Occurrence of the bacteria in a hospital environment and their sensitivity profile to the main antimicrobials in a reference general hospital in Curitiba, Brazil / Ocorrência de bactérias em ambiente hospitalar, e seu perfil de sensibilidade aos principais antimicrobianos em um hospital de referência em Curitiba, Brasil / Ocurrencia de bacterias en ambiente hospitalario y su perfil de sensibilidad a los principales antimicrobianos en un hospital de referencia en Curitiba, Brasil

Introduction: Antimicrobial resistance rates are increasing in both hospital and community settings, creating a favorable environment for the development of superbacteria. Therefore, local studies are necessary for the proper management of current antimicrobial arsenals and for addressing the current bacteriological scenario. Aim: The aim of this study is to profile bacterial epidemiology in a hospital in Curitiba, Brazil and associate it with the effectiveness of antimicrobial therapy. Methodology: Data from 2019 to 2021 were collected by the Center for Epidemiology and Hospital Infection Control (CEHIC), and this was a quantitative single-center study. Results: The most commonly detected microorganisms were Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Enterococcus faecalis, Acinetobacter baumannii, Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus hominis, and Enterobacter cloacae. A. baumannii and K. pneumoniae had the lowest mean sensitivity coefficients, while S. aureus was the most sensitive. Erythromycin was the least effective antimicrobial agent, while daptomycin was the most effective. Conclusion: These results are consistent with the literature and can be used to optimize empiric therapies, as there are already important therapeutic failures associated with antimicrobial resistance.

Introdução: As taxas de resistência antimicrobiana estão em ascensão tanto em ambientes hospitalares como comunitários, criando um cenário propício para o desenvolvimento de superbactérias e, assim, torna-se necessário estudos locais para uma gestão adequada dos arsenais antimicrobianos atuais e frente ao cenário bacteriológico atual. Objetivo: O escopo desse estudo visa traçar o perfil epidemiológico bacteriano num hospital em Curitiba, Brasil e associá-lo à eficácia da terapia antimicrobiana. Metodologia: Os dados de 2019 a 2021 foram recolhidos pelo Centro de Epidemiologia e Controle de Infecções Hospitalares (CECIH), sendo este um estudo unicêntrico quantitativo. Resultados: Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Enterococcus faecalis, Acinetobacter baumannii, Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus hominis, e Enterobacter cloacae foram os microrganismos mais comuns detectados. A. baumannii e K. pneumoniae tinham as médias de coeficiente de sensibilidade mais baixas, enquanto S. aureus era o mais sensível. A eritromicina era o agente antimicrobiano menos eficaz, enquanto a daptomicina era o mais eficaz. Conclusão: Estes resultados estão de acordo com a literatura e podem ser utilizados para otimizar as terapias empíricas, visto que já há falhas terapêuticas importantes associadas a resistência antimicrobiana.

Introducción: Las tasas de resistencia antimicrobiana están en aumento tanto en el ámbito hospitalario como en el comunitario, creando un escenario propicio para el desarrollo de superbacterias, por lo que son necesarios estudios locales para una gestión adecuada de los actuales arsenales antimicrobianos y hacer frente al escenario bacteriológico actual. Objetivo: El alcance de este estudio pretende trazar el perfil epidemiológico bacteriano en un hospital de Curitiba, Brasil y asociarlo a la eficacia de la terapia antimicrobiana. Metodología: Los datos de 2019 a 2021 fueron recogidos por el Centro de Epidemiología y Control de Infecciones Hospitalarias (CECIH), siendo un estudio cuantitativo unicéntrico. Resultados: Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus epidermidis, Pseudomonas aeruginosa, Enterococcus faecalis, Acinetobacter baumannii, Staphylococcus haemolyticus, Staphylococcus hominis y Enterobacter cloacae fueron los microorganismos más frecuentes detectados. A. baumannii y K. pneumoniae presentaron los coeficientes medios de sensibilidad más bajos, mientras que S. aureus fue el más sensible. La eritromicina fue el agente antimicrobiano menos eficaz, mientras que la daptomicina fue el más eficaz. Conclusión: Estos resultados concuerdan con la literatura y pueden ser utilizados para optimizar las terapias empíricas, pues ya existen importantes fracasos terapéuticos asociados a la resistencia antimicrobiana.

Caracterización fenotípica y molecular de cepas de Klebsiella pneumoniae productores de carbapenemasas tipo OXA-48 circulantes en Chile

Introducción: La aparición y diseminación de Enterobacterales resistentes a carbapenémicos ha generado un gran impacto en las infecciones asociadas a la atención de salud en el mundo. Recientemente, en Chile se detectó un brote por Klebsiella pneumoniae productora de carbapenemasas tipo oxacilinasas (OXA) de la subfamilia tipo OXA-48, reportándose los primeros casos en pacientes hospitalizados mayoritariamente en la zona norte del país. Objetivo: Determinar los perfiles fenotípicos, genotípicos y de susceptibilidad antimicrobiana de 16 cepas referidas durante mayo del año 2021 desde las regiones de Antofagasta y Metropolitana al Laboratorio de Referencia del Instituto de Salud Pública. Metodología: Las cepas provenientes de muestras clínicas fueron analizadas mediante técnicas tradicionales (Kirby-Bauer y epsilometría) y automatizadas, además de técnicas colorimétricas, inmunocromatográficas y moleculares (RPC y PFGE). Resultados: Se detectó la presencia de los genes blaoxa-48 y blaoxa-232 con una resistencia inusual, tanto a carbapenémicos (ertapenem, imipenem y meropenem) como a cefalosporinas (cefepime, cefotaxima y ceftazidima), además de piperacilina/tazobactam y temocilina. Se detectaron dos subtipos por PFGE, siendo predominante el clon CL-Kpn-Spe-329 (93,8%) con dos mecanismos de resistencia identificados: carbapenemasa y β-lactamasa de espectro extendido (BLEE). Conclusión: Ante esta alerta epidemiológica es necesario unificar criterios existentes en la red asistencial nacional para la oportuna detección, vigilancia y control de posibles brotes de cepas productores de oxacilinasa tipo OXA-48.

Background: The appearance and spread of carbapenems-resistant Enterobacterales have generated a major impact on health care-associated infections worldwide. Recently, a Klebsiella pneumoniae outbreak expressing OXA-48 like-carbapenemases was detected in Chile, the first reported cases corresponded to hospitalized patients mainly from northern Chile. Aim: To characterize the phenotypic and genotypic profiles of antimicrobial susceptibility of 16 clinical isolates referred during May 2021 from Antofagasta and Metropolitan regions to the Reference Laboratory of Instituto de Salud Publica. Methods: Antimicrobial susceptibility of all strains was analyzed using traditional (Kirby-Bauer and epsilometry) and automated methods, and complemented with colorimetric, immunochromatographic and molecular (PCR and PFGE) techniques. Results: As a result of the genetic characterization, blaoxa-48 and blaoxa-232 genes were detected, showing the isolates an unusual resistance profile to both carbapenems (ertapenem, imipenem, and meropenem) and cephalosporins (cefepime, cefotaxime, and ceftazidine), as well as piperacillin/ tazobactam and temocillin. Two subtypes were detected by PFGE, with a predominant clone CL-Kpn-Spe-329 (93.8%), with two resistance mechanisms identified: carbapenemase and extended-spectrum β-lactamase (ESBL). Conclusion: Due to this epidemiological alert, it is essential the establishment of national guidelines for early detection, surveillance, and control of future outbreaks of OXA-48 like carbapenemases isolates.

Evaluación de la Susceptibilidad Antimicrobiana de Porphyromonas gingivalis Aisladas de Pacientes Periodontales en Población Chilena

RESUMEN: Porphyromonas gingivalis (P. gingivalis) es un microorganismo frecuentemente aislado en pacientes con periodontitis, en los que también se incluye los de la población chilena. El modelo de "Keystone bacteria" demostró que P. gingivalis induce la disbiosis del biofilm subgingival y permite el desarrollo de algunas especies sobre otras, modulando la patogenicidad de la comunidad microbiológica completa. El tratamiento de la periodontitis es principalmente mecánico, pero en condiciones específicas es necesario el complemento con antibioterapia. Los estudios globales de antibióticos evaluados en ensayos clínicos y estudios in vitro han mostrado resultados mixtos en cuanto a eficacia y susceptibilidad. Este estudio descriptivo tuvo como objetivo evaluar el perfil de susceptibilidad antimicrobiana in vitro a metronidazol, clindamicina, amoxicilina más ácido clavulánico, moxifloxacino y azitromicina de P. gingivalis aisladas de pacientes periodontales chilenos. Se obtuvieron muestras microbiológicas de pacientes con diagnóstico de periodontitis estadíos III y IV generalizada, las que se sometieron a procesos de identificación mediante un espectrómetro de masas (MALDI-TOF MS). Posteriormente, a cada muestra positiva a P. gingivalis se aplicó el protocolo gold standard de susceptibilidad para los cinco antimicrobianos evaluados (Dilución en Agar Sangre Brucella- McFarland 0.5). Se seleccionaron 50 pacientes (25 mujeres, 25 hombres) entre 34-69 años. Finalmente, se recuperaron 25 cepas de P. gingivalis (50 %) para el análisis de susceptibilidad y todas ellas fueron sensibles a todos los antibióticos evaluados (100 % susceptibilidad). Las cepas de P. gingivalis fueron altamente sensibles a los cinco antibióticos evaluados en esta población, lo que podría implicar contar con diferentes alternativas de tratamiento farmacológico antimicrobi ano como complemento al tratamiento mecánico convencional en pacientes específicos.

ABSTRACT: Porphyromonas gingivalis (P. gingivalis) is a microorganism frequently isolated in patients with periodontitis, which also include those of Chilean population. The "Keystone bacteria" model demonstrated that P. gingivalis induces dysbiosis of the subgingival biofilm and allows the development of some species over others, modulating the pathogenicity of the entire microbiological community. The treatment of periodontitis is mainly mechanical; nevertheless, under specific conditions the complement with antibiotherapy is needed. Global studies of antibiotics evaluated in clinical trials and in vitro studies have shown mixed results in terms of efficacy and susceptibility. This descriptive study aimed to evaluate antimicrobial susceptibility profile in vitro to metronidazole, clindamycin, amoxicillin plus clavulanic acid, moxifloxacin and azithromycin of P. gingivalis isolated from Chilean periodontal patients. Microbiological samples were obtained from patients with a diagnosis of generalized periodontitis stages III and IV, which were exposed to identification processes by a mass spectrometer (MALDI-TOF MS). Subsequently, the gold standard susceptibility protocol for the five antimicrobials evaluated was applied to each P. gingivalis- positive sample (Dilution in Brucella-McFarland Blood Agar 0.5). 50 patients (25 women, 25 men) between 34-69 years old were selected. Finally, 25 P. gingivalis strains (50 %) were recovered for susceptibility testing and all of them were susceptible to all antibiotics tested (100 % susceptibility). P. gingivalis strains were highly susceptible to the five antibiotics evaluated in this population, which could implies counting different antimicrobial pharmacological treatment alternatives as a complement to conventional mechanical treatment in specific patients.

Recomendaciones para diagnóstico y tratamiento de la infección del tracto urinario en pediatría. Parte 1: Grupo de trabajo asociado al Comité de Antimicrobianos, Sociedad Chilena de Infectología (SOCHINF) / Recommendations for the diagnosis and treatment of urinary tract infection in pediatrics. Part 1: Working group associated with the Antimicrobial Committee, Chilean Society of Infectology

Resumen La infección del tracto urinario (ITU) es una de las infecciones bacterianas más frecuentes en la infancia. Un adecuado diagnóstico es esencial para poder realizar un tratamiento racional, eficiente y eficaz; sin embargo, existe gran heterogeneidad en los métodos diagnósticos, específicamente en el estudio de la susceptibilidad antimicrobiana. El objetivo de estas recomendaciones es entregar herramientas para uniformar los criterios diagnósticos, el estudio de susceptibilidad bacteriana in vitro y el tratamiento antimicrobiano de la ITU en la población pediátrica, con un enfoque de uso racional de los antimicrobianos. En esta primera parte, se presentan las recomendaciones en cuanto a cómo obtener una adecuada muestra de orina, el diagnóstico de laboratorio incluyendo puntos de corte -unidades formadoras de colonias/mL de orina-, además de consideraciones microbiológicas para el estudio de susceptibilidad y finalmente, el manejo de la ITU en pediatría. En la segunda parte se detalla el tratamiento antimicrobiano de sus complicaciones, el manejo de ITU en situaciones especiales y consideraciones farmacocinéticas y farmacodinámicas de los antimicrobianos a indicar en ITU.

Abstract The urinary tract infection (UTI) is one of the most common bacterial infections in childhood. An adequate diagnosis is essential to be able to carry out a rational, efficient and effective treatment, however, there great heterogeneity in diagnostic methods, specifically in the study of antimicrobial susceptibility. The aim of these recommendations is to provide tools to homogenize the diagnosis criteria, susceptibility study and antimicrobial treatment of urinary tract infection in the pediatric population, with a rational use of antibiotics approach. In the first part, the recommendations regarding diagnosis are presented, such as sampling and cut-off points, as well as microbiological considerations for susceptibility study and management of UTI in pediatrics. The second part details the management of complications, UTI in special situations, and pharmacokinetic and pharmacodynamic considerations of antimicrobials to be prescribed in UTI.

Patrones de susceptibilidad de gramnegativos en un hospital pediátrico de tercer nivel: 2013 vs. 2018 / Gram-negative susceptibility patterns in a tertiary pediatric hospital: 2013 vs. 2018

Resumen Introducción: Los gramnegativos continúan siendo los causantes de infecciones asociadas a la atención a la salud (IAAS). Material y métodos:: Analizamos la resistencia antimicrobiana de patógenos durante el 2013 vs. 2018 y lo comparamos con lo publicado en 2006 vs. 2012. Resultados: Identificamos nueve patógenos gramnegativos, de un total de 404 aislamientos, con una prevalencia en 2013 (N = 227 [0.22]) vs. 2018 (N = 177 [0.17]) y una incidencia por egresos (6,607 en el 2013 y 7,778 en el 2018) del 3.4 y 2.2% respectivamente. Destacaron tres patógenos: Klebsiella pneumoniae (129 [31.93%]), Pseudomonas aeruginosa (85 [21.03%]) y Escherichia coli (80 [19.80%]). Estos, llamados patógenos ESKAPE-E, prevalecieron como causantes de IAAS. Identificamos un aumento en los patrones de resistencia para muchos patógenos en 2018. Conclusión: La multirresistencia a patógenos ESKAPE-E es un serio problema de salud pública, por carecer de alternativas terapéuticas para enfrentar este reto. Los mapas de resistencia bacteriana ayudan en la prescripción antibiótica.

Abstract Background: Gram-negatives continue to be the cause of infections associated with health care (HCAI). Material and methods: We analyzed the antimicrobial resistance of pathogens during 2013 vs. 2018 and we compare it with what was published in 2006 vs. 2012. Results: We identified 9 gram-negative pathogens, out of a total of 404 isolates, with a prevalence in 2013 (N = 227 [0.22]) vs. 2018 (N = 177 [0.17]) and an incidence due to discharges (6,607 in 2013 and 7,778 in 2018) of 3.4 and 2.2%, respectively.Three pathogens stood out Klebsiella pneumoniae (129 [31.93%]), Pseudomonas aeruginosa (85 [21.03%]) and Escherichia coli (80 [19.80%]). These, called ESKAPE-E pathogens, prevailed as the cause of HCAI. We identified an increase in resistance patterns for many pathogens in 2018. Conclusion: Multi-resistance to ESKAPE-E pathogens is a serious public health problem, due to the lack of therapeutic alternatives to face this challenge. Bacterial resistance maps help in antibiotic prescription.

Susceptibilidad antimicrobiana en muestras urogenitales de ureaplasma urealyticum, el principal agente en infección intramaniótica / Antimicrobial susceptibility in urogenital samples of ureaplasma urealyticum, the main agent in intramaniotic infection

RESUMEN OBJETIVO: Ureaplasma urealyticum es el agente más frecuentemente aislado en infección intraamniótica. Los macrólidos son los antimicrobianos de primera elección en embarazadas. Se ha descrito el aumento de resistencia, pudiendo limitar las opciones terapéuticas durante la gestación. El propósito del estudio es evaluar susceptibilidad antimicrobiana de Ureaplasma urealyticum aislado en mujeres en edad fértil, que se atienden en Clínica Alemana Temuco, Araucanía, Chile. METODO: Se estudian todas las muestras de orina y flujo vaginal para cultivo de U. urealyticum, de pacientes entre 18 y 40 años, recibidas en el Laboratorio de Microbiología Clínica Alemana Temuco, en período Abril 2013 a Enero 2015. Se procesan las muestras con kit Mycoplasma IST 2 de Biomerieux. En las que resultan positivas, se estudia susceptibilidad a macrólidos, tetraciclinas y quinolonas. RESULTADOS: 426 muestras de orina y flujo vaginal (390 pacientes). 197 pacientes resultaron positivas para U. urealyticum. (50,5%). La susceptibilidad fue 88,4% (174 pctes) a Eritromicina, 87,9% (173 pctes) a Claritromicina y 91,9% (181 pctes) a Azitromicina (NS). 15 de 197 pacientes (7,6%) fueron resistentes a los 3 macrólidos. La susceptibilidad a Quinolonas fue 55,3% a Ciprofloxacino, y 94% a Ofloxacino. El 100% resultó susceptible a Tetraciclinas. CONCLUSIONES: Cerca del 10% de U. urealyticum aislados en nuestra serie son resistentes a macrólidos, contribuyendo a la no erradicación de la infección en tratamientos empíricos. Dentro de ellos, azitromicina aparece con la mayor efectividad. El aumento de resistencia limitará opciones terapéuticas, con gran impacto perinatal en futuro. La vigilancia de susceptibilidad en cada hospital es fundamental para elección terapéutica.

ABSTRACT INTRODUCTION: Ureaplasma urealyticum is the most frequently isolated microorganism in intra-amniotic infection. The macrolides are the first choice antimicrobials for treat this infection in pregnancy. The increasing resistance has been described worldwide, seriously limiting therapeutic options in pregnancy. The aim of the study is to evaluate antimicrobial susceptibility of U. urealyticum aislated in fertile-age women in Clínica Alemana Temuco, Araucania region, Chile. METHOD: Urine and vaginal samples were analyzed for U. urealyticum, from every 18 to 40 years old patients, received at Microbiology Laboratory of Clínica Alemana Temuco, between April 2013 to January 2015. The samples are processed with Mycoplasma IST 2 kit of Biomerieux. If they became positives, susceptibility to macrolides, tetracyclines and quinolones was studied. RESULTS: 426 urine and vaginal samples were collected (390 patients). 197 patients were positive for U. urealyticum (50.5%). The susceptibility was 88.4% (174 pts) to Erythromicyn, 87.9% (173 pts) to Clarithromycin and 91.9% (181 pts) to Azithromycin (NS). Resistance to all macrolides was observed in 15 out of 197 patients (7.6%). The susceptibility to Quinolones was 55.3% to Ciprofloxacin, and 94% to Ofloxacin. The 100% was susceptible to Tetracyclines. DISCUSSION: Near to 10% of isolated Ureaplasma spp in our serie were resistant to some macrolide, being a factor for failing to eradicate the infection in empirical treatment. Azithromycin was the most effective. The increasing resistance will limit therapeutic options, with great perinatal impact in the future. Susceptibility surveillance in each hospital is very important for therapeutic options.

Bacterial Contaminants and Antimicrobial Susceptibility Profile of Boar Semen in Southern Brazil Studs / Contaminantes bacterianos y perfil de susceptibilidad del semen porcino en centros de recogida em Brasil

Abstract Objective. To assess the microbiological profile in seven Boar Studs (BS) in Southern Brazil, as well as evaluate antimicrobial susceptibility response to most commonly found microorganisms in BS. Material and methods. Bacteriologic analysis was carried out in samples from the water purification system, semen extender, raw and stored semen, lab benches, and other working surfaces. Results. Growth of a mixed bacterial population was observed in water samples from all but one BS. Approximately 85% of the BS had significant contamination on their working surfaces with at least one bacterial contaminant. A total of 86% of raw semen samples were contaminated with one or more different bacteria, while 100% of the boar studs provided contaminated samples. Bacterial susceptibility to antimicrobial agents varied from over 80% for gentamycin, neomycin and ceftiofur to 40% or less for penicillin and lincomycin. Conclusions. The identification of the critical points provides necessary support to devise better strategies to minimize contamination in BS. Also, assessing the level of antimicrobial drug resistance offers accurate information to formulate more efficient antibacterial protocols that closely observe the rational use of antibiotics.

Resumen Objectivo. Evaluar el perfil microbiológico de siete centros de recogida de semen porcino (BS) en el sur de Brasil, así como evaluar la susceptibilidad antimicrobiana a la mayoría de los microorganismos encontrados en los BS. Material y métodos. El análisis bacteriológico se realizó en muestras del sistema de purificación de agua, diluyentes de semen, semen crudo y almacenado, bancos de laboratorio y otras superficies de trabajo. Resultados. El crecimiento de una población bacteriana mixta se observó en muestras de agua de todas las BS excepto una. Aproximadamente el 85% de la BS tenía contaminación significativa en sus superficies de trabajo con al menos un contaminante bacteriano. Un total de 86% de muestras de semen crudo fueron contaminadas con una o más bacterias diferentes, mientras que el 100% de BS proporcionaron muestras contaminadas. La susceptibilidad bacteriana a agentes antimicrobianos varió en más del 80% para gentamicina, neomicina y ceftiofur a 40% o menos para penicilina y lincomicina. Conclusiones. La identificación de los puntos críticos proporciona el apoyo necesario para idear mejores estrategias para minimizar la contaminación en CRSP. Además, la evaluación del nivel de resistencia a los antimicrobianos ofrece información precisa para formular protocolos antibacterianos más eficientes que tengan en cuenta el uso racional de los antibióticos.

Comparación y evaluación de métodos cuantitativos para determinar la susceptibilidad antimicrobiana de cepas del complejo Mycobacterium abscessus / Comparison and Evaluation of Quantitative Methods for Determining Antimicrobial Susceptibility of Complex Mycobacterium Abscessus Strains / Comparação e avaliação de métodos quantitativos para determinar a susceptibilidade antimicrobiana de cepas do complexo Mycobacterium abscessos

Resumen Introducción: el complejo Mycobacterium abscessus incluye especies patógenas emergentes multirresistentes, lo cual limita las opciones terapéuticas para tratar las infecciones causadas por dichos microorganismos. En este estudio se compararon las concentraciones inhibitorias mínimas (CIM) obtenidas mediante dos métodos cuantitativos, se establecieron los puntos de corte empleados en el micrométodo colorimétrico (MMC) y se evaluó la susceptibilidad antimicrobiana. Materiales y métodos: la CIM de nueve antibióticos fue determinada mediante el MMC y la microdilución en caldo (MDC) para 19 cepas del complejo M. abscessus. El test F de Snedecor se utilizó para establecer la diferencia significativa de las CIM entre los dos métodos y se determinaron los puntos de corte mediante la técnica de distribución de la probabilidad para el MMC. Resultados: se encontró una correlación de los resultados de la CIM del 50% entre MMC y MDC para los antibióticos ensayados. Probablemente esta discrepancia en los resultados se deba a diferencias en algunos parámetros técnicos de cada procedimiento. Todas las cepas fueron sensibles a la amikacina y resistentes a meropenem y ampicilina-sulbactam. Independientemente de la especie del complejo M. abscessus, las fluoroquinolonas mostraron una baja actividad inhibitoria (0-25%) sobre los aislados clínicos, resultados que son similares a los reportados por otros autores. Conclusión: Los patrones de multirresistencia observados en las cepas analizadas sugieren la necesidad de utilizar las pruebas de susceptibilidad como herramientas que permitan orientar y optimizar las conductas terapéuticas en infecciones producidas por M. abscessus.

Abstract Introduction: The Mycobacterium abscessus complex includes multidrug resistant emerging pathogens, which limit therapeutic options for treating infections caused by these microorganisms. In this study, the minimum inhibitory concentrations (MICS) obtained by 2 quantitative methods were compared, the cut-off points used in the colorimetric micromethod (CMM) were established and the antimicrobial susceptibility was evaluated. Materials and Methods: The MIC for nine antibiotics was determined by CMM and broth microdilution (BMD) for 19 strains of M. abscessus complex. The Snedecor F test was used to establish the significant difference in the CIM between the methods, cutoff points were determined by the probability distribution method for the CMM. Discussion: A correlation of 50% between CMM and BMD for antibiotics tested was found. Probably, this discrepancy in the results is due to differences in some technical parameters of each procedure. All strains were susceptible to amikacin and were resistant to meropenem and ampicillin-sulbactam. Independently of the species of M. abscessus complex, fluoroquinolones showed a low inhibitory activity (0-25%) on clinical isolates, results that are similar to those reported by other authors. Conclussion: The Multidrug resistance patterns observed in the strains tested suggest the need for susceptibility testing as tools to guide and optimize the therapeutic behavior in infections caused by M. abscessus.

Resumo Introdução: o complexo Mycobacterium abscessus inclui espécies patógenas emergentes multirresistentes, o qual limita as opções terapêuticas para tratar as infeções causadas por estes microrganismos. Neste estudo compararam-se as concentrações inibitórias mínimas (CIMS) obtidas mediante 2 métodos quantitativos, se estabeleceram os pontos de corte empregados no micrométodo colorimétrico (MMC) e se avaliou a susceptibilidade antimicrobiana. Materiais e métodos: a CIM de 9 antibióticos foi determinada mediante o MMC e microdiluição em caldo (MDC) para 19 cepas do complexo M. abscessus. O teste F de Snedecor utilizou-se para estabelecer a diferença significativa das CIMS entre os dois métodos e determinaram-se os pontos de corte mediante a técnica de distribuição da probabilidade para o MMC. Resultados: se encontrou uma correlação dos resultados da CIM do 50% entre MMC e MDC para os antibióticos testados. Provavelmente, esta discrepância nos resultados se deve a diferenças em alguns parâmetros técnicos de cada procedimento. Todas as cepas foram sensíveis à amikacina e resistentes a meropenem e ampicilina-sulbactam. Independentemente da espécie do complexo M. abscessos, as fluoroquinolonas mostraram uma baixa atividade inibitória (0-25%) sobre os isolados clínicos, resultados que são similares aos reportados por outros autores. Conclussão: Os patrões de multirresistência observados nas cepas analisadas, sugerem a necessidade de utilizar as provas de susceptibilidade como ferramentas que permitam orientar e otimizar as condutas terapêuticas em infeções produzidas por M. abscessus.

Biotipos y susceptibilidad antimicrobiana de S. mutans en niños con y sin caries dental / Biotypes and antimicrobial susceptibility of S. mutans in children with and without dental caries

Objetivos: investigar los biotipos de S. mutans aislados de niños con y sin caries dental y determinar su susceptibilidad antimicrobiana. Métodos: este estudio observacional descriptivo incluyó 206 niños entre los 3 y 5 años de dos preescolares en Bogotá, D. C., Colombia. Después de su aislamiento en agar Mitis Salivarius Bacitracina, las cepas S. mutans se identificaron por pruebas bioquímicas y se biotipificaron por el sistema api-ZYM. En todos los aislamientos se determinó por el método de dilución en agar la concentración inhibitoria mínima (CIM) de Penicilina, Amoxicilina, Cefazolina, Eritromicina, Clindamicina, Imipenem, Vancomicina y Teicoplanina. Resultados: Se encontró S. mutans en 30 de los 79 niños sin caries dental (38%) y en 56 de los 127 niños con caries (44,1%). Los niños con caries presentaron un recuento superior de S. mutans en comparación con los niños sin caries (p < 0,05). En total se identificaron 121 cepas de S. mutans en los 86 niños: 43 cepas en los 30 niños sin caries dental y 78 en los 56 niños con caries dental. Las 121 cepas fueron agrupadas en 38 biotipos: 24 en el grupo de caries y 14 en el grupo sin caries. En el grupo de caries los biotipos más frecuentes fueron el XV, XI, XII y XVII, respectivamente, con 26, 12, 11 y 4 cepas y en el grupo sin caries los biotipos más frecuentes fueron el XXVI, XX y XXXVI, respectivamente, con 14, 8 y 7 cepas. Todos los biotipos fueron altamente sensibles a los antimicrobianos evaluados; el 50 y 90% de las cepas S. mutans fueron inhibidas, respectivamente, por concentraciones menores a 0,12 y 1 µg/ml para todos los antimicrobianos estudiados. Para la penicilina, eritromicina e imipenem se obtuvieron los valores promedios más bajos de CIMs. Conclusiones: en la población objeto de estudio se encontró una gran diversidad biotípica, los aislamientos fueron altamente susceptibles a los antimicrobianos evaluados y en cada grupo de pacientes se identificaron patrones únicos que podrían indicar una colonización específica.

Objectives: The main objective was to investigate the biotypes of S. mutans isolated from children with and without dental caries and determine its antimicrobial susceptibility. Methods: this descriptive observational study included 206 children aged 3 to 5 years of two preschool institutions in Bogota-Colombia. After isolation on agar Mitis Salivarius Bacitracin, S. mutans strains were identified by biochemical tests and biotyped by the api-ZYM system. The minimal inhibitory concentrations (MICs) of the S. mutans isolates were evaluated against penicillin, amoxicillin, cefazolin, erythromycin, clindamycin, imipenem, vancomycin and teicoplanin by an agar dilution method. Results: S. mutans was found in 30 of the 79 children without dental caries (38%) and in 56 of the 127 children with caries (44.1%). Children with cavities had a higher count of S. mutans compared to children without caries (p < 0.05). A total of 121 strains of S. mutans were identified in 86 children: 43 strains in 30 children with dental caries and 78 in the 56 children with dental caries. The 121 strains were grouped into 38 biotypes: 24 in the group caries and 14 in the group without caries. In the group caries the most common biotypes were the XV, XI, XII and XVII, respectively, with 26, 12, 11 and 4 strains and the group caries the most common biotypes were the XXVI, XX and XXXVI, respectively, with 14, 8 and 7 strains. All biotypes were highly sensitive to all antimicrobials tested; 50 and 90% of S. mutans strains were inhibited by using concentrations lower than 0.12 and 1 µg/ml, respectively, for all antibiotics studied. The lowest MICs average values were obtained for penicillin, erythromycin and imipenem. Conclusions: In the study population a wide variety of biotypes was found, isolates were highly sensitive to antimicrobials evaluated and in each clinical group were identified unique patters that could indicate a specific colonization.

Susceptibilidad antimicrobiana en aislamientos cubanos de Vibrio cholerae O1 procedentes de muestras clínicas / Antimicrobial susceptibility in Cuban isolates of Vibrio cholerae O1 obtained from clinical samples

Introducción: la re-emergencia de cólera en Haití estableció un nuevo reservorio para el incremento de la séptima pandemia. Esto provocó su diseminación a República Dominicana y a otros países de la región del Caribe, como Cuba y México. Objetivo: estudiar la susceptibilidad antimicrobiana de aislamientos de Vibrio cholerae O1, serotipo Ogawa, biotipo El Tor aisladas de pacientes durante el evento epidemiológico de cólera ocurrido en Cuba entre junio de 2012 y agosto de 2013. Métodos: se realizó el estudio de la susceptibilidad antimicrobiana in vitro en 144 aislamientos de V. cholerae, mediante el método de Bauer-Kirby frente a nueve antimicrobianos: ampicilina, sulfonamida, trimetoprim/sulfametoxazol, cloranfenicol, tetraciclina, doxiciclina, azitromicina, ciprofloxacina y gentamicina, según las normas del Instituto de Estándares de Laboratorio Clínico de los Estados Unidos de América. Resultados: el total de los aislamientos resultaron resistentes al trimetoprim-sulfametoxazol; el 98,7 por ciento lo fue a la sulfonamida y el 90,3 por ciento a la ampicilina. Se obtuvieron valores de sensibilidad intermedia para ciprofloxacina (30,6 por ciento) y cloranfenicol (27,1 por ciento). Se apreciaron niveles de sensibilidad superior al 92 por ciento a los antimicrobianos de primera línea en el tratamiento de la enfermedad (doxiciclina, tetraciclina y azitromicina), así como también a la gentamicina. No se observaron cepas multirresistentes. Conclusiones: los datos aportados por este trabajo demuestran la efectividad in vitro de los antimicrobianos utilizados en el tratamiento la enfermedad diarreica aguda causada por V. cholerae en Cuba(AU)

Introduction: re-emergence of cholera in Haiti created a new reservoir for the increase of the seventh pandemic. This resulted in its spread to the Dominican Republic and other Caribbean countries, such as Cuba and Mexico. Objectives: study the antimicrobial susceptibility of isolates of Vibrio cholerae O1, Ogawa serotype, El Tor biotype, obtained from patients during the cholera epidemiological event occurring in Cuba from June 2012 to August 2013. Methods: a study was conducted of 144 V. cholerae isolates using the Bauer-Kirby method to determine in vitro susceptibility to nine antimicrobials: ampicillin, sulfonamide, trimethoprim/sulfamethoxazole, chloramphenicol, tetracycline, doxycycline, azithromycin, ciprofloxacin and gentamicin, in compliance with standards from the U.S. Clinical and Laboratory Standards Institute. Results: all isolates were resistant to trimethoprim/sulfamethoxazole; 98.7 percent to sulfonamide and 90.3 percent to ampicillin. Intermediate sensitivity values were obtained for ciprofloxacin (30.6 percent) and chloramphenicol (27.1 percent). Sensitivity levels above 92 percent were found for first-line antimicrobials (doxycycline, tetracycline and azithromycin), as well as gentamicin. Multi-drug resistant strains were not found. Conclusions: results reveal the effectiveness in vitro of the antimicrobials used in Cuba to treat acute diarrheal disease caused by V. cholerae(AU)

Caracterización de aislamientos nosocomiales de S. aureus en muestras purulentas en un hospital ortopédico en Cuba / Characterization of nosocomial isolates of S. aureus purulent samples in an orthopedic hospital in Cuba / Caractérisation des isolats nosocomiaux de S. aureus à partir des échantillons purulents dans un service d'orthopédie à Cuba

OBJETIVO: caracterizar microbiológicamente los aislamientos de Staphylococcus aureus recuperados a partir de muestras purulentas tomadas a pacientes con infecciones asociadas a la atención sanitaria en el Hospital Ortopédico Docente "Fructuoso Rodríguez" de enero a mayo de 2014. MÉTODO: estudio descriptivo realizado en el Hospital Ortopédico Docente "Fructuoso Rodríguez" de enero a mayo de 2014 en el que se analizaron 134 muestras de pacientes hospitalizados. El procesamiento de las muestras se realizó por métodos microbiológicos convencionales, y en aquellas donde se recuperó S. aureus se determinó la susceptibilidad antimicrobiana por el método de Bauer Kirby y de E-test para vancomicina. RESULTADOS: En 41,0 % de los aislamientos se identificó S. aureus. El 52,7 % de estos se obtuvieron de heridas quirúrgicas. Se encontró que 50,9 % de los aislamientos de S. aureus fueron meticillin resistentes. No se encontró ninguna cepa resistente a vancomicina. Los aislamientos de S. aureus meticillin resistentes resultaron ser significativamente más resistentes que los de S. aureus meticillin sensibles para eritromicina y las tetraciclinas (tetraciclina y doxiciclina). CONCLUSIONES: S. aureus resultó el microorganismo más encontrado en las muestras purulentas estudiadas. En los aislamientos hospitalarios S. aureus predominó en las heridas quirúrgicas lo cual está en correspondencia con la literatura revisada. La mitad de los aislamientos estudiados resultaron ser S. aureus meticillin resistentes. Todos los antimicrobianos testados, con excepción de vancomicina, mostraron mayores porcentajes de resistencia en los aislamientos meticillin resistentes que en los meticillin sensibles lo que representa un aumento en la estadía hospitalaria y en el costo de la atención médica en aquellos pacientes con S. aureus meticillin resistentes.

OBJECTIVE: microbiologically characterize isolates of Staphylococcus aureus recovered from purulent samples to patients with infections associated with health care at "Fructuoso Rodríguez" Teaching Orthopedic Hospital from January to May 2014. METHOD: a descriptive study was conducted at "Fructuoso Rodríguez" Teaching Orthopedic Hospital from January to May 2014 in which 134 samples from hospitalized patients were analyzed. Sample processing was performed by conventional microbiological methods and for those samples where S. aureus was recovered, antimicrobial susceptibility by the Kirby Bauer method and E-test was determined for vancomycin. RESULTS: 41.0 % of S. aureus isolates were identified. 52.7 % of these were obtained from surgical wounds. It was found that 50.9 % of the isolates were meticillin-resistant S. aureus. No vancomycin resistant strain was found. The isolates of meticillin-resistant S. aureus were significantly more resistant than S. aureus meticillin sensitive to erythromycin and tetracyclines (tetracycline and doxycycline). CONCLUSIONS: S. aureus was the microorganism most found in the purulent samples studied. In hospital S. aureus isolates predominated in the surgical wound which is in line with the literature reviewed. Half of the studied isolates proved meticillin-resistant S. aureus. All antimicrobials tested except vancomycin, showed higher percentages of meticillin resistance in isolates resistant to meticillin sensitive in which an increase in the hospital stay and cost of care for patients with S. aureus meticillin resistant.

OBJECTIF: le but de ce travail est de caractériser du point de vue microbiologique les isolats de Staphylococcus aureus prélevés des échantillons purulents de patients affectés par des infections associées aux soins de santé du service d'orthopédie de l'hôpital universitaire "Fructuoso Rodríguez" depuis janvier jusqu'à mai 2014. MÉTHODES: une étude descriptive de 134 échantillons de patients hospitalisés à l'hôpital universitaire "Fructuoso Rodríguez" a été réalisée depuis janvier jusqu'à mai 2014. L'analyse de ces échantillons a été effectuée par des méthodes microbiologiques conventionnelles. La susceptibilité antimicrobienne a été définie par la méthode de Kirby Bauer et le test de sensibilité à la vancomycine dans les échantillons où le S. aureus a été récupéré. RÉSULTATS: le S. aureus a été identifié dans 41 % des isolats. Une partie (52.7 %) a été obtenue des blessures chirurgicales. On a trouvé que 50.9 % des isolats de S. aureus étaient résistants à la méticilline, tandis qu'aucune souche résistante à la vancomycine n'a été trouvée. Les isolats de S. aureus résistant à la méticilline étaient significativement plus résistants que les isolats de S. aureus sensibles à la méticilline pour l'érythromycine et les tétracyclines (tétracycline et doxicilline). CONCLUSIONS: le Staphylococcus aureus a été le microorganisme le plus souvent trouvé dans les échantillons purulents étudiés. Concernant les isolats hospitaliers, le S. aureus a été en majorité surtout dans les blessures chirurgicales, ce qui est en correspondance avec la littérature révisée. La moitié des isolats analysés ont mis en évidence un Staphylococcus aureus résistant à la méticilline. Tous les antimicrobiens testés, à l'exception de la vancomycine, ont montré des pourcentages de résistance beaucoup plus hauts dans les isolats résistants à la méticilline que dans les isolats sensibles à la méticilline. Ceci a résulté en une augmentation du séjour hospitalier et du coût des soins de santé des patients touchés par S. aureus résistant à la méticilline.

Portadores nasales de S. aureus en el personal de enfermería de un centro de salud del Estado Carabobo, Venezuela / Nasal carriers of S. aureus in the nursing staff of health center from Carabobo state, Venezuela

Staphylococcus aureus ha resultado ser un problema en el área de la salud, por su comportamiento frente a pacientes inmunosuprimidos y por la resistencia bacteriana que ha desarrollado en las últimas décadas. Es común que la fuente de infección sea el personal de salud, por ende el conocimiento de los factores de riesgo y la presencia de patologías alérgicas podría prevenir la colonización nasal del personal de salud y la posterior transmisión a los pacientes hospitalizados. La investigación fue de tipo descriptiva no experimental y de corte transversal, consistió en evaluar la frecuencia de portadores nasales de Staphylococcus aureus en el personal de enfermería de un centro de salud del Estado Carabobo. La muestra estuvo conformada por 30 enfermeras, donde 50% (15) resultaron no portadoras de dicho microorganismo, 27% (8) portadoras SAMS, y 23% (7) portadoras de SAMR, se detectaron 8 patrones de resistencia antibiótica, de donde destaca la resistencia a oxacilina, cefoxitin, clindamicina, eritromicina y ciprofloxacina, se obtuvo asociación estadísticamente significativa (p=0,0001) entre la portación nasal Staphylococcus aureus y la presencia de antecedentes de patologías alérgicas, por lo tanto puede considerarse que la presencia de estas patologías es un factor de riesgo de colonización nasal.

Staphylococcus aureus has been a problem in the area of health, for their behavior in immunosuppressed patients and bacterial resistance has developed in recent decades. It is common that the source of infection be health personnel, hence the knowledge of risk factors and the presence of allergic diseases could prevent nasal colonization of health personnel and subsequent transmission to hospitalized patients. It was a descriptive, not experimental and cross section research to assess the frequency of nasal carriage of Staphylococcus aureus in nursing staff of health center from Carabobo state. The sample consisted of 30 nurses, where 50% (15) were not carriers of this organism, 27% (8) carriers SAMS, and 23% (7) carriers of MRSA, 8 patterns of antibiotic resistance were detected, of which highlights resistance, to oxacillin, cefoxitin, clindamycin, erythromycin, ciprofloxacin, statistically significant association (p = 0.0001) between Staphylococcus aureus nasal carriage and the presence of a history of allergic diseases is obtained, thus can be considered that the presence of these pathologies is a risk factor of nasal colonization.

Agentes etiológicos en infecciones post-quirúrgicas en servicios del hospital "Luis Blanco Gásperi": Carabobo, Venezuela / Etiologic agents in post- surgical infections in hospital services "Luis Blanco Gásperi": Carabobo, Venezuela

Dentro de las infecciones nosocomiales (IN), la infección de sitio quirúrgico (ISQ), es un problema de gran relevancia, sin embargo, el subregistro es muy frecuente. El objetivo de este estudio fue determinar los agentes etiológicos de infecciones postquirúrgicas en el Hospital "Luis Blanco Gásperi", período Junio-Agosto 2012. Se realizó estudio descriptivo, de campo, de corte transversal y no experimental, obteniéndose que de un total de 528 pacientes intervenidos quirúrgicamente, 8,5% (n=45) presentó sospecha clínica de ISQ, resultando con crecimiento microbiano positivo 5,49% (n=29). Los agentes etiológicos aislados predominantemente fueron bacilos gramnegativos (77,27%), con prevalencia de miembros de la familia Enterobacteriaceae, principalmente Escherichia coli (18,18%). Asimismo, se encontró como patrón epidemiológico de los pacientes, un predominio de adultos con una media de 53 años, de sexo femenino y 48,28% provenientes de la misma comunidad (Municipio Valencia, Estado Carabobo). El patrón de susceptibilidad a antibióticos in vitro, reportó un alto índice de sensibilidad a aminoglucósidos y carbapenems, 42,11% de aislados clínicos presentaron algún mecanismo de resistencia a antimicrobianos.

Within nosocomial infections (NI), surgical site infection (SSI) is a problem of great relevance, however, underreporting is common. The aim of this study was to determine the etiological agents of post-surgical infections at the "Luis Blanco Gasperi" Hospital, period June to August 2012. A descriptive field, cross-sectional and non-experimental study was conducted from a totall of 528 patients undergoing surgery, 8.5% (n= 45) had clinical suspicion of SSI resulting positive for microbial growth 5.49% (n= 29). The isolated bacteria were predominantly gram-negative bacilli (77.27%), with prevalence of Enterobacteriaceae family members, particularly Escherichia coli (18.18%). It was also found as epidemiological pattern from patients, a prevalence of adults with an average of 53 years, female and 48.28% from the same community (Valencia municipality, Carabobo state). The pattern of in vitro susceptibility to antibiotics, reported a high rate of sensitivity to aminoglycosides and carbapenems, 42.11% of the clinical isolates showed some mechanism of resistance to antimicrobials.

La antibiótico-resistencia de bacterias de importancia clínica aisladas del río Almendares, Cuba, abordada como problema de salud ecosistémica / The antibiotic-resistance of clinically significant bacteria isolated from Almendares River in Cuba, addressed as an ecosystem health problem

La Universidad actual tiene, además de su papel docente, una posición privilegiada en cuanto a la protección del medio ambiente mediante la difusión de los resultados de sus investigaciones. Uno de los problemas medioambientales, y por ende de salud, que más preocupa a los investigadores en la actualidad es la resistencia a los antibióticos de bacterias que habitan los ecosistemas acuáticos. El objetivo del presente trabajo es demostrar la presencia de bacterias de importancia clínica en el río Almendares, La Habana, Cuba, como problema de salud ecosistémica y así tener una visión más completa en el análisis de situaciones problémicas sobre el estado ecológico real del mismo que se discuten en la docencia de pregrado y postgrado. Se determinó la susceptibilidad antimicrobiana in vitro de 72 aislados del río Almendares por el método de Bauer- Kirby. Las lecturas fueron realizadas teniendo en los catálogos del Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Se obtuvieron aislados resistentes a las cefalosporinas de tercera y cuarta generación, un aislado de Escherichia coli fue resistente a nueve antibióticos distintos, mientras que fueron también multirresistentes aislados de Salmonella sp., Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Enterococcus faecalis y Streptococcus pneumoniae. La presencia de bacterias de diferentes grupos de importancia clínica, resistentes y multirresistentes a antibióticos, en este río constituye un importante problema de salud ecosistémica, lo cual constituye un riesgo potencial que afecta los servicios ecosistémicos de los cuales depende gran parte de la población de la capital cubana.

The current University has, besides its educational paper, a privileged position as for the protection of the environment by means of the diffusion of the results of its investigations. One of the environmental problems, and therefore health, of greatest concern to researchers today is the antibiotic resistance of bacteria that inhabit aquatic ecosystems. The objective of this paper is to demonstrate the presence of bacteria of clinical importance from the Almendares River in Havana, Cuba, as an ecosystem health problem and thus have a more complete vision on the analysis of problem situations about the actual ecological status of this ecosystem, which are being discussed in pre and postgraduate teaching. The antimicrobial susceptibility was determined from 72 strains isolated in vitro on Almendares River through Bauer-Kirby method. The readings were carried out having in the catalogs of the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Isolated resistant to cefalosporins of third and fourth generation were obtained, one isolated of Escherichia coli was resistant to nine different antibiotics, while isolated of Salmonella enterica, Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus, Enterococcus faecalis and Streptococcus pneumoniae were also multiresistant. It was concluded that the presence of some resistant and multiresistant to antibiotics bacteria of clinical importance, in this river, constitute an important problem of ecosystem health, which at the same time, establishes a potential risk that affects the ecosystem services from which many people from Cuban capital depend.

Susceptibilidad antimicrobiana en Chile 2012 / Antimicrobial susceptibility in Chile 2012

Bacteria antimicrobial resistance is an uncontrolled public health problem that progressively increases its magnitude and complexity. The Grupo Colaborativo de Resistencia, formed by a join of experts that represent 39 Chilean health institutions has been concerned with bacteria antimicrobial susceptibility in our country since 2008. In this document we present in vitro bacterial susceptibility accumulated during year 2012 belonging to 28 national health institutions that represent about 36% of hospital discharges in Chile. We consider of major importance to report periodically bacteria susceptibility so to keep the medical community updated to achieve target the empirical antimicrobial therapies and the control measures and prevention of the dissemination of multiresistant strains.

La resistencia bacteriana es un problema de salud pública que lejos de estar controlado, aumenta en cantidad y complejidad. El Grupo Colaborativo de Resistencia, es un conjunto de profesionales que representan a 39 establecimientos de salud del país y que se ha ocupado desde 2008 de recolectar información sobre la susceptibilidad antimicrobiana de bacterias en Chile. En este documento se presenta la susceptibilidad in vitro acumulada del año 2012, de 28 establecimientos de salud del país que representan, al menos, 36% de los egresos hospitalarios de Chile. Consideramos de la mayor relevancia reportar periódicamente la susceptibilidad bacteriana de modo de mantener a la comunidad médica actualizada para orientar las terapias empíricas y las medidas de control y prevención de la diseminación de cepas multi-resistentes.

Caracterización molecular de la región determinante de resistencia a quinolonas (QRDR) de la topoisomerasa IV de Bartonella bacilliformis en aislados clínicos

Bartonella bacilliformis es el agente etiológico de la Enfermedad de Carrión, endémica del Perú. Pocas investigaciones han sido realizadas acerca de los genes asociados a la resistencia antimicrobiana en aislados clínicos de este patógeno. Estos genes no están caracterizados molecularmente, ni se conoce la región asociada a dicha resistencia. Por ello, el objetivo del este trabajo fue caracterizar molecularmente la región determinante de la resistencia a las quinolonas (QRDR) en la topoisomerasa IV, que está codificada por los genes parC y parE, así como también desarrollar una prueba de susceptibilidad antimicrobiana para B. bacilliformis. Las muestras sanguíneas de 65 pacientes procedentes de La Libertad, Cusco, Ancash y Piura, se sembraron en placas de agar sangre e incubaron a 30 °C con 5% CO2. Luego se procedió a: (1) determinar la susceptibilidad antimicrobiana y (2) extraer el DNA genómico, amplificar los genes mencionados, secuenciarlos y analizarlos mediante herramientas bioinformáticas. Se obtuvieron 6 cultivos positivos. Los aislados fueron sensibles a la ciprofloxacina (excepto uno procedente de Quillabamba-Cusco, que presentó susceptibilidad disminuida) y resistentes al ácido nalidíxico. Del análisis de las secuencias aminoacídicas de ParC y ParE de B. bacilliformis se concluye que presentan diferencias aminoacídicas en comparación con las secuencias de las proteínas respectivas de E. coli K12 MG1655, que probablemente confieran resistencia al ácido nalidíxico pero no a la ciprofloxacina. Se determinó que las QRDR de las proteínas ParC y ParE de B. bacilliformis están comprendidas entre los aminoácidos 67 al 118 y 473 al 530, respectivamente. El antibiograma y la concentración mínima inhibitoria se evalúan mejor usando inóculos a escala 1 de McFarland y a los 6 días de incubación

Bartonella bacilliformis is the etiologic agent of Carrion's disease, which if endemic to Peru. Studies on antimicrobial resistance genes from clinical isolates of this pathogen are scarce, and the molecular characteristics of these genes and their region resistance-associated are currently unknown. In this work we made the molecular characterization of the quinolone-resistance, and establish the region (QRDR) for the topoisomerase IV, which is encoded by the parC and parE genes, as well as develop an antimicrobial susceptibility test for B. bacilliformis. 65 Blood samples from La Libertad, Cusco, Ancash and Piura were processed on Blood Agar plates and incubated at 30 °C, 5% CO2. The antimicrobial susceptibility was determined, then the genomic DNA extracted, aforementioned genes amplified, their sequence determined and it analyzed using bioinformatics tools. Six positive cultures were obtained. The isolates were susceptible to Ciprofloxacin (except one strain from Quillabamba _ Cusco, which showed decreased susceptibility) and were resistant to Nalidixic Acid. From the sequence analysis of B. bacilliformis ParC and ParE there have been shown amino acid differences compared to the respective protein sequences from E. coli K12 MG1655, which is likely to confer resistance to Nalidixic Acid but not to Ciprofloxacin. It was determined that B. bacilliformis ParC and ParE proteins QRDRs are comprised between amino acids 67 to 118 and 473 to 530, respectively. The antibiogram and the minimal inhibitory concentration are best assessed using the #1 McFarland standards after a 6-day incubation period

Perfil etiológico y susceptibilidad antimicrobiana del primer episodio de infección urinaria febril / Etiologic and antibiotic susceptibility profile of the first episode of febrile urinary tract infection

Urinary tract infection (UTI) is a common infection in childhood; its diagnosis involves performing a urine culture. Aim: To describe the etiology and bacterial susceptibility of the first episode of UTI in children presenting with fever to the emergency room. Patients and Methods : One hundred and five children (2 months -5 years old) seen at the Hospital Dr. Sotero del Rio in Santiago, between November 2009 and November 2010 were evaluated. A urine specimen was obtained by transurethral catheterization. Urine was cultured and microorganisms were identified and tested for antimicrobial susceptibility. Results: 76.2% (80) of patients were women and 80% (84) were under 18 months. Urine sediment was abnormal in 82.5%. The most frequently isolated microorganism was Escherichia coli (96.1%) showing high susceptibility to aminoglycosides (near 100%), third generation cephalosporins, ciprofloxacin and nitrofurantoin; and low susceptibility to cephalothin (69%) and trimethoprim/sulfamethoxazole (66%). We found one ESBL-producing strain. Conclusion: The most common uropathogen was E. coli with good in vitro susceptibility to aminoglycosides and third generation cephalosporins, which are the recommended initial empirical therapy. E. coli ESBL-producing strains appear as emerging pathogens in community acquired UTIs in children.

La infección del tracto urinario (ITU) es muy frecuente en la niñez y su diagnóstico implica la realización de urocultivo. Objetivo: Describir la etiología y susceptibilidad bacteriana del primer episodio de ITU en niños que consultaron por fiebre en una unidad de emergencia. PacientesyMétodos: Se evaluaron 105 niños (2 meses -5 años) consultantes en la Unidad de Emergencia Infantil del Hospital Sótero del Río del área sur-oriente de Santiago entre noviembre de 2009 y noviembre de 2010, con muestra de orina tomada por cateterismo trans-uretral para sedimento de orina, urocultivo y antibiograma. Resultados: El 76,2% (80) de los pacientes fueron mujeres y 80% (84) tenía menos de 18 meses. El sedimento de orina resultó alterado en 82,5%. El microorganismo aislado con mayor frecuencia fue Escherichia coli (96,1%) que mostró buena susceptibilidad in vitro (cercana a 100%) para aminoglucósidos, cefalosporinas de tercera generación, quinolonas y nitrofurantoína, y baja susceptibilidad para cefalotina (69%) y cotrimoxazol (66%). Una cepa era productora de β-lactamasa de expectro extendido (bLEE). Conclusión: El uropatógeno más frecuente fue E. coli que demostró buena susceptibilidad in vitro a aminoglucósidos y cefalosporinas de tercera generación, antimicrobianos parenterales recomendados como tratamiento empírico inicial para este grupo de pacientes. Las cepas de E. coli productoras de bLEE aparecen como patógenos emergentes en las ITUs adquiridas por niños en la comunidad.

Vigilancia institucional de la susceptibilidad antimicrobiana en patógenos de interés clínico / Institutional vigilance of antimicrobial susceptibility in pathogens of clinical interest

Introducción. El incremento en la resistencia de los microorganismos a los antibióticos ha provocado un aumento en la morbimortalidad de las infecciones, un mayor uso de antibióticos y el exceso en gastos de hospitalización. Por lo tanto, el objetivo de este trabajo fue describir la frecuencia de microorganismos patógenos y sus patrones de susceptibilidad bacteriana en cultivos de sangre, orina y de otros fluidos corporales en un hospital pediátrico de tercer nivel. Métodos. Se incluyeron en el estudio cepas de cultivos de sangre, orina, líquido cefalorraquídeo y otros, como pleural, pericárdico y peritoneal, de enero de 2010 a junio de 2011. La identificación y la susceptibilidad se obtuvieron utilizando el equipo Vitek 2XL, de acuerdo con las recomendaciones del Clinical and Laboratory Standards Institute . Resultados. Se aislaron e identificaron 7708 bacterias de 27,209 cultivos de muestras biológicas. Los microorganismos más frecuentes fueron Staphylococcus coagulasa negativa, Escherichia coli, Enterococcus spp, Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa y Klebsiella pneumoniae . La actividad antimicrobiana en contra de los diferentes patógenos fue variable. Escherichia coli presentó la mayor resistencia a trimetoprima-sulfametoxazol (74%) y ampicilina-sulbactam (68%). Las mejores opciones resultaron nitrofurantoína e imipenen, con 84 y 100% de sensibilidad. La resistencia de Enterococcus faecium fue de 58% a vancomicina. Streptococcus pneumoniae presentó 100% de sensibilidad a vancomicina. Conclusiones. La frecuencia de patógenos provenientes de diferentes fluidos corporales no ha variado considerablemente. Sin embargo, el cambio más notable se observó en la resistencia, tanto en Gram positivos como en Gram negativos, en contra de los fármacos convencionales, así como en los considerados de amplio espectro.

Background. The increased resistance of microorganisms to antibiotics has led to an increase in morbidity and mortality from infections, increased use of antibiotics and excessive hospitalization costs. Therefore, the aim of this study was to describe the frequency of pathogens and bacterial susceptibility patterns in cultures of blood, urine and other body fluids in a tertiary pediatric hospital. We also aimed to determine the patterns of resistance in pathogens of clinical interest isolated in blood, urine and other sterile liquids in a pediatric teaching center and third-level hospital. Methods. The Institutional Antimicrobial Surveillance Program was established to monitor the predominant pathogens and antimicrobial susceptibility patterns of infections such as bacteremia, pneumonia and urinary infections. The species of each isolate was determined according to routine methodology and Vitek system from January 2010 to June 2011. Antimicrobial agents and susceptibility testing were determined using the Vitek 2XL according to the Clinical and Laboratory Standards Institute. Results. We recovered 7708 isolates from 27,209 cultures (28.3%). Gram negative represented 52.7%. A rank order showed Staphylococcus coagulase-negative , Escherichia coli, Enterococcus spp ., Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae and others. The antimicrobial susceptibility of the most frequently encountered pathogens was variable. E. coli showed the highest resistance to trimethopim-sulfamethoxazole and ampicillin-sulbactam (74 and 68%, respectively) finding the best option to be nitrofurantoin and imipenem with 84 and 100% sensitivity, respectively. Enterococcus faecium resistance was 58% vancomycin, and Streptococcus pneumoniae showed 100% sensitivity to vancomycin. Conclusions. This study emphasizes the problem of resistance and the needs to select an appropriate broad-spectrum empirical regimen guided by the knowledge of pathogen occurrences and local/regional/global resistance patterns. Such practices require the interrelation between clinical microbiology laboratories and hospital pharmacies.