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1.
MedicalExpress (São Paulo, Online) ; 4(5)Sept.-Oct. 2017. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-894366

ABSTRACT

OBJECTIVE: Glioblastoma, the most common and lethal brain tumor, is also one of the most defying forms of malignancies in terms of treatment. Integrated genomic analysis has searched deeper into the molecular architecture of GBM, revealing a new sub-classification and promising precision in the care for patients with specific alterations. METHOD: Here, we present the classification of a Brazilian glioblastoma cohort into its main molecular subtypes. Using a high-throughput DNA sequencing procedure, we have classified this cohort into proneural, classical and mesenchymal sub-types. Next, we tested the possible use of the overexpression of the EGFR and CHI3L1 genes, detected through immunohistochemistry, for the identification of the classical and mesenchymal subtypes, respectively. RESULTS: Our results demonstrate that genetic identification of the glioblastoma subtypes is not possible using single targeted mutations alone, particularly in the case of the Mesenchymal subtype. We also show that it is not possible to single out the mesenchymal cases through CHI3L1 expression. CONCLUSION: Our data indicate that the Mesenchymal subtype, the most malignant of the glioblastomas, needs further and more thorough research to be ensure adequate identification.


OBJETIVO: O glioblastoma (GBM), o tumor cerebral mais comum e mais letal, é também um dos tipos de tumores de mais difícil tratamento. Análises genômicas integradas têm contribuído para um melhor entendimento da arquitetura molecular dos GBMs, revelando uma nova subclassificação com a promessa de precisão no tratamento de pacientes com alterações específicas. Neste estudo, nós apresentamos a classificação de uma casuística brasileira de GBMs dentro dos principais subtipos do tumor. MÉTODO: Usando sequenciamento de DNA em larga escala, foi possível classificar os tumores em proneural, clássico e mesenquimal. Em seguida, testamos o possível uso da hiperexpressão de EGFR e CHI3L1 para a identificação dos subtipos clássico e mesenquimal, respectivamente. RESULTADOS: Nossos resultados deixam claro que a identificação genética dos subtipos moleculares de GBM não é possível utilizando-se apenas um único tipo de mutação, em particular nos casos de GBMs mesenquimais. Da mesma forma, não é possível distinguir os casos mesenquimais apenas com a expressão de CHI3L1. CONCLUSÃO: Nossos dados indicam que o subtipo mesenquimal, o mais maligno dos GBMs, necessita de uma análise mais aprofundada para sua identificação.


Subject(s)
Animals , Sequence Analysis, DNA/methods , Glioblastoma/classification , Genes, erbB-1 , Chitinase-3-Like Protein 1/analysis
2.
São Paulo med. j ; 135(1): 57-65, Jan.-Feb. 2017. tab
Article in English | LILACS | ID: biblio-846276

ABSTRACT

ABSTRACT CONTEXT AND OBJECTIVE: Acute kidney injury (AKI) is still a headache for clinicians and scientists as a possible reason for increased death among intensive care unit (ICU) patients after invasive cardiac surgery. Furthermore, the diagnostic process for AKI using conventional biomarkers is not sufficient to ensure early warning of this condition because of the morbid influence of non-renal factors that definitively delay the time for the prognosis. These imposed limitations have led to significant amounts of research targeted towards identifying novel biomarkers for AKI with a sustained degree of sensitivity and specificity. Here, we reviewed previous studies conducted on the Klotho, CYR61 and YKL-40 biomarkers in relation to AKI. DESIGN AND SETTING: Review of the literature conducted in the Institute of Clinical Chemistry & Biochemistry, Ljubljana University Medical Center, Slovenia. METHODS: The literature was searched in PubMed and the Cochrane Library. From the database of this specialty, we selected 17 references that matched our context for detailed analysis and further investigation. RESULTS: The studies reviewed showed notable differences in their results relating to the diagnostic impact of Klotho, CYR61 and YKL-40 on early prediction of AKI. CONCLUSIONS: The results regarding the Klotho, CYR61 and YKL-40 biomarkers showed markedly equivocal performance in the previous studies and did not fulfill the expectations that these factors would form valid possible biomarkers for AKI.


RESUMO CONTEXTO E OBJETIVO: A lesão renal aguda (LRA) ainda é uma dor de cabeça para os clínicos e cientistas como possível razão para o aumento da mortalidade entre os pacientes de unidade de terapia intensiva (UTI) após cirurgia cardíaca invasiva. Além disso, o processo de diagnóstico para LRA usando biomarcadores convencionais não é suficiente para garantir um alerta precoce desta condição, devido à influência mórbida de fatores não renais que podem retardar o tempo para o prognóstico. Essas limitações geraram quantidades significativas de pesquisas orientadas para identificar novos biomarcadores para LRA com um grau adequado de sensibilidade e especificidade. Revisamos estudos anteriores realizados sobre os biomarcadores Klotho, CYR61, YKL-40 para LRA. TIPO DE ESTUDO E LOCAL: Revisão da literatura realizada no Instituto de Química Clínica e Bioquímica, Centro Médico da Universidade de Ljubljana, Eslovênia. MÉTODOS: A literatura foi pesquisada no PubMed e Cochrane Library. A partir da base de dados da especialidade, selecionamos 17 referências que combinavam com o contexto para uma análise detalhada e mais investigação. RESULTADOS: Os estudos revisados mostraram diferenças notáveis nos resultados sobre o impacto diagnóstico de Klotho, CYR61 e YKL-40 sobre a detecção precoce do LRA. CONCLUSÃO: Os resultados em relação aos biomarcadores Klotho, CYR61 e YKL-40 mostraram desempenho marcadamente equívoco nos estudos anteriores e não cumpriram as expectativas de que estes fatores constituam possíveis biomarcadores válidos para LRA.


Subject(s)
Humans , Biomarkers/analysis , Cysteine-Rich Protein 61/analysis , Acute Kidney Injury/diagnosis , Chitinase-3-Like Protein 1/analysis , Glucuronidase/analysis , Sensitivity and Specificity
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