Mycobacteriophages as versatile tools for genetic manipulation of mycobacteria and development of simple methods for diagnosis of mycobacterial diseases / Micobacteriófagos como herramientas versátiles para la manipulación genética y el desarrollo de métodos simples para el diagnóstico de enfermedades micobacterianas

Tuberculosis, caused by Mycobacterium tuberculosis, is responsible for over two million deaths per year worldwide. Due to its long doubling time (18 h), the microbiological detection of M. tuberculosis by conventional methods takes up to one month, unless the number of bacilli in the biological sample is high enough. Thus, drug resistance assessment requires at least one month for obtaining the primary culture and another month to determine its susceptibility to antimycobacterial drugs. Moreover, for a long time, the lack of genetic tools for mycobacteria has been a barrier for undertaking studies aimed at understanding the mechanisms of drug resistance and drug target identification, being all these topics of utmost importance considering the increase in the number of drug-resistant clones and the few therapeutic options available. Mycobacteriophages are promising as a novel source of genetic elements for mycobacteria manipulation, as well as for the development of versatile, simple, fast and cheap methods for drug resistance assessment of M. tuberculosis clinical isolates. We herein describe the background related to the use of mycobacteriophages, with emphasis placed on their utilization for drug resistance analysis in our country.

La tuberculosis, enfermedad causada por el bacilo Mycobacterium tuberculosis, es responsable de más de dos millones de muertes anuales en el mundo. Debido a su largo tiempo de duplicación (18 h), la detección bacteriológica de M. tuberculosis por métodos convencionales necesita de un mes o aun más, a menos que el número de bacilos en la muestra clínica sea suficientemente alto. Por consiguiente, se necesita un mínimo de dos meses para determinar la resistencia de este microorganismo a las drogas antituberculosas: uno para obtener el cultivo primario y otro para ensayar la sensibilidad frente a aquellas. La falta de herramientas para la manipulación genética de micobacterias ha dificultado la identificación de los blancos de acción de las drogas y el estudio de los mecanismos de resistencia a éstas, tópicos de la mayor relevancia dado el aumento mundial del número de aislamientos clínicos multirresistentes y las pocas opciones terapéuticas disponibles. Los micobacteriófagos son considerados nuevas herramientas para la manipulación de las micobacterias, así como para el desarrollo de métodos simples, rápidos y económicos para determinar la sensibilidad a drogas de los aislamientos clínicos de M. tuberculosis. En esta revisión se describen los antecedentes del uso de micobacteriófagos con énfasis en su utilización para el análisis de resistencia a drogas antituberculosas en nuestro país.

Trends in multidrug-resistant tuberculosis: [review]

Multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB) is an increasing global problem. The extent and burden of MDR-TB varies significantly from country to country and region to region. Globally, about three per cent of all newly diagnosed patients have MDR-TB and the proportion is higher in patients who had previously received anti-tuberculosis (anti-TB) treatment reflecting the failure of programs designed to ensure complete cure of patients with tuberculosis. The management of MDR-TB is a challenge that should be undertaken by experienced clinicians at centers equipped with reliable laboratory services and implementation of DOTS-Plus strategy.

Rapid detection of rifampicin susceptibility of mycobacterium tuberculosis in sputum specimens by mycobacteriophage assay

To evaluate the performance of FASTPlaqueTB-RIF TM, a newly introduced bacteriophage assay for rapid detection of rifampicin susceptibility of Mycobacterium tuberculosis in sputum specimens. A comparative study of 40 sputum specimens from patients of pulmonary tuberculosis, using FASTPlaqueTB-RIF TM and Bactec 460 TB system carried out at the Armed Forces Institute of Pathology, Rawalpindi between September and November 2001. Of the 40 clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis tested for rifampicin [RIF] susceptibility using the Bactec 460 TB system, 28 isolates were resistant to RIF and 12 isolates were susceptible. FASTPlaqueTB-RIF TM identified 24 specimens as resistant to RIF. Three specimens that revealed susceptible isolates on Bactec 460, were resistant by FASTPlaqueTB-RIF' while four specimens which revealed resistant isolates on Bactec 460, demonstrated susceptibility to RIF by FASTPlaqueTB-RIF TM. The sensitivity and specificity of FASTPlaqueTB-RIF TM were 86% and 73% respectively. The predictive values of positive and negative tests were 0.89 and 0.67 respectively. The overall accuracy of the technique was 82%. The phage assay took 48 hours to perform. Early detection of rifampicin resistance by the mycobacteriophage technique direct from sputum specimens is a potentially useful new test which would allow decision regarding appropriate therapy to be made early thus having a positive impact on patient care and on prevention of spread of MDR TB

Tuberculosis y SIDA en México / Tuberculosis and AIDS in Mexico

La tuberculosis continúa representando un problema importante en México y de acuerdo con las cifras notificadas ha ocurrido un exceso en el número de casos esperados en los últimos años, principalemente en adultos jóvenes de ambos sexos; se estima la tasa en 51.7 casos por 100 000 habitantes. En los pacientes con SIDA ocupa el tercer lugar como entidad infecciosa, depués de candidiasis y neumonía por P. carinii. De los 19 352 casos de SIDA notificados hasta julio de 1994, 8.3 por ciento de los pacientes presentó tuberculosis como manifestación inicial. De acuerdo con las encuestas centinela llevadas a cabo entre 1990-1994 en 17 entidades federativas en pacientes tuberculosos, la prevalencia de infección por VIH es de 3.1 por ciento (rango = 0 a 6.5 por ciento) en 1 187 pacientes del sexo masculino y de 1 por ciento (rango = 0 a 2.3 por ciento) en 886 del sexo femenino. Se describen los resultados de los estudios de investigación epidemiológica llevados a cabo en el campo de la prevención de la tuberculosis, así como las características de drogosusceptibilidad de las cepas de M. tuberculosis aisladas en estos pacientes. Finalmente se discuten las perspectivas de prevención y control

La tuberculosis continúa representando un problema importante en México y de acuerdo con las cifras notificadas ha ocurrido un exceso en el número de casos esperados en los últimos años, principalmente en adultos jóvenes de ambos sexos; se estima la tasa en 51.7 casos por 100 000 habitantes. En los pacientes con SIDA ocupa el tercer lugar como entidad infecciosa, después de candidiasis y neumonía por P. carinii. De los 19 352 casos de SIDA notificados hasta julio de 1994, 8.3% de los pacientes presentó tuberculosis como manifestación inicial. De acuerdo con las encuestas centinela llevadas a cabo entre 1990-1994 en 17 entidades federativas en pacientes tuberculosos, la prevalencia de infección por VIH es de 3.1% (rango=0 a 6.5%) en 1 187 pacientes del sexo masculino y de 1% (rango=0 a 2.3%) en 886 del sexo femenino. Se describen los resultados de los estudios de investigación epidemiológica llevados a cabo en el campo de la prevención de la tuberculosis, así como las características de drogosusceptibilidad de las cepas de M. tuberculosis aisladas en estos pacientes. Finalmente se discuten las perspectivas de prevención y control.

Micobacterioses em pacientes portadores da síndrome da imunodeficiência adquirida: importância de uma investigação sistemática / Mycobacteriosis in patients with acquired immunodeficiency syndrome: the importance of systematic research

Com o objetivo de demonstrar a importância da investigação sistemática de micobactérias em pacientes com SIDA, independente dos sintomas apresentados, a autora pesquisou a presença de Mycobacterium tuberculosis e micobactéria atípica em materiais obtidos em três sitios: pulmão (escarro espontâneo ou induzido), urina e medula óssea. Para tal, realizou um estudo transversal em 24 pacientes com SIDA, internados em um hospital público de Salvador. 12 pacientes (50%) tiveram diagnóstico de micobacteriose: através da cultura foi identificado um paciente (4%) com uma associação de micobactérias atípicas e seis (25%) com Mycobacterium tuberculosis. Cinco pacientes (21%) apresentaram positividade apenas à baciloscopia, que correspondiam provavelmente ao Mycobacterium tuberculosis. Para a obtenção de secreção das vias aéreas inferiores nos pacientes que não expectoraram espontaneamente para três amostras, foi utilizada a técnica da indução do escarro através da nebulização com solução hipertônica, o que levou a um acréscimo de 8% no diagnóstico de micobacteriose. No entanto, a obtenção de secreção com esta técnica só ocorreu nos pacientes com anormalidade clinica do aparelho respiratório, sendo improdutiva a sua utilização naqueles pacientes sem alteração deste aparelho. A pesquisa em sitios extra-pulmonares de fácil acesso, através da urocultura e do aspirado de medula óssea, acrescentou mais 17%, cada exame, ao diagnóstico de micobacteriose. Quando analisados em associação ao escarro induzido, acrescentaram 25% ao número de casos diagnosticados. A presença de poucos bacilos foi uma constante em todas as amostras dos pacientes com exames positivos, o que evidenciou a importância da obtenção de amostras seriadas do escarro para aumentar a chance de diagnóstico de micobactéria pulmonar. Neste estudo, foram ainda observados aspectos clinicos, concluindo-se que micobactérias devem ser pesquisadas em todos os pacientes que expectorem espontaneamente ou...