Estandarización de una técnica de PCR múltiple para la detección de los serogrupos O157, O104 y "big six" de Escherichia coli productora de la toxina Shiga (STEC) / Standardization of a multiplex PCR technique for the detection of Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) serogroups O157, O104 and "big six"

Los serogrupos O26, O45, O103, O104, O111, O121, O145 y O157 de STEC se relacionan con un elevado número de casos de SUH a nivel mundial, por lo que están incluidos dentro de las categorías de mayor riesgo para los humanos, según los criterios de autoridades alimentarias de Estados Unidos y Europa. El método convencional de identificación de antígenos O y H se realiza por aglutinación con antisueros de conejo. Este método además de ser muy costoso y laborioso, no se encuentra disponible en el país para empleo masivo. En este contexto, el objetivo de este estudio observacional descriptivo de corte transverso ha sido la estandarización de una técnica de PCR múltiple para la detección de estos 8 serogrupos, a fin de contar con un sistema de detección eficiente, sensible y con potencial de aplicación en la industria alimentaria. Se estandarizaron reacciones de PCR empleando como controles positivos cepas E. coli de referencia correspondientes a la totalidad de los serogrupos citados. Se obtuvieron productos de tamaños esperados para cada serogrupo, no se observaron amplificaciones cruzadas o falsos positivos. Esta técnica estandarizada podría representar una herramienta rápida y menos costosa que la técnica serológica, con la capacidad de ser aplicada a diferentes matrices, permitiendo la detección de estos serogrupos en aislados STEC de ganado en pie, fuentes de agua de consumo, alimentos e incluso en aislamientos clínicos asociados a enfermedades humanas(AU)

STEC serogroups O26, O45, O103, O104, O111, O121, O145, and O157, are related to a high number of cases of HUS worldwide, so they are included in the categories of greatest risk for humans, according to the food administration criteria of the United States and Europe. The conventional method of identifying antigens O and H is carried out by agglutination with rabbit antisera. This method is very expensive and laborious and is not available in the country for massive-scale use. In this context, the objective of this cross-sectional descriptive observational study has been the standardization of a multiplex PCR technique for the detection of these 8 serogroups, in order to have an efficient and sensitive detection system with the potential for application in the food industry. PCR reactions were standardized using as positive controls reference E. coli strains to correspond to all the mentioned serogroups. Products of expected sizes were obtained for each serogroup; no cross-amplification or false positives were observed. This standardized technique could represent a quick and less expensive tool than the serological technique, with the possibility to be applied to different kind of samples, allowing the detection of these serogroups in STEC isolates of live cattle, sources of drinking water, food and even in clinical isolates associated with human diseases(AU)

Epidemiología, clínica y factores pronósticos de Enfermedad Meningocóccica Invasora en un centro de referencia de Paraguay. 2005 a 2018

Resumen Introducción: La enfermedad meningocóccica ha sido y sigue siendo una causa importante de morbilidad y mortalidad. Objetivos: Analizar las características clínicas y epidemiológicas de pacientes con infección meningocóccica invasora hospitalizados en un centro hospitalario de referencia. Materiales y métodos: Estudio descriptivo, observacional y retrospectivo de revisión de historias clínicas de pacientes internados entre los años 2005 y 2018 en el Instituto de Medicina Tropical con aislamiento o detección de N. meningitidis en sangre o LCR. Resultados: Fueron captados 44 pacientes con enfermedad meningocóccica invasora durante el periodo estudiado (3±2 casos/año). Los casos predominaron en el grupo etario 15000 /mm3 (p=0,03), la plaquetopenia15000 /mm3, la leucopenia <5000/ mm3, y la plaquetopenia se asociaron a mayor mortalidad.

Abstract Introduction: Meningococcal disease has been and continues to be an important cause of morbidity and mortality around the world. Objectives: To analyze the clinical and epidemiological characteristics of patients with invasive meningococcal infection hospitalized in a reference hospital center. Materials and methods: A descriptive, observational and retrospective study based in the review of clinical records of patients admitted between 2005 and 2018 in the Institute of Tropical Medicine in whom Neisseria meningitidis was isolated o detected by PCR in blood or CSF. Results: Forty-four patients with invasive meningococcal disease were recruited during the period studied (3 ± 2 cases/year). The cases predominated in the age group 15000/mm3 (p=0.03), thrombocytopenia15,000/mm3, leukopenia <5000 / mm3, and thrombocytopenia were associated with increased mortality.

Avances de laboratorio sobre la leptospirosis humana en Cuba, 1989-2016 / Laboratory advances about human leptospirosis in Cuba, 1989-2016

La leptospirosis humana es una enfermedad que tiene en Cuba un comportamiento endemo-epidémico con un carácter cíclico estacional. El avance tecnológico introducido en el país ha permitido tener un mejor conocimiento del agente causal en las provincias cubanas, así como realizar intervenciones en los brotes epidémicos ocurridos durante años, y brindar informaciones que fortalezcan al Programa Nacional de Prevención y Control y a los ensayos clínicos de la vacuna cubana vaxSPIRAL®. En este trabajo se resumen aspectos de interés relacionados con la vigilancia de laboratorio y los resultados de algunas de las investigaciones realizadas en el periodo 1989-2016(AU)

In Cuba human leptospirosis is a condition of an endemic-epidemic, cyclic-seasonal nature. Technological advances introduced into the country have made it possible to expand knowledge about the causal agent in Cuban provinces, carry out interventions in the epidemic outbreaks which have occurred during years, and offer information strengthening the National Prevention and Control Program and the clinical assays for the Cuban vaccine vaxSPIRAL®. The paper summarizes aspects of interest related to laboratory surveillance, as well as the results of some of the studies conducted in the period 1989-2016(AU)

Enfermedad meningocócica: epidemiología, diagnóstico y vacunación / Meningococcal disease: epidemiology, diagnosis and vaccination

La enfermedad meningocócica invasiva causada por N. meningitidis es un problema global de salud pública, por su alta morbilidad y mortalidad. Esta patología es causada en su mayoría por los serogrupos A,B,C, W-135 e Y. La prevención mediante la vacunación es la mejor herramienta para disminuir la carga mundial de esta enfermedad. Las vacunas no conjugadas que toman como base solo el polisacárido externo, aun cuando son beneficiosas en epidemias, producen pobre inmunogenicidad a largo plazo en los niños menores de dos años de edad, que representan la población de mayor riesgo. Las vacunas de nueva generación, en donde el polisacárido es conjugado con proteína transportadoras, producen respuestas inmune en niños menores de 2 años, lo cual podría producir una reducción importante de la enfermedad en esta población de alto riesgo. Las nuevas técnicas de detección están constituyendo a mejorar el pronóstico de la enfermedad, al permitir un diagnóstico más temprano y específico, conducentes a un tratamiento más oportuno. La creación de vacunas que confieran una protección más amplia, especialmente contra el serogrupo B, y protejan a la población en mayor riesgo, sigue siendo un reto...

Prevalência de sorogrupos de neisseria meningitidis causadores de doença meningocócica no estado da Bahia de 1998 a 2007 / Prevalence of neisseria meningitidis sorogroups that cause meningococcal disease in Bahia, from 1998 to 2007 / Prevalencia de serogrupos de n. meningitidis causadores de enfermedad meningocócica en el estado de la Bahia de 1998 a 2007

A Doença Meningocócica (DM), problema de saúde pública em razão da elevada morbidade e letalidade em nosso meio, tem preocupado devido à recente ascensão do sorogrupo C da N. meningitidis em detrimento do sorogrupo B, que apresenta maior potencial para causar epidemias, e ao possível surgimento de novo perfil epidemiológico da doença. O objetivo deste estudo é quantificar a prevalência dos sorogrupos de N. meningitidis causadores de DM no estado da Bahia nos últimos 10 anos. Este é um estudo descritivo que avalia casos notificados de DM na Bahia de 1998 a 2007, por sexo, idade, letalidade e sorogrupos causadores. Dos 2.070 casos de DM, foram sorogrupados 327 (34,4por cento). O sorogrupo B foi responsável por 71,9por cento dos casos e o C por 26,65por cento, entretanto foi verificada inversão da frequência a partir de 2006, com sorogrupo C representando 77,8por cento dos casos em 2007. Homens e menores de cinco anos foram mais acometidos e a letalidade em 2007 foi de 31por cento. Concluiu-se que, também na Bahia, ocorreu um aumento do sorogrupo C em detrimento do sorogrupo B, o que evidencia a mudança da prevalência do sorogrupo causador da doença meningocócica, fato que tem como consequencia a mudança no perfil epidemiológico da doença.

Meningococcal disease (MD) is a public health problem due to the high morbidity and mortality rate in our country. Recently, the rise of serogroup C of N. meningitidis serogroup B instead, worries due to the greater potential to cause epidemics of this group and the possible emergence of a new epidemiological pattern of disease. The aim of this study is to quantify the prevalence of serogroups of N. meningitidis causes of DM in the state of Bahia in the last 10 years. This is a descriptive study that evaluates reported cases of DM in Bahia from 1998 to 2007, by sex, age, cause lethality and serogroups. Of the 2,070 cases of DM were different serogroups 327 (34.4percent). The serogroup B accounted for 71.9percent of cases and 26.65percent for C, however the frequency was observed reversal from 2006, with serogroup C accounting for 77.8percent of cases in 2007. Men and children under five years were most affected and the mortality rate in 2007 was 31percent. It was concluded that, in Bahia, an increase of serogroup C at the expense of serogroup B, which shows the change in the prevalence of serogroup causing meningococcal disease, a fact that leads to change in the epidemiology of the disease.

Resumen La enfermedad meningocócica (ED) es un problema de salud pública debido a la alta morbilidad y mortalidad en nuestro medio. El reciente aumento del serogrupo C de N. meningitidis en detrimento del serogrupo B, ha despertado preocupación por su alto potencial de causar epidemias y al posible aparecimiento de un nuevo patrón epidemiológico. El objetivo de este estudio es cuantificar la prevalencia de los serogrupos de N. meningitidis causa de la ED en el estado de la Bahía, en los últimos 10 años. Es un estudio descriptivo que evalúa denuncias de casos de ED en la Bahía de 1998 a 2007, por sexo, edad, letalidad y serogrupos causadores de la enfermedad. De los 2.070 casos de ED, 327 (34,4por ciento) fueron seroagrupados. El serogrupo B representó el 71,9por ciento de los casos y el C, el 26,65por ciento, sin embargo, se observó reversión en la frecuencia a partir de 2006, con el serogrupo C representando el 77,8por ciento de los casos en 2007. 678 Los hombres y los niños menores de cinco años fueron los más afectados y la tasa de mortalidad en 2007 fue del 31por ciento. Se concluye que, también en el estado de la Bahía, hubo un aumento del serogrupo C, en detrimento del serogrupo B, lo que muestra el cambio en la prevalencia del serogrupo causador de la enfermedad meningocócica, hecho que tiene como consecuencia el cambio de patrón epidemiologico de la enfermedad.

Serotipos de Streptococcus pneumoniae en Cuba y progresión de la resistencia a la penicilina / Streptococcus pneumoniae serotypes in Cuba and progression of resistance to penicilina

INTRODUCCIÓN: en Cuba, a partir de 2006, ha sido difícil establecer la incidencia real de las meningitis bacterianas y otras enfermedades invasivas por Streptococcus pneumoniae, como consecuencia del bajo porcentaje de aislamiento e identificación de este agente en la red de laboratorios de microbiología del país. OBJETIVO: alertar sobre la necesidad de revitalizar la vigilancia activa de la enfermedad neumocócica invasiva, epidemiológica y microbiológica, fundamentalmente las meningitis y neumonías, en la etapa previa a la vacunación. MÉTODOS: se compararon la circulación de los serogrupos/serotipos capsulares y la susceptibilidad a penicilina de los aislamientos de S. pneumoniae responsables de infecciones invasivas, en dos períodos de la vigilancia: años 1994-2006 y 2007-2009. RESULTADOS: los serogrupos más frecuentes fueron: 3, 6, 7, 9, 14, 17, 18, 19, 20 y 23, pero se constató durante el segundo período de estudio, la circulación de otros no contenidos en las vacunas conjugadas disponibles comercialmente (serogrupo 15) y asociados a resistencia a antimicrobianos (serotipo 5). Por otra parte, se puso de manifiesto un incremento de la resistencia a la penicilina. CONCLUSIONES: para garantizar una alta efectividad con la inclusión en el calendario de vacunación infantil en Cuba, de alguna de las vacunas conjugadas contra S. pneumoniae, se impone el estudio de un número más representativo de aislamientos. Esto también permitirá hacer una correcta evaluación de la tendencia al incremento de la resistencia a la penicilina y adoptar guías de tratamiento adecuadas en el medio cubano.

INTRODUCTION: since 2006 in Cuba, there has been difficult to determine the actual incidente of bacterial meningitis and other invasive diseases caused by Streptococcus pneumoniae, as a result of the low percentage of isolation and identification of this agent in the domestic microbiology lab network. OBJECTIVE: to warn of the need of revitalizing the active surveillance of invasive, epidemiological and microbiological pneumoccocic diseases, mainly meningitis and pneumoniae in the phase prior to vaccination. METHODS: a comparison was made on the circulation of capsulary serogroups/serotypes and the invasive infection-causing S. pneumoniae isolates susceptibility to penicilline in two periods: 1994-2006 and 2007-2009. RESULTS: the most frequent serogroups were 3, 6, 7, 9, 14, 17, 18, 19, 20 and 23; however, in the second period, it was observed that others not contained in the available conjugate vaccines (serogrup 15) and associated to antimicrobial resistance (serotype 5) were circulating. On the other hand, increased resistance to penicilline was evident. CONCLUSIONS: it is required to study a more representative number of isolates in order to assure high effectiveness with the incorporation of some S. pneumoniae conjugate vaccines in the Cuban infant vaccination schedule. This will also allow duly assessing increased resistance to penicilline and adopting therapeutical guidelines suited to the Cuban setting.

Estudio seroepidemiológico de la leptospirosis humana en el departamento del Valle del Cauca, Colombia / Seroepidemiological situation of human leptospirosis in Valle del Cauca, Colombia

OBJETIVO: confirmar serológicamente la ocurrencia de leptospirosis humana en casos presuntivos procedentes del departamento del Valle del Cauca, estudiar variables clínico-epidemiológicas asociadas a la enfermedad e identificar los serogrupos de Leptospira más prevalentes en la región. MÉTODOS: se analizaron 150 muestras séricas colectadas en fase aguda, de casos con sospecha clínica y con riesgo epidemiológico de leptospirosis. Fueron evaluadas mediante hemoaglutinación indirecta y microaglutinación tomando como criterio de confirmación de la enfermedad la presencia de un título por microaglutinación mayor o igual que 1:800. Se analizaron datos epidemiológicos de interés así como síntomas y signos presentados en cada caso. RESULTADOS: las técnicas serológicas empleadas permitieron definir 31 casos confirmados (20,6 por ciento) y 16 casos probables (10,6 por ciento). Icterohaemorrhagie fue el serogrupo de mayor reactividad serológica tanto en casos confirmados como probables. Los síntomas más comunes fueron fiebre (89,3 por ciento), cefalea (86,7 por ciento) y mialgias (77,3 por ciento). Síntomas de leptospirosis severa como ictericia e insuficiencia renal fueron observados en 36 por ciento y 6,7 por ciento de los casos, respectivamente. Cerca de 70 por ciento de los casos confirmados o probables procedía de zonas urbanas y 85 por ciento resultó de hombres con un promedio de edad de 40 años. Los factores de riesgo más frecuentes fueron la exposición a roedores o animales domésticos (95,7 por ciento) y aguas potencialmente contaminadas (36,2 por ciento). CONCLUSIONES: los resultados del presente estudio sugieren que la leptospirosis constituye un problema de salud pública en el Valle del Cauca, región suroccidental de Colombia.

OBJECTIVE: to serologically confirm the occurrence of human leptospirosis in presumptive cases from the department of Valle del Cauca in Colombia, to study clinical-epidemiological data associated to the disease and to find out the most prevalent leptospiral serogroups. METHOD: a total of 150 serum samples collected during the acute phase from clinically suspected patients of having leptospirosis were analyzed. Samples were evaluated by indirect hemagglutination and microagglutination tests, taking a microagglutination titer equal to or greater than 1:800 as definition of confirmed case. Epidemiological data as well as symptoms and signs of interest were analyzed. RESULTS: these serological techniques allowed defining 31 confirmed cases (20.6 percent) and 16 probable cases (10.6 percent). Icterohaemorrhagiae was the serogroup with the higher serological reactivity in both confirmed and probable cases. Most common symptoms were fever (89.3 percent), headaches (86.7 percent) and myalgias (77.3 percent). Symptoms of severe leptospirosis like jaundice and renal failure were observed in 36 percent and 6.7 percent of cases, respectively. About 70 percent of confirmed or probable cases came from urban areas and 85 percent of them were men aged 40 years as average. The epidemiological risk factors were exposure to rats and domestic animal (95.7 percent) and potentially contaminated water (36.2 percent). CONCLUSIONS: the results of the present study suggest that leptospirosis is a public health problem in Valle del Cauca, a region located on the south west of the country.

Serogrupos y susceptibilidad antimicrobiana en cepas de Shigella / Serogroups and antimicrobial susceptibility in Shigella strains

Shigella spp es uno de los agentes causales más importantes de diarrea aguda en los niños. La presente investigación tuvo como objetivo conocer la frecuencia de serogrupos y la susceptibilidad antimicrobiana a los fármacos de elección y a los alternativos. MÉTODOS. Se realizó un estudio descriptivo y retrospectivo entre enero de 2004 y diciembre de 2006 a partir de 34 cepas de Shigella spp. aisladas en heces de niños menores de 5 años ingresados en el Hospital Aleida Fernández Chardiet (Municipio Güines) a causa de enfermedad diarreica aguda. RESULTADOS. Los serogrupos encontrados fueron S sonnei (70,5 por ciento) y S flexneri (29,5 por ciento). Ambos serogrupos mostraron altos niveles de resistencia al trimetoprim-sulfametoxazol y a la ampicilina, ademas en las cepas de S sonnei se encontró resistencia al ácido nalidíxico y en las de S flexneri al cloranfenicol. Todas las cepas mostraron altos porcentajes de sensibilidad a la ceftriaxona, norfloxacina y ciprofloxacina. El 70 por ciento de las cepas de S sonnei fueron multirresistentes. El patrón de multirresistencia (ampicilina, trimetoprim-sulfamtetoxazol y Acido nalidíxico) se encontró en ambos serogrupos. CONCLUSIONES. La determinación y vigilancia de los patrones de resistencia facilita el control de la política de uso de antibióticos en la región estudiada y previene el surgimiento de cepas resistentes a fármacos de nueva generación.

Shigella ssp. is one of the more important causal agents of acute diarrhea in children. Present research has as aim to know serogroups frequency and antimicrobial susceptibility to choice drugs, and to its alternatives. METHODS: A descriptive retrospective study was carried out between January 2004 and December 2006 of 34 strains of Shigella isolated from children lower than 5 years admitted in Aleida Fernßndez Chardiet Hospital in Güines Municipality by acute diarrheic disease. RESULTS: Serogroups included S sonnei (70,5 percent), and S flexeneri (29,5 percent). Both serogroups showed high levels of resistance to Trimethoprim-Sulfamethoxaxole and to Ampicillin and to in strains of S sonnei there was resistance to nalidixic acid, and in that of S flexeneri, to Chloramphenicol. All strains showed high percentages of sensibility to Cephtriaxone, Norphloxacine, and to Cyprophloxacine. The 70 percent of strains of S sonnei were multi-resistant. Multiresistance pattern (Ampicillin, Trimetroprim-Sulfamethoxaxole and nalidixic acid) was present in both serogroups. Assessment and surveillance of resistance patterns allow control of policy on use of antibiotics in study region, and to foresee rise of strains resistant to new generation-drugs.

Vigilancia de Neisseria meningitidis en Argentina, 1993-2005: distribución de serogrupos, serotipos y serosubtipos causantes de enfermedad invasiva / Surveillance of Neisseria meningitidis in Argentina, 1993-2005: Distribution of serogroups, serotypes and serosubtypes isolated from invasive disease

Neisseria meningitidis es agente causal de enfermedades severas como meningitis, bacteriemia y síndrome de shock séptico. Se presenta la distribución en serogrupos, serotipos y serosubtipos de 2244 aislamientos de N. meningitidis obtenidos de cuadros de meningitis y/o meningococcemia durante el período 1993-2005 y analizados en el Laboratorio Nacional de Referencia del INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán". Estos aislamientos eran provenientes de 33 hospitales de todo el país, conformados en una red nacional de laboratorios para el estudio de meningitis bacteriana. Durante el período 1993-1995 prevaleció el serogrupo B (66%), mientras que entre los años 1995 y 2001 prevaleció el serogrupo C (65%); a partir de esta fecha se restableció la prevalencia de B. En los últimos 5 años los serogrupos Y y W135 representaron en su conjunto el 15,6%, mientras que hasta el año 2000 no superaron el 4,7%. Se registró mayor diversidad en la distribución de serotipos y serosubtipos dentro del serogrupo B que dentro del serogrupo C. Los aislamientos no subtipables durante todo el período de estudio representaron el 52,8%; este elevado porcentaje evidencia la limitada capacidad de la serología para la determinación de subtipos de meningococo.

Neisseria meningitidis is an important cause of meningitis, bacteremia and septic shock syndrome. We herein present the distribution of serogroups, serotypes and serosubtypes of 2244 isolates of N. meningitidis from patients with meningitis or meningococcemia, received within the period 1993-2005, in the National Reference Laboratory, INEI-ANLIS "Dr. Carlos G. Malbrán", from 33 Argentine hospitals that are included in a National Network devoted to for the study of bacterial meningitis. Between 1993-1995, serogroup B was prevalent (66%) whereas in the period from 1995-2001, serogroup C prevailed (65%). However, following but after that period, the prevalence of serogroup B was recovered. In the last 5 years of the studied period, the serogroups Y and W135 represented as a whole a 15.6% as a whole whereas up to the year 2000 during the first 6 years they accounted for it was of 4.7%. Higher diversity in the distribution of serotypes and serosubtypes was observed within serogroup B. The nonsubtypable isolates throughout the period of study represented the 52.8%, this high percentage demonstrates the limited capacity of the serotyping for the determination of meningococcal/meningococcus subtypes. of meningococco.