PCorteSoft - Sistema para la determinación del punto de corte óptimo en escalas predictivas y la categorización de variables continuas

Al desarrollar modelos de predicción para su aplicación en la práctica clínica, los profesionales de la salud suelen categorizar las variables clínicas que son de naturaleza continua. En muchas ocasiones estos modelos constituyen la base para la confección de escalas predictivas, a partir de las cuales se estratifica a los pacientes en varias categorías atendiendo al fenómeno estudiado. En estos casos se requiere la determinación de uno o varios puntos de cortes que permitan dividir el recorrido de la variable, variables continuas o puntuaciones de una escala, en dos o más categorías. El presente trabajo tiene como objetivo la automatización de diferentes métodos para dicotomizar variables continuas en modelos de predicción clínica, donde la variable respuesta es dicotómica, y determinar el punto de corte óptimo en la estratificación de pacientes en dos categorías, a partir de escalas de predicción. Para ello se elaboró un software en el lenguaje de programación R, que implementa diferentes métodos para la determinación del punto de corte óptimo, lo cual agiliza el trabajo investigativo de los especialistas de salud en el proceso de elaboración de modelos predictivos y/o escalas de predicción.

When developing predictive models for application in clinical practice, health professionals often categorize clinical variables that are continuous in nature. In many cases, these models are the basis for the development of predictive scales from which patients are stratified into various categories according to the phenomenon under study. In both cases, it is necessary to determine one or more cut-off points that allow dividing the path of the variable, continuous variables, or scores of a scale into two or more categories. The aim of the present work is to automate different existing methods for dichotomizing continuous variables in clinical prediction models where the response variable is dichotomous, as well as to determine the optimal cut-off point for stratifying patients into two categories, based on prediction scales. For this purpose, a software was developed in the R programming language, which implements different existing methods for the determination of the optimal cut-off point, speeding up the research work of health specialists in the process of developing predictive models and/or prediction scales.

Determinación de valores de corte de 17 hidroxiprogesterona ajustados por edad gestacional para la pesquisa neonatal de la hiperplasia suprarrenal congénita / Assessment of gestational age-adjusted 17-hydroxyprogesterone cut-off values for neonatal screening of congenital adrenal hyperplasia

La pesquisa neonatal de hiperplasia suprarrenal congénita se realiza mediante la determinación de 17 hidroxiprogesterona (17OHP) en gotas de sangre seca en papel de filtro. Los bebés prematuros presentan valores más elevados que los bebés de término, siendo de utilidad contar con límites de corte apropiados. Nuestro objetivo fue actualizar los valores de corte de 17OHP ajustados por edad gestacional para la metodología en uso a nivel nacional por las jurisdicciones asistidas por el "Programa Nacional de Fortalecimiento de la Detección Precoz de Enfermedades Congénitas". La 17OHP se determinó utilizando el kit comercial de enzimo-inmunoanálisis (ELISA competitivo), Elizen Neonatal 17OHP Screening (Zentech, Bélgica). Se obtuvieron límites de corte utilizando percentiles de la distribución de los valores de 17OHP para cada edad gestacional. La sensibilidad obtenida fue 100%, especificidad 98,76 %, tasa de falsos positivos 1,24 % y el valor predictivo positivo 1,12 %. Destacamos la importancia de disponer de límites de corte adecuados a la población. La armonización de los mismos permitirá resultados comparables entre los programas regionales de pesquisa neonatal (AU)

Newborn screening for congenital adrenal hyperplasia is performed by the measurement of 17-hydroxyprogesterone (17OHP) in dried blood spots on filter paper. Premature infants have higher values than full-term infants, and appropriate cutoff values are useful. Our aim was to update the cut-off values of 17OHP adjusted for gestational age for the methodology used at a national level in regions assisted by the "National Program for Strengthening the Early Detection of Congenital Diseases". 17OHP was determined using the commercial enzyme-linked immunosorbent assay (competitive ELISA) kit, Elizen Newborn 17OHP Screening (Zentech, Belgium). Cut-off values were obtained using percentiles of the distribution of 17OHP values for each gestational age. Sensitivity was 100%, specificity 98.76%, false positive rate 1.24%, and positive predictive value 1.12%. It is important to have cut-off values that are adjusted to the population. Harmonization will allow for the comparison of results among regional newborn screening programs (AU)

Índice TG/HDL para identificar a sujetos con síndrome metabólico en población mexicana / TG/HDL index to identify subjects with metabolic syndrome in the Mexican population

Resumen Antecedentes: El índice triglicéridos/lipoproteína de alta densidad (TG/HDL) ha sido propuesto como un indicador de riesgo cardiovascular. En México, existe un estudio en adultos jóvenes que lo relaciona con resistencia a la insulina, pero no se ha definido un punto de corte que distinga a sujetos con síndrome metabólico. Objetivo: Determinar el punto de corte para el índice TG/HDL que identifique a sujetos con síndrome metabólico en población mexicana. Métodos: El síndrome metabólico se diagnosticó mediante los criterios establecidos en el Tercer Reporte del Panel de Tratamiento para Adultos del Programa Nacional de Educación en Colesterol adaptados a la población mexicana. Para identificar el punto de corte del índice TG/HDL se utilizó el análisis de curvas ROC y el índice de Youden. Resultados: En el estudio participaron 1318 sujetos con edad de 40.9 ± 13.0 años; 65.6 % fuerin mujeres y 34.4 % hombres; 41.2% presentó síndrome metabólico. El índice TG/HDL obtuvo un valor del área bajo la curva de 0.85 y un valor óptimo de punto de corte ≥ 3.46, con sensibilidad de 79.6 % y especificidad de 76.4 %. Conclusiones: El punto de corte ≥ 3.46 para el índice TG/HDL es adecuado para identificar a sujetos con síndrome metabólico en población mexicana.

Abstract Background: The triglyceride/high-density lipoprotein (TG/HDL) index has been proposed as an indicator of cardiovascular risk. In Mexico, there is a study in young adults that relates it to insulin resistance, but no cutoff point that identifies subjects with metabolic syndrome has been defined. Objective: To determine the cutoff point for the TG/HDL index that identifies subjects with metabolic syndrome in the Mexican population. Methods: Metabolic syndrome was diagnosed using the criteria established by the Third Report of the Adult Treatment Panel of the National Cholesterol Education Program adapted to the Mexican population. To identify the TG/HDL index cutoff point, ROC curve analysis and the Youden index were used. Results: 1,318 subjects aged 40.9 ± 13.0 years participated in the study; 65.6% were women and 34.4% men; 41.2% had metabolic syndrome. The TG/HDL index obtained an area under the curve of 0.85 and an optimal cutoff point value ≥ 3.46, with a sensitivity of 79.6% and specificity of 76.4%. Conclusions: TG/HDL index cutoff point ≥ 3.46 is suitable for identifying subjects with metabolic syndrome in the Mexican population.

Valor de corte de los índices de ajuste en el análisis factorial confirmatorio

Resumen En las investigaciones psicológicas resulta de amplia relevancia conocer si los cuestionarios utilizados miden los constructos latentes de interés. A tal efecto, el Análisis Factorial Confirmatorio se emplea frecuentemente en la literatura especializada para aportar evidencias de validez a las escalas empleadas. Sin embargo, en la actualidad existe cierta disparidad de criterios respecto de los puntos de corte que deben tenerse en consideración. Por este motivo, el presente trabajo se propone revisar la literatura en torno a los diferentes puntos de corte tradicionales de los índices de ajuste más utilizados. Se concluye que para seleccionar los indices e interpretar los resultados se debe tener en cuenta que estos puntos de corte pueden cambiar por diferentes motivos, tales como el tamaño de la muestra.

Abstract In psychological research, it is of great relevance to know whether the questionnaires used measure the latent constructs of interest. For this purpose, Confirmatory Factor Analysis is frequently used in the specialized literature to provide evidence of validity to the scales used. However, there is currently a certain disparity in the criteria regarding the cut-off points to be taken into consideration. For this reason, this paper aims to review the literature on the different cut-off points for the most commonly used fit indexes. It is concluded that to select the indexes and interpret the results, it should be should take into account that these cut-off points may change for different reasons, such as sample size.

Valor de corte de la circunferencia de la cintura como predictor de disglucemia / Cut-off point of the waist circumference as a predictor of dysglycemia

Introducción: la circunferencia de la cintura es un parámetro clínico útil para identificar alteraciones en el metabolismo de los carbohidratos, pero la Organización Mundial de la Salud recomienda que cada país o región debe establecer sus propios valores de corte. Objetivo: determinar el punto de corte de la circunferencia de cintura como predictor de disglucemia en una población cubana. Métodos: se realizó un estudio descriptivo transversal basado en 982 pacientes (457 hombres y 525 mujeres) que asistieron a las consultas del Instituto Nacional de Endocrinología por sospecha de diabetes mellitus tipo 2, entre abril de 2008 y abril de 2013. La metodología consistió en la realización de un interrogatorio y un examen físico, que incluyó la medición de la circunferencia de cintura y estudios de laboratorio que se completaron con una prueba de tolerancia a la glucosa oral. Se determinaron distribuciones de frecuencia de las variables cualitativas y de las cuantitativas, media y desviación estándar. Además se utilizaron el coeficiente de correlación de Pearson, regresión lineal simple, el análisis de las curvas Receiver Operator Characteristics y la prueba de chi cuadrado. Resultados: se halló una correlación positiva entre la circunferencia de cintura y los valores de glucemia, insulinemia, ácido úrico y el índice Homeostasis Model Assessment Estimate of Insulin Resistance. La circunferencia de la cintura en ambos sexos fue la variable con mayor poder predictor de disglucemia, con un punto de corte de cintura de 86,75 cm en hombres y 80,5 cm en las mujeres. Conclusiones: el punto de corte óptimo de la circunferencia de cintura como predictor de disglucemia en hombres es de 86,75 cm (87) y en mujeres de 80,5 cm (81) en una población cubana(AU)

Introduction: waist circumference is a useful clinical parameters to identify alterations in carbohydrate metabolism; however the World Health Organization recommends that each country or region should set its own cut off point values. Objective: to determine the cut-off point of the waist circumference as a predictor of dysglycemias in a Cuban population. Methods: a cross-sectional descriptive study was conducted in 982 patients (457 men and 525 females) who went to the medical offices of the National Institute of Endocrinology on suspicion of diabetes mellitus type 2 from April 2008 to April 2013. The methodology consisted of administration of questionnaires and physical examination including the measurement of waist circumference and lab studies that were completed with the oral glucose tolerance test. Frequency distributions of the qualitative and quantitative variables, the median and standard deviation were all determined. Additionally, Pearson´s correlation coefficient, the simple linear regressions, analysis of Receiver Operator Characteristic curves and the Chi-square test were also used. Results: positive correlation was found between the waist circumference and the glycemia, insulinemia, uric acid and the homeostasis model assessment estimate of insulin resistance. Waist circumference in both sexes was the variable with greatest predictive power for dysglycemia, with a cutoff point of 86.75 cm for men and 80.5 cm for women. Conclusions: the optimal cutoff point of waist circumference as a dysglycemia predictor in men is 86.75 cm (87) and in women is 80.5 (81) in a Cuban population(AU)

Susceptibilidad del género aspergillus a los antifúngicos por el método de microdilución en caldo / Susceptibility of the aspergillus genus to antifungal agents by the broth microdilution method

La aspergilosis es una micosis ocasionada por el género Aspergillus que afecta tanto a pacientes inmunocompetentes como inmunosuprimidos. La presentación clínica depende del estado inmune del hospedero y de los factores de riesgo asociados; en la medida en que progrese la inmunosupresión habrá mayor probabilidad de adquirir la enfermedad invasora que se asocia a una elevada morbimortalidad. El objetivo de este trabajo fue Establecer la susceptibilidad del género Aspergillus a diferentes antifúngicos por el método de Microdilución en caldo según el documento M38-A2, con el fin de conocer los patrones de susceptibilidad de los aislados clínicos de Aspergillus spp. Se utilizaron 76 cepas clínicas que se encuentran en resguardo en la micoteca del Departamento de Micología del Instituto Nacional de Higiene "Rafael Rangel". Se utilizaron cepas controles A. fumigatus ATCC 204305, A. flavus ATCC 204304, C. parapsilosis ATCC 22019 y C. krusei ATCC 6258. Obteniendo como resultado que las CMI más elevadas in vitro frente a las 4 especies de Aspergillus fueron Voriconazol y AmB. Itraconazol y Caspofungina reportaron las CMI más bajas y por consiguiente los PCE obtenidos se encontraron entre más o menos 2 CMI comparadas con otras investigaciones. Este estudio aportó información importante sobre el comportamiento del género Aspergillus frente a los antifúngicos más utilizados en el tratamiento de la aspergilosis en nuestro país como a nivel mundial.

Aspergillosis is a mycosis caused by the genus Aspergillus that affects both immunocompetent and immunosuppressed patients. The clinical presentation depends on the host's immune status and the associated risk factors; As immunosuppression progresses, there is a greater probability of acquiring the invasive disease that is associated with high morbidity and mortality. The objective of this work was to establish the susceptibility of the genus Aspergillus to different antifungals by the method of Microdilution in broth according to document M38-A2, in order to know the susceptibility patterns of the clinical isolates of Aspergillus spp. Seventy-six clinical strains were used in the mycology department of the National Institute of Hygiene "Rafael Rangel". Control strains A. fumigatus ATCC 204305, A. flavus ATCC 204304, C. parapsilosis ATCC 22019 and C. krusei ATCC 6258 were used. As a result, the highest MICs in vitro against the 4 Aspergillus species were Voriconazole and AmB. Itraconazole and Caspofungin reported lower MICs and therefore the PCEs obtained were found between plus or minus 2 MICs compared to other investigations. This study provided important information about the behavior of the genus Aspergillus against the most commonly used antifungals in the treatment of aspergillosis in our country as a worldwide.

Establecer puntos de cortes epidemiológicos de la actividad in vitro de azoles frente a los aislados de candida spp por el método de etest y microdilución en caldo / Establish epidemiological cut-off points for the in vitro activity of azoles against candida spp. isolates, by the etest method and broth microdilution

Durante las últimas décadas, el aumento de la prevalencia de las infecciones fúngicas ha sido constante, convirtiéndose en uno de los retos sanitarios actuales dado el incremento de morbimortalidad y de los costos asociados a Infecciones por Candida; la tasa de mortalidad es del 47% marcado por el cambio epidemiológico de las especies de Candida diferentes de C. albicans; las cuales presentan resistencia a los antifúngicos; por lo que es necesario establecer puntos de corte epidemiológico que permitan la indicación del antifúngico adecuado y precoz para minimizar resistencia y morbi-mortalidad. Se analizaron 102 aislados, la especie más frecuente fue Candida pelliculosa (43%), seguida por C. parapsilosis (34%), C. tropicalis (9%), C. albicans (6%), C. lipolytica (4%) y con un 2% correspondiente para C. guilliermondii y C. glabrata. Los valores obtenidos por microdilución en caldo y difusión por Etest, como punto de corte epidemiológico (PCE en µg/mL) fueron en fluconazol, voriconazol y posaconazol 4, 0,25 y 1 respectivamente para C. pelliculosa; 2, 0,06 y 0,125 para C. parapsilosis; 2, 0,25 y 0,125 corresponde a C. tropicalis; 2 , 0,125 y 0,25 para C.albicans. A C. lipolytica, C. guillermondii y C. glabrata la cantidad de aislados no eran representativo para determinar el PCE. Se encontró una resistencia de 9,8%, a los triazoles. Ambos métodos presentaron una correlación de 0.99 se recomienda el uso de Etest para determinar la Concentración Mínima Inhibitoria en el Laboratorio de Microbiología y detectar resistencia de forma precoz.

During the last decades, there has been a constant increase of the prevalence of fungal infections, becoming one of the actual sanitary challenges given the increase of death rates and costs associated to infections caused by Candida., the mortality is 47% marked by the epidemiological change of the different from the C. albicans species of Candida., which present resistence to fungus treatments, that is why it is necessary to state epidemiological cuts that allow the indication of the proper antifungus treatment at an early moment to minimize resistance and high death rate., 102 strains were analyzed., the most common species was Candida pelliculosa (43%), followed by C. parapsilosis(34%), C tropicalis(9%), C albicans (6%), C. lipolityca (4%), and a 2% corresponds to C. guillermondii and C . glabrata. The values obtained by microdilution in broth and Etest diffusion as an epidemiological cutoff values (EVC in µg/ml) were in fluconazole, voriconazol and posaconazole 4, 0.25 and 1 respectively for C. pelliculosa., 2, 0.06 and 0.125., C parapsilosis; 2, 0.25 and 0.125., it corresponds to C. tropicalis; 2, 0.125 and 0.25 for C albicans, C lipolityca, C. guillermondii and C. glabrata the amount of isolates was not reprentative enough to determine the ECV. A resistante of 9.8% was found. Both methods presented a correlation of 0.99 and the Etest is recomended to determine the minimum inhibitory concentration in laboratory to detect resistance earlier

Distribución de la concentración inhibitoria mínima y puntos de corte "wild-type" en bacterias de origen animal en Argentina / Wild-typeminimal inhibitory concentration distributions in bacteria of animal origin in Argentina

El objetivo de este estudio fue determinar los patrones de resistencia antimicrobiana en bacterias indicadoras aisladas de muestras fecales de animales domésticos. La concentración inhibitoria mínima (CIM) fue determinada por el método de dilución en agar. El criterio de interpretación usado se basó en la distribución de la CIM y el punto de corte epidemiológico (ECOFF o ECV) de acuerdo con los datos del European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST). Los resultados obtenidos de 237 aislamientos de Escherichia coli mostraron sensibilidad reducida a ampicilina, estreptomicina y tetraciclina, antimicrobianos comúnmente usados en porcinos y aves de explotación intensiva. Con respecto a todas las especies del género Enterococcus spp., solo existe ECOFF o ECV para la vancomicina. De los 173 Enterococcus spp. aislados, sólo uno presentó sensibilidad reducida a dicho agente y fue categorizado como población 'non-wild-type' (NWT). Este es el primer informe en Argentina que presenta datos de puntos de corte epidemiológico en bacterias animales

The aim of this study was to determine the antimicrobial resistance profiles of indicator bacteria isolated from domestic animal feces. Minimal inhibitory concentration (MIC) was determined by agar dilution. Interpretative criteria on the basis of wild-type MIC distributions and epidemiological cutoff values (ECOFF or ECV) were used according to the 'European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing' (EUCAST) data. Results from 237 isolates of Escherichia coli showed reduced susceptibility for ampicillin, streptomycin and tetracycline, the antimicrobials commonly used in intensive breeding of pigs and hens. Regarding all the species of the genus Enterococcus spp., there are only ECOFF or ECV for vancomycin. Of the 173 Enterococcus spp. isolated, only one showed reduced susceptibility to vancomycin and was classifi ed as 'non-wild-type' (NWT) population. This is the fi rst report in Argentina showing data of epidemiological cutoff values in animal bacteria

Estimación del punto de corte de la circunferencia abdominal como criterio diagnóstico del síndrome metabólico / Estimated cutoff abdominal circumference of metabolic syndrome diagnosis criterion

Introducción: la circunferencia abdominal constituye un factor de riesgo aterogénico y un criterio para obtener el diagnóstico del síndrome metabólico. Diversos organismos internacionales han recomendado que el punto de corte de esta circunferencia para definir dicho síndrome sea determinado contextualmente en cada país. Sin embargo, en Cuba no existen estudios que se hayan encaminado a tal fin. Objetivo: estimar el punto de corte de la circunferencia abdominal para el diagnóstico del síndrome en un grupo poblacional. Métodos: se realizó un estudio observacional, de corte transversal, en 703 sujetos pertenecientes a la región Holguín-Granma. Se tomaron las variables que definen el síndrome metabólico según los criterios del Adult Treatment Panel III modificados. Se obtuvieron las curvas COR (Receiver Operador Characteristics) para cada sexo de los diferentes valores de la circunferencia para discriminar aquellos sujetos con dos criterios diagnósticos o más de este síndrome. Se escogió el punto de corte según el índice de Youden. Resultados: el punto de corte de la circunferencia abdominal obtenido fue de 97 cm para los hombres y de 85 cm para las mujeres, con una sensibilidad del 55 % y especificidad del 91 % en el caso de los hombres, y 87 y 72 % respectivamente para las mujeres. Conclusiones: el punto de corte de la circunferencia abdominal para ser empleado en nuestro contexto para el diagnóstico del síndrome metabólico es de 97 cm en el hombre y de 85 cm en la mujer.

Introduction: waist circumference is an atherogenic risk factor and a criterion for metabolic syndrome diagnosis. Various international organizations have recommended that the cutoff point of this circumference to define that the abovementioned syndrome would be contextually determined in each country. However, in Cuba, there are no studies aiming this end. Objective: to estimate the cutoff point of waist circumference for the diagnosis of this syndrome in a population group. Methods: an observational, cross-sectional study was conducted in 703 patients at the Holguin Granma region. Variables defining the metabolic syndrome according to the modified criteria of Adult Treatment Panel III were taken. The curves of Receiver Operator Characteristics (ROC) were obtained for each sex at different values of the circumference to discriminate those subjects with two or more diagnostic criteria in this syndrome. The cutoff point was chosen according to Youden rate. Results: the cutoff abdominal circumference obtained was 97 cm in men and 85 cm in women, with 55% sensitivity and 91% specificity in men, and 87 and 72% respectively in women. Conclusions: in our context, the cutoff point of abdominal circumference to be used for diagnosing of metabolic syndrome is 97 cm in men and 85 cm in women.