Infección con Toxoplasma gondii (Eucoccidiorida: Sarcocystidae) en murciélagos de Campeche y Yucatán, México

Toxoplasma gondii es un protozoario parásito reconocido como el agente causal de la toxoplasmosis, enfermedad zoonótica que afecta a humanos y animales domésticos o silvestres. En México, representa un problema de salud pública y veterinaria, sobre todo en regiones con climas tropicales y subtropicales. Los murciélagos han sido identificados como hospederos accidentales en el ciclo de transmisión; no obstante, en México no existe información previa; por lo tanto, el objetivo del presente estudio es reportar la infección con T. gondii en murciélagos capturados en sitios de los estados de Campeche y Yucatán, México. Se capturaron murciélagos en dos sitios de Yucatán y uno de Campeche, ubicados en la Península de Yucatán. Se recolectaron riñones, bazo e hígado y se emplearon en la extracción de ADN total. La infección con T. gondii se detectó a través de la amplificación de un fragmento del gen B1, utilizando PCR anidada. Los productos positivos fueron purificados y enviados a secuenciación para su posterior análisis de alineamiento; adicionalmente, se construyó un árbol filogenético. Se analizaron un total de 69 murciélagos pertenecientes a ocho especies distintas: 41 (59.4 %, 41/69) Artibeus jamaicensis; seis (8.7 %, 6/69) Pteronotus parnellii; seis (8.7 %, 6/69) Noctilio leporinus; seis (8.7 %, 6/69) Chiroderma villosum; cuatro (5.8 %, 4/69) Glossophaga soricina; dos (2.9 %, 2/69) Carollia sowelli; dos (2.89 %, 2/69) Artibeus lituratus y dos (2.9%, 2/69) Rhogeessa aeneus. La PCR anidada identificó ocho (11.6 %, 8/69) murciélagos positivos a la infección: seis (75 %, 6/8) A. jamaicensis, capturados en X'matkuil y Panabá, un (12.5 %, 1/8) G. soricina y un (12.5 %, 1/8) C. villosum, ambos capturados en Panabá. El análisis de alineamiento arrojó 99-100 % para cobertura y 97-99 % para identidad respecto a secuencias de T. gondii. Nuestros resultados aportan al entendimiento del ciclo de transmisión de T. gondii en la región; sin embargo, son necesarias investigaciones futuras para determinar los genotipos circulantes, ya que estudios anteriores han demostrado que estos animales pueden estar infectados con genotipos identificados en otros animales domésticos o silvestres e incluso en humanos.

Toxoplasma gondii is a protozoan parasite recognized as the causative agent of toxoplasmosis, a zoonotic disease that affects humans and domestic or wild animals. In Mexico, it represents a public and animal health problem, especially in regions with tropical and subtropical climates. Bats have been reported as accidental hosts in the transmission cycle; however, there is no preceding information in Mexico. Therefore, the aim of the present study is to report the T. gondii infection in bats captured in sites of Campeche and Yucatan states, Mexico. Bats were captured in two sites in Yucatan (X'matkuil and Panaba) and one in Campeche (Hampolol), located in the Yucatan Peninsula. Kidneys, spleen, and liver were collected and used in the total DNA extraction. Toxoplasma gondii infection was detected through the amplification of a B1 gene fragment, using nested PCR. The positive PCR products were purified and sent to sequencing for a posterior sequence identity analysis. Additionally, a phylogenetic tree was made. A total of 69 bats belonging to eight different species were processed: 41 (59.4 %, 41/69) Artibeus jamaicensis; six (8.7 %, 6/69) Pteronotus parnellii; six (8.7 %, 6/69) Noctilio leporinus; six (8.7 %, 6/69) Chiroderma villosum; four (5.8 %, 4/69) Glossophaga soricina; two (2.9 %, 2/69) Carollia sowelli; two (2.89 %, 2/69) Artibeus lituratus; and two (2.9 %, 2/69) Rhogeessa aeneus. The nested PCR identified eight (11.6 %, 8/69) infected bats: six (75 %, 6/8) A. jamaicensis, captured in X'matkuil and Panaba, one (12.5 %, 1/8) G. soricina, and one (12.5 %, 1/8) C. villosum, both captured in Panaba. The alignment analysis yielded 99-100 % for cover and 97-99 % for identity to T. gondii sequences. Our results contribute to the understanding of the T. gondii transmission cycle in the region; however, future research is needed to determine circulating genotypes, as previous studies have demonstrated that these animals might be infected with identified genotypes in other domestic or wild animals and even in humans.

El componente racial influencia la resistencia a la infección con el virus de la leucosis bovina / The racial component influences resistance to infection with the bovine leukemia virus

RESUMEN El virus de la leucosis bovina (VLB) es un retrovirus que afecta principalmente el ganado lechero, reduciendo la producción de leche entre el 2,5 y 5%. La raza criolla colombiana Blanco Orejinegro (BON) es una raza rustica, bien adaptada, que ha mostrado resistencia in vitro a las infecciones ocasionadas por los virus de la fiebre aftosa y la estomatitis vesicular, así como las originadas por la bacteria Brucella abortus. El objetivo del presente estudio fue determinar si la raza BON y su cruce con Holstein son resistentes a la infección por el VLB. Se tomaron 124 muestras de sangre (59 Holstein, 40 BON y 25 BON x HOL) del mismo hato, se extrajo el DNA y se realizó una PCR-anidada correspondiente a una región del gen env de VLB. Se obtuvo un fragmento de 444 pb en los animales positivos. La prevalencia molecular del hato fue 33% para VLB. Se encontró diferencia significativa para infección por VLB entre los tres grupos raciales (p < 0,05). El porcentaje de infección fue del 55,9% para la raza Holstien, 5% para las vacas BON y 24% para el cruce BON x HOL; este último presentó una reducción en el porcentaje de infección del 32% respecto a la raza Holstein, lo cual puede ser atribuido a la presencia de genes de resistencia en la raza BON. Se comprobó que el nivel de infección es menor en vacas lecheras del cruce BON x HOL que en la raza lechera Holstein.

ABSTRACT The bovine leukemia virus (BLV) is a retrovirus that primarily affects dairy cattle, reducing milk production between 2.5 and 5%. The Colombian Blanco Orejinegro (BON) is a well-adapted, rustic, creole breed resistant to in vitro infections of Foot-and-mouth disease virus and vesicular stomatitis virus, as well as to Brucella abortus. This study aimed to determine if the crossing of BON and Holstein breeds is resistant to infection by BLV. Blood samples of 124 individuals (59 Holstein, 40 BON, and 25 BON x HOL) of the same herd were taken. The DNA was extracted, and a nested PCR was performed related to a region of the env gene of BLV. A fragment of 444 bp was obtained for positives animals. The molecular in-herd prevalence was 33% for BLV. A significant difference for BLV infection was found among the groups (p<0.05). The infection rate for the Holstein group was 55.9%, for BON cattle 5%, and for BON x HOL cattle 24%. The latter showed a reduction in the infection rate of 32% to the Holstein breed, which can be attributed to the presence of resistance genes in the BON breed. It was found that the level of infection is lower in BON x HOL cattle in contrast with Holstein dairy cows.

Estandarización de una técnica de RT-PCR anidada para detección de alfavirus / Standardization of a nested RT-PCR technique for alphavirus detection

El género Alphavirus está constituido por virus de ARN de los cuales, varias especies son causantes de enfermedades humanas y animales como los virus chikungunya, Mayaro y los virus de encefalitis equinas, por lo que son considerados un problema de salud pública a nivel regional. En Paraguay han sido reportadas infecciones humanas por chikungunya pero son necesarios más estudios para ampliar conocimientos sobre circulación y ecoepidemiología de los alfavirus. La transcripción reversa de ARN seguida de una reacción en cadena de la polimerasa (RT-PCR) anidada es de gran utilidad como herramienta diagnóstica y en la vigilancia epidemiológica. El objetivo de este estudio fue definir las condiciones óptimas de reacción y determinar el límite de detección para una RT-PCR anidada para la detección genérica de alfavirus. El límite de detección obtenido, de 0,47 UFP/mL, indica una alta sensibilidad, pudiéndose aplicar la técnica a muestras humanas y animales de suero, líquido cefalorraquídeo, órganos y a pooles de mosquitos. Este trabajo servirá de base a otros estudios de detección e identificación de especies de alfavirus circulantes en nuestro país, lo que contribuiría a fortalecer su vigilancia y prevención.

The genus Alphavirus consists of RNA viruses of which several species areresponsible for human and animal diseases, such as chikungunya, Mayaro and equineencephalitis viruses, and are therefore considered a regional public health problem. InParaguay, human infections have been reported by chikungunya, but more studies areneeded to increase knowledge on the circulation and ecoepidemiology of alphaviruses.Reverse RNA transcription followed by a nested polymerase chain reaction (RT-PCR) isvery useful as a diagnostic tool and in epidemiological surveillance. The objective ofthis study was to define optimal reaction conditions and to determine the limit ofdetection for a nested RT-PCR for generic alphavirus detection. The detection limitobtained, of 0,47 PFU/mL, indicate high sensitivity, and the possibility of applying thetechnique to human and animals samples of serum, cerebrospinal fluid, organs andmosquito pools. This work will serve as a basis for other studies of detection andidentification of alphavirus species circulating in our country, which would helpstrengthen the surveillance and prevention.

Molecular analysis of a fragment of bovine leukemia virus env gene by Nested-PCR in dairy cows from Pasto, Nariño / Análisis molecular de un fragmento del gen env del virus de leucosis bovina, por PCR anidada en vacas lecheras de Pasto, Nariño / Análise molecular pela reação em cadeia da polimerase de um fragmento do gene env do vírus de leucose bovina aninhada em vacas leiteiras de Pasto, Nariño

Abstract: Introduction: Routine diagnosis for bovine leukemia is performed using indirect serologic tests, although it is recommended to use polymerase chain reaction (PCR), which allows a reliable diagnosis in early stages and in young animals. Moreover, by amplifying the DNA, it is possible to sequence fragments of the virus, which allows to identify genotypes and to construct phylogenetic trees. Objective: To analyze a fragment of the env gene of bovine leukemia virus (BLV) isolated from indirect ELISA-positive animals in dairy farms in the municipality of Pasto (Nariño). Materials and methods: Once the presence of BLV was established in 48 animals over two years old in seven dairy farms in the municipality of Pasto by indirect ELISA test, a nested PCR test was performed to confirm diagnosis and to sequence a fragment of the env gene in positive animals and their daughters. The sequences obtained were compared with the seven genotypes described worldwide by MEGA 6 program. Results: The sequences of the compared fragments do not differ from those described; but they allow their grouping into different clusters according to their similarity. The genotypes found in these farms correspond to genotype 1 and 2 described in the literature. Conclusions: Only one genotype was found on farms with proper recovery and adequate biosecurity measures, and on farms with less control in management and recovery practices, both genotypes described for the region were evident.

Resumen: Introducción: El diagnóstico de rutina para la leucosis bovina se realiza con pruebas serológicas indirectas, aunque se recomienda usar la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), que permite un diagnóstico confiable en fases iniciales y en animales jóvenes. Además, mediante la amplificación del ADN se pueden secuenciar fragmentos del virus, que permite identificar los genotipos presentes y construir árboles filogenéticos. Objetivo: Analizar un fragmento del gen env del virus de leucosis bovina (VLB) aislado de animales positivos a ELISA indirecta en fincas lecheras del municipio de Pasto, Nariño. Materiales y métodos: Una vez establecida la presencia del VLB en 48 animales mayores de dos años en siete fincas lecheras del municipio de Pasto mediante la prueba de ELISA indirecta, se realizó una prueba de PCR anidada para confirmar el diagnóstico y secuenciar un fragmento del gen env en los animales positivos y sus hijas. Las secuencias obtenidas se compararon con los siete genotipos descritos en el mundo mediante el programa MEGA 6. Resultados: Las secuencias de los fragmentos comparados no difieren de las descritas; pero permiten su agrupación en diferentes clústeres de acuerdo con su similitud. Los genotipos encontrados en estas fincas corresponden al genotipo 1 y 2 descritos en la literatura. Conclusiones: En las fincas con reposición propia y adecuadas medidas de bioseguridad solo se encontró un genotipo y en las fincas con menor control en las prácticas de manejo y de reposición se encontraron los dos genotipos descritos para la región.

Resumo: Introdução: O diagnóstico de rotina para a leucose bovina se realiza com provas serológicas indiretas, mesmo que se recomenda usar a reação em cadeia da polimerase (PCR), que permite um diagnóstico confiável em fases iniciais e em animais jovens. Além do mais, mediante a amplificação do ADN se podem sequenciar fragmentos do vírus, que permite identificar os genótipos presentes e construir árvores filogenéticas. Objetivo: Analisar um fragmento do gene env do vírus de leucose bovina (VLB) isolado de animais positivos a ELISA indireta em fazendas leiteiras do município de Pasto, Nariño. Materiais e métodos: Uma vez estabelecida a presença do VLB em 48 animais maiores de dois anos em sete fazendas leiteiras do município de Pasto mediante a prova de ELISA indireta, se realizou uma prova de PCR aninhada para confirmar o diagnóstico e sequenciar um fragmento do gene env nos animais positivos e suas filhas. As sequências obtidas foram compararam com os sete genótipos descritos no mundo mediante o programa MEGA 6. Resultados: As sequências dos fragmentos comparados não diferem das descritas; mas permitem a sua agrupação em diferentes clusters de acordo com sua similitude. Os genótipos encontrados nestas fazendas correspondem ao genótipo 1 e 2 descritos na literatura. Conclusões: Nas fazendas com reposição própria e adequadas medidas de biossegurança somente se encontrou um genótipo e nas fazendas com menos controle nas práticas de manejo e de reposição se encontraram os dois genótipos descritos para a região.

Determinación de los genes, 16S ADNr, polA, y TpN47, en la detección de Treponema pallidum subsp. pallidum para el diagnóstico de sífilis congénita / Determination of genes, 16S ADNr, polA, and TpN47, in the detection of Treponema pallidum subsp. pallidum in the diagnosis of congenital syphilis

Objetivo. Comparar el comportamiento de tres genes diana 16S ADNr, polA, y TpN47, para la detección de T. pallidum subsp. pallidum. Métodos. Se usaron técnicas moleculares como la reacción en cadena de la polimerasa en muestras de cordón umbilical. Mediante PCR convencional, PCR anidada y PCR en tiempo real se amplificaron blancos moleculares del microorganismo. Resultados. Se evidenció que con los tres genes por PCR convencional se obtienen similares resultados, pero por con PCR anidada y PCR en Tiempo Real, el gen TpN47 tiene mayor sensibilidad en comparación con los genes polA y 16S ADNr. Se concluye que el gen TpN47 se puede usar como blanco molecular para el diagnóstico oportuno de sífilis congénita por medio de PCR anidada y en tiempo real, ya que alcanzó la máxima sensibilidad y especificidad en este estudio.

Objective. To compare the behavior of the three target genes (16S rDNA, polA, and TpN47) for the detection of T. pallidum subsp. Pallidum. Methods. Molecular techniques such as polymerase chain reaction were used on samples of an umbilical cord. Molecular targets of the microorganism were amplified by means of conventional PCR, nested PCR and real-time PCR. Results. Similar results for the three genes were obtained by conventional PCR; but in the case of nested PCR and real-time PCR, the gen TpN47 exhibited higher sensitivity in comparison to the genes polA and 16S rDNA. In conclusion, the gen TpN47 can be used as a molecular target for the prompt diagnosis of congenital syphilis through nested PCR and real-time PCR due to its high sensitivity and specificity shown in this study.

Frecuencia de los transcriptos p190BCR-ABL y p210BCR-ABL en una población colombiana con leucemia mieloide crónica (LMC) usando RT-PCR cualitativa / Detection of p190BCR-ABL AND p210BCR-ABL fusion transcripts in patients with chronic myeloid leukemia (CML) using qualitative RT-PCR / Frequência dos transcritos p190BCR-ABL e p210BCR- ABL numa população colombiana com leucemia mielóide crônica (LMC) usando RT-PCR qualitativa

Introducción: la leucemia mieloide crónica (LMC) se caracteriza por la presencia del cromosoma Filadelfia (Ph) que resulta de la translocación recíproca balanceada t(9;22)(q34;q11); este marcador cromosómico se encuentra con menor frecuencia en pacientes con leucemia linfoide aguda (LLA). Objetivo: determinar la frecuencia de las fusiones génicas BCR-ABL, que codifican para los transcriptos p210BCR-ABL y p190 BCR-ABL en pacientes colombianos con diagnóstico de LMC, en diferentes fases de la enfermedad o de su tratamiento. Materiales y métodos: estudio descriptivo de corte transversal de 31 pacientes con LMC (15-78 años). El análisis se hizo a partir de muestras de sangre periférica con la técnica PCR anidada cualitativa para las isoformas P210 BCR-ABL (b3a2 e b2a2) y P190 BCR-ABL (e1a2). Resultados: se detectó el transcripto p210BCR-ABL en 29 de los 31 casos (93,6%). En ellos se identificaron las fusiones génicas b2a2 (16/29; 55,2%), b3a2 (10/29; 34,5%) y la coexpresión b3a2 y b2a2 (3/29; 10,3%). Conclusión: la fusión génica b2a2 fue la más frecuente en esta población con LMC.

Introduction: Chronic myelogenous leukemia (CML) is characterized by the presence of the Philadelphia chromosome (Ph), resulting from the balanced reciprocal translocation t(9;22)(q34;q11). This marker chromosome is found less frequently in patients suffering from acute lymphoblastic leukemia. Objective: To determine the frequency of BCR-ABL gene fusions encoding the p210BCR-ABL y p190 BCR-ABL transcripts in Colombian patients diagnosed with CML in different stages of the disease and/or its treatment. Materials and methods: Cross sectional, descriptive study of thirty one CML patients (aged 15-78). Analysis was carried out through qualitative nested PCR for the isoforms P210 BCR-ABL (b3a2 e b2a2) and P190 BCR-ABL (e1a2), and based on peripheral blood samples. Results: In 29 of the 31 patients (93.6%) transcript p210BCR-ABL was detected; b2a2 and b3a2 gene fusions and the coexpression b3a2 y b2a2 were identified in 55.2% (16/29), 34.5% (10/29) and 10.3% (3/29) of the cases, respectively. Conclusion: b2a2 gene fusion was the most frequent in this CML population.

Introdução: a leucemia mielóide crônica (LMC) caracteriza- se pela presença do cromossomo Filadélfia (Ph) que resulta da translocação recíproca balanceada t(9;22)(q34;q11); este marcador cromossômico se encontra com menor frequência em pacientes com leucemia linfoide aguda (LLA). Objetivo: determinar a frequência das fusões genéticas BCR-ABL, que codificam para os transcritos p210BCR-ABL e p190 BCR-ABL em pacientes colombianos com diagnóstico de LMC, em diferentes fases da doença ou de seu tratamento. Materiais e métodos: estudo descritivo de corte transversal de 31 pacientes com LMC (15-78 anos). A análise se fez a partir de mostras de sangue periférico com a técnica PCR aninhada qualitativa para as isoformas P210 BCR-ABL (b3a2 e b2a2) e P190 BCR-ABL (e1a2). Resultados: detectou-se o transcrito p210BCR-ABL em 29 dos 31 casos (93,6%). Neles se identificaram as fusões genéticas b2a2 (16/29; 55,2%), b3a2 (10/29; 34,5%) e a co-expressão b3a2 e b2a2 (3/29; 10,3%). Conclusão: a fusão genética b2a2 foi a mais frequente nesta população com LMC.

Determinación, por PCR, de Salmonella Enteritidis FT 13 A y Salmonella Issatschenko en muestras de pollitos infectados experimentalmente / Determination of Salmonella Enteritidis FT 13 A and Salmonella Issatschenko by PCR in samples of chicks experimentally infected

The objective of this work was to determine by PCR the presence of Salmonella Enteritidis FT-13A (SE) and Salmonella Issatschenko (SI) in different samples of organs from 4 days old chicks experimentally infected. Four days old chicks were inoculated with SE and SI and their organs were frozen for DNAextraction to perform classic and nested PCR. It was possible to demonstrate the presence of SE and SI after 6 hours after experimental infection (AEI), but as time passed AEI positive results were inconsistent, obtaining negative results until 174 hours AEI. PCR is useful for detecting SE and SI in the early hours AEI. It is recommended to use pre-enrichment of the samples, in order to facilitate the DNA extraction and the detection of Salmonella by PCR.

El objetivo del presente trabajo fue determinar por medio de esta prueba, la presencia de Salmonella Enteritidis FT-13A (SE) y de Salmonella Issatschenko (SI), en diferentes muestras de órganos de pollitos de 4 días de edad infectados experimentalmente. Se emplearon órganos congelados de pollitos de 4 días de edad inoculados experimentalmente con SE y SI, para extraer el ADN y realizar la PCR clásica y anidada. Se logró detectar SE y SI desde las 6 horas posinfección experimental (PIE), pero conforme pasó el tiempo PIE, los resultados positivos fueron inconsistentes, obteniendo resultados negativos hasta las 174 horas PIE. Se concluyó que la PCR es útil para detectar SE y SI en las primeras horas PIE. Se sugiere utilizar pre-enriquecimiento de las muestras, para facilitar la extracción de ADN y la detección de Salmonella por medio de la PCR.

Detección molecular y tipificación del virus dengue por RT-PCR y PCR anidada usando oligonucleótidos mejorados / Molecular detection and typing of dengue virus by RT-PCR and nested PCR using degenerated oligonucleotides

Objetivos: Modificar los oligonucleótidos comúnmente utilizados para la detección y tipificación del virus dengue y evaluar su desempeño sobre ARNs provenientes de muestras clínicas. Materiales y métodos: A partir del alineamiento de secuencias disponibles en el GenBank para la región C-prM/M se determinó la variabilidad genética dentro de cada serotipo del virus dengue, lo cual permitió realizar modificaciones a los oligonucleótidos convencionalmente usados en la tipificación. Tales modificaciones incluyeron la adición y eliminación de nucleótidos en el extremo 3', teniendo en cuenta la posición del codón, así como la inclusión de sitios degenerados en posiciones altamente variables. Los oligonucleótidos se evaluaron a diferentes concentraciones sobre ARNs extraídos a partir de cultivos celulares infectados y posteriormente de sueros de pacientes con diagnóstico probable de dengue. Resultados: Los oligonucleótidos amplificaron específicamente cada serotipo del virus dengue, tanto desde sobrenadantes de cultivo como desde muestras clínicas en prueba piloto. Conclusiones: El rediseño de los oligonucleótidos consideró la variabilidad genética acumulada en más de 15 años, mostrándose experimentalmente su valor y utilidad en la detección y tipificación del virus dengue.

Objective: To modify the commonly used primers for detecting and typing of dengue viruses and evaluate their performance on RNAs derived from clinical samples. Materials and methods: To determine the genetic variability within each dengue virus serotype, sequences of C-prM/M region available on GenBank were aligned allowing modifications to the primers conventionally used for virus typing. Modifications include nucleotide insertion and deletion in the 3' end taking into account the codon position, and also the inclusion of degenerated sites in highly variable positions. Primers were evaluated at different concentrations on extracted RNAs from infected cell cultures and subsequently from sera of probable dengue diagnosed patients. Results: All primers specifically amplified each dengue virus serotype from cell culture supernatants and clinical samples in a pilot test. Conclusions: The re-designed primers took into account the accumulated variability during more than 15 years, experimentally showing their value and utility for detecting and typing of dengue viruses.

ELFA IgG anti-Toxoplasma y PCR anidada para el diagnóstico de toxoplasmosis en mujeres gestantes de Sincelejo, Colombia / ELFA anti-Toxoplasma IgG and nested PCR for the diagnosis of toxoplasmosis in pregnant women from Sincelejo, Colombia

Introducción. La vigilancia serológica de la toxoplasmosis no se incluye comúnmente en el control prenatal de las mujeres gestantes del departamento de Sucre; además, las técnicas usadas para el diagnóstico de la toxoplasmosis congénita no tienen suficiente sensibilidad para detectar los casos activos con el fin de instaurar un tratamiento oportuno y, así, reducir las secuelas en el recién nacido. El objetivo de este trabajo fue utilizar la amplificación de ADN de T. gondii mediante la técnica de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) anidada en muestras de sangre de mujeres gestantes seronegativas de Sincelejo, para detectar la presencia del parásito. Materiales y métodos. La PCR anidada se realizó durante un período de 17 meses a partir del ADN extraído de las muestras de sangre de 100 mujeres gestantes de Sincelejo, seronegativas por la prueba ELFA (Enzyme-Linked Fluorescent Assay) IgG ant-Toxoplasma. Resultados. Se detectó ADN de T. gondii en 12 de las 100 mujeres gestantes incluidas en el estudio. Fue posible contactar para seguimiento a siete de ellas; en cuatro se detectaron títulos de anticuerpos IgG, que correspondían a la seroconversión de mujeres gestantes positivas por PCR. Conclusiones. La utilidad de la técnica de PCR en la detección de ADN de T. gondii en muestras de sangre periférica de mujeres gestantes con resultados negativos por la prueba ELFA IgG anti-Toxoplasma. Esta investigación demuestra la importancia de combinar las pruebas serológicas con técnicas moleculares para mejorar el diagnóstico de la infección por T. gondii.

Introduction: Toxoplasmosis is a worldwide disease caused by the protozoan parasite Toxoplasma gondii, which can produce serious damage in immune compromised patients and congenitally infected newborns. Serological screening for T. gondii infection is not currently included in the routine prenatal control for pregnant women in the department of Sucre; moreover, techniques used for diagnosis of congenital toxoplasmosis do not show enough sensitivity in the detection of active cases of toxoplasmosis in order to offer opportune treatment and to reduce the consequences of this infection in the newborn. Objective: To detect DNA of Toxoplasma gondii by nested PCR assay in peripheral blood samples of seronegative pregnant women from Sincelejo, Sucre. Materials and methods: Nested PCR assay was done using DNA extracted from peripheral blood samples of 100 seronegative pregnant women by Elfa anti-Toxoplasma IgG assay from the city of Sincelejo, throughout a 17 month period. Results: T. gondii DNA was detected in 12 of the 100 pregnant women included in this study. It was possible to follow 7 of them, and only 4 showed high titles of IgG antibodies obtaining an overall seroconversion of 57,1% in positive pregnant women by the PCR assay. Conclusions: These results demonstrate the utility of a PCR test to detect Toxoplasma gondii DNA in peripheral blood samples of seronegative pregnant women by ELFA anti-Toxoplasma IgG test. This research also confirms the importance of combining serological tests with molecular techniques to improve the diagnosis of Toxoplasma gondii infection.

Evaluación de la técnica de PCR anidada para el diagnóstico de Pneumocystis jirovecii / Evaluation of the nested PCR technique for Pneumocystis jirovecii diagnosis

Se realizó un estudio comparativo entre las técnicas de inmunofluorescencia directa (IFD) y la reacción en cadena de la polimerasa anidada (PCRa) en 62 muestras del tracto respiratorio inferior, con la finalidad de evaluar la técnica de PCRa para el diagnóstico de Pneumocystis jirovecii. Al comparar ambas técnicas, la PCRa obtuvo valores de sensibilidad 100%; especificidad 79,2%; valor predictivo positivo 58,3%; valor predictivo negativo 100% y una concordancia de 84% con la técnica de IFD. La PCRa para el diagnóstico de neumocistosis predice con éxito la ausencia de la enfermedad cuando el resultado es negativo. Ante un resultado positivo, debe tomarse en cuenta la condición clínica del paciente, ya que la prueba no es capaz de discriminar entre colonización e infección.

A comparative study between the direct immunofluorescency technique (DIF) and the nested polymerase chain reaction (nPCR) was carried out in 62 samples taken from the lower respiratory tract in order to evaluate the nPCR technique for Pneumocystis jirovecii diagnosis. When comparing both techniques, nPCR showed 100% sensitivity, 79.2% specificity, 58.3% positive predictive value, 100% negative predictive value, and 84% of agreement with the DIF technique. nPCR used for pneumocystosis diagnosis successfully predicts absence of disease when the result is negative. With a positive result, the clinical condition of the patient should be taken into account since the test is not capable of discriminating between colonization and infection.

Detección de Mycobacterium avium subespecie paratuberculosis, por medio de PCR-anidada a partir de muestras de heces de ovinos / Detection of Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis by nested-PCR of ovine fecal samples

Paratuberculosis is a chronic granulomatous enteritis caused by Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis (Map), which affects wild and domestic ruminants. Map is shed in feces from infected animals. Transmission of the infection takes place by oral ingestion of the bacterium from contaminated food and water with feces. With the objective to establish a paratuberculosis diagnosis in ovine by nested-PCR from fecal samples, 204 fecal and serum ovine samples were studied. Feces were evaluated by nested-PCR and bacterial culture, serum samples were analyzed by agar gel immunodiffusion (AGID). Nested-PCR yielded a 210 bp amplification product that corresponds to Map-IS900, in 61 out of 204 samples. From these, 43 were from AGID positive animals and 18 from negative animals. Seventeen Map strains were isolated by bacterial culture and AGID detected 91 positive animals. Nested-PCR allowed to detect, sooner, greater number of animals shedding bacillus, even when they had resulted negative to the serological test. This result is considered important because generally these animals, while remaining in the farm, constitute the main source of infection for the herd. Nested-PCR should be considered as an alternative, when a prompt result is required to know the health status of the herd with respect to paratuberculosis.

La paratuberculosis es una enteritis granulomatosa de curso crónico ocasionada por Mycobacterium avium subespecie paratuberculosis (Map), afecta a rumiantes domésticos y silvestres. Map es excretada en las heces de animales que desarrollan la enfermedad, y la transmisión de la infección se da mediante la ingestión de alimentos y agua contaminados por heces de animales infectados. Con el objetivo de establecer el diagnóstico de paratuberculosis en ovinos por medio de la PCR-anidada a partir de muestras de heces, se trabajaron 204 muestras de heces y sueros de ovinos; las heces se evaluaron por PCR-anidada y cultivo bacteriológico, las muestras de sueros fueron analizadas por medio de inmunodifusión en agar gel (lDGA). Con la PCR-anidada se obtuvo un producto de amplificación 210 pb que corresponde a la IS900 de Map, en 61 de las 204 muestras. De éstas, 43 eran de animales positivos a IDGA y 18 negativos. Mediante cultivo bacteriológico se aislaron 17 cepas de Map; en este contexto, la IDGA detectó a 91 animales como positivos. La PCR-anidada permitió detectar en menor tiempo a mayor cantidad de animales que estaban eliminando al bacilo, aun cuando habían resultado negativos a la prueba serológica; este resultado se considera importante, ya que generalmente estos animales, al permanecer dentro de la granja, constituyen la principal fuente de infección para el rebaño. Se debe considerar a la PCR-anidada como alternativa, cuando se requiera el diagnóstico en breve tiempo, para conocer el estado sanitario del rebaño con respecto a paratuberculosis.

Evaluation of a nested-PCR assay for Streptococcus pneumoniae detection in pediatric patients with community-acquired pneumonia / Evaluación de una PCR anidada en pacientes pediátricos para diagnóstico de neumonía neumocócica adquirida en la comunidad

The aim of the present work was to evaluate the usefulness of a simplified method for DNA extraction coupled to a nested-PCR protocol, based on the amplification of pneumolysin gene fragments for the diagnosis of pneumococcal pneumonia in pediatric patients with clinical and radiological evidence of bacterial infection. Bacterial DNA was extracted from sera by boiling and used without further purification in the PCR for the pneumolysin gene. None toxic reagents were used and the necessary steps to obtain the DNA were left at a minimum; furthermore, it overcomes the use of expensive commercial kits for DNA purification. The total procedure can be completed the same day of sampling and, most important, it avoids the use of sophisticated technology. Both in vitro analytical specificity and sensitivity (10 CFU/ml) of the assay were similar to those previously reported. When clinical samples were tested, the rate of positivity was shown to be 83.3% and 71% in pediatric patients with positive (group a) and negative blood cultures (group b), respectively. In group a, DNA detection was successful in samples from children without treatment or with less than 48 h of antibiotic therapy. None amplification was obtained from sera patients with viral infection or in samples from healthy controls. The application of the strategy described in this paper substantially seems to improve the diagnostic process in a determinate group: blood culture-negative children with pneumonia.

El objetivo del presente trabajo fue evaluar la utilidad de un método simplificado para extracción de ADN, acoplado a un protocolo de PCR anidada, basada en la amplificación de fragmentos del gen de la neumolisina para el diagnóstico de neumonía neumocócica en niños con evidencias clínicas y radiológicas de infección bacteriana. El ADN bacteriano fue extraído del suero por calentamiento y utilizado en la PCR para el gen de la neumolisina sin purificación posterior. Para la obtención de ADN no se utilizan reactivos tóxicos ni costosos "kits" comerciales. El procedimiento completo puede ser realizado en el día y lo que es más importante, evita el uso de tecnología sofisticada. La especificidad analítica in vitro y la sensibilidad (10 UFC/ml) del ensayo fueron similares a lo hallado en publicaciones anteriores. El porcentaje de muestras positivas fue del 83,3% y del 71% en los pacientes con hemocultivos positivos (grupo a) y negativos (grupo b), respectivamente. En el grupo a, sólo se obtuvieron resultados positivos mediante la PCR anidada en los pacientes no tratados o con menos de 48 hs de tratamiento antibiótico. No se obtuvieron señales de amplificación en los sueros de los pacientes con infecciones virales ni en las muestras del grupo control. La aplicación de la estrategia descripta incrementa la posibilidad diagnóstica de neumonía neumocócica en niños con hemocultivos negativos.