Detection of avian metapneumovirus subtype A from wild birds in the State of São Paulo, Brazil / Detecção de metapneumovirus aviário subtipo A em aves silvestres no estado de São Paulo, Brasil

The present study investigated the circulation of avian metapneumovirus (aMPV) in wild birds in Brazil. To do so, 131 samples from 366 oropharyngeal or cloacal swabs collected from 18 species of birds were tested individually or in pools by RT-PCR. Samples detected by RT-PCR were selected for DNA sequencing. Thirteen (9.9%) samples were detected by the RT-PCR targeting the N gene and four out of 13 samples were sequenced. Sequencing results showed a high identity with the aMPV subtype A. Our results confirm the circulation of the aMPV subtype A in wild birds in Brazil even five years after its last detection.(AU)

O presente estudo investigou a circulação de metapneumovírus aviário em aves silvestres no Brasil. Para tanto, 131 amostras de 366 suabes orofaringeanos ou cloacais coletados de 18 espécies de aves foram testadas individualmente ou na forma de pools por RT-PCR. As amostras detectadas por RT-PCR foram selecionadas para sequenciamento. Treze (9,9%) das amostras foram detectadas por RT-PCR tendo o gene N como alvo; destas, quatro foram sequenciadas com sucesso. Resultados do sequenciamento mostraram alta identidade com o aMPV de subtipo A. Nossos resultados confirmam a circulação de aMPV subtipo A em aves silvestres no Brasil mesmo cinco anos após sua última detecção.(AU)

Detection of infectious bronchitis virus and Avian metapneumovirus by a duplex semi-nested reversetranscription–polymerase chain reaction assay / Detecção do vírus da bronquite infecciosa das galinhas e do metapneumovírus aviário utilizando uma reação de transcrição reversa com reação em cadeia pela polimerase duplex

Duplex RT-PCR assay is reported for the simultaneous detection of avian infectious bronchitis virus (IBV) and avian metapneumovirus (aMPV), the causative agents of major diseases in poultry. The duplex RT-PCR assay optimized showed a detection limit of 10-3 (101 EID50/50m L for IBV and 100.5 EID50/50m L for aMPV, respectively when two viruses were mixed and 10-1 for each one separated (103 EID50/50m L for IBV and 102.5 EID50/50m L for aMPV, respectively. It was specific, sensitive and applicable for the rapid detection of these viruses in clinical samples.

Descreve-se um ensaio de duplex RT-PCR assay para a detecção simultânea do vírus da bronquite infecciosa das galinhas (IBV) e do metapneumovirus aviário (aMPV), agentes etiológicos de doenças de elevada importância em avicultura. A duplex RT-PCR otimizada mostrou um limiar de detecção de 10-3 (101 EID50/50m L para IBV e 100.5 EID50/50m L para aMPV, respectivamente, quando da combinação dos dois vírus e 10-1 para cada um dos vírus em separado(103 EID50/50m L para IBV e 102.5 EID50/50m L para aMPV, respectivamente. O ensaio foi demonstrado como específico, sensível e aplicável à rápida detecção destes vírus em amostras clínicas.