Plataforma laboratorial para monitorear el SARS-CoV-2 basada en la vigilancia de influenza y otros virus respiratorios en Perú / Laboratory platform for monitoring SARS-CoV-2 based on surveillance of influenza and other respiratory viruses in Peru

RESUMEN En el Perú, la pandemia de la COVID-19 ha evidenciado la utilidad de tener un sistema de vigilancia laboratorial estructurado y en funcionamiento desde hace 22 años, basado en la vigilancia de influenza; inicialmente en modalidad de unidades centinela, y después fortaleciéndose e innovándose, con recursos propios y con apoyo externo, para generar información de calidad. Se han implementado avances biotecnológicos para la confirmación diagnóstica e incrementado las capacidades de la red nacional de laboratorios, manteniendo la eficiencia, considerando las diversas y complejas realidades de los niveles regionales, y superando dificultades de comunicación y articulación entre instituciones. Resulta necesario consolidar este sistema, con trabajo colaborativo y coordinado entre sus componentes, impulsando su eficacia y oportunidad y promoviendo la vigilancia genómica de nuevos virus y variantes, como actualmente ocurre con el SARS-CoV-2.

ABSTRACT In Peru, the COVID-19 pandemic demonstrated the usefulness of having a structured laboratory surveillance system that has been operational for 22 years, based on influenza surveillance; initially in the form of sentinel units, and later strengthened and innovated, with its own resources and with external support, to provide quality information. Biotechnological advances have been implemented for diagnostic confirmation and the capacity of the national laboratory network has been expanded, maintaining efficiency, considering the diverse and complex realities of each region, and overcoming difficulties regarding communication and articulation between institutions. It is necessary to consolidate this system, with collaborative and coordinated work between its components, boosting its effectiveness and timeliness and promoting genomic surveillance of new viruses and variants, as is currently the case with SARS-CoV-2.

Miocarditis fulminante en adultos por el virus de la influenza B: reporte de dos casos y revisión de la literatura / Fulminant myocarditis due to the influenza B virus in adults: Report of two cases and literature review

Resumen La miocarditis es una enfermedad inflamatoria del miocardio. Las infecciones virales son la causa más común, aunque también puede deberse a reacciones de hipersensibilidad y de etiología autoinmunitaria, entre otras. El espectro clínico de la enfermedad es variado y comprende desde un curso asintomático, seguido de dolor torácico, arritmias y falla cardiaca aguda, hasta un cuadro fulminante. El término 'fulminante' se refiere al desarrollo de un shock cardiogénico con necesidad de soporte vasopresor e inotrópico o dispositivos de asistencia circulatoria, ya sea oxigenación por membrana extracorpórea o balón de contrapulsación intraaórtico. Cerca del 10 % de los casos de falla cardiaca por miocarditis corresponde a miocarditis fulminante. La miocarditis por influenza se considera una condición infrecuente; no obstante, su incidencia ha aumentado desde el 2009 a raíz de la pandemia de influenza por el virus AH1N1. Por su parte, la miocarditis por influenza de tipo B sigue siendo una condición infrecuente. Se describen aquí dos casos confirmados de miocarditis fulminante por el virus de la influenza B atendidos en un centro cardiovascular, que requirieron dispositivos de asistencia circulatoria mecánica.

Abstract Myocarditis is an inflammatory disease of the myocardium. Viral infections are the most common cause, although it can also be due to hypersensitivity reactions and autoimmune etiology, among other causes. The clinical spectrum of the disease is varied, from an asymptomatic course, followed by chest pain, arrhythmias, and acute heart failure, to a fulminant episode. The term fulminant refers to the development of cardiogenic shock with a need for vasopressor support and inotropic or assisted circulation devices either extracorporeal membrane oxygenation (ECMO) or intra-aortic counterpulsation balloon. About 10% of cases of heart failure due to myocarditis correspond to fulminant myocarditis. Influenza myocarditis has been considered an infrequent condition. However, its incidence has increased since 2009 as a result of the AH1N1 pandemic; otherwise, myocarditis due to the Influenza type B virus remains an infrequent entity. We describe the experience in a cardiovascular center of two confirmed cases of fulminant myocarditis due to influenza B that required circulatory assistance devices.

Etiología viral de las infecciones agudas del tracto respiratorio inferior en Cuba / Viral etiology of the acute infections of the lower respiratory tract in Cuba

RESUMEN Fundamento: las infecciones respiratorias agudas constituyen la causa principal de morbilidad a nivel mundial, al ser sus principales agentes etiológicos los virus respiratorios. Objetivo: determinar el papel de diferentes virus respiratorios en la causa de la infección respiratoria aguda grave durante el período mayo 2012 - junio 2013, en Cuba. Métodos: se realizó un estudio analítico transversal, el universo fueron las muestras clínicas recibidas en el Laboratorio Nacional de Referencia (LNR) de Virus Respiratorios del Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí (IPK) como parte de la vigilancia de las IRA de posible etiología viral, desde el 1 de mayo de 2012 y el 30 de junio de 2013. Se estudiaron 1 604 muestras procedentes de pacientes de todas las edades con manifestaciones clínicas. Para el diagnóstico se emplearon tres ensayos de TR-RCP múltiple de tipo anidado y un TR-RCP en tiempo real. Resultados: los rinovirus fueron los agentes más identificados, seguidos de los virus Influenza y del virus sincitial respiratorio. Los de mayor frecuencia en los pacientes con infección respiratoria aguda grave fueron los virus Influenza se demostró asociación significativa (OR 6,437; 95 % IC: 3,407-12,159; p=0,000) y en los pacientes <1 año se encontró también asociación con la detección del virus sincitial respiratorio; hubo correlación también en la población de 15-59 años con los virus Influenza (p=0,000). El virus Influenza B circuló entre los meses de mayo y septiembre del año 2012, mientras que el virus Influenza A (H1N1) pdm09 predominó en la circulación durante el 2013. Conclusiones: los resultados de esta investigación permiten esclarecer la contribución específica de los diferentes virus respiratorios en la causa de dicha enfermedad. Al mismo tiempo alertan a los programas nacionales la necesidad de centralizar los esfuerzos de la vigilancia en este tipo de infección para la identificación oportuna de eventos de salud inusitados por los virus Influenza.

ABSTRACT Background: acute respiratory infections are the main cause of mortality and morbidity worldwide, with respiratory viruses as main causative agents. Objective: to determine the paper of different respiratory viruses in the etiology of the severe acute respiratory infections during the period May 2012- June 2013, in Cuba. Methods: a transverse analytical study was carried out, the universe there were the clinical samples received in the National Laboratory of Reference (LNR) of Respiratory Viruses of the Institute of Tropical Medicine Pedro Kourí (IPK) as part of the alertness of the IRA of possible viral etiology, from May 1, 2012 and June 30, 2013. There were studied 1 604 samples proceeding from patients of all the ages with clinical declarations. For the diagnosis, there were used three essays of multiple TR-RCP of sheltered type and a TR-RCP in real-time. Results: rhinoviruses were the agents largely identified, followed by the Influenza viruses and the respiratory syncytial virus. The ones of bigger frequency in patients with severe acute respiratory infection were Influenza viruses demonstrating significant association (OR 6,437; 95 % CI: 3,407-12,159; p= 0,000) and in patients <1 year old it was also found association with the detection of respiratory syncytial virus; correlation was also in the population of 15-59 years with the viruses Influenza (p= 0,000). The Influenza virus B circulated mainly between the months of May and September of the year 2012, while the virus Influenza A (H1N1) pdm09 predominated during 2013. Conclusions: the results of this investigation allow explaining the specific contribution of the different respiratory viruses in the etiology of said pathology. At the same time, they alert the national programs of the need to centralize the efforts in vigilance of this type of infection to achieve opportune identification of health events unusual for the viruses Influenza.

La influenza en Costa Rica 2003-2006, un tema fundamental para la vigilancia epidemiológica actual / Influenza in Costa Rica 2003-2006, a fundamental issue for the current epidemiological surveillance

Anualmente la influenza causa aproximadamente 3.5 millones de casos severos en el mundo. Objetivo: Describir y analizar la situación epidemiológica de la influenza y apoyar el fortalecimiento de su sistema de vigilancia. Métodos: Estudio descriptivo retrospectivo. Se calculó incidencia, riesgo relativo, RR, intervalo de confianza al 95 por ciento, IC 95 por ciento, y número de egresos con sus promedios móviles, tasas de egreso hospitalario de influenza y neumonía. Fuentes de datos: los registros de notificación colectiva del Ministerio de Salud, la base de datos de egresos hospitalarios del Seguro Social y los registros de la vigilancia centinela del Centro Nacional de Influenza. Resultados: La incidencia anual mostró tendencia al aumento, R2 igual 0.9, con picos en marzo a abril, junio a septiembre y agosto a diciembre. Las tasas anuales de egreso hospitalario mostraron tendencia a disminuir, R2 igual 0.9, con picos en marzo a mayo, julio a septiembre y septiembre a octubre. El pico de aislamientos del laboratorio se presentó en el segundo semestre de cada año, más frecuente en los meses de julio, agosto y septiembre. discusión: Se cotejaron los datos de la vigilancia, los egresos hospitalarios y el laboratorio, los resultados no fueron suficientes para concluir si la influenza muestra estacionalidad. Se sugiere realizar un estudio del sistema de vigilancia de influenza para mejorar la calidad y el registro de los datos ya que es fundamental conocer la estacionalidad de la influenza y sus cambios para respaldar las intervenciones correspondientes y sus modificaciones.

Objective: To describe and analyze the influenza epidemiological situation in the past four years in order to support enhancement of the influenza surveillance system in Costa Rica.Methods: A descriptive, retrospective study was conducted. Incidence and hospital discharge rates were calculated. Sources of data were: collective notification forms of the Ministry of Health, the hospital discharge data base of the Costa Rican Social Security system as well as the influenza surveillance forms of the National Influenza Center. Results: Since 2005 collective information has been gathered monthly, by province, by age-groups and sex. From 2005 through 2006, the highest rates were found in the months of March and May. Regarding hospital discharges, mobile averages showed that a peak was reached between June and September. Laboratory diagnoses were highest during the months of July through September. Discussion: Collective notification is higher in the first semester; nevertheless, hospital discharge rates are higher between June and September which match the peak reached by laboratory diagnoses for influenza virus; this may suggest seasonality but there is a lack of robust data to confirm this; therefore, we suggest conducting further seasonality studies. This study supports the development of guidelines for the influenza surveillance process in Costa Rica.

Mortalidad asociada con las temporadas de mayor circulación de los virus de la influenza en Bogotá, Colombia, 1997-2005 / Mortality associated with peak seasons of influenza virus circulation in Bogotá, Colombia, 1997-2005

OBJETIVO: Estimar el exceso de mortalidad potencialmente atribuible a los virus de la influenza A y B y al virus sincitial respiratorio humano (VSRH) en las temporadas de mayor circulación de los virus de la influenza en Bogotá, Colombia entre 1997 y 2005. MÉTODOS: Se relacionaron las tasas mensuales de mortalidad general, por neumonía en menores de 5 años y por neumonía y afecciones cardiovasculares en mayores de 60 años, en Bogotá, Colombia, con las temporadas de mayor circulación de los virus de la influenza en esa ciudad. Los datos de mortalidad se obtuvieron del Departamento Nacional de Estadísticas de Colombia; las temporadas de mayor circulación de los virus se definieron como los meses contiguos en los que el número de aislamientos era igual o superior a la mitad del total de los aislamientos del año. Se calcularon las razones de tasas de incidencia (RTI) y sus intervalos de confianza de 95 por ciento (IC95 por ciento). RESULTADOS: El virus de la influenza A mostró un patrón de circulación estacional, pero no el de la influenza B y el VSRH. La mayor circulación de los virus de la influenza se asoció con un incremento promedio anual de 5 por ciento en la mortalidad general durante el período estudiado (RTI = 1,05; IC95 por ciento: 1,046 a 1,064). En las temporadas de mayor circulación de los virus de la influenza, la mortalidad combinada por neumonía e influenza en todas las edades fue mayor en 11 por ciento que en el resto del período (RTI = 1,11; IC95 por ciento: 1,051 a 1,178). CONCLUSIONES: En las temporadas de mayor circulación de los virus de la influenza en Colombia puede aumentar la mortalidad, en particular por neumonía y afecciones cardiovasculares en mayores de 60 años. Deben emprenderse acciones de prevención específicas para prevenir la influenza, especialmente en estos dos grupos de edad.

OBJECTIVE: To estimate potential excess mortality attributable to influenza viruses A and B and human respiratory syncytial virus (HRSV) during peak seasons of influenza virus circulation in Colombia from 1997 to 2005. METHODS: A comparison of monthly, general mortality rates from pneumonia in children under 5 years of age and from pneumonia and cardiovascular disease in those more than 60 years of age in Bogota, Colombia, were compared to the city's peak seasons of influenza virus circulation. Mortality data were obtained from the National Bureau of Statistics of Colombia; peak seasons of virus circulation were defined as contiguous months in which the number of isolates was equal to or greater than half the total number of isolates for the year. Incidence rate ratios (IRR) and their 95 percent confidence intervals (95 percentCI) were determined. RESULTS: Influenza A demonstrated a pattern of seasonal circulation, but influenza B and HRSV did not. The increased circulation of influenza virus was associated with an average annual increase of 5 percent in overall mortality during the study period (IRR = 1.05; 95 percentCI: 1.046-1.064). During seasons of increased circulation of influenza viruses, the combined mortality from pneumonia and influenza for all ages was 11 percent higher than it was at other times (IRR = 1.11; 95 percentCI: 1.051-1.178). CONCLUSIONS: During peak seasons of influenza virus circulation in Colombia, there can be increased mortality, particularly from pneumonia and cardiovascular disease among those more than 60 years of age. Preventive actions specific to protecting against influenza should be taken, especially in these two age groups.