ABSTRACT
The Neotropical otter is one of the least known otter species, and it is considered to be threatened to various degrees throughout its geographic range. Little information exists on the ecological characteristics of this species, and no genetic study has been published about it until now, hampering the design of adequate conservation strategies for its populations. To contribute with genetic information to comprehensive conservation efforts on behalf of L. longicaudis, we characterized the molecular diversity of the 5 portion of the mtDNA control region in samples from this species collected in Southern and Southeastern Brazil. The sequence analysis revealed a high level of haplotype diversity (h = 0.819; SE = 0.0052) and nucleotide variability ranging from 0.0039 to 0.0067. One of the sampled haplotypes was the most common in both regions and, from this sequence, several other (locally occurring) haplotypes could be derived by single point mutations. No significant genetic differentiation was observed between the Southern and Southeastern regions.
A lontra Neotropical é uma das espécies de lontras menos conhecidas e apresenta diferentes graus de ameaça ao longo de sua distribuição geográfica. Pouca informação existe a respeito de aspectos ecológicos desta espécie e nenhum estudo genético foi publicado até o momento, dificultando a delimitação de estratégias adequadas de conservação para suas populações. Para contribuir com informação genética aos esforços de conservação de L. longicaudis, a diversidade molecular da porção 5 da região controladora do DNA mitocondrial foi caracterizada em amostras desta espécie coletadas nas regiões Sul e Sudeste do Brasil. A análise das seqüências revelou um alto nível de diversidade haplotípica (h = 0,819; SE = 0,0052) e variabilidade nucleotídica entre 0,0039 a 0,0067. Um dos haplótipos encontrados foi o mais comum em ambas as regiões e, desta seqüência, diversos outros haplótipos (de ocorrência restrita) podem ter se derivado através de mutações pontuais. Nenhuma diferenciação genética significante foi observada entre as regiões Sul e Sudeste.
Subject(s)
Animals , DNA, Mitochondrial/genetics , Genetic Variation , Otters/genetics , Base Sequence , Brazil , DNA Primers , Geography , Haplotypes/genetics , Molecular Sequence DataABSTRACT
The giant otter (Pteronura brasiliensis) is an aquatic mammal of the Mustelidae family, endemic to South America. Its original distribution corresponds to the region from the Guyanas to Central-North Argentina, but it is extinct or on the verge of extinction in most of its historical range. Currently, the species is considered endangered by the World Conservation Union (IUCN). Based on its geographic distribution in the South American continent and on some morphological characters, two subspecies were suggested: P. brasiliensis brasiliensis, occurring in the Amazon and Orinoco River Basins, and P. brasiliensis paranensis, in the Paraná and Paraguai River Basins. However, there is no consensus on assuming this subspecies division and no detailed studies have been carried out to elucidate this question. This study aims to evaluate the genetic diversity and population structure of Pteronura brasiliensis along its range in Brazil to check the possibility of the existence of two distinct subspecies using also a reciprocal monophyly criterion. We analyzed the control region, and the Cytochrome b and Cytochrome c Oxidase subunit I genes of the mitochondrial DNA in several giant otter populations from the Amazon and Paraguai River Basins. Analyses have indicated some degree of geographic correlation and a high level of inter-population divergence, although the subspecies division is not highly supported. As we observed strong population structure, we cannot rule out the existence of further divisions shaping the species distribution. The results suggest that a more complex population structure occurs in P. brasiliensis, and the conservation practice should concentrate on preserving all remaining local populations.
A ariranha (Pteronura brasiliensis) é um mamífero aquático da família Mustelidae, endêmico da América do Sul. Sua distribuição original se estendia desde as Guianas até o centro-norte da Argentina, mas está extinta ou à beira da extinção na maior parte de sua distribuição histórica. Atualmente a espécie é considerada como ameaçada de extinção pela World Conservation Union (IUCN). Em função de sua distribuição no continente sul-americano e de algumas características morfológicas, duas subespécies foram sugeridas: P. brasiliensis brasiliensis, com ocorrência nas bacias do Amazonas e Orinoco, e P. brasiliensis paranensis, ocorrendo nas bacias dos Rios Paraná e Paraguai. Inexiste, contudo, um consenso sobre a validade da divisão em subespécies e nenhum estudo detalhado foi realizado para elucidar esta questão. Este trabalho tem o objetivo de avaliar a diversidade genética e a estrutura populacional de P. brasiliensis ao longo de sua distribuição no Brasil para verificar a existência de duas subespécies baseando-se também em um critério de monofilia recíproca. A região controle e os genes do Citocromo b e da Subunidade I da Citocromo c Oxidase do DNA mitocondrial foram analisados em diversas populações de ariranha que ocorrem nas bacias dos rios Amazonas e Paraguai. As análises indicaram um grau moderado de correlação geográfica e um alto nível de divergência inter-populacional, embora a divisão em subespécies não seja bem sustentada. Como uma forte estruturação populacional foi observada, não é possível descartar a existência de outras subdivisões nesta espécie. Os resultados indicam a presença de uma estrutura populacional mais complexa em P. brasiliensis, o que implica que medidas de conservação deveriam concentrar seus esforços preservando todas as populações locais remanescentes.