Zero-inflated beta regression model for leaf citrus canker incidence in orange genotypes grafted onto different rootstocks / Modelo de regressão beta inflacionado de zeros para a incidência de cancro cítrico foliar em genótipos de laranja enxertados sobre diferentes porta-enxertos

Data with excess zeros are frequently found in practice, and the recommended analysis is to use models that adequately address the counting of zero observations. In this study, the Zero Inflated Beta Regression Model (BeZI) was used on experimental data to describe the mean incidence of leaf citrus canker in orange groves under the influence of genotype and rootstocks of origin. Based on the model, it was possible to quantify the odds that a null observation to mean incidence comes from a particular plant according to genotype and rootstock, and estimate its expected value according to this combination. Laranja Caipira rootstock proved to be the most resistant to leaf citrus canker as well as Limão Cravo proved to be the most fragile. The Ipiguá IAC, Arapongas, EEL and Olímpia genotypes have statistically equivalent chances.

Dados com excesso de zeros são encontrados muitas vezes na prática, e a análise recomendada é utilizar modelos que suportem adequadamente a contagem de observações nulas. Neste artigo, o Modelo de Regressão Beta Inflacionado de Zeros (BeZI) foi aplicado a dados experimentais para descrever a incidência média de cancro cítrico foliar em pomares de laranja sob a influência do genótipo e do porta-enxerto de origem. Com base no modelo, foi possível quantificar as chances de que uma observação nula para a incidência média seja proveniente de uma determinada planta, de acordo com o genótipo e o porta-enxerto, além de estimar o seu valor esperado conforme essa combinação. O porta-enxerto Laranja Caipira mostrou ser o mais resistente ao cancro cítrico foliar, assim como o Limão Cravo mostrou ser o mais suscetível. Os genótipos Ipiguá IAC, Arapongas, EEL e Olímpia apresentaram chances estatisticamente equivalentes.

Inducen cambios relevantes en las estimaciones de la talla los nuevos procedimientos de construcción de curvas de crecimiento / Do new procedures for estimating growth curves introduce outstanding changes in height estimates

Introducción: El uso de curvas de crecimiento para supervisar el desarrollo físico de los niños es esencial en la práctica pediátrica. Las normas cubanas de talla se elaboraron en la década de los 70 siguiendo procedimientos recomendados en ese momento. En los últimos años se han obtenido métodos estadísticos automatizados capaces de modelar correctamente el proceso del crecimiento. La OMS, en su Estudio Multicéntrico, utilizó el método Box-Cox PowerExponential (BCPE). Es importante determinar si introducir este nuevo procedimiento para construir curvas induce modificaciones en los valores de los perpercentiles que habitualmente se estiman. Objetivo: evaluar las discrepancias entre los valores de los perpercentiles estimados por ambos procedimientos. Material y Métodos: se usaron los datos de longitud en decúbito supino y estatura, de sujetos cubanos menores de 20 años medidos en el primer Estudio Nacional de Crecimiento y Desarrollo (ENCD). Se construyeron curvas usando el método BCPE implementado en el paquete GAMLSS de R. Las diferencias se evaluaron comparando los valores de los perpercentiles suavizados obtenidos por ambos métodos. Resultados: los modelos que mejor ajustaron fueron: para la longitud en decúbito supino, sexo femenino NO (GLµ=10;GLÏ­=5;edad0.001); sexo masculino NO(GLlµ=14;GLÏ­=6;edad0.006); para estatura, sexo femenino NO(GLµ=16;GLÏ­=10;edad0.544); sexo masculino NO(GLµ=16;GLÏ­=12;edad0.117). Las estimaciones de los perpercentiles de estatura fueron muy similares con ambos procedimientos. En los perpercentiles extremos de la longitud en decúbito supino se detectaron diferencias, debidas muy probablemente a correcciones introducidas en el cómputo de la desviación estándar durante el procesamiento del ENCD. Conclusiones: para la longitud en decúbito supino se detectaron diferencias, no así en la estatura. Se recomienda el uso del procedimiento automatizado pues disminuye considerablemente la carga subjetiva presente en el método anterior(AU)

Introduction: The use of growth curves to monitor physical development in children is essential for pediatric health care. Cuban height charts were created during the seventies decade following technics recommended at that time. In the last years, statistical methods based computational technics have been obtained a better model pattern for growth process. In particular WHO in the Multicenter Growth Study used the Box-Cox Power Exponential (BCPE) method. It is important to determine whether the application of such procedure in drawing curves introduce changes in the percentiles' estimates commonly used. Objective: To evaluate discrepancies between percentiles' estimates from both methods. Material and methods: supine-decubitus length data and height from Cubans under 20 years old from the first National Growth and Development Study (ENCD) were examined. Perpercentiles were estimated viEl método BCPE a the BCPE method implemented in GAMLSS' package supported in R language. Comparison of smoothed percentiles obtained from both procedures were plotted to evaluate discrepancies. Results: The best fitted models were: for female supine-decubitus lengths the NO (DFµ=10;DFÏ­=5;age0.001) and NO(DFµ=14;DFÏ­=6;age0.006) for male respectively and NO(DFµ=16;DFÏ­=10;age0.544) and NO(DFµ=16;DFÏ­=12;age0.117) for female and male height. Height percentiles estimates were closely enough using either method. Some differences were detected for length percentiles, possibly due to computational corrections done while calculating standard deviations of ENCD. Conclusions: Some differences were detected for length percentiles estimations but not for the height. The use of computational procedure is recommended because its considerable reduction of the subjective charge as compare with the method used before(AU)

Experiencia en el uso de R para el ajuste de curvas de crecimiento / Using R for adjusting growths curves

La construcción de curvas de crecimiento para dimensiones antropométricas es un proceso engorroso que hasta ahora, en el país, se ha realizado manualmente. Con el objetivo de automatizar este proceso se realizó una actualización del estado del arte de métodos para ajuste de curvas de crecimiento basados en programas de computación. Se presenta una experiencia realizada con datos de circunferencia de cintura de varones entre 8 y 19 años de edad, residentes en Ciudad de La Habana en el año 1998, donde se aplicaron los métodos adoptados por la Organización Mundial de la Salud (OMS) para la elaboración de patrones internacionales de crecimiento. El soporte computacional de dichos métodos se basa en el paquete GAMLSS del proyecto R, software de código abierto y completamente libre(AU)

Child growth curves construction is a tiresome and time consuming process that has been done manually till now in our country. A review of methods for adjusting growth curve was carried out in order to automate this process. Techniques and procedures adopted by the World Health Organization (WHO) for the construction of child growth standards were applied to adjust waist circumference curve for boys from 8 to 19 years old. The methods recommended by WHO rest in the use of the computational package GAMLSS, which was developed in R, free and open source software for statistical computing(AU)