Quality selection and genetic diversity of Tunisian durum wheat varieties using SSR markers / Seleção de qualidade e diversidade genética de vari edades de trigo duro da tunísia usando marcadores SSR

Our study focuses on the molecular analysis of the genetic diversity within 15 Tunisian durum wheat varieties and the assessment of the efficiency of some available markers to select valuable genotypes for technological proprieties of semolina (i.e. parameters related to SDS-sedimentation, mixing time and breakdown resistance of mixograph, grain protein content and yellow colour). While several markers were validated, others were not informative within the genotypes used. A high level of polymorphic information content (PIC) was detected, with an average of 5.2 polymorph alleles per locus and 0.6 average. Old varieties have high protein content however; modern varieties display strong gluten strength. Our results thus open the opportunity to choose valuable parents on the base of pedigrees, technological properties and genetic distances; and lead us to select efficient markers for the Regional Indigenous Land Strategy (Rils) selection strategy

Nosso estudo enfoca a análise molecular da diversidade genética em 15 variedades de trigo duro tunisiano e a avaliação da eficiência de alguns marcadores disponíveis para selecionar genótipos valiosos para propriedades tecnológicas de semolina (ou seja, parâmetros relacionados à sedimentação sds, tempo de mistura e resistência à degradação do mixógrafo, teor de proteína dos grãos e cor amarela). Enquanto vários marcadores foram validados, outros não foram informativos dentro dos genótipos utilizados. Foi detectado um alto nível de conteúdo de informação polimórfica (pic), com uma média de 5,2 alelos polimórficos por locus e 0,6 média. Variedades antigas têm alto teor de proteína no entanto; variedades modernas exibem forte força de glúten. Nossos resultados abrem, assim, a oportunidade de escolher pais valiosos com base em pedigrees, propriedades tecnológicas e distâncias genéticas; e nos levam a selecionar marcadores eficientes para a estratégia de seleção da estratégia regional de terras indígenas (rils).

Genetic diversity in algerian durum wheat varieties (Triticum turgidum L var. durum) using microsatellite markers / Diversidade genética em variedades de trigo duro argelino (Triticum turgidum L var. durum) usando marcadores microssatélites

Characterization of germplasm by DNA-markers provides powerful tool to precise germplasm identification. This study aimed to quantify the genetic diversity and to estimate the phylogenetic relationship among genotypes in many crop species. The results of the present study realized between Nov and Dec 2016 in biotechnologie unit (ICARDA, Morocco) which aimed to characterize a subset of 14 Algerian selected durum wheat cultivars (Triticum turgidum L. var. durum), using 13 SSR (Single Sequence Repeat) indicated the presence of a total of 39 alleles. The genetic diversity at the 13 microsatellites loci varied from 0,142 for Xgwm337 to 0.735 for Xgwm213 with a mean of 0.444. Polymorphic information content (PIC) values ranged from 0.13 to 0.70 and the genetic distance among the cultivars from 0.15 to 0.77. Clustering analysis showed that the studied varieties were grouped according to their population of origin, suggesting a provenance effect in their ordination. In fact the most similar varieties were those introduced from CIMMYT-ICARDA breeding program, which may have common parents in their pedigree. Selections from local landraces were more similar to each other and dissimilar to CIMMYT-ICARDA material, showing an agro-ecological adaptation.

A caracterização de germoplasma por marcadores de DNA fornece uma ferramenta poderosa para a identificação precisa de germoplasma, quantificar a diversidade genética e estimar a relação filogenética entre genótipos em muitas espécies de culturas. Os resultados do presente estudo foram realizados entre novembro e dezembro de 2016 na unidade de biotecnologia (ICARDA, Marrocos) que objetivou caracterizar um subconjunto de 14 cultivares de trigo duro argelinos selecionados (Triticum turgidum L. var. durum), utilizando 13 SSR (Single Sequence Repeat ) indicou a presença de um total de 39 alelos. A diversidade genética nos 13 locos de microssatélites variou de 0,142 para Xgwm337 a 0,735 para Xgwm213 com uma média de 0,444. Os valores do conteúdo de informação polimórfica (PIC) variaram de 0,13 a 0,70 e a distância genética entre as cultivares de 0,15 a 0,77. A análise de agrupamento mostrou que as variedades estudadas foram agrupadas de acordo com sua população de origem, sugerindo um efeito de proveniência em sua ordenação. De fato, as variedades mais similares foram aquelas introduzidas no programa de criação CIMMYT-ICARDA, que podem ter pais comuns em seu pedigree. Seleções de variedades locais foram mais similares entre si e diferentes do material CIMMYT-ICARDA, mostrando uma adaptação agroecológica.