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1.
Braz. j. biol ; 84: e249472, 2024. tab, ilus
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1364512

ABSTRACT

Leaf rust, caused by Puccinia triticina, is the most common rust disease of wheat. The fungus is an obligate parasite capable of producing infectious urediniospores. To study the genetic structure of the leaf rust population 20 RAPD primers were evaluated on 15 isolates samples collected in Pakistan. A total of 105 RAPD fragments were amplified with an average of 7 fragments per primer. The number of amplified fragments varied from 1 to 12. GL Decamer L-07 and GL Decamer L-01 amplified the highest number of bands (twelve) and primer GL Decamer A-03 amplified the lowest number of bands i.e one. Results showed that almost all investigated isolates were genetically different that confirms high genetic diversity within the leaf rust population. Rust spores can follow the migration pattern in short and long distances to neighbor areas. Results indicated that the greatest variability was revealed by 74.9% of genetic differentiation within leaf rust populations. These results suggested that each population was not completely identical and high gene flow has occurred among the leaf rust population of different areas. The highest differentiation and genetic distance among the Pakistani leaf rust populations were detected between the leaf rust population in NARC isolate (NARC-4) and AARI-11and the highest similarity was observed between NARC isolates (NARC-4) and (NARC-5). The present study showed the leaf rust population in Pakistan is highly dynamic and variable.


A ferrugem da folha, causada por Puccinia triticina, é a ferrugem mais comum do trigo. O fungo é um parasita obrigatório, capaz de produzir urediniósporos infecciosos. Para estudar a estrutura genética da população de ferrugem da folha, 20 primers RAPD foram avaliados em 15 amostras de isolados coletadas no Paquistão. Um total de 105 fragmentos RAPD foram amplificados com uma média de 7 fragmentos por primer. O número de fragmentos amplificados variou de 1 a 12. GL Decamer L-07 e GL Decamer L-01 amplificaram o maior número de bandas (doze), e o primer GL Decamer A-03 amplificou o menor número de bandas, ou seja, um. Os resultados mostraram que quase todos os isolados investigados eram geneticamente diferentes, o que confirma a alta diversidade genética na população de ferrugem da folha. Os esporos de ferrugem podem seguir o padrão de migração em distâncias curtas e longas para áreas vizinhas. Os resultados indicaram que a maior variabilidade foi revelada por 74,9% da diferenciação genética nas populações de ferrugem. Esses resultados sugeriram que cada população não era completamente idêntica e um alto fluxo gênico ocorreu entre a população de ferrugem da folha de diferentes áreas. A maior diferenciação e distância genética entre as populações de ferrugem da folha do Paquistão foram detectadas entre a população de ferrugem da folha no isolado NARC (NARC-4) e AARI-11 e a maior similaridade foi observada entre os isolados NARC (NARC-4) e (NARC-5). O presente estudo mostrou que a população de ferrugem da folha no Paquistão é altamente dinâmica e variável.


Subject(s)
Triticum/parasitology , Biomarkers , Agricultural Pests , Fungi/genetics , Puccinia/genetics
2.
Braz. j. biol ; 84: e256817, 2024. tab, mapas, ilus
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1364511

ABSTRACT

The basic aim of this study was aimed to determine the ichthyofaunal diversity of River Panjkora in both upper and lower Dir districts in Khyber Pakhtunkhwa province of Pakistan.Fish samples were collected by using fishnets from March to September 2020. A total of 724 specimens were collected and classified into 5 families, 14 genera, and 18 species. The overall results revealed that most fish fauna of river Panjkora contains 8 species of family Cyprinidae (56.49%) followed by 4 species of Nemacheilidae (24.44%), 2 species of Channidae (10.63%), and Sisoridae (7.04%), and 1 species of Mastacembelidae (1.38%), respectively. Among all kinds of fish species, Schizothorax plagiostomus (16.57%) was highly dominated and followed by Carassius auratus (11.87%) and Racoma labiata (9.66%) and were reported as highly abundant, especially during April, May, and June. The least abundant species were Glyptothorax punjabensis, Glyptothorax sufii, and Mastacembelus armatus, that constituting 2.48%, 2.20%, and 1.38% of the total fish samples. The Overall Simpson's diversity (1-D= 0.919) and Simpson's Reciprocal index values (1/D= 12.3876), and Shannon's index (H= 2.68) were indicating that river Panjkora contains a quite rich and diverse group of fish species. The highest microplastics observed in site 7 compared to other study area. Conservation steps should be taken as a top priority to protect and conserve the marine environment and natural heritage from further loss, extinction and stop or minimize losses incurred through irresponsible fishery practices


O objetivo básico deste estudo foi determinar a diversidade ictiofaunística do rio Panjkora nos distritos de Lower e Upper de Dir, na província de Khyber Pakhtunkhwa, no Paquistão. Amostras de peixes foram coletadas com redes de arrasto de março a setembro de 2020. Foram coletados 724 espécimes, classificados em 5 famílias, 14 gêneros e 18 espécies. Os resultados gerais revelaram que a maioria da ictiofauna do rio Panjkora contém 8 espécies da família Cyprinidae (56,49%), seguidas por 4 espécies de Nemacheilidae (24,44%), 2 espécies de Channidae (10,63%) e Sisoridae (7,04%) e 1 espécie de Mastacembelidae (1,38%). Entre todas as espécies de peixes, Schizothorax plagiostomus (16,57%) foi altamente predominante, seguida por Carassius auratus (11,87%) e Racoma labiata (9,66%), e elas foram relatadas como altamente abundantes, especialmente nos meses de abril, maio e junho. As espécies menos abundantes foram Glyptothorax punjabensis, Glyptothorax sufii e Mastacembelus armatus, que constituíram 2,48%, 2,20% e 1,38%, respectivamente, do total de peixes amostrados. O índice de diversidade de Simpson (1-D = 0,919), o índice recíproco de Simpson (1/D = 12,3876) e o índice de Shannon (H = 2,68) indicaram que o rio Panjkora contém um grupo bastante rico e diversificado de espécies de peixes. Os microplásticos mais altos foram observados no local 7 em comparação com outra área de estudo. Medidas de conservação devem ser tomadas como prioridade máxima para proteger e conservar o ambiente marinho e o patrimônio natural de novas perdas e extinção e para parar ou minimizar as perdas ocorridas por práticas de pesca irresponsáveis.


Subject(s)
Animals , Biodiversity , Rivers , Environmental Pollution , Fishes , Microplastics , Pakistan
3.
Braz. j. biol ; 84: e256160, 2024. tab, graf, mapas, ilus
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1360203

ABSTRACT

Riverine forests are unique and highly significant ecosystems that are globally important for diverse and threatened avian species. Apart from being a cradle of life, it also serves as a gene pool that harbors a variety of flora and fauna species (repeated below). Despite the fact, this fragile ecosystem harbored avian assemblages; it is now disappearing daily as a result of human activity. Determining habitat productivity using bird species is critical for conservation and better management in the future. Multiple surveys were conducted over a 15-month period, from January to March 2019, using the distance sampling point count method. A total of 250 point count stations were fixed systematically at 300 m intervals. In total, 9929 bird individuals were recorded, representing 57 species and 34 families. Out of 57 bird species, two were vulnerable, one was data deficient, one was nearly threatened, and the remaining 53 species were of least concern. The Eurasian Collard Dove - Streptopelia decaocto (14.641 ± 2.532/ha), White-eared Bulbul - Pycnonotus leucotis (13.398 ± 4.342/ha) and Common Babbler - Turdoides caudata (10.244 ± 2.345/ha) were the three first plenteous species having higher densities. However, the densities of three species, i.e., Lesser Whitethroat - Sylvia curruca, Gray Heron - Ardea cinerea and Pallas Fish Eagle - Haliaeetus leucoryphus, were not analyzed due to the small sample size. The findings of diversity indices revealed that riverine forest has harbored the diverse avian species that are uniformly dispersed across the forest. Moreover, recording the ten foraging guilds indicated that riverine forest is rich in food resources. In addition, the floristic structure importance value index results indicated that riverine forest is diverse and rich in flora, i.e. trees, shrubs, weeds and grass, making it an attractive and productive habitat for bird species.


As florestas ribeirinhas são ecossistemas únicos e altamente significativos que são globalmente importantes para diversas espécies de aves ameaçadas de extinção. Além de serem o berço da vida, também servem como um conjunto genético que abriga uma variedade de espécies da flora e da fauna. Apesar disso, esse frágil ecossistema abrigava um conjunto de aves, mas agora está desaparecendo diariamente como resultado da atividade humana. Determinar a produtividade do hábitat usando espécies de pássaros é fundamental para a conservação e melhor gestão no futuro. Vários levantamentos foram realizados ao longo de um período de 15 meses, de janeiro de 2018 a março de 2019, por meio do método de contagem de pontos de amostragem de distância. Foram fixadas sistematicamente 250 estações de contagem de pontos em intervalos de 300 m. No total, foram registrados 9.929 indivíduos de aves, representando 57 espécies e 34 famílias. Das 57 espécies de aves, duas eram vulneráveis, uma tinha dados insuficientes, uma estava quase ameaçada e as 53 espécies restantes eram as menos preocupantes. O: Pomba de colar euroasiática - Streptopelia decaocto (14.641 ± 2.532/ha), o Bulbul de orelha branca - Pycnonotus leucotis (13.398 ± 4.342/ha) e Tagarela comum - Turdoides caudata (10.244 ± 2.345/ha) foram as três primeiras espécies abundantes com maiores densidades. No entanto, as densidades de três espécies, Papa-amoras-cinzento (Sylvia curruca), Garça-real-europeia (Ardea cinerea) e Águia-pescadora de Pallas (Haliaeetus leucoryphus), não foram analisadas por causa do pequeno tamanho da amostra. Os resultados dos índices de diversidade revelaram que a floresta ribeirinha abrigou diversas espécies de aves que estão uniformemente dispersas pela floresta. Além disso, o registro das dez guildas de forrageamento indicou que a floresta ribeirinha é rica em recursos alimentares. Além disso, os resultados do índice de valor de importância da estrutura florística indicaram que a floresta ribeirinha é variada e rica em flora, ou seja, árvores, arbustos, ervas daninhas e grama, tornando-a um hábitat atraente e produtivo para espécies de aves.


Subject(s)
Birds , Forests , Ecosystem , Genetic Background
4.
Braz. j. biol ; 84: e256942, 2024. tab, ilus
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1360223

ABSTRACT

Domestic donkey plays a key role as a draft animal in rural economy of Pakistan where its population is increasing every year. The complete mtDNA control region of forty randomly sampled donkeys was PCR- amplified and sequenced bi-directionally using specific primers. Distinct mtDNA haplotypes obtained in the current study (KY446001−KY446011) were subjected to haplotype (h) and nucleotide diversity (π) measures using DnaS as well as to phylogenetic, Network, and AMOVA analyses. There were a total 27 polymorphic sites present within 11 unique mtDNA haplotypes from the studied 40 animals from different regions. Neighbor-joining network and median-joining network both illustrated the splitting of all these haplotypes into two well-defined Nubian and Somali lineages, confirming African maternal origin of Pakistani domestic donkey. Diversity parameters h (0.967± 0.037) and π (0.02917± 0.00307) were found to reveal high levels of genetic diversity in Pakistani donkeys. AMOVA demonstrated only 1% of genetic differences between two mtDNA maternal lineages, pointing to lack of population substructure in Pakistani donkeys as is the case with worldwide domestic donkey population. Pakistani donkeys have African maternal origin and high levels of mtDNA diversity. High genetic diversity may be due to non-selective breeding and heteroplasmy. We herein provide the first report on mtDNA diversity of control region in Pakistani domestic donkey.


O burro doméstico possui um papel fundamental como animal de tração na economia rural do Paquistão, onde a população desse animal está aumentando a cada ano. A região de controle de mtDNA completa de 40 burros amostrados aleatoriamente foi ampliada por PCR e sequenciada bidirecionalmente por intermédio de primers específicos. Haplótipos distintos de mtDNA obtidos no estudo atual (KY446001 − KY446011) foram submetidos a medidas de haplótipo (h) e diversidade de nucleotídeos (π) por meio de DnaS, bem como análises filogenéticas, de rede e AMOVA. Havia um total de 27 sítios polimórficos presentes em 11 haplótipos de mtDNA exclusivos dos 40 animais estudados de diferentes regiões. A rede de união de vizinhos e a rede de união mediana ilustram a divisão de todos esses haplótipos em duas linhagens núbias e somalis bem definidas, confirmando a origem materna africana do burro doméstico do Paquistão. Os parâmetros de diversidade h (0,967 ± 0,037) e π (0,02917 ± 0,00307) revelaram altos níveis de diversidade genética em burros paquistaneses. AMOVA demonstrou apenas 1% de diferenças genéticas entre as duas linhagens maternas de mtDNA, apontando a falta de subestrutura populacional em burros paquistaneses, como é o caso da população mundial de burros domésticos. Os burros paquistaneses têm origem materna africana e altos níveis de diversidade de mtDNA. A alta diversidade genética pode ser por causa da reprodução não seletiva e de heteroplasmia. Aqui, fornecemos o primeiro relatório sobre a diversidade do mtDNA da região de controle em burros domésticos do Paquistão


Subject(s)
Animals , Pakistan , Genetic Variation , DNA, Mitochondrial , Equidae
5.
Braz. j. biol ; 84: e248656, 2024. tab, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1345542

ABSTRACT

Abstract Several species of Cichla successfully colonized lakes and reservoirs of Brazil, since the 1960's, causing serious damage to local wildlife. In this study, 135 peacock bass were collected in a reservoir complex in order to identify if they represented a single dominant species or multiple ones, as several Cichla species have been reported in the basin. Specimens were identified by color pattern, morphometric and meristic data, and using mitochondrial markers COI, 16S rDNA and Control Region (CR). Overlapping morphological data and similar coloration patterns prevented their identification using the taxonomic keys to species identification available in the literature. However, Bayesian and maximum likelihood from sequencing data demonstrated the occurrence of a single species, Cichla kelberi. A single haplotype was observed for the 16S and CR, while three were detected for COI, with a dominant haplotype present in 98.5% of the samples. The extreme low diversity of the transplanted C. kelberi evidenced a limited number of founding maternal lineages. The success of this colonization seems to rely mainly on abiotic factors, such as increased water transparency of lentic environments that favor visual predators that along with the absence of predators, have made C. kelberi a successful invader of these reservoirs.


Resumo Muitas espécies de Cichla colonizaram com sucesso lagos e reservatórios do Brasil desde os anos 1960, causando graves prejuízos à vida selvagem nesses locais. Neste estudo, 135 tucunarés foram coletados em um complexo de reservatórios a fim de identificar se representavam uma espécie dominante ou múltiplas espécies, uma vez que diversas espécies de Cichla foram registradas na bacia. Os espécimes foram identificados com base na coloração, dados morfométricos e merísticos, e por marcadores mitocondriais COI, 16S rDNA e Região Controle (RC). A sobreposição dos dados morfométricos e o padrão similar de coloração impediram a identificação utilizando as chaves de identificação disponíveis na literatura. Entretanto, as análises bayesiana e de máxima verossimilhança de dados moleculares demonstraram a ocorrência de uma única espécie, Cichla kelberi. Um único haplótipo foi observado para o 16S e RC, enquanto três foram detectados para o COI, com um haplótipo dominante presente em 98,5% das amostras. A baixa diversidade nos exemplares introduzidos de C. kelberi evidenciou um número limitado de linhagens maternas fundadoras. O sucesso da invasão parece depender de fatores abióticos, como a maior transparência da água de ambientes lênticos que favorece predadores visuais que, atrelado à ausência de predadores, fez do C. kelberi um invasor bem-sucedido nesses reservatórios.


Subject(s)
Animals , Cichlids/genetics , Phylogeny , Genetic Variation/genetics , Haplotypes/genetics , Lakes , Bayes Theorem
6.
Braz. j. biol ; 84: e252088, 2024. tab
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1345543

ABSTRACT

Abstract Acacia mangium is a pioneer species with fast growth and frequently used in the recovery of degraded areas. The objectives were to evaluate insects and spiders, their ecological indices and interactions on A. mangium saplings in a tropical degraded area in recovering process. The experimental design was completely randomized with 24 replications, with treatments represented by the first and second years after A. mangium seedling planted. Numbers of leaves/branch, branches/sapling, and ground cover by A. mangium saplings, Hemiptera: Phenacoccus sp. and Pachycoris torridus; Hymenoptera: Tetragonisca angustula and Trigona spinipes, Brachymyrmex sp., Camponotus sp. and Cephalotes sp.; Blattodea: Nasutitermes sp. and Neuroptera: Chrysoperla sp.; abundance, species richness of pollinating insects, tending ants, and the abundance of Sternorrhyncha predators were greatest in the second year after planting. Numbers of Hemiptera: Aethalium reticulatum, Hymenoptera: Camponotus sp., Cephalotes sp., Polybia sp., T. angustula, T. spinipes, tending ants, pollinating insects, Sternorrhyncha predators and species richness of tending ants were highest on A. mangium saplings with greatest numbers of leaves or branches. The increase in the population of arthropods with ground cover by A. mangium saplings age increase indicates the positive impact by this plant on the recovery process of degraded areas.


Resumo Acacia mangium é uma espécie pioneira, de rápido crescimento e utilizada na recuperação de áreas degradadas. Os objetivos foram avaliar insetos e aranhas, seus índices ecológicos e interações com plantas de A. mangium em área tropical degradada em processo de recuperação. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado com 24 repetições, com os tratamentos representados pelos primeiro e segundo anos após a plantio de A. mangium. Os números de folhas/galhos, galhos/plantas e cobertura do solo por plantas de A. mangium, de Hemiptera: Phenacoccus sp. e Pachycoris torridus; Hymenoptera: Tetragonisca angustula e Trigona spinipes, Brachymyrmex sp., Camponotus sp. e Cephalotes sp.; Blattodea: Nasutitermes sp. e Neuroptera: Chrysoperla sp.; a abundância, riqueza de espécies de insetos polinizadores, formigas cuidadoras e a abundância de predadores de Sternorrhyncha foram maiores no segundo ano após o plantio. Os números de Hemiptera: Aethalium reticulatum, Hymenoptera: Camponotus sp., Cephalotes sp., Polybia sp., T. angustula, T. spinipes, formigas cuidadoras, insetos polinizadores, predadores de Sternorrhyncha e a riqueza de espécies de formigas cuidadoras foram maiores em plantas de A. mangium com maior altura e número de folhas ou galhos. O aumento populacional de artrópodes e da cobertura do solo com o processo de envelhecimento das plantas de A. mangium indicam impacto positivo dessa planta na recuperação de áreas degradadas.


Subject(s)
Animals , Spiders , Acacia , Insecta , Environmental Biomarkers , Environmental Restoration and Remediation
7.
Braz. j. biol ; 83: e249211, 2023. tab, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1345523

ABSTRACT

Abstract This study was conducted to estimate the diversity and the occurrence of commercially important finfish species collected by twenty fish sampling site of Sindh and Baluchistan coasts of the Arabian Sea in Pakistan from January to December 2019. Additionally, physicochemical characteristics of seawater were analyzed from these selected sites and found to be within suitable ranges required for fish growth and survive. A total of 81287 fish individuals were collected and identified as 49 species belonging to 26 families in our study. The most diversified family was Sparidae (13 species) followed by Carangidae and Lutjanidae (4 species), Mullidae, Serranidae, Ariidae (3 species), and Sciaenidae (2 species). The remaining 20 families were represented by only one species. The values of Shannon diversity index calculated for the four selected habitats revealed that high fish diversity was reported at Sonmiani Coast (H'=1.81), while less at Ormara Coast (H'=0.23). Likewise, Evenness index (E) was high at Sonmiani Coast (E=0.50) and less fish diversity was reported at Ormara Coast (E=0.06). Reducing risks to threatened marine species in coastal habitats also requires conservation actions at multiple scales. Thus, it was concluded that our study could be valuable in providing the more information's regarding to the diversity of finfish species and their occurrence along the Pakistan Coast. Further, to better understand the effects, regular monitoring and conservation measures should be taken to mitigate the influence of anthropogenic activities and protect finfish diversity from further decline


Resumo Este estudo foi conduzido para estimar a diversidade e a ocorrência de espécies de peixes comercialmente importantes coletadas por vinte locais de amostragem de peixes nas costas de Sindh e Baluchistão do mar da Arábia, no Paquistão, de janeiro a dezembro de 2019. Além disso, as características físico-químicas da água do mar foram analisadas a partir desses peixes locais selecionados e considerados dentro dos intervalos adequados necessários para o crescimento e sobrevivência dos peixes. Um total de 8.1287 indivíduos de peixes foi coletado e identificado como 49 espécies pertencentes a 26 famílias em nosso estudo. A família mais diversificada foi Sparidae (13 espécies), seguida por Carangidae e Lutjanidae (4 espécies), Mullidae, Serranidae, Ariidae (3 espécies) e Sciaenidae (2 espécies). As 20 famílias restantes foram representadas por apenas uma espécie. Os valores do índice de diversidade de Shannon calculados para os quatro habitats selecionados revelaram que uma alta diversidade de peixes foi relatada na costa Sonmiani (H' = 1,81), enquanto menos na costa Ormara (H' = 0,23). Da mesma forma, o índice de regularidade (E) foi alto na costa de Sonmiani (E = 0,50) e menos diversidade de peixes foi relatada na costa de Ormara (E = 0,06). A redução dos riscos para as espécies marinhas ameaçadas em habitats costeiros também requer ações de conservação em várias escalas. Assim, concluiu-se que nosso estudo pode ser valioso para fornecer mais informações sobre a diversidade de espécies de peixes finos e sua ocorrência ao longo da costa do Paquistão. Além disso, para compreender melhor os efeitos, medidas regulares de monitoramento e conservação devem ser tomadas para mitigar a influência das atividades antropogênicas e proteger a diversidade de peixes finos de um declínio maior.


Subject(s)
Humans , Animals , Water , Biodiversity , Seawater , Ecosystem , Fishes
8.
Braz. j. biol ; 83: e249159, 2023. tab
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1339415

ABSTRACT

Abstract There is a paucity of research conducted on microbial prevalence in pheasants. The microbiota of captive birds has zoonotic significance and must be characterize. Present study is therefore planned to assess the microbiota from oral, fecal and gut content of captive avian species. It will be helpful in characterization of harmful microbes. Different samples taken from oral, gut and feces of ring-necked pheasants (Phasianus colchicus), green pheasants (Phasianus versicolor), golden pheasant (Chrysolophus pictus) and silver pheasant (Lophura nycthemera). Samples were collected, diluted, and inoculated onto different agar plates (MacConkey, SS agar, MSA and nutrient agar) for cultivation of bacterial species. Colonies of E.coli, Staphylococcus spp. Brachyspira spp. and Campylobacter spp were observed based on colony morphology. Colony forming unit showed E. coli as frequently found bacteria in fecal, oral and gut contents of all the above pheasants. The overall significance difference was found among bacterial species of golden pheasants, green pheasant, ring-necked pheasant, and silver pheasants. It was concluded that E.coli is predominant isolated from heathy pheasants followed by Campylobacter, Staphylococcus and Brachyspira.


Resumo Há uma escassez de pesquisas realizadas sobre a prevalência microbiana em faisões. A microbiota de aves em cativeiro tem significado zoonótico e deve ser caracterizada. O presente estudo está, portanto, planejado para avaliar a microbiota do conteúdo oral, fecal e intestinal de espécies aviárias em cativeiro. Será útil na caracterização de micróbios nocivos. Diferentes amostras retiradas da boca, intestino e fezes de faisões de pescoço redondo (Phasianus colchicus), faisões verdes (Phasianus versicolor), faisões dourados (Chrysolophus pictus) e faisão prateado (Lophura nycthemera). As amostras foram coletadas, diluídas e inoculadas em diferentes placas de ágar (MacConkey, ágar SS, MSA e ágar nutriente) para o cultivo de espécies bacterianas. Colônias de E. coli, Staphylococcus spp., Brachyspira spp. e Campylobacter spp foram observados com base na morfologia da colônia. A unidade formadora de colônia mostrou E. coli como bactéria frequentemente encontrada no conteúdo fecal, oral e intestinal de todos os faisões acima. A diferença de significância geral foi encontrada entre as espécies bacterianas de faisões dourados, faisões verdes, faisões de pescoço anelado e faisões prateados. Verificou-se que a E.coli é predominantemente isolada de faisões saudáveis, seguida por Campylobacter, Staphylococcus e Brachyspira.


Subject(s)
Animals , Galliformes , Escherichia coli , Feces
9.
Braz. j. biol ; 83: e245536, 2023. tab
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1339403

ABSTRACT

Abstract Acacia mangium (Willd., 1806) (Fabales: Fabaceae) is a fast growing, rustic, pioneer species, with potential to fix nitrogen, and for programs to recover degraded areas. The objective was to evaluate the distribution and the functional diversity of interactions and the K-dominance of arthropod groups on A. mangium saplings. The number of individuals of eleven species of phytophagous insects, three bee species, and fourteen natural enemy species were highest on the adaxial leaf surface of this plant. Abundance, diversity and species richness of phytophagous insects and natural enemies, and abundance and species richness of pollinators were highest on the adaxial A. mangium leaf surface. The distribution of five species of sap-sucking hemipterans and six of protocooperating ants (Hymenoptera), with positive interaction between these groups, and three bee species (Hymenoptera) were aggregated on leaves of A. mangium saplings. Aethalion reticulatum (L.) (Hemiptera: Aethalionidae) and Bemisia sp. (Hemiptera: Aleyrodidae); Brachymyrmex sp. and Camponotus sp. (Hymenoptera: Formicidae); and Trigona spinipes Fabricius (Hymenoptera: Apidae) were the most dominant phytophagous insects, natural enemies, and pollinators, respectively, on A. mangium leaves. Knowledge of preferred leaf surfaces could help integrated pest management programs.


Resumo Acacia mangium (Willd., 1806) (Fabales: Fabaceae) é uma planta pioneira com rápido crescimento, rusticidade, potencial nitrificador e importante em programas de recuperação de áreas degradadas. O objetivo foi avaliar a distribuição e a diversidade funcional das interações e a dominância-K de grupos de artrópodes em árvores jovens de A. mangium. Os números de indivíduos de onze espécies de insetos fitófagos, três de abelhas e quatorze de inimigos naturais foram maiores na superfície adaxial de folhas dessa planta. A abundância, diversidade e riqueza de espécies de insetos fitófagos e inimigos naturais, e a abundância e riqueza de espécies de polinizadores foram maiores na face adaxial de folhas de A. mangium. A distribuição de cinco espécies de hemípteros sugadores de seiva e seis de formigas protocooperantes (Hymenoptera), com interação positiva entre esses grupos, e três de abelhas (Hymenoptera) foi agregada em folhas de plantas jovens de A. mangium. Aethalion reticulatum (L.) (Hemiptera: Aethalionidae) e Bemisia sp. (Hemiptera: Aleyrodidae); Brachymyrmex sp. e Camponotus sp. (Hymenoptera: Formicidae); e Trigona spinipes Fabricius (Hymenoptera: Apidae) foram os insetos fitófagos, inimigos naturais e polinizadores mais dominantes, respectivamente, em folhas de A. mangium. A definição da superfície foliar preferida pode auxiliar programas de manejo integrado de pragas.


Subject(s)
Animals , Ants , Arthropods , Acacia , Fabaceae , Bees , Plant Leaves
10.
Braz. j. biol ; 83: e248305, 2023. tab
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1339359

ABSTRACT

Abstract Fertilization with dehydrated sewage sludge can speed up the recovery process of degraded areas due to nutrients concentration, favoring the development of pioneer plants such as Acacia auriculiformis A. Cunn. ex Beth (Fabales: Fabaceae) and the emergence of insects. This study aimed the evaluation of chewing, pollinating insects, predators, their ecological indices and relationships on A. auriculiformis plants fertilized with dehydrated sewage sludge. The experimental design was completely randomized with two treatments (with and without dehydrated sewage sludge) and 24 repetitions. The prevalence of chewing insects Parasyphraea sp. (Coleoptera: Chrysomelidae), Nasutitermes sp. (Blattodea: Termitidae), and Tropidacris collaris (Stoll, 1813) (Orthoptera: Romaleidae), defoliation, and ecological indices of abundance of Coleoptera and Orthoptera were observed on fertilized A. auriculiformis. Acacia auriculiformis plants, with a superior number of branches/tree, revealed greater abundance of Coleoptera and Orthoptera, species richness of pollinating insects, defoliation, numbers of Parasyphraea sp. and T. collaris. The ones with larger leaves/branches displayed greater abundance of species richness of Coleoptera and Diabrotica speciosa (Germar, 1824) (Coleoptera: Chrysomelidae). Therefore, the use of A. auriculiformis plants, fertilized with dehydrated sewage sludge, is promising in the recovery of degraded areas due to the ecological indices increase of chewing and pollinators insects and spiders in the analyzed area.


Resumo A fertilização com lodo de esgoto desidratado pode acelerar o processo de recuperação de áreas degradadas devido à concentração de nutrientes, favorecendo o desenvolvimento de plantas pioneiras tais como Acacia auriculiformis A. Cunn. ex Beth (Fabales: Fabaceae) e de seus insetos. O objetivo deste trabalho foi avaliar os insetos mastigadores, polinizadores e predadores e seus índices e relações ecológicas em plantas de A. auriculiformis fertilizadas com lodo de esgoto desidratado, em área degradada, durante 24 meses. O delineamento foi inteiramente casualizados com dois tratamentos (com e sem adubação com lodo de esgoto desidratado) e 24 repetições (uma repetição = uma planta). O maior número de insetos mastigadores Parasyphraea sp. (Coleoptera: Chrysomelidae), Nasutitermes sp. (Blattodea: Termitidae) e Tropidacris collaris (Stoll, 1813) (Orthoptera: Romaleidae), de desfolha, e do índice ecológico abundância de Coleoptera e de Orthoptera foram maiores em plantas de A. auriculiformis fertilizadas do que nas não fertilizadas com lodo de esgoto desidratado. Plantas de A. auriculiformis, com maior quantidade de galhos/árvore, apresentaram maiores abundâncias de Coleoptera e Orthoptera, riqueza de espécies de insetos polinizadores, desfolha e números de Parasyphraea sp. e T. collaris, e as com maior folhas/galho os de riqueza de espécies de Coleoptera e Diabrotica speciosa (Germar, 1824) (Coleoptera: Chrysomelidae). Por tanto, a utilização de A. auriculiformis, adubada com lodo de esgoto desidratado, é promissora na recuperação de áreas degradadas devido ao aumento dos índices ecológicos de insetos mastigadores, polinizadores e aranhas na área.


Subject(s)
Animals , Acacia , Fabaceae , Sewage , Fertilization , Insecta
11.
Braz. j. biol ; 83: e250505, 2023. tab, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1339347

ABSTRACT

Abstract The South American fruit fly, Anastrepha fraterculus (Wiedemann, 1830) (Diptera: Tephritidae), is an important pest in the subtropical region of Brazil. This insect has tritrophic relation between wild fruits and parasitoids and is associated with apple (Malus domestica Borkh.) orchards adjacent to the Atlantic Forest in Paraná. We thus investigated the degree of infestation of the fruit fly and natural parasitism in wild and cultivated fruits surrounding apple orchards. For this purpose, we collected fruits of Acca sellowiana (Berg.) Burret, Campomanesia xanthocarpa (Mart), Eugenia uniflora L., Eugenia pyriformis Cambessèdes, Psidium cattleianum Sabine, Psidium guajava (L.), Annona neosericea Rainer and Eriobotrya japonica (Thumb) in apple orchards adjacent to the Atlantic Forest located in Campo do Tenente, Lapa and Porto Amazonas counties. In total, we collected 18,289 fruits during four growing years. The occurrence of A. fraterculus depends on the susceptible period of apple fruits. A. sellowiana and P. cattleianum were considered primary fruit fly multipliers and P. guajava was secondary, all occurring after the apple harvest (IS period). The group of parasitoids with A. fraterculus was Aganaspis pelleranoi (Brèthes, 1924) (Hymenoptera: Figitidae), Opius bellus (Gahan, 1930), Doryctobracon areolatus (Szépligeti, 1911) and Doryctobracon brasiliensis (Szépligeti, 1911) (Hymenoptera: Braconidae) all of which are first records in the Atlantic Forest in Paraná. First record of O. bellus occurring in the State of Paraná, as well as, first record of the tritrophic association between host plant A. neosericea, parasitoids D. areolatus and O. bellus and fruit fly A. fraterculus. The host P. cattleianum stood out among the Myrtaceae species in regard to the high diversity of parasitoid species (81% of parasitoids). The total number of Figitidae species (76.5%) was higher than that of Braconidae species. The influence of climatic events in southern Brazil on wild fruit production should be further studied to understand the association of A. fraterculus with the tritrophic relationship.


Resumo Mosca-das-frutas sul-americana, Anastrepha fraterculus (Wiedemann, 1830) (Diptera: Tephritidae), é uma importante praga da região subtropical do Brasil. Este inseto tem relação tritrófico entre frutos silvestres e parasitoides e está associado a pomares de macieiras (Malus domestica Borkh.) adjacentes à Mata Atlântica no Paraná. Assim, investigamos o grau de infestação da mosca-das-frutas e o parasitismo natural em frutas silvestres e cultivadas ao redor de pomares de maçã. Para tanto, foram coletados frutos de Acca sellowiana (Berg.) Burret, Campomanesia xanthocarpa (Mart), Eugenia uniflora L., Eugenia pyriformis Cambessèdes, Psidium cattleianum Sabine, Psidium guajava (L.), Annona neosericea Rainer e Eriobotrya japonica (Thumb) em pomares de maçã adjacentes à Mata Atlântica localizados nos municípios de Campo do Tenente, Lapa e Porto Amazonas. No total, coletamos 18.289 frutos durante quatro anos de cultivo. A ocorrência de A. fraterculus depende do período de suscetibilidade dos frutos da maçã. A. sellowiana e P. cattleianum foram considerados multiplicadores primários de mosca-das-frutas e P. guajava foi secundário, todos ocorrendo após a colheita da maçã (período IS). Os parasitóides a associados a A. fraterculus foram Aganaspis pelleranoi (Brèthes, 1924) (Hymenoptera: Figitidae), Opius bellus (Gahan, 1930), Doryctobracon areolatus (Szépligeti, 1911) e Doryctobracon brasiliensis (Szépligeti, 1911) (Hymenoptera: Braconidae), todos os quais são primeiros registros na Mata Atlântica no Paraná. Primeiro registro de O. bellus ocorrendo no Estado do Paraná, assim como, primeiro registro da associação tritrófica entre o hospedeiro A. neosericea, parasitoides D. areolatus e O. bellus e mosca-das-frutas A. fraterculus. O hospedeiro P. cattleianum se destacou entre as espécies de Myrtaceae pela alta diversidade de parasitóides associados (81% dos parasitóides). O número total de espécies de Figitidae (76,5%) foi superior ao de espécies de Braconidae. A influência de eventos climáticos no sul do Brasil na produção de frutas silvestres deve ser mais estudada para entender a associação de A. fraterculus com a relação tritrófica.


Subject(s)
Animals , Malus , Tephritidae , Hymenoptera , Brazil , Forests
12.
Braz. j. biol ; 83: e246984, 2023. tab, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1285632

ABSTRACT

Abstract Physids belong to Class Gastropoda; belong to Phylum Mollusca and being bioindicators, intermediate hosts of parasites and pests hold a key position in the ecosystem. There are three species of Genus Physa i.e. P. fontinalis, Physa acuta and P. gyrina water bodies of Central Punjab and were characterized on the basis of molecular markers High level of genetic diversity was revealed by polymorphic RAPD, however SSR markers were not amplified. The multivariate analysis revealed polymorphism ranging from 9.09 percent to 50 percent among the three Physid species. Total number of 79 loci were observed for the three species under study and 24 loci were observed to be polymorphic. These RAPD fragment(s) can be developed into co dominant markers (SCAR) by cloning and can be further sequenced for the development of the Physa species specific markers to identify the introduced and native species in Pakistan.


Resumo Os físidos pertencem à classe Gastropoda; pertencem ao filo Mollusca e, sendo bioindicadores, hospedeiros intermediários de parasitas e pragas, ocupam uma posição-chave no ecossistema. Existem três espécies do gênero Physa, ou seja, P. fontinalis, Physa acuta e P. gyrina em corpos d'água do Punjab Central e foram caracterizadas com base em marcadores moleculares. Alto nível de diversidade genética foi revelado por RAPD polimórfico, no entanto os marcadores SSR não foram amplificados. A análise multivariada revelou polimorfismo variando de 9,09% a 50% entre as três espécies de Physid. Um número total de 79 loci foi observado para as três espécies em estudo e 24 loci foram observados como polimórficos. Esses fragmentos RAPD podem ser desenvolvidos em marcadores codominantes (SCAR) por clonagem e podem ser posteriormente sequenciados para o desenvolvimento de marcadores específicos da espécie Physa para identificar as espécies introduzidas e nativas no Paquistão.


Subject(s)
Animals , Gastropoda , Introduced Species , Pakistan , Phylogeny , Ecosystem , Random Amplified Polymorphic DNA Technique
13.
Braz. j. biol ; 83: e242070, 2023. tab, graf
Article in English | LILACS, VETINDEX | ID: biblio-1278554

ABSTRACT

Abstract Interactions between endophytic fungi (EFs) and their host plants range from positive to neutral to negative. The results of such interactions can vary depending on the organ of the infected host plant. EFs isolated from the leaves of some species of plants have potential for use as agents to inhibit seed germination and control invasive plants. The objectives of this study were to identify EFs present in the leaves of Copaifera oblongifolia and to evaluate the role of these fungi in seed germination and seedling development. A total of 11 species of EFs were isolated, which were identified using the internal transcribed spacers (ITS) sequence of the nuclear ribosomal DNA. The isolated species of EFs are generalists and probably are transmitted horizontally. Laboratory tests revealed that filtrates of these fungal isolates differently affect seed germination and seedling development of C. oblongifolia. The species Curvularia intermedia, Neofusicoccum parvum, Pseudofusicoccum stromaticum and Phomopsis sp. negatively affected seed germination, with N. parvum standing out for its negative effects, inhibiting seedling germination and survival in 89 and 222%, respectively. In addition, Cochliobolus intermedius negatively affected seedling development. Thus, the combined use of N. parvum and C. intermedius, or products from the metabolism of these microorganisms, in the control of invasive plants deserves attention from future studies.


Resumo As interações entre fungos endofíticos (FEs) e suas plantas hospedeiras variam de positivas, neutras a negativas. Os resultados destas interações podem variar dependendo do órgão da planta hospedeira infectada. FEs isolados de folhas de algumas espécies de plantas têm potencial para serem usados como agentes inibidores da germinação de sementes e no controle de plantas invasoras. Os objetivos deste estudo foram identificar os FEs presentes nas folhas de Copaifera oblongifolia e avaliar o papel destes fungos na germinação das sementes e no desenvolvimento das plântulas. Um total de 11 espécies de FEs foi isolado das folhas de C. oblongifolia e identificado através da sequência dos espaçadores internos transcritos do DNA ribossomal nuclear. As espécies de FEs isoladas são generalistas e provavelmente devem ser transmitidas horizontalmente. Os resultados dos testes de germinação mostraram que filtrados destes isolados fúngicos podem afetar diferentemente a germinação das sementes e o desenvolvimento das plântulas de C. oblongifolia. As espécies Curvularia intermedia, Neofusicoccum parvum, Pseudofusicoccum stromaticum e Phomopsis sp. afetaram negativamente a germinação das sementes de C. oblongifolia. Dentre estas espécies devemos destacar que N. parvum reduziu a germinação e a sobrevivência das plântulas em 89 e 222%, respectivamente. Além disso, Cochiliobolus intermedius afetou negativamente o desenvolvimento das plântulas. Assim, o uso combinado de N. parvum e C. intermedius, ou de produtos do metabolismo destas espécies de fungos, têm potencial para serem usados no manejo de plantas invasoras.


Subject(s)
Germination , Fabaceae , Ascomycota , Seeds , Plant Leaves , Seedlings , Fungi , Curvularia
14.
Rev. biol. trop ; 70(1)dic. 2022.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS, SaludCR | ID: biblio-1387722

ABSTRACT

Resumen Introducción: La diversidad de una comunidad biológica es el resultado de procesos ecológicos e históricos, los cuales, analizados en conjunto, producen una mejor comprensión de las causas que la generan. Objetivo: Actualizamos y analizamos la diversidad específica y taxonómica de la ictiofauna del río Amacuzac, México. Métodos: Durante cinco temporadas de muestreo (2019-2020), recolectamos peces de diez sitios en el río y aplicamos un análisis de conglomerados a las variables del hábitat. Resultados: Recolectamos 7 638 individuos, siete de especies nativas y nueve no nativas, incluyendo Copadichromis borleyi, un nuevo registro para el Amacuzac. La riqueza por sitio osciló entre ocho y 13 especies. Las variables del hábitat definieron cuatro grupos. Las especies más abundantes fueron: Poeciliopsis gracilis, Poecilia maylandi y Amatitlania nigrofasciata. Las especies menos abundantes fueron: Pterygoplichtys pardalis, Ilyodon whitei, Copadichromis borleyi e Ictalurus punctatus. Las especies más relevantes fueron: A. nigrofasciata, Amphilophus istlanus, Andinoacara rivulatus, Notropis boucardi, Oreochormis sp., P. maylandi, P. gracilis y Thorichthys maculipinis. Las especies más restringidas fueron: Atherinella balsana, C. borleyi e I. punctatus. Conclusiones: Las especies en peligro de extinción, A. istlanus y N. boucardi, aun prevalecen en el río. Además, se muestra un aumento en el número de especies no nativas. Analizar la diversidad desde dos perspectivas, aporta una visión más completa de los cambios que se dan en el Río Amacuzac como consecuencia del establecimiento de especies, información que es importante para futuras estrategias de conservación.


Abstract Introduction: The diversity of a biological community is the result of ecological and historical processes, which, when analyzed jointly, produce a better understanding of the causes that generate it. Objective: We update and analyze the specific and taxonomic diversity of the ichthyofauna of the Amacuzac River, Mexico. Methods: During five sampling seasons (2019-2020) we collected fishes from ten sites in the river and applied a cluster analysis to habitat variables. Results: We collected 7 638 individuals; seven were native species and nine were non-native, including Copadichromis borleyi, a new record for the Amacuzac. Richness per site ranged from eight to 13 species. Habitat variables defined four groups. The most abundant species were Poeciliopsis gracilis, Poecilia maylandi and Amatitlania nigrofasciata. The least abundant species were: Pterygoplichtys pardalis, Ilyodon whitei, Copadichromis borleyi and Ictalurus punctatus. The most prevalent species were: A. nigrofasciata, Amphilophus istlanus, Andinoacara rivulatus, Notropis boucardi, Oreochormis sp., P. maylandi, P., gracilis and Thorichthys maculipinis. The most restricted species were: Atherinella balsana, C. borleyi and I. punctatus. Conclusions: Endangered species such as A. istlanus and N. boucardi are still prevalent in the river, but non-native species continue to increase. Analyzing the diversity from two perspectives provides a more complete view of the changes taking place in the Amacuzac River as a consequence of species establishment, information that is important for future conservation strategies.


Subject(s)
Animals , Aquatic Fauna , Rivers , Biodiversity , Mexico
15.
Rev. biol. trop ; 70(1)dic. 2022.
Article in English | LILACS-Express | LILACS, SaludCR | ID: biblio-1387717

ABSTRACT

Abstract Introduction: There is low evidence of genetic diversity and hybridization processes within Crocodylus acutus and C. moreletii populations. Objetive: To evaluate genetic diversity and some phylogenetic relationships in wild and captive populations of C. acutus and C. moreletii using the Barcode of Life Data System (COX1, cytochrome C oxidase subunit 1 gene). Methods: 28 individuals phenotypically like C. acutus located in the state of Guerrero, Oaxaca and Quintana Roo were sampled, as well as animals belonging to C. moreletii located in the states of Tabasco, Campeche, and Quintana Roo. 641 base pairs of nucleotide sequence from COX1 were used to obtain the haplotype and nucleotide diversity per population, and a phylogenetic and network analysis was performed. Results: Evidence of hybridization was found by observing C. moreletti haplotypes in animals phenotypically determined as C. acutus, as well as C. acutus haplotypes in animals classified as C. moreletti. Low haplotypic diversity was observed for C. acutus (0.455 ± 0.123) and for C. moreletii (0.505 ± 0.158). A phylogenetic tree was obtained in which the sequences of C. acutus and C. moreletii were grouped into two well-defined clades. Organisms identified phenotypically as C. acutus but with C. moreletii genes were separated into a different clade within the clade of C. moreletii. Conclusions: There are reproductive individuals with haplotypes different from those of the species. This study provides a small but significant advance in the genetic knowledge of both crocodile species and the use of mitochondrial markers, which in this case, the COX1 gene allowed the detection of hybrid organisms in wild and captive populations. Conservation efforts for both species of crocodiles should prevent the crossing of both threatened species and should require the genetic identification of pure populations, to design effective conservation strategies considering the possibility of natural hybridization in areas of sympatry.


Resumen Introducción: Existe poca evidencia de la diversidad genética y los procesos de hibridación dentro de las poblaciones de Crocodylus acutus y C. moreletii. Objetivo: Evaluar la diversidad genética y algunas relaciones filogenéticas en poblaciones silvestres y cautivas de C. acutus y C. moreletii utilizando el Sistema de Código de Barras de la vida (COX1, subunidad I del gen del citocromo C oxidasa). Métodos: Se muestrearon 28 individuos fenotípicamente similares a C. acutus ubicados en los estados de Guerrero, Oaxaca y Quintana Roo, así como animales pertenecientes a C. moreletii ubicados en los estados de Tabasco, Campeche y Quintana Roo. Se utilizaron 641 pares de bases de la secuencia de nucleótidos de la subunidad I del gen del citocromo C oxidasa para obtener el haplotipo y la diversidad de nucleótidos por población, y se realizó un análisis filogenético y de redes. Resultados: Se encontró evidencia de hibridación al observar haplotipos de C. moreletti en animales determinados fenotípicamente como C. acutus, así como haplotipos de C. acutus en animales clasificados como C. moreletti. Se observó una baja diversidad haplotípica para C. acutus (0.455 ± 0.123) y para C. moreletii (0.505 ± 0.158). Se obtuvo un árbol filogenético en el que las secuencias propias de C. acutus y C. moreletii se agruparon en dos grandes y bien definidos clados. Los organismos identificados fenotípicamente como C. acutus pero con genes de C. moreletii se separaron en un clado diferente dentro del clado de C. moreletii. Conclusiones: Existen individuos reproductores con haplotipos diferentes a los de la especie. Este estudio aporta un pequeño pero significativo avance en el conocimiento genético tanto de las especies de cocodrilos como del uso de marcadores mitocondriales, que, en este caso, el gen COX1 permitió la detección de organismos híbridos en poblaciones silvestres y cautivas. Los esfuerzos de conservación para ambas especies de cocodrilos deben evitar el cruce de ambas especies amenazadas y deben requerir la identificación genética de poblaciones puras, para diseñar estrategias de conservación efectivas considerando la posibilidad de hibridación natural en áreas de simpatría.


Subject(s)
Animals , Alligators and Crocodiles/genetics , Mexico , Electronic Data Processing
16.
Rev. biol. trop ; 70(1)dic. 2022.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS, SaludCR | ID: biblio-1387710

ABSTRACT

Resumen Introducción: La naturaleza tropical está experimentando una amenaza sin precedentes que incluye comunidades de peces costeros que requieren un constante seguimiento de la presencia de especies. El uso simultáneo de varios métodos de monitoreo debería reducir el sesgo causado por la selectividad de cada método. Objetivo: Este estudio uso cuatro diferentes métodos de muestreo a lo largo de dos años para evaluar y comparar los ensamblajes de peces en el Área Marina de Manejo Bahía Santa Elena, Pacífico de Costa Rica. Métodos: Examinamos los cambios en la riqueza y composición de especies entre épocas de afloramiento y no afloramiento entre julio de 2019 y febrero de 2020. Aplicamos censos visuales, cámaras remotas submarinas; líneas de fondo; y pesca deportiva. Resultados: Identificamos 140 especies de peces (54 familias); las cámaras submarinas remotas detectaron el 83 %, seguido por los censos visuales submarinos (65 %), la pesca deportiva (16 %) y las líneas de fondo (14 %). Solo el método de pesca deportiva detectó diferencias en la riqueza y composición de especies entre temporadas. Conclusión: Las cámaras remotas parecen ser el mejor método para el conteo de especies y la pesca deportiva para detectar diferencias estacionales en las costas tropicales similares a la aquí estudiada.


Abstract Introduction: Tropical nature is experiencing an unprecedented threat that includes coastal fish communities that requires a close monitoring of species presence. The simultaneous use of several monitoring methods should reduce the bias caused by the selectivity of each method. Objective: This study used four different sampling methods over two years to assess and compare fish assemblages in the Santa Elena Bay Marine Management Area (AMM-BSE), North Pacific of Costa Rica. Methods: We examined changes in species richness and composition between upwelling and non-upwelling seasons from July 2019 and February 2020. We applied visual censuses, underwater remote cameras; bottom lines; and sport fishing. Results: We identified 140 species of fish (54 families); remote underwater cameras detected 83 %, followed by underwater visual censuses (65 %), sport-fishing (16 %) and bottom lines (14 %). Only the sport-fishing method detected differences in species richness and composition between seasons. Conclusion: Remote cameras appear to be the best method for species counts, and sport-fishing to detect seasonal differences in tropical coasts similar to the one studied here.


Subject(s)
Animals , Data Collection/methods , Fishes , Biological Monitoring/methods , Bays , Costa Rica
17.
Rev. biol. trop ; 70(1)dic. 2022.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS, SaludCR | ID: biblio-1387700

ABSTRACT

Resumen Introducción: Tradicionalmente, los estudios de escarabajos coprófagos en los bosques secos tropicales (BST) del Caribe colombiano han aplicado metodologías diseñadas para zonas húmedas y andinas del país, lo cual podría estar incidiendo en el rendimiento y la eficiencia del muestreo. Objetivo: Con el fin de aportar a esta discusión, se analizó cómo la cantidad de cebo y el tiempo de operación de la trampa de caída inciden en la efectividad de captura de escarabajos coprófagos en un fragmento de BST en La Reserva Campesina la Flecha, San Jacinto, Colombia. Métodos: Para la captura de los escarabajos, se utilizó trampas de caída, cebadas con tres cantidades diferentes de atrayente: pequeño (34.6 g), mediano (53.8 g) y grande (114.9 g), las cuales permanecieron activas en campo durante 48 h. Cuatro muestreos fueron realizados entre marzo y septiembre de 2015, abarcando por igual la época seca y de lluvia. Resultados: Se registró un total de 4 563 individuos, agrupados en 10 géneros y 27 especies de escarabajos coprófagos. Los mayores valores de riqueza, abundancia y biomasa se presentaron en el cebo grande, a las 48 h, durante la época de lluvias. Sin embargo, el tiempo de operación de la trampa no tuvo efecto en la estimación de la riqueza, abundancia y biomasa de escarabajos independientemente de los tamaños de cebo. Los tres órdenes de la diversidad ( 0 D, 1 D y 2 D), presentaron valores similares entre las cantidades de cebo durante la época de lluvia, pero en la época seca, los cebos de mayor tamaño presentaron los valores de diversidad más altos. Por su parte con el cebo de mayor tamaño se capturó significativamente más riqueza, abundancia y biomasa de escarabajos de cuerpo pequeño y grande siendo esta situación más notaria durante la época seca. Conclusiones: Los resultados de este trabajo evidencian que para el estudio de los ensamblajes de escarabajos en el BST la utilización de un cebo de mayor tamaño contribuye a una mejor estimación de riqueza, abundancia, diversidad y biomasa, sobre todo durante la época seca, cuando las condiciones ambientales propician que los cebos pierdan su atractividad con mayor rapidez.


Abstract Introduction: Typically, research on dung beetles in the Tropical Dry Forests (TDF) of Colombian Caribbean region, have applied methodologies designed for wet or Andean areas of the country, which could be influencing the performance and efficiency of sampling. Objective: In order to contribute to this discussion, we analyzed how the bait amount and pitfall trap operating time influence the collection effectiveness of dung beetles in a TDF fragment at Reserva Campesina La Flecha, San Jacinto, Colombia. Methods: For the collection of beetles, we utilized pitfall traps baited with three different amounts of attractants: small (34.6 g), medium (53.8 g), and large (114.9 g), which remained active in the field for 48 h., 4 samplings between March and September 2015 were carried out, covering both, dry and rainy seasons. Results: A total of 4 563 individuals were recorded, grouped into 10 genera and 27 species of dung beetles. The highest values of richness, abundance and biomass were registered in the large bait, at 48 h, during the rainy season. However, the trap operating time had no effect on the estimation of beetles' richness, abundance, and biomass, regardless of bait sizes. The three diversity orders ( 0 D, 1 D y 2 D) showed similar values between the bait amounts during rainy season, but in the dry season, the largest baits displayed the highest diversity values. On the other hand, with the largest bait, significantly more richness, abundance, and biomass of small and large body beetles were registered, especially during the dry season. Conclusions: The results of this research show that, for the study of beetles' assemblages in the BST, the use of a larger bait contributes to a better estimate of richness, abundance, diversity and biomass, especially during the dry season, when environmental conditions promote a more rapidly loss of baits attractiveness.


Subject(s)
Animals , Coleoptera , Biomass , Sampling Studies
19.
Rev. chil. nutr ; 49(3)jun. 2022.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1388614

ABSTRACT

RESUMEN Objetivo: Evaluar la diversidad alimentaria entre los habitantes de las provincias de Lima, Arequipa y Sullana de Perú durante el tiempo de aislamiento debido a la COVID-19 y explorar los factores asociados. Métodos: Estudio transversal en el que se aplicó cuestionarios electrónicos a los encuestados entre la última semana de junio y primera semana de julio de 2020. Todas las ciudades se encontraban en cuarentena al momento de realizar el estudio. Evaluamos la diversidad dietética utilizando el Puntaje de Diversidad Dietética del Hogar (HDDS, siglas en inglés). Se recolecto información en un total de 672 hogares, después del control de calidad en gabinete y previo al análisis estadístico se analizaron los datos de 600 hogares: 281 en Lima, 212 en Arequipa y 107 en Sullana; el total de participantes fueron 2.570 residentes de las tres ciudades de Perú. Resultados: El grupo de cereales tuvo el 96,5% de consumo, las misceláneas el 77,7%, los aceites y grasas el 74,7%, y los pescados y mariscos el 52,3%. Tener mayores ingresos económicos se asoció con un HDDS significativamente más alto en comparación con aquellos que tienen menores ingresos (p<0,01). Los habitantes de Sullana tienen el puntaje de diversidad alimentaria más bajo (HDDS= 7,82), seguido por Arequipa (HDDS= 10,19) y Lima (HDDS= 10,93). Conclusiones: Las personas con menor nivel educativo, con menores ingresos económicos y residentes en Sullana tenían un Puntaje de Diversidad Dietética del Hogar más bajo.


ABSTRACT Objective: To evaluate dietary diversity among the inhabitants of the Peruvian provinces of Lima, Arequipa and Sullana during the time of isolation due to COVID-19 and to explore the associated factors. Methods: Cross-sectional study in which electronic questionnaires were applied to respondents between the last week of June and the first week of July 2020. All cities were in quarantine at the time of the study. We assessed dietary diversity using the Household Dietary Diversity Score (HDDS). Information was collected from a total of 672 households, after quality control and prior to statistical analysis, data from 600 households were analyzed: 281 from Lima, 212 from Arequipa and 107 from Sullana, representing 2,570 residents of the three Peruvian cities. Results: The group of cereals had 96.5% of consumption, miscellaneous 77.7%, oils and fats 74.7%, and fish and shellfish 52.3%. Having higher economic income was associated with a significantly higher HDDS compared to those with lower income (p<0.01). The inhabitants of Sullana have the lowest dietary diversity score (HDDS= 7.82), followed by Arequipa (HDDS= 10.19) and Lima (HDDS= 10.93). Conclusions: People with a lower educational level, with lower economic income and residents of Sullana had a lower Household Dietary Diversity Score.

20.
rev. udca actual. divulg. cient ; 25(1): e1579, ene.-jun. 2022. tab, graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1395187

ABSTRACT

ABSTRACT Quinoa (Chenopodium quinoa Wild.) is an Andean crop that originated from the Andes of South America, with great agronomic, industrial, pharmaceutical potential and also a great capacity to tolerate adverse environmental factors. In Colombia, more accurately in the Department of Nariño, Cauca, Cundinamarca and Boyacá. Shows great genetic variation, both molecular and morphological, which organization remains poorly documented. In Boyacá, there are few studies on the morphological characterization of cultivated materials, and there is no certified planting material, with farmers planting a mixture of materials. Qualitative and quantitative descriptors and principal component and cluster analyses were used to characterize the structure of the intra-population phenotypic variation in Blanca de Jericó quinoa materials grown in the Department of Boyacá. The principal component analysis explained more than 70 % of the observed variation, with the AP, LP, DP, LHS, and AHS characteristics being more variable. The cluster analysis showed grouping by characteristics, such as AP, panicle color, and the presence of pigmented axillae. Results show that the variance in morpho-phenological traits was concentrated at the intra-population, due to high variation at the inter-individual level. A more efficient selection process should be carried out to find materials or "pure" varieties with higher yields, resistance to biotic and abiotic factors, and adaptation to local conditions, which make quinoa an economically profitable crop in the Boyacá department.


RESUMEN La quinua (Chenopodium quinoa Wild.) es un cultivo andino, originario de los Andes Suramericanos, con gran potencial agronómico, industrial y farmacéutico y también con una gran capacidad para tolerar factores ambientales adversos. En Colombia, actualmente, se cultiva en los departamentos de Nariño, Cauca, Cundinamarca y Boyacá. Presenta una gran variación genética, tanto a nivel molecular como morfológica, la cual, ha sido poco documentada. En Boyacá son pocos los estudios de caracterización morfológica de materiales cultivados y no hay material de siembra certificado, por lo que los agricultores siembran una mezcla de materiales. Descriptores cualitativos y cuantitativos y un análisis de componentes principales y de agrupamiento fueron usados para caracterizar la estructura de la variación fenotípica intrapoblacional de los materiales de quinua Blanca Jericó, que son cultivados en el departamento de Boyacá. El análisis de componentes principales explicó más del 70 % de la variación observada, siendo las características más variables AP, LP, DP, LHS y AHS. El análisis clúster mostró un agrupamiento por características, tales como AP, color de la panícula y presencia de axilas pigmentadas. Los resultados mostraron que la variación en las características morfológicas estaba concentrada dentro de la población, debido a la alta variación, a nivel inter-individual. Se deben llevar a cabo procesos de selección más eficientes para encontrar materiales "puros" o variedades con más altos rendimientos, con resistencia a factores bióticos y abióticos y adaptados a las condiciones locales, para así hacer de la quinua un cultivo económicamente rentable para el departamento de Boyacá.

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