Genetic diversity in oocyte donors used in in vitro bovine embryo production programs in Brazil / Diversidad genética en donadoras de ovocitos utilizadas en programas de producción de embriones bovinos in vitro en Brasil / Diversidade genética em doadoras de oócitos utilizadas em programas de produção de embriões bovinos in vitro no Brasil

Abstract Background: Current reproductive management of bovine elite populations involves the use of assisted reproductive technologies (ARTs), aiming to obtain the greatest genetic gain. However, inadequate use of ARTs may lead to loss of genetic diversity in the offspring. Objective: To assess the genetic diversity in elite female cattle populations used in commercial in vitro embryo production. Methods: Using genetic and ecological approaches for the study of populations based on microsatellite markers, we assessed the genetic diversity between and within populations of cows used in commercial in vitro embryo production programs in Brazil. Results: Endogamy within populations varied from zero to 9.1%, while heterozygosity between populations (FST) was <0.05 in the different population interactions. AMOVA showed 1% variation between populations, 8% between individuals and 91% within individuals. The dimensionality reduction method utilized indicated a lack of structure in the populations analyzed, identifying two main clusters in the three populations. Conclusions: Low genetic diversity between cow populations associated with commercial programs of in vitro embryo production in Brazil was evidenced. Variable levels of endogamy within the populations were observed. Approaches of population genetics as well as ecological diversity can be implemented to more thoroughly estimate genetic diversity in livestock populations.

Resumen Antecedentes: El actual manejo reproductivo en poblaciones de bovinos de élite incluye la utilización de tecnologías de reproducción asistida (ARTs) con el fin de obtener mayor ganancia genética. Sin embargo, el uso inadecuado de las ART puede llevar a la pérdida de diversidad genética en los descendientes. Objetivo: Evaluar la diversidad genética en poblaciones de vacas de élite utilizadas en la producción comercial de embriones bovinos in vitro. Métodos: Utilizando abordajes de la genética y ecología de poblaciones basados en marcadores microsatélites, evaluamos la diversidad genética entre y dentro de poblaciones de vacas participantes de programas comerciales de producción de embriones in vitro en Brasil. Resultados: La endogamia dentro de las poblaciones varió de cero a 9,1%, mientras que la heterocigosidad entre poblaciones (FST) fue <0,05 en las diferentes interacciones de la población. El AMOVA mostró variación del 1% entre poblaciones, 8% entre individuos y 91% dentro de individuos. El método de reducción de dimensionalidad utilizado indicó una falta de estructura en las poblaciones analizadas, identificando dos grupos principales en las tres poblaciones. Conclusiones: Se evidenció una baja diversidad genética entre las poblaciones de vacas asociadas a programas comerciales de producción de embriones in vitro en Brasil. Se evidenciaron niveles variables de endogamia entre las poblaciones. Abordajes de la genética poblacional, así como de diversidad ecológica pueden ser implementados para estimar de manera más amplia la diversidad genética en poblaciones animales de interés pecuario.

Resumo Antecedentes: O atual manejo reprodutivo das populações de elite em bovinos envolve o uso de tecnologias de reprodução assistida (ARTs), visando obter o maior ganho genético. No entanto, o uso inadequado de ARTs pode levar à perda de diversidade genética na prole. Objetivo: Avaliar a diversidade genética em populações de vacas de elite utilizadas na produção comercial de embriões bovinos in vitro. Métodos: Utilizando abordagens da genética e ecologia de populações baseadas em marcadores microssatélites, foi avaliada a diversidade genética entre e dentro das populações de vacas participantes de programas comercias de produção in vitro de embriões. Resultados: A endogamia dentro das populações variou de zero a 9,1%, enquanto a heterozigosidade entre populações (FST) foi <0,05 nas diferentes interações populacionais. AMOVA mostrou variação de 1% entre populações, 8% entre indivíduos e 91% dentro de indivíduos. O método de redução de dimensionalidade utilizado indicou uma falta de estrutura nas populações analisadas, identificando dois clusters principais nas três populações. Conclusões: Baixa diversidade genética entre populações de vacas associadas a programas de produção in vitro de embriões foi evidenciada. Níveis de endogamia variáveis dentro das populações foram observados. Abordagens da genética populacional assim como de diversidade ecológica podem ser implementadas na tentativa de estimar de maneira mais abrangente a diversidade genética em populações animais de interesse pecuário.

Primer reporte de la variabilidad genética del gato (Felis catus), con marcadores fenotípicos en Coveñas, Sucre / First report of genetic variability in cats (Felis catus), with phenotypic markers, in Coveñas, Sucre / Primeiro repórter da variabilidade genética do gato (Felis catus), com marcadores fenotípicos em Coveñas, Sucre

Resumen El objetivo de esta investigación fue determinar la variabilidad genética de las poblaciones de gatos domésticos (Felis catus) utilizando genes que codifican la coloración, el diseño y la longitud del pelaje en Coveñas, Sucre, Colombia. Se realizaron muestreos aleatorios entre septiembre y diciembre de 2014, en 187 animales adultos presentes en cinco barrios de Coveñas, donde se caracterizó fenotípicamente cada animal. La nomenclatura utilizada está en concordancia con el Committee Standardized Genetic Nomenclature For Cats (1968), y atiende a los marcadores autosómicos de codificación morfológica: el locus ligado al sexo Orange (O) y los loci autosómicos non-agouti (a), tabby blotched (Tb), dilution (d), long hair (l) spotting white (s) y dominant white (W). Se calcularon los parámetros genéticos poblacionales: frecuencia alélica, diversidad genética, flujo génico, equilibrio Hardy-Weinberg y distancia genética, y se infirieron las relaciones filogenéticas entre las poblaciones de gatos. Se encontró que el marcador non-agouti fue el de mayor frecuencia, mientras los genes tabby blotched y dominant white presentaron los valores más bajos. La mayor parte de la diversidad genética se encontró dentro de las poblaciones (HS) y poca entre las poblaciones (D) y un elevado flujo génico. Se observó un exceso de heterocigotos en la población. No hubo equilibrio Hardy-Weinberg. Las poblaciones se encuentran muy relacionadas genéticamente. Además, se evidenció una posible selección natural y artificial del locus non-agouti.

Abstract This research aimed to determine genetic variability in domestic cat populations (Felis catus) using genes that codify the coloration, design and length of the coat in Coveñas, Sucre, Colombia. Random samples were collected between September and December 2014 from 187 adult animals in five neighborhoods of Coveñas, and each animal was characterized phenotypically. The nomenclature used in this research follows the Standardized Genetic Nomenclature for the Domestic Cat (1968), and examines the autosomal markers of morphological coding: the locus linked to sex Orange (O) and the autosomal loci Non-agouti (a), tabby blotched (Tb), dilution (d), long hair (l) spotting white (s) and dominant white (W). The genetic parameters of the population were calculated: allele frequency, genetic diversity, gene flow, Hardy-Weinberg equilibrium, and genetic distance; and phylogenetic relationships among cat populations were inferred. It was found that the Non-agouti marker was the most frequent, while the tabby blotched and dominant white genes had the lowest values. Most genetic diversity was found within the studied populations (HS), with little diversity between populations (D), and high gene flow was evidenced. An excess of heterozygotes was observed in the population. There was no Hardy-Weinberg equilibrium. Populations are genetically closely related. In addition, a possible natural and artificial selection of the Non-agouti locus was evidenced.

Resumo O objetivo desta pesquisa foi determinar a variabilidade genética das populações de gatos domésticos (Felis catus) utilizando genes que codificam a coloração, o desenho e a longitude da pelagem em Coveñas, Sucre, na Colômbia. Realizaram-se amostras aleatórias entre setembro e dezembro de 2014, em 187 animais adultos presentes em cinco bairros de Coveñas, onde se caracterizou fenotipicamente cada animal. A nomenclatura utilizada está em concordância com o Committee Standardized Genetic Nomenclature For Cats (1968), e atende a os marcadores autossômicos de codificação morfológica: o locus ligado a sexo Orange (O) e os loci autossômicos Non-agouti (a), tabby blotched (Tb), dilution (d), long hair (l) spotting white (s) e dominant white (W). Calcularam-se os parâmetros genéticos populacionais: frequência alélica, diversidade genética, fluxo génico, equilíbrio Hardy-Weinberg e distância genética, e se inferiram as relações filogenéticas entre as populações de gatos. Constatou-se que o marcador Non-agouti foi o de maior frequência, e enquanto que os genes tabby blotched e dominant white apresentaram os valores mais baixos. A maior parte da diversidade genética foi encontrada dentro das populações (HS) e pouca entre as populações (D) e um elevado fluxo génico. Observouse um excesso de heterozigotos na população. Não houve equilíbrio Hardy-Weinberg. As populações encontram-se muito relacionadas geneticamente. Além do mais, evidenciou-se uma possível seleção natural e artificial do locus Non-agouti.

Diversidad genética de palomas domésticas (Columba livia) en Ciénaga de Oro (Colombia), utilizando genes del plumaje / Genetic diversity of domestic pigeons (Columba livia) in Ciénaga de Oro, Colombia, using plumage genes / Diversidade genética de pombos domésticos (Columba livia) em Ciénaga de Oro (Colômbia), utilizando genes da plumagem

Resumen El objetivo de este trabajo fue evaluar la diversidad genética de las poblaciones de palomas domésticas (Columba livia) por medio del uso de genes que codifican la coloración y diseño del plumaje, en Ciénaga de Oro (Córdoba, Colombia). Se realizaron muestreos aleatorios en cinco colonias de Ciénaga de Oro, en el periodo comprendido entre junio y agosto de 2015. Mediante excursiones urbanas, observación directa y registros fotográficos, se estudiaron 325 palomas. Se utilizaron los marcadores autosómicos que codifican la coloración y diseño del plumaje: Grizzle (G), Spread (S), Checker (C) y el locus ligado al sexo Ash-Red (B). Los parámetros genéticos -frecuencia alélica, diversidad genética, equilibrio Hardy-Weinberg y estructura poblacional- fueron calculados con el programa PopGene 1.31. La estructura genética y la distancia genética se evaluaron mediante el programa FSTAT v. 2.9.3.2. La elaboración del dendrograma se realizó con el programa MEGA 5.2. El marcador de mayor frecuencia alélica fue Spread, mientras que el marcador Ash-Red presentó los valores más bajos. Se obtuvo escasa diferenciación genética entre las poblaciones y un elevado flujo génico. Se observó un exceso de heterocigotos; a esto se le suma la ausencia de equilibrio Hardy-Weinberg. Se evidenció posible selección natural para el marcador Spread.

Abstract This study aimed to evaluate the genetic diversity of domestic pigeon populations (Columba livia), using genes that are responsible for encoding plumage color and design, in Ciénaga de Oro (Córdoba, Colombia). Random samplings were performed in 5 colonies of Ciénaga de Oro from June to August 2015. By means of urban excursions, direct observation and photographic records, 325 pigeons were studied. Autosomal markers encoding plumage color and design were used: Grizzle (G), Spread (S), Checker (C), and the sex-linked Ash-Red locus (B). Genetic parameters-allele frequency, genetic diversity, Hardy-Weinberg equilibrium, and population structure-were calculated using the PopGene 1.31 program. Genetic structure and genetic distance were evaluated using the FSTAT v. 2.9.3.2 program. A dendrogram was elaborated using the MEGA 5.2 program. The marker with the highest allele frequency was Spread, while the Ash-Red marker showed the lowest values. Little genetic differentiation between populations and high gene flow were obtained. An excess of heterozygotes was observed, in addition to the absence of Hardy-Weinberg equilibrium. A possible natural selection for the Spread marker was evidenced.

Resumo O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética das populações de pombos domésticos (Columba livia) por meio do uso de genes que codificam a coloração e desenho da plumagem, em Ciénaga de Oro (Córdoba, Colômbia). Se realizaram amostragens aleatórias em 5 colônias de Ciénaga de Oro, no periodo compreendido entre junho e agosto de 2015. Mediante excursões urbanas, observação direta e registros fotográficos, se estudaram 325 pombos. Se utilizaram os marcadores autossômicos que codificam a coloração e desenho da plumagem: Grizzle (G), Spread (S), Checker (C) e o locus ligado ao sexo Ash-Red (B). Os parâmetros genéticos - frequência alélica, diversidade gené tica, equilíbrio Hardy-Weinberg e estrutura populacional - foram calculados com o programa PopGene 1.31. A estrutura genética e a distância genética foram avaliadas mediante o programa FSTAT v. 2.9.3.2. A elaboração do dendrograma se realizou com o programa MEGA 5.2. O marcador de maior frequência alélica foi Spread, em quanto que o marcador Ash-Red apresentou os valores mais baixos. Obteve-se escassa diferenciação genética entre as populações e um elevado fluxo génico. Pôde-se observar um excesso de heterozigotos; a isto soma-se a ausência de equilíbrio Hardy-Weinberg. Constatou-se possível seleção natural para o marcador Spread.

Genetic variability and evidence of founder effect in Hemiodus orthonops (Characiformes: Hemiodontidae) from the upper Paraná River basin, Brazil / Variabilidade genética e evidência do efeito do fundador em Hemiodus orthonops (Characiformes: Hemiodontidae) da bacia do alto rio Paraná, Brasil

Hemiodus orthonops is a small fish of the Hemiodontidae family, order Characiformes, with a maximum of 25 cm standard length. Until recently, H. orthonops was an endemic species from the Paraná-Paraguay basin and it was absent from the upper Paraná River basin. Since 2008, it has started to be collected in the upper Paraná River, representing up to 10% of catches. Two population samples of H. orthonops from two localities of the upper Parana River basin (Porto Camargo and Porto Figueira) were analyzed using the allozymes electrophoresis technique. Twenty-one enzymatic loci were detected. The population sample from Porto Camargo displayed a genetic variability (He = 0.1061) higher than that from Porto Figueira (He = 0.0580) and homozygote excess in both of them. The FST value (0.2081) indicated genetic structure. The excess of homozygotes in both samples was probably due to founder effect in the population.

Hemiodus orthonops é um pequeno peixe da família Hemiodontidade da Ordem Characiformes com um comprimento padrão máximo de 25 cm. Até recentemente, H. orthonops estava ausente da bacia do alto rio Paraná. Desde 2008 ele passou a ser coletado na bacia do alto rio Paraná, representando até 10% das coletas. Duas amostras populacionais de H. orthonops provenientes de duas localidades da bacia do alto rio Paraná (Porto Camargo e Porto Figueira) foram analisadas pela técnica de eletroforese de aloenzimas. Vinte um loci enzimáticos foram detectados. A amostra proveniente de Porto Camargo revelou uma variabilidade genética (He = 0,1017) superior à amostra de Porto Figueira (He = 0,0558) e excesso de homozigotos em ambas as amostras. O valor de F ST entre elas (0,2081) indica que há estruturação genética. O excesso de homozigotos nas duas amostras é provavelmente devido ao efeito do fundador.

Molecular biology techniques for loss of heterozygosity detection: the glioma example / Técnicas de biologia molecular para avaliação da perda de heterozigosidade: o exemplo em glioma

ABSTRACT In recent years, many oncology institutions have implemented the use of molecular approaches to assess and manage cancer patients. One commonly observed type of genetic alteration in cancer is the loss of heterozygosity (LOH). In the clinical setting, this molecular genetic marker is an important tool for disease prognosis, diagnosis and treatment. For example, the loss of 1p/19q is a classical molecular marker for oligodendroglioma assessment. In addition, this marker is associated with a favorable prognosis and chemosensitivity in oligodendroglial tumors. Interpretation of the clinical significance of molecular markers requires that health professionals and biomedical scientists understand the basic theoretical fundamentals of molecular diagnostic techniques. Although there are different methodologies to assess LOH, including high-performance techniques, this review aims to describe the polymerase chain reaction (PCR)-based LOH assays and fluorescence in situ hybridization (FISH), which are the molecular techniques most used for evaluation of 1p/19q status in pathology laboratories.

RESUMO Nos últimos anos, instituições de oncologia têm implementado o uso de abordagens moleculares para avaliar e conduzir pacientes com câncer. O tipo mais comum de alteração encontrada no câncer é a perda de heterozigosidade (LOH). Na clínica, esse marcador molecular pode ter importância para o prognóstico, o diagnóstico e/ou na decisão do tratamento. Por exemplo, a perda de 1p/19q é um marcador molecular clássico para a avaliação do oligodendroglioma. Além disso, esse marcador está associado ao prognóstico favorável e à quimiossensibilidade em tumores oligodendrogliais. A interpretação do significado clínico dos marcadores moleculares exige que os profissionais da área da saúde entendam os fundamentos básicos teóricos das técnicas de diagnóstico molecular. Embora existam diferentes metodologias para avaliar a LOH, inclusive técnicas de alta performance, esta revisão tem o objetivo de descrever o ensaio de LOH com base na reação da cadeia da polimerase (PCR) e a hibridização in situ fluorescente (FISH), que são as técnicas moleculares mais usadas para avaliação do status 1p/19q em laboratórios de patologia.

Enzyme Polymorphism in Sitophilus oryzae (Linnaeus, 1763) and Sitophilus zeamais (Motschulsky, 1855) (Coleoptera, Curculionidae) in southern Brazil / Polimorfismo Enzimático em Sitophilus oryzae (Linnaeus, 1763) e Sitophilus zeamais (Motschulsky, 1855) (Coleoptera, Curculionidae) no sul do Brasil

Beetles of the species Sitophilus oryzae and S. zeamais are pests of great economic importance since they attack not only rice and maize but also several other cereals. In fact, these beetles are one of the most visible threats to sustainable food production. Current study estimated the genetic variability of S. oryzae in two samples, one from the State of Paraná (PR), Brazil, and another from the state of Rio Grande do Sul (RS), Brazil, and a sample of S. zeamais from the State of Santa Catarina (SC), Brazil. Isozyme electrophoresis in starch gel technique was employed to analyze eight enzyme systems (AAT, ACP, GDH, GPI, IDH, MDH, PGM and ME). Average heterozygosity rates were 0.0091, 0.0100 and 0.0000 and expected heterozygosity rates were 0.0419, 0.0452 and 0.0000 respectively for the samples of PR, SC and RS samples. The percentage of polymorphic loci was 30% in the PR sample, 0% in the RS sample and 30% in the SC sample. Genetic identity rates were I=0.9983 between samples from PR and RS; I = 0.6892 between PR and SC, and I = 0.6925 between SC and RS. Nei´s (1978) genetic distance rates were 0.0017, 0.3722 and 0.3675. Samples presented low genetic variability.

Os besouros Sitophilus oryzae e S. zeamais são considerados pragas de grande importância econômica. Além do arroz e do milho, eles atacam outros diversos cereais. São uma das ameaças mais visíveis para a produção sustentável de alimentos. Este trabalho teve como objetivo estimar a variabilidade genética de S. oryzae em duas amostras, uma do Estado do Paraná (PR), e outra do Rio Grande do Sul (RS) e uma amostra de S. zeamais de Santa Catarina (SC). Utilizou-se a técnica de eletroforese de isozimas em gel de amido para a análise de oito sistemas enzimáticos (AAT, ACP, GDH, GPI, IDH, MDH, ME e PGM). A heterozigosidade média observada foi de 0,0091, 0,0100 e 0,0000 e a esperada foi de 0,0419, 0,0452 e 0,0000 para as amostras do PR, SC e RS, respectivamente. A porcentagem de locos polimórficos foi de 30, 0 e 30% nas amostras do PR, RS e SC, respectivamente. Os valores para identidade genética foram de I = 0,9983 entre as amostras do PR e RS; I = 0,6892 entre PR e SC e I = 0,6925 entre SC e RS, e os valores da distância genética de Nei (1978) foram 0,0017, 0,3722 e 0,3675, respectivamente. As amostras apresentaram pouca variabilidade genética.

Allozyme analysis of the four species of Hypostomus (Teleostei: Loricariidae) from the Ivaí river, upper Paraná river basin, Brazil / Análise aloenzimática de quatro espécies de Hypostomus (Teleostei: Loricariidae) do rio Ivaí, bacia do alto rio Paraná, Brasil

Allozyme electrophoresis analysis were performed in four species of Hypostomus (Loricariidae), H. albopunctatus, H. hermanni, H. regani, and Hypostomus sp. 1/NUP 5612 from the Ivaí river, a tributary of the upper Paraná river. The study of 14 loci revealed diagnostic characters and exclusive alleles in a low frequency. The heterozygosity ranged from 0.000 in H. albopunctatus to 0.199 in H. hermanni, which was higher than the heterozygosity in other samples of Hypostomus in literature, as well as in other fish groups. Hypostomus albopunctatus and H. regani revealed higher similarity (I = 0.804), while H. hermanni and Hypostomus sp. 1/NUP 5612 showed the least genetic identity (I = 0.569). All samples were genetically distinguished, despite there were several shared alleles. The FST value was 0.671, showing a high genetic differentiation among the samples. Hypostomus sp. 1/NUP 5612 was genetically distinguished from the three congeners by the loci Adh-A and G3pdh-B and by present rare exclusive alleles in other six enzymatic systems.

Análises aloenzimáticas foram realizadas em quatro espécies de Hypostomus (Loricariidae), H. albopunctatus, H. hermanni, H. regani e Hypostomus sp. 1/NUP 5612 coletadas no rio Ivaí, um tributário da bacia do alto rio Paraná, através da técnica de eletroforese. O estudo de 14 loci gênicos revelou alelos diagnósticos e alelos exclusivos com uma baixa frequência. A heterozigosidade variou de 0,000 em H. albopunctatus a 0,199 em H. hermanni, a qual foi maior que a média para outras espécies de Hypostomus, como também para outros grupos de peixes já estudadas. Hypostomus albopunctatus e H. regani revelaram maior similaridade (I = 0,804), enquanto que H. hermanni e Hypostomus sp. 1/NUP 5612 mostraram a menor identidade genética (I = 0,569). Todas as populações foram geneticamente distintas apesar de apresentarem muitos alelos em comum. O teste de FST resultou em um valor de 0,671, indicando uma diferenciação significativa entre as populações. Hypostomus sp. 1/NUP 5612 foi geneticamente diferenciada das três congêneres pelos loci Adh-A e G3pdh-B e por apresentar alelos raros exclusivos em outros seis sistemas enzimáticos.

Cutaneous mosaicisms: concepts, patterns and classifications / Mosaicismos cutaneos: conceitos, padroes e classificacoes

A mosaic is an organism composed of two or more genetically distinct cell populations derived from a genetically homogeneous zygote. Cutaneous mosaicisms are the clinical expressions of these disorders. The main event which allows the existence of mosaicism is a genetic mutation, either structural or functional. Cutaneous mosaicisms usually manifest by specific patterns on the skin and the archetypic pattern is the system of Blaschko lines, but others include checkerboard, phylloid, large patches without midline separation and lateralization. Since 1901, when Blaschko lines were first described, the study of mosasicism has helped to elucidate the behavior of numerous genetic diseases, generating therapeutic perspectives for these pathologies, including the promising gene therapy.

Um mosaico é um organismo formado por duas ou mais populações de células geneticamente distintas originadas a partir de um mesmo zigoto geneticamente homogêneo. Os mosaicismos são as expressões clínicas dessa desordem, e a mutação gênica seu evento determinante, que pode ser tanto estrutural quanto funcional. Os mosaicismos cutâneos costumam se expressar em padrões específicos, dentre os quais podem ser mencionados as prevalentes linhas de Blaschko, o padrão "checkerboard", o padrão filóide, o padrão em placa sem separação na linha média e o padrão de lateralização, que serão abordados neste artigo. Desde 1901, momento da primeira descrição das linhas de Blaschko, o estudo dos mosaicismos tem contribuído para a elucidação do comportamento de numerosas desordens genéticas, de forma a criar perspectivas terapêuticas para essas doenças, incluindo a promissora terapia gênica.

Genetic variability in Oligosarcus paranensis (Teleostei: Characiformes) from the São Francisco river, Ivaí river basin ­ Paraná State, Brazil / Variabilidade Genética em Oligosarcus paranensis do rio São Francisco, Bacia do rio Ivaí ­ Estado do Paraná, Brasil

The genetic variability of Oligosarcus paranensis was estimated from a population collected in São Francisco river, Prudentópolis county in Paraná State (Brazil) using the electrophoresis in starch gel technique. Eleven enzymatic systems were analyzed: Aspartate aminotransaminase (AAT; E. C. 2.6.1), Alcohol dehydrogenase (ADH; E. C. 1.1.1.1), Esterase (EST; E. C. 3.1.1.1), Glucose-6-phosphate isomerase (GPI; E. C. 5.3.1.9), Glycerol-3-Phosphate dehydrogenase (G3PDH; E. C. 1.1.1), Isocitrate dehydrogenase (IDH; E. C. 1.1.1.42), L-lactate dehydrogenase (LDH; E. C. 1.1.1.27), Malate dehydrogenase (MDH; E. C. 1.1.1.37 ), Malate dehydrogenase NADP (ME; E. C. 1.1.1.40), Phosphoglucomutase (PGM; E. C. 5.4.2.2) and Sorbitol dehydrogenase (SORB; E.C. 1.1.1.14). Twenty loci were identified through 15% corn starch gel electrophoresis of which nine (45%) were polymorphic. The average expected heterozygosity was estimated as 0.1229 ± 0.1728, and the observed was 0.0586 ± 0.1069, indicating high genetic variability. The average value of FIS = 0.5145 indicates homozygote excess.

A variabilidade genética de Oligosarcus paranensis foi estimada a partir de uma população coletada no rio São Francisco, município de Prudentópolis no Estado do Paraná (Brasil) utilizando a técnica de eletroforese em gel de amido. Onze sistemas enzimáticos foram analisados: Aspartato aminotransaminase (AAT; E.C. 2.6.1.1), Álcool desidrogenase (ADH; E.C. 1.1.1.1), Esterase (EST; E.C. 3.1.1.1), Glicose-6-fosfato isomerase (GPI; E.C. 5.3.1.9), Glicerol-3-fosfato desidrogenase (G3PDH; E.C. 1.1.1.8), Isocitrato desidrogenase (IDH; E.C. 1.1.1.42), L-Lactato desidrogenase (LDH; E.C. 1.1.1.27), Malato desidrogenase (MDH; E.C. 1.1.1.37), Malato desidrogenase NADP+ (ME; E.C. 1.1.1.40), Fosfoglicomutase (PGM; E.C. 5.4.2.2) e Sorbitol desidrogenase (SORB; E.C. 1.1.1.14). Foram identificados vinte loci por eletroforese em gel de amido de milho 15% dos quais nove (45%) foram polimórficos. A heterozigosidade média esperada foi estimada em 0,1229 ± 0,1728, e a observada foi de 0,0586 ± 0,1069, indicando uma alta variabilidade genética. O valor médio de FIS = 0,5145 indica excesso de homozigotos.

Pérdida de heterocigocidad e identificación de portadoras de distrofia muscular de Duchenne: un caso familiar con evento de recombinación / Loss of heterozygosity and carrier identification in Duchenne muscular dystrophy: a familiar case with recombination event / Perda de heterozigosidade e identificação de portadoras de distrofia muscular de Duchenne: um caso familiar com evento de recombinação

La distrofia muscular de Duchenne y Becker (DMD/DMB) es una entidad de herencia recesiva ligada al cromosoma X que se presenta con debilidad muscular y es causada por mutaciones en el gen de la distrofina. La pérdida de heterocigocidad permite identificar a las mujeres portadoras de deleción en el gen de la distrofina mediante haplotipos. Objetivo: identificar mujeres portadoras en una familia con un paciente afectado por DMD mediante análisis de pérdida de heterocigocidad. Materiales y métodos: se analizaron nueve miembros de una familia con un afectado de DMD. Se hizo extracción de ADN y amplificación de diez STR del gen de la distrofina; se construyeron haplotipos, y se determinó el estado de portadora de deleción en dos de las seis mujeres analizadas, quienes mostraron pérdida de heterocigocidad de tres STR. Se establecieron algunos eventos de recombinación. Resultados: dos de las seis mujeres analizadas, mostraron pérdida de heterocigocidad en tres de los diez STR genotipificados, indicando su estado de portadora de deleción en este fragmento del gen de la distrofina. Con la segregación familiar de los haplotipos se establecieron eventos de recombinación. Conclusiones: mediante pérdida de heterocigocidad es posible establecer el estado de portadora de deleción en el gen de la distrofina con un 100% de certeza. La construcción de haplotipos identifica el cromosoma X portador de la deleción en familiares del caso índice. Se evidenció un evento de recombinación en una de las hermanas del afectado, lo que hace indeterminado su estado de portadora.

Duchenne/Becker Muscular Dystrophy (DMD/BMD) is an X-linked recessive disease characterized by muscular weakness. It is caused by mutations on the dystrophin gen. Loss of heterozygosity allows us to identify female carriers of deletions on the dystrophin gen. Objective: identify female carriers in a family with a patient affected by DMD. Material and methods: nine family members and the affected child were analyzed using DNA extraction and posterior amplification of ten STRs on the dystrophin gen. Haplotypes were constructed and the carrier status determined in two of the six women analyzed due to loss of heterozygosity in three STRs. Additionally, we observed a recombination event. Conclusions: loss of heterozygosity allows us to establish with a certainty of 100% the carrier status of females with deletions on the dystrophin gen. By the construction of haplotypes we were able to identify the X chromosome with the deletion in two of the six women analyzed. We also determined a recombination event in one of the sisters of the affected child. These are described with a high frequency (12%). A possible origin for the mutation is a gonadal mosaicism in the maternal grandfather or in the mother of the affected child in a very early stage in embryogensis. This can be concluded using the analysis of haplotypes.

A distrofia muscular de Duchenne e Becker (DMD/DMB) é uma entidade de herança recessiva ligada ao cromossoma X que se apresenta com debilidade muscular e é causada por mutações no gene da distrofia. A perda de heterozigosidade permite identificar às mulheres portadoras de deleção no gene da distrofina mediante haplótipos. Objetivo: identificar mulheres portadoras em uma família com um paciente afetado de DMD mediante análises de perda de heterozigosidade. Materiais e métodos: se analisaram nove membros de uma família com um afetado de DMD. De fez extração de ADN e amplificação de dez STR do gene da distrofina; construíram-se haplótipos, e determinou-se o estado de portadora de deleção em duas das seis mulheres analisadas, as quais mostraram perda de heterozigosidade de três STR. Estabeleceram-se alguns eventos de recombinação. Resultados: duas das seis mulheres analisadas mostraram perda de heterozigosidade em três dos dez STR genotipados, indicando seu estado de portadora de deleção neste fragmento do gene da distrofina. Com a segregação familiar dos haplótipos se estabeleceram eventos de recombinação. Conclusões: mediante perda de heterozigosidade é possível estabelecer o estado de portadora de deleção no gene da distrofina com um 100% de certeza. A construção de haplótipos identifica o cromossoma X portador da deleção em familiares do caso índice. Evidenciou-se um evento de recombinação em uma das irmãs do afetado, o que faz indeterminado seu estado de portadora.

Molecular characterization of breast cancer in young Brazilian women / Caracterização molecular do câncer de mama e mulheres brasileiras jovens

OBJECTIVE: To evaluate the distribution of molecular subtypes of breast tumors diagnosed in young Brazilian women and to analyze the frequency of loss of heterozygocity (LOH) in BRCA1 among different molecular subtypes of early-onset breast cancer. METHODS: Samples from 72 cases of invasive breast carcinoma diagnosed in women aged between 19 and 40 years were evaluated using an immunohistochemical panel of biomarkers. Three intragenic BRCA1 locus microsatellites, D17S1322, D17S1323, and D17S855, were PCR amplified from matched normal (lymphocyte) and tumor DNAs for (LOH) analysis. RESULTS: We found 13 cases (18 percent) that had an immunohistochemical profile consistent with being basal-like. Forty cases (55 percent) were luminal A type; 11 percent (8 cases) were luminal B type, 13 percent (9 cases) were HER2-overexpressing tumors and two cases were ER-/HER2- carcinomas lacking basal marker expression. Four of the 16 informative cases at D17S1322, one of the four informative cases at D17S855, and none of the five informative cases at D17S1323 displayed LOH (four basal-like and one Luminal A). Microsatellite instability (MSI) at D17S855 and D17S1322 was found in two cases (one a basal-like and one Luminal A). CONCLUSION: In our study, basal-like tumor was the second most frequent molecular type among young Brazilian women and was only observed in women diagnosed under the age of 35 years. There was no significant difference of LOH at BRCA1 locus rates between basal-like breast tumors and not-basal-like breast tumors (p=0.62). LOH in BRCA1 and MSI in these breast cancers were not frequent but may indicate a small group of breast cancers with a specific molecular makeup.

OBJETIVO: Avaliar a distribuição dos subtipos moleculares dos tumores de mama diagnosticados em mulheres brasileiras jovens e determinar a frequência de perda de heterozigose (LOH) no gene BRCA1 entre os diferentes subtipos moleculares de tumores. MÉTODOS: Setenta e dois casos de carcinoma invasivo de mama diagnosticados em mulheres entre 19 e 40 anos de idade foram classificados de acordo com o subtipo molecular utilizando um painel imunoistoquímico e para a análise de LOH foram utilizados três marcadores intragênicos para o gene BRCA1 (D17S1322, D17S855, D17S1323). RESULTADOS: Treze casos (18 por cento) apresentaram perfil imunoistoquímico compatível com carcinoma do tipo basal (basal-like tumor). Quarenta casos (55 por cento) foram classificados como tumores do tipo luminal A; 11 por cento (oito casos) do tipo luminal B, 13 por cento (nove casos) corresponderam a tumores com superexpressão de HER2 (HER2-overexpressing tumors) e dois casos corresponderam a carcinomas ER/HER2 negativos sem expressão de marcadores basais. LOH foi detectada em quatro dos 16 casos informativos para o marcador D17S1322 e em um dos quatro casos informativos para D17S855. Instabilidade de microssatélites (MSI) foi observada em dois casos, um do tipo basalóide e um do tipo luminal A. CONCLUSÃO: Carcinomas do tipo "basal-like" corresponderam ao segundo subtipo molecular mais frequente entre os tumores de mama diagnosticados neste grupo de mulheres e foram restritos às mulheres com idade inferior a 35 anos. Não houve diferença significativa na frequência de LOH no gene BRCA1 entre os subtipos moleculares (p= 0,62). A frequência de LOH e de instabilidade de microssatélite em BRCA1 foi baixa neste grupo de pacientes, porém podem indicar um pequeno grupo de cânceres de mama com características moleculares específicas distintas.

Análise do gene AIP na acromegalia familial isolada / Analysis of the AIP gene in familial isolated acromegaly

A acromegalia é doença insidiosa e desfigurante caracterizada por um crescimento desproporcional dos ossos das mãos, pés e do crânio devido à exposição crônica a altos níveis de hormônio de crescimento (GH) e de seu efetor insuline growth factor 1 (IGF-1). Trata-se de uma doença rara, com incidência estimada de 3-4 casos por milhão, com prevalência de aproximadamente 50 casos por milhão de pessoas. A principal causa da acromegalia é a presença de um tumor hipofisário secretor de GH (somatotropinoma). Caso o somatotropinoma ocorra durante a infância ou adolescência, antes do fechamento das epífises dos ossos longos, a criança crescerá longitudinalmente de forma descontrolada, caracterizando a forma clínica gigantismo. Na grande maioria dos casos a acromegalia se apresenta na forma esporádica, entretanto casos familiais da doença podem ocorrer associados à Neoplasia Endócrina Múltipla tipo 1 (NEM-1), ao complexo de Carney (CNC) e à acromegalia familial isolada (IFS). Os genes responsáveis pela NEM-1 (MEN1) e CNC (PRKAR1A) foram clonados há mais 10 anos, entretanto etiologia molecular da IFS permaneceu desconhecida até recentemente. Vierimaa et al. (2006) combinaram estudos de ligação por análise de polimorfismos e estudos de expressão gênica e identificaram mutações no gene AIP em famílias com acromegalia não-NEM-1 e não-CNC; além de perda de heterozigose (LOH) nos somatotropinomas dos pacientes com mutação AIP. No presente estudo, investigamos o gene AIP em três famílias brasileiras com IFS e em seus tumores (hipofisários e não-hipofisários). Descrevemos uma nova mutação AIP (Y268X) em uma família brasileira com IFS, confirmando o papel desse novo gene na predisposição a tumores hipofisários. A partir de dados gerados em uma extensa revisão da literatura, sugerimos que os tumores hipofisários familiais isolados são doenças multigênicas que possuiriam um gene principal, mas que sofreriam influência de outros genes/loci ainda pouco caracterizados...

Acromegaly is a rare disfigurating and insidious disease characterized by enlargement of hands, feet and skull bones due to excess of growth hormone (GH) secreted by a pituitary tumor (somatotropinoma). The majority of the cases with acromegaly is sporadic, however it may occur in association with inherited disorders as Multiple Endocrine Neoplasia type 1 (MEN1), Carney complex (CNC) and Isolated Familial Somatotropinoma (IFS). The genes associated with MEN1 syndrome (MEN1) and CNC (PRKAR1A) have been described more than a decade ago, however until very recently the molecular etiology of IFS remained unknown. Using a combined strategy of single nucleotide polymorphism (SNP) analysis and gene expression analysis, Vierimaa et al. (2006) described mutations in the AIP gene occurring in families with acromegaly not associated with MEN1 and CNC. In the current study, we investigated three Brazilian families with IFS and were able to describe two germline mutations in the AIP gene, confirming the role of this new gene in the predisposition to familial somatotropinoma. We revised the literature of genetic studies of isolated pituitary adenoma syndromes, which indicated a genetic heterogeneity as well as possible multigenic inheritance for these diseases. Thus, we investigated the role of several genes/loci (SSTR2, SSTR5, CDKN1B, AHR, PRKAR1A, PTTG, PROP1, MEG3, RB1 and 2p16) selected as potentially acting as phenotypic modulators in IFS. Our data indicate that AIP-mutated patients are prone to pituitary disease, however it is necessary the co-segregation of markers located at oncogenic regions to the development of the pituitary tumors and manifestation of the disease. Herein, we also present the first somatic analysis of non-pituitary tumors of AIP-mutated patients. A potential role of AIP, which is implicated in the cAMP pathway, could not be excluded in the development of an adrenocortical carcinoma.

Genetic variability of native populations of Wasmannia Forel (Hymenoptera: Formicidae) and their biogeographical implications / Variabilidade genética de populações nativas de espécies de Wasmannia Forel (Hymenoptera: Formicidae) e suas implicações biogeográficas

Wasmannia auropunctata (Roger) and Wasmannia rochai Forel are economically important ants in the Southeast and Southwest regions of Bahia State, Brazil. Randomly Amplified Polymorphic DNA (RAPD) markers were used to distinguish and analyze the genetic variability of populations of both species from Ilhéus, Jequié, BA and French Guyana. The genetic distances among W. auropunctata and W.rochai populations (55.8-71.4 percent) suggest genetic differentiation among them. Wasmannia auropunctata populations from sugarcane and banana plantations in Jequié were the most distant genetically (30.1-46.3 percent) and may represent populations restricted to isolated fragments. The high genetic distances among W. auropunctata populations from CEPLAC experimental areas, in Ilhéus (26.8-34.6 percent) and the other populations from Ilhéus (23.3-40.8 percent), suggest a multicolonial structure of W. auropunctata in southeast Bahia. The genetic proximity among the W. auropunctata populations from cocoa (14.1 percent) and coconut plantations (18.5 percent) in Ilhéus with the populations from the French Guyanan forests suggest that there was recent and large expansion of populations derived from a single population, that are today distributed in habitats with similar environmental characteristics. The high polymorphism and the estimated heterozygosity values for the two species suggest that we studied native W. auropunctata and W.rochai populations.

Wasmannia auropunctata (Roger) e Wasmannia rochai Forel são duas formigas economicamente importantes no Sudeste e Sudoeste da Bahia. Marcadores de RAPD (polimorfismo de DNA amplificado ao acaso) foram utilizados para distinguir e analisar a variabilidade genética de populações de ambas as espécies, provenientes de Ilhéus e Jequié, BA, e da Guiana Francesa. As distâncias genéticas entre populações de W. auropunctata e W.rochai (55,8-71,4 por cento) evidenciam a diferenciação genética entre elas. As populações de W. auropunctata presentes em canaviais e bananais de Jequié mostraram-se geneticamente mais distantes (30,1-46,3 por cento), podendo representar populações restritas a fragmentos isolados. As elevadas distâncias genéticas entre as populações de W. auropunctata das áreas experimentais da CEPLAC, em Ilhéus (26,8-34,6 por cento), assim como as demais populações de Ilhéus (23,3-40,8 por cento), sugerem uma estrutura multicolonial de W. auropunctata no Sudeste da Bahia. A proximidade genética entre as populações de W. auropunctata dos cacauais (14,1 por cento) e coqueirais de Ilhéus (18,5 por cento) com as populações de floresta da Guiana Francesa sugere que houve expansão grande e recente de populações oriundas de uma única população a partir de um centro não-determinado, estando hoje distribuídas em habitats com características ambientais semelhantes. O elevado polimorfismo e os valores das heterozigosidades estimadas para as duas espécies sugerem que foram analisadas populações nativas de ambas as espécies.