gastric lumen, a giant bezoar of hard mass, smooth surface, non-movable, with approximately 6-7 cm size and occupying almost 50% of the gastric lumen region corresponding to the gastric body and fundus, and extending to the antrum. Attemps for removal the mass, endoscopically, were unsuccessful, so surgery was performed and it was removed successfully. The patient had a favorable postoperative evolution and was discharged 7 days after surgery, with outpatient follow-up and ambulatory medical treatment.


RESUMO Relatou-se o caso de uma paciente do sexo feminino, 48 anos, com história patológica pessoal de hipertensão arterial, cardiopatia isquêmica, arritmias cardíacas e neurose depressiva e ingestão diária de corpos estranhos há alguns anos, que tinha hábito de mastigar fragmentos de espuma de poliestireno (polyfoam), que ele diluiu em gasolina para poder moldar, amolecer e ingerir depois. A paciente compareceu à consulta de Gastroenterologia por apresentar epigastralgia, azia, sensação de plenitude gástrica pós-prandial, embora só conseguisse digerir pequenas quantidades de alimentos. Foi realizada endoscopia, onde um bezoar gigante de consistência dura, superfície lisa, imóvel, medindo aproximadamente 6-7 cm de diâmetro, ocupando praticamente 50% da luz gástrica, correspondente à luz gástrica, foi observado na entrada do lúmen gástrico, fundo e corpo gástrico, com extensão em direção ao antro. As tentativas de removê-lo endoscopicamente não tiveram sucesso, então ele foi submetido a uma cirurgia e foi removido. O paciente teve evolução pós-operatória favorável, com alta hospitalar sete dias após, com acompanhamento ambulatorial e acompanhamento médico ambulatorial.


Subject(s)
Humans , Female , Middle Aged , Bezoars/surgery , Bezoars/diagnosis , Endoscopy/methods
7.
Medicina (B.Aires) ; 80(supl.3): 1-6, June 2020. ilus, graf, tab
Article in English | LILACS | ID: biblio-1135184

ABSTRACT

The disease named COVID-19, caused by the SARS-CoV-2 coronavirus, is currently generating a global pandemic. Vaccine development is no doubt the best long-term immunological approach, but in the current epidemiologic and health emergency there is a need for rapid and effective solutions. Convalescent plasma is the only antibody-based therapy available for COVID-19 patients to date. Equine polyclonal antibodies (EpAbs) put forward a sound alternative. The new generation of processed and purified EpAbs containing highly purified F(ab’)2 fragments demonstrated to be safe and well tolerated. EpAbs are easy to manufacture allowing a fast development and scaling up for a treatment. Based on these ideas, we present a new therapeutic product obtained after immunization of horses with the receptor-binding domain of the viral Spike glycoprotein. Our product shows around 50 times more potency in in vitro seroneutralization assays than the average of convalescent plasma. This result may allow us to test the safety and efficacy of this product in a phase 2/3 clinical trial to be conducted in July 2020 in the metropolitan area of Buenos Aires, Argentina.


La enfermedad denominada COVID-19 es causada por el coronavirus SARS-CoV-2 y es actualmente considerada una pandemia a nivel global. El desarrollo de vacunas es sin duda la mejor estrategia a largo plazo, pero debido a la emergencia sanitaria, existe una necesidad urgente de encontrar soluciones rápidas y efectivas para el tratamiento de la enfermedad. Hasta la fecha, el uso de plasma de convalecientes es la única inmunoterapia disponible para pacientes hospitalizados con COVID-19. El uso de anticuerpos policlonales equinos (EpAbs) es otra alternativa terapéutica interesante. La nueva generación de EpAbs incluyen el procesamiento y purificación de los mismos y la obtención de fragmentos F(ab’)2 con alta pureza y un excelente perfil de seguridad en humanos. Los EpAbs son fáciles de producir, lo cual permite el desarrollo rápido y la elaboración a gran escala de un producto terapéutico. En este trabajo mostramos el desarrollo de un suero terapéutico obtenido luego de la inmunización de caballos utilizando el receptor-binding domain de la glicoproteína Spike del virus. Nuestro producto mostró ser alrededor de 50 veces más potente en ensayos de seroneutralización in vitro que el promedio de los plasmas de convalecientes. Estos resultados nos permitirían testear la seguridad y eficacia de nuestro producto en ensayos clínicos de fase 2/3 a realizarse a partir de julio de 2020 en la zona metropolitana de Buenos Aires, Argentina.


Subject(s)
Humans , Animals , Immunoglobulin Fab Fragments/isolation & purification , Coronavirus Infections/therapy , Immune Sera/immunology , Antibodies, Viral/isolation & purification , Antibodies, Viral/immunology , Antibodies, Viral/chemistry , Argentina , Immunoglobulin G/isolation & purification , Immunoglobulin G/chemistry , Immunoglobulin Fab Fragments/chemistry , Neutralization Tests , Pandemics , Betacoronavirus , SARS-CoV-2 , COVID-19 , Horses
8.
Hig. Aliment. (Online) ; 34(290): 14, Janeiro/Junho 2020.
Article in Portuguese, English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1393534

ABSTRACT

O objetivo deste estudo foi de avaliar as condições higiênico-sanitárias de quatro marcas de chás industrializados comercializados na cidade de Pouso Alegre ­ MG utilizando parâmetros de presença de matérias estranhas e análises microbiológicas. Foram coletadas no período de setembro a outubro de 2017, amostras de chás de camomila, erva-doce, hortelã e chá misto que contém em sua formulação essas mesmas ervas. Foram utilizados os métodos da Association of Official Analytical Chemists International (AOAC) de acordo com a RDC n°14 para capturar as sujidades leves e nas análises microbiológicas, foram utilizados métodos da International Organization for Standardization (ISO) de acordo com a RDC n° 12 para avaliar coliformes totais e termotolerantes, fungos e Salmonella spp. Nas pesquisas de matérias estranhas somente três marcas de camomila foram aprovadas, estando o restante dos chás em desacordo com a legislação vigente por estarem acima do limite de tolerância aceitável. Na avaliação de coliformes e Salmonella sp. todas as amostras foram aprovadas porém, houve um crescimento considerável de fungos filamentosos nestas amostras. Os estudos apontam grandes falhas nas boas praticas de fabricação, por se tratarem de produtos industrializados que contam com processos de limpeza e controle de qualidade para certificarem alimentos livres de risco a saúde dos consumidores. A pesquisa sugere uma revisão da resolução vigente para implantar a análise de presença de fungos


The aim of this study was to evaluate the hygienic-sanitary conditions of four brands of industrialized teas marketed in the city of Pouso Alegre ­ MG using parameters of presence of foreign matter and microbiological analyzes. Were collected in the period from September to October 2017, samples of chamomile teas, fennel, mint and mixed tea that contains in its formulation these same herbs. Were used the methods of the International Association of Analytical Chemists (AOAC) according to RDC n° 14 to capture light dirt and in the microbiological analyzes, were used the methods of the International Organization for Standardization (ISO) according to RDC nº 12 to evaluate total and thermotolerant coliforms, fungi and Salmonella spp. In the research of extraneous materials, only three brands of chamomile were approved, the rest of the teas being in disagreement with the current legislation because they are above the acceptable tolerance limit. In the evaluation of coliforms and Salmonella sp. all samples were approved, however, there was a considerable growth of filamentous fungi in these samples. The studies point out major flaws in good manufacturing practices, as they are industrialized products that rely on cleaning and quality control processes to certify foods that are free from risks to the health of consumers. The research suggests a revision of the current resolution to implement the analysis of the presence of fungi

9.
Hig. aliment ; 34(290): 10-23, Janeiro/Junho 2020. tab
Article in Portuguese | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1482530

ABSTRACT

O objetivo deste estudo foi de avaliar as condições higiênico-sanitárias de quatro marcas de chás industrializados comercializados na cidade de Pouso Alegre - MG utilizando parâmetros de presença de matérias estranhas e análises microbiológicas. Foram coletadas no período de setembro a outubro de 2017, amostras de chás de camomila, erva-doce, hortelã e chá misto que contém em sua formulação essas mesmas ervas. Foram utilizados os métodos da Association of Official Analytical Chemists International (AOAC) de acordo com a RDC n°14 para capturar as sujidades leves e nas análises microbiológicas, foram utilizados métodos da International Organization for Standardization (ISO) de acordo com a RDC n° 12 para avaliar coliformes totais e termotolerantes, fungos e Salmonella spp. Nas pesquisas de matérias estranhas somente três marcas de camomila foram aprovadas, estando o restante dos chás em desacordo com a legislação vigente por estarem acima do limite de tolerância aceitável. Na avaliação de coliformes e Salmonella sp. todas as amostras foram aprovadas porém, houve um crescimento considerável de fungos filamentosos nestas amostras...


The aim of this study was to evaluate the hygienic-sanitary conditions of four brands of industrialized teas marketed in the city of Pouso Alegre - MG using parameters of presence of foreign matter and microbiological analyzes. Were collected in the period from September to October 2017, samples of chamomile teas, fennel, mint and mixed tea that contains in its formulation these same herbs. Were used the methods of the International Association of Analytical Chemists (AOAC) according to RDC n° 14 to capture light dirt and in the microbiological analyzes, were used the methods of the International Organization for Standardization (ISO) according to RDC nº 12 to evaluate total and thermotolerant coliforms, fungi and Salmonella spp. In the research of extraneous materials, only three brands of chamomile were approved, the rest of the teas being in disagreement with the current legislation because they are above the acceptable tolerance limit. In the evaluation of coliforms and Salmonella sp. all samples were approved, however, there was a considerable growth of filamentous fungi in these samples


Subject(s)
Industrialized Foods , Tea/microbiology , Food Contamination , Enterobacteriaceae , Health Surveillance
10.
Trends Psychol ; 27(2): 473-490, Apr.-June 2019. tab, graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1014719

ABSTRACT

Abstract Introduction: Film clips are the most used stimuli to induce different emotional states. Objective: Identify, select, and evaluate a set of film clips according to dimensionality and discreteness of emotions. Film experts suggested 437 fragments, but only 70 met the criteria to be included in the LATEMO-E film-clip database. Study 1: The 70 film clips were tested for their ability to induce disgust, anger, fear, sadness, amusement, tenderness, and neutral (n = 147 participants; mean age = 20.64 years, SD ±2.21 years). Results: A total of 28 film clips presented adequate scores on intensity and discreteness. Study 2: A total of 28 selected film clips were assessed again in a new sample of 106 participants (mean age = 20.96 years, SD ±2.45 years). Results: Anger and amusement film clips were the most extreme in the valence and activation dimensions. Anger and fear film clips were the most extreme categories in the intensity, certainty, and control dimensions. Conclusions: These stimuli were useful for inducing emotional states that can be judged from both the dimensional perspective of emotions and the basic emotions perspective. Evoked emotions could be differentiated according to cognitive patterns of evaluation that guide behavior in response to emotional stimulation.


Resumo Introdução: os clipes são os estímulos mais utilizados para induzir diferentes estados emocionais. Objetivo: identificar, selecionar e avaliar um conjunto de clipes de filme de acordo com a discrição e dimensionalidade da emoção. 437 fragmentos foram sugeridos por especialistas em filmes, mas 70 atenderam aos criterios de inclusão em um banco de dados de filmes. Estudo 1: os 70 clipes foram testados em sua capacidade de induzir: nojo, raiva, medo, tristeza, diversão, ternura e neutro (N = 147 participantes; M = 20,64; DP ±2,21). Resultados: 28 clipes apresentaram escores adequados de intensidade e discrição. Estudo 2: 28 clipes selecionados foram reavaliados em uma nova amostra de 106 participantes (M = 20,96; DP ±2,45). Resultados: os clipes de raiva e diversão foram os mais extremos nas dimensões de valência e ativação. Clips de raiva e medo foram as categorias mais extremas nos indicadores de intensidade, certeza e controle. Conclusões: os estímulos foram úteis para induzir estados emocionais que podem ser julgados tanto pela perspectiva dimensional das emoções quanto pela perspectiva básica das emoções. Além disso, as emoções evocadas são diferenciadas de acordo com os padrões cognitivos de avaliação que guiam o comportamento em resposta à estimulação emocional.


Resumen Introducción: los fragmentos de películas están entre los estímulos más usados para inducir distintos estados emocionales. Objetivo: identificar, seleccionar y evaluar un set de fragmentos de películas según la discreción y la dimensionalidad de la emoción. Expertos en cine sugirieron 437 fragmentos, pero solo 70 fueron identificados como aquellos que cumplieron con los criterios de inclusión en un set de fragmentos de películas. Estudio 1: los 70 fragmentos fueron evaluados en su capacidad para inducir: asco, ira, miedo, tristeza, diversión, ternura y neutro (N = 147 participantes; M = 20.64; DE ±2.21). Resultados: 28 fragmentos presentaron puntuaciones adecuadas en intensidad y discreción. Estudio 2: los 28 fragmentos fueron reevaluados en una nueva muestra de 106 participantes (M = 20.96, DE ±2.45). Resultados: los fragmentos de ira y diversión fueron los más extremos en las dimensiones valencia y activación. Ira y miedo fueron las categorías más extremas en los indicadores intensidad, certeza y control. Conclusiones: los estímulos resultaron útiles para inducir estados emocionales que pueden ser juzgados desde la perspectiva dimensional de las emociones, así como desde el enfoque de las emociones básicas. Además, las emociones provocadas se diferencian en función de patrones cognitivos de evaluación que guían la conducta en respuesta al estímulo emocional.

11.
Hig. aliment ; 33(288/289): 2115-2118, abr.-maio 2019. tab
Article in Portuguese | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1482280

ABSTRACT

A farinha de trigo é obtida por moagem e suas características são influenciadas por condições a que são submetidas na producão. A contaminação deste produto pode se dar desde a infestação dos grãos de trigo por pragas do campo até o seu ambiente de armazenagem. Com isso torna-se necessário o uso das boas práticas de produção para garantir a qualidade do produto e evitar riscos ao consumidor. Neste sentido, a ANVISA estabelece um limite de tolerância para avaliação de matérias estranhas macroscópicas e microscópicas em alimentos. Este trabalho buscou coletar, analisar e verificar a qualidade de amostras de farinha de trigo tipo 1, afim de verificar sua adequação frente a legislação vigente, tendo como base o método da “Association of Official of Analytical Chemists International” (AOAC). Os resultados mostraram, presença de matérias estranhas, porém dentro dos limites estabelecidos, demonstrando qualidade em relação à presença de sujidades.


Subject(s)
Food Contamination/analysis , Food Contamination/legislation & jurisprudence , Flour/analysis , Flour/standards , Food Quality
12.
Braz. j. biol ; 79(2): 337-344, Apr.-June 2019. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-989444

ABSTRACT

Abstract Dicksonia sellowiana Hook. (Dicksoniaceae) is target of extractive exploitation and is threatened with extinction. We analyzed the population structure, the spatial distribution pattern of D. sellowiana and its relationship with environmental parameters within three fragments of Araucaria Forest in Rio Grande do Sul, Brazil. The fragments are of different sizes, namely, large (H1LF) with 246 ha, medium (H2MF) with 57 ha and small (H3SF) with 5.2 ha. Within each site, 1 ha was delimited, divided into 100 subplots (100 m2), of which 20 were selected with a draw. In each subplot, counting of the individuals, the registration of the caudice height and the coverage of leaves (SC) (m2), measurements of photosynthetically active radiation (PAR), canopy opening degree (CO), soil moisture (SM) and litter thickness (LT). The temperature (T) was measured inside each site. A total of 792 plants were sampled, of which 551 were concentrated in H1LF, 108 in H2MF and 133 in H3SF. An average of 1320 ha-1 individuals were estimated. Of the total including the three fragments, 96.9% of the individuals are in the first class of height (up to 0.8 m), indicating a great potential of population development. The spatial distribution pattern (AI) was aggregated in the three populations and the plants presented a heterogeneous total coverage, between 4.73 m2 (H2MF) and 2,223.47 m2 (H1LF). The highest values ​​of SC and SM were more related to the distribution of individuals in H1LF whereas the opposite was recorded in H2MF. The highest values ​​of PAR, LT and CO correlated with the distribution of D. sellowiana in H3SF. In addition to revealing that the H1LF population is among the most dense in southern Brazil, the results demonstrated a significant structural distinction between the interior populations of the fragments, in spite of them being located near to one another and being part of the same natural field matrix.


Resumo Dicksonia sellowiana Hook. (Dicksoniaceae) é alvo de exploração extrativista e encontra-se ameaçada de extinção. Analisamos a estrutura populacional, o padrão de distribuição espacial de D. sellowiana e sua relação com parâmetros ambientais no interior de três fragmentos de Floresta com Araucária, no Rio Grande do Sul (RS), Brasil. Os fragmentos possuem diferentes tamanhos sendo denominados de grande (H1LF) com 246 ha, médio (H2MF) com 57 ha e de pequeno (H3SF) com 5,2 ha. No interior de cada sítio, foi demarcado 1 ha, fracionado em 100 subparcelas (100m2), das quais 20 foram sorteadas. Em cada subparcela foi feita a contagem dos indivíduos, o registro da altura do cáudice e da cobertura (SC) (m2) das folhas, as medições da radiação fotossinteticamente ativa (PAR), grau de abertura do dossel (CO), umidade do solo (SM) e espessura da serapilheira (LT). A temperatura (T) foi medida no interior de cada sítio. Foram amostradas 792 plantas, das quais 551 concentradas no H1LF, 108 no H2MF e 133 no H3SF e em média foram estimados 1320 indivíduos ha-1. Do total dos três fragmentos, 96,9% dos indivíduos estão na primeira classe de altura (até 0,8 m), indicando grande potencial de desenvolvimento das populações. O padrão de distribuição espacial (AI) foi agregado nas três populações e as plantas apresentaram uma cobertura total heterogênea, entre 4,73m2 (H2MF) e 2.223,47m 2 (H1LF). Os maiores valores de SC e de SM foram mais relacionadas com a distribuição dos indivíduos no H1LF enquanto que o contrário foi registrado no H2MF. Os maiores valores de PAR, LT e de CO relacionaram-se com a distribuição de D. sellowiana no H3SF. Além de revelar que a população do H1LF está entre as mais densas já descritas no sul do Brasil, os resultados demonstraram uma significativa distinção estrutural entre as populações dos interiores dos fragmentos com diferentes tamanhos, embora muito próximos geograficamente e inseridos em uma mesma matriz de campo natural.


Subject(s)
Endangered Species/statistics & numerical data , Plant Dispersal/physiology , Tracheophyta/physiology , Temperature , Brazil , Forests , Ecosystem , Plant Leaves
13.
Biosci. j. (Online) ; 35(1): 267-276, jan./fev. 2019. tab, ilus, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1048580

ABSTRACT

Forest structure studies may be carried out through the diametric distribution of individuals within a population, which is defined by characterizing the number of trees per unit area and diameter class intervals. The De Liocourt's q quotient can be used to assess the relationship between recruitment and mortality in forest communities because when a constant ratio occurs between the classes, it represents that the recruitment rate is similar to the mortality rate and the distribution can be considered as regular or balanced. This study aims to analyze the diametric structure of the arboreal component of a seasonal deciduous forest fragment located in the Peixe River Valley, Midwest of Santa Catarina State, Brazil. The sampled individuals were distributed in diameter classes with an amplitude of 5 cm, in which the center of the first class presented a value of 6.5 cm. Subsequently, the observed and estimated diametric distribution curves were constructed for the overall sampling and for species with the highest importance value (IV) and with different ecological attributes. The study area presented a deficit of trees in the overall and per species diameter classes when compared to a balanced forest. The De Liocourt's q quotient can be used to assess the diametric structure of deciduous forest fragments.


Estudos de estrutura florestal podem ser realizados através da distribuição dos diâmetros de indivíduos dentro de uma população, que é definida pela caracterização do número de árvores por unidade de área e intervalos de classe de diâmetro. O quociente Q de De Liocourt pode ser usado para avaliar a relação entre recrutamento e mortalidade nas comunidades florestais, porque quando uma relação constante ocorre entre as classes, ela representa que a taxa de recrutamento é semelhante à taxa de mortalidade e a distribuição pode ser considerada como regular ou equilibrado. Este estudo tem como objetivo analisar a estrutura diamétrica do componente arbóreo de um fragmento da floresta decidual localizado na região do vale do Rio Peixe, meio-oeste do Estado de Santa Catarina, Brasil. Os indivíduos amostrados foram distribuídos em classes de diâmetro com uma amplitude de 5 cm, no qual o centro da primeira classe apresentou um valor de 6,5 cm. Posteriormente, as curvas de distribuição dos diâmetros observadas e estimadas foram construídas para a amostragem global e para espécies com maiores valores de importância (IV) e com diferentes atributos ecológicos. A área de estudo apresentou déficit de árvores nas classes de diâmetro geral e por espécie em comparação com uma floresta equilibrada. O quociente Q de De Liocourt pode ser usado para avaliar a estrutura diametral dos fragmentos de floresta deciduais.


Subject(s)
Forests , Conservation of Natural Resources , Biodiversity , Ecology
14.
Arq. Inst. Biol ; 86: e0942017, 2019. tab, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-998421

ABSTRACT

Bemisia tabaci has been known in Brazil since 1923, in cotton, soybean, tomato and bean crops, and it leads to economic losses due to the transmission of different viruses. Studies focused on analyzing the incidence of this pest in forest environments remain scarce in the literature. Thus, the aims of the current study were to investigate the incidence of B. tabaci in four Atlantic forest fragments in Rio de Janeiro state, Brazil, as well as to record its hosts in these environments. An area of approximately one hectare was delimited for each Atlantic forest fragment based on images provided by the Brazilian Institute of Geography and Statistics (IBGE). Plants presenting whiteflies were tagged throughout monthly inspections conducted in each forest fragment in order to be checked during the following visits. Collection criteria were adopted to assure sampling standardization in each fragment. The mean number of whiteflies was analyzed through the Kruskal-Wallis non-parametric test, which was followed by Dunn's post-hoc test, both at 5% significance level. The total of 216 collections were conducted and 1,126 B. tabaci fourth-instar nymphs were collected in four Atlantic forest fragments over 24 months. The following hosts were recorded for the first time: Caesalpinia pluviosa Benth, Tradescantia zebrina Linn., Impatiens walleriana Linn., Cupania sp. and Talisia esculenta Klotzsch & O. Berg. The dry period (winter) enabled the increase of B. tabaci populations in the herein investigated forest fragments.(AU)


Bemisia tabaci é conhecida no Brasil desde 1923, relatada em cultivos de algodão, soja, tomate e feijoeiro, promovendo prejuízos econômicos por ser transmissora de viroses. São praticamente inexistentes os trabalhos que analisam sua ocorrência em ambiente florestal. Nesse sentido, o objetivo deste trabalho foi estudar a ocorrência de B. tabaci em quatro fragmentos florestais de Mata Atlântica no estado do Rio de Janeiro, bem como registrar seus hospedeiros nesses ambientes. Em cada fragmento de Mata Atlântica foi demarcada uma área com cerca de um hectare, delimitada com o uso de imagens obtidas do Instituto Brasileiro de Geografia e Estatística (IBGE). Ao longo das inspeções mensais nos fragmentos florestais, os vegetais que apresentavam moscas-brancas foram marcados e inspecionados a toda nova visita. Adotaram-se critérios de coleta para garantir padronização do esforço amostral em todos os fragmentos. A análise do número médio de moscas-brancas foi feita pelo teste não paramétrico de Kruskal-Wallis, com posterior aplicação do pós-teste de Dunn, ambos a 5% de significância. Foram realizadas 216 coletas e capturadas 1.126 ninfas de quarto instar de B. tabaci nos quatro fragmentos de Mata Atlântica ao longo dos 24 meses. Registraram-se, pela primeira vez, os hospedeiros: Caesalpinia pluviosa Benth, Tradescantia zebrina Linn., Impatiens walleriana Linn., Cupania sp. e Talisia esculenta Klotzsch & O. Berg. O período seco (inverno) promove estímulos para o aumento da população de B. tabaci em fragmentos florestais.(AU)


Subject(s)
Forests , Hemiptera , Impatiens , Caesalpinia , Tradescantia
15.
Biota Neotrop. (Online, Ed. ingl.) ; 18(2): e20170395, 2018. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-951159

ABSTRACT

Abstract: Human-modified landscapes (HMLs) are composed by small, isolated and defaunated forest fragments, which are surrounded by agricultural and urban areas. Information on species that thrives in these HMLs is essential to direct conservation strategies in local and regional scales. Since HMLs are dominant in the Atlantic Forest, we aimed to assess the mammalian diversity in a HML in southeastern Brazil and to propose conservation strategies. We collected data of terrestrial (small-, medium- and large-sized) and volant mammals in three small forest fragments (10, 14 and 26 ha) and adjacent areas, between 2003 and 2016, using complementary methods: active search, camera trapping, live-traps, mist nets and occasional records (i.e., roadkills). In addition, we used secondary data to complement our species list. We recorded 35 native mammal species (6 small-sized, 16 medium- and large-sized, and 13 bats) and seven exotic species in the HML. The recorded mammal assemblage (non-volant and volant), although mainly composed of common and generalist species, includes three medium- and large-sized species nationally threatened (Leopardus guttulus, Puma concolor and Puma yagouaroundi) and two data deficient species (Galictis cuja and Histiotus velatus), highlighting the importance of this HML for the maintenance and conservation of mammal populations. Despite highly impacted by anthropogenic disturbances, the study area harbors a significant richness of medium- and large-sized mammals, being an important biodiversity refuge in the region. However, this biodiversity is threatened by the low quality of the habitats, roadkills and abundant populations of domestic cats and dogs. Therefore, we stress the need of conservation strategies focusing on the medium- and large-sized mammals as an umbrella group, which could benefit all biodiversity in the landscape. We recommend actions that promotes biological restoration, aiming to increase structural composition and connectivity of the forest fragments, reducing roadkills and controlling the domestic cats and dogs' populations, in order to maintain and improve the diversity of mammals in long-term.


Resumo: Paisagens antropicamente modificadas (HMLs) são compostas por fragmentos florestais pequenos, isolados e defaunados, imersos em áreas agrícolas e/ou urbanas. Informações sobre as espécies que habitam essas paisagens são importantes para o direcionamento de estratégias de conservação em escalas local e regional. Uma vez que as HMLs são as paisagens dominantes na Mata Atlântica, o objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade de mamíferos em uma HML do sudeste do Brasil e propor estratégias para sua conservação. Foram coletados dados de mamíferos terrestres (pequenos, médios e grandes) e voadores em três fragmentos florestais (10, 14 e 26 ha) e áreas adjacentes, entre 2003 e 2016, usando métodos complementares: busca ativa, armadilhamento fotográfico, armadilhas de captura e redes de neblina. Adicionalmente, foram utilizados dados de literatura para complementar a lista de espécies. Foram registradas 35 espécies de mamíferos nativos (6 de pequenos, 16 de médios e grandes e 13 de morcegos) e sete espécies exóticas. A assembleia de mamíferos registrada (terrestres e voadores), embora composta por espécies generalistas, apresentou três espécies de médio e grande porte ameaçadas de extinção nacionalmente (Leopardus guttulus, Puma concolor and Puma yagouaroundi) e duas deficientes em dados (Galictis cuja and Histiotus velatus), destacando a importância dessa HML para conservação e manutenção das populações de mamíferos. Embora inserida em uma paisagem extremamente modificada, a área de estudo abriga uma riqueza significativa de mamíferos de médio e grande porte, sendo um importante refúgio para a biodiversidade na região. Entretanto, essa biodiversidade está ameaçada pela baixa qualidade dos habitats, por atropelamentos e por abundantes populações de cães e gatos domésticos. Portanto, enfatizamos a necessidade de estratégias de conservação focadas nos mamíferos de médio e grande porte como grupo "guarda-chuva", o que pode beneficiar as demais espécies na paisagem. Recomendamos ações de conservação visando a restauração biológica, para melhorar a composição estrutural e conectividade dos fragmentos florestais, reduzir o número de atropelamentos e controlar as populações de cães e gatos domésticos, afim de manter e aumentar a diversidade local de mamíferos em longo prazo.

16.
São Paulo; s.n; s.n; 2018. 123 p. ilus, graf, tab.
Thesis in Portuguese | LILACS | ID: biblio-998353

ABSTRACT

A tuberculose (TB) é considerada uma das principais doenças infecciosas e apresenta fatores críticos como a relação com o HIV/AIDS, tratamento longo e a resistência a múltiplos fármacos. A enzima di-hidrofolato redutase das micobactérias (mtDHFR) é um alvo pouco explorado e apresenta grande potencial para o desenvolvimento de novos fármacos contra TB. Estudos preliminares obtiveram fragmentos com baixa afinidade à mtDHFR, entretanto com potencial para otimização. Com isso, o fragmento foi usado como protótipo para a proposição de 22 análogos. Os compostos foram planejados utilizando informações sobre ligantes e a estrutura tridimensional de mtDHFR, além do biososterismo como estratégia norteadora. Os ensaios de docking molecular com a mtDHFR revelaram que os análogos propostos tiveram escores interessantes e, além disso, a inserção de substituintes demonstrou favorecer a ligação à enzima, o que corroborou o planejamento. Com isso, sintetizou-se 22 análogos planejados e o protótipo MB872, por meio de protocolos de alquilação, hidrólise e cicloadição 1,3 dipolar para os compostos com anéis triazol e tetrazol. Os compostos foram obtidos com rendimentos de bom a ótimo (60 ~ 90%) e suas estruturas foram elucidadas por RMN 1H e 13C. Os resultados do ensaio de inibição enzimática corroboraram com os dados de docking, uma vez que a presença do grupo carboxílico revelou ser importante para a atividade. Além disso, alguns dos compostos revelaram atividades interessantes, entre 8 a 40 µM, sendo que o mais ativo apresentou IC50 de 7 µM. Ensaios de cinética enzimática com o análogo mais ativo indicou uma inibição não competitiva com o substrato natural da enzima, uma vez que os valores de Km se mantiveram constantes, enquanto Vmax decaiu (0,22 µM e 0,43 - 0,34 ΔFU/min, respectivamente). Os análogos sintetizados foram mandados para ensaio in vitro para avaliar a atividade frente a micobactéria


Tuberculosis (TB) is an important infectious disease and presents critical factors such as the relationship with HIV / AIDS, long treatment and resistance to multiple drugs. The enzyme dihydrofolate reductase from mycobacteria (mtDHFR) is a poorly explored and presents great potential to be a target for new drugs against TB. Preliminary studies have obtained fragments with low affinity to mtDHFR, but with potential to become lead compounds. Therefore, the fragment was used as a prototype for 22 analogues proposed in this work. The compounds were designed using bioisosterism, information about ligands and the three-dimensional structure of mtDHFR. Molecular docking assays with mtDHFR revealed satisfactory scores for anlogues. Furthermore, the insertion of substituents seemed to increase the affinity with the enzyme. Thereby, twenty two analogues and prototype were synthesized using alkylation, hydrolysiss and 1,3-dipolar cycloaddition methods. The compounds were obtained in good yields (60 ~ 90%) and their structures were elucidated with 1H and 13C NMR spectroscopy. The enzymatic affinity assay corroborates docking results, because the presence of carboxyl group showed to be important for the activity. Furthermore, some of the compounds revealead interesting activities, ranging 8 to 40 µM. The most active showed IC50 of 7 µM and enzyme kinetics assays indicated noncompetitive inhibition with natural enzyme substrate. The synthesized analogs were sent for in vitro assay to assess mycobacteria activity


Subject(s)
Process Optimization , Molecular Docking Simulation/instrumentation , Mycobacterium/classification , Tetrahydrofolate Dehydrogenase/analysis , Tuberculosis/pathology , Chemistry, Pharmaceutical/methods
17.
Arq. Inst. Biol ; 85: e0992017, 2018. tab, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-995662

ABSTRACT

Corynespora cassiicola is a cosmopolitan ascomycete widely known as phytopathogen in several crops, and more recently as an emerging pathogen in humans. In this study the genetic variability of 60 isolates of Corynespora cassiicola from different hosts and cities of Amazonas was evaluated, using AFLP molecular markers. Seven genetic groups were identified according to a dendrogram obtained by the Unweighted Pair Group Method using Arithmetical Averages, indicating significant variability among the isolates. Three isolates of different hosts (28, obtained from papaya; 55, obtained from cucumber; and 58, from tomato) remained as single individuals in distinct groups, suggesting marked genetic variation in comparison to the other isolates and possible specificity by the host.(AU)


Corynespora cassiicola é um ascomiceto cosmopolita amplamente conhecido como fitopatógeno em diversas culturas e, mais recentemente, como patógeno emergente em humanos. Na região Norte do Brasil é responsável por perdas significativas em cultivos tanto em casa de vegetação como em campo aberto. Neste estudo foi avaliada a variabilidade genética de 60 isolados de Corynespora cassiicola procedentes de diferentes hospedeiras e municípios do Amazonas, usando marcadores moleculares AFLP. Foram identificados sete grupos genéticos de acordo com dendrograma obtido pelo método de agrupamento UPGMA, indicando significativa variabilidade entre os isolados. Três isolados de diferentes hospedeiras (isolado 28, obtido de mamoeiro; isolado 55, obtido de pepineiro; e isolado 58, proveniente de tomateiro) permaneceram como indivíduos únicos em grupos distintos, sugerindo variação genética marcante em comparação com os demais e possível especificidade pela hospedeira de origem.(AU)


Subject(s)
Fungi/pathogenicity , Noxae , Plant Diseases , Biological Variation, Population
18.
Arq. Inst. Biol ; 85: e0742016, 2018. ilus, tab
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-996666

ABSTRACT

Bovine leukemia virus (BLV) is a member of Retroviridae family, genus Deltaretrovirus, and the main viral agent responsible for economic loses in dairy herds. Some studies have been carried out about BLV genotypes, and at least seven genotypes were found out in samples of different regions of the world. The objective of this study was to identify BLV samples from seropositive dairy cattle in Santa Catarina state, Brazil, using molecular techniques. Blood samples were collected (454) from dairy cattle from 31 different farms, and serology using agar gel immunodiffusion test (AGID) was performed. After that, 191 seropositive samples were submitted to DNA extraction, and in 77 samples the polymerase chain reaction (PCR) for amplification of a 440 bp fragment of the env gene was performed. Nineteen DNA samples were subjected to restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis by digestion of the PCR fragment by five restriction endonucleases - BamHI, HaeIII, Tru9I, TaqI, and MwoI. It was found 42% seropositive animals (191/454) and 68% positives of the farms (21/31). The PCR showed 80.5% (62/77) of animals positive. The RFLP analysis identified five different genotypes dispersed by Santa Catarina state, with the highest prevalence for genotype X (47.4%). Overall, our results identified the viral genotypes present in dairy cattle and the prevalence of new variants in representative farms from Santa Catarina state.(AU)


O bovine leukemia virus (BLV) é um membro da família Retroviridae, gênero Deltaretrovirus, e o principal agente viral causador de perdas econômicas em rebanhos leiteiros. Diversos estudos têm sido feitos sobre os genótipos de BLV, e foram encontrados pelo menos sete em amostras de diferentes partes do mundo. O objetivo deste estudo foi realizar a caracterização molecular de amostras de BLV de bovinos leiteiros soropositivos no estado de Santa Catarina. Foram coletadas 454 amostras de sangue de bovinos de 31 propriedades, e fez-se inicialmente a sorologia por meio do teste de imunodifusão em gel de ágar. Após a sorologia, 191 amostras soropositivas foram então submetidas à extração de DNA, e em 77 amostras se realizou a reação da polimerase em cadeia (PCR), para a amplificação de um fragmento de 440 pb do gene env. Dezenove amostras foram submetidas à análise do polimorfismo dos fragmentos de restrição por digestão do fragmento da PCR por cinco enzimas de restrição: BamHI, HaeIII, Tru9I, TaqI e MwoI. Os resultados obtidos na sorologia apontaram 42% de animais soropositivos (191/454) e 68% de propriedades positivas (21/31). Na PCR, 80,52% (62/77) dos animais apresentaram-se positivos. A análise do polimorfismo dos fragmentos de restrição identificou cinco genótipos circulantes no estado, e a maior prevalência foi observada no genótipo X (47,4%). Este estudo permite-nos conhecer alguns dos genótipos virais presentes em bovinos leiteiros do estado de Santa Catarina, bem como identificar a existência de novas variantes e sua prevalência atual, e os resultados são úteis para futuros estudos epidemiológicos.(AU)


Subject(s)
Cattle , Serologic Tests/methods , Enzootic Bovine Leukosis , Leukemia Virus, Bovine , Milk , Polymerase Chain Reaction/methods , Agribusiness/economics
19.
Article in English | LILACS-Express | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1467199

ABSTRACT

Abstract Dicksonia sellowiana Hook. (Dicksoniaceae) is target of extractive exploitation and is threatened with extinction. We analyzed the population structure, the spatial distribution pattern of D. sellowiana and its relationship with environmental parameters within three fragments of Araucaria Forest in Rio Grande do Sul, Brazil. The fragments are of different sizes, namely, large (H1LF) with 246 ha, medium (H2MF) with 57 ha and small (H3SF) with 5.2 ha. Within each site, 1 ha was delimited, divided into 100 subplots (100 m2), of which 20 were selected with a draw. In each subplot, counting of the individuals, the registration of the caudice height and the coverage of leaves (SC) (m2), measurements of photosynthetically active radiation (PAR), canopy opening degree (CO), soil moisture (SM) and litter thickness (LT). The temperature (T) was measured inside each site. A total of 792 plants were sampled, of which 551 were concentrated in H1LF, 108 in H2MF and 133 in H3SF. An average of 1320 ha-1 individuals were estimated. Of the total including the three fragments, 96.9% of the individuals are in the first class of height (up to 0.8 m), indicating a great potential of population development. The spatial distribution pattern (AI) was aggregated in the three populations and the plants presented a heterogeneous total coverage, between 4.73 m2 (H2MF) and 2,223.47 m2 (H1LF). The highest values of SC and SM were more related to the distribution of individuals in H1LF whereas the opposite was recorded in H2MF. The highest values of PAR, LT and CO correlated with the distribution of D. sellowiana in H3SF. In addition to revealing that the H1LF population is among the most dense in southern Brazil, the results demonstrated a significant structural distinction between the interior populations of the fragments, in spite of them being located near to one another and being part of the same natural field matrix.


Resumo Dicksonia sellowiana Hook. (Dicksoniaceae) é alvo de exploração extrativista e encontra-se ameaçada de extinção. Analisamos a estrutura populacional, o padrão de distribuição espacial de D. sellowiana e sua relação com parâmetros ambientais no interior de três fragmentos de Floresta com Araucária, no Rio Grande do Sul (RS), Brasil. Os fragmentos possuem diferentes tamanhos sendo denominados de grande (H1LF) com 246 ha, médio (H2MF) com 57 ha e de pequeno (H3SF) com 5,2 ha. No interior de cada sítio, foi demarcado 1 ha, fracionado em 100 subparcelas (100m2), das quais 20 foram sorteadas. Em cada subparcela foi feita a contagem dos indivíduos, o registro da altura do cáudice e da cobertura (SC) (m2) das folhas, as medições da radiação fotossinteticamente ativa (PAR), grau de abertura do dossel (CO), umidade do solo (SM) e espessura da serapilheira (LT). A temperatura (T) foi medida no interior de cada sítio. Foram amostradas 792 plantas, das quais 551 concentradas no H1LF, 108 no H2MF e 133 no H3SF e em média foram estimados 1320 indivíduos ha-1. Do total dos três fragmentos, 96,9% dos indivíduos estão na primeira classe de altura (até 0,8 m), indicando grande potencial de desenvolvimento das populações. O padrão de distribuição espacial (AI) foi agregado nas três populações e as plantas apresentaram uma cobertura total heterogênea, entre 4,73m2 (H2MF) e 2.223,47m 2 (H1LF). Os maiores valores de SC e de SM foram mais relacionadas com a distribuição dos indivíduos no H1LF enquanto que o contrário foi registrado no H2MF. Os maiores valores de PAR, LT e de CO relacionaram-se com a distribuição de D. sellowiana no H3SF. Além de revelar que a população do H1LF está entre as mais densas já descritas no sul do Brasil, os resultados demonstraram uma significativa distinção estrutural entre as populações dos interiores dos fragmentos com diferentes tamanhos, embora muito próximos geograficamente e inseridos em uma mesma matriz de campo natural.

20.
Biota Neotrop. (Online, Ed. ingl.) ; 17(3): e20160291, 2017. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-951113

ABSTRACT

Abstract Alocasia macrorrhizos (L.) G.Don grows and proliferates in shaded areas in several forest fragments in urban zones. The adult plant has axils that accumulate rain water (phytotelmata) and serve as breeding sites for several families of aquatic insects. The objective of this study was to determine the composition of the entomofauna associated with water accumulations in axils of A. macrorrhizos in urban areas of Manaus, Brazil. Individuals of A. macrorrhizos were sampled in five forest fragments, between April/2005 and March/2007 in urban areas of Manaus, totaling 184 sampling units. A manual suction hose was used for the removal of entomofauna. A total of 1,941 immatures of Diptera were collected representing the following families: Culicidae (96.5%), Chironomidae (2%), Psychodidae (0.7%), Ephydridae (0.7%) and Corethrellidae (0.1%). Five Culicidae species were identified: Wyeomyia melanocephala Dyar & Knab, 1906 (91.7%), Wy. ypsipola Dyar, 1922 (4.3%), Aedes albopictus (Skuse, 1894) (2.3%), Ae. aegypti (Linnaeus, 1762) (1.5%) and Johnbelkinia longipes (Fabricius, 1805) (0.1%). The members of Culicidae were the most abundant, confirming the importance of this group in communities associated with phytotelmata, with a positive relation to the volume of water (p < 0.05). The occurrence of Ae. aegypti and Ae. albopictus in axils of A. macrorrhizos demonstrates the potential of this Araceae as a breeding site of these medically important species. However, the real contribution of this Araceae in the maintenance and dispersion of populations of these two species of mosquitoes throughout the year should be further studied.


Resumo A. macrorrhizos (Araceae) é cultivada e se prolifera naturalmente em locais sombreados em diversos fragmentos de mata na zona urbana de Manaus. A planta adulta apresenta axilas que acumulam água da chuva (phytotelmata) e servem de criadouro para diversas famílias de insetos aquáticos. O objetivo do trabalho foi conhecer a composição da entomofauna associada às axilas de A. macrorrhizos, na área urbana de Manaus, Amazonas, Brasil. Entre 2005 e 2007, indivíduos de A. macrorrhizos foram amostrados em cinco fragmentos urbanos de mata, totalizando 184 unidades amostrais. Uma mangueira de sucção manual foi utilizada para coletar a fauna associada. Um total de 1.941 imaturos de Diptera foram coletadas, representadas pelas seguintes famílias: Culicidae (96,5%), Chironomidae (2%), Psychodidae (0,7%), Ephydridae (0,7%) e Corethrellidae (0,1%). Foram identificadas cinco espécies de Culicidae: Wyeomyia melanocephala Dyar & Knab, 1906 (91,7%), Wy. ypsipola Dyar, 1922 (4,3%), Aedes albopictus (Skuse, 1894) (2,3%), Ae. aegypti (Linnaeus, 1762) (1,5%) e Johnbelkinia longipes (Fabricius, 1805) (0,1%). Os representantes de Culicidae foram os mais abundantes confirmando a importância desse grupo nas comunidades associadas a fitotelmatas, com relação positiva com o volume de água por planta (p < 0.05). A ocorrência de Ae. aegypti e Ae. albopictus nas axilas de A. macrorrhizos demonstra o potencial dessa Araceae como criadouro para estas espécies de importância médica. Contudo, a real contribuição dessa Araceae na manutenção e dispersão populacional dessas duas espécies de mosquitos ao longo do ano precisa ser melhor estudada.

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