Sorghum hybrids grown in hydroponics contrast for phosphorus use efficiency / Híbridos de sorgo crescidos em hidroponia contrastam para eficiência de uso de fósforo

Phosphorus (P) use efficiency is crucial for sorghum production. P acquisition efficiency is the most important component of P use efficiency. The early-stage evaluation of plant development is a useful tool for identifying P-efficient genotypes. This study aimed to identify sorghum hybrids that are efficient in P use efficiency and assess the genetic diversity among hybrids based on traits related to P acquisition efficiency. Thus, 38 sorghum hybrids and two inbred lines (checks) were evaluated under low and high P in a paper pouch system with nutrient solution. Biomass and root traits related to P efficiency were measured. There was no interaction between genotypes and P levels concerning all evaluated traits. The biomass and root traits, except root diameter, presented smaller means under low P than high P. Efficient and inefficient hybrids under each P level were identified. The genetic diversity assessment grouped these genotypes in different clusters. The hybrids AG1090, MSK326, AG1060, 1G100, AS 4639, DKB 540, and DKB 590 were superior under low-P and high-P. Hybrids SC121, 1236020 e 1167017 presented the lowest means than all other hybrids, under both conditions. The evaluated hybrids showed phenotypic diversity for traits related to P acquisition, such as root length and root surface area, which can be useful for establishing selection strategies for sorghum breeding programs and increasing P use efficiency.

A eficiência do uso do fósforo (P) é fundamental para a produção de sorgo. A avaliação no estágio inicial do desenvolvimento da planta é uma ferramenta útil para a identificação de genótipos eficientes de P. Este trabalho teve como objetivo identificar híbridos de sorgo que sejam eficientes ao uso de P e avaliar a diversidade genética entre os híbridos com base em características relacionadas à eficiência de aquisição de P. Assim, 38 híbridos de sorgo e duas linhagens (testemunhas) foram avaliados sob baixo e alto P em sistema de pastas de papel com solução nutritiva. Características de biomassa e de raiz relacionadas à eficiência de P foram mensuradas. Não houve interação entre genótipos e níveis de P em todas as características avaliadas. As características de biomassa e raiz, exceto o diâmetro da raiz, apresentaram médias menores sob baixo P em comparação com alto P. Híbridos eficientes e ineficientes sob cada nível de P foram identificados e agrupados quanto à diversidade genética. Os híbridos AG1090, MSK326, AG1060, 1G100, AS 4639, DKB 540 e DKB 590 foram superiores sob baixo-P e alto-P. Os híbridos SC121, 1236020 e 1167017 apresentaram as menores médias que todos os outros híbridos, em ambas condições. Os híbridos avaliados apresentaram diversidade fenotípica para características relacionadas à aquisição de P, como comprimento e área superficial da raiz, o que pode ser útil para estabelecer estratégias de seleção para programas de melhoramento de sorgo e aumentar a eficiência de uso do P.

Sorghum hybrids grown in hydroponics contrast for phosphorus use efficiency

Abstract Phosphorus (P) use efficiency is crucial for sorghum production. P acquisition efficiency is the most important component of P use efficiency. The early-stage evaluation of plant development is a useful tool for identifying P-efficient genotypes. This study aimed to identify sorghum hybrids that are efficient in P use efficiency and assess the genetic diversity among hybrids based on traits related to P acquisition efficiency. Thus, 38 sorghum hybrids and two inbred lines (checks) were evaluated under low and high P in a paper pouch system with nutrient solution. Biomass and root traits related to P efficiency were measured. There was no interaction between genotypes and P levels concerning all evaluated traits. The biomass and root traits, except root diameter, presented smaller means under low P than high P. Efficient and inefficient hybrids under each P level were identified. The genetic diversity assessment grouped these genotypes in different clusters. The hybrids AG1090, MSK326, AG1060, 1G100, AS 4639, DKB 540, and DKB 590 were superior under low-P and high-P. Hybrids SC121, 1236020 e 1167017 presented the lowest means than all other hybrids, under both conditions. The evaluated hybrids showed phenotypic diversity for traits related to P acquisition, such as root length and root surface area, which can be useful for establishing selection strategies for sorghum breeding programs and increasing P use efficiency.

Resumo A eficiência do uso do fósforo (P) é fundamental para a produção de sorgo. A avaliação no estágio inicial do desenvolvimento da planta é uma ferramenta útil para a identificação de genótipos eficientes de P. Este trabalho teve como objetivo identificar híbridos de sorgo que sejam eficientes ao uso de P e avaliar a diversidade genética entre os híbridos com base em características relacionadas à eficiência de aquisição de P. Assim, 38 híbridos de sorgo e duas linhagens (testemunhas) foram avaliados sob baixo e alto P em sistema de pastas de papel com solução nutritiva. Características de biomassa e de raiz relacionadas à eficiência de P foram mensuradas. Não houve interação entre genótipos e níveis de P em todas as características avaliadas. As características de biomassa e raiz, exceto o diâmetro da raiz, apresentaram médias menores sob baixo P em comparação com alto P. Híbridos eficientes e ineficientes sob cada nível de P foram identificados e agrupados quanto à diversidade genética. Os híbridos AG1090, MSK326, AG1060, 1G100, AS 4639, DKB 540 e DKB 590 foram superiores sob baixo-P e alto-P. Os híbridos SC121, 1236020 e 1167017 apresentaram as menores médias que todos os outros híbridos, em ambas condições. Os híbridos avaliados apresentaram diversidade fenotípica para características relacionadas à aquisição de P, como comprimento e área superficial da raiz, o que pode ser útil para estabelecer estratégias de seleção para programas de melhoramento de sorgo e aumentar a eficiência de uso do P.

The Role of Deep Phenotyping of Precision Medicine for Rare Bone Diseases / 罕见病研究

Deep phenotyping is a precise and comprehensive approach used for the precise analysis and comprehensive assessment of multi-system phenotypes of the patients. The approach uses symptoms, signs, various medical examination and laboratory results, and other relevant medical information. In the clinical diagnosis and medical research of rare bone diseases, deep phenotyping plays a pivotal role. The realization of precision medicine primarily comprises three key dimensions: deep phenotyping, stratified medicine, and targeted therapy. The deep phenotyping is the basis for the latter two. Deep phenotyping not only facilitates fine subtyping of diseases, but also allows for the in-depth understanding of genetic data. The use of deep phenotyping requires stand- ardized terminology and specific procedures. Moreover, deep phenotyping shows substantial potential using the application of artificial intelligence technology particularly when combining with multi-omics techniques.

COMPARACIÓN MORFO-AGRONÓMICA Y MOLECULAR DE CATORCE VARIEDADES DE ARROZ (Oryza sativa) CON LAS LÍNEAS QUE DIERON SU ORIGEN / Morpho-agronomic and molecular comparison of fourteen varieties of rice (Oryza sativa) with the lines that gave them the origin

RESUMEN Con el objetivo de determinar las diferencias morfo-agronómicas y de calidad, y la diversidad genética entre 14 variedades de arroz de América Latina con sus respectivas líneas de origen, se estableció un estudio (Bloques completos al azar, con 28 genotipos, tres repeticiones y dos siembras en el tiempo), en el cual se midieron 25 variables morfo-agronómicas y de calidad de grano. El análisis molecular se hizo mediante un arreglo de 96 marcadores tipo SNP de alta capacidad de discriminación para arroces Indica. El análisis estadístico se hizo combinando los datos de las dos siembras porque no hubo diferencias estadísticas entre ellas. Además, se analizaron en conjunto los datos moleculares con los morfo-agronómicos y de calidad, usando el índice de Gower para generar una matriz de similitud. Mediante el programa SAS se analizaron los datos agronómicos y moleculares tanto en forma independiente como en conjunto. Los resultados mostraron que, de las 14 variedades, ocho se agruparon con su línea de origen y hubo una variedad que se agrupó con una línea hermana de su ancestro. Los resultados fueron consistentes cuando el análisis de datos se hizo independientemente o combinado. Dada la amplia diversidad encontrada dentro de las variedades y que ninguna fue homocigota al 100 % no se pudieron establecer los perfiles genéticos distintivos de ellas, por lo que se debe hacer la purificación de las variedades para establecer su huella genética.

ABSTRACT This research aimed to determine the morpho-agronomic, grain quality, and molecular differences between 14 rice varieties and their ancestors. These rice varieties from Latin America were tested for 25 variables in a randomized complete block design with 28 genotypes, two planting dates, and three replications. The molecular analysis was done using an array of 96 SNP markers with a high discrimination capacity for Indica rice. A combined statistical analysis was done because there were no statistical differences between the planting dates. Also, molecular, morpho-agronomic, and grain quality data were analyzed together, using the Gower index to generate a similarity matrix. Agronomic and molecular data were analyzed both, together and independently, through the SAS program. Results showed that eight varieties were grouped with their respective ancestor, and one variety was grouped with a sibling of their ancestor and was consistent in all the analyses. However, given the wide heterozygosity found within the varieties, distinctive genetic profiles could not be established; the varieties must be purified to establish their genetic footprint.

Análise do perfil de Rh e Kell em doadores de sangue em Porto Alegre, Rio Grande do Sul / Phenotypic profile analysis of Rh and Kell blood group systems among donors in Porto Alegre, Rio Grande do Sul

Introdução: A hemoterapia é uma prática terapêutica pelo meio de transfusão sanguínea. Devido ao baixo estoque de bolsas de sangue e o aumento de pacientes crônicos e emergenciais, se faz necessária a realização de testes imuno-hematológicos para minimizar os riscos de reações transfusionais e aloimunizações em doadores e receptores de sangue. Deste modo, no estudo foi avaliada a prevalência dos antígenos dos sistemas Rh e Kell em doadores de sangue de Porto Alegre ­ RS.Métodos: Estudo quantitativo, transversal e retrospectivo que foi realizado através da análise das informações dos doadores de sangue contidas no banco de dados do Hemocentro do Estado do Rio Grande do Sul, nos anos de 2018 e 2019.Resultados: Das 6.479 amostras fenotipadas, quanto ao sistema Rh, 44,6% são Rh positivo e 55,4% são Rh negativo. As frequências dos antígenos encontradas foram de, CC 10,1%, Cc 27%, cc 62,9%, EE 1,2%, Ee 13,9%, ee 84,9%. E, para o sistema Kell, K1 positivo 7,1% e K1 negativo 92,9%.Conclusões: Antígenos do sistema Rh e Kell exibem um grande nível de imunogenicidade e uma forte ligação com a Doença Hemolítica do Recém-nascido, podendo ocorrer a sensibilização em pacientes caso não haja a compatibilidade sanguínea. Este estudo ressalta a importância da implementação da fenotipagem eritrocitária em doadores de sangue, sugere-se mais estudos com períodos distintos para a pesquisa de resultados satisfatórios.

Introduction: Hemotherapy is a therapeutic practice consisting of blood transfusion. Low blood supply and an increase in chronic and emergency patients have made it necessary to conduct immunohematology tests to minimize the risks of adverse reactions and alloimmunization in donors and recipients. Therefore, this study aimed to assess the prevalence of Rh and Kell blood group antigens among blood donors in Porto Alegre, Rio Grande do Sul, Brazil.Methods: We conducted a quantitative, cross-sectional, retrospective study. Information from blood donors included in the Rio Grande do Sul's Blood Center database from 2018 to 2019 were analyzed.Results: A total of 6,479 samples were phenotyped, of which 44.6% were Rh-positive and 55.4% were Rh-negative. Antigen prevalence was CC (10.1%), Cc (27%), cc (62.9%), EE (1.2%), Ee (13.9%), and ee (84.9%). As for the Kell group, 7.1% were K1-positive and 92.9% were K1-negative.Conclusions: The Rh and Kell antigens are highly immunogenic and have a strong link with the hemolytic disease of the newborn. Sensitization may occur in patients if there is no blood compatibility. This study highlights the importance of implementing erythrocyte phenotyping in blood donors. Further studies should be conducted in different time frames to achieve satisfactory results.

Herramientas complementarias utilizadas en el programa de mejoramiento de arveja (Pisum sativum l.) de la Universidad Nacional de Rosario / Complementary tools utilized in the pea (Pisum sativum l.) breeding program at Universidad Nacional de Rosario

RESUMEN El mejoramiento convencional puede ser complementado mediante diferentes estrategias que incrementen la eficiencia de las metodologías y la tasa actual de aumento de los rendimientos a fin de satisfacer la demanda. El uso de marcadores moleculares con el objetivo de desarrollar mapas de ligamiento de la especie, el uso de Blup (Best Linear Unbiased Prediction) para una selección eficiente de progenitores a hibridar, el uso del cultivo in vitro para incrementar artificialmente el número de plantas F1 o el uso de fenotipificación digital para una eficiente caracterización digital que puede realizarse durante la regeneración periódica y rutinaria de accesiones en colecciones de germoplasma.

ABSTRACT Conventional breeding can be complemented by different strategies that increase the efficiency of the methodologies and the current rate of increase in yields in order to meet demand. The use of molecular markers with the aim of developing linkage maps of the species, the use of Blup (Best Linear Unbiased Prediction) for an efficient selection of progenitors to hybridize, the use of in vitro culture to artificially increase the number of F1 plants or the use of digital phenotyping for efficient digital characterization that can be performed during the periodic and routine regeneration of accessions in germplasm collections.

Aplicación de diferentes metodologías en el mejoramiento de lenteja (Lens culinaris Medik) / Application of different methodologies in lentil (Lens culinaris Medik) breeding

RESUMEN La lenteja (Lens culinaris Medik.) es una especie diploide autógama (2n=2x=14) perteneciente a la familia Fabaceae. Es uno de los cultivos más antiguos que se conocen, con 8.000 a 9.000 años de historia, y se encuentra entre los primeros domesticados en Medio Oriente. Las semillas tienen un alto valor nutricional. Este cultivo es un interesante sustituto del trigo en las rotaciones de cereales, pero su importancia es baja debido a la falta de buenas variedades con adaptación local. Uno de los principales problemas que enfrentan los mejoradores en nuestro país es la estrecha base genética del germoplasma cultivado y su bajo potencial de rendimiento. En 2004 se inició un programa de mejoramiento de lentejas para desarrollar nuevas variedades con adaptación a las condiciones predominantes en las áreas de cultivo de Argentina. El germoplasma se obtuvo del ICARDA (Centro Internacional de Investigación Agrícola en las Zonas Áridas) y de productores locales. Se utilizan métodos convencionales de mejoramiento basados en la hibridación y selección. Se han obtenido dos nuevas variedades, una del tipo macrosperma (Boyerito FCA) y la otra del tipo microsperma (Tacuarita FCA) mediante la aplicación de selección masal en poblaciones F2 provenientes de la hibridación de materiales seleccionados. Este programa complementa los métodos de mejora tradicional con técnicas biotecnológicas como la transgénesis, el uso de marcadores moleculares, el cultivo de embriones in vitro combinado con el método SSD para acortar el ciclo generacional, y el fenotipado digital.

ABSTRACT Lentil (Lens culinaris Medik.) is a self-pollinating diploid (2n=2x=14) species belonging to the Fabaceae family. It is one of the oldest crops known, with 8,000 to 9,000 years of history and it is among the earliest domesticates from the Near East Fertile Crescent. The seeds have high nutritional value. This crop is an interesting substitute to wheat in cereal rotations but its importance is low due to a lack of suitable varieties with local adaptation. Some of the major problems that Argentinian lentil breeders face are the narrow genetic base of the current cultivated germplasm and its low yield potential. A lentil breeding program was initiated in 2004 to develop new varieties with adaptation to prevalent conditions in growing areas of Argentina. Germplasm was obtained from ICARDA (International Center for Agricultural Research in the Dry Areas) and local producers. Conventional breeding methods using hybridization and selection are being carried out to develop improved varieties, broad the genetic base, and isolate superior recombinant inbred lines. Two new varieties have been obtained, one of the macrosperm type (Boyerito FCA) and the other of the microsperm type (Tacuarita FCA) through the application of mass selection in F2 populations from the cross of selected materials. This program complements traditional breeding methods with biotechnological techniques such as transgenesis, use of molecular markers, in vitro embryo culture combined with the SSD method to shorten the breeding time, and digital phenotyping.

Duffy phenotyping and FY*B-67T/C genotyping as screening test for benign constitutional neutropenia

ABSTRACT Objective: Low levels of neutrophils can be an intrinsic condition, with no clinical consequences or immunity impairment. This condition is the benign constitutional neutropenia (BCN), defined as an absolute neutrophils count (ANC) ≤2000 cells/mm. Diagnosis of BCN is of exclusion where patients are submitted to blood tests and possibly to invasive diagnostic search until secondary causes of neutropenia are ruled out. The natural history of the disease suggests benign evolution and Brazilian study showed an overall frequency of 2.59%. The main mechanisms include reduced neutrophil production, increased marginalization, extravasation to the tissues and immune destruction. Genetic studies showed strong association between the single nucleotide variant rs2814778 located on chromosome 1q23.2 in the promoter region of the atypical chemokine receptor 1 (Duffy blood group system) gene (ACKR1, also termed DARC) and BCN. The aim of this study is to evaluate FY phenotypes and genotypes including the analysis of the rs2814778 SNP in Brazilian patients with BCN in order to determine an effective diagnostic tool, allowing reassurance of the patient and cost reduction in their care. Methods: Case control study, with 94 individuals (18 patients and 76 controls). Phenotyping was performed by gel test and genotyping was performed by PCR-RFLP. Results: White blood cell (WBC) and absolute neutrophils (AN) counts showed lower levels in patients compared to controls. In the patient group 83.3% were genotyped as FY*B/FY*B. The SNP rs2814778 (-67T > C) was identified in 77.8% of the patients genotyped as FY*B-67C/FY*B-67C. In the control group, 72.7% were homozygous for the wild type and 23.3% were heterozygous. Conclusion: This study reinforces that FY phenotyping and genotyping can be used to detect most people with BCN, avoiding excessive diagnostic investigation. Besides, this procedure may reduce health costs and be reproductible in clinical practice.

Fenotipos clínicos en el síndrome de apnea obstructiva del sueño / Clinical phenotypes in obstructive sleep apnea

El síndrome de apnea e hipopnea obstructiva del sueño se caracteriza por episodios repetitivos de obstrucción de vía aérea superior y es reconocida cada vez más, como un trastorno heterogéneo y complejo, proponiéndose múltiples fenotipos en base a su mecanismo patogénico, alteraciones polisomnográficas y la presentación clínica. El fenotipo clínico se enfoca en identificar características de un paciente basándose en signos, síntomas, antropometría, comorbilidades, medidas fisiológicas, anatómicas o respuesta al tratamiento. Al ser una enfermedad sub diagnosticada, de alta prevalencia y que produce elevada morbi-mortalidad, se debe estar atento a la pesquisa precoz y en las poblaciones de riesgo. Su diagnóstico se basa en el índice de apnea-hipopnea (IAH) y se requiere un IAH •5 eventos/hora para confirmar el diagnóstico. Sin embargo, cada vez hay más evidencia que el IAH por sí solo es insuficiente para comprender la presentación clínica, respuesta al tratamiento, calidad de vida y mortalidad de los pacientes con apnea del sueño. El fenotipo clínico puede servir de este modo, para entender mejor las diferentes formas de presentación teniendo como finalidad la medicina personalizada con el objetivo de favorecer la conducta terapéutica individualizada. El objetivo de esta revisión es abordar los fenotipos clínicos y proponer una huella digital en los pacientes con apnea del sueño

Obstructive sleep apnea and hypopnea syndrome is characterized by repetitive episodes of upper airway obstruction and is increasingly recognized as a heterogeneous and complex disorder, proposing multiple phenotypes based on its pathogenic mechanism, polysomnographic alterations, and clinical presentation. The clinical phenotype focuses on identifying a patient's characteristics based on signs, symptoms, anthropometry, comorbidities, physiological, anatomical measures or response to treatment. As it is an underdiagnosed disease of high prevalence associated to high morbidity and mortality, we must be alert to early screening and risk populations. Diagnosis is based on the apnea-hypopnea index (AHI) AHI •5 events/hour is required to confirm it, however, there is increasing evidence that AHI alone is insufficient to understand the clinical presentation, the response to treatment, the quality of life and the mortality of patients with sleep apnea. In this way, the clinical phenotype can serve to better understand the different forms of presentation and looks for a personalized medicine that favors an individualized therapeutic behavior. The aim of this review is to address clinical phenotypes and propose a fingerprint in patients with sleep apnea

Erythrocyte phenotyping for feline AB system in domestic cats from the Ilhéus-Itabuna microregion, Bahia, Brazil / Fenotipagem eritrocitária para sistema AB felino em gatos domésticos da microrregão Ilhéus-Itabuna, Bahia, Brasil

This study aimed to determine the erythrocyte phenotypes of the feline AB system and to check the presence of antigens other than those present in the feline AB system in domestic cats from Ilhéus-Itabuna microregion, Bahia, Brazil. Three-hundred feline blood samples were collected at the Veterinary Hospital of the "Universidade Estadual de Santa Cruz" (UESC) and in home visits to perform blood phenotyping using the tube-method testing. The reverse phenotyping was made between cats that tested phenotype B with blood samples of cats that tested phenotype A to confirm the blood phenotype B. The cross-tested among cats with phenotype A was made in order to verify the presence of different antigens of AB system in this blood phenotype. The results underwent macroscopic and microscopic analyses. Among the 300 animals tested, regarding breed, 290 were mixed-breed cats and among the remaining ten, five were Persians, four Siamese, and one Angora. 297 (99%) presented with phenotype A (including all the breeding cats) and three (1%) with phenotype B, and all this cats were mixed-breed cats. None (0%) of the cats showed the phenotype AB. All phenotype B bloods reacted to reverse phenotyping with phenotype A, confirming the phenotype B of these cats. All phenotype A bloods were compatible among each other, so no further erythrocyte antigens were detected through this test. The mother of one of the phenotype B cats was identified and had phenotype A, demonstrating phenotype A parents with phenotype B offspring. This finding indicates heterozygosis in the studied population. This data enable to conclude that the studied population presented different erythrocyte phenotypes, subsequently highlighting the importance of conducting phenotype analyses in these animals before performing blood transfusion to avoid serious hemolytic complications associated with incompatibility.(AU)

O objetivo deste estudo foi determinar a frequência dos fenótipos eritrocitários do sistema AB felino e verificar a presença de outros antígenos, não pertencentes ao sistema AB felino, em gatos domésticos das cidades de Ilhéus e Itabuna, Bahia, Brasil. Amostras de sangue de 300 gatos foram coletadas no Hospital Veterinário da Universidade Estadual de Santa Cruz (UESC) e em visitas domiciliares para realizar a fenotipagem sanguínea usando o método de tubo. A fenotipagem reversa foi realizada em gatos que testaram o fenótipo B com amostras que testaram o fenótipo A, para confirmação do fenótipo sanguíneo. O teste cruzado foi realizado entre gatos do fenótipo A, para pesquisar a presença de diferentes antígenos do sistema AB dentro desse fenótipo sanguíneo. Os resultados foram submetidos a análises macroscópicas e microscópicas. Dos 300 animais testados, 110 eram machos e 190 fêmeas, e suas idades variaram de cinco meses à 15 anos. Sobre as raças, 290 eram gatos sem raça definida e dos 10 restantes, cinco eram Persas, quatro eram Siameses e um Angorá. 297 (99%) apresentaram fenótipo A (incluindo todos os gatos de raça) e três (1%) tiveram fenótipo B, sendo todos esses gatos sem raça definida. Nenhum (0%) dos gatos apresentou fenótipo AB. Todos os sangues com fenótipo B reagiram na fenotipagem reversa com o fenótipo A, confirmando o fenótipo B desses gatos. Todos os sangues com fenótipo A foram compatíveis entre si, portanto nenhum antígeno eritrocitário adicional foi detectado através deste teste. A genitora de um dos gatos com fenótipo B, foi encontrada e a mesma possuía fenótipo A, demonstrando pais com fenótipo A e cria com fenótipo B. Esse achado indica heterozigose na população estudada. Esses dados levam à conclusão de que diferentes fenótipos eritrocitários estão presentes na população estudada e destacam a importância da realização de testes fenotípicos nesses animais antes dos procedimentos de transfusão, a fim de evitar complicações hemolíticas graves decorrentes do envolvimento de animais incompatíveis.(AU)

Cytometric blood phenotyping in free-living white-eyed parakeet (Psittacara leucophthalmus) / Fenotipagem citométrica do sangue de maritacas jovens de vida-livre (Psittacara leucophthalmus)

This study aimed at performing cytometric phenotyping of the blood samples from free-living, young white-eyed parakeets (Psittacara leucophthalmus), stained with 3,3-dihexyloxacarbocyanine [DiOC6(3)]. DiOC6(3)-stained whole blood samples from 19 free-living, young white-eyed parakeets were analyzed by flow cytometry and cell types were distinguished by their typical fluorescence in blue laser channel (FL-1) and SSC (side scatter). It was possible to differentiate erythrocytes (58.3±13.6) from leukocytes (32.4±13.1) and some of the leucocyte subpopulations: lymphocytes/thrombocytes (29.7±7.7), monocytes (30.6±8.5), and granulocytes (5.9-26). However, lymphocytes and thrombocytes could not be sorted in the plots. Our study determined that the predominant population in white-eyed parakeet (P. leucophthalmus) was lymphocytes, thrombocytes, and monocytes in the leucocytes gates in comparison to the granulocyte population. The cytometry method and use of DiOC6(3) stain was available for parakeets blood samples and can be studied and applied to other species of parrots.(AU)

Este estudo teve como objetivo realizar a fenotipagem citométrica com 3,3-di-hexiloxacarbocianina [DiOC6 (3)] de amostras de sangue de maritacas jovens de vida-livre (Psittacara leucophthalmus). As amostras de sangue total, coradas com DiOC6(3) de 19 maritacas de vida livre, foram analisadas por citometria de fluxo e os tipos de células foram distinguidos por sua fluorescência típica no canal laser azul (FL-1) e SSC (dispersão lateral). Foi possível diferenciar eritrócitos (58,3±13,6) de leucócitos (32,4±13,1) e algumas subpopulações de leucócitos: linfócitos/trombócitos (29,7±7,7), monócitos (30,6±8,5) e granulócitos (5,9-26), entretanto, linfócitos e trombócitos não puderam ser diferenciados em duas populações distintas. Nosso estudo determinou que a população predominante P. leucophthalmus foi mononuclear agranulocítica em comparação com a taxa de aquisição da população granulocítica. A metodologia de citometria de fluxo com uso da coloração de DiOC6(3) foi aplicável a amostras sanguíneas das maritacas e pode ser estudado e aplicado para outras espécies de psitacídeos.(AU)

AncPhore: A versatile tool for anchor pharmacophore steered drug discovery with applications in discovery of new inhibitors targeting metallo-

We herein describe AncPhore, a versatile tool for drug discovery, which is characterized by pharmacophore feature analysis and anchor pharmacophore (

Erythrocyte phenotyping for feline AB system in domestic cats from the Ilhéus-Itabuna microregion, Bahia, Brazil

ABSTRACT: This study aimed to determine the erythrocyte phenotypes of the feline AB system and to check the presence of antigens other than those present in the feline AB system in domestic cats from Ilhéus-Itabuna microregion, Bahia, Brazil. Three-hundred feline blood samples were collected at the Veterinary Hospital of the Universidade Estadual de Santa Cruz (UESC) and in home visits to perform blood phenotyping using the tube-method testing. The reverse phenotyping was made between cats that tested phenotype B with blood samples of cats that tested phenotype A to confirm the blood phenotype B. The cross-tested among cats with phenotype A was made in order to verify the presence of different antigens of AB system in this blood phenotype. The results underwent macroscopic and microscopic analyses. Among the 300 animals tested, regarding breed, 290 were mixed-breed cats and among the remaining ten, five were Persians, four Siamese, and one Angora. 297 (99%) presented with phenotype A (including all the breeding cats) and three (1%) with phenotype B, and all this cats were mixed-breed cats. None (0%) of the cats showed the phenotype AB. All phenotype B bloods reacted to reverse phenotyping with phenotype A, confirming the phenotype B of these cats. All phenotype A bloods were compatible among each other, so no further erythrocyte antigens were detected through this test. The mother of one of the phenotype B cats was identified and had phenotype A, demonstrating phenotype A parents with phenotype B offspring. This finding indicates heterozygosis in the studied population. This data enable to conclude that the studied population presented different erythrocyte phenotypes, subsequently highlighting the importance of conducting phenotype analyses in these animals before performing blood transfusion to avoid serious hemolytic complications associated with incompatibility.

RESUMO: O objetivo deste estudo foi determinar a frequência dos fenótipos eritrocitários do sistema AB felino e verificar a presença de outros antígenos, não pertencentes ao sistema AB felino, em gatos domésticos das cidades de Ilhéus e Itabuna, Bahia, Brasil. Amostras de sangue de 300 gatos foram coletadas no Hospital Veterinário da Universidade Estadual de Santa Cruz (UESC) e em visitas domiciliares para realizar a fenotipagem sanguínea usando o método de tubo. A fenotipagem reversa foi realizada em gatos que testaram o fenótipo B com amostras que testaram o fenótipo A, para confirmação do fenótipo sanguíneo. O teste cruzado foi realizado entre gatos do fenótipo A, para pesquisar a presença de diferentes antígenos do sistema AB dentro desse fenótipo sanguíneo. Os resultados foram submetidos a análises macroscópicas e microscópicas. Dos 300 animais testados, 110 eram machos e 190 fêmeas, e suas idades variaram de cinco meses à 15 anos. Sobre as raças, 290 eram gatos sem raça definida e dos 10 restantes, cinco eram Persas, quatro eram Siameses e um Angorá. 297 (99%) apresentaram fenótipo A (incluindo todos os gatos de raça) e três (1%) tiveram fenótipo B, sendo todos esses gatos sem raça definida. Nenhum (0%) dos gatos apresentou fenótipo AB. Todos os sangues com fenótipo B reagiram na fenotipagem reversa com o fenótipo A, confirmando o fenótipo B desses gatos. Todos os sangues com fenótipo A foram compatíveis entre si, portanto nenhum antígeno eritrocitário adicional foi detectado através deste teste. A genitora de um dos gatos com fenótipo B, foi encontrada e a mesma possuía fenótipo A, demonstrando pais com fenótipo A e cria com fenótipo B. Esse achado indica heterozigose na população estudada. Esses dados levam à conclusão de que diferentes fenótipos eritrocitários estão presentes na população estudada e destacam a importância da realização de testes fenotípicos nesses animais antes dos procedimentos de transfusão, a fim de evitar complicações hemolíticas graves decorrentes do envolvimento de animais incompatíveis.

Cytometric blood phenotyping in free-living white-eyed parakeet (Psittacara leucophthalmus)

ABSTRACT: This study aimed at performing cytometric phenotyping of the blood samples from free-living, young white-eyed parakeets (Psittacara leucophthalmus), stained with 3,3-dihexyloxacarbocyanine [DiOC6(3)]. DiOC6(3)-stained whole blood samples from 19 free-living, young white-eyed parakeets were analyzed by flow cytometry and cell types were distinguished by their typical fluorescence in blue laser channel (FL-1) and SSC (side scatter). It was possible to differentiate erythrocytes (58.3±13.6) from leukocytes (32.4±13.1) and some of the leucocyte subpopulations: lymphocytes/thrombocytes (29.7±7.7), monocytes (30.6±8.5), and granulocytes (5.9-26). However, lymphocytes and thrombocytes could not be sorted in the plots. Our study determined that the predominant population in white-eyed parakeet (P. leucophthalmus) was lymphocytes, thrombocytes, and monocytes in the leucocytes gates in comparison to the granulocyte population. The cytometry method and use of DiOC6(3) stain was available for parakeets blood samples and can be studied and applied to other species of parrots.

RESUMO: Este estudo teve como objetivo realizar a fenotipagem citométrica com 3,3-di-hexiloxacarbocianina [DiOC6 (3)] de amostras de sangue de maritacas jovens de vida-livre (Psittacara leucophthalmus). As amostras de sangue total, coradas com DiOC6(3) de 19 maritacas de vida livre, foram analisadas por citometria de fluxo e os tipos de células foram distinguidos por sua fluorescência típica no canal laser azul (FL-1) e SSC (dispersão lateral). Foi possível diferenciar eritrócitos (58,3±13,6) de leucócitos (32,4±13,1) e algumas subpopulações de leucócitos: linfócitos/trombócitos (29,7±7,7), monócitos (30,6±8,5) e granulócitos (5,9-26), entretanto, linfócitos e trombócitos não puderam ser diferenciados em duas populações distintas. Nosso estudo determinou que a população predominante P. leucophthalmus foi mononuclear agranulocítica em comparação com a taxa de aquisição da população granulocítica. A metodologia de citometria de fluxo com uso da coloração de DiOC6(3) foi aplicável a amostras sanguíneas das maritacas e pode ser estudado e aplicado para outras espécies de psitacídeos.

Frequência de anticorpos irregulares identificados em pacientes atendidos em um hemonúcleo no sudoeste do Paraná no ano de 2017 / Frequency of irregular antibodies identified in patients treated at the hemotherapy service in southwest of Paraná in 2017

Quando um indivíduo é exposto a antígenos eritrocitários não próprios, ocorre uma resposta imunológica, que leva à produção de anticorpos irregulares voltados contra esses antígenos. Esse processo é conhecido como aloimunização eritrocitária e acontece em decorrência de transfusões de sangue ou gestações incompatíveis. Na medicina transfusional a pesquisa de anticorpos irregulares é fundamental, pois a falha na detecção de um aloanticorpo pode provocar reações transfusionais, aloimunizações, anemias hemolíticas autoimunes e doença hemolítica perinatal. Este estudo tem por objetivo analisar a frequência de anticorpos irregulares de pacientes atendidos no Hemocentro Regional de Francisco Beltrão, Paraná, no ano de 2017. Os dados foram coletados a partir da revisão de registros em arquivos do Laboratório de Imunohematologia do Hemonúcleo. Foram avaliados dados de 49 protocolos de pacientes que apresentaram dificuldades transfusionais no ano de 2017. Dentre os pesquisados, 37 pacientes (75,5%) apresentaram anticorpos irregulares. Dentre os anticorpos anti-eritrocitários observados neste estudo, evidenciou-se a presença de doze pacientes com anti-D (27,2%), seis pacientes com anti-K (13,6%), quatro pacientes com anti-C (9,0%) e em seis pacientes (13,6%) foi observada a presença de autoanticorpos. Este estudo indica que, nos pacientes transfundidos, os anticorpos mais frequentes foram os aloanticorpos Anti-D do Sistema Rh, provavelmente devido ao seu alto grau de imunogenicidade. A prevalência desses anticorpos é semelhante a vários estudos encontrados na literatura.

When an individual is exposed to not-self red blood cell antigens, an immune response occurs, which leads to the production of irregular antibodies directed against these antigens. This process is known as erythrocyte alloimmunization and occurs as a result of blood transfusions or incompatible pregnancies. In transfusion medicine, the search for irregular antibodies is essential, since failure to detect an alloantibody can cause transfusion reactions, alloimmunizations, autoimmune hemolytic anemias, and perinatal hemolytic disease. This study aims at analyzing the frequency of irregular antibodies of patients seen at the Regional Blood Center of Francisco Beltrão, Paraná, in 2017. The data were collected from the review of records in files of the Immunohematology Laboratory of Hemonúcleo. Data from 49 protocols of patients who had transfusion difficulties in 2017 were evaluated. Among those surveyed, 37 patients (75.5%) had irregular antibodies. Among the anti-erythrocyte antibodies observed in this study, the presence of twelve patients with anti-D (27.2%), six patients with anti-K (13.6%), four patients with anti-C (9.0 %), and in six patients (13.6%) with the presence of autoantibodies were observed. This study indicates that, in transfused patients, the most frequent antibodies were the Rh System Anti-D alloantibodies, probably due to their high degree of immunogenicity. The prevalence of these antibodies is similar to several studies found in the literature.

Tecnologias digitais, subjetividade e psicopatologia: possíveis impactos da pandemia / Digital technologies, subjectivity and psychopathology: possible impacts of the pandemic / Technologies numériques, subjectivité et psychopathologie: impacts possible de la pandémie / Tecnologías digitales, subjetividad y psicopatología: posibles impactos de la pandemia

O artigo aborda o uso de tecnologias digitais na psiquiatria atual, discutindo o impacto dos dispositivos técnicos no horizonte social para além dos limites da clínica, focando a análise no projeto de fenotipagem digital, seu alcance, e nos desafios que ele suscita para o campo psiquiátrico.

The present article addresses the use of digital technologies in current psychiatry, discussing the impact of technical devices on the social horizon, beyond the limits of the clinical field. Our analysis focuses of the digital phenotyping project, its scope and the challenges it poses for the psychiatric field.

Cet article discute l'utilisation des technologies numériques en psychiatrie contemporaine, soit l'impact des dispositifs techniques sur l'horizon social au-delà des limites de la clinique. Il se concentre sur l'analyse du projet de phénotypage numérique, sa portée et les défis qu'il pose au domaine psychiatrique.

El artículo aborda el uso de las tecnologías digitales en la psiquiatría actual, discutiendo el impacto de los dispositivos técnicos en el horizonte social más allá de los límites de la clínica, enfocándose en el análisis del proyecto de fenotipado digital, su alcance y los desafíos que plantea para el campo psiquiátrico.

Prevalencia del antígeno D débil y su clasificación fenotípica en donantes voluntarios de sangre / Prevalence of "weak" D antigen and its phenotypic classification in voluntary blood donours / Prevalência do antígeno D "fraco" e sua classificação fenotípica em doadores voluntários de sangue

En el campo de la medicina transfusional la correcta identificación de los fenotipos del sistema Rh y en especial del antígeno D debe ser de manera inequívoca por su relevancia clínica. El antígeno D tiene variantes denominadas D parcial, D débil y DEL, las que se producen por mutaciones de los alelos RHD/RHCE o por una supresión en la expresión fenotípica. Se trató de un estudio descriptivo, retrospectivo de corte transversal en el que se realizó una revisión de registros primarios durante el período 2011-2014 validados de acuerdo con el protocolo de Hernández-Sampieri R. Se utilizó estadística descriptiva mediante la aplicación del software informático SPSS versión 22.0 y se estableció la relación entre variables independientes a través del análisis estadístico de Chi-cuadrado. Se determinó una prevalencia de donantes RhD negativos de 1,8 a 2,5% y RhD débil de 1,79 a 2,28%. La fenotipificación serológica permitió identificar que los tipos 2 y 5 eran los más frecuentes. También se estableció la existencia de aloinmunización por anti-D, anti-C y anti-E. Se estableció de esta manera la existencia de D débil y una importante aloinmunización en la población de donantes de sangre tipificados como D negativo y D débil, por lo que se recomienda implementar un algoritmo de identificación del antígeno D en servicios de medicina transfusional.

In the field of transfusion medicine, the correct identification of the phenotypes of the Rh system and especially of the D antigen must be unequivocal for clinical relevance. The D antigen has variants called partial D, weak D and DEL. These are produced by mutations of the RHD/RHCE alleles or a suppression in phenotypic expression. The objective of this study was to establish the frequency of weak D antigen in the population of blood donours from 17 Ecuadorian states and their phenotypic combinations. It was a descriptive, retrospective cross-sectional study performed during the 2011-2014 period and validated with primary records in accordance with the Hernández-Sampieri R protocol. A descriptive statistics through the application of SPSS computer software version 22.0 was used and the relationship between independent variables through the Chi-square statistic method was established. A prevalence of RhD negative donours from 1.8 to 2.5% and weak D 1.79 to 2.28% was observed The serological phenotyping made it possible to identify that type 2 and 5 were the most frequent. The presence of alloimmunization by anti-D, anti-C and anti-E was also established. Besides, the presence of weak D types and significant alloimmunization in the donour population of blood typed as D negative and weak was established, so it is recommended to implement an algorithm for the identification of D antigen in transfusional medicine services.

No campo da medicina transfusional, a correta identificação dos fenótipos do sistema Rh e especialmente do antígeno D deve ser inequívoca devido a sua relevância clínica. O antígeno D tem variantes chamadas de D parcial, D fraca e DEL, as quais são produzidos por mutações dos alelos RHD/RHCE ou por uma supressão na expressão fenotípica. O objetivo deste estudo foi estabelecer a frequência do antígeno D fraco em uma população de doadores de sangue de 17 províncias equatorianas e suas combinações fenotípicas. Foi uma estudo descritivo, retrospectivo de corte transversal em que se realizou uma revisão dos registros primários validados de acordo com o Protocolo Hernández-Sampieri R durante o período 2011-2014. Utilizou-se estatísticas descritivas através da aplicação do software informático SPSS versão 22.0 e a relação entre variáveis independentes através da análise estatística de qui-quadrado. Foi determinada uma prevalência de doadores RhD negativos de 1,8 a 2,5% e RhD fraco de 1,79 a 2,28%. A genotipagem serológica permitiu identificar que os tipos 2 e 5 são os mais frequente. A existência de alo imunização por anti-D, anti-C e anti-E também foi estabelecida. A existência de D fraco e uma alo imunização significativa na população de doadores de sangue tipificados como D negativo e fraco, por isso é recomendado implementar um algoritmo de identificação do antígeno D em serviços de medicina transfusional.

Identification of Brucella abortus biovar 4 of bovine origin in Colombia / Identificación de Brucella abortus biovar 4 de origen bovino en Colombia

The objective of this study was to identify twelve Brucella abortus isolates of bovine origin from the department of Nariño in Colombia up to the biovar level. These isolates are included in the collection of the Germplasm Bank of Microorganisms of Animal Health Interest -Bacteria and Virus (BGSA-BV). The identification was carried out through conventional methods such as macro and microscopic morphological descriptions, enzymatic activity, biochemical profile, substrate use and sensitivity to dyes. Complementary genotypic characterization was carried out using multiplex PCR for B. abortus, Brucella melitensis, Brucella ovis, and Brucella suis-Erytritol (AMOS-ERY-PCR), RFLP-IS711, by southern blot hybridization, as well as by the multiple locus variable number of tandem repeat analysis (MLVA) using the ery gene and the insertion sequence IS711 and variable number of tandem repeats (VNTR) as molecular markers. The results of the phenotypic and molecular characterization allowed to identify twelve isolates as B. abortus biovar 4 as well as to differentiate field from vaccine strains. This is the first study on the phenotypic and molecular identification of B. abortus isolates in Colombia. It was concluded that the phenotypic and molecular identification of twelve isolates as B. abortus biovar 4 could be achieved using conventional and molecular techniques with enough resolution power. The identification of these isolates to the biovar level in taxonomic and epidemiological terms will allow the use of this genetic resource as reference strains in future research. This finding constitutes the basis for identifying biotypes not previously reported in the country that might be useful to support brucellosis survey programs in Colombia.

El objetivo de este estudio fue identificar 12 aislamientos de Brucella abortus de origen bovino procedentes del departamento de Narino, Colombia, hasta la descripción de biovar. Estos aislamientos conforman la colección del Banco de Germoplasma de Microorganismos de Interés en Salud Animal, Bacterias y Virus. La identificación se hizo mediante métodos convencionales, como la descripción morfológica macro y microscópica de actividad enzimática, de perfiles bioquímicos, de utilización de sustratos y de sensibilidad a colorantes. Se hizo una caracterización genotipica complementaria mediante PCR múltiple para Brucella abortus, Brucella melitensis, Brucella ovisy Brucella suis-eritritol (AMOS-ERY-PCR); RFLP-/S7II; hibridación Southern blot y análisis multi-locus de repeticiones en tándem de número variable (MLVA), empleando como marcadores moleculares el gen ery, la secuencia de inserción /S711 y el número variable de repeticiones en tándem (VNTR). Los resultados de la caracterización fenotípica y molecular permitieron identificar 12 aislamientos de campo como B. abortus biovar 4 y diferenciar cepas de campo de cepas vacunales. Este es el primer estudio de identificación fenotípica y molecular de aislamientos de B. abortus en Colombia. Por su importancia taxonómica y epidemiológica, la identificación de estos aislamientos hasta el nivel de biovar permitirá disponer de recursos genéticos que se pueden emplear como cepas de referencia en futuras investigaciones. Estos resultados pueden considerarse como una base para la identificación de biotipos no reportados en el país y podrán ser utilizados en programas de monitoreo y vigilancia de la brucelosis bovina en Colombia.

Tipificación del antígeno Duffy como método indirecto para identificar individuos asintomáticos de malaria / Duffy antigen typing as an indirect method to identify asymptomatic malaria individuals

En países considerados endémicos de malaria a pesar de las estrategias realizadas anualmente para el control y erradicación de esta enfermedad existen brotes aislados de malaria debido probablemente a portadores asintomáticos, presencia de individuos con fenotipo Duffy negativo o movimientos poblacionales. El sector "50 casas" de la provincia de Esmeraldas-Ecuador reúne todas estas características por lo que el objetivo de esta investigación fue determinar la presencia del fenotipo Fy(a-b-) y su relación con el Plasmodium vivax. Se realizó una encuesta a cada miembro de las familias participantes y luego de aceptado y firmado el consentimiento informado se tomaron muestras sanguíneas para la realización de pruebas serológicas en búsqueda de anticuerpos y antígenos de P. vivax, fenotipificación del sistema Duffy y pruebas de PCR en tiempo real para la determinación de ADN de Plasmodium vivax y P. falciparum. Los resultados demostraron que existe una asociación estadísticamente significativa entre el fenotipo Duffy y malaria por P. vivax (p<0,05). Ante esta situación los organismos de control deberán proponer nuevas estrategias para la detección de portadores asintomáticos y medidas preventivas para evitar nuevos brotes de malaria, así como determinar si P. vivax ha encontrado un nuevo mecanismo de invasión en individuos portadores del fenotipo Fy(a-b-).

Despite the strategies carried out annually for the control and eradication in countries considered endemic for malaria, there are isolated outbreaks probably due to asymptomatic carriers. These involve the presence of individuals with Duffy negative phenotype or population movements. The neighbourhood "50 casas" of the province of Esmeraldas-Ecuador has all these characteristics, so the purpose of this research was to determine the presence of the Fy(a-b-) phenotype and its relationship with the Plasmodium vivax. A survey was carried out into each member of the participating families and after accepting and signing the informed consent, blood samples were taken to perform serological tests in search of antibodies and antigens of P. vivax. The phenotyping of Duffy system and real-time PCR tests for DNA determination of Plasmodium vivax and falciparum was realized. The results showed that there is a statistically significant association between the Duffy phenotype and P. vivax malaria (p<0.05). In view of this situation, the control agencies should propose new strategies for the detection of asymptomatic carriers and preventive measures to hinder new outbreaks of malaria and determine if P. vivax has found a new invasion mechanism in individuals with the Fy(a-b-) phenotype.

Nos países considerados endêmicos para malária, apesar das estratégias realizadas anualmente para o controle e erradicação desta doença existem surtos isolados de malária, resultantes provavelmente de portadores assintomáticos, presença de indivíduos com fenótipo Duffy negativo ou movimentos populacionais. O setor "50 casas" na província de Esmeraldas-Equador reúne todas essas características. Portanto o objetivo desta pesquisa foi determinar a presença de fenótipo Fy(a-b-) e sua relação com Plasmodium vivax. Foi realizada uma enquete para cada membro das famílias participantes e após a aceitação e assinatura do Consentimento informado, foram coletadas amostras de sangue para a realização de testes sorológicos em busca de anticorpos e antígenos do P. vivax. Além de testes de fenotipagem do sistema Duffy e PCR em tempo real para determinação de DNA de Plasmodium vivax e P. falciparum. Os resultados mostraram que existe uma associação estatisticamente significante entre o fenótipo Duffy e a malária por P. vivax (p<0,05). Perante está situação os órgãos de fiscalização terão que propor novas estratégias para a detecção de portadores assintomáticos e medidas preventivas para evitar novos surtos de medidas de malária bem como determinar se P. vivax tem encontrado um novo mecanismo de invasão em indivíduos portadores do fenótipo Fy(a-b-).

Chlamydoconidium-producing Trichophyton tonsurans: Atypical morphological features of strains causing tinea capitis in Ceará, Brazil

Objective: To report atypical morphological features of Trichophyton (T.) tonsurans strains associated with tinea capitis. Methods: Eighty-two T. tonsurans strains isolated in Ceará, Brazil, were analyzed regarding macro and micromorphological features and nutritional patterns. Results: Fifty-two samples presented abundant chlamydoconidia, which were produced in chains. Macroscopically, these strains developed small glabrous colonies that were firmly attached to the surface of the culture medium, with few or no aerial mycelia and intense rusty yellow pigmentation. Seven strains did not grow with stimulus from thiamine. Samples were heterogeneous regarding urease production and none presented in vitro hair perforation. Conclusions: The observation of T. tonsurans strains with distinct phenotypic features indicates the need to revise the taxonomic criteria for routine identification of this dermatophyte.