Polymorphisms of the GSTT1 and GSTM1 genes in polycystic ovary syndrome

SUMMARY BACKGROUND: This study aimed to investigate the deletion polymorphisms of the genes of the glutathione S-transferase family GSTT1 and GSTM1 in patients with Polycystic Ovarian Syndrome (PCOS), comparing them with a control population. METHODS: Blood was collected from 219 women (110 with PCOS and 109 controls) and genomic DNA was extracted. For the analysis of polymorphisms, the technique used was multiplex PCR. In the statistical analysis, the chi-square test and multiple logistic regression were used. RESULTS: There is no association between the GSTM1 null and GSTT1 null genotypes with PCOS when analyzed separately (P = 0.616 and P = 0.188). The analysis of the combined genotypes showed differences between the groups (P < 0.05), evidencing that the genotypic combination GSTT1 positive and GSTM1 negative is more frequent among patients. In the multivariate analysis, smoking was more frequent in the control group (OR = 0.22; 95% CI - 0.87-0.57; P = 0.002) while the presence of a family history of PCOS (OR = 2, 96; 95% CI - 1.54-5.68; P = 0.001) was more frequent in women with PCOS. CONCLUSIONS: In the studied sample, the deletion polymorphisms of the GSTT1 and GSTM1 genes isolated are not associated with PCOS, but in combination, they may be implicated in the etiology of the condition.

RESUMO OBJETIVO: Este estudo teve como objetivo investigar os polimorfismos de deleção dos genes da família glutationa S-transferase GSTT1 e GSTM1 em pacientes com síndrome dos ovários policísticos (SOP), comparando-as com uma população controle. MÉTODOS: Foi colhido sangue de 219 mulheres (110 com SOP e 109 controles) e extraído o DNA genômico. Para análise dos polimorfismos, a técnica empregada foi PCR multiplex. Na análise estatística foi utilizado o teste do qui-quadrado e regressão logística múltipla. RESULTADOS: Não há associação dos genótipos GSTM1 nulo e GSTT1 nulo com SOP quando analisados isoladamente (p=0,616 e p=0,188). A análise dos genótipos combinados mostrou diferenças entre os grupos (p<0,05), evidenciando que a combinação genotípica GSTT1 positivo e GSTM1 negativo é mais frequente entre as pacientes. Na análise multivariada, o hábito tabagista foi mais frequente no grupo controle (OR=0,22; IC 95% - 0,87-0,57; p=0,002), enquanto que a presença do histórico de SOP familiar (OR=2,96; IC 95% - 1,54-5,68; p=0,001) foi mais frequente nas mulheres com SOP. CONCLUSÕES: Na casuística estudada, os polimorfismos de deleção dos genes GSTT1 e GSTM1 isolados não estão associados a SOP, mas em combinação podem estar implicados na etiologia da condição.

Prueba de concepto de una pcr multiplex de primera generación (cualitativa) para detección del oncogén e7 de vphs de alto riesgo

Introducción: Infección persistente con el virus de papiloma humano de alto riesgo (VPH-AR) causa cáncer de cuello uterino (CCU). Existen ensayos moleculares para la detección y la genotipificación del gen L1 de VPH, sin embargo, L1 puede perderse durante la integración viral. La expresión e integración del oncogén E7 es fundamental para el desarrollo de CCU. Objetivo: Estandarizar una PCR multiplex (mPCR) del oncogén E7 (E7-mPCR) para genotipificación de los VPH-AR de mayor frecuencia en CCU (VPH-16, -18, -31, -33, -45 y -52). Métodos: Se obtuvieron cepillados cervicales de voluntarias y se analizaron amplificando por PCR el gen L1 con subsecuente hibridación reversa. Posteriormente, se escogieron 59 muestras positivas para VPH-AR y se analizaron por E7-mPCR. Resultados: Se evidenció una elevada concordancia entre los resultados del ensayo E7- mPCR y los de la PCR de L1 (concordancia observada de 95,1%, Kappa de Cohen = 0,88), encontrándose mayor número de infecciones por VPH- AR en el 15,8% con E7-mPCR. Conclusión: E7-mPCR es una herramienta diagnóstica con alta concordancia y económica que puede adaptarse a una plataforma de mayor complejidad para procesar y detectar mayor cantidad de muestras y genotipos de VPH-AR.

Introduction: The persistent infection of the high-risk Human Papiloma Virus (VPH-AR in Spanish) causes uterine cervix cancer (CCU in Spanish). There are molecular essays for detection and genotyping of gen L1 of VPH. However, L1 may get lost during the viral integration. The expression and integration of oncogene E7 is fundamental for the development of CCU. Objective: To standardize a multiplex PCR (mPCR) of oncogene E7 (E7-mPCR) for genotyping the VPH- AR of highest frequency in CCU (VPH-16, -18, -31, -33, -45 y -52). Method: We obtained cervix brushing simples from volunteers and we analyzed them by amplifying the L1 gene through PCR with a subsequent reverse hybridization. After that, we chose 59 positive VPH- AR samples and we analyzed them for E7-mPCR. Results: We found out a high concordance between the results of the essay E7-mPCR and those of L1 PC (Observed concordance was of 95.1%, Cohen's Kappa = 0.88), and we revealed a higher number of infections for VPH-AR in a 15.8% with E7-mPCR. Conclusion: E7-mPCR is an economic diagnostic tool with high concordance which can be adapted to a platform with more complexity to process and detect a higher number of samples and VPH-AR genotypes.

Introdução: a infecção persistente com o virus de papiloma humano de alto risco (HPV-AR) causa cáncer de colo do útero (CCU). Existem ensaios moleculares para detecção e para a genotipificação do gene L1 de HPV; contudo, L1 pode ser perdido durante a integrado viral. A expressão e integração do oncogênese E7 é fundamental para o desenvolvimento do CCU. Objetivo: padronizar uma PCR multiplex (mPCR) do oncogênese E7 (E7-mPCR) para genotipificação dos HPV-AR de maior frequência no CCU (HPV-16, -18, -31, -33, -45 e -52). Métodos: foram realizadas raspagens com escova cervical rodada em voluntárias e foram analisadas a partir da amplificação do gene L1 por PCR com subsequente hibridação inversa. Em seguida, foram escolhidas 59 amostras positivas para HPV-AR, as quais foram analisadas por E7-mPCR. Resultados: foi evidenciada elevada concordância entre os resultados do ensaio E7-mPCR e os da PCR de L1 (concordância observada de 95,1%, Kappa de Cohen = 0,88), encontrando-se maior número de infecções por HPV-AR em 15,8% com E7-mPCR. Conclusão: E7-mPCR é uma ferramenta diagnóstica com alta concordância e económica que pode ser adaptada a uma plataforma de maior complexidade para processar e detectar maior quantidade de amostras e genótipos de HPV-AR.

No association between glutathione S-transferase M1 and T1 gene polymorphisms and susceptibility to endometriosis / Ausência de associação entre polimorfismos nos genes da glutationa-S transferase M1 e T1 e suscetibilidade à endometriose

ABSTRACT Introduction: Endometriosis is a common gynecologic disorder influenced by genetic and environmental factors. The glutathione S-transferase family is associated with endometriosis because its main function is cellular detoxification, so the absence of those enzymes may be a factor for the development of the disorder. Objective: Investigate the relationship between polymorphisms of GSTM1 and GSTT1 genes and endometriosis, in order to gain a better understanding of the association between detoxification genes and the susceptibility to endometriosis. Material and methods: Case-control study in 132 women (49 with endometriosis and 83 of the control group). The genotype was determined using multiplex polymerase chain reaction (PCR), observed in 10% polyacrylamide gel electrophoresis stained with silver nitrate, and statistical analysis was performed. Results: There was not a significant difference between the GSTM1 and GSTT1 null genotype in the endometriosis group and the control group (p = 0.9956). The same result was observed with the combined genotype (p = 0.8129). Conclusion: In the present study, the GSTM1 and GSTT1 polymorphisms are not associated with a higher risk of endometriosis.

RESUMO Introdução: A endometriose é uma doença ginecológica comum influenciada por fatores genéticos e ambientais. A família de glutationa-S-transferase está associada à endometriose porque tem como principal função a detoxificação celular, de modo que a ausência dessas enzimas pode ser um fator no desenvolvimento da doença. Objetivo: Investigar a relação entre polimorfismos nos genes GSTM1 e GSTT1 e endometriose, a fim de melhor compreender a associação entre os genes de detoxificação e a suscetibilidade à endometriose. Material e métodos: Estudo caso-controle em 132 mulheres (49 com endometriose e 83 do grupo- controle). O genótipo foi determinado utilizando reação em cadeia da polimerase (PCR) multiplex, observado em eletroforese em gel de poliacrilamida 10% corado com nitrato de prata, e a análise estatística foi empregada. Resultados: Não houve diferença significativa entre o genótipo nulo GSTM1 e GSTT1 no grupo endometriose e no controle (p = 0,9956). O mesmo resultado foi observado para o genótipo combinado (p = 0,8129). Conclusão: No presente estudo, os polimorfismos GSTM1 e GSTT1 não estão associados a maior risco de endometriose.

Investigação da variação no número de cópias genômicas (CNVs) em pacientes com anomalias congênitas e atraso de desenvolvimento neuropsicomotor (ADNPM) pela técnica de MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) / Investigation of the copy number variation (CNVs) in patients with congenital anomalies (CA) and mental retardation (MR) using the MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) technique

INTRODUÇÃO: Os desequilíbrios genômicos constituem causa frequente de abortamento, anomalias congênitas (AC) e atraso de desenvolvimento neuropsicomotor (ADNPM). O aprimoramento de novas técnicas de diagnóstico citogenômico, como por exemplo, a MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) e a triagem ampla do DNA utilizando arrays, mostraram que a alteração no número normal de cópias genômicas (CNVs) influencia na patogenicidade dos fenótipos em diversas síndromes. OBJETIVOS: Com isso, os objetivos do presente estudo foram identificar CNVs em pacientes com MC e ADNPM utilizando a técnica de MLPA e, a partir dos resultados alterados, aplicar da técnica de array para a identificação de possíveis rearranjos complexos, além de associar as alterações moleculares encontradas com o fenótipo dos pacientes. MÉTODOS: Participaram do estudo 416 pacientes com MC e ADNPM. As amostras de DNA foram analisadas utilizando a técnica de MLPA com kits comerciais para as principais síndromes de microdeleções (P064) e regiões subteloméricas (P036 e P070). Dois kits de MLPA específicos para as regiões 7q11.23 (P029) e 22q11.2 (P250) também foram utilizados para complementar a identificação de CNVs atípicas. Entre os casos que apresentavam alterações pela técnica de MLPA, 15 pacientes foram submetidos à técnica de array, utilizando três diferentes plataformas: Agilent SurePrint G3 Genoma Humano microarray 180 K, HumanCytoSNP-12 BeadChip, CytoScan(TM) HD array 6.0 Affymetrix®. RESULTADOS: A análise molecular pela técnica de MLPA possibilitou a detecção de microdeleções e/ou microduplicações em 97 pacientes sendo que: em 46 pacientes foi possível encontrar alterações utilizando apenas o kit P064 (microdeleções), em 34 pacientes utilizando apenas os kits P036 e P070 (regiões subteloméricas) e em quatro pacientes só foi possível identificar a alteração utilizando outro kit de MLPA (P250), específico para alterações genômicas em 22q11.2. Rearranjos complexos, envolvendo mais...

INTRODUCTION: Genomic imbalances are the most common cause of miscarriage, congenital anomalies (CA) and mental retardation (MR). With the improvement of new cytogenomics diagnostic techniques, such as the MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification) and the array techniques, it have been shown that changes in the normal gene copy number influence the pathogenic variability of phenotypes in different syndromes. AIMS: The aims of the present study were to identify CNVs in patients with CM and RM using the MLPA technique and, from the abnormalities results, to apply the array methodology for the identification of complex rearrangements. Furthermore, the study aimed to associate the alterations found by molecular techniques with the phenotype of patients. METHODS: 416 patients with CM and RM participated in the study. The samples were analysed by MLPA technique with commercial kits for the main microdeletion syndromes (P064) and subtelomeric regions (P036 and P070). Two more MLPA kits for specific regions 7q11.23 (P029) and 22q11.2 (P250) were used to confirm the altered results and to complement some results with the identification of atypical abnormalities. From the patients who presented abnormalities by MLPA technique, 15 underwent by microarray-based comparative genomic hybridization (CGH-array) technique, using three different platform: Agilent SurePrint G3 Human Genome microarray 180 kb, HumanCytoSNP -12 BeadChip, CytoScan(TM) HD ® and Affymetrix 6.0. RESULTS: The molecular analysis by MLPA technique allowed the detection of microdeletions and/or microduplications in 97 patients. In 46 patients it was possible to find genomic alteration using only MLPA kit P064 and in 34 patients using only the subtelomeric kits P036 and P070. For four patients it was only possible to identify the genomic abnormalities using another specific MLPA kit (P250), involving the 22q11.2 region. Complex rearrangements involving more than three chromosomes were detected...

Estudo do perfilamento gênico tumoral e de marcadores de doença residual mínima (CK19 e c-ErbB-2) através de RT-PCR quantitativo na fração mononuclear do sangue periférico em pacientes com câncer de mama durante o tratamento / Study of tumor gene profiling and minimal residual disease markers (CK19 and c-ErbB-2) by quantitative RT-PCR in peripheral blood mononuclear fraction in patients with breast cancer during chemotherapy

INTRODUÇÃO: De acordo com a estimativa de 2012 do INCA, eram esperados 52.680 novos casos de câncer de mama no Brasil, com um risco estimado de 52 casos a cada 100 mil mulheres. Estes dados mostram a necessidade da identificação de biomarcadores efetivos para rastreamento precoce e seguimento destas mulheres durante seu tratamento. Neste trabalho, para a avaliação de potenciais biomarcadores desta doença, foi idealizado um modelo laboratorial específico que avalie tanto a capacidade de um dado biomarcador rastrear um tumor inicial de mama, bem como testar o seu potencial valor para o seguimento de mulheres já diagnosticadas durante seu tratamento. Este modelo baseia-se na avaliação de células tumorais circulantes e perfilamento gênico tumoral. MÉTODOS: Amostras biológicas (sangue periférico e tumor) de 167 pacientes diagnosticadas com carcinoma mamário estadios I, II e III com indicação de quimioterapia adjuvante para: a) avaliação da presença de células tumorais circulantes através da expressão de CK19 e HER2 na Fração Mononuclear do Sangue Periférico (FMNSP) por RT-PCR quantitativo e b) perfilamento gênico tumoral através da análise da expressão de 21 genes relacionados a importantes processos de carcinogênese mamária em amostras de tecido parafinado por ensaio multiplex de RT-PCR quantitativo utilizando o sistema Plexor®. RESULTADOS: Foi observada uma correlação significativa entre CK19 e HER2 na primeira coleta e queda da concentração de HER2 no SP durante o tratamento; porém, não foi percebida queda significativa do CK19 ao longo do estudo. A expressão de HER2 na segunda coleta de pacientes positivas para HER2 na primeira coleta tendeu a se correlacionar significativamente com um pior Intervalo Livre de Doença (ILD). Através da padronização da pontuação em quartis das análises realizadas em multiplex pelo sistema Plexor, foi percebido que o quartil superior apresentava ILD significativa pior do que a de pacientes nos demais quartis...

BACKGROUND: According to the estimate of 2012 INCA, were expected 52,680 cases of breast cancer in Brazil, with an estimated risk of 52 cases per 100 000 women. These data show the need for effective identification of biomarkers for early screening and follow-up of these women during their treatment. In this work, for the evaluation of potential biomarkers of this disease, a model laboratory was designed to evaluate both the specific capacity of a given biomarker trace an initial breast tumor, as well as test its potential value for the follow-up of women already diagnosed during their treatment. This model was based on the evaluation of circulating tumor cells and tumor gene profiling. METHODS: Biological samples (peripheral blood and tumor) of 167 patients diagnosed with breast cancer stages I, II and III with an indication for adjuvant chemotherapy: a) to evaluate the presence of circulating tumor cells through the expression of HER2 and CK19 in Peripheral Blood Mononuclear fraction (PBMN) by quantitative RT-PCR and b) tumor profiling gene by analyzing the expression of 21 genes related to important processes of mammary carcinogenesis in paraffinized tissue samples by multiplex assay for quantitative RT-PCR using the Plexor ® System. RESULTS: Was observed a significant correlation between HER2 and CK19 in the first collection and decrease in concentration of HER2 in PB during the treatment, but were not perceived significant decrease of CK19 along the study. The expression of HER2 in the second collection of patients positive for HER2 in the first test tended to correlate with a significantly worse disease-free interval (DFI). Through standardization of the scores in quartiles of the analyzes performed at multiplex Plexor system was seen that the upper quartile ILD had significantly worse than patients in the other quartiles...