Colicin type 7 produced by majority of Shigella sonnei isolated from Thai patients with diarrhoea

Thirty one out of 153 strains of Shigella sonnei isolated from Thai patients with diarrhoea showed antibacterial activity against S. sonnei by agar well diffusion method. All of them harbor plasmids with the genetic determination of colicin type 7 (Js) gene but without colicin E and colicin U gene. The PCR product obtained from strain 35/44 was shown to be the gene for colicin type 7 lytic protein (cja). The partially purified bacteriocin (PPB) containing colicin type 7 of strain 35/44 was prepared and used for characterization. The antibacterial activity of PPB against a total of 17 selected Gram-positive and Gram-negative bacteria was tested. It was found that PPB of strain 35/44 was active against E. coli O157, S. sonnei and S. boydii. The sensitivity of PPB from this strain to proteinase K, trypsin and α-chymotrypsin suggests the proteinaceous nature of these antimicrobial substances. Therefore, this isolated bacterium can be regarded as bacteriocin producing bacteria. The bacteriocin produced by this isolated S. sonnei was heat stable as evidenced by its ability to maintain the activity at 80 °C for 60 min. In addition, it was stable within a wide range of pH (3-9). The molecular weight of colicin type 7 from isolated S. sonnei strain 35/44 analyzed by SDS-PAGE was 54.4 kDa composing of at least five subunits. It is to our knowledge; the first report of Thai patients with diarrhoea that S. sonnei isolated from them contained colicin type 7.

Chromobacterium violaceum genome: molecular mechanisms associated with pathogenicity

Chromobacterium violaceum is a versatile, Gram-negative beta-protebacterium that grows in a variety of ecosystems in tropical and subtropical areas, such as the water and borders of the Negro River, in the Amazon region of Brazil. Although it is a saprophyte and is generally considered non-pathogenic, sporadic cases of human infection have been described, mainly in young children and in immunodeficient individuals. Although rare, infections with C. violaceum are characterized by rapid dissemination and high mortality. With the complete genome sequence of C. violaceum now available, a detailed description of the molecular arsenal required for this bacterium's remarkable versatility has been revealed. Most importantly, a more detailed picture of its biotechnological properties, including the characteristic violacein pigment, has emerged. The complete genome sequence also enabled us to make a thorough examination of the repertoire of genes encoding probable virulence factors, which determine the potential for pathogenesis. We described a number of genes involved in infectious processes, such as host cell adhesion, [quot ]contact-dependent secretion[quot ] of factors that promote cell invasion, as well as other virulence factors, such as cytolytic proteins. We also described genes involved with the synthesis of lipopolysaccharides and proteoglycan, known to elicit the synthesis of pro-inflammatory cytokines and involved in the detoxification process, which may contribute to the evasion of the bacteria from the host immune response

Conocimiento y posibles aplicaciones del estudio de las colicinas / Knowledge and possible aplications of the study of colicins

Las colicinas son sustancias proteicas con actividad bactericida, producidas por miembros de la familia Enterobacteriaceae y que presentan un espectro de acción limitado únicamente a especies de la misma familia. El estudio de las colicinas data desde 1925, aunque su primera clasificación, basada en sus propiedades químicas, físicas y biológicas, fue la realizada en 1948 por Frédériq. Posteriormente, Davies y Reeves en 1975 las dividieron en dos grandes grupos: A y B, de acuerdo con los diferentes patrones de resistencia obtenidos para una serie de mutantes resistentes a cada una de las colicinas conocidas. Se demostró que las mutatantes de resistencia a colicinas del grupo A nunca son resistentes a colicinas del grupo B, y viceversa. Actualmente se han hecho avances notables en el conocimiento del modo de acción de las colicinas. En efecto, se ha determinado que las colicinas pueden actuar en tres formas diferentes: 1) aquellas que actúan específicamente en la membrana celular, induciendo canales dependientes de diferencias de voltaje; 2) las que presentan actividad endonucleolítica, y 3) el caso especial de la colicina M, que es capaz de inhibir específicamente la síntesis de mureína. En general, se ha determinado que el efecto bactericida de las colicinas en las células sensibles precisa de tres partes de la molécula: 1) la unión específica de la colicina con su receptor en la membrana celular externa, que requiere de la parte central de la proteína; 2) la parte -NH2 terminal de la colicina, la cual es necesaria para que ésta atraviese la membrana celular, y 3) la parte -COOH terminal, que es indispensable para el reconocimiento de la colicina con su blanco específico. Las colicinas están codificadas en plásmidos; se han localizado varios de los genes involucrados tanto en la producción de la colicina, como de la proteína de liberación, así como de la proteína que le confiere inmunidad a la célula portadora de dicho plásmido. Los genes estructurales que codifican para dichas proteínas están bajo el control del regulón SOS, que se encuentra reprimido por la proteína LexA. El conocimiento de los plásmido colicinogénicos (factores col+) ha facilitado el desarrollo de la biotecnología, debido a que son multicopia y autorreplicables, por lo que son empleados como vectores de clonación en diferentes estudios del DNA. No obstante el uso más frecuente del conocimiento del fenómeno de colicinogenia en diferentes partes del mundo, ha sido en estudios epidemiológicos Así, se ha establecido que la frecuencia de cepas colicinogénicas es mayor entre los aislados de individuos enfermos, en comparación con los obtenidos de individuos sanos de la misma especie y de la misma ubicación geográfica. Por su parte, la colicina V ha sido ampliamente reconocida como un marcador de patogenicidad entre cepas de Escherichia coli, mientras que la colicina E1 se ha identificado frecuentemente entre sujetos sanos. Por otro lado, a pesar de que las colicinas se han detectado desde hace más de setenta y cinco años, aún no se conocen los efectos biológicos que puedan tener sobre el hospedero humano portador de cepas colinogénicas. Consecuentemente, para establecer si las colicinas pueden conferir alguna ventaja no sólo a las cepas productoras, sino también al hospedero, se requieren aún numerosos trabajos de investigación biomédica