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1.
Rev. medica electron ; 34(1): 25-33, ene.-feb. 2012.
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-629892

ABSTRACT

En el laboratorio de Sistema Ultra-Micro-Analítico, del banco de sangre del Hospital Territorial Universitario Dr Mario Muñoz Monroy, del municipio Colón, provincia Matanzas, se realizó un estudio descriptivo prospectivo longitudinal, sobre el comportamiento de marcadores serológicos, donde se determinó la incidencia y prevalencia del antígeno de superficie del virus de la hepatitis B (VHB, HBsAg) y de los anticuerpos contra los virus de la hepatitis C (VHC, anti-VHC) y de la inmunodeficiencia humana 1 y 2 (VIH 1 y 2, anti-VIH 1+2), en donantes de sangre del territorio, y el estimado de infección potencial no detectada transmisible por sangre o riesgo residual (RR) en la sangre donada, en el tiempo comprendido del 1 de enero de 1998 al 31 de diciembre de 2007. La investigación se realizó con todo el universo de donantes útiles y sus respectivas donaciones de sangre, y quedó constituido por 49 749 donantes y 84 932 bolsas de sangre. Los índices de prevalencia (x 100 000 donantes), incidencia (x 100 000 donantes), y estimado de riesgo residual (x 1 000 000 de unidades de sangre donada) en el citado período de tiempo fueron: para el VHB 0,81; 0,17 y 0,20; para el VHC 0,55; 0,12 y 0,23; y para los VIH 1y2 0,005; 0,01x10-2 y 0,02 x10-3, respectivamente, índices bajos según la clasificación internacional; pero no para Cuba con respecto al HBsAg.


We carried out a prospective descriptive longitudinal study on the behavior of the serologic markers in the Ultra-Micro-Analytic System laboratory, of the blood bank of the territorial university hospital Dr Mario Muñoz Monroy, of the municipality of Colon, province of Matanzas. We determined the incidence and prevalence of the surface Hepatitis B virus antigen (HBV, HBsAg) and of the antibodies against the Hepatitis C (HCV, anti HCV) and the human immunodeficiency virus 1 and 2 (HIV 1 and 2, anti-HIV 1+2) in blood donors of the territory, and the estimate of non-detected potential infection transmissible by blood or residual risk (RR) in the donated blood, in the period from January 1st 1998 to December 31st 2007. The research was made with all the universe of utile donors and their respective blood donations, and was formed by 49 749 donors and 84 932 blood bags. The prevalence rates (x 100 000 donors), incidence (x 100 000 donors), and estimated residual risk (x 1 000 000 units of donated blood) in the quoted time period were: for the HBV 0,81; 0,17 and 0,20; for the HCV 0,55; 0,12 and 0,23, and for the HIV 1 and 2 0,005; 0,01x10-2 and 0,02x10-3 respectively, low rates according to the international classification, but not for Cuba with respect of the HBsAg.


Subject(s)
Humans , HIV Antibodies/blood , Hepatitis C Antibodies/blood , Hepatitis B Surface Antigens/blood , Blood Donors , Biomarkers/blood , Serologic Tests , Blood Banks , Epidemiology, Descriptive , Prospective Studies
2.
Infectio ; 14(1): 20-30, mar. 2010. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-560937

ABSTRACT

Introducción: La mayor parte del genoma celular es accesible a la integración retroviral; sin embargo, se propone que este proceso no es aleatorio y es dependiente de cada retrovirus. Objetivos: Identificar y caracterizar las regiones del genoma humano en donde ocurre la integración del virus de la inmunodeficiencia humana de tipo 1 (VIH-1) en células mononucleares de sangre periférica, macrófagos y células T de Jurkat infectadas. Materiales y métodos: Se seleccionaron 300 secuencias de ADN humano obtenidas por el método de ligación mediada por PCR, previamente depositadas en el GenBank. Utilizando el programa BLAST, sólo 264 de ellas se incluyeron en el estudio, pues se pudo obtener información sobre localización cromosómica, genes anotados, secuencias repetidas, número de islas CpG y tiempo medio de replicación, entre otras variables genómicas. Estas secuencias se exportaron a otras bases de datos. Resultados: El 53% (140/264) de las integraciones se registraron en bandas G. El 70,45% de los provirus se localizaron en los genes humanos anotados, mientras que el restante lo hizo en elementos repetidos. En general, la selección del sitio de integración se relacionó con las características locales genómicas y estructurales de la cromatina, entre las que se incluyen secuencias Alu-Sx y L1, densidad génica y de islas CpG, remodelación de la cromatina y tiempo de replicación. Éstas influenciarían la interacción eficiente del complejo de preintegración con los genomas celulares. Conclusión: Se determinó que la integración del VIH-1 en los genomas celulares estudiados estaría condicionada por características diferenciales de la cromatina y por procesos epigenéticos que influirían la selección del sitio blanco de integración.


Introduction: Most of the infected host cell genome is available for retroviral integration; however, it has been proposed that this process does not occur at random and depends upon each type of retrovirus. Objective: The objective is to identify and characterize differences in human genome regions of peripheral blood mononuclear cells, macrophages and Jurkat T cells in which integration of HIV-1 occurs. Material and Methods: Three hundred human DNA genome sequences, previously deposited in the GenBank, were selected at random. Using program BLAST, only 264 of them were included in the study because relevant information about chromosomal position, associated genes, repetitive sequences, number of CpG islands and average replication time was available; these sequences were exported to other data bases for analysis. Results: 53% (140/264) of integrations were located on G bands. 70.45% of provirus was located in human genes and the rest was located in repetitive elements. In general the integration site selection was correlated with genomics and structural characteristics of cell chromatin including Alu-Sx and L1 sequences, gene and CpG island densities, remodeling of chromatin, and replication time. All of them would influence the efficient interaction between the pre-integration complex and target cell genomes. Conclusion: It was determined that HIV-1 integration in target cellular genomes would be conditioned by differential characteristics of associated chromatin and by epigenetic processes that would influence the selection of integration sites.


Subject(s)
Acanthoma , Macrophage Activation , Genomics
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