Modelo molecular teórico del receptor serotoninérgico 5HT2A acoplado a proteína G / Theoretical molecular model of the G protein-coupled 5HT2A serotonergic receptor / Modelo molecular teórico do receptor serotoninérgico 5-HT2A acoplado à proteína G

Objetivo. Construir un modelo molecular teórico de la estructura terciara del receptor 5HT2A de Homo sapiens a partir de estructurasobtenidas experimentalmente como plantillas. Materiales y métodos. Para la realización del modelo teórico se contempló el protocoloestablecido por Ballesteros y Weinstein para la construcción del receptor acoplado proteína G, por medio de alineamiento de la secuenciade aminoácidos, perfiles de hidrofobicidad, refinamiento de bucles por restricciones espaciales, y minimización de energía con el campode fuerza OPLS_2005. Resultados. El modelo obtenido fue validado por el gráfico de Ramachandran con un 91,7% de aminoácidosdentro de los límites establecidos para ángulos phi y psi, y un RMSD de 0,95 Å con respecto a rodopsina de bovino. Conclusiones. Seobtuvo un modelo teórico validado, útil para realización de estudios de acoplamiento ligando-receptor...

Objective Build a theoretical molecularmodel of the tertiary structure of the Homo sapiens 5HT2A receptor from experimentally obtained structures as templates. Materialsand methods In the construction of the theoretical model we considered the protocol established by Ballesteros and Weinstein for theconstruction of the G-protein coupled receptor, by the alignment of the amino acid sequence, hydrophobicity profiles, refinement ofloops by spatial restrictions and energy minimization with the force field OPLS_2005. Results The resulting model was validated bythe Ramachandran plot with 91.7% of amino acids within the limits set for angles phi and psi and a RMSD of 0.95 Å with respect tobovine rhodopsin. Conclusions We obtained a validated theoretical model useful in studies of ligand-receptor docking...

Objetivo. Construir um modelo molecularteórico da estrutura terciária do receptor 5HT2A de Homo Sapiens, com estruturas obtidas experimentalmente como moldes. Materiaise métodos. Para a elaboração do modelo teórico se utilizou o protocolo estabelecido por Ballesteros e Weinstein para a construção doreceptor acoplado à proteína G, por intermédio de alinhamento da seqüência de aminoácidos, perfis de hidrofobicidade, refinamento debucles por restrições espaciais e minimização da energia com o campo de força OPLS_2005. Resultados. O modelo obtido foi validadopelo gráfico de Ramachandran com 91,7% dos aminoácidos dentro dos limites estabelecidos para os ângulos phi e psi, e um RMSD de0,95 Å com respeito à rodopsina de bovino. Conclusões. Obteve-se um modelo teórico validado, útil para a realização de estudos deacoplamento ligante-receptor...

Hydrophobicity test in mutans Streptococci

Kinetic hydrophobic measurements were performed by confronting 40 mutans streptococci from thirty 10- to 20-year-old patients with 200 ml hexadecane (Sigma). Fourteen patients had high dental caries risk (Group A), dmft + DMFT >5 with 3 or more active caries, and 16 had low dental caries risk (Group B), dmft + DMFT <3 without active caries. Twenty bacteria from Group A and 20 bacteria from Group B were typed using De La Higuera's procedure and confirmed by API strip (bio- Merieux). From the 14 patients in Group A we obtained 12 S. mutans (8 hydrophobic/ 4 non-hydrophobic), 5 S. sobrinus (4 hydrophobic/ 1 non-hydrophobic) and 3 S. rattus (hydrophobic). From the 16 patients in Group B we obtained 11 Streptococcus mutans (10 non-hydrophobic/ 1 hydrophobic), 7 Streptococcus sobrinus (6 non-hydrophobic/ 1 hydrophobic) and 2 Streptococcus rattus (hydrophobic). Patients with high dental caries risk have a higher prevalence of hydrophobic bacteria than patients with low dental caries risk (p=0.0003). All typed S. rattus were hydrophobic.

Con el objeto de evaluar una posible relacion entre hidrofobicidad y caries dental, se estudiaron 40 cepas de Streptococcus grupo mutans provenientes de 30 pacientes de entre 10 y 20 anos, 14 pacientes con tres o mas caries activas e indice ceod mas CPOD > 5 (Grupo A) y 16 pacientes sin caries activas, con ceod mas CPOD < 3 (Grupo B). Las cepas fueron aisladas a partir de muestras de saliva en AMS-BT y tipificadas por pruebas bioquimicas y API-strep realizandose la medicion cinetica de hidrofobicidad, enfrentandolas con 200 ml de hexadecano (Sigma). En el grupo A se caracterizaron 12 cepas Streptococcus mutans: 8 hidrofobicas y 4 no hidrofobicas, 5 cepas de Streptococcus sobrinus: 4 hidrofobicas y 1 no hidrofobica y 3 cepas Streptococcus rattus hidrofobicas. En el grupo B, se caracterizaron 11 cepas de S. mutans, 10 no hidrofobicas y 1 hidrofobica, 7 cepas de S. sobrinus: 6 no hidrofobicas y 1 hidrofobica y 2 cepas de S. rattus hidrofobicas. Todos los pacientes del grupo A presentaron al menos 1 cepa hidrofobica. En las cepas aisladas de estos pacientes se demostro la existencia de una alta prevalencia de Streptococcus grupo mutans con caracteristicas hidrofobicas p=0,0003. Estos resultados indicarian la relacion entre la capacidad de adherencia a hexadecano y caries activa. Todas las cepas tipificadas como S. rattus fueron hidrofobicas independientemente del grupo de origen.

Biofilm formation by Stenotrophomonas maltophilia isolates from device-associated nosocomial infections / Formación de biopelículas por aislamientos de Stenotrophomonas maltophilia recuperados de infecciones nosocomiales asociadas al uso de dispositivos médicos

Medical devices are often colonized by bacteria which may cause severe infections. The aim of this work was to evaluate biofilm formation by S. maltophilia isolates from device-associated nosocomial infections. The 13 local isolates exhibited different capacities of biofilm formation on hydrophilic and hydrophobic surfaces. All isolates formed strong biofilms in polystyrene microplates, while strong, moderate or weak biofilms were detected in borosilicate (BS) or polypropylene (PP) tubes. The proficiency of biofilm formation was better evaluated by the level of crystal violet staining expressed relative to the final culture density. The microscopic analysis of biofilms formed on glass coverslips revealed the presence of a matrix of exopolysaccharides and microcolonies typical of biofilm architecture. Isolates with increased adhesion to BS showed larger microcolonies. According to our results, twitching correlated well with attachment to the three abiotic surfaces tested, while swimming only showed a slight correlation with biofilm formation on PP. Poor correlation was observed between cell surface hydrophobicity and biofilm formation. One of the highest biofilm-producing isolates adhered to urethral catheters of different materials, and exhibited an increased resistance to oxidative stress, one of the common stresses encountered by bacteria during the infection process due to the immune response.

El objetivo de este trabajo fue evaluar la formación de biopelículas por parte de aislamientos de Stenotrophomonas maltophilia. Los 13 aislamientos locales evaluados mostraron diferente capacidad de formar biopelículas en superficies hidrofílicas e hidrofóbicas. Todos ellos formaron biopelículas fuertes en microplacas de poliestireno (PS), mientras que se observaron biopelículas fuertes, moderadas o débiles en tubos de borosilicato (BS) o polipropileno (PP). La medida del cristal violeta unido a la biopelícula expresada en función de la densidad final de los cultivos permitió una mejor evaluación de la eficiencia de formación de biopelículas. El análisis microscópico de biopelículas formadas sobre cubreobjetos mostró la presencia de una matriz de exopolisacáridos y microcolonias típicas de la arquitectura de las biopelículas. Los aislamientos con mayor adhesión a BS mostraron microcolonias de mayor tamaño. La motilidad asociada a superficies ( twitching) presentó buena correlación con la adhesión a BS, PP y PS, mientras que la motilidad asociada a flagelos solo correlacionó ligeramente con la adhesión a PP. La correlación entre la hidrofobicidad de la superficie bacteriana y la formación de biopelículas fue escasa. Uno de los aislamientos productores de biopelículas fuertes evidenció capacidad de adhesión a catéteres uretrales de diferentes materiales y mayor resistencia al estrés oxidativo.

Síntesis y caratterización de fases estacionaris mesoporosas mediante pruebas cromatográficas y relaciones cuantitativas estructura-retención / Synthesis and characterization of mesoporous stationary phases using chromatographic tests and quantitative structure-retention relatinnships

En este trabajo se describe la síntesis, funcionalización y evaluación cromatográfica de tres sílicas mesoporosas con propiedades fisicoquímicas diferentes. Los materiales son preparados de acuerdo con métodos ya establecidos, que conducen a partículas isomórficas de tamaño micrométrico, y se modifican químicamente mediante un procedimiento clásico de silanización con octildimetilclorosilano seguido por silanización secundaria o end-capping con trimetilclorosilano. La prueba de Galushko y las relaciones cuantitativas estructura retención (RCER) son implementadas para la evaluación cromatográfica. Con el fin de realizar un estudio comparativo, los parámetros obtenidos se confrontan con los reportados en la literatura para cinco columnas comerciales. Aunque el comportamiento cromatográfico es el esperado para fases octil ligadas, los nuevos materiales presentan una mayor hidrofobicidad e inactividad química si se les compara con las columnas tradicionales. La asimetría observada para los picos es atribuida a irregularidades en el empaque debido a una mayor dispersión en el tamaño y la morfología de partícula.

In this work the synthesis, functionalization and chromatographic evaluation of three mesoporous silicas with different physical chemistry properties are described. The materials were prepared, as isomorphic micrometric particles, according to established methods and they were chemically modified by a classic procedure of silylation with octyldimethylchlorosilane followed by secondary silylation or end-capping. Galushko’ s test and quantitative structure-retention relationships were implemented for the chromatographic evaluation. A comparative study was done by comparing the parameters obtained with those reported in literature for five commercial columns. Although the chromatographic behavior is the expected for octyl phases, the new materials show larger hydrophobicity and chemical inactivity when compared with traditional columns. The asymmetric behavior of the peaks is attributed to packing irregularities due to a larger dispersion in particle size and morphology.