Sistematización de la prevalencia de Anaplasma spp., en caninos y metanálisis de A. platys y A. phagocytophilum / Systematization of the prevalence of Anaplasma spp. in canines and meta-analysis of A. platys and A. phagocytophilum

RESUMEN Objetivo. Estimar la prevalencia general de Anaplasma spp. y la prevalencia específica de A. platys y A. phagocytophilum en caninos, mediante estudios publicados entre 2000 y 2018. Materiales y métodos. Revisión sistemática con 14 estrategias de búsqueda, garantizando exhaustividad y reproducibilidad en fases de la guía PRISMA. Se evaluó la calidad con STROBE. Se calcularon frecuencias y se estimó la prevalencia global y las específicas según país, periodo y prueba diagnóstica, con sus intervalos de confianza del 95%. Se realizó Forest Plot para la prevalencia individual y global de A. platys o A. phagocytophilum según PCR, ELISA e IFI, las cuales se compararon con base en el Estadístico Z. Resultados. Se incluyeron 30 estudios con 18.472 caninos, la mayoría de Brasil, Estados Unidos y Alemania. En IFI se halló una prevalencia de 39.0% (IC95%= 37.0-41.0), en ELISA 9.3% (IC95%= 8.8-9.8) y en PCR 7.1% (IC95% = 6.4-7.8). La prevalencia basada en PCR fue estadísticamente mayor en América con 11.9% (IC95% = 10.5-13.3) frente a África con 5.5% (IC95% = 1.2-9.7), Asia 4.1% (IC95% = 3.1-5.1) y Europa 3.5% (IC95% = 2.5-4.5). La prevalencia de A. platys con PCR fue 16.1% (IC95% = 14.2-17.9) y de A. phagocytophilum 3.7% (IC95%= 2.8-4.6). Conclusiones. Se halló una elevada prevalencia de infección, con mayor importancia de A. platys, en un bajo número de publicaciones en el ámbito mundial y con una elevada heterogeneidad según el país, la técnica diagnóstica y la especie implicada.

ABSTRACT Objective. To estimate the general prevalence of Anaplasma spp. and the specific prevalence of A. platys and A. phagocytophilum in canines through studies published between 2000 and 2018. Materials and methods. Systematic review with 14 search strategies to ensure exhaustivity and reproducibility in the stages specified in the PRISMA guide. Quality was evaluated with STROBE. Frequencies were calculated and global and specific prevalences were estimated by country, period of study and diagnostic test employed, with 95% confidence intervals. A forest plot was made showing the individual and global prevalences A. platys and A. phagocytophilum by PCR, ELISA, and IFI, compared using a Z-Test. Results. Thirty studies with 18.472 canines were included, mostly from Brazil, the United States, and Germany. In the studies with IFI, the prevalence was 39.0% (95% CI= 37.0-41.0); with ELISA 9.3% (95% CI=8.8-9.8); and with PCR, 7.1% (95% CI= 6.4-7.8). The prevalence with PCR was statistically higher in America at an 11.9% (95% CI= 10.5-13.3) compared to Africa, at an 5.5% (95% CI= 1.2-9.7), Asia, 4.1% (95% CI= 3.1-5.1), and Europe, 3.5% (95% CI = 2.5-4.5). The prevalence of A. platys with PCR was 16.1% (95% CI= 14.2-17.9), and of A. phagocytophilum, 3.7% (95% CI= 2.8-4.6). Conclusions. The study showed a high prevalence of the infection, with a greater presence of A. platys, in a low number of publications worldwide, with highly heterogeneous results when considering countries, diagnostic techniques, and species involved.

Recovery of environmental Cryptococcus neoformans and Cryptococcus gattii in Cúcuta and association with clinical isolates / Recuperación de Cryptococcus neoformans y C. gattii ambientales y su asociación con aislados clínicos en Cúcuta, Colombia

ABSTRACT Objective. Isolate, identify and molecularly characterize pathogenic Cryptococcus isolates for humans from environmental and clinical samples from the city of Cúcuta. Materials and methods. A total of 1300 samples were collected from 446 trees of 10 different species in 10 public areas of Cúcuta. Concomitantly, clinical isolates of Cryptococcus neoformans were obtained (June 2016-June 2017). The samples were cultivated in Guizottia abysinica seed medium and were then biochemically identified and characterized by PCR fingerpinting and RFLP of the URA5 gene. Results. C. neoformans displayed an environmental prevalence of 4.3% (19 positive individuals), and that of C. gattii was 0.2% (1 positive individual); this yielded a total of 20 Cryptococcus-positive trees and 21 isolates (two from the same individual). Santander Park registered 47.6% of the global prevalence (10/21 isolates), followed by La Victoria Park with 23.8% (5/21 isolates), corresponding to C. neoformans. One C. gattii isolate was collected from a Ficus benjamina tree located in Mercedes Ábrego Park. Genotypic analysis revealed the presence of C. neoformans var. grubii VNI in 85.7% of environmental isolates as well as 100% of clinical isolates. VNII and VGII molecular types represented 9.5% and 4.8% of the environmental isolates, respectively. Conclusions. The longitudinal sampling of previously reported environmental niches of the fungus reveals its presence and suggests that permanent monitoring is required both in the environment and in patients, especially in endemic areas of the city.

RESUMEN Objetivo. Aislar, identificar y caracterizar molecularmente aislamientos de Cryptococcus patógenos para humanos a partir de muestras ambientales y clínicas de la ciudad de Cúcuta. Materiales y métodos. Se recolectaron 1300 muestras de 446 árboles de 10 especies diferentes, en 10 zonas públicas de Cúcuta. Concomitantemente, se obtuvieron aislados clínicos de Cryptococcus neoformans (junio de 2016-junio de 2017). Se realizó cultivo en agar semillas de Guizottia abysinica, posterior identificación bioquímica y caracterización genética mediante PCR-huella Digital y RFLP-URA5. Resultados. Se determinó prevalencia ambiental para C. neoformans de 4.3% (19 individuos positivos) y C. gattii de 0.2% (1 individuo positivo), para un total de 21 aislados y 20 árboles positivos. El parque Santander registró el 47.6% de la prevalencia global (10/21 aislados), seguido del parque La Victoria con 23.8% (5/21 aislados), correspondientes a C. neoformans. Se obtuvo un aislado de C. gattii en un individuo Ficus benjamina del parque Mercedes Ábrego. El análisis genotípico reveló presencia de C. neoformans var. grubii VNI en el 85.7% de los aislados ambientales, así como en el 100% de los clínicos, seguido de VNII y VGII en 9.5% y 4.8% de los aislados ambientales, respectivamente. Conclusiones. El muestreo longitudinal de los nichos ambientales previamente reportados del hongo revela su presencia y sugiere que se requiere una vigilancia permanente tanto en el medio ambiente como en los pacientes, especialmente en las zonas endémicas de la ciudad.