Evaluation of the design of the influenza-like illness sentinel surveillance system in Brazil / Evaluación del diseño de la vigilancia centinela de la enfermedad tipo influenza en Brasil / Avaliação do desenho da vigilância sentinela de síndrome gripal no Brasil

Abstract: The influenza-like illness (ILI) sentinel surveillance operates in Brazil to identify respiratory viruses of public health relevance circulating in the country and was first implemented in 2000. Recently, the COVID-19 pandemic reinforced the importance of early detection of the circulation of new viruses in Brazil. Therefore, an analysis of the design of the ILI sentinel surveillance is timely. To this end, we simulated a sentinel surveillance network, identifying the municipalities that would be part of the network according to the criteria defined in the design of the ILI sentinel surveillance and, based on data from tested cases of severe acute respiratory illness (SARI) from 2014 to 2019, we drew samples for each sentinel municipality per epidemiological week. The draw was performed 1,000 times, obtaining the median and 95% quantile interval (95%QI) of virus positivity by Federative Unit and epidemiological week. According to the ILI sentinel surveillance design criteria, sentinel units would be in 64 municipalities, distributed mainly in capitals and their metropolitan areas, recommending 690 weekly samples. The design showed good sensitivity (91.65% considering the 95%QI) for qualitatively detecting respiratory viruses, even those with low circulation. However, there was important uncertainty in the quantitative estimate of positivity, reaching at least 20% in 11.34% of estimates. The results presented here aim to assist in evaluating and updating the ILI sentinel surveillance design. Strategies to reduce uncertainty in positivity estimates need to be evaluated, as does the need for greater spatial coverage.

Resumen: La vigilancia centinela de la enfermedad tipo infuenza (ETI) funciona en Brasil para identificar los virus respiratorios de importancia para la salud pública que circulan en el país y comenzó a ser implementada en 2000. Recientemente, la pandemia de COVID-19 ha reforzado la importancia de la detección temprana de la circulación de nuevos virus en el territorio brasileño. Así, se hace oportuno un análisis del diseño de la vigilancia centinela de la ETI. Para ello, simulamos una red centinela identificando los municipios que formarían parte de la red según los criterios definidos en el diseño de la vigilancia centinela de la ETI y, a partir de los datos de casos testados de infección respiratoria aguda grave (IRAG) de 2014 a 2019, se extrajeron muestras para cada municipio centinela por semana epidemiológica. El sorteo se repitió 1.000 veces y se obtuvo la mediana y el intervalo cuantílico del 95% (IC95%) de la positividad por virus, por Unidad Federativa y semana epidemiológica. Según los criterios del diseño de la vigilancia centinela de la ETI, unidades centinelas estarían en 64 municipios, distribuidas principalmente en capitales y zonas metropolitanas de las capitales, preconizando 690 muestras semanales. El diseño presentó una buena sensibilidad (total de 91,65% considerando el IC95%) para la detección cualitativa de los virus respiratorios, incluso los de baja circulación. Sin embargo, hubo una importante incertidumbre en la estimación cuantitativa de la positividad, alcanzando al menos el 20% en el 11,34% de las estimaciones. Los resultados presentados aquí tienen como objetivo ayudar en la evaluación y actualización del diseño de la red centinela. Es necesario evaluar las estrategias para reducir la incertidumbre en las estimaciones de positividad, al igual que la necesidad de una mayor cobertura espacial.

Resumo: A vigilância sentinela de síndrome gripal atua no Brasil identificando os vírus respiratórios de importância para a saúde pública circulantes no país, e começou a ser implementada em 2000. Recentemente, a pandemia de COVID-19 reforçou a importância da detecção precoce de novos vírus em circulação no território brasileiro. Assim, se faz oportuna uma análise do desenho da vigilância sentinela de síndrome gripal. Para tal, simulamos uma rede sentinela, identificando os municípios que fariam parte da rede segundo os critérios definidos no desenho da vigilância sentinela de síndrome gripal, e, a partir dos dados de casos testados de síndrome respiratória aguda grave (SRAG) de 2014 a 2019, sorteamos amostras para cada município sentinela por semana epidemiológica. O sorteio foi repetido mil vezes, obtendo-se a mediana e intervalo quantílico de 95% (IQ95%) da positividade para cada vírus por Unidade Federativa e semana epidemiológica. Segundo os critérios do desenho da vigilância sentinela de síndrome gripal, unidades sentinelas estariam em 64 municípios, distribuídas principalmente em capitais e suas zonas metropolitanas, o que preconizou 690 amostras semanais. O desenho apresentou boa sensibilidade (total de 91,65%, considerando o IQ95%) para a detecção qualitativa dos vírus respiratórios, mesmo os de baixa circulação. Porém, houve importante incerteza na estimativa quantitativa de positividade, chegando a, pelo menos, 20% em 11,34% das estimativas. Os resultados aqui apresentados visam auxiliar a avaliação e a atualização do desenho da rede sentinela. Estratégias para reduzir a incerteza nas estimativas de positividade precisam ser avaliadas, assim como a necessidade de maior cobertura espacial.

Association between obesity and hospitalization in mild COVID-19 adult outpatients in Brazil: a prospective cohort study

ABSTRACT Objective: To evaluate the association between obesity and hospitalization in mild COVID-19 adult outpatients in Brazil. Subjects and methods: Adults with signs and symptoms suggestive of acute SARS-CoV-2 infection who sought treatment in two hospital (public and private) emergency departments were prospectively enrolled. Patients with confirmed COVID-19 at inclusion were followed by phone calls at days D7, D14 and D28. Multivariable logistic regression models were employed to explore the association between obesity and other potential predictors for hospitalization. Results: A total of 1,050 participants were screened, and 297 completed the 28-day follow-up and were diagnosed with COVID-19 by RT-PCR. The median age was 37.2 (IQR 29.7-44.6) years, and 179 (60.0%) were female. The duration of symptoms was 3.0 (IQR 2.0-5.0) days, and 10.0 (IQR 8.0-12.0) was the median number of symptoms at inclusion. Ninety-five (32.0%) individuals had obesity, and 233 (78.5%) had no previous medical conditions. Twenty-three participants (7.7%) required hospitalization during the follow-up period. After adjusting, obesity (BMI ≥ 30.0 kg/m2) (OR = 2.69, 95% CI 1.63-4.83, P < 0.001) and older age (OR = 1.05, 95% CI 1.01-1.09, P < 0.001) were significantly associated with higher risks of hospitalization. Conclusion: Obesity, followed by aging, was the main factor associated with hospital admission for COVID-19 in a young population in a low-middle income country. Our findings highlighted the need to promote additional protection for individuals with obesity, such as vaccination, and to encourage lifestyle changes.

Low performance of a SARS-CoV-2 point-of-care lateral flow immunoassay in symptomatic children during the pandemic

Abstract Objective: to evaluate the accuracy of an antibody point-of-care lateral flow immunoassay (LFI -Wondfo Biotech Co., Guangzhou, China) in a pediatric population. Methods: children and adolescents (2 months to 18 years) with signs and symptoms suggestive of acute SARS-CoV-2 infection were prospectively investigated with nasopharyngeal RT-PCR and LFI at the emergency room. RT-PCR was performed at baseline, and LFI at the same time or scheduled for those with less than 7 days of the clinical picture. Overall accuracy, sensitivity and specificity were assessed, as well as according to the onset of symptoms (7-13 or ≥14 days) at the time of the LFI test. Results: In 175 children included, RT-PCR and LFI were positive in 51 (29.14%) and 36 (20.57%), respectively. The overall sensitivity, specificity, positive and negative predictive value was 70.6% (95%CI 56.2-82.5), 96.8% (95%CI 91.9-99.1), 90.0% (95%CI 77.2-96.0), and 88.9% (95%CI 83.9-92.5), respectively. At 7-13 and ≥14 days after the onset of symptoms, sensitivity was 60.0% (95%CI 26.2-87.8) and 73.2% (95%CI 57.1-85.8) and specificity was 97.9% (95%CI 88.7-99.9) and 96.1% (95%CI 89.0-99.2), respectively. Conclusion: Despite its high specificity, in the present study the sensitivity of LFI in children was lower (around 70%) than most reports in adults. Although a positive result is informative, a negative LFI test cannot rule out COVID-19 in children.

Diagnostic accuracy of a SARS-CoV-2 rapid test and optimal time for seropositivity according to the onset of symptoms / Acurácia diagnóstica de um teste rápido para SARS-CoV-2 e tempo ótimo para a soropositividade a partir do início dos sintomas / Precisión diagnóstica del test rápido SARS-CoV-2 y período óptimo para la seropositividad según la aparición de síntomas

Point-of-care serological tests for SARS-CoV-2 have been used for COVID-19 diagnosis. However, their accuracy over time regarding the onset of symptoms is not fully understood. We aimed to assess the accuracy of a point-of-care lateral flow immunoassay (LFI). Subjects, aged over 18 years, presenting clinical symptoms suggestive of acute SARS-CoV-2 infection were tested once by both nasopharyngeal and oropharyngeal RT-PCR and LFI. The accuracy of LFI was assessed in periodic intervals of three days in relation to the onset of symptoms. The optimal cut-off point was defined as the number of days required to achieve the best sensitivity and specificity. This cut-off point was also used to compare LFI accuracy according to participants' status: outpatient or hospitalized. In total, 959 patients were included, 379 (39.52%) tested positive for SARS-CoV-2 with RT-PCR, and 272 (28.36%) tested positive with LFI. LFI best performance was achieved after 10 days of the onset of symptoms, with sensitivity and specificity of 84.9% (95%CI: 79.8-89.1) and 94.4% (95%CI: 91.0-96.8), respectively. Although the specificity was similar (94.6% vs. 88.9%, p = 0.051), the sensitivity was higher in hospitalized patients than in outpatients (91.7% vs. 82.1%, p = 0.032) after 10 days of the onset of symptoms. Best sensitivity of point-of-care LFI was found 10 days after the onset of symptoms which may limit its use in acute care. Specificity remained high regardless of the number of days since the onset of symptoms.

Os testes sorológicos no local de atendimento (point-of-care) para a infecção pelo SARS-CoV-2 têm sidos utilizados para o diagnóstico da COVID-19. Entretanto, não está plenamente elucidada a acurácia dos testes ao longo do tempo em relação ao início dos sintomas. Nosso objetivo foi de avaliar a acurácia, no local de atendimento, do imunoensaio de fluxo lateral (LFI). Pacientes com ≥ 18 anos de idade que apresentavam sintomas clínicos sugestivos de infecção aguda pelo SARS-CoV-2 foram testados uma vez com RT-PCR da nasofaringe e orofaringe, além do LFI. A acurácia do LFI foi avaliada com intervalos periódicos de 3 dias a partir do início dos sintomas. O ponto de corte ótimo foi definido como o número necessário de dias para atingir a melhor sensibilidade e especificidade. Esse ponto foi utilizado também para comparar a acurácia do LFI de acordo com a situação do paciente (ambulatorial ou hospitalizado). Foram incluídos 959 pacientes, dos quais 379 (39,52%) testaram positivos para SARS-CoV-2 pelo RT-PCR e 272 (28,36%) pelo LFI. Foi atingido o melhor desempenho para o LFI com 10 dias a partir do início dos sintomas, com sensibilidade e especificidade de 84,9% (IC95%: 79,8-89,1) e 94,4% (IC95%: 91,0-96,8), respectivamente. Embora a especificidade não tenha sido diferente entre os grupos de pacientes (94,6% vs. 88,9%, p = 0,051), a sensibilidade foi mais alta nos pacientes hospitalizados que nos ambulatoriais (91,7% vs. 82,1%, p = 0,032) no dia 10 depois do início dos sintomas. A melhor sensibilidade do LFI no local de atendimento ocorre 10 dias depois do início dos sintomas, o que pode limitar seu uso no atendimento agudo. A especificidade permanece alta, independentemente do número de dias desde o início dos sintomas.

Los puestos de atención para pruebas serológicas del SARS-CoV-2 han sido usado para la diagnosis de la COVID-19. No obstante, su precisión a lo largo del tiempo, en lo que respecta a la aparición de los síntomas, no se ha comprendido completamente. Nuestro objetivo fue evaluar la precisión de un puesto de atención de inmunoanálisis de flujo lateral (LFI). Se hizo pruebas a individuos ≥ 18 años, presentando síntomas clínicos compatibles con una infección aguda de SARS-CoV-2, tanto vía nasofaríngea y orofaríngea RT-PCR, como LFI. La precisión de LFI fue evaluada en intervalos periódicos de 3 días con respecto a la aparición de los síntomas. El punto óptimo de corte se definió como el número de días requerido para alcanzar la mejor sensibilidad y especificidad. Este punto también se usó para comparar la precisión del LFI, según el estatus de los participantes: ambulatorios u hospitalizados. Se incluyeron a 959 pacientes, 379 (39,52%) dieron positivo en las pruebas de SARS-CoV-2 RT-PCR, y 272 (28,36%) fueron positivos en los LFI. Se alcanzó el mejor rendimiento de los LFI tras 10 días de la aparición de los síntomas, con una sensibilidad y especificidad de un 84,9% (IC95%: 79,8-89,1) y 94,4% (IC95%: 91,0-96,8), respectivamente. A pesar de que la especificidad no fue diferente (94,6% vs. 88,9%, p = 0,051), la sensibilidad fue mayor en pacientes hospitalizados que en los ambulatorios (91,7% vs. 82,1%, p = 0,032) tras 10 días desde la aparición de los síntomas. La mejor sensibilidad LFI del puesto de cuidado se produce tras 10 días de la aparición de los síntomas, lo que quizás limite su uso en el cuidado de urgencias. La especificidad permanece alta independientemente del número de días desde la aparición de los síntomas.

Descrição dos casos hospitalizados pela COVID-19 em profissionais de saúde nas primeiras nove semanas da pandemia, Brasil, 2020 / Descripción de los casos hospitalizados por COVID-19 en profesionales de salud en las primeras nueve semanas de la pandemia, Brasil, 2020 / Description of COVID-19 hospitalized health worker cases in the first nine weeks of the pandemic, Brazil, 2020

Objetivo: Descrever os casos hospitalizados pela COVID-19 em profissionais de saúde no Brasil. Métodos: Estudo descritivo de tipo série de casos; foram incluídos aqueles com adoecimento entre 21 de fevereiro e 15 de abril de 2020, registrados no Sistema de Informação de Vigilância da Gripe (SIVEP-Gripe). Resultados: Dos 184 casos, 110 (59,8%) eram do sexo feminino, com mediana de idade de 44 anos (mínima-máxima: 23-85); 89 (48,4%) eram profissionais da enfermagem e 50 (27,2%) eram médicos. Ainda, 92 (50,0%) apresentavam comorbidade, predominando cardiopatias (n=37; 40,2%). Dos 112 profissionais com registro de evolução, 85 (75,9%) alcançaram cura e 27 (24,1%) foram a óbito, 18 destes do sexo masculino. Conclusão: O perfil dos profissionais de saúde hospitalizados por COVID-19 é semelhante ao da população quanto à idade e comorbidades; porém, diferente quanto ao sexo. As áreas profissionais mais acometidas foram a enfermagem e a medicina.

Objetivo: Describir los casos hospitalizados por COVID-19 en profesionales de salud, en Brasil. Métodos: Estudio descriptivo del tipo serie de casos; se incluyeron aquellos que enfermaron entre el 21 de febrero y el 15 de abril de 2020, registrados en el Sistema de Información de Vigilancia de la Gripe (SIVEP-Gripe). Resultados: De los 184 (1,76%) casos 110 (59,8%) eran del sexo femenino, con promedio de edad de 44 años (mínima-máxima: 23-85), 89 (48,4%) eran profesionales de enfermería y 50 (27,2%) médicos. Además, 92 (50,0%) presentaron comorbilidad, predominando las cardiopatías (n=37; 40,2%). De los 112 profesionales con un historial de evolución, 85 (75,9%) fueron curados y 27 (24,1%) murieron, 18 de los cuales era de sexo masculino. Conclusión: El perfil de los hospitalizados por COVID-19 es similar al de la población en edad y comorbilidades, aunque diferente con relación a sexo. Las áreas más afectadas fueron la enfermería y la medicina.

Objective: To describe COVID-19 hospitalized health worker cases in Brazil. Methods: This was a descriptive case series study; it included cases that became ill between February 21st and April 15th, 2020 registered on the Influenza Surveillance Information System (SIVEP-Gripe, acronym in Portuguese). Results: Of the 184 cases, 110 (59.8%) were female and median age was 44 years (min-max: 23-85); 89 (48.4%) were nursing professionals and 50 (27.2%) were doctors. Ninety-two (50.0%) presented comorbidity, with heart disease predominating (n=37; 40.2%). Of the 112 professionals with a record of case progression, 85 (75.9%) were cured and 27 (24.1%) died, 18 of whom were male. Conclusion: The profile of COVID-19 hospitalized health workers is similar to that of the general population with regard to age and comorbidities, but different in relation to sex. The most affected areas were nursing and medicine.

Monitoramento da síndrome gripal em adultos nas capitais do Brasil e no Distrito Federal por meio de inquérito telefônico / Influenza like illness monitoring in adults of the State Capitals and Federal District in Brazil by telephone survey

OBJETIVOS: Com o objetivo de estimar a prevalência da síndrome gripal em adultos das capitais e regiões do Brasil, realizou-se monitoramento da ocorrência de sinais e sintomas compatíveis por inquérito telefônico (VIGITEL) em 2010. MÉTODO: Estudo transversal que contou com 47.876 entrevistas nas capitais dos estados brasileiros e no Distrito Federal, com amostragem probabilística da população >18 anos, residente em domicílios com linha fixa de telefone. Foram analisadas as questões referentes à síndrome gripal e influenza pandêmica (H1N1) 2009, no período de 10 de janeiro a 30 de novembro de 2010. Os percentuais foram calculados para as regiões do país e para o Brasil e ponderados segundo a distribuição sociodemográfica da PNAD 2008. RESULTADOS: A prevalência de indivíduos, com algum sinal ou sintoma de gripe nos 30 dias anteriores à entrevista, foi de 31,2 por cento (IC95 por cento 30,2-32,2 por cento). O relato de síndrome gripal foi mais frequente entre as mulheres, adultos jovens (18 a 29 anos) e aquelas pessoas com 9 a 11 anos de estudo. A maior prevalência de sinais ou sintomas gripais ocorreu na região Norte. Verificou-se tendência crescente com posterior decréscimo em todas as regiões, exceto na Nordeste. A procura pelo serviço de saúde foi relatada por 26,8 por cento (IC95 por cento 25,1-28,5) das pessoas que adoeceram. A suspeita médica de influenza pandêmica (H1N1) 2009 ocorreu em 2,6 por cento (IC95 por cento 1,8-3,4) dos entrevistados que relataram ter procurado o serviço de saúde. CONCLUSÃO: Os resultados deste inquérito forneceram informações oportunas e úteis, as quais não foram captadas pelo sistema de vigilância tradicional, como a ocorrência de sinal ou sintoma gripal e a procura pelo serviço de saúde.

OBJECTIVES: In order to estimate the prevalence of influenza like illness (ILI) in adults from all state capitals and geographic regions in Brazil, a periodical monitoring of ILI cases by the national telephone survey (VIGITEL) was carried out in 2010. METHOD: A cross-sectional study with 47,876 telephone interviews in the state capitals and Federal District, a probabilistic sample of adult population (>18 years-old) with landline telephone. Questions concerning the results of ILI cases and pandemic influenza (H1N1) 2009, from January 10 to November 30, were analyzed. The proportion of cases stratified by sociodemographic characteristics and Brazilian geographic region was weighted with data from the National Survey with Household Sampling (PNAD) 2008. RESULTS: The prevalence of ILI cases in the last 30 days before interview was 31.2 percent (95 percentCI 30.2-32.2 percent) for all state capitals and the Federal District. This prevalence was higher among women, young adults (18 to 29 years-old) and individuals with 9 to 11 years of schooling. According to the geographic region analysis, Northern Brazil presented the highest prevalence of ILI cases. A tendency to increase with further decrease was observed among the geographic regions, except the Northeast. Need for health care assistance was reported by 26.8 percent (95 percentCI 25.1-28.5) from ILI cases. Among ILI cases that sought health care assistance, 2.6 percent (95 percentCI 1.8-3.4) reported pandemic influenza (H1N1) 2009 medical suspicion. CONCLUSION: The results of this survey supported influenza surveillance as it provided timeliness and useful surveillance information, which were not captured by the traditional surveillance system, as the occurrence of ILI and need of health care assistance.

Malária em Cruzeiro do Sul (Amazônia Ocidental brasileira): análise da série histórica de 1998 a 2008 / Malaria in Cruzeiro do Sul (Western Brazilian Amazon): analysis of the historical series from 1998 to 2008

OBJETIVO. Descrever as características epidemiológicas da malária e seus principais determinantes no Município de Cruzeiro do Sul, no Estado do Acre, Brasil, entre 1998 e 2008 MÉTODOS. Este estudo descritivo, retrospectivo, utilizou dados secundários disponíveis nos sistemas de informação em malária desenvolvidos pelo Ministério da Saúde do Brasil (SISMAL/SIVEP-Malária). Os dados foram analisados no software TABLEAU®. Dados geo-espaciais foram obtidos para avaliar a distribuição dos casos de malária. RESULTADOS: A incidência parasitária anual (IPA) de 27 casos/1-000 habitantes em 1998 chegou a 571,5 casos/1-000 habitantes em 2006, quando a cidade registrou sua maior epidemia, subsequente ao estabelecimento de um programa estadual de incentivo à perfuração de tanques para piscicultura, em 2005. As localidades rurais apresentaram maior número de casos. Entretanto, as localidades periurbanas que possuíam tanques de piscicultura tiveram IPAs mais elevadas do que áreas sem tanques. Após a intensificação das ações do Programa Nacional de Controle da Malária, a IPA diminuiu para 152,9 casos/1-000 habitantes em 2008. CONCLUSÕES. O incentivo a atividades econômicas em áreas periurbanas de transmissão instável de malária, típicas da América Latina, deve ser muito bem planejado. O controle da malária em Cruzeiro do Sul baseou-se em estratégias integradas implementadas simultaneamente pelos governos federal, estadual e municipal, como preconizado pelo Plano Nacional de Controle da Malária. É importante ressaltar a utilidade de um bom sistema de informação como o SIVEP-Malária para estimar a carga de doença e monitorar de forma eficiente o impacto das intervenções.

OBJECTIVE: To describe the epidemiological characteristics of malaria and its main determinants in the municipality of Cruzeiro do Sul, State of Acre, Brazil, between 1998 and 2008. METHODS: This descriptive, retrospective study was carried out with secondary data available from the malaria information systems developed by the Brazilian Ministry of Health (SISMAL/SIVEP-Malária). The data were analyzed using the TABLEAU® software. Geospatial data were obtained to assess the distribution of malaria cases. RESULTS: The annual parasite incidence (API) of 27 cases/1 000 population in 1998 reached 571.5 cases/1 000 population in 2006, the year in which the city recorded its largest epidemics, following the establishment of a state program that encouraged the digging of tanks for fish farming in 2005. Rural sites had the highest number of cases. However, peri-urban locations with fish tanks had higher APIs than peri-urban areas without tanks. Following the strengthening of control actions by the National Malaria Control Program, the API in Cruzeiro do Sul dropped to 152.9 cases/1 000 population in 2008. CONCLUSIONS: The type of economic activity fostered in peri-urban areas characterized by unstable malaria transmission, which are typical of Latin America, must be very well planned. Malaria control in Cruzeiro do Sul relied on integrated strategies implemented simultaneously by federal, state, and city governments, as recommended by the National Malaria Control Program. It is important to underscore the usefulness of a reliable information system such as SIVEP-Malária to estimate the burden of disease and efficiently monitor the impact of interventions.