Diferenciación genética de las poblaciones de Felis catus en los municipios de Restrepo y Darién del Valle del Cauca, Colombia / Genetic differentiation of Felis catus populations in the municipalities Restrepo and Darién of Valle del Cauca, Colombia

Los genes implicados en los rasgos del pelaje de los gatos son útiles para el análisis de la estructura genética que presentan sus poblaciones. El objetivo de este trabajo fue determinar si existe diferenciación genética entre las poblaciones de gato doméstico de los municipios de Restrepo y Darién, los cuales se encuentran separados por el "Lago Calima". Para esto se estimaron las frecuencias alélicas de diversos marcadores del pelaje y se determinó si estas poblaciones presentaban diferencias significativas en su estructura génica o si se encontraban en equilibrio Hardy­Weinberg, además, se realizó una comparación con otras poblaciones inventariadas en el Valle del Cauca. Posteriormente, se llevó a cabo un análisis de componentes principales (ACP-Biplot), para conocer la correlación entre las frecuencias alélicas y los aportes de cada una de ellas a la variabilidad. También se realizó una prueba de Mantel para estimar si existía correlación entre los índices de fijación (FST) y las distancias geográficas. La prueba de Mantel mostró que el gen Orange es el único que muestra una correlación positiva entre los índices de diferenciación FST y las distancias geográficas. La comparación de las poblaciones de interés con las del Valle del Cauca, evidenció que los genes que aportaron más a la variabilidad fueron Dilution (19,08%), Long hair (16,09%), Agouti (16,06%) e Inhibitor (14,04%). Sin embargo, se encontró que las poblaciones de Restrepo y Darién tienen perfiles genéticos similiares y se comportan como una sola según los valores del equilibrio Hardy-Weinberg y los FST. Debido a que no hay diferencias significativas entre las poblaciones estudiadas, se concluye que, aunque el Lago Calima sea una barrera geográfica, no tiene un efecto significativo en la diferenciación genética entre las poblaciones de gatos de Restrepo y Darién.

The genes involved in cat coat traits are useful for the analysis of genetic structure within a population. The objective of this paper was to determine if any genetic differences exist among domestic cat populations from the municipalities of Restrepo and Darien, which are separated by Calima Lake. To analyze population structure, we estimated allelic frequencies of several coat markers, tested for alignment with the Hardy-Weinberg equilibrium, and compared our populations of interest to others from the Valle del Cauca region. Subsequently, we performed a principal components analysis (PCA-Biplot) to determine the correlation between allelic frequencies and their contributions to variability. A Mantel test was also used to estimate possible correlation among differentiation indexes (FST) and geographic distances. We performed the Mantel test on the Orange gene and identified a positive correlation among differentiation indexes (FST) and geographical distances. After comparing our populations of interest to others in the Valle del Cauca, we observed that the genes with the greatest contribution to variability were Dilution (19,08%), Long hair (16,09%), Agouti (16,06%) and Inhibitor (14,04%). However, we also found that the Restrepo and Darien populations of interest had similar genetic profiles, and aligned with the Hardy-Weinberg equilibrium, and the FST. Due to the absence of significant differentiation between the populations studied, we conclude that Calima Lake does not have a significant effect on any differentiation between the cat populations of Restrepo and Darien.

Genetic structure of Antioquia Holstein from two SNPs and association with dairy traits / Estructura genética del Holstein Antioqueño a partir de dos SNP y asociación con características lecheras

Objective. Analyze the structure and genetic differentiation of a population of Antioquia Holstein cows from the polymorphisms A192G of INHA and A-320T of FSHR, and explore the association of the genotypic combinations with milk traits. Materials and methods. 1240 lactations of 356 animals from 9 herds in 6 municipalities of Antioquia were analyzed. Genotyping was performed by PCR-RFLP. Structure and genetic diversity parameters were determined using GenAlex software. The association of genotypes combinations with productive and reproductive traits was explored through a linear mixed model. Results. SNP A192G showed a frequency of 0.534 and 0.466 for A and G alleles respectively and SNP A-320T had a frequency of 0.660 far A allele and 0.339 for T allele, this way the population is in HWE. The F ST, F IS and F IT values were 0.059, 0.285 and 0.328 respectively indicating a moderate genetic differentiation between subpopulations. The A-320T SNP showed significant effect on milk yield. Fat and protein percentage, calving interval and services per conception were not affected by these polymorphisms or their interaction. Conclusions. Phenotypic selection made on this population has not been strong enough to generate noticeable changes in allele frequencies of these polymorphisms or deviations from Hardy-Weinberg equilibrium. The interaction of these polymorphisms has no significant effect on the characteristics of zootechnical interest, so its use in programs of molecular marker assisted selection is not recommended.

Objetivo. Analizar la estructura y diferenciación genética de una población de vacas Holstein de Antioquia a partir de los polimorF ISmos A192G de INHA y A-320T de FSHR, y explorar la asociación de las combinaciones genotípicas con características de importancia económica en lecherías especializadas. Materiales y métodos. Se analizaron 1240 lactancias, de 356 animales de 9 hatos en 6 municipios de Antioquia. La genotipificación se realizó mediante PCR-RFLP. Se determinaron parámetros de estructura y diversidad genética utilizando el software GenAlex. La asociación de las combinaciones de genotipos con características productivas y reproductivas se exploró mediante un modelo linear mixto. Resultados. El SNP A192G presentó una frecuencia de 0.534 y 0.466 para el alelo A y G respectivamente y el SNP A-320T tuvo una frecuencia de 0.660 para el alelo A y 0.339 para el alelo T, encontrándose la población en HWE. Los valores F ST, F IS y F IT fueron 0.059, 0.285 y 0.328 respectivamente indicando una moderada diferenciación genética entre subpoblaciones. El SNP A-320T presentó efecto significativo sobre la producción de leche. El porcentaje de grasa, proteína, intervalo entre partos y servicios por concepción no se vieron afectados por los polimorF ISmos o su interacción. Conclusiones. La selección fenotípica realizada sobre esta población no ha sido lo suficientemente fuerte para generar cambios notorios en las frecuencias alélicas de estos polimorF ISmos ni desviaciones del equilibrio de Hardy-Weinberg. La interacción de estos polimorF ISmos no presenta un efecto significativo sobre las características de interés zootécnico por lo cual no se recomienda su uso en programas de selección asistida por marcadores moleculares.

Origen y composición genética de la población cubana / Origin and genetic composition of the Cuban population

Se hace una revisión a partir de la aparición del Homo sapiens en el continente africano y el comienzo de las migraciones hacia diferentes regiones geográficas, que condujeron después a la llegada del hombre primitivo a América y su desplazamiento a través de América del Norte hasta llegar a Sudamérica, y desde aquí a las islas del Caribe. Se comenta cómo influyó la llegada de los españoles sobre las poblaciones indígenas caribeñas y su contribución a la introducción de negros provenientes de las colonias africanas en esta región del mundo. Se analizan diversos trabajos científicos realizados fundamentalmente en Cuba, que demuestran, mediante diferentes marcadores bioquímicos y moleculares, la gran mezcla étnica de la población cubana, constituida sobre todo por blancos caucasoides, negros africanos y mulatos resultantes de la mezcla de ambas poblaciones y, en menor proporción y sin significación evidente, de otras poblaciones como son la china y la indoamericana

A literature review was made on the emergence of Homo sapiens in the African continent and the beginning of migration towards different geographic regions; this led to the arrival of the primitive man to the America and his movement through the North America to South America, and from this place to the Caribbean Islands. The impact of the arrival of Spaniards on the Caribbean native populations and their contribution to the introduction of Black people from the Arican colonies located in this region of the world were also commented on. Likewise, several scientific works mainly carried out in Cuba were analyzed, since they prove the great ethnic admixture of the Cuban population basically made up of Caucasians, African blacks and mulattos; being the latter the result of the mixture of the first two population groups and to a lesser extent of other populations like Chinese and IndoAmerican, but without evident significance