Tumor banks: the cornerstone of basic research in urology

PURPOSE: Tumor banks have the primary responsibility for collecting, cataloging, storing and disseminating samples of tissues, cells and fluids, which are used by researchers to identify diagnostic molecular markers, prognostic indicators and therapeutic targets. The objective of this review was to describe a simple, reliable and reproducible protocol for obtaining and storing samples of urological tumors. MATERIALS AND METHODS: Urogenital tumor tissues were collected by the surgeons from the Urology Division of University of Sao Paulo Medical School. The obtained surgical specimens were immediately placed in liquid nitrogen, dry ice or in a tube containing RNAlater ®, and then stored by cryopreservation (-80°C). A mirror fragment was fixed in 10 percent formalin processed routinely and embedded in Paraplast®. RESULTS: We developed a protocol for the collection, cataloging, storage, conservation and use of tumor samples. During a period of one year the Urological Tumor Bank of the Urology Division stored 274 samples of prostate, bladder, kidney, penis and testicle tumors of different histological types, 74 urine and 271 serum samples. CONCLUSIONS: Having biological materials characterized and available along with the clinical patient information provides an integrated portrait of the patients and their diseases facilitating advances in molecular biology. It also promotes the development of translational research improving methods of diagnosis and cancer treatment.

Banco de encéfalos humanos: uma ferramenta importante para o estudo do envelhecimento cerebral / Banco de encéfalos humanos: una herramienta importante para el estudio del envejecimiento del cerebro / Bank of human encephala: an important tool for the study of brain aging

Para o melhor entendimento dos processos relacionados a senescência e à senilidade cerebral, o estudo do tecido cerebral é mandatório, tanto nos seus aspectos macroscópicos quanto microscópicos, sobretudo quando os dados encontrados na análise anátomo– patológica podem ser correlacionados com as condições clínico – funcionais dos indivíduos. De modo a propiciar ferramentas para o estudo do envelhecimento cerebral, foi criado o Banco de Encéfalos Humanos do Grupo de Estudos em Envelhecimento Cerebral da FMUSP (BEHGEEC), em 2003. O presente estudo tem como objetivo descrever a experiência do GEEC na criação e implementação de um banco deencéfalos humanos com fins de ensino e pesquisa e para tanto, relata a experiência do GEEC desde sua criação até seu funcionamento, apontando os procedimentos de coleta e processamento dos casos incluídos e suas rotinas de estudo, ensino e pesquisa. Palavras-chave: Encéfalo. Bancos de tecidos. Envelhecimento.

For a better understanding of processes related to senescence and to brain senility, the study of brain tissue is mandatory, regarding both the microscopic and the macroscopic aspects, over all when data found in anatomopathological analysis may be correlated to clinical-functional conditions of individuals. In order to make available tools for the study of brain aging, the Bank of HumanEncephala of the Group of Studies in Brain Aging of FMUSP was created (BEHGEEC) in 2003. The present study aims to describe the experience of GEEC in the creation and implementation of a bank of human encephala with purposes of teaching and research and for this it narrates the experience of GEEC since its creation until its functioning, pointing to procedures of collection and processing of cases and its routines of study, teaching and research. Keywords: Brain. Tissue banks. Aging.

Para una mejor comprensión de los procesos relacionados con la senectud y con la senilidad del cerebro, el estudio del tejido del cerebro es obligatorio, respecto a los aspectos microscópicos y a los macroscópicos, sobre todo cuando los datos encontrados en el análisis anatomopatológica se pueden correlacionar a las condiciones clínico-funcionales de los individuos. Para hacer las herramientas disponibles para el estudio del envejecimiento del cerebro, el banco de encéfalos humanos del grupo de estudios en el envejecimientodel cerebro de FMUSP (BEHGEEC) fue creado en 2003. Este estudio intenta describir la experiencia de GEEC en la creación y puesta en práctica de un banco de encéfalos humanos con propósitos de enseñanza y de investigación y para esto narra la experiencia de GEEC desde su creación hasta su funcionamiento, señalando a los procedimientos de la colección y del procesamiento de casos y a sus rutinasde estudio, enseñanza y investigación.Palabras llave: Encéfalo. Bancos de tejidos. Envejecimiento.

Banco de tumores en Chile, su aporte a la investigación: resultados de un proyecto piloto / A pilot experience with a tumor bank

Background: Despite having the technical facilities and the knowledge, Chile did not have a tumor bank until recently. Aimn: To describe the results of the first three years of a tumor bank. Material and methods: All cases stored in a tumor bank from June 2004 tojune 2007 were included. Samples were frozen in isopentane, afterwards in liquid nitrogen and finally transferred to freezers at -80°C. Quality controls with DNA and RNA extraction and immunohistochemistry, were per formed. Results: In the study period, 1239 cases were collected and 79 percent were malignant tumors. In 78 percent of cases, samples from the tumor and of normal neighaboring tissue, were stored. Twenty six percent of samples were from breast cáncer and 22 percent for digestive tumors. Immunohistochemical expression ofvimentin was measured in 30 cases and the expression of Ki67 an p53 in 20 cases. Thirteen of 15 breast cáncer samples had expression of estrogen receptors. In 30 cases, DNA and RNA extraction was carried out, amplifying B-globin and B-actin. Moreover RNA was extracted from 63 gastríc cáncer, 30 colon cáncer and gallbladder cáncer samples, for specific projects. Conclusions: The creation of a tumor bank is feasible, preserving samples of high biológical quality.

Protocolo de um banco de tecidos neoplásicos / Protocol for a tumor tissue bank

Um banco de tumores com organização sistematizada das informações permite a elaboração de pesquisas em câncer com conclusões sólidas e científicas. Assim, há a necessidade de um protocolo específico, cuja principal vantagem seria a de agregar informações qualificadas sobre o doador às amostras tumorais utilizadas para a pesquisa. O objetivo deste trabalho foi desenvolver um protocolo de procedimentos simples, confiável e reproduzível, para adquirir e armazenar amostras de tumores do sistema músculo-esquelético. O planejamento deste protocolo tem como base os dados da literatura relacionada a bancos de tecidos neoplásicos, no período de 1969 a 2005. Descreve a captação, armazenamento das amostras e o histórico do doador. O banco de tumores com um protocolo eficiente permite armazenar amostras de tecido normal e neoplásico, além de registrar dados referentes a pacientes com lesões neoplásicas. Além disso, possibilita o fornecimento, aos pesquisadores em câncer, de amostras de tecido em condições ideais para a pesquisa.

A Tumor Bank with systematic organization of data allows for the carrying out of cancer research with sound and scientific conclusions. The need thus arises for a specific protocol whose main advantage would be that of adding qualified donor information to tumor samples used in research. The purpose of this study was to develop a simple, reliable, and replicable procedures protocol to acquire and store samples of musculoskeletal tumors. The basis for the planning of this protocol comprises the information gathered in the literature relating to tumor tissue banks from 1969 to 2005. The paper describes the capture, storage, and donor background. The tumor bank with an efficient protocol allows to store both healthy and neoplastic tissue, and to record information relating to patients with neoplastic lesions. Furthermore, it enables supplying tissue samples in ideal research conditions.

Estruturação de um banco de dentes humanos / Structuralization of a human teeth bank

Um Banco de Dentes Humanos (BDH) é uma instituição sem fins lucrativos, vinculada a uma faculdade, universidade ou outra instituição. Seu propósito é suprir as necessidades acadêmicas, fornecendo dentes humanos para pesquisa ou para treinamento laboratorial pré-clínico dos alunos, dessa forma eliminando o comércio ilegal de dentes que ainda existe nas faculdades de Odontologia. Cabe também ao BDH zelar pela eliminação da infecção cruzada que existe no manuseio indiscriminado de dentes extraídos. Para o bom funcionamento de um BDH, é fundamental um controle severo de seus procedimentos internos, que incluem a separação e o estoque de dentes, assim como o cadastro e o arquivamento das fichas dos doadores ou beneficiários. Aqui, abordaremos as funções que um BDH pode desempenhar e a forma pela qual hoje o Banco de Dentes Humanos da Faculdade de Odontologia da Universidade de São Paulo (FOUSP) funciona e organiza-se

Desarrollo de bancos de muestras para investigación en epidemiología molecular / Development of sample banks for research in molecular epidemiology

En los últimos años se ha implementado la metodología para el desarrollo de bancos de material genético, mediante el establecimiento de líneas celulares transformadas, la extracción directa del DNA, el almacenamiento de sangre u otros tejidos criopreservados y el estudio de muestras conservadas en bloques de parafina. Los propósitos principales para la creación de estos bancos pueden ser académicos y de investigación, principalmente relacionados con el mapeo génico o contemplar aspectos de servicio, tales como estudios familiares de ligamiento por riesgo genético, identificación en casos de medicina forense y tipificación para trasplantes. Estos desarrollos tienen muy importantes implicaciones éticas y legales y crean derechos y obligaciones por parte de los donadores y por quienes manejan los bancos de material biológico

Organización y funcionamiento del primer banco de piel en Argentina, oficialmente autorizado / Organize and function skin banks officially authorized in Argentina

Desde principios de este siglo aparecen en la bibliografía internacional publicaciones relacionadas con la conservación de piel para su empleo como homoinjertos en el tratamiento de las quemaduras graves. A partir de la década del 50 se encuentran datos referidos a la posibilidad de organizar bancos para el almacenamiento de piel. A partir de 1980 se elaboran protocolos detallados para el procesamiento, almacenaje y ulterior empleo de la piel conservada. En nuestro país, la Fundación del Quemado Fortunato Benaim ha podido concretar la instalación de un Banco de Piel que se ajusta a los requisitos internacionales y es el primero oficialmente autorizado en la Argentina por el INCUCAI, de acuerdo con las disposiciones emanadas de la Ley de Ablación de Implante de Organos y Tejidos

Banco de osso: organizaçäo e utilizaçäo clínica no Hospital das Clínicas da FMRP/USP / Bone bank: organization and clinical use in the Hospital das Clínicas of FMRP/USP

Os autores descrevem a rotina do Banco de Osso do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicna de Ribeiräo Preto da Universidade de Säo Paulo e seus primeiros resultados utilizando enxerto ósseo homólogo congelado. Os enxertos procederam de cabeças femorais obtidas durante artroplastias de quadril, das quais foram cuidadosamente retirados os remanescentes de partes moles e cartilagem e, ap[os serem divididas em quatro pedaços, foram imersas em 200ml de soro fisiológico com um grama de Jeflin e guardados em frasco estéril,s endo estocadas no congelador a - 70 graus Celsus. No dia de sua utilizaçäo, o frasco era deixado na temperatura ambiente por algumas horas. O enxerto era reduzido a pequenos fragmentos e deixado em soro fisiológico até o momento de sua aplicaçäo. No período de 1984 a julho de 1989 foram submetidos a enxertia 41 pacientes, recebendo um deles aplicaçäo bilateral (paciente 22). Os diagnósticos iniciais foram: perdas de substância = 25(57%); pseudoartrose asséptica = 7(17%); patologias congênitas = (12%); escoliose idiopática = 1(2%). Foram submetidos aos seguintes tratamentos cirúrgicos: osteossíntese = 25(60%); alongamento = 5(12%); artrose = 4(10%); curetagem de lesäo com enxertia = 8(19%). Como critériod e avaliaçäo, usamos a itegraçäo radiológica. Preenchimento da funçäo destinada era considerado bom resultado e, como mau, a näo integraçäo radiológica com reabsorçäo e falha no tratamento. Obtivemos 36(86%) bons resultados e seis (14%) maus resultados. Destes seis maus resultados, cinco foram reoperados com uso de enxerto autólogo, resolvendo o problema. Um paciente evoluiu con infecçäo o pós-operatória, sendo submetido à cirurgia de Girdlestone, obtendo cura da infecçäo. Concluímos que o Banco de Osso, nos moldes propostos, preenche os objetivos desejados, sendo de baixo custo e de fácil montagem

Banco de osso: um método simplificado / Bone banks: a simplinfied method

Os autores relatam o emprego de enxerto ósseo homólogo congelado, sua aplicaçäo como um método seguro, eficiente e de baixo custo. Baseando-se em uma metodologia convencional dos bancos de ossos, os autores salientam a viabilidade dos mesmos em locais desprovidos de maiores recursos