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2.
Rev. biol. trop ; Rev. biol. trop;60(3): 1075-1096, Sept. 2012. ilus, graf, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-659571

ABSTRACT

Soil properties and the environment have multiple outcomes on fungal communities. Although, the interaction effects between management intensity, pH, available phosphorus, organic carbon, soil texture and different fractions of water stable macro-aggregates on the communities of microscopic filamentous fungi (MFF), iron phosphate solubilizing fungi (PSF-Fe), and iron and calcium phosphate solubilizing fungi (PSF-(Fe+Ca)), have been previously evaluated in field conditions, this has never been performed in terms of their combined effects, neither with phosphate solubilizing fungi. To assess this, we collected 40 composite soil samples from eight Mexican and Colombian coffee plantations, with different management intensities and physico-chemical edaphic parameters, during 2008-2009. We isolated different communities of MFF, PSFFe and PSF-(Fe+Ca), by wet sieving and soil particles culture in Potato-Dextrose-Agar from soil samples, and we classified isolates in terms of their phosphate solubilizing ability. Following the principal component analysis results, we decided to analyze fungal communities and abiotic factors interactions for each country separately. Structural Equation Models revealed that organic carbon was positively associated to MFF richness and number of isolates (λ>0.58), but its relationship with PSF-Fe and PSF-(Fe+Ca) were variable; while the available phosphorus, pH and water stable macro-aggregate fractions did not show a clear pattern. Management intensity was negatively related to PSF-Fe (λ≤-0.21) morphotype richness and the number of isolates in Colombian coffee plantations. We found that the relationships of clay and organic carbon content, and available phosphorus and soil pH, with the species richness and number of isolates of MFF, PSF-Fe and PSF-(Fe+Ca) were highly variable; this made impossible to generalize the responses between saprotrophic fungal groups and geographic zones. The management intensity was not related to species richness and number of isolates of MFF in any coffee areas, while for PSF the relationship could not be defined. The different water stable macro-aggregates fractions did not show a defined pattern in relation to the species richness and the number of isolates of saprophytic and phosphate solubilizing fungi (PSF). This study highlights the need to take into account edaphic and geographic context in order to reach a better understanding of the intensity management effects on MFF and PSF function in agroecosystems.


El suelo y sus propiedades tienen múltiples relaciones con las comunidades fúngicas. El efecto conjunto de la intensidad de manejo y las variables edáficas, incluida la estabilidad de agregados sobre las comunidades de hongos microscópicos filamentosos (HMF), solubilizadores de fosfato de hierro (HSP-Fe) y solubilizadores tanto de fosfato de hierro como de calcio (HSP-(Fe+Ca)) no han sido evaluadas en campo. A partir de 40 muestras edáficas de ocho plantaciones de café de Colombia y México, con diferentes intensidades de manejo (IMPC) y con diferencias en sus variables edáficas, se aislaron y evaluaron las comunidades de HMF, HSP-Fe y HSP-(Fe+Ca) durante 2008-2009. Empleando modelos basados en ecuaciones estructurales se encontró que el carbono orgánico se relacionó positivamente con la riqueza y abundancia de HMF (λ>0.58) y fue variable en su relación con HSP-Fe y HSP-(Fe+Ca). Las relaciones del fósforo disponible, pH y las fracciones de macro-agregados fueron altamente variables. El IMPC se relacionó negativamente con HSP-Fe (λ≤-0.21) en cafetales colombianos. Se discuten las interacciones para cada conjunto de variables (químicas, estabilidad de macro-agregados y de manejo de plantación) y se explican las relaciones resultantes. Las relaciones de cada variable son inseparables del contexto edáfico y geográfico, los cuales imprimen marcadas diferencias.


Subject(s)
Coffee/microbiology , Fungi/metabolism , Phosphates/metabolism , Soil Microbiology , Colombia , Fungi/classification , Fungi/isolation & purification , Mexico , Solubility
3.
Hig. aliment ; 23(168/169): 180-183, jan.-fev. 2009. tab
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-549337

ABSTRACT

Ocratoxina A (OTA) é uma das mais importantes micotoxinas de interesse para a saúde humana. OTA é potencialmente nefrotóxica, teratogênica e imunotóxica, afetando particularmente o sistema renal. É produzida por três espécies principais de fungos: Aspergillus ochraceus, Aspergillus carbonarius e Penicillium verrucosum, com uma menor contribuição para Aspergillus niger. O café é produzido em países tropicais onde condições climáticas são favoráveis ao crescimento de fungos e produção de micotoxinas como OTA. Para avaliar a concentração de OTA em café torrado e moído consumido no estado de Minas Gerais (Brasil), 45 amostras foram coletadas pela Vigilância Sanitária do Estado de Minas Gerais, em 2006. A toxina foi isolada por coluna de imunoafinidade e quantificada por cromatografia líquida de alta eficiência, utilizando detector de fluorescência. (...) Os resultados revelaram que o nível de contaminação de OTA em café não foi significativa.


Subject(s)
Coffee/microbiology , Food Samples , Health Surveillance , Ochratoxins/isolation & purification , Brazil , Consumer Product Safety , Mycotoxins
4.
Neotrop. entomol ; 37(4): 436-448, July-Aug. 2008. graf, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-492706

ABSTRACT

Se realizó un estudio durante los años 2002, 2003 y 2004, con el fin de determinar la composición, la abundancia, riqueza, diversidad, equidad, ocurrencia y fluctuación temporal de las especies de saltahojas en tres zonas productoras de café de Costa Rica. Se utilizaron trampas amarillas pegajosas para clasificar y cuantificar el número de saltahojas adultos durante el período de muestreo. Se encontró un total de 82.500 individuos, pertenecientes a 139 especies ubicadas dentro de nueve subfamilias. San Isidro de León Cortés presentó la mayor diversidad entre los sitios estudiados. Veinticinco especies se encontraron frecuentemente en al menos uno de los sitios muestreados, y solamente Coelidiana sp.1, Osbornellus sp.1, Scaphytopius sp.1 y Empoasca sp. se capturaron a lo largo de todo el período de estudio. La fluctuación temporal de los taxa que comprenden los principales vectores de X. fastidiosa Wells et al. mostró diferencias entre las zonas estudiadas.


A survey was conducted during 2002, 2003 and 2004 to determine the leafhopper species composition, abundance, richness, diversity, evenness, occurrence and flight activity among three coffee production zones of Costa Rica. Yellow sticky traps were used to qualify and quantify the number of aerial leafhoppers during the sampling period. A total of 82,500 individuals, belonging to 139 species within nine leafhopper subfamilies, were trapped. San Isidro de León Cortés site presented the highest diversity from the three surveyed sites. Twenty five species were frequently trapped at least in one of the studied zones, and only Coelidiana sp.1, Osbornellus sp.1, Scaphytopius sp.1 and Empoasca sp. were trapped throughout the sampling period. The flight activity of the taxa that contain the main vectors of Xylella fastidiosa Wells et al. showed differences among the sampling zones.


Subject(s)
Animals , Coffee , Hemiptera/classification , Costa Rica , Coffee/microbiology , Coffee/parasitology , Crops, Agricultural/microbiology , Crops, Agricultural/parasitology , Flight, Animal , Hemiptera/microbiology , Population Density , Plant Diseases/microbiology , Plant Diseases/parasitology , Species Specificity , Xylella
5.
Hig. aliment ; 22(159): 99-104, mar. 2008. tab, graf
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-495423

ABSTRACT

O Brasil ocupa historicamente a posição de maior produtor e exportador de café verde do mundo (1,37 milhões de toneladas métricas de café em 2003, segundo a FAO, 2005).Existe atualmente uma forte demanda por cafés especiais, de bebida superior, pelos países importadores, entre eles destacam-se o Canadá, os Estados Unidos e a França, o que tem levado a busca de técnicas para produção de cafés de melhor qualidade. Sabe-se que qualidade final do grão beneficiado é resultante de vários fatores, incluindo cultivo, colheita, pós-colheita, pré-secagem, secagem, beneficiamento, armazenamento e industrialização (moagem e torração). Normalmente a etapa de pré-secagem é realizada em terreiro aberto, o que expõe o produto às condições ambientais, e completada em secadores rotativos. Nos últimos anos surgiu como alternativa o uso de estufas de lona plástica com a finalidade de proteger o produto, durante a etapa de pré-secagem, de eventuais precipitações que ocorram durante essa fase. A velocidade do ar e temperatura durante a pré-secagem são fatores fundamentais no processo que influenciam a qualidade do produto e a sua microbiota. Com base nessas considerações, o objetivo desse estudo foi comparar a pré-secagem do café em terreiro e em estufas, fechada e parcialmente aberta, avaliando as taxas de secagem em cada ambiente, a qualidade do produto seco e a microbiologia do produto...


Subject(s)
Coffee/microbiology , Food Preservation , Food Production , Food Quality
6.
Hig. aliment ; 19(131): 34-40, maio 2005. ilus, tab
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-410754

ABSTRACT

Sendo o café uma das bebidas mais consumidas no País, e dada a sua importância econômica, realizamos um trabalho de avaliação do café torrado e moído comercializado no município do Rio de Janeiro, testando assim sua qualidade; para isto, foram analisadas 23 amostras de café torrado e moído, no período de novembro de 2003 e fevereiro de 2004, provenientes de estabelecimentos comerciais do município do Rio de Janeiro. Os resultados mostraram que boa parte das amostras estavam de acordo com a legislação de alimentos vigente (Resolução RDC nº 175, de 08 de julho de 2003), (visto que a mesma não estabelece limites para fragmentos de insetos no café torrado e moído), mesmo tendo-se encontrado cerca de 226 fragmentos de insetos em 25g em uma das amostras, conforme ilustra as figuras do texto.


Subject(s)
Coffee/microbiology , Commerce , Food Analysis , Food Contamination , Insecta
7.
Neotrop. entomol ; 34(1): 77-82, Jan.-Feb. 2005. tab
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-451498

ABSTRACT

A broca-do-café, Hypothenemus hampei (Ferrari), é uma das mais importantes pragas do cafeeiro. Seu controle é realizado, na maioria das vezes, utilizando-se produtos químicos sintéticos que contaminam o meio ambiente, os alimentos e os agricultores. O fungo Beauveria bassiana é um agente natural de controle dessa praga e apresenta potencial para o controle biológico. Assim, com o objetivo de selecionar isolados de B. bassiana para o controle da broca-do-café avaliou-se a virulência de 61 isolados, originários de diversos hospedeiros e regiões geográficas. A seleção foi realizada em duas fases: na primeira fase selecionaram-se 11 isolados com mortalidade confirmada acima de 60 por cento. Na segunda fase determinou-se para os 11 isolados pré-selecionados, a CL50, taxa de esporulação (mortalidade confirmada/mortalidade total) e a produção de conídios em H. hampei. O isolado CG425 apresentou maior mortalidade total corrigida e confirmada, maior taxa de esporulação e CL50 = 2,5 x 10(6) conídios/ml e o isolado CB102, apresentou maior produção de conídios sobre os cadáveres, 11,6 x 10(6) conídios/adulto. Esses isolados apresentam potencial para serem utilizados em programas de controle biológico da broca-do-café com B. bassiana.


Hypothenemus hampei (Ferrari) (Coffee Berry Borer) is one of the most important coffee pests. Its control is carried out mainly using synthetic chemical products, which contaminate the environment, food and farmers. The entomopathogenic fungus Beauveria bassiana is a natural enemy of coffee berry borer and presents potential for biological control. With the objective to select strains of B. bassiana for the management of H. hampei, the virulence of 61 strains, from diverse hosts and geographic regions, were tested. The selection was carried out in two phases: in the first phase 11 strains, with confirmed mortality above 60 percent, were selected. In the second phase, for the 11 preselected strains, we determined: LC50, sporulation rate (confirmed mortality/total mortality) and conidia production on H. hampei cadavers. The CG425 strain presented the greater total and confirmed mortality, highest sporulation rate and CL50 = 2.5 x 10(6) conidia/ml and CB102 strain, presented highest conidia production on insects, 11.6 x 10(6) conidia/insect. These isolates present height potential to be used in biological control programs of coffee berry borer with B. bassiana.


Subject(s)
Coleoptera , Coffee/microbiology , Coffee/parasitology , Pest Control, Biological/methods
8.
Rev. biol. trop ; Rev. biol. trop;52(3): 757-764, sept. 2004. graf, ilus
Article in English | LILACS | ID: lil-501706

ABSTRACT

The coffee berry borer Hypothenemus hampei Ferrari (Coleoptera: Scolytidae) was first reported infecting Costa Rican coffee plantations in the year 2000. Due to the impact that this plague has in the economy of the country, we were interested in seeking new alternatives for the biological control of H. hampei, based on the entomopathogenic bacteria Bacillus thuringiensis. A total of 202 B. thuringiensis isolates obtained from Costa Rican coffee plantations infested with H. hampei were analyzed through crystal morphology of the crystal inclusions and SDS-PAGE of 6-endotoxins, while 105 strains were further evaluated by PCR for the presence cry, cyt and vip genes. Most of the Bt strains showed diverse crystal morphologies: pleomorphic (35%), oval (37%), bipyramidal (3%), bipyramidal and oval (12%), bipyramidal, oval and pleomorphic (10%) and bipyramidal, oval and cubic (3%). The SDS-PAGE analyses of the crystal preparations showed five strains with delta-endotoxin from 20 to 40 kDa, six from 40 to 50 kDa, seven from 50 to 60 kDa, 19 from 60 to 70 kDa, 29 from 70 to 100 kDa and 39 from 100-145 kDa. PCR analyses demonstrated that the collection showed diverse cry genes profiles having several genes per strain: 78 strains contained the vip3 gene, 82 the cry2 gene, 45 the cry1 and 29 strains harbored cry3-cry7 genes. A total of 13 strains did not amplified with any of the cry primers used: cry1, cry2, cry3-7, cry5, cry11, cry12 and cry14. Forty-three different genetic profiles were found, mainly due to the combination of cry1A genes with other cry and vip genes. The genetic characterization of the collection provides opportunities for the selection of strains to be tested in bioassays against H. hampei and other insect pests of agricultural importance.


Subject(s)
Animals , Genetic Variation , Bacillus thuringiensis/genetics , Coleoptera , Coffee , Endotoxins/genetics , Hemolysin Proteins/genetics , Bacterial Proteins/genetics , Bacterial Toxins/genetics , Bacillus thuringiensis/chemistry , Bacillus thuringiensis/ultrastructure , Coffee/microbiology , Coffee/parasitology , Pest Control, Biological , Electrophoresis, Polyacrylamide Gel , Microscopy, Electron, Scanning , Polymerase Chain Reaction
9.
Hig. aliment ; 17(107): 56-62, abr. 2003. tab
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-350940

ABSTRACT

Analisaram três marcas de café (torrado e moído) de diferentes lotes, coletadas em pontos comerciais da cidade de São Luís-MA, no decorrer do mês de março de 2001. Nas análises realizadas foram feitas as determinações microbiológicas, bromatológicas, microscópicas e metrológicas. Em conformidade com a Portaria nº01/87 da Divisão Nacional de Vigilância Sanitária de Alimentos (para as análises microbiológicas), Resolução nº 12/78 da Comissão Nacional de Normas e Padrões para Alimentos (para as análises bromatológicas, e microscópicas) e Portaria INMETRO nº 210/92 (para análise metrológica), todas as amostras encontram-se dentro dos padrões exigidos para o consumo.


Subject(s)
Coffee/microbiology , Food Quality
10.
Hig. aliment ; 16(99): 61-69, ago. 2002. ilus, tab
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-329708

ABSTRACT

Foram analisadas 26 amostras de café torrado e moído no período de novembro de 2000 a maio de 2001, provenientes de estabelecimentos comerciais de regiöes variadas. Os resultados mostraram que boa parte das amostras estavam de acordo com a legislaçäo de alimentos vigentes. Uma das matérias estranhas detectadas na maioria das amostras foram os fragmentos de insetos e quanto à sujidades pesadas, neste caso referindo-se à presença de pedaços macroscópicos de silicato, algumas amostras apresentaram resultados insatisfatórios.


Subject(s)
Coffee/microbiology , Food Contamination , Chemical Phenomena
11.
Rev. biol. trop ; Rev. biol. trop;50(1): 45-48, Mar. 2002.
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-333051

ABSTRACT

"Crespera" is an infectious disease of coffee plants that affects both the coffee production and the economy of the coffee producer countries. This disease affects morphologically the plant: long and narrow leaves with wavy borders and marginal necrosis; strong chlorosis results in drying of the leave, and leads to bad conditions of the plant. The internodes are short, producing the appearance of multiple sprouts in the axial sprout, the flowers can turn greenish, and the plant can present branches with severe symptoms, and branches without apparent symptoms at the same time. As a result, the coffee bean production decreases strikingly. The aim of this work was to determine the occurrence of the possible causative agent in the coffee plants using transmission electron microscopy. Normal and infected plants were compared looking at the leaves, central vein, lateral veins and petiole. It was determined that xylematic vessels show the presence of gram negative bacilliform bacteria (of thick-wavy walls), with dimensions of 0.3-0.5 micron diameter and 1-4 microns, length. The control plants did not show bacteria in the xylem.


Subject(s)
Gram-Negative Bacteria/isolation & purification , Coffee/microbiology , Plant Diseases/microbiology , Coffee/ultrastructure , Microscopy, Electron, Scanning
12.
Rev. bras. alergia imunopatol ; 20(1): 10-8, jan.-fev. 1997. ilus, tab, graf
Article in Portuguese | LILACS | ID: lil-209699

ABSTRACT

Os fungos basidiomicetos sao aeroalérgenos ainda pouco estudados. O basidiomiceto Hemileia vastatrix é conhecido por causar a ferrugem em plantaçoes de café. Esse fungo produz abundantes esporos anemófilos que podem alcançar alturas superiores a mil metros e propagar-se por longas distâncias na atmosfera. Um estudo preliminar no Brasil, demonstrou que a inalaçao desses esporos pode sensibilizar indivíduos que residem em regioes cafeicultoras do. Com a finalidade de demonstrar a presença de IgE específica a esse fungo e a possível relaçao com doenças respiratórias alérgicas, foram realizados testes cutâneos de leitura imediata em 378 indivíduos utilizando-se extratos de Hemileia vastatrix. Os extratos foram preparados com esporos do fungo usando-se líquido de Coca e Tris-HCl como soluçoes extratoras. Para os testes intradérmicos utilizou-se extrato na concentraçao de 0,02 mg de proteína/mL, e para os testes de punctura, na concentraçao de 2 mg/mL. Os indivíduos foram divididos em quatro grupos de acordo com a procedência (regioes cafeicultoras e nao-cafeicultoras) e a ocorrência de sintomas alérgicos, e um grupo de 50 trabalhadores rurais em fazendas de café. Observamos que houve número significantemente maior de pacientes sensibilizados no Grupo IV (atópicos de zonas cafeicultoras) em realçao aos grupos 1 e 2 (indivíduos procedentes de regioes nao-cafeicultoras). Pela técnica de "Western blotting" foi detectada IgE específica a vinte bandas protéicas do Hemileia vastatrix no soro de indivíduos que apresentaram testes positivos para este fungo. Concluímos que o basidiomiceto Hemileia vastatrix é capaz de sensibilizar o ser humano, induzindo a síntese de IgE específica, e que há maior sensibilizaçao em indivíduos atópicos residentes em regioes cafeicultoras.


Subject(s)
Humans , Male , Basidiomycota/chemistry , Coffee/microbiology , Hypersensitivity/diagnosis , Immunoglobulin E/analysis , Brazil , Incidence , Rural Workers , Skin Tests
13.
Rev. microbiol ; 26(2): 79-82, abr.-jun. 1995. tab
Article in English | LILACS | ID: lil-169842

ABSTRACT

O Laboratório da Seçäo de Química Biológica do Instituto Adolfo Lutz tem sido requisitado desde outubro de 1989 a emitir laudos de análise de ocratoxina A (OA) em café cru em gräo destinado à exportaçäo para Grécia e Líbano, pois estes países impuseram o limite máximo aceitável de 20 mg/kg de OA neste produto. Foram comparados dois métodos de análise de ocratoxina A por cromatografia em camada delgada para café cru em gräo. Um deles descrito no AOAC é específico para a determinaçäo de OA neste produto e o outro foi desenvolvido por Soares e Rodriguez-Amaya (1985) e Sabino (1989). Este último já é utilizado rotineiramente no laboratório nas análises de produtos como arroz, amendoim, mandioca, feijäo, milho e seus derivados. Neste estudo foram levados em consideraçäo os seguintes parâmetros: recuperaçäo e reprodutibilidade do método, facilidade deoperaçäo, disponibilidade de materiais, exposiçäo do analista a reagentes tóxicos, rapidez e custo para implantaçäo na rotina de análise. Os resultados experimentais demonstraram que perante um método específico e consagrado, da AOAC, o método 2 mostrou ser bom e promissor. Escolheu-se a técnica de Soares e Rodriguez-Amaya modificada por Milanez e Sabino pois revelou possuir maior simplicidade de operaçäo e menor custo


Subject(s)
Edible Grain/microbiology , Chromatography, Thin Layer , Mycotoxins/analysis , Ochratoxins/analysis , Coffee/microbiology
14.
Rev. mex. micol ; 4: 153-60, 1988. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-73678

ABSTRACT

Se cultivaron 10 cepas mexicanas de PlPleurotus ostreatus sobre pulpa de café y paja de cebada, las cuales se aislaron a partir de especímenes que crecían en forma silvestre sobre diversos substratos en al región de Xalapa. Ver. Las cepas variaron en cuanto a la producción de cuerpos fructíferos frescos y eficiencia biológicas obtenidas se registraron con la cepa INIREB-21 (138.13%) en la pulpa de café y con la cepa INIREB-26 (96.04%) en la paja de cebada. El tiempo para producir los primeros primordios de fructificación y para el desarrollo completo de los cuerpos fructíferos, fué menor en paja de cebada que en pulpa de café


Subject(s)
Hordeum/microbiology , Basidiomycota , Coffee/microbiology , Culture Media
15.
Rev. mex. micol ; 4: 317-21, 1988. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-73711

ABSTRACT

Se inocularon dos cepas del hiperparásito Verticillium lecanii (Zimm.) Viegas, aisladas de la región de Coatepec, VEracruz, sobre uredinios de Hemileia Vastatrix Berk. & Br., que se encontraban parasitando las hojas del cafeto. una primera inoculación se llevó a cabo aplicando por goteo suspensiones conidiales de las dos cepas de V. lecanii, no encontrándose diferencia significativa de patogenicidad. Se procedió a auna segunda inoculación con 3 diferentes solucicones de conidiosporas de la cepa (INIREB-87, de acuerdo al índice de esporulación po uredinio de H. vastatrix. Se logró inducir la infección de V. lecanii entre un 50 y 60% sobre los uredinios de H. vastatrix dependiendo de la dilución empleada


Subject(s)
Mitosporic Fungi/isolation & purification , Coffee/microbiology
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