Efecto combinado de la interacción genética sobre el desarrollo del bocio nodular con tiroiditis autoinmune y adenoma tiroideo en los habitantes de Bucovina del Norte / Combined effect of gene-gene interaction on the development of nodular goiter with autoimmune thyroiditis and thyroid adenoma in the inhabitants of Northern Bukovyna

ABSTRAC This article presents the results of a comprehensive analysis of the combined influence of genetic polymorphisms associated with various links of apoptosis regulation (BCL-2, CTLA-4 and APO-1/Fas) on the development of nodular goiter with autoimmune thyroiditis and thyroid adenoma in the studied population. The analysis was performed using the Multifactor Dimensionality Reduction (MDR) method by calculating the prediction potential. Graphic models of gene-gene interaction with the highest cross-validation consistency created by the MDR method showed complex "synergistic or independent" impact of polymorphic loci of the CTLA-4 (+49G/A), Fas (-1377G/A) and BCL-2 (63291411 A>G) genes on the onset of thyroid pathology in general, or its individual types (nodular goiter with autoimmune thyroiditis and thyroid adenoma) in the population of Northern Bukovyna.

RESUMEN Este artículo presenta los resultados de un análisis exhaustivo de la influencia combinada de polimorfismos genéticos asociados a diversos enlaces en la regulación de la apoptosis (BCL-2, CTLA-4 y APO-1/FAS) sobre el desarrollo de bocio nodular con tiroiditis autoinmune y adenoma tiroideo en la población estudiada. Para ello, se utilizó el método de reducción de dimensionalidad multifactorial (MDR) mediante el cálculo de los potenciales de predicción. Los modelos gráficos de interacción gen-gen con la mayor consistencia de validación cruzada creada por el método MDR mostraron un complejo impacto «sinérgico o independiente¼ de los loci polimórficos de los genes CTLA-4 (+49G/A), FAS (-1377G/A) y BCL-2 (63291411A>G) en el inicio de la patología tiroidea en general, o sus tipos individuales (bocio nodular con tiroiditis autoinmune y adenoma tiroideo) en la población de Bucovina septentrional.

Métodos indicativos de estabilidade para determinação do besilato de anlodipino, nifedipino e nimodipino considerados inibidores do canal de cálcio / Determination of calcium channel blockers amlodipine besylate, nifedipine and nimodipine by stability assays

A hipertensão é uma doença crônica não transmissível e mais freqüente na população sendo o principal fator de risco para complicações cardiovasculares, tais como acidente vascular cerebral e infarto agudo do miocárdio. Na presente pesquisa estão sendo estudados os fármacos utilizados no tratamento da hipertensão mais especificamente, os bloqueadores do canal de cálcio do grupo diidropiridínicos: besilato de anlodipino, nifedipino e nimodipino. O objetivo desse trabalho foi verificar a estabilidade intrínseca dos fármacos besilato de anlodipino, nifedipino e nimodipino, para isto foram utilizadas as seguintes técnicas: testes indicativos de estabilidade utilizando as técnicas de espectrofotometria na região do Ultravioleta/Visível (UV/VIS) e Cromatografia em fase Líquida de Alta Eficiência (CLAE). Termogravimetria/ Termogravimetria Derivada (TG/DTG), Calorimetria Exploratória Diferencial (DSC), Difração de Raios X (DRX), Espectroscopia de absorção na região do Infravermelho com Transformada de Fourier (FTIR) e Microscopia Eletrônica de Varredura (MEV). Para o fármaco besilato de anlodipino (AB) pelo método de degradação forçada, analisado por espectrofotometria no UV/VIS, as condições para a análise espectrofotométrica foram metanol e água a uma proporção de (5:45 v/v) e a segunda diluição com água. A leitura foi efetuada a 364,4nm. A linearidade foi estabelecida na faixa de 40,0-65,0 µg/mL e o coeficiente de correlação foi (r) 0,9992. O método cromatográfico, mostrou o diferente comportamento das substâncias nifedipino e nimodipino diante dos meios básicos, ácido, neutro e oxidativo. As condições para a substância nifedipino foram coluna LiChrospher®100 RP-18 (5µm) Merck® fase móvel constituída por metanol e água (45:55v/v), fluxo 1.0 mL/min, tempo de retenção 5,1min, detecção UV a 234nm e vazão de 1.0 mL/min. Foi obtida uma linearidade no intervalo de 5.0-55.0 µg/mL coeficiente de correlação (r) =0,9964. E para a substância nimodipino foram coluna LiChrospher®100 RP-18 (5µm) Merck® fase móvel constituída por acetonitrila e água (55:45v/v), fluxo 1.0mL/min, tempo de retenção 5,8 min, detecção UV a 235 nm e vazão de 1.0mL/min. Foi obtida uma linearidade no intervalo de 5.0-55.0 µg/mL coeficiente de correlação (r) =0,9964. Os resultados obtidos das curvas TG/DTG e DSC mostraram o perfil da decomposição térmica das substâncias estudadas pela Calorimetria Exploratória Diferencial. A análise dos resultados de DRX e DSC mostraram que não há evidências de polimorfismo nessas substâncias. No entanto nas análises de Espectroscopia de absorção na região do infravermelho com Transformada de Fourier (FTIR) não foram encontradas diferenças significativas na matéria-prima e no padrão de referência. As análises de MEV permitiram observar a cristalinidade das substâncias estudadas

Hypertension is the most frequent non-communicable chronic disease in the population being the main factor of risk for cardiovascular complications, such as stroke and acute myocardial infarction. In this work, active pharmaceutical ingredients used to treat hypertension were studied, more specifically the blockers calcium channel dihydropyridine group: amlodipine besylate, nifedipine and nimodipine. The aim of this study was to determine the intrinsic stability of amlodipine besylate, nifedipine and nimodipine. For this purpose the following stability test techniques were used: UV/VIS spectrophotometry and chromatography Net phase High Performance. Thermogravimetry/Derivative Thermogravimetry (TG/ DTG), Differential Scanning Calorimetry (DSC), X-Ray Diffraction (XRD), Fourier Transformed Infrared absorption (FTIR) and Scanning Electron Microscopy (MEV). For drug amlodipine besylate (AB) by forced degradation method analyzed by spectrophotometry UV/VIS spectrophotometric conditions for the analysis were methanol and water at a ratio (5:45v/v) and the second dilution with water. The reading was made at 364,4nm. The linearity was established in the range of 40.0 to 65.0 mg/mL and the correlation coefficient was (r) 0.9992. The chromatographic method showed different behavior of nifedipine and nimodipine substances on the basic means, acid, neutral and oxidative. The conditions for nifedipine were LiChrospher®100 RP-18 column (5µm) Merck® mobile phase consisting of methanol and water (45:55v/v), flow 1.0 mL/min, retention time 5,1min, UV detection at 234 nm and flow of 1.0 mL/min. Linearity was obtained within the range of 5.0-55.0 mg/mL correlation coefficient (r) = 0.9964. And for nimodipine the parameters were: LiChrospher®100 RP-18 column (5µm) Merck® mobile phase consisted of acetonitrile: water (55:45v/v), flow 1.0 mL/min, retention time 5,8min, UV detection at 235nm and flow of 1.0 mL/min. The linearity was obtained within the range of 5.0- 55.0 mg/mL correlation coefficient (r) = 0.9964. The results of TG/DTG and DSC curves presented the profile of the thermal decomposition of the substances studied by DSC. The results of XRD and DSC presented no evidence of polymorphism in these analyzes, however, according to analyzes of absorption spectroscopy in the infrared (FTIR) there were no significant differences in the raw materials and standard reference. SEM analyzes allowed to observe the crystallinity of the studied substances

Genetics and sport performance: current challenges and directions to the future

In recent years there has been a great progress in molecular biology techniques, which has facilitated the researches on influence of genetics on human performance. There are specific regions of DNA that can vary between individuals. Such variations (i.e., polymorphisms) may, in part, explain why some individuals have differentiated responses to certain stimuli, including the responses to sports training. In a particular sport, the presence of specific polymorphisms may contribute to high levels of performance. Since 1998, several polymorphisms have been associated with athletic phenotypes; however the accumulation of information generated over these 15 years shows that the influence of genetics to sport is extremely complex. In this review, we will summarise the current status of the field, discussing the implications of available knowledge for the practice of professionals involved with the sport and suggesting future directions for research. We also discuss topics related to the importance of polygenic profile characterization of athletes, methods for the identification of new polymorphisms associated with physical performance, the use of genetic testing for predicting competitive success, and how crucial is the genetic profile for the success athletes in competition.

Effects of R219K polymorphism of ATP-binding cassette transporter 1 gene on serum lipids ratios induced by a high-carbohydrate and low-fat diet in healthy youth

BACKGROUND: Diets are the important players in regulating plasma lipid profiles. And the R219K polymorphism at the gene of ATP-binding cassette transporter 1(ABCA1) was reported to be associated with the profiles. However, no efforts have been made to investigate the changes of lipid profiles after a high-carbohydrate and low-fat diet in different subjects with different genotypes of this polymorphism. This study was to evaluate the effects of ABCA1 R219K polymorphism on serum lipid and apolipoprotein (apo) ratios induced by a high-carbohydrate/low-fat (high-CHO) diet. After a washout diet of 54.1% carbohydrate for 7 days, 56 healthy young subjects (22.89 ± 1.80 years old) were given a high-CHO diet of 70.1% carbohydrate for 6 days. Height, weight, waist circumference, hip circumference, glucose (Glu), triglyceride (TG), total cholesterol (TC), high density lipoprotein cholesterol (HDL-C), low density lipoprotein cholesterol (LDL-C), apoA-1 and apoB-100 were measured on the 1st, 8th and 14th days of this study. Body mass index (BMI), waist-to-hip ratios (WHR), log(TG/HDL-C), TC/HDL-C, LDL-C/HDL-C and apoA-1/apoB-100 were calculated. ABCA1 R219K was analyzed by a PCR-RFLP method. RESULTS: The results indicate that the male subjects of all the genotypes had higher WHR than their female counterparts on the 1st, 8th and 14th days of this study. The male K carriers had higher log(TG/HDL-C) and TC/HDL-C than the female carriers on the 1st and 14th days, and higher LDL-C/HDL-C on the 14th day. When compared with that on the 8th day, TC/HDL-C was decreased regardless of the genotypes and genders on the 14th day. Log(TG/HDL-C) was increased in the males with the RR genotype and the female K carriers. Lowered BMI, Glu and LDL-C/HDL-C were found in the male K carriers, but only lowered BMI in the female K carriers and only lowered LDL-C/HDL-C in the females with the RR genotype. CONCLUSIONS: These results suggest that ABCA1 R219K polymorphism is associated differently in males and females with elevated log(TG/HDL-C) and decreased LDL-C/HDL-C induced by the high-CHO diet.

Polimorfismos genéticos da kappa-caseína e da beta-lactoglobulina e produção de leite em bovinos / Kappa-casein and beta-lactoglobulin genetic polymorphisms and milk yield in bovines

As variantes gênicas da beta-lactoglobulina (β-LG) e da kappa-caseína (κ-CN) bovinas são associadas à produção, qualidade e características de processamento do leite. O objetivo deste trabalho foi analisar as frequências dos genótipos AA, AB e BB, por meio da técnica de PCR-RFLP, da β-LG e da κ-CN bovinas, e suas associações com a produção de leite (kg leite/dia) em bovinos das raças Girolanda, Holandesa e Jersey. Para a κ-CN, a frequência do genótipo AA foi maior nos animais das raças Holandesa (37%) e Girolanda (63%). Na raça Jersey, houve predomínio do genótipo BB (60%). Para a β-LG, o genótipo AB foi o mais encontrado nas raças Girolanda (54%) e Holandesa (58%), enquanto nos animais da raça Jersey houve predomínio do genótipo BB (45%). Houve associação do alelo B da κ-CN com maior produtividade leiteira nas raças Girolanda e Holandesa, e do alelo A da β-LG com maior produtividade de leite na raça Jersey. As variantes genéticas da κ-CN podem ser usadas como marcadores na seleção para a produtividade leiteira nas raças Girolanda e Holandesa. Para a raça Jersey, as variantes da β-LG seriam mais adequadas para essa seleção.

Bovine beta-lactoglobulin (β-LG) and kappa-casein (κ-CN) genic variants are associated with productivity, quality and processing features of milk. The objective of this study was to analyze through the PCR-RFLP technique, the frequency of AA, AB and BB genotypes of bovine β-LG and κ-CN, and their association to milk production (kg milk/day) in Girolanda, Holstein and Jersey cattle. For κ-CN, the frequency of the AA genotype was higher in Holstein (37%) and Girolanda (63%), while there was a predominance of the BB genotype in Jersey (60%). For β-LG, the BB genotype was the most found in Girolanda (54%) and Holstein (58%), while there was a predominance of the BB genotype (45%) in Jersey. There was a positive association between B allele of κ-CN and milk production in the Girolanda and Holstein cattle and between A allele of β-LG and milk production in the Jersey cattle. Genetic variants of κ-CN could be used as markers for the selection for productivity in Girolanda and Holstein cattle. The genetic variants of β-LG would be more appropriate for this selection in the Jersey breed.

Identificación de polimorfismos en RXam2, un gen candidato de resistencia a la bacteriosis vascular de yuca / Identification of polymorphisms in RXam2 a cassava bacterial blight resistance gene candidate

La yuca se constituye en la base de la alimentación para más de mil millones de personas en el mundo. Una de las principales enfermedades de la yuca y que podría comprometer la seguridad alimentaria es la bacteriosis vascular ocasionada por la bacteria Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). El gen candidato de resistencia RXam2 codifica para una proteína con dominios NBS (Nucleotide Binding Site) y LRR (Leucine Rich Repeats) y colocaliza con un QTL (Quantitative Trait Loci) que explica el 61.6% de la resistencia a la cepa CIO151 de Xam. En este trabajo se secuenció parcialmente el gen RXam2 en tres variedades de yuca: MCOL2246, TMS60444 y SG107-35 con el objetivo de tener una visión preliminar del grado de polimorfismos tipo SNP (Single Nucleotide Polymorphism) que se presenta en este gen. La región secuenciada incluye 507 pb de la región promotora y 1309 pb de la secuencia codificante. Se logró identificar 5 y 31 SNPs al interior de las variedades MCOL2246 y TMS60444, respectivamente. Al mismo tiempo el número de SNPs entre las variedades fue de 44, 34 y 23 para MCOL2246-TMS60444, TMS60444-SG107-35 y MCOL2246-SG107-35, respectivamente. El mayor número de SNPs estuvieron localizados en la región -500 a -300 pb que corresponden a un fragmento de la región promotora del gen, aunque también se identificó un importante número de polimorfismos en la región codificante. Este estudio permitirá identificar el número de polimorfismos en este gen en un mayor grupo de variedades de yuca con el fin de asociar estos polimorfismos con el fenotipo de resistencia/susceptibilidad.

Cassava is a staple food for more than a billion people. One of the major diseases of cassava which could compromise food security is known as cassava bacterial blight, caused by the bacterium Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (Xam). The RXam2 resistance gene candidate encodes a protein with Nucleotide Binding Site and Leucine Rich Repeats domains, and colocalizes with a QTL (Quantitative Trait Loci) that accounts for 61.6% of the resistance to the Xam strain CIO151. In this work we sequenced 1816 bp corresponding to a partial sequence of this gene in three cassava varieties with the aim of having a preliminary overview of the degree of Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs). The sequenced regions included 507 bp of the promotor and 1309 bp of the coding sequence. It was possible to identify five and 31 intravarietal SNPs in MCOL2246 and TMS60444, respectively. In addition, the number of SNPs between varieties was 44, 34 and 23 for MCOL2246-TMS60444, TMS60444-SG107-35 and MCOL2246-SG107-35, respectively. The largest number of SNPs was located in the promoter region -500 to -300 bp. This study may help to develop alternatives to identify SNPs in a more diverse group of cassava varieties, and possibly associate them with resistance/susceptible phenotypes.

Estudio del polimorfismo genético de las células de la médula ósea y del sistema nervioso central de ratas mediante la técnica de RAPD / Study of genetic polymorphism of the bone marrow and the central nervous system of rats cells by RAPD technique

Los modelos experimentales en rata han sido de gran utilidad en las evaluaciones terapéuticas o de reemplazo de células en enfermedades neurodegenerativas. Se ha comprobado que las células de la médula ósea (CMO) de ratas pueden diferenciarse en células que no forman parte de sus linajes normales. Hay evidencias de estos procesos de trans-diferenciación, pero aún no se conocen los mecanismos moleculares que activan estos procesos. El propósito de nuestro trabajo fue estudiar el polimorfismo genético del ADN de los tipos celulares que conforman las CMO y las células del sistema nervioso central (SNC), estríatales y de la corteza de ratas mediante la técnica de RAPD. Las CMO, las células mononucleares (CMMO), las células estromales (CEMO) y las del SNC fueron obtenidas de ratas, y su ADN genómico fue purificado y amplificado mediante la técnica de RAPD, utilizando 15 cebadores al azar. Se construyó un dendograma de las bandas de amplificación generadas utilizando el método de UPGMA. Las células estudiadas según el análisis del RAPD quedaron en 2 grupos bien definidos, pudiéndose diferenciar las CEMO del resto de las células estudiadas. Los cebadores OPA-6, 7 y 12, mostraron el polimorfismo genético de los linajes de células estudiadas. Mediante la técnica de RAPD se demostró la variabilidad genética entre las CEMO y las CMMO, células estriadas y de corteza que mostraron una homogeneidad genética, proponiéndose marcadores específicos de RAPD para cada grupo de células. Este es el primer estudio del polimorfismo genético de las CMO y del SNC de ratas.

Experimental models have been of grate usefulness in the therapeutic or replacement cells in neurodegenerative diseases. It has been demonstrated that bone marrow cells (BMC), can be difefferentiated in cells that do not form part of their normal lineage. There is evidence of these trans-differentiation processes in these cells, but nevertheless, molecular mechanisms that activate these differentiation process still not known. The purpose of our work was to study the genetic polymorphism of those cellular types; that conform the rat bone marrow cells (BMC) as well as those of the central nervous system (CNS), striatum cells and cortex ones, trough RAPD technique. BM, mononuclear cells (BMMC), estromal cells (BMSC) and the CNS cells were obtained from rats and genomic ADN was purified and amplified through RAPD technique, using 15 random primers. A dendogram was constructed according to UPGMA method of the amplifying RAPD bands. Studied cells as- according to the RAPD analysis- were grouped into 2 well- defined groups, as CEMO coud be differentiated from the rest of studied cells. OPA-6, 7 and 12 primers showed the genetic polymorphism of the studied lineages cells. Also will be proposed specific RAPD genetic markers. Through RAPD technique permitted the genetic variability was demonstrated betwen BMEC and BMMC of striated cells and of cortex, which demonstratd a genetic homogeneity through RAPD technique so specific genetic markers of RAPD were thus propose for each group of cells. These constitute the first study on genetic polymorphism of BMC and CNS.

Relação entre as concentrações séricas da vitamina D, polimorfismos do gene do VDR e síndrome metabólica em adultos e idosos / Relationship between serum concentrations of vitamin D, VDR gene polymorphisms and metabolic syndrome in adults individuals

Introdução - O receptor de vitamina D (VDR) é expresso em vários tecidos e quando este se encontra na sua forma ativada, modula a expressão de diversos genes. Esses incluem variações dos níveis circulantes de 1,25(OH) 2 D , variações na densidade mineral óssea, secreção e sensibilidade à insulina em resposta à glicose, suscetibilidade à diabetes tipo 1 e 2, obesidade, dislipidemias e hipertensão arterial. Atualmente, evidências têm sugerido o envolvimento da vitamina D com a síndrome metabólica. Objetivo - Investigar a concentração sérica da vitamina D e sua relação com a síndrome metabólica e avaliar a potencial associação entre estes fatores com a presença de polimorfismos no gene do receptor de vitamina D (VDR) em indivíduos adultos. Métodos - Trata-se de um estudo transversal, onde foram avaliados 372 indivíduos adultos. Foram coletadas amostras sanguíneas para dosagens laboratoriais da 25(OH)D 3 , PTH e exames bioquímicos relacionados à SM, além disso foram realizadas avaliações antropométricas (peso, altura, IMC). A síndrome metabólica (SM) foi classificada usando o critério proposto pelo National Cholesterol Education Program-Adult Treatment Panel III (NCEP-ATP III). A resistência a insulina foi estimada pelo cálculo de HOMA IR e a função da célula pelo cálculo de HOMA . A 25(OH)D foi dosada por HPLC e a insuficiência foi determinada pelo ponto de corte da curva Roc (52,6nmol/l). Foram avaliados também PTH intacto e cálcio sérico. Os polimorfismos BsmI e FokI foram detectados através da digestão das enzimas de restrições específicas para cada polimorfismo e confirmados através da técnica PCR alelo específico (ASPCR) ou amplificação de mutação refratária (ARMs) nos indivíduos com e sem SM (52 por cento vs. 48 por cento , respectivamente). A análise estatística inclui construção da curva ROC, teste T de Student, testes de correlação, teste de equilíbrio de Hardy-Weinberg, ANOVA, regressão logística binária (Odds Ratio). Estas análises foram conduzidas no software SPSS para Windows, versão 18 e p < 0,05 foi considerado significante.

Infección por Trypanosoma cruzi y polimorfismo del Citocromo B del ADN mitocondrial en Triatoma maculata de Anzoategui y Portuguesa, Venezuela / Trypanosoma cruzi infection and cytochrome b polimorphism of mitochondrial dna in Triatoma maculata of Anzoátegui and Portuguesa states, Venezuela

Con el fin de entender la dinámica poblacional de Triatoma maculata, se analizó el polimorfismo genético y los índices de infección con Trypanosoma cruzi, utilizando triatominos provenientes de ecotopos y regiones geográficas diferentes. El índice de infección parasitaria para T. maculata, fue de 29.8% a través de la observación directa al microscopio y 40.3% utilizando el método de reacción en cadena de la polimerasa. Los niveles de infección encontrados incrementan la importancia de T. maculata como vector involucrado en el ciclo de transmisión de T. cruzi. El análisis del polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción de una región del gen Cyt B, permitió establecer en forma preliminar, diferencias en los patrones de bandas de este gen, según el origen geográfico de cada población. Esto puede asociarse a cambios relacionados con procesos adaptativos involucrados en la colonización de nuevos hábitats. No se observó variación genética para vectores capturados en diferentes ecotopos de una misma localidad. Sin embargo es evidente la participación del vector en el ciclo de transmisión, mostrando que la presencia de T. maculata en las casas no puede ser ignorada

In order to understand more about the populational dynamics of Triatoma maculata, the genetic polimorphism and the infection indexes of Trypanosoma cruzi were analysed, using triatomine obtained from different ecotopes and geographical regions. The parasitic infection index of T. maculata was 29.8% using the microscope direct observation, and 40.3% by the polymerase chain reaction method. Both methods were important for epidemiological screening of the vectors with low potential of infection. The amplification of one region the Cyt B gene of these organisms, followed by a restriction fragments length polymorphism analysis, allowed us to establish different patterns of bands according to the geographic origin of each population, which indicates the lack of migration between individuals of Portuguesa and Anzoátegui states. These genetic differences may be associated with changes in adaptative events involved in the colonization of new habitats. The lack of polymorphism among vectors collected in different habitats of the same region showed an important genetic flow which has epidemiological implications in the risk of transmission of the disease, showing that the presence of T. maculata in houses cannot be ignored

Estudio de diversidad de accesiones de guayabo (psidium guajava L) mediante el marcador molecular ISTR / Studying the diversity of guava (psidium guajava L) accessions using ISTR molecular markers

Los estudios de variabilidad genética resultan útiles para el manejo racional del material, tanto para su conservación como para el mejoramiento. La Repetición de Secuencias Inversas Marcadas (ISTR) es una técnica basada en la PCR que permite el estudio de la diversidad genética de individuos y poblaciones; identificación de cultivares, entre otras aplicaciones. En este sentido, el objetivo del presente trabajo fue estudiar la diversidad de accesiones de guayabo empleando este marcador molecular. Para el análisis de los datos se generó una matriz de ausencia-presencia de las bandas polimórficas, a partir de la cual se desarrolló un análisis de agrupamiento basado en el coeficiente de Jaccard y el método UPGMA para la construcción del dendrograma con el programa NTSYS-pc. La evaluación de los genotipos de guayabo con el marcador ISTR generó un total de 52 bandas polimórficas, las cuales permitieron diferenciar todos los materiales evaluados, corroborando la utilidad de esta técnica para la identificación de accesiones en la especie. El análisis de agrupamiento permitió evidenciar la formación de cuatro grupos de diversidad definidos y la presencia de cuatro accesiones externas. Las diferencias encontradas en el agrupamiento de las accesiones por ISTR respecto a las obtenidas previamente por AFLP y SSR sugieren que el elegir la técnica más apropiada para determinados estudios puede resultar un proceso difícil. Los resultados discutidos en este trabajo indican la necesidad de realizar estudios integrados en el banco de germoplasma de este cultivo para lograr un manejo más racional de la base genética del mismo.

Studies about genetic variability can be useful for material rational management, as much as for conservation and breeding. The Inverse Sequence Tagged Repeats (ISTR) is a technique based on PCR, which permit the study of genetic diversity for individuals and populations; cultivars identification, within other applications. In this sense, the objective of the present work was to study guava accessions diversity using this molecular marker. For data analysis, an absence-presence matrix for polymorphic bands was generated, from which a cluster analysis was developed, based on Jaccard coefficient and UPGMA method for dendrogram construction using NTSYS-pc program. Guava genotypes evaluation with ISTR marker generated a total of 52 polymorphic bands, which permitted to differentiated all the materials evaluated, corroborating the utility of this technique for accessions identification in the specie. Cluster analysis permitted to evidence the formation of four defined diversity groups and the presence of four external accessions. The differences encountered for accessions clustering with ISTR respected to the ones obtained previously for AFLP and SSR suggest that the election of the most appropriated technique for determinate studies can result a difficult process. The results discussed in this work indicate the necessity to made integrated studies on the germplasm bank of this crop to obtain a more adequate management.

Os polimorfismos dos receptores adrenérgicos na insuficiência cardíaca: o que a genética explica? / Adrenergic receptor polymorphisms in heart failure: what can genetics explain?

A insuficiência cardíaca (IC) é uma doença complexa, onde diversos mecanismos fisiopatológicos atuam e diferentes polimorfismos genéticos estão envolvidos. O sistema adrenérgico está diretamente relacionado a esta patologia participando da auto-regulação cardiovascular, tendo papel crucial na deteriorização da função cardíaca. Os beta-bloqueadores surgiram como um grande avanço da cardiologia no tratamento da IC, no entanto a resposta medicamentosa varia para cada paciente podendo estar relacionado a diversos fatores, entre eles o genético. A determinação pela genética do desenvolvimento da IC, da resposta medicamentosa e prognóstico são questões que serão abrangidas nesta revisão.

Heart failure (HF) is a complex disease, which involves several physiopathological mechanisms and different genetic polymorphisms. The adrenergic system is directly related to this pathology, as it participates in cardiovascular autoregulation and has a crucial role in the deterioration of cardiac function. The beta-blockers appeared as a great advance in cardiology for the treatment of HF; however, the drug response varies according to each patient, as several factors are associated, such as the genetic one. This review aims at assessing the genetic involvement in the development of HF, the drug response and the prognosis.

Polimorfismos de genes de citocinas na pré-eclâmpsia / Polymorphisms of genes of cytokines in preeclampsia

A pré-eclâmpsia é uma forma de hipertensão exclusiva da gravidez, sendo uma das principais causas de morbimortalidade materna e perinatal em todo o mundo. Diversas evidências mostram que mecanismos imunológicos estão envolvidos em sua fisiopatologia. Neste contexto, a participação das citocinas parece exercer papel importante na ativação do processo inflamatório verificado na doença. Estes fatores estão presentes em todo o processo reprodutivo exercendo papéis tanto de ativação como de inibição de respostas celulares. A identificação dos genes que codificam a produção de diferentes citocinas e a possibilidade de ocorrência de polimorfismo destes genes, modulando eventualmente expressão clínica com padrões diferenciados, trouxe novas perspectivas para avaliar a participação destes mediadores na pré-eclâmpsia. Essa atualização descreve as principais citocinas relacionadas com a gestação e as pesquisas relacionadas aos polimorfismos de genes que codificam IL-10, IL-6, IFN-y, TGF-b e TNF-a na pré-eclâmpsia.

The pre-eclampsia is an exclusive form of hypertension in pregnancy, one of the major causes of fetal and maternal morbidity and mortality throughout the world. Several evidences show that immune mechanisms are involved in its pathogenesis. In this context, the participation of the cytokines seems to play an important role in the activation of the inflammatory process observed in the disease. These factors are present throughout the reproductive process playing a role in the activation as well as in the inhibition of cell answers. The genes identification that codifies the production of different cytokines and the possibility of occurrence of polymorphisms of these genes, modulating eventually clinical expression with differentiated patterns, brought new perspectives to evaluate the participation of these mediators in the preeclampsia. This updating describes the main cytokines related to the gestation and the researches related to the polymorphisms of genes that codify IL-10, IL-6, IFN-y, TGF-b e TNF-a in the pre-eclampsia.

Chromosomal variability in the wild ornamental species of Symphysodon (Perciformes: Cichlidae) from Amazon

Cytogenetic studies were conducted on three discus species which inhabit the Amazon in Brazil: Symphysodon haraldi from Manacapuru, S. aequifasciatus from Tefé and S. discus from Barcelos. All individuals showed 2n=60 chromosomes, most of them biarmed. No sexual chromosomal heteromorphism was verified. However, different karyotypic formulae, owing to the presence of subtelocentric chromosomes, were verified for S. aequifasciatus and S. discus. One of the karyotypic formulae from S. aequifasciatus (cytotype 2) differs from the others, due to one of the homologues in the first chromosome pair being significantly larger than the other. A large variability was observed toward the nucleolar organizer regions (NOR) of S. haraldi and S. aequifasciatus. Although the number of silver-stained blocks varied from 2 to 5, confirming different NOR patterns, at least seven homologue pairs were involved with NORs. In S. discus only two marks were observed, however two chromosome pairs were involved, characterizing a multiple NOR system for the three species. The heterochromatic blocks were mainly located in the pericentromeric region of all chromosomes but, in some of them, they are also located in the proximal regions, both in the short and long arms. Moreover, in the cytotype 2 from S. aequifasciatus, an interstitial heterochromatic block was observed on the long arm of the largest homologue of the first pair. A direct comparison of karyotypes from more related genera (Heros, Uaru, Mesonauta and Pterophyllum), makes it clear that a succession of chromosomal rearrangements, mainly pericentric inversions, translocations and fissions/fusions occurred resulting in the present diploid number and intraspecific karyological variability found in Symphysodon.

Estudos citogenéticos foram conduzidos em três espécies de acará-disco que habitam a Amazônia no Brasil: Symphysodon haraldi coletada em Manacapuru, S. aequifasciatus coletada em Tefé e S. discus em Barcelos. Todos os indivíduos apresentaram 2n=60 cromossomos, a maioria deles com dois braços. Heteromorfismo de cromossomos sexuais não foi detectado. Porém, diferentes fórmulas cariotípicas, devido à presença de cromossomos subtelocêntricos, foram verificadas em S. aequifasciatus e em S. discus. Uma das fórmulas cariotípicas (citótipo 2) de S. aequifasciatus difere das outras, devido a um dos homólogos do primeiro par cromossômico ser significativamente maior que o outro. Uma grande variabilidade foi observada em relação à região organizadora do nucléolo (RON) de S. haraldi e de S. aequifasciatus. Embora, o número de marcações coradas por Nitrato de Prata variou de 2 a 5, confirmando diferentes padrões de RON, pelo menos sete pares de homólogos foram envolvidos com a RON. Em S. discus foram observadas apenas duas marcas, envolvendo, contudo, dois pares de cromossomos, caracterizando um sistema de RONs múltiplas, para as três espécies. Os blocos heterocromáticos estão localizados, principalmente, na região pericentromérica de todos os cromossomos, sendo que alguns deles também foram observados em regiões próximas aos centrômeros, tanto nos braços curtos quanto nos braços longos. Além disso, no citótipo 2 de S. aequifasciatus, um bloco heterocromático foi observado, intersticialmente no braço longo do maior homólogo do primeiro par. Uma comparação direta dos cariótipos dos gêneros mais relacionados (Heros, Uaru, Mesonauta e Pterophyllum), deixa claro que ocorreu uma sucessão de rearranjos cromossômicos, principalmente inversões pericêntricas, translocações e fissões/fusões, que resultou no presente número diplóide e na variabilidade cariotípica encontrada em Symphysodon.

Novos polimorfismos no gene da obesidade em raças divergentes de suínos / Polymorphisms in the leptin gene in divergent swine breeds

Investigou-se a existência de polimorfismo no gene da leptina (gene da obesidade) entre varrões da raça nativa Piau (porco tipo banha) e matrizes mestiças de raças comerciais (Landrace/Large White e Landrace/Large White com Pietrain), selecionadas para peso e precocidade. Oito pares de primers foram desenhados a partir da seqüência disponível no GenBank (U66254), usada, neste trabalho, como seqüência de referência. Amostras de DNA foram extraídas de células sangüíneas brancas utilizando-se solução de fenol:clorofórmio, após tratamento com proteinase K. Os fragmentos gerados por amplificação da reação em cadeia da polimerase foram purificados e seqüenciados em seqüenciador automático. As seqüências de nucleotídeos, obtidas a partir do DNA das raças comerciais de suíno, apresentaram maior similaridade com a seqüência de referência, e as seqüências geradas a partir do DNA dos animais nativos divergiram de ambas em algumas posições. Dos 28 polimorfismos encontrados, oito foram observados em apenas uma das três seqüências geradas a partir do DNA das raças nativas. Doze estavam presentes em duas seqüências, e os oito polimorfismos restantes foram encontrados nos três animais nativos.

Leptin gene (obese gene) polymorphism was investigated in Piau boars (a fat, native breed) and sows from commercial strains (Landrace/Large White and Landrace/Large White by Pietrain) chosen for rapid growth and early sexual maturity. Eight pairs of primers designed using the sequence available from GenBank (access n° U66254) were identified as the reference sequence in this project. DNA samples were extracted from white blood cells using phenol:chloroform solution, after treatment with proteinase K. Fragments generated by amplification of the Polymerase Chain Reaction were purified and sequenced in an automatic sequencer. Nucleotide sequences obtained from DNA of commercial swine breeds were similar to the reference sequence; whereas sequences generated from native breed DNA diverged from the reference sequence and from domestic breed DNA. Of the 28 polymorphisms found, eight were observed in only one of the three sequences generated from DNA of native breeds. Twelve polymorphisms were present in two sequences and the eight remaining polymorphisms were found in all three categories of DNA.

Prevalência do polimorfismo G1793A da metilenotetra-hidrofolato redutase em idosos - Itajaí, (SC) / Prevalence of mthfr G 1793A polimorfism in elderly - Itajaí, (SC)

Mutações no gene da enzima 5,10-metilenotetrahidrofolato redutase (MTHFR), envolvida no metabolismo da homocisteína vêm sendo associadas à hiperhomocisteinemia e possivelmente como fator de risco para doenças vasculares. O objetivo do presente trabalho foi determinar o genótipo do polimorfismo G1793A da enzima MTHFR em 55 idosos internos no Asilo Dom Bosco (Itajaí/SC). Foram coletados 5,0 mL de sangue periférico, após jejum de 8 horas para a extração do DNA. A presença da mutação G1793A da MTHFR foi determinada através da amplificação de um fragmento do gene da enzima pela Reação em Cadeia da polimerase (PCR). A digestão do fragmento obtido com a enzima BsbrI, resultou em perfil de restrição que permitiu definir o genótipo dos pacientes. A análise molecular revelou que 2 pacientes (3,64) por cento apresentaram genótipo heterozigoto (GA); enquanto que os 53 restantes (96,36)

Association of genetic polymorphism in GH gene with milk production traits in Beijing Holstein cows.

Associations were analysed between polymorphisms of the growth hormone gene (GH-MspI) (localized in intron 3) and milk production traits of Beijing Holstein cows (a total of 543 cows). Polymerase chain reaction (PCR)-restriction fragment length polymorphism (RFLP) method was used for identification of various genotypes. Frequencies of genotypes were 0.77, 0.21 and 0.02 for A/A, A/B and B/B, respectively. The frequency of the GH A allele is 0.875. The results of the least squares means show that in all three lactations, the GH A/A cows yielded more milk (P less than 0.01 for lactation I and P less than 0.05 for lactations II and III), whereas A/B cows showed higher milk fat content than A/A individuals (P less than 0.05 for lactations I and II, and P less than 0.01 for lactation III). The A/A cows yielded more fat than A/B individuals (P less than 0.01 only in lactation I). The A/A cows yielded more milk protein than A/B individuals (P less than 0.01 for lactations I, II, and III). The A/A cows produced milk of higher protein content than of A/B individuals (P less than 0.05 only in lactation II).

A doença arterial coronariana sob o prisma da genética molecular / A genetic view of the coronary artery disease

A biologia molecular evolui de forma vertiginosa e atualmente é tida como ferramenta indispensável na compreensão de doenças complexas e multifatoriais como a doença arterial coronariana. Tal abordagem gera uma nova forma de avaliação de doenças conhecidas e propicia a criação de novas técnicas, novos métodos diagnósticos e possíveis abordagens terapêuticas, interferindo diariamente no desfecho clínico final do paciente. O número de publicações em genética cardiovascular aumentou cinco vezes nos últimos 20 anos e a descoberta de novos polimorfismos e mutações bem como marcadores de inflamação, coagulação e genes relacionados ao metabolismo lipídico contribuem para se conhecer cada vez mais os aspectos intrínsecos envolvidos na aterosclerose. Este artigo irá abordar os principais avanços nessa área, identificando os polimorfismos mais comuns e sua relevância clínica segundo grandes ensaios e meta-análises,bem como fazer um breve racional acerca do desenho atual dos ensaios clínicos em biologia molecular

Farmacogenética em cardiologia / Pharmacogenetics in cardiology

Vários fatores influenciam as respostas às drogas utilizadas em Cardiologia. Embora a interação de vários fatores torne difícil prever a resposta a drogas, o progresso científico das últimas duas décadas criou a expectativa de que se possa determinar como variações genéticas(polimorfismos) afetam as respostas às drogas. Nesta revisão, objetivamos proporcionar ao cardiologista clínico uma introdução a alguns dos principais conceitos relativos à Farmacogenética, bem como uma breve perspectiva clínica de alguns dos principais avanços recentes realiaados pela Farmacogenética na terapêutica cardiovascular. Muitas conquistas já foram feitas em estudos Farmacogenéticos relacionados a aspectos farmacocinéticos. Atualmente vários estudos enfocam aspectos Farmacogenéticos da farmacodinâmica cardiovascular. Exemplos de polimorfismos que afetam a farmacocinética das drogas utilizadas em Cardiologia incluem polimorfismos de enzimas do citocromo P450. Em particular, polimorfismos da CYP 2C9 afetam as respostas ao wafarin e aos antagonistas de receptores do tipo 1 da angiotensina II. Polimorfismos da CYP 2D6 afetam o metabolismo de vários betabloqueadores e de antiarrítmicos. Polimosfismos da CYP 3A4 afetam o metabolismo de várias estatinas e de bloqueadores de canais de cálcio. Polimorfismos do gene MDR-1, que codifica o transportador glicoproteína-P, influenciam a farmacocinética de várias drogas absorvidas no intestino, com destaque dado à digoxina. Vários outros polimorfismos relacionados a farmacodinâmica cardiovascular estão sendo estudados. Polimorfismos dos genes que codificam a enzima conversora da angiotensina e o angiotensinogênio parecem não afetar de forma consistente a resposta aos inibidores da enzima conversora da angiotensina. Polimorfismos dos receptores tipo 1 da angiotensina II e dos receptores beta-adrenérgicos modificam as respostas de seus respectivos antagonistas. Vários desafios devem ser superados para o sucesso da Farmacogenética em Cardiologia. O maior deles corresponde à validação clínica consistente de marcadores genéticos realmente capazes de prever respostas favoráveis ou toxidade a drogas

Rede ONSA e o projeto genoma humano do câncer: contribuiçäo ao genoma humano / ONSA network and the human cancer genome project: contribution to the human genome

A contribuiçäo maior da ciência brasileira ao genoma humano foi trazida pelo Projeto Genoma Humano do Câncer (Human Genome Cancer Project- HCGP) uma parceria da FAPESP e do Ludwig Institute for Cancer Research e desenvolvido por 29 diferentes laboratórios de seqüenciamento e um centro de bioinformática. Foram seqüenciados mais de 1 milhäo de fragmentos génicos expressos (expressed sequences tags, ESTs), provenientes de diferentes tumores humanos. Grande parte destes dados é de acesso público através da website do Gene Bank (www.ncbi.nim.nig.gov), mantido pelo NCBI - National Center for Biotechnology Information. Atualmente, diversos projetos estäo em desenvolvimento utilizando informações geradas no HCGP e abrangem observar a expressäo diferenciada dos genes em diferentes tumores, caracterizaçäo completa de genes específicos, assim como o estudo funcional e estrutural dos produtos protéicos. É promissora a perspectiva de que num futuro próximo, diferentes resultados provenientes destas investigações possam trazer benefícios preventivos, prognósticos e clínicos em câncer e outras doenças.