Un desafío terapéutico: la heterorresistencia en Mycobacterium tuberculosis / An emerging problem: heteroresistance in Mycobacterium tuberculosis

Resumen Se considera infección mixta por Mycobacterium tuberculosis (Mtb) a la coexistencia en forma simul tánea y en un mismo paciente de 2 cepas diferentes de Mtb o 2 variantes distintas de la misma cepa. Cuando una de las variantes selecciona mutaciones de resistencia, se denomina heterorresistencia (HTR) monoclonal; en caso de que sean 2 cepas diferentes, una sensible y una resistente (o cepas con diferentes patrones de resistencia), se denomina HTR policlo nal. Se presentan 3 pacientes, HIV/sida, todos con reiterados problemas de adherencia al tratamiento, en los cuales a través de la secuenciación genómica completa de Mtb se diagnosticó HTR monoclonal con coexistencia de 2 variantes de la misma cepa aisladas de muestras de pulmón y ganglios linfáticos, con diferentes perfiles de resistencia en cada uno de los casos. Es importante pensar en la posibilidad de HTR, principalmente en pacientes con múltiples intentos terapéuticos previos y altas poblaciones bacilares, como en el sida avanzado, dado que esta situación compromete potencialmente los resultados del tratamiento al coexistir cepas o variantes de ce pas sensibles y resistentes.

Abstract Mixed infection by Mycobacterium tuberculosis (Mtb) consists in the simultaneous coexistence in the same patient of two different strains of Mtb or 2 different variants of the same strain. When one of the variants selects for resistance mutations, it is called monoclonal heteroresistance (HTR); if there are 2 different strains, one sensitive and one resistant (or with different resis tance patterns), it is called polyclonal HTR. Three cases of HIV/AIDS patients are presented, all with repeated treatment adherence problems, in whom monoclonal HTR was diagnosed through Mtb complete genomic sequentiation with the coexistence of two variants of the same strain isolated from samples from lung and lymph nodes, with different resistance profiles in each case. It is important to consider the possibility of HTR, especially in patients with multiple previous therapeu tic attempts and high bacillary populations, such as in advanced AIDS, since this situation potentially com promises treatment results by coexisting sensitive and resistant variants of a strain (or strains).

Phenotypic and genotypic characterization of oxacillin-susceptible and mecA positive Staphylococcus aureus strains isolated in Uruguay / Caracterización fenotípica y genotípica de cepas de Staphylococcus aureus sensibles a oxacilina y mecA positivas aisladas en Uruguay

Abstract The aim of this study was to characterize phenotypically and genotypically 27 mecApositive Staphylococcus aureus strains with oxacillin MICs of ≤2 g/ml by Vitek 2, isolated indifferent regions of Uruguay. Susceptibility to oxacillin and cefoxitin was studied by gradient dif-fusion, disk diffusion to cefoxitin, and Phoenix and MicroScan systems. PBP2a was determined.SCCmec typing was performed and the isolates were compared by PFGE. Twenty-six isolateswere susceptible to oxacillin; one strain was susceptible to cefoxitin by disk diffusion and 3strains by gradient diffusion. Phoenix and MicroScan panels detected methicillin resistance in25 and 27 strains, respectively. Twenty-six strains tested positive for PBP2a. Twenty-six strainscarried SCCmec V and 24 belonged to pulsotype A. One strain carried SCCmec IV and did notbelong to pulsotype A. Cefoxitin disk diffusion test and PBP2a detection correctly identified 26of these 27 strains as MRSA. PFGE results suggest the dissemination of a cluster of MRSA carryingSCCmec V.

Resumen El objetivo de este estudio fue caracterizar fenotípicamente y genotípicamente 27 cepas de Staphylococcus aureus positivas para mecA y con CIM de oxacilina <2 pg/ml según Vitek 2, obtenidas en diferentes regiones del país. La sensibilidad frente a la oxacilina y la cefoxitina se estudió por difusión en gradiente, por disco-difusión (cefoxitina) y por los sistemas Phoenix y MicroScan. Se analizó la portación de PBP2a, se realizó la tipificación de SCCmec y las cepas se compararon mediante PFGE. Resultaron sensibles a oxacilina por difusión en gradiente 26 cepas; una fue sensible a cefoxitina por disco-difusión y 3 lo fueron por difusión en gradiente. Los sistemas Phoenix y MicroScan detectaron resistencia a meticilina en 25 y 27 cepas, respectivamente. Asimismo, 26 cepas portaban PBP2a y 26 cepas mostraron presencia de SCCmec V, 24 correspondieron al pulsotipo A. Una portaba SCCmec IV y no perteneció al pulsotipo A. La prueba de disco-difusión con cefoxitina y la detección de PBP2a identificaron 26 de 27 cepas como MRSA. La PFGE sugiere la diseminación de un grupo MRSA con SCCmec V. © 2022 Asociación Argentina de Microbiología. Publicado por Elsevier Espana, S.L.U. Este es un artículo Open Access bajo la licencia CC BY-NC-ND (https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/).

Comparación de métodos fenotípico y genotípico en la detección de Staphylococcus aureus meticilino resistente en centros hospitalarios de Pereira / Comparison between phenotype and genotype methods in the detection of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus in Center Hospital of Pereira

Resumen Introducción: Staphylococcus aureus es un importante patógeno, puede causar infecciones leves de piel, hasta enfermedades con compromiso vital. La aparición de Staphylococcus aureus meticilino-resistentes, MRSA; ha aumentado su resistencia antimicrobiana, especialmente a β-lactámicos; dificultando el manejo de las infecciones, aumentando las tasas de morbi-mortalidad, convirtiéndose en un problema de salud pública. La expresión fenotípica de la resistencia suele ser heterogénea, dificultando su detección en el laboratorio por métodos convencionales; lo cual, incrementa los costos en la atención hospitalaria de infecciones por MRSA. Objetivo: Comparar métodos fenotípico y genotípico para la identificación de aislamientos hospitalarios de MRSA en centros hospitalarios de Pereira. Métodos: A partir de aislamientos de S. aureus obtenidos de tres instituciones de salud de alta complejidad clasificadas como A, B y C; se determinó la resistencia a meticilina por concentración mínima inhibitoria en sistemas automatizados y el gen mecA por PCR múltiple. Resultados: La prevalencia fenotípica de MRSA fue 44,4%, la institución A presentó la mayor tasa con 48,65%. La prevalencia genotípica fue 57,4%; en las instituciones A, B y C fue 55,2%, 41,7% y 75%, respectivamente, con diferencia estadísticamente significativa (p<0.05). La sensibilidad y especificidad del método fenotípico fue 99,0% y 94,7%, respectivamente, frente al método gold estándar de la PCR. El índice Kappa fue 0,942 indicando un nivel de concordancia muy bueno entre métodos. Conclusión: La prevalencia de aislamientos MRSA en las instituciones de Pereira fue alta. Los índices de concordancia de los métodos fenotípicos demostraron que son confiables para el diagnóstico de infecciones por MRSA.

Abstract Introduction: Staphylococcus aureus is an important pathogen, can cause mild skin infections, to diseases with compromise vital. The appearance of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus MRSA; It has increased its antimicrobial resistance, especially to β-lactam; hampering the handling of them infections, increasing the rates of morbidity-mortality, becoming a health public problem. The phenotype expression of the resistance tend to be heterogeneous, hindering its detection in the laboratory by conventional methods; which increases costs in the hospital care of MRSA infections. Objective: To compare the phenotypes and genotypes methods for identification of hospital isolates MRSA in Pereira. Methods: From isolates of S. aureus obtained of three high complexity institutions of health classified as A, B and C; determined resistance to Methicillin by minimum inhibitory concentration in automated systems and mecA gene by multiplex PCR. Results: The phenotype prevalence of MRSA was 44.4%, the institution A presented the highest rate with 48.65%. The genotype prevalence was 57.4%; in the institutions A, B and C was 55.2%, 41.7% and 75%, respectively, with difference statistically significant (p < 0.05). The sensitivity and specificity of the phenotype method were 99.0% and 94.7%, respectively, against the gold standard of the PCR method. The Kappa index was 0,942 indicating a very good level of concordance between methods. Conclusion: The prevalence of isolates MRSA in the institutions of Pereira was high. The concordance index of phenotype methods showed that they are reliable for the diagnosis of MRSA infections.

Sensibilidad de Acinetobacter a la colistina evaluada mediante los métodos de predifusión y de concentración inhibitoria mínima: Detección de aislamientos heterorresistentes / Comparative evaluation of the sensitivity of Acinetobacter to colistin, using the prediffusion and minimum inhibitory concentration methods: Detection of heteroresistant isolates

El objetivo de este estudio fue evaluar comparativamente los métodos de predifusión y de concentración inhibitoria mínima para establecer la sensibilidad de aislamientos del complejo Acinetobacter calcoaceticus-baumannii (ABC) a la colistina y detectar a aquellos que presenten heterorresistencia a dicho antibiótico. Se estudiaron 75 aislamientos de ABC recuperados de materiales clínicamente significativos. Se determinó su sensibilidad a la colistina por el método de predifusión y de concentración inhibitoria mínima. Todos los aislamientos resultaron sensibles, con CIM = 2 µg/ml y halos de inhibición en el ensayo de la predifusión = 20 mm. Mediante el método de eficiencia de plaqueo se evaluó la presencia de heterorresistencia a la colistina. Se encontraron 14 aislamientos que originaron colonias heterorresistentes; sus CIM aumentaron en algunos casos en más de 8 veces. Con estas colonias seleccionadas se repitió el ensayo de predifusión. Finalmente se confeccionaron los gráficos de dispersión y se realizaron los análisis de regresión lineal, tanto para el conjunto inicial de todos los aislamientos clínicos como para el subgrupo de los aislamientos resistentes generados durante la evaluación de la heterorresistencia. Se obtuvieron coeficientes de determinación (r²) de 0,2017 y 0,604, respectivamente, lo que indica correlación entre los métodos sólo al evaluar aislamientos preseleccionados por su resistencia a este agente.

The objective of this study is to perform a comparative evaluation of the prediffusion and minimum inhibitory concentration (MIC) methods for the detection of sensitivity to colistin, and to detect Acinetobacter baumanii-calcoaceticus complex (ABC) heteroresistant isolates to colistin. We studied 75 isolates of ABC recovered from clinically significant samples obtained from various centers. Sensitivity to colistin was determined by prediffusion as well as by MIC. All the isolates were sensitive to colistin, with MIC = 2µg/ml. The results were analyzed by dispersion graph and linear regression analysis, revealing that the prediffusion method did not correlate with the MIC values for isolates sensitive to colistin (r² = 0.2017). Detection of heteroresistance to colistin was determined by plaque efficiency of all the isolates with the same initial MICs of 2, 1, and 0.5 µg/ml, which resulted in 14 of them with a greater than 8-fold increase in the MIC in some cases. When the sensitivity of these resistant colonies was determined by prediffusion, the resulting dispersion graph and linear regression analysis yielded an r² = 0.604, which revealed a correlation between the methodologies used.

Staphylococcus aureus e estafilococos coagulase negativosresistentes à vancomicina em um Hospital Universitário Brasileiro / Vancomycin-resistant Staphylococcus aureus and coagulase-negative staphylococci in a Brazilian University Hospital

Infecções hospitalares por Methicillin-Resistant S. aureus (MRSA) e Methicillin-Resistant Coagulase-Negative Staphylococci (MRCoNS) estão entre as mais frequentes mundialmente, justificando um aumento significativo no uso de vancomicina. Com o objetivo de avaliar a presença de estafilococos resistentes aos glicopeptídeos em pacientes em uso terapêutico desse antimicrobiano, internados no Hospital de Clínicas da Universidade Federal de Uberlândia, Uberlândia MG, foi realizado um estudo longitudinal prospectivo incluindo 41 pacientes, 21 adultos e 20 crianças, entre dezembro de 2000 e março de 2002. O monitoramento microbiológico foi realizado por meio de swabs coletados a partir da cavidade bucal e reto e cultivo primário em Ágar Manitol Salgado acrescido de 6 mg/mL de oxacilina. Amostras selecionadas foram testadas quanto à sensibilidade aos glicopeptídeos pelas técnicas de gel difusão e diluição em ágar e a análise de heterorresistência, pela semeadura utilizando inóculo correspondente à escala 0,5 de McFarland (108 UFC/mL) e análise do perfil populacional. Um único paciente, nefropata em programa de hemodiálise apresentou-se colonizado com uma amostra do fenótipo Vancomycin-Intermediate S. aureus (VISA) (CIM = 8 miug/mL) e em doze, foram isoladas amostras de estafilococos heterorresistentes, correspondendo oito hVISA e quatro hVICoNS. O estudo do perfil populacional, confirmou a presença de subpopulações de células resistentes, sendo seis hVISA e duas hVICoNS. A presença de amostras heterorresistentes à vancomicina pode representar um risco potencial no futuro.

Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and Methicillin-resistant Coagulase-negative Staphylococci (MRCoNS) are among the most frequent hospital infections around the world, and are associated with a significant rise in the use of vancomycin. In order to assess the presence of staphylococci resistant to glycopeptides in patients taking this antibiotic in Uberlândia Federal University Hospital, Uberlândia (MG, Brazil), a prospective longitudinal study of 41 patients (21 adults and 20 children) was performed between December 2000 and March 2002. Microbiological monitoring was carried out by means of swabs collected from the oral cavity and rectum, screened by culturing in Salt Mannitol Agar plus 6 ?g/mL oxacillin. Selected samples were tested for susceptibility to glycopeptides, by the techniques of gel diffusion and dilution in agar, and for heteroresistance, by seeding with an inoculum at a density of 0.5 on the McFarland scale (108 CFU/mL) and performing a population analysis profile (PAP). A single nephropathy patient was colonized with a strain of vancomycin intermediate S. aureus (VISA) phenotype (MIC = 8 miug/mL). In twelve patients, heteroresistant staphylococci were isolated, corresponding to eight hVISA and four hVICoNS. The PAP study confirmed the presence of six hVISA and two hVICoNS. The presence of heteroresistant vancomycin samples may pose a potential risk in the future.