Diagrammatic scales for the estimation of black node disease severity in common bean / Escalas diagramáticas para a estimativa da gravidade da doença do nó negro no feijão comum

ABSTRACT: The objective of this study was to design two diagrammatic scales for the evaluation of black node disease (Stagonosporopsis hortensis and Boeremia spp.) in common bean (Phaseolus vulgaris L.). The developed scales corresponded to logarithmic intervals (SADL) of seven levels and equal intervals (SADE) of nine levels. These scales were compared to the scale developed by the International Center for Tropical Agriculture (CIAT), which corresponds to a descriptive scale (NoSAD). In the scale validation the accuracy, precision, and concordance of repeatability were determined using Lin's concordance correlation coefficient, whereas inter-rater reproducibility was determined by the overall concordance correlation coefficient (OCCC). It was observed that with the use of the proposed scales, reproducibility and repeatability were significantly improved for inexperienced raters, and reproducibility was improved in the case of experienced raters. Thus, the designed standard area diagrams with equal and logarithmic intervals are a useful tool for estimating severity under field and experimental conditions as part of the study of this patho-system.

RESUMO: O objetivo deste estudo foi delinear duas escalas diagramáticas para avaliação da doença do nó preto (Stagonosporopsis hortensis e Boeremia spp.) em feijoeiro (Phaseolus vulgaris L.). As escalas desenvolvidas corresponderam a intervalos logarítmicos (SADL) de sete níveis e intervalos iguais (SADE) de nove níveis. Essas escalas foram comparadas com a escala desenvolvida pelo Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT), que corresponde a uma escala descritiva (NoSAD). Na validação da escala, a exatidão, precisão e concordância da repetibilidade foram determinadas usando o coeficiente de correlação de concordância de Lin, enquanto a reprodutibilidade entre avaliadores foi determinada pelo coeficiente de correlação de concordância geral (OCCC). Observou-se que, com o uso das escalas propostas, a reprodutibilidade e a repetibilidade foram significativamente melhoradas para os avaliadores inexperientes, e a reprodutibilidade foi melhorada no caso dos avaliadores experientes. Assim, as escalas diagramáticas projetadas são uma ferramenta útil para estimar a severidade em condições experimentais e de campo como parte do estudo desse sistema patológico.

Standard area diagram set for scab quantification in trilobed leaves of the sour passion fruit / Escala diagramática para a quantificação da verrugose em folhas trilobadas do maracujazeiro azedo

ABSTRACT: The study aimed to develop and validate a standard area diagram set (SADs) to improve accuracy, precision, and reproducibility in the assessment of scab severity in trilobed leaves of the sour passion fruit. The SADs comprised six severity levels (1%; 3%; 6%; 11%; 21%; and 33%). The SADs increased the accuracy of the estimates by reducing the constant and systematic errors, and the tendency to overestimate the actual severity, limited the number of evaluators who presented this trend, in addition to increasing the bias correction factor. The inexperienced evaluators were the ones that benefited the most from the SADs use. Once the SADs was introduced, 80% and 100% evaluators gave estimates free from constant and systematic errors, respectively. The improvement in precision was verified by the increase in the coefficient of determination and Lin's concordance correlation coefficient, by reducing absolute errors and increasing the reproducibility of the estimates.

RESUMO: O objetivo deste estudo foi desenvolver e validar uma escala diagramática para melhorar a acurácia, precisão e reprodutibilidade na avaliação da severidade da verrugose em folhas trilobadas do maracujazeiro azedo. A escala apresentou seis níveis de severidade (1; 3; 6; 11; 21 e 33%) e aumentou a acurácia das estimativas, reduzindo os erros constantes e sistemáticos, a tendência de superestimação em relação aos valores de severidade real e o número de avaliadores que apresentavam essa tendência, além de aumentar o fator de correção do desvio. Os avaliadores inexperientes foram os mais beneficiados pela utilização da escala, sendo que 80% e 100% destes avaliadores apresentaram estimativas livres de erros constantes e sistemáticos, respectivamente, quando a escala foi empregada. O aumento da precisão foi verificado pelo incremento dos coeficientes de determinação e de concordância de Lin, redução dos erros absolutos e aumento da reprodutibilidade das estimativas.

Development and validation of a standard area diagram set as assessment aid for estimating the severity of bacterial spot on tri-lobed leaves of yellow passion fruit / Desenvolvimento e validação de escala diagramática como auxílio na avaliação da severidade da bacteriose em folhas trilobadas do maracujazeiro azedo

Bacterial spot (Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae) significantly reduces yellow passion fruit (Passiflora edulis Sims) yield and longevity. A standard area diagram set (SADs) for severity assessment of bacterial spot on tri-lobed leaves of yellow passion was developed and validated in this study. The SADs consisted of eight severity levels (2; 4; 9; 18; 35; 58; 80; and 94%). For its validation, 20 raters, who initially estimated the disease severity without the aid of the SADs, were divided into four groups (G1 and G3, inexperienced; G2 and G4, experienced). Subsequently, G1 and G2 performed the second evaluation without the SADs, and G3 and G4 completed the second evaluation with the proposed SADs. The accuracy and precision of the assessments were determined by simple linear regression and by the Lin's concordance correlation coefficient (LCCC). The proposed SADs allowed accurate and precise quantification of bacterial spot severity, increasing the agreement between estimated and actual values. Inexperienced raters benefited the most from the use of the SADs. The increase in accuracy and precision in the non-aided groups, when present, was less pronounced than those increments observed in the SADs-aided groups. The LCCC confirmed the increases in accuracy and precision detected by the linear regression analysis.

A bacteriose (Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae) reduz significativamente a produção e longevidade do maracujazeiro azedo (Passiflora edulis Sims). Uma escala diagramática para a avaliação da severidade da bacteriose em folhas trilobadas do maracujazeiro azedo foi desenvolvida e validada neste estudo. A escala diagramática apresentou oito níveis de severidade (2; 4; 9; 18; 35; 58; 80 e 94%). Para a sua validação, os 20 avaliadores foram divididos em quatro grupos (G1 e G3, sem experiência; G2 e G4, com experiência), que inicialmente estimaram a severidade da doença sem auxílio da escala. Posteriormente, G1 e G2 fizeram outra avaliação sem escala, e G3 e G4 realizaram a avaliação com a escala proposta. A acurácia e a precisão das estimativas foram determinadas por regressão linear simples e pelo coeficiente de correlação de concordância de Lin (LCCC). A escala diagramática proposta permitiu quantificar a severidade da bacteriose de forma acurada e precisa, aumentando a concordância entre os valores estimados e os reais. Os avaliadores inexperientes foram os mais beneficiados pelo uso da escala. O aumento da acurácia e precisão nos grupos que realizaram dupla avaliação sem escala, quando ocorreu, foi mais discreto que os incrementos observados nos grupos que utilizaram a escala. O LCCC confirmou os incrementos da acurácia e precisão detectados pela análise de regressão linear.

A diagramatic scale to quantify severity of antracnose in Rubus glaucus Benth / Uma escala diagramática para quantificar a severidade da antracnose em Rubus glaucus Benth

ABSTRACT: Rubus glaucus Benth, commonly referred to as mora de Castilla, is affected by Colletotrichum acutatum, as it induces anthracnose in many of the plant organs. Generally, it affects the fruits during the post-harvest phase and damages them, causing economic losses due to the poor crop quality. At present, no standardized methods are available for this pathosystem that can be used to characterize quantitatively the epidemic and to permit the prediction and comparison of the disease management techniques. In this research, we proposed a logarithmic diagrammatic scale of the severity of anthracnose induced by C. acutatum in the fruits of the thornless variety of R. glaucus Benth. This scale is constructed on the adjustment of the Weber-Fechner law and includes six classes, viz., 0%, 1-6%, 7-25%, 26-50%, 51-75%, 76-100%. The scale was validated using 14 evaluators, which entailed measuring the affected fruits with and without utilizing the scale; this improved the precision, accuracy and reproducibility of the calculations whenever the scale was used. We concluded that the scale proposed can be used to assess the severity of anthracnose induced by the fungus in the R. glaucus Benth fruits.

RESUMO: Mora de Castilla (Rubus glaucus Benth) é afetado por Colletotrichum acutatum, causando antracnose em órgãos diferentes da planta. Nos frutos geralmente é em pós-colheita, causando danos que geram perdas econômicas relacionadas com a qualidade das culturas. Ainda não existem para esse patossistema métodos padronizados para caracterizar quantitativamente a epidemia e que pode prever e comparar os métodos de manejo da doença. Por esta razão, neste trabalho foi criada uma escala logarítmica diagramática da severidade da antracnose causada pelo fungo C. acutatum em frutos de R. glaucus Benth com base na lei de Weber-Fechnere composto por 6 niveis: 0%, 1-6%, 7-25%, 26-50%, 51-75% e 76-100%. A escala foi validada por 14 evaluadores, fazendo medições de frutos afetados com e sem o uso da escala, que mostrou melhor precisão, exatitude e reproducibilidade nas avaliações em que o uso da escala foi feito. Isto permite concluir que a escala proposta pode ser usada na estimação da severidade da antracnose causada em frutos de R. glaucus Benth.