ABSTRACT
Abstract The present study involves the chemical and bacteriological analysis of water from different sources i.e., bore, wells, bottle, and tap, from Peshawar, Mardan, Swat and Kohat districts of Khyber Pakhtunkhwa (KP) province, Pakistan. From each district, 50 water samples (10 samples from each source), regardless of urban and rural status, were collected from these sources and analysed for sulphates, nitrates, nitrites, chlorides, total soluble solids and coliforms (E. coli). Results indicated that majority of the water sources had unacceptable E. coli count i.e.> 34 CFU/100mL. E. coli positive samples were high in Mardan District, followed by Kohat, Swat and Peshawar district. Besides this, the some water sources were also chemically contaminated by different inorganic fertilizers (nitrates/nitrites of sodium, potassium) but under safe levels whereas agricultural and industrial wastes (chloride and sulphate compounds) were in unsafe range. Among all districts, the water quality was found comparatively more deteriorated in Kohat and Mardan districts than Peshawar and Swat districts. Such chemically and bacteriologically unfit water sources for drinking and can cause human health problems.
Resumo O presente estudo envolve a análise química e bacteriológica de água de diferentes fontes, ou seja, furo, poços, garrafa e torneira, dos distritos de Peshawar, Mardan, Swat e Kohat da província de Khyber Pakhtunkhwa (KP), Paquistão. De cada distrito, 50 amostras de água (10 amostras de cada fonte), independentemente do status urbano e rural, foram coletadas dessas fontes e analisadas para sulfatos, nitratos, nitritos, cloretos, sólidos solúveis totais e coliformes (E. coli). Os resultados indicaram que a maioria das fontes de água tinha uma contagem inaceitável de E. coli, ou seja, > 34 UFC / 100 mL. As amostras positivas para E. coli foram elevadas no distrito de Mardan, seguido por Kohat, Swat e distrito de Peshawar. Além disso, algumas fontes de água também foram contaminadas quimicamente por diferentes fertilizantes inorgânicos (nitratos/nitritos de sódio, potássio), mas em níveis seguros, enquanto os resíduos agrícolas e industriais (compostos de cloreto e sulfato) estavam em níveis inseguros. Entre todos os distritos, a qualidade da água foi considerada comparativamente mais deteriorada nos distritos de Kohat e Mardan do que nos distritos de Peshawar e Swat. Essas fontes de água química e bacteriologicamente impróprias para beber podem causar problemas à saúde humana.
Subject(s)
Humans , Drinking Water , Water Quality , Pakistan , Escherichia coliABSTRACT
The present study was conducted to isolate and characterize bacteria from water and soil sample taken from the Lahore Canal at different sites i.e. Mall Road, Mohlanwal and Khera site. Isolated bacterial strains were identified on the basis of morphological and biochemical tests. Identification was confirmed by culturing bacteria on selective media. Antibiotic resistance test was also performed to observe the resistance of bacteria against different antibiotics. Blood agar test was performed for identification of different pathogenic bacteria. The result revealed that water and soil samples of Lahore Canal Lahore from different sites were contaminated with Escherichia coli, Salmonella sp., Vibrio sp., Bacillus spp., Enterococcus sp. and Staphylococcus spp. Due to presence of these pathogens, this water is not suitable for any domestic and irrigation use. Study also revealed that water of the Lahore Canal is harmful for human health as it is contaminated with bacteria that can cause severe disease e.g., Escherichia coli can cause gastroenteritis, Bacillus spp. can cause nausea and vomiting, Enterococcus may infect urinary tract, Salmonella sp. is responsible for Bacteremia, Staphylococcus spp. can cause mild fever and Vibrio sp. can be the reason of cholera. Thus it is rendered unfit for any kind of human use even other than drinking like swimming, bathing, washing etc., until and unless some remedial measures are employed to eradicate pathogenic microorganisms by WASA and LWMS according to standards of WHO. Similarly, it is quite harmful, when and where ever it is used for irrigation without proper treatment.
O presente estudo foi realizado para isolar e caracterizar bactérias de amostras de água e solo retiradas do Canal Lahore, em Lahore, em diferentes locais, ou seja, Mall Road, Mohlanwal e Khera. As cepas bacterianas isoladas foram identificadas com base em testes morfológicos e bioquímicos. A identificação foi confirmada por cultura de bactérias em testes de meios seletivos. O teste de resistência aos antibióticos também foi realizado para observar a resistência das bactérias a diferentes antibióticos. Foi realizado o teste de ágar sangue para identificar diferentes bactérias patogênicas. O resultado revelou que amostras de água e solo do Canal Lahore, Lahore, de diferentes localidades estavam contaminadas com Escherichia coli, Salmonella sp., Vibrio sp., Bacillus spp., Enterococcus sp. e Staphylococcus spp. Por causa da presença desses patógenos, essa água não é adequada para qualquer uso doméstico e de irrigação. O estudo revelou que a água do Canal Lahore é prejudicial à saúde humana, pois está contaminada com bactérias que podem causar doenças graves, por exemplo: Escherichia coli pode ocasionar gastroenterite; Bacillus spp. pode causar náuseas e vômitos; Enterococcus sp. pode infectar o trato urinário; Salmonella sp. é responsável pela bacteremia; Staphylococcus spp. pode causar febre leve; e Vibrio sp. pode ser a razão da cólera. Assim, torna-se imprópria para uso humano, como natação, banho, lavagem etc., até que algumas medidas corretivas sejam empregadas para erradicar microrganismos patogênicos por WASA e LWMS de acordo com os padrões da OMS. Da mesma forma, é bastante prejudicial, quando usada para irrigação sem tratamento adequado.
Subject(s)
Animals , Soil , Staphylococcus , Vibrio , Drug Resistance, Microbial , Water Samples , Enterococcus , Escherichia coliABSTRACT
Abstract As an important enzyme, xylanase is widely used in the food, pulp, and textile industry. Different applications of xylanase warrant specific conditions including temperature and pH. This study aimed to carry out sodium alginate beads as carrier to immobilize previous reported mutated xylanase from Neocallimastix patriciarum which expressed in E. coli, the activity of immobilization of mutated xylanase was elevated about 4% at pH 6 and 13% at 62 °C. Moreover, the immobilized mutated xylanase retained a greater proportion of its activity than the wide type in thermostability. These properties suggested that the immobilization of mutated xylanase has potential to apply in biobleaching industry.
Resumo Como importante enzima, a xilanase é amplamente utilizada na indústria alimentícia, de celulose e têxtil. Diferentes aplicações de xilanase garantem condições específicas, incluindo temperatura e pH. Este estudo teve como objetivo realizar grânulos de alginato de sódio como carreador para imobilizar xilanase mutada relatada anteriormente de Neocallimastix patriciarum que expressa em E. coli, a atividade de imobilização da xilanase mutada foi elevada em cerca de 4% em pH 6 e 13% a 62 °C. Além disso, a xilanase mutada imobilizada reteve uma proporção maior de sua atividade do que o tipo amplo em termoestabilidade. Essas propriedades sugerem que a imobilização da xilanase mutada tem potencial para aplicação na indústria de biobranqueamento.
Subject(s)
Neocallimastix , Temperature , Escherichia coli/geneticsABSTRACT
Abstract Increasing trend in antimicrobial resistance and failure of chemically synthesized antibiotics lead to discover alternative methods for the treatment of bacterial infections. Various medicinal plants are in use traditionally and their active compounds can be further applied for treatment of bacterial diseases. This study was designed to determine the antibacterial activity of Punica granatum (P. granatum L.) (pomegranate) peel extract against Enterobacteriaceae [Escherichia coli (E. coli), Salmonella Typhimurium (S. Typhimurium) and Shigella Dysenteriae (S. Dysenteriae)] and gram-positive bacterium [Staphylococcus aureus (Staph aureus)]. Methanolic extract of P. granatum L. peel was prepared by Soxhlet apparatus method. Total flavonoid and phenolic contents from the extract were determined by High Performance Liquid Chromatography (HPLC). The antibacterial activity of P. granatum L. peel extract was evaluated through agar well diffusion method. HPLC showed the range of phenolics (gallic acid, caffeic acid, benzoic acid, cinnamic acid) and flavonoid compounds. The chemical structures of flavonoid and phenolics found in the methanolic extract of P. granatum L. peel have been reported for the first time. The methanolic peel extract (50 ul) of yellow P. granatum L. showed 26, 10, 10 and 9mm zones of inhibition (ZOI) against S. aureus, S. Typhimurium, S. Dysenteriae and E. coli, respectively. The methanolic extract of red P. granatum L. (100 ul) showed 27, 8, 12 and 15 mm ZOI against Staph. aureus, S. Typhimurium, S. Dysenteriae and E. coli, respectively. Highest ZOI was observed against Staph. aureus. Many of the bacteria studied in the present work may cause serious gastrointestinal infections, which can lead to hemorrhagic diarrhea in children. These infections can be life-threatening to young children and the elderly. There is an incentive to find alternative control measures, such as plant and herbal extracts, especially in lesser-developed countries where traditional antibiotics may not be readily available.
Resumo A tendência crescente na resistência antimicrobiana e na falha dos antibióticos sintetizados quimicamente leva à descoberta de métodos alternativos para o tratamento de infecções bacterianas. Várias plantas medicinais estão em uso tradicionalmente e seus compostos ativos podem ser posteriormente aplicados para o tratamento de doenças bacterianas. Este estudo foi desenhado para determinar a atividade antibacteriana do extrato de casca de Punica granatum (P. granatum L.) (romã) contra Enterobacteriaceae [Escherichia coli (E. coli), Salmonella Typhimurium (S. Typhimurium) e Shigella Dysenteriae (S. Dysenteriae) ] e bactéria gram-positiva [Staphylococcus aureus (Staph aureus)]. O extrato metanólico da casca de P. granatum L. foi preparado pelo método do aparelho de Soxhlet. O conteúdo total de flavonoides e fenólicos do extrato foi determinado por cromatografia líquida de alta eficiência (HPLC). A atividade antibacteriana do extrato da casca de P. granatum L. foi avaliada através do método de difusão em ágar. HPLC mostrou a gama de compostos fenólicos (ácido gálico, ácido cafeico, ácido benzoico, ácido cinâmico) e flavonoides. As estruturas químicas de flavonoides e fenólicos encontradas no extrato metanólico da casca de P. granatum L. foram relatadas pela primeira vez. O extrato metanólico da casca (50 ul) de P. granatum L. amarelo apresentou zonas de inibição (ZOI) de 26, 10, 10 e 9mm contra S. aureus, S. Typhimurium, S. Dysenteriae e E. coli, respectivamente. O extrato metanólico de P. granatum L. vermelho (100 ul) apresentou 27, 8, 12 e 15 mm IOI contra Staph. aureus, S. Typhimurium, S. Dysenteriae e E. coli, respectivamente. O ZOI mais alto foi observado contra Staph. aureus. Muitas das bactérias estudadas no presente trabalho podem causar infecções gastrointestinais graves, que podem levar à diarreia hemorrágica em crianças. Essas infecções podem ser fatais para crianças pequenas e idosos. Há um incentivo para encontrar medidas de controle alternativas, como extratos de plantas e ervas, especialmente em países menos desenvolvidos, onde os antibióticos tradicionais podem não estar prontamente disponíveis.
Subject(s)
Humans , Child, Preschool , Child , Aged , Pomegranate , Staphylococcus aureus , Plant Extracts/pharmacology , Chromatography, High Pressure Liquid , Escherichia coli , Anti-Infective AgentsABSTRACT
Abstract The β-lactam/lactamase inhibitors (BLBLIs) combination drugs are considered an effective alternative to carbapenems. However, there is a growing concern that the increased use of BLBLIs may lead to increased resistance. This study determined the temporal association between the consumption of BLBLI and the antimicrobial resistance in Gram-negative bacteria. In this retrospective study, electronic data on the Gram-negative bacterial isolates, including A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli, and K. pneumoniae from in-patients and susceptibility testing results were retrieved from the medical records of the clinical laboratory. A linear regression and cross-correlation analysis were performed on the acquired data. Increasing trends (p<0.05) in the consumption of BIBLI and carbapenem with a median use of 27.68 and 34.46 DDD/1000 PD per quarter were observed, respectively. A decreased trend (p=0.023) in the consumption of fluoroquinolones with a median use of 29.13 DDD/1000 PD per quarter was observed. The resistance rate of K. pneumoniae was synchronized with the BIBLI and carbapenem consumptions with a correlation coefficient of 0.893 (p=0.012) and 0.951 (p=0.016), respectively. The cross-correlation analysis against the consumption of BIBLI and meropenem resistant K. pneumoniae was peaked at 0-quarter lag (r=951, p=0.016). There was an increasing trend in the consumption of BLBLI and carbapenems. The increasing trend in the rates of resistance to piperacillin/tazobactam, in line with the increasing consumption of BLBLI, suggests that BLBLI has to be used with caution and cannot be directly considered as a long-term alternative to carbapenems.
Resumo Os medicamentos combinados de β-lactâmicos / inibidores da lactamase (BLBLIs) são considerados uma alternativa eficaz aos carbapenêmicos. No entanto, existe uma preocupação crescente de que o aumento do uso de BLBLIs pode levar ao aumento da resistência. Este estudo determinou a associação temporal entre o consumo de BLBLI e a resistência antimicrobiana em bactérias gram-negativas. Neste estudo retrospectivo, os dados eletrônicos sobre as bactérias gram-negativas isoladas, incluindo A. baumannii, P. aeruginosa, E. coli e K. pneumoniae de pacientes internados e os resultados dos testes de suscetibilidade foram recuperados dos registros médicos do laboratório clínico. Uma regressão linear e análise de correlação cruzada foram realizadas nos dados adquiridos. Foram observadas tendências crescentes (p < 0,05) no consumo de BIBLI e carbapenem com uma mediana de uso de 27,68 e 34,46 DDD/1000 PD por trimestre, respectivamente. Foi observada uma tendência de diminuição (p = 0,023) no consumo de fluoroquinolonas com uma mediana de uso de 29,13 DDD/1000 PD por trimestre. A taxa de resistência de K. pneumoniae foi sincronizada com os consumos de BIBLI e carbapenem com coeficiente de correlação de 0,893 (p = 0,012) e 0,951 (p = 0,016), respectivamente. A análise de correlação cruzada contra o consumo de BIBLI e K. pneumoniae resistente ao meropenem atingiu o pico no intervalo de 0 quarto (r = 951, p = 0,016). Houve uma tendência de aumento no consumo de BLBLI e carbapenêmicos. A tendência crescente nas taxas de resistência a piperacilina/tazobactam, em linha com o consumo crescente de BLBLI, sugere que BLBLI deve ser usado com cautela e não pode ser considerado diretamente como alternativa de longo prazo aos carbapenêmicos.
Subject(s)
Humans , Gram-Negative Bacterial Infections , Gram-Negative Bacterial Infections/epidemiology , Anti-Bacterial Agents/therapeutic use , Microbial Sensitivity Tests , Retrospective Studies , Escherichia coli , Gram-Negative BacteriaABSTRACT
Abstract Many soil microorganisms' i.e., bacteria and fungi produce secondary metabolites called antibiotics. These are used for the treatment of some of the bacterial, fungal and protozoal diseases of humans. There is a need for isolation of a broad spectrum of antibiotics from microorganisms due to the emergence of antibiotic resistance. In the present study two antibiotic producing bacteria Klebsiella pneumoniae and Bacillus cereus were isolated from pharmaceutical and poultry feed industry of Hattar, Haripur Pakistan. Total 10 waste samples were collected from different industries (Marble, Ghee, Soap, Mineral, Steel, Poultry Feed, Pharmaceutical, Qarshi, Cosmetic and Glass). Thirty-three bacterial strains were isolated from industrial wastes of these ten different industries. Fourteen out of thirty-three bacterial strains exhibited antimicrobial activities against at least one of the test microbes considered in this study including Escherchia coli, Staphylococcus aureus and Salmonella typhi. The bacteria were isolated by standard serial dilution spread plate technique. Morphological characterization of the isolates was done by Gram staining. Nine bacterial isolates out of fourteen were initially identified as B. cereus and five as K. pneumoniae through biochemical characterization. The antibacterial activities were tested by well diffusion method. Maximum number of antibiotic producing bacteria were isolated from pharmaceutical and poultry feed industry based on the results of primary screening, the most potential isolates S9, S19, S20, S22 and S23 were selected for secondary screening. The maximum activity against E. coli and S. aureus was recorded by bacterial isolate S19 i.e zones of inhibition of 6.5mm and 9mm while S20 showed 7.5mm and 6mm zones respectively. Molecular identification was carried out on the basis of 16S rRNA sequence analysis. Finally, the isolates were identified as B. cereus accession number LC538271and K. pneumoniae accession number MT078679. Analysis of bacterial extract S20 through GC-MS indicated the presence of 8 compounds of diverse nature and structure. Present study suggests that wastes of pharmaceutical and poultry feed industry may have antibiotic producing bacteria. These bacteria could be utilized for the production of antibiotics. B. cereus and K. pneumoniae isolated from wastes of poultry feed and pharmaceutical industries have the potential to produce antibiotics and could be used to control the microbial growth.
Resumo Muitos microrganismos do solo, ou seja, bactérias e fungos produzem metabólitos secundários chamados antibióticos. Eles são usados para tratamento de algumas doenças bacterianas, fúngicas e protozoárias em humanos. Há necessidade de isolamento de um amplo espectro de antibióticos de microrganismos devido ao surgimento de resistência aos antibióticos. No presente estudo, duas bactérias produtoras de antibióticos, Klebsiella pneumoniae e Bacillus cereus, foram isoladas da indústria farmacêutica e de ração avícola de Hattar, Haripur, Paquistão. Um total de 10 amostras de resíduos foi coletado de diferentes indústrias (mármore, ghee, sabão, mineral, aço, ração para aves, farmacêutica, Qarshi, cosmética e vidro). Trinta e três cepas bacterianas foram isoladas de resíduos industriais dessas dez diferentes indústrias. Quatorze das 33 cepas bacterianas exibiram atividades antimicrobianas contra pelo menos um dos micróbios de teste considerados neste estudo, incluindo Escherchia coli, Staphylococcus aureus e Salmonella typhi. As bactérias foram isoladas pela técnica de placa de diluição em série padrão. A caracterização morfológica dos isolados foi feita por coloração de gram. Nove isolados bacterianos de 14 foram inicialmente identificados como B. cereus e cinco como K. pneumoniae por meio de caracterização bioquímica. As atividades antibacterianas foram testadas pelo método de difusão em poço. O número máximo de bactérias produtoras de antibióticos foi isolado da indústria farmacêutica e de ração avícola com base nos resultados da triagem primária, os isolados mais potenciais S9, S19, S20, S22 e S23 foram selecionados para a triagem secundária. A atividade máxima contra E. coli e S. aureus foi registrada pelo isolado bacteriano S19, ou seja, zonas de inibição de 6,5 mm e 9 mm, enquanto S20 mostrou zonas de 7,5 mm e 6 mm, respectivamente. A identificação molecular foi realizada com base na análise da sequência 16S rRNA. Finalmente, os isolados foram identificados como B. cereus número de acesso LC538271 e K. pneumoniae número de acesso MT078679. A análise do extrato bacteriano S20 por meio de GC-MS indicou a presença de oito compostos de natureza e estrutura diversas. O presente estudo sugere que resíduos da indústria farmacêutica e de ração para aves podem conter bactérias produtoras de antibióticos. Essas bactérias podem ser utilizadas para a produção de antibióticos B. cereus e K. pneumoniae isolados de resíduos de rações de aves e indústrias farmacêuticas têm potencial para produzir antibióticos e podem ser usados para controlar o crescimento microbiano.
Subject(s)
Humans , Staphylococcus aureus , Industrial Waste , RNA, Ribosomal, 16S , Plant Extracts , Microbial Sensitivity Tests , Escherichia coli , Gas Chromatography-Mass Spectrometry , Anti-Bacterial Agents/pharmacologyABSTRACT
Abstract There is a paucity of research conducted on microbial prevalence in pheasants. The microbiota of captive birds has zoonotic significance and must be characterize. Present study is therefore planned to assess the microbiota from oral, fecal and gut content of captive avian species. It will be helpful in characterization of harmful microbes. Different samples taken from oral, gut and feces of ring-necked pheasants (Phasianus colchicus), green pheasants (Phasianus versicolor), golden pheasant (Chrysolophus pictus) and silver pheasant (Lophura nycthemera). Samples were collected, diluted, and inoculated onto different agar plates (MacConkey, SS agar, MSA and nutrient agar) for cultivation of bacterial species. Colonies of E.coli, Staphylococcus spp. Brachyspira spp. and Campylobacter spp were observed based on colony morphology. Colony forming unit showed E. coli as frequently found bacteria in fecal, oral and gut contents of all the above pheasants. The overall significance difference was found among bacterial species of golden pheasants, green pheasant, ring-necked pheasant, and silver pheasants. It was concluded that E.coli is predominant isolated from heathy pheasants followed by Campylobacter, Staphylococcus and Brachyspira.
Resumo Há uma escassez de pesquisas realizadas sobre a prevalência microbiana em faisões. A microbiota de aves em cativeiro tem significado zoonótico e deve ser caracterizada. O presente estudo está, portanto, planejado para avaliar a microbiota do conteúdo oral, fecal e intestinal de espécies aviárias em cativeiro. Será útil na caracterização de micróbios nocivos. Diferentes amostras retiradas da boca, intestino e fezes de faisões de pescoço redondo (Phasianus colchicus), faisões verdes (Phasianus versicolor), faisões dourados (Chrysolophus pictus) e faisão prateado (Lophura nycthemera). As amostras foram coletadas, diluídas e inoculadas em diferentes placas de ágar (MacConkey, ágar SS, MSA e ágar nutriente) para o cultivo de espécies bacterianas. Colônias de E. coli, Staphylococcus spp., Brachyspira spp. e Campylobacter spp foram observados com base na morfologia da colônia. A unidade formadora de colônia mostrou E. coli como bactéria frequentemente encontrada no conteúdo fecal, oral e intestinal de todos os faisões acima. A diferença de significância geral foi encontrada entre as espécies bacterianas de faisões dourados, faisões verdes, faisões de pescoço anelado e faisões prateados. Verificou-se que a E.coli é predominantemente isolada de faisões saudáveis, seguida por Campylobacter, Staphylococcus e Brachyspira.
Subject(s)
Animals , Galliformes , Escherichia coli , FecesABSTRACT
Abstract The present study was aimed to manifest the antibacterial and antifungal activity of methanolic extracts of Salix alba L. against seven Gram-positive and Gram-negative bacterial pathogens e.g. Streptococcus pyogenes, Staphylococcus aureus (1), S. aureus (2), Shigella sonnei, Escherichia coli (1), E. coli (2) and Neisseria gonorrhoeae and three fungal isolates from the air such as Aspergillus terreus, A. ornatus, and Rhizopus stolonifer. Two different serotypes of S. aureus and E. coli were used. The agar well-diffusion method results showed the dose-dependent response of plant extracts against bacterial and fungal strains while some organisms were found resistant e.g. E. coli (1), S. sonnei, A. terreus and R. stolonifer. The highest antibacterial activity was recorded at 17.000±1.732 mm from 100 mg/mL of leaves methanolic extracts against S. pyogenes while the activity of most of the pathogens decreased after 24 h of incubation. The highest antifungal activity was reported at 11.833±1.0 mm against A. ornatus at 50 mg/mL after 48 h of the incubation period. These experimental findings endorse the use of S. alba in ethnopharmacological formulations and suggest the use of methanolic extracts of the said plant to develop drugs to control the proliferation of resistant disease causing pathogenic microbes.
Resumo O presente estudo teve como objetivo manifestar a atividade antibacteriana e antifúngica de extratos metanólicos de Salix alba L. contra sete patógenos bacterianos Gram-positivos e Gram-negativos. Streptococcus pyogenes, Staphylococcus aureus (1), S. aureus (2), Shigella sonnei, Escherichia coli (1), E. coli (2) e Neisseria gonorrhoeae e três isolados de fungos do ar, como Aspergillus terreus, A. ornatus, e Rhizopus stolonifer. Dois sorotipos diferentes de S. aureus e E. coli foram usados. Os resultados do método de difusão em ágar mostraram a resposta dependente da dose de extratos de plantas contra cepas de bactérias e fungos, enquanto alguns organismos foram considerados resistentes, e.g. E. coli (1), S. sonnei, A. terreus e R. stolonifer. A maior atividade antibacteriana foi registrada em 17.000 ± 1.732 de 100 mg/mL de extratos metanólicos de folhas contra S. pyogenes, enquanto a atividade da maioria dos patógenos diminuiu após 24 h de incubação. A maior atividade antifúngica foi relatada em 11,833 ± 1,0 contra A. ornatus a 50 mg/mL após 48 h do período de incubação. Esses achados experimentais endossam o uso de S. alba em formulações etnofarmacológicas e sugerem o uso de extratos metanólicos da referida planta para o desenvolvimento de fármacos que controlem a proliferação de doenças resistentes que causam micróbios patogênicos.
Subject(s)
Salix , Antifungal Agents/pharmacology , Aspergillus , Rhizopus , Staphylococcus aureus , Plant Extracts/pharmacology , Microbial Sensitivity Tests , Methanol , Escherichia coli , Anti-Bacterial Agents/pharmacologyABSTRACT
La colonización fecal en lactantes por bacterias resistentes a los antimicrobianos es un potencial riesgo para futuras terapias antibióticas. Nuestro objetivo fue determinar la frecuencia y características sociodemográficas de lactantes portadores fecales de enterobacterias resistentes a ciprofloxacina (PFRC) y sus genes de resistencia asociados. Analizamos muestras fecales de 41 niños lactantes residentes en el distrito de Talara-Piura, Perú, en 2019. Evaluamos la presencia de 3 genes de resistencia a quinolonas: aac(6')-Ib-cr, qnrB y oqxA y 2 de betalactamasas: bla CTX-M, bla PER-2.El 68% de lactantes fueron PFRC, Escherichia coli (83,3%) fue el más frecuente. El análisis genotípico detectó: oqxA (41,1%), qnrB (26,7%) y aac(6')-Ib-cr (20%) y al gen bla CTX-M en el 93,3% de los aislados con betalactamasas. La elevada frecuencia de PFRC nos alertan sobre el potencial riesgo en la pérdida de utilidad de esta familia antibiótica en el área de estudio.
Fecal colonization by antimicrobial-resistant bacteria in infants is a potential risk for future antibiotic therapy. We aimed to determine the sociodemographic characteristics and frequency of infants who were fecal carriers of ciprofloxacin-resistant enterobacteriaceae (FCCRE) and their associated resistance genes. We analyzed fecal samples from 41 infants from the district of Talara, Piura, Peru in 2019. The presence of 3 quinolone resistance genes was evaluated: aac(6')-Ib-cr, qnrB and oqxA as well as of 2 beta-lactamase genes: bla CTX-M,bla PER-2. We found that 68% of infants were FCCRE, Escherichia coli (83.3%) was the most frequent bacteria. The genotypic analysis detected: oqxA (41.1%), qnrB (26.7%), aac(6')-Ib-cr (20%) and the bla CTX-M gene (93.3%) of the isolates with beta-lactamases. The high frequency of FCCRE alerts us of the potential risk of this antibiotic family becoming less useful over time.
Subject(s)
Humans , Male , Infant, Newborn , Infant , beta-Lactamases , Drug Resistance , Infant, Newborn , Quinolones , Escherichia coli , Peru , Enterobacteriaceae , Anti-Bacterial AgentsABSTRACT
A infecção do trato urinário (ITU) nada mais é do que o acometimento das vias urinárias por microrganismo. Entre as infecções hospitalares de maior incidência está a infecção do trato urinário, acometendo mais mulheres do que homens. Uma das possíveis causas dessa infecção, em pacientes na unidade de terapia intensiva (UTI), é o uso de cateter vesical. Seu tratamento inadequado pode ocasionar uma pielonefrite, podendo adentrar à circulação sanguínea, gerando uma infecção sistêmica e levar o paciente a óbito. A resistência antimicrobiana é uma das principais dificuldades encontrada em UTI sendo considerado um problema de saúde pública. O objetivo deste trabalho foi realizar um breve relato, baseado na literatura, sobre a resistência antimicrobiana na infecção urinária em unidade de terapia intensiva adulta. Em ambientes hospitalares o principal microrganismo causador de ITU é Escherichia coli, sendo 55,5% das culturas positivas estão associadas a procedimentos invasivos, como as sondas vesicais de demora, como consequência este é o microrganismo que mais apresenta resistência aos antimicrobianos utilizados como a ampicilina, trimetoprima e ciprofloxacino. O uso indiscriminado de antibióticos deixa em evidência a necessidade de análise criteriosa da real necessidade de qual antimicrobianos usar, tempo de uso e forma correta de administração. Portanto é necessária a ação dos profissionais de saúde frente a atenção ao paciente, desde a higiene das mãos, uso do cateter, quando necessário observar a real necessidade do uso do antimicrobianos e que esse seja feito após cultura e antibiograma.
Urinary tract infection (UTI) is nothing more than the involvement of the urinary tract by a microorganism. Among the hospital infections with the highest incidence is urinary tract infections, affecting more women than men. One of the possible causes of this infection in patients in the intensive care unit (ICU) is the use of a bladder catheter. Its inadequate treatment can cause pyelonephritis, which can enter the bloodstream, generating a systemic infection and leading the patient to death. Antimicrobial resistance is one of the main difficulties encountered in ICUs and is considered a public health problem. The objective of this study was to present a brief report, based on the literature, on antimicrobial resistance in urinary tract infections in an adult intensive care unit. In hospital environments, the main microorganism that causes UTI is Escherichia coli, and 55.5% of positive cultures are associated with invasive procedures, such as indwelling urinary catheters, as a consequence, this is the microorganism that is most resistant to antimicrobials used, such as ampicillin, trimethoprim and ciprofloxacin. The indiscriminate use of antibiotics highlights the need for a careful analysis of the real need for which antimicrobials to use, time of use, and correct form of administration. Therefore, it is necessary for the action of health professionals in the care of the patient, from the hygiene of the professional to, the use of the catheter, when necessary to observe the real need for the use of antimicrobials and that this is done after culture and antibiogram.
La infección del tracto urinario (ITU) no es más que la afectación de las vías urinarias por un microorganismo. Entre las infecciones hospitalarias con mayor incidencia se encuentra la infección del tracto urinario, que afecta más a mujeres que a hombres. Una de las posibles causas de esta infección en pacientes en la unidad de cuidados intensivos (UCI) es el uso de una sonda vesical. Su tratamiento inadecuado puede causar pielonefritis, la cual puede ingresar al torrente sanguíneo, generando una infección sistémica y llevando al paciente a la muerte. La resistencia a los antimicrobianos es una de las principales dificultades encontradas en las UCI y se considera un problema de salud pública. El objetivo de este estudio fue presentar un breve informe, basado en la literatura, sobre la resistencia antimicrobiana en infecciones del tracto urinario en una unidad de cuidados intensivos de adultos. En ambientes hospitalarios, el principal microorganismo causante de ITU es Escherichia coli, y el 55,5% de los cultivos positivos están asociados a procedimientos invasivos, como sondas vesicales permanentes, por lo que este es el microorganismo más resistente a los antimicrobianos utilizados, como la ampicilina. ., trimetoprima y ciprofloxacino. El uso indiscriminado de antibióticos pone de relieve la necesidad de un análisis cuidadoso de la necesidad real de qué antimicrobianos utilizar, el momento de uso y la forma correcta de administración. Por lo tanto, es necesaria la actuación de los profesionales de la salud en el cuidado del paciente, desde la higiene del profesional, uso del catéter, cuando sea necesario observar la necesidad real del uso de antimicrobianos y que este se realice previo cultivo y antibiograma.
Subject(s)
Humans , Female , Urinary Tract Infections/complications , Urinary Tract Infections/mortality , Urinary Tract Infections/prevention & control , Urinary Tract Infections/drug therapy , Drug Resistance, Microbial/drug effects , Urinary Tract , Women , Ciprofloxacin/therapeutic use , Cross Infection/complications , Cross Infection/transmission , Escherichia coli/pathogenicity , Catheters/microbiology , Hand Hygiene , Ampicillin/therapeutic use , Intensive Care Units , Anti-Infective Agents/therapeutic use , Anti-Bacterial Agents/therapeutic useABSTRACT
Introducción. Las infecciones asociadas con la atención en salud constituyen un problema de salud pública porque aumentan la morbimortalidad de los pacientes, sobre todo de aquellos con factores de riesgo, como la inmunosupresión debida a enfermedades oncológicas. Es importante conocer la diversidad genética de los principales microorganimos causantes de infecciones hospitalarias mediante la vigilancia epidemiológica tradicional y la epidemiología molecular, para hacer un mejor seguimiento y detectar brotes tempranamente. Objetivo. Determinar el grupo filogenético y la resistencia a antibióticos de las cepas de Escherichia coli aisladas de pacientes con cáncer hospitalizados. Materiales y métodos. Se hizo un estudio de tipo transversal que incluyó 67 cepas de Escherichia coli productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE). Se determinó el grupo filogenético, el perfil de resistencia a los antibióticos, los genes de resistencia a betalactámicos, el tipo de las muestras y los servicios de hospitalización de donde fueron recuperadas. Resultados. El grupo filogenético más frecuente fue el B2 (36 %). El 57 % de las cepas B2 fueron aisladas de muestras de orina y el 33 % provenía del servicio de urología. La resistencia a ciprofloxacino y gentamicina fue de 91 y 53 %, respectivamente, y el 79 % de las cepas tenía el gen blaCTX-M. Se encontró una relación significativa (p<0,05) entre los grupos filogenéticos y la resistencia a ciprofloxacina, así como a la edad del paciente. Conclusión. El filogrupo de E. coli predominante fue el B2. Se evidenció una gran resistencia a ciprofloxacina y gentamicina, una proporción elevada de cepas BLEE con el blaCTX-M, y una relación entre el grupo filogenético y la resistencia a ciprofloxacino.
Introduction: Healthcare-associated infections are a public health problem due to the increased morbimortality of patients, especially those with risk factors such as immunosuppression due to oncological diseases. It is essential to determine the genetic diversity of the main microorganisms causing healthcare infections by combining traditional epidemiological surveillance and molecular epidemiology for better outbreak follow-up and early detection. Objective: To determine the phylogenetic group and antibiotic resistance of Escherichia coliisolated from hospitalized oncologic patients. Materials and methods: We conducted a cross-sectional study of 67 strains of ESBL-producing Escherichia coli to determine their phylogenetic group and described their antibiotic resistance profile, beta-lactam resistance genes, as well as the type of sample and the hospitalization areas from which they were recovered. Results: The most frequent phylogenetic group was B2 (36%); 57% of B2 strains were isolated from urine and 33% came from the urology department. Resistance to ciprofloxacin and gentamicin was 92% and 53%, respectively, and 79% of the strains had the blaCTX-Mgene. A significant association (p<0.05) was found between the phylogenetic groups, ciprofloxacin resistance, and the age of the patients. Conclusion: The predominant E. coli phylogroup was B2. We evidenced high resistance to ciprofloxacin and gentamicin, a high proportion of ESBL strains with the blaCTX-M gene, and a significant association between the phylogenetic group and the resistance to ciprofloxacin.
Subject(s)
beta-Lactam Resistance , Escherichia coli , Phylogeny , Gentamicins , CiprofloxacinABSTRACT
Fosfomycin tromethamol (FT) was reintroduced as an option for the treatment of low urinary tract infection (UTI) in children. In this study, we described the antibiotic sensitivity and mechanisms of resistance to fosfomycin in isolates from children older than 6 years with UTI. Urine culture and antibiotic susceptibility study were performed. In fosfomycin resistant strains, PCR for fos, blaCTX-M was performed followed by classification by phylogenetic group and sequencetyping. Escherichia coli was the most frequent etiological agent (89.2%). The susceptibility percentages were: fosfomycin 97.9%; amoxicillin-clavulanate 92.7%; cefuroxime and ceftriaxone 99%; nitrofurantoin 94.4%. An E. coli strain (ST69, phylogenetic group D) was resistant to fosfomycin (MIC 256mg/l) and carried the blaCTX-M-14 and fosA3 genes in a 45kb IncN-type plasmid.
La fosfomicina-trometamol (FT) se reintrodujo como una opción para el tratamiento de la infección del tracto urinario (ITU) baja en niños. En este estudio describimos la sensibilidad antibiótica y los mecanismos de resistencia a FT en aislamientos de niños mayores de 6 anos con ITU. Se realizaron urocultivos y estudios de sensibilidad antibiótica. En las cepas resistentes a fosfomicina se realizó la técnica de PCR para fos, blaCTX-M, y su identificación según su grupo filogenéticoy secuenciotipo. Escherichiacoli fue el agente etiológico más frecuente (89,2%). Los porcentajes de sensibilidad fueron: fosfomicina 97,9%; amoxicilina-clavulánico 92,7%; cefurox-ima y ceftriaxona 99%; nitrofurantoína 94,9%. Una cepa de E. coli (ST69, grupo filogenético D) fue resistente a fosfomicina (CIM 256mg/l) y portaba los genes blaCTX-M-14 y fosA3 en un plás-mido de 45 kb del tipo IncN. Este es el primer reporte de E. coli ST69 con blaCTX-M-14/fosA3 de origen humano.
Subject(s)
Humans , Child , Urinary Tract Infections/drug therapy , Escherichia coli Infections/drug therapy , Escherichia coli Infections/epidemiology , Fosfomycin/therapeutic use , Fosfomycin/pharmacology , Phylogeny , beta-Lactamases/genetics , Microbial Sensitivity Tests , Drug Resistance, Bacterial , Escherichia coli/genetics , Anti-Bacterial Agents/pharmacologyABSTRACT
BACKGROUND: Propolis has been considered a highly valuable material due to its therapeutic properties. However, in Colombia, the commercialization of propolis is limited not only by low production but also by the little knowledge about its efficient extraction. Therefore, finding an optimal and economical extraction method to obtain propolis is a necessity for beekeepers that would open new possibilities for industrial use and, therefore, for the market. OBJECTIVES:The objective of this study was to evaluate a conventional and ultrasound-assisted extraction method, seeking to obtain the highest yield and a high amount of content of bioactive compounds in propolis extracts. METHODS: The extraction was carried out for three crude propolis from different types of bees: Tetragoniscaangustula or Angelita (ANG), Meliponaeburnea or Melipona(MEL), and Scaptotrigonaspp (SCT). The extracts were characterized by color, pH, visual appearance, solid content, antioxidant capacity, total polyphenol content, and bacterial inhibition capacity. RESULTS: The highest extraction performance was obtained when the ultrasound-assisted method was used, especially for the ANG extract, which in addition to presenting inhibition for gram-negative (E. coli) and gram-positive (S. Aureus) bacteria, had the best antioxidant activity with a value of 545 mg GAE / 100 g of sample and total polyphenol content of 1,884 mg GAE / 100 g of sample. CONCLUSIONS: Ultrasound-assisted extraction can be considered a low-cost alternative to increase the extraction performance of crude propolis, together with its total polyphenol content and antioxidant capacity, without altering its physical properties
ANTECEDENTES: El propóleos ha sido considerado un material de alto valor por sus propiedades terapéuticas. Sin embargo, en Colombia la comercialización de propóleos está limitada no solo por la baja producción sino también por el incipiente conocimiento sobre la extracción eficiente de este. Por ello, encontrar un método de extracción óptimo y económico para la obtención de propóleos es una necesidad para los apicultores que abriría nuevas posibilidades para el uso industrial y por tanto para el mercado. OBJETIVOS: El objetivo de este estudio fue evaluar un método de extracción convencional y asistido por ultrasonido (US) buscando el mayor rendimiento y alto contenido de compuestos bioactivos en extractos de propóleos. MÉTODOS: La extracción se realizó para tres propóleos crudos de diferentes tipos de abejas Tetragonisca angustula o Angelita(ANG), Melipona eburnea o Melipona (MEL) y Scaptotrigona spp (SCT). Todos los extractos se caracterizaron por su color, pH, apariencia visual, contenido de sólidos, capacidad antioxidante, contenido total de polifenoles y capacidad de inhibición bacteriana. RESULTADOS: El mayor rendimiento de extracción se obtuvo cuando se usó el método asistido por ultrasonido y específicamente para el extracto ANG, que además de presentar inhibición para bacterias gram negativas (E. coli) y gram positivas (S. Aureus), tuvo la mejor actividad antioxidante con un valor de 545 mg GAE / 100 g de muestra y contenido total de polifenoles de 1884 mg GAE / 100 g de muestra. CONCLUSIONES: La extracción asistida por ultrasonido puede considerarse una alternativa de bajo costo para aumentar el rendimiento de extracción del propóleos crudo, así como su contenido total de polifenoles y capacidad antioxidante sin alterar sus propiedades físicas
Subject(s)
Humans , Propolis/chemistry , Staphylococcus aureus/drug effects , Escherichia coli/drug effects , Antioxidants/pharmacology , Ultrasonics , Bees , Microbial Sensitivity Tests , Anti-Bacterial Agents/pharmacologyABSTRACT
Introduction: Staphylococcus aureus and Escherichia coli are pathogens that cause chronic infections due to antibiotic resistance mechanisms and their ability to adhere to surfaces and to form biofilms. The search for new agents from natural resources to counter microbial biofilms is an urgent priority in healthcare. Objetive: chemical composition, antibacterial and anti-biofilm activity of Plectranthus amboinicus essential oil (PAEO) and carvacrol were investigated against E. coli and S. aureus. Methodology: PAEO was chemically analyzed using gas chromatography coupled to a mass spectrometer. Antimicrobial activity was assessed by the disc diffusion method and broth microdilution method to determine minimum inhibitory concentrations (MICs). Antibiofilm activity was investigated using 96-well plates with a crystal violet assay. Results: carvacrol (85.25%) was the major component of PAEO. The disc diffusion test confirmed the ability of PAEO and carvacrol in inhibiting bacteria in their planktonic form. The MICs of PAEO against S. aureus and E. coli were 0.31 and 1.25%, respectively, with bactericidal effect. Carvacrol demonstrated a significant antibacterial property (MIC = 0.31%), exhibiting bacteriostatic effects against S. aureus and bactericidal effects against E. coli. Carvacrol considerably inhibited E. coli biofilm formations (58.9%). Moreover, carvacrol inactivated the mature biofilms. Conclusion: the data obtained are promising, and facilitates the development of new therapeutic alternatives. These results indicate the potential of carvacrol in treating diseases caused by E. coli and S. aureus
Introdução: Escherichia coli e Staphylococcus aureus são patógenos que podem causar infecções persistentes devido aos mecanismos de resistência e à sua capacidade de aderir e formar biofilme. A busca por novos agentes a partir de recursos naturais para combater o biofilme é uma prioridade na área da saúde. Objetivo: a composição química, a atividade antibacteriana e anti-biofilme do óleo essencial de Plectranthus amboinicus (PAEO) e do carvacrol foram investigadas frente a S. aureus e E. coli. Metodologia: a análise química do PAEO foi realizada por cromatografia gasosa acoplada a espectrômetro de massa. A atividade antimicrobiana foi avaliada por difusão em disco e microdiluição em caldo para determinar as concentrações inibitórias mínimas (CIMs). As atividades do anti-biofilme foram investigadas usando placas de 96 poços pelo ensaio de cristal violeta. Resultados: o carvacrol (85,25%) foi o principal componente do PAEO. A capacidade do PAEO e do carvacrol para inibir bactérias planctônica foi confirmada por difusão em disco. A CIM do PAEO para S. aureus e E. coli foi de 0,31 e 1,25%, respectivamente, com efeito bactericida. O carvacrol demonstrou uma propriedade antibacteriana significativa (CIM=0,31%), exibindo efeito bacteriostático frente a S. aureus e efeito bactericida para E. coli. O carvacrol inibiu significativamente a formação de biofilme de E. coli (58,9%) e promoveu a desestabilização do biofilme maduro. Conclusão: os dados obtidos são promissores, possibilitando o desenvolvimento de novas alternativas terapêuticas e revelam a potencialidade do carvacrol como fonte para o tratamento de doenças causadas por E. coli e S. aureus.
Subject(s)
Staphylococcus aureus/drug effects , Oils, Volatile/pharmacology , Biofilms/drug effects , Plectranthus/chemistry , Escherichia coli/drug effects , Anti-Bacterial Agents/pharmacology , Microbial Sensitivity Tests/methodsABSTRACT
Homeopathy is a therapy that uses medications prepared with infinitesimal and dynamized dilutions. Current studies demonstrate in vitro activity of homeopathy on gram-positive bacteria such as Staphylococcus aureusand Streptococcus pyogenes. Among bacterial infections, urinary tract infection (UTI) is frequent, leads to later consequences and the main causal agent is Escherichia coli(E. coli). In other publications, it has been reported inactivity of homeopathy on E. colicultures. Due to the divergence in the literature, the objective of this study was to evaluate gram-negative bacteria growth under homeopathy treatment. Methods:The medicines Atropabelladona, Cantharis, Staphysagria,and Colibacillinumwere tested at 6CH, 12CH and 30CH inE. coliATCC 25922 and EPEC (Enteropathogenic Escherichia coli) ATCC 43887. Two hundred and fifty microliters of the medicines in alcohol 30% were incubated at 37ºC with 3 mL of Müller Hinton broth (MH), 10 µL of cultures at 0.5 Macfarland and subsequent dilution at 1/10. Bacterial growth was evaluated in a spectrophotometer at 600nm, in the periods of 6, 12,and 20 hours of incubation. Resultsand Discussion:The results showed no inhibition of bacterial growth under the studied conditions. These data corroborate with studies already published that indicate the absence of action of homeopathy on E. colicultures. Considering other studies, it can be suggested that homeopathic medicines have direct activity on the growth of Gram-positive and not Gram-negative bacteria. Evaluating the two bacterial groups, it is possible to assume that the difference in homeopathy activity could be linked to differences in the bacterial wall structure. This hypothesis should be evaluated by other tests with the same bacterialstrains. Conclusion:The homeopathic medicines tested have no direct activity on Gram-negative bacteria cultures.
Subject(s)
Urinary Tract Infections/therapy , Homeopathic Remedy , Escherichia coliABSTRACT
Introducción: La resistencia a los antimicrobianos (RAM) es un problema de salud pública que manifiesta la disminuida eficacia de estos agentes en la prevención y tratamiento de una proporción cada vez más amplia de patologías. Los actinomicetos son un grupo bacteriano importante de productores de metabolitos activos contra patógenos. Objetivo: Aislar actinomicetos del bosque tropical de Nariño, con potencial producción de metabolitos inhibitorios contra bacterias multidrogo-resistentes. Materiales y métodos: Se tomaron muestras de suelo de Bosque Tropical Húmedo de la Reserva Natural del Río Ñambí, se analizaron microbiológica y molecularmente. Se estimuló la producción in vitro de metabolitos secundarios y evaluó el efecto inhibitorio de estos extractos contra las bacterias multidrogo-resistentes Escherichia coli y Staphylococcus aureus. Resultados: Se obtuvieron 11 aislados presuntivos, se confirmó que cuatro de ellos correspondieron al género Streptomyces sp. Las pruebas de inhibición contra bacterias multidrogo-resistentes E. coli y S. aureus, permitieron verificar que el aislado P3772 fue el más eficiente en la inhibición de los patógenos. Conclusiones: Todos los actinomicetos evaluados presentan actividad antibacteriana contra al menos una de las bacterias patógenas estudiadas; destacando el aislado P3772, que inhibe a E. coli y S. aureus. Se espera caracterizar los compuestos vinculados a la actividad antibacteriana.
Introduction: Antimicrobial resistance (AR) is a public health problem that reveals the diminished efficacy of these agents in the prevention and treatment of an increasingly larger number of pathologies. Actinomycetes are an important bacterial producer group of metabolites that are active against pathogens. Objective: To isolate actinomycetes from the tropical forest of Nariño (Colombia), which have the potential to produce inhibitory metabolites against multi-drug resistant bacteria. Materials and methods: Soil samples were taken from the Humid Tropical Forest of the Río Ńambí Natural Reserve and analyzed through microbiological and molecular assays. In vitro production of secondary metabolites was first stimulated, followed by the assessment of the inhibitory effect of these extracts against multi-drug resistant Escherichia coli and Staphylococcus aureus. Results: 11 presumptive isolates were obtained, confirming that four of them corresponded to the Streptomyces sp. genus. The bacterial isolate P3772 was identified as the one with the highest inhibitory effect against multi-drug resistant E. coli and S. aureus. Conclusions: All the actinomycetes evaluated presented antibacterial activity. The isolate P3772 stands out, which inhibited both E. coli and S. aureus. The compounds associated with this antibacterial activity will be characterized in future studies.
Subject(s)
Humans , Male , Female , Bacteria , Anti-Infective Agents , Staphylococcus aureus , Actinobacteria , Drug Resistance, Bacterial , Escherichia coli , Anti-Bacterial AgentsABSTRACT
Urinary tract infections (UTIs) are the most common health-care-associated infections (HCAIs) and one of the top-ranking microbial infections. In the community, about 80% of UTIs are caused by uropathogenic Escherichia coli (UPEC), but there is a high variability of etiological agents involved in hospital-acquired UTIs. With this context in mind, the current study aimed to evaluate the prevalence of the main etiological agents responsible for UTIs and their susceptibility profile at the Hospital das Clínicas de Ribeirão Preto, a high complexity reference hospital in the Southeast region of Brazil. This retrospective and descriptive study analyzed all positive inpatient cultures [100,000 colony-forming unit (CFU)/mL] from November 2016 to April 2017. The most prevalent microorganism was Kleb-siella pneumoniae (23 isolates), equivalent to 37.7% of positive urocultures. The second most prevalent agent was UPEC, with 19 isolates (31.1%). The risk factors evaluated in these inpatients showed that 17.5% underwent a uro-logical procedure on admission, 31.6% were using a urinary catheter; 26.2% were using immunosuppressive drugs during the period in which the clinical diagnosis was made. Our results demonstrate the prevalence of UTI causes in the hospital context and the main risk factors for them and will be pretty helpful in guiding empirical treatment in severe UTIs inside the hospital as well as reflect on the actual need and time duration of invasive procedures in the hospital environmen (AU)
As infecções do trato urinário (IU) são a terceira causa principal de infecções associadas ao ambiente hospitalar, logo após as infecções pulmonares e da corrente sanguínea. Na comunidade, cerca de 80% das IU são causadas por E. coli, mas há uma alta variabilidade de agentes etiológicos envolvidos nas IU hospitalares. Este estudo visa avaliar a prevalência dos principais agentes etiológicos e perfil de suscetibilidade envolvidos em IU em um am-biente hospitalar de referência de alta complexidade no sul do Brasil. Este é um estudo retrospectivo e descritivo que analisou todas as culturas positivas (100.000 ufc/ml) de pacientes nas enfermarias de um hospital terciário no período entre novembro de 2016 a abril de 2017. O microorganismo mais prevalente foi Klebsiella pneumoniae (23 isolados), o que equivale a 37,7% das uroculturas. O segundo agente mais prevalente foi Escherichia coli, com 19 isolados (31,1%). Os fatores de risco avaliados nestes pacientes mostraram que 17,5% foram submetidos a um procedimento urológico na admissão, 31,6% estavam usando um cateter urinário; 26,2% estavam usando drogas imunossupressoras no período em que o diagnóstico clínico foi feito. Nossos resultados demonstram uma mudança importante na prevalência das causas de IU no contexto hospitalar e os principais fatores de risco para elas e serão bastante úteis para orientar o tratamento empírico em IU grave dentro do hospital, bem como refletir sobre a real necessidade e a duração dos procedimentos invasivos no ambiente hospitalar (AU)
Subject(s)
Humans , Urinary Tract Infections , Escherichia coli , Urinary Catheters , Immunosuppressive Agents , Klebsiella pneumoniaeABSTRACT
Resumen Escherichia coli shigatoxigénica (STEC) está involucrada en el desarrollo del síndrome urémico hemolítico, entre otras enfermedades que son de gran importancia para la salud pública e inocuidad alimentaria a nivel mundial. La capacidad de STEC de formar biofilms en los alimentos y en diferentes superficies podría conducir a la contaminación cruzada por el desprendimiento de las células bacterianas. El objetivo del presente trabajo fue detectar la presencia de genes que codifican factores de adherencia mediante la técnica de PCR y determinar la capacidad de formación de biofilms por medio de cultivo en microplacas de poliestireno de 96 pocillos y la técnica de cristal violeta, en cepas de STEC aisladas de muestras clínicas humanas en la ciudad de Mar del Plata, Argentina. El perfil de genes de adherencia más frecuente fue efa1, iha, fimCD, ehaA, lpfA1-3, lpfA2-2, cah (43,9%). Todas las cepas de STEC formaron biofilms con valores de densidad óptica entre 0,209 y 3,251 y el 54,4% (31/57) de las mismas fueron clasificadas como fuertes formadoras de biofilms. La capacidad de formación de biofilms de STEC constituye un riesgo evidente en la transmisión de este patógeno al ser humano a tener en cuenta para su vigilancia y control.
Abstract Shigatoxigenic Escherichia coli (STEC) is involved in the development of hemolytic uremic syndrome, among other diseases that are relevant to public health and food safety worldwide. The ability of STEC to form biofilms in food and on different surfaces could lead to cross-contamination by shedding bacterial cells. The aim of this work was to detect the presence of genes encoding adherence factors by the PCR technique and to determine the biofilm formation ability by culture in 96-well polystyrene microplates and the crystal violet technique, in STEC strains isolated from human clinical samples in Mar del Plata city, Argentina. The most frequent adherence gene profile was efa1, iha, fimCD, ehaA, lpfA1-3, lpfA2-2, cah (43.9%). All STEC strains formed biofilms with optical density values between 0.209 and 3.251. Also, the 54.4% (31/57) of STEC strains were classified as strong biofilm formers. The ability of STEC to form biofilms constitutes an evident risk in the transmission of this pathogen to humans, which must be taken into account for its surveillance and control.
Resumo A Escherichia coli shigatoxigênica (STEC) está envolvida no desenvolvimento da síndrome hemolítica urêmica, entre outras doenças relevantes para a saúde pública e segurança alimentar em todo o mundo. A capacidade do STEC de formar biofilmes nos alimentos e em diferentes superfícies poderia levar à contaminação cruzada através do desprendimento de células bacterianas. O objetivo do presente trabalho foi detectar a presença de genes que codificam fatores de aderência através da técnica PCR e determinar a capacidade de formação de biofilme por cultura em microplacas de poliestireno de 96 poços e da técnica de cristal violeta, em cepas STEC isoladas de amostras clínicas humanas na cidade de Mar del Plata, Argentina. O perfil de genes de aderência mais frequente foi efa1, iha, fimCD, ehaA, lpfA1-3, lpfA2-2, cah (43,9%). Todas as cepas de STEC formaram biofilmes com valores de densidade ótica entre 0,209 e 3,251. Também, os 54,4% (31/57) das estirpes STEC foram classificados como fortes formadores de biofilmes. A habilidade de formação de biofilmes de STEC constitui um risco evidente na transmissão deste patógeno ao humano, que deve ser levado em consideração para sua vigilância e controle.
Subject(s)
Humans , Escherichia coli , Shiga-Toxigenic Escherichia coli , Sprains and Strains , Cells , Disease , Biofilms , Growth and Development , Environmental Pollution , Food Safety , Food , Genes , MethodsABSTRACT
INTRODUCCIÓN: En neonatos y lactantes bajo 90 días de vida la fiebre constituye un signo clínico relevante ya que puede corresponder a una infección bacteriana grave, por lo que se toman hemocultivos de forma rutinaria y el paciente es hospitalizado. Aún no existe una recomendación respecto al tiempo de observación necesario una vez internado el paciente. OBJETIVO: Describir las bacterias aisladas en hemocultivos de lactantes bajo 90 días de vida hospitalizados por fiebre y el tiempo de detección de crecimiento microbiano en los mismos. ¨MÉTODO: Estudio descriptivo, retrospectivo. Se revisaron hemocultivos positivos tomados entre 2014 y 2016 en neonatos y lactantes < 90 días de edad. Se obtuvieron las identificaciones, tiempo de positividad de las bacterias, así como datos clínicos, de laboratorio y demográficos. RESULTADOS: Se identificaron 172 hemocultivos positivos, 51 cumplían los criterios de inclusión. De éstos, 21 microorganismos fueron patógenos (Escherichia coli: 10, Streptococcus agalactiae: 3, Streptococcus pyogenes: 3, otros: 5) y 30 se consideraron contaminación, principalmente Staphylococcus coagulasa negativa. En relación al total de la muestra, la mediana del tiempo de positividad fue de 10 h. A las 24 h de cultivo se detectó crecimiento bacteriano en 94% de la muestra. CONCLUSIÓN: Las bacterias patógenas aisladas en los hemocultivos de pacientes < 90 días de edad, que ingresaron con fiebre, corresponden principalmente a bacilos gramnegativos y estreptococos. Todos los patógenos aislados fueron detectados antes de 24 h de incubación.
BACKGROUND: Fever in infants younger than 90 days may reflect a serious bacterial infection, so blood cultures (BC) are taken routinely and the patient is hospitalized. The observation time to detect occult bacteremia is not well established. AIM: To describe type and positivity time of isolated bacteria in blood cultures in infants under 90 days admitted for fever. METHODS: Retrospective, descriptive study. Positive blood cultures taken between 2014-2016 in young infants admitted for fever were included. Identification and time of positivity of each bacteria, clinical, laboratory and demographic data were recorded. Demographic variables and the clinical outcome was obtained. RESULTS: There were 172 positive blood cultures, only 51 met inclusion criteria. Of these, 21 microorganisms were pathogenic (Escherichia coli: 10, Streptococcus agalactiae: 3, Streptococcus pyogenes: 3, others: 5) and 30 were considered contamination, mainly coagulase negative Staphylococcus. In relation to the total sample, the median time of positivity was 10 hrs. At 24 hours of culture, bacterial growth was detected in 94% of the sample. CONCLUSION: The pathogenic bacteria isolated in the blood cultures of patients younger than 90 days who were admitted with fever correspond mainly to Gram negative bacilli and streptococci. All isolated pathogens were detected before 24 h of incubation.
Subject(s)
Humans , Infant , Child , Bacteremia/diagnosis , Bacteremia/microbiology , Streptococcus agalactiae , Streptococcus pyogenes , Retrospective Studies , Escherichia coli , Fever , HospitalsABSTRACT
RESUMEN Los asilos de ancianos son instituciones con una alta prevalencia de infecciones del tracto urinario ocasionado por Escherichia coli productoras de ß-lactamasas de espectro extendido (BLEE), con diversos factores de virulencia. El objetivo del estudio fue determinar la frecuencia del gen bla CTX-M y de ocho genes de virulencia en 35 E. coli uropatógenas productoras de BLEE provenientes de seis asilos en Perú, durante el 2018. El 57,1% (20/35) de las E. coli fueron portadores del gen bla CTX-M. Además, se obtuvo una frecuencia del 46% (15/35) y 37% (13/35) de hly-alfa y cnf-1, respectivamente; elevada presencia de los genes iucC (63%, 22/35), aer (94%, 33/35) y chuA (94%, 33/34) y una frecuencia del 46% (16/35) y del 91% (32/34) de los genes pap GII y nanA, respectivamente. Existe predominancia en la distribución del gen bla CTX-M, además de una alta frecuencia de exotoxinas que le confieren una ventaja competitiva para diseminarse hacia el torrente sanguíneo.
ABSTRACT Nursing homes are institutions with high prevalence of urinary tract infections caused by ESBL-producing E. coli with several virulence factors. The aim of this study was to determine the frequency of the bla CTX-M gene and eight virulence genes in 35 ESBL-producing uropathogenic E. coli from six nursing homes in Peru during 2018. Of the E. coli samples, 57.1% (20/35) were carriers of the bla CTX-M gene. Furthermore, we obtained frequencies of 46% (15/35) and 37% (13/35) for hly-alpha and cnf-1, respectively; we also found high presence of the iucC (63%, 22/35), aer (94%, 33/35) and chuA genes (94%, 33/34) as well as a frequency of 46% (16/35) and 91% (32/34) for the pap GII and nanA genes, respectively. The bla CTX-M gene is predominant and a high frequency of exotoxins gives it a competitive advantage for spreading into the bloodstream.