Identification of the Salivary Microbiota of Patients with Oral Cancer in Antofagasta- Chile by Molecular Diagnosis of the 16S rRNA Gene / Identificación de la Microbiota de Saliva de Pacientes con Cáncer Oral de Antofagasta por Diagnóstico Molecular del Gen ARNr 16S

ABSTRACT: Oral cancer, is part of several cancers that affect head and neck, and that according to numerous studies shows an increase of approximately 3-5 % of all cancers. In the last 10 years there has been an increased interest in saliva for its use as a diagnostic tool, due to its easy access, and non-invasive sample collection, unlike blood samples. Studies of metagenomics to the microbiota of oral cancer patients have shown the presence of some groups in greater proportion, it is postulated that they could be used as markers especially in the saliva of these patients. In Antofagasta the number of patients with this type of cancer increases each year. However, there are no studies on the changes that affect the oral microbiota in these patients. The objective of this study is to contribute to the knowledge of the microbiota present in the saliva of patients with oral cancer in the region of Antofagasta, limiting this study exclusively to the group of cultivable anaerobic bacteria. The strains identified are related to the group of Streptococcus mitis / oralis, S. anginosus and S. gordoni, only one strain is grouped near the cluster that includes S. australis and S. parasanguinis. 36.4 % of the molecularly identified isolates, are closely related to the S. anginosus species described in the literature in oropharyngeal tumors. The same percentage is obtained for the taxa related to the cluster that includes S. mitis, proposed in other studies as a diagnostic indicator in subjects with oral squamous cell carcinoma.

RESUMEN: El de cáncer oral, es parte de un grupo de cáncer que afecta cabeza y cuello, y que según demuestran numerosos estudios va en aumento corresponde aproximadamente al 3-5 % de todos los cánceres. En los últimos 10 años la saliva ha aumentado su interés para su uso como diagnóstico debido a su fácil acceso y recolección no invasiva, a diferencia la sangre. Estudios de metagenómica a la microbiota de pacientes con cáncer bucal han demostrado la presencia de algunos grupos en mayor proporción, se postula que podrían ser utilizados como marcadores especialmente en la saliva de estos pacientes. En Antofagasta el número de pacientes con este tipo de cáncer aumenta cada año, sin embargo no hay estudios sobre los cambios que afectan a la microbiota bucal de estos pacientes. El objetivo de este estudio es contribuir al conocimiento de la microbiota presente en la saliva de los pacientes con cáncer bucal en la región de Antofagasta acotando este estudio exclusivamente al grupo de bacterias anaerobias cultivables. Las cepas identificadas se relacionan con el grupo de Streptococcus mitis/oralis, S. anginosus y S. gordoni, sólo una cepa se agrupa cerca del cluster que incluye a S. australis y S. parasanguinis. Un 36,4 % de los aislados identificados molecularmente se relacionan cercanamente a la especie S. anginosus descrita en la bibliografía en tumores orofaríngeos y el mismo porcentaje se obtiene para los taxones relacionados al cluster que agrupa a S. mitis, propuesto en otros estudios como indicador diagnóstico en sujetos con carcinoma oral de células escamosas.

Monitoramento microbiológico da água de bicas em parques públicos de Curitiba (PR) / Microbiological monitoring from fountains in public parks in Curitiba (PR), Brazil

RESUMO Nascentes localizadas em locais públicos, como praças e parques, frequentemente são utilizadas pela população como fonte alternativa de água, o que pode colocar em risco a saúde pública quando não há qualidade adequada para consumo. O objetivo deste trabalho foi avaliar a água das bicas localizadas em três parques públicos da cidade de Curitiba, Paraná. O monitoramento foi realizado mensalmente por meio de de análises microbiológicas de coliformes totais (CT), Escherichia coli (EC) e bactérias heterotróficas (BH), e tomadas de pH, com coletas em triplicata durante um ano em três pontos: Parque Atuba (A), Parque Gutierrez (B) e Parque São Lourenço (C). Os resultados mostraram contaminação por CT no ponto A, em B foi observado presença em níveis elevados em todas as coletas de CT(log 2,4350±0,6730 NMP.100 mL-1), EC (log 1,0890±0,6327 NMP.100 mL-1) e BH (log 1,9170±0,6920 UFC.mL-1), não sendo observadas diferenças significativas entre os períodos de coleta (p>0,05). Foi evidenciado que nos períodos chuvosos a condição de potabilidade da água decaiu em todos os pontos avaliados, com aumento significativo na contagem de CT seguido pelo acréscimo de BH, sugerindo infiltração nas nascentes canalizadas. A presença constante de EC no ponto B sugere contaminação por esgoto, o que pode colocar em risco a saúde das pessoas que consomem a água disponível nas bicas.

ABSTRACT Water sources in public places like parks and squares are often used by people as an alternative for available water, which might be a public health concern when there is no adequate quality for consumption. The aim of this study was to evaluate the water quality from the fountains located in three public parks in Curitiba, Paraná, Brasil. The monitoring was conducted monthly by microbiological analysis of total coliforms (TC), Escherichia coli (EC) and heterotrophic bacteria (HB) and the pH was taken, with triplicate samples during a year at three sites: Atuba Park (A), Gutierrez Park (B) and São Lourenço Park (C). The results showed TC in site A; at B it was observed the presence, at high levels, of TC (log 2.4350± 0.6730 NMP.100 mL-1), EC (log 1.0890±0.6327 NMP.100 mL-1) and HB (log 1.9170±0.6920 UFC.mL-1), significant differences among sampling periods were not observed (p>0.05). It was observed that in the rainy season the condition of water portability decreased in all evaluated sites with a significant increase in TC, followed by increasing of HB, suggesting infiltration in the channeled sources. The presence of E. coli in site B suggests wastewater pollution, which can endanger the health people consuming the available water in the taps.

Alterações microbianas e químicas de um gleissolo sob macaubeiras nativas em função da variação sazonal e espacial / Microbial and chamical changes in gleysol under native macauba palms by the spatial and seasonal variations

A macaúba (Acrocomia aculeata) é uma alternativa para a produção de biodiesel e, consorciada com pastagem, pode auxiliar na recuperação de áreas degradadas. O objetivo deste trabalho foi estudar as alterações nos atributos microbiológicos, na matéria orgânica e no N total do solo, em função da variação sazonal e espacial em um Gleissolo sob maciço de macaubeiras nativas, no Cerrado. O estudo observacional foi realizado na região de Planaltina de Goiás, na Fazenda Agropecuária Santa Fé. Foram selecionadas dez árvores em uma mata com macaubeiras nativas no bioma cerrado. A coleta de solo foi realizada na camada de 0 a 10 centímetros de profundidade, sob uma linha horizontal, imaginária, traçada a partir da base do caule das macaubeiras. As amostras de solo foram coletadas a 50, 150 e 250 centímetros de distância do caule da palmeira, durante o verão chuvoso (março de 2010) e inverno seco (julho 2010). Para a avaliação estatística das variáveis observadas, utilizou-se um modelo misto. As médias das variáveis observadas foram submetidas a testes para verificar se seguiam a distribuição normal, e a homogeneidade de variâncias. Em seguida, os dados foram submetidos ao teste F e as médias foram comparadas pelo teste t. Os atributos carbono microbiano (Cmic), respiração basal (RB), quociente metabólico (qCO2), a matéria orgânica do solo (MOS) e a relação C/N do solo são sensíveis à variação sazonal e espacial em mata de macaubeiras no Cerrado. O nitrogênio total (NT) foi sensível à variação espacial. A microbiota presente no solo sob macaubal se manteve mais equilibrada durante o período seco, apresentando maiores teores de carbono microbiano e quociente microbiano e menor quociente metabólico e relação C/N do solo.

Macauba palm (Acrocomia aculeata) is an alternative for biodiesel production and intercropped with pastures, can be used to recover degraded areas. The aim of this paper was to study the alterations of microbial and soil organic matter and total N, in function of sazonal and spatial variation of a Gleysol, under native macauba palms (Acrocomia aculeata). This observational study took place in Santa Fe Agropecuaria farm, in the region of Planaltina de Goias, State of Goias. Ten trees were selected from a native forest containing macauba palms. Soil samples were then taken at a depth of 0 - 10 cm from a horizontal imaginary line, drawn from the macauba`s palm trunk. Soil samples were taken from a 50, 150 and 250 cm distance from the trunk, during the wet summer (March, 2010) and the dry winter (July, 2010). The mixed model was used in order to evaluate the observational study. The observational means were submitted to testing to evaluate if their values followed a normal distribution and to test homogeneity of variance. Subsequently, data were submitted to the F-test and the means were compared using the t-test. The Cmic, RB, qCO2 and the MO and soil C/N have been found to be sensitive to seasonal and spatial variation in the native forest of macauba palms, in the Cerrado. The NT showed to be sensitive to spatial variation. The microbiota present in the soil under macauba palms was more efficient and maintained a higher equilibrium during the dry winter, presenting higher values of Cmic and Cmic:Corg, and lower values of qCO2 and soil C/N ratio.

Calidad bacteriológica de aguas en piscinas públicas y privadas de la ciudad de Cumaná, estado Sucre, Venezuela / Bacteriological quality of water of public and private pools of the city of Cumaná, Sucre state, Venezuela

Para evaluar la calidad bacteriológica de aguas de piscinas en la ciudad de Cumaná, estado Sucre, Venezuela, se recolectaron muestras de agua en 1 piscina pública y 4 privadas, codificadas de la A a la E; se tomaron 2 muestras semanales durante 2 meses, antes y después de la limpieza. Se determinó pH, temperatura y cloro residual; los aerobios mesófilos por contaje en placas, el Número Más Probable (NMP) para coliformes totales (CT) y fecales (CF) e identificación bacteriana por métodos convencionales. El pH osciló entre 6,8 y 7,3, la temperatura de 29 a 31ºC y el cloro residual de 0,3 a 0,5 mg/L. El contaje más elevado de bacterias mesófilas se obtuvo en B con 6x10 2 UFC/mL, y el más bajo en C con 3x10 2 UFC/mL. En relación al NMP, antes de la limpieza, el valor más alto se obtuvo en D con 2,8x10 3 CT/100 ml; E mostró el valor más alto de CF /100 ml. Después de la limpieza B mostró el valor más alto de CT ubicándose en 9,3mLx10 2 y los valores más alto de CF para D y E en 3x10 2 . Los valores de CF antes y después de la limpieza superan lo establecido por la normativa Venezolana (0 NMP/100mL). Estadísticamente, no se evidenciaron diferencias significativas entre las piscinas para CT y CF antes y después de la limpieza. Las bacterias Gramnegativas predominaron, en E (84,21%) y B (71,92%), Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli y Pseudomonas aeruginosa. A presentó mayor número de aislados Grampositivos (44,44%), identificándose Staphylococcus epidermidis y Enterococcus faecalis. Estos resultados indican una constante contaminación bacteriana y riesgo sanitario.

To evaluate the bacteriological quality of water pools in the city of Cumaná, Sucre state, Venezuela, water samples were collected in 1 public and 4 private pools, coded A to E, respectively, 2 samples were taken weekly for 2 months before and after a pool cleaning process. We determined pH, temperature and residual chlorine, aerobic mesophilic for total plate count, the Most Probable Number (MPN) for total coliforms (TC) and fecal (FC) and bacterial identification by conventional methods. The pH in the samples ranged between 6.8 and 7.3, temperature of 29 to 31ºC and chlorine residual of 0.3 to 0.5 mg/L The highest count of aerobic mesophilic bacteria was obtained in B with 6x10 2 . CFU/mL. In relation to the MPN, before cleaning, the CT highest value was obtained in D with 2.8 x10 3 and CT/100mL, E showed the highest CF value with 6x10 2 CF/100mL. After cleaning, the results for B indicated the CT highest values, 9.3 x10 2 CT/100mL, and in D and E the results had the CF highest values, 3x10 2 CF/100 mL. CF values in the samples before and after cleaning exceed the standards established by Venezuela (0 NMP/100mL). Statistically, no significant differences were found between pools for CT and CF before and after cleaning. Gram-negative bacteria predominated, being more frequent in E (84.21%) and B (71.92%), mainly, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli and Pseudomonas aeruginosa. Sample A had more isolated Gram-positive (44.44%), identified as Staphylococcus epidermidis and Enterococcus faecalis. These results indicate a constant bacterial contamination and health risk.