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1.
Biomédica (Bogotá) ; 39(4): 622-630, oct.-dic. 2019. graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1089080

ABSTRACT

En la mayoría de los casos, la diferenciación sexual masculina ocurre con la participación del gen SRY. Sin embargo, se pueden presentar otros genotipos excepcionales, como en el caso que se presenta en este reporte. Se trata de un paciente adulto de sexo masculino atendido en el Servicio de Paternidades del Instituto de Genética de la Universidad Nacional de Colombia. Se le hicieron los análisis del gen de la amelogenina y de repeticiones cortas en tándem (Short Tandem Repeat, STR) específicas para el gen SRY con estuches comerciales de identificación humana, así como los de cariotipo convencional e hibridación in situ fluorescente del SRY, y el estudio de microdeleciones del cromosoma Y mediante reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Se le hizo la evaluación clínica y se le brindó asesoramiento genético. El paciente no presentaba ambigüedad genital, su cariotipo era 46 XX, y el perfil molecular era negativo para el gen SRY y positivo para el ZFY. Se le diagnosticó un trastorno de diferenciación sexual 46 XX testicular no sindrómico, una rara condición genética. Solo el 20 % de los pacientes con este diagnóstico son negativos para SRY y exhiben perfiles moleculares diversos. La información disponible parece indicar que el ZFY está relacionado con la diferenciación sexual masculina, aún en ausencia del gen SRY.


In most cases, male sexual differentiation occurs with SRY gene mediation. However, exceptional genotypes have been identified, as shown in this paper. This was a male adult patient seen at the Servicio de Paternidades, Instituto de Genética, Universidad Nacional de Colombia. The following procedures were carried out: Amelogenin gene and short tandem repeat analyses using human identification commercial kits, conventional karyotype, SRY fluorescent in situ hybridization, PCR analysis for Y chromosome microdeletions, clinical evaluation, and genetic counseling. We present an adult male with unambiguous genitalia, karyotype 46,XX, and an SRY negative and ZFY positive molecular profile. The diagnosis of nonsyndromic 46,XX testicular disorder of sex development (DSD) -a rare genetic condition- was established. Only 20 % of similarly diagnosed patients are SRY negative and exhibit diverse molecular profiles. Until now, available evidence seems to indicate that, even in the absence of SRY, the ZFY factor is involved in male sexual differentiation.


Subject(s)
Disorders of Sex Development , 46, XX Testicular Disorders of Sex Development , Sex Differentiation , Tandem Repeat Sequences , Genes, sry , Amelogenin
2.
Med. lab ; 20(9-10): 411-432, 2014. tab, graf, ilus
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-834828

ABSTRACT

La investigación científica de la paternidad biológica es un caso especial de la determinación de la relación genética entre dos o más individuos, con base en los principios de la herencia mendeliana simple de los marcadores genéticos, en los que se establecen que los alelos se segregan en la meiosis de forma independiente y discreta. En la evaluación de las relaciones biológicas forenses la prueba de paternidad es el análisis más común, en el cual los perfiles genéticos de dos individuos (o tres si la madre está disponible) son utilizados para comparar la probabilidad relativa de que uno de ellos sea el padre contra la probabilidad de no estar relacionado con la ascendencia del otro individuo analizado. En este caso las repeticiones cortas en tándem (STR) son los marcadores genéticos no ligados más utilizados para la evaluación del parentesco debido a su alto polimorfismo, y a que los resultados obtenidos, usualmente con la aplicación de estadísticas robustas, favorecen la determinación de la relación. Las repeticiones cortas en tándem son típicamente examinadas por la técnica de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) mediante plataformas comerciales de múltiples loci de repeticiones cortas en tándem, eficientes y con gran poder de discriminación. Esta revisión describe el estado actual de las pruebas de paternidad mediante ADN, la metodología, el informe de los resultados y su interpretación, para facilitar su comprensión a los profesionales relacionados de una o de otra manera con estos análisis.


Scientific study of biological paternity is a special case of genetic relationship determinationbetween individuals, based on simple mendelian inheritance principles of genetic markers, which establish that the alleles are segregate independently and discreetly during meiosis. The most common analysis of forensic biological relationships evaluation is the paternity test, which the genetic profiles of two individuals (or three if the mother is available) are uses to compare the relative probability of that one of them being the father against the probability of not is ancestrally related to the other analyzed individual. The short tandem repeats (STR) are the commonly used unlinked genetic markers for relationship evaluation due to their high polymorphism. Besides, the results usually favor the determinationof the relationship when a robust statistical analysis is applied. The short tandem repeats analysis is typically by the polymerase chain reaction (PCR), using multiple short tandem repeats loci on commercial platforms, which are efficient and with high discriminating power. This review describes the current state of DNA paternity test, the methodology, the results report, and the interpretation, to facilitate their understanding to related professionals with these types of analysis.


Subject(s)
Humans , Genetic Testing , Paternity , Polymerase Chain Reaction , Tandem Repeat Sequences
3.
Rev. salud pública ; 11(1): 3-13, ene.-feb. 2009. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-523870

ABSTRACT

Objetivo Evaluar la variabilidad de VNTR (variable-number tandem repeat) de Mycobacterium leprae de pacientes colombianos con y sin tratamiento previo para identificar posibles fuentes de infección y entender los patrones de transmisión de la enfermedad. Metodología Estudio transversal descriptivo, en donde mediante un muestreo electivo a conveniencia se tomaron 161 biopsias de pacientes multibacilares de lepra, que habían sido solicitadas para diagnóstico y seguimiento de la enfermedad, de las cuales se realizó extracción de ADN de M. leprae y usando la técnica de PCR para VNTRs de M. leprae estandarizada, se establecieron los genotipos y los diferentes clusters mediante el agrupamiento apareado UPGMA. Resultados En las 161 muestras totales se hallaron 22 genotipos VNTRs diferentes, de las cuales 100 muestras (62,1 por ciento) pertenecían al genotipo único VNTRU, y de los genotipos restantes, los mayoritarios, es decir los que dieron lugar a formación de grupos o clusters fueron VNTR17 (5,6 por ciento), VNTR20 (4,3 por ciento), VNTR18 (4,3 por ciento), VNTR14 (4,3 por ciento) y VNTR13 (3,7 por ciento). Conclusión En este estudio se evidencia por análisis de agrupamiento que se pueden detectar clones con diferente grado de virulencia/agresividad, lo cual implica la necesidad de incrementar varias de las actividades del programa de control que darán como resultado la verdadera disminución de la transmisión del microorganismo.


Objective Assessing VNTR (variable-number tandem repeat) variability of Mycobacterium leprae from Colombian patients with and without prior treatment to identify potential sources of infection and to understand the patterns of disease transmission. Methodology This was a descriptive cross-sectional study where a convenience sample of biopsies was taken from 161 multibacillary leprosy patients; diagnosis and monitoring of the disease had been requested for these patients. DNA was extracted from M. leprae and standardised using the PCR technique for M. leprae VNTR, ge­notypes were established and different clusters grouped by unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA). Results 22 different VNTR genotypes were found from 161 samples, of which 100 samples (62.1 percent) had a single u-VNTR genotype and the remaining genotypes were VNTR 17 (5.6 percent), VNTR 20 (4.3 percent), VNTR 18 (4.3 percent), VNTR 14 (4.3 percent) and VNTR 13 (3.7 percent), namely those forming groups or clusters. Conclusion This study showed that clones can be detected with varying degrees of virulence / aggressiveness by cluster analysis, implying the need for more monitoring programme activities which will result in a real decline in microorganism transmission.


Subject(s)
Adolescent , Adult , Aged , Aged, 80 and over , Child , Child, Preschool , Female , Humans , Infant , Male , Middle Aged , Young Adult , Leprosy/microbiology , Leprosy/transmission , Mycobacterium leprae/classification , Mycobacterium leprae/genetics , Colombia , Cross-Sectional Studies , Genotype , Tandem Repeat Sequences , Young Adult
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