Two years into the Brazilian Reproducibility Initiative: reflections on conducting a large-scale replication of Brazilian biomedical science

Scientists have increasingly recognised that low methodological and analytical rigour combined with publish-or-perish incentives can make the published scientific literature unreliable. As a response to this, large-scale systematic replications of the literature have emerged as a way to assess the problem empirically. The Brazilian Reproducibility Initiative is one such effort, aimed at estimating the reproducibility of Brazilian biomedical research. Its goal is to perform multicentre replications of a quasi-random sample of at least 60 experiments from Brazilian articles published over a 20-year period, using a set of common laboratory methods. In this article, we describe the challenges of managing a multicentre project with collaborating teams across the country, as well as its successes and failures over the first two years. We end with a brief discussion of the Initiative's current status and its possible future contributions after the project is concluded in 2021.

37 years of scientific activity in a Biochemistry Department in Brazil: patterns of growth and factors leading to increased productivity

Scientific activity in Brazil has experienced an accelerated growth in the past decades, with an increase in productivity that greatly surpasses the international average. This growth has occurred mostly at the expense of centers of excellence in public universities, which account for the vast majority of the country's scientific output. The aim of this study was to evaluate the production of the Department of Biochemistry of a large public university in southern Brazil (Universidade Federal do Rio Grande do Sul), as well as to identify internal and external policies that have influenced this growing production profile. We have performed a historical analysis of the scientific output of this Department of Biochemistry, which accounts for a considerable share of the indexed scientific production at this university. By focusing on the temporal course of its growth and drawing correlations between scientific output and important events in the history of the Department of Biochemistry and of the Brazilian science policies, we concluded that internal factors (as the creation of a postgraduation program, collaboration among researchers, experienced abroad researchers, qualification of faculty members) and external factors (as investments in the postgraduate education, the establishment of national scientific policies, such as financial stimuli for productive researchers and evaluation systems) influence scientific productivity in Brazil.

A atividade científica no Brasil apresentou um crescimento acelerado nas últimas décadas, com um aumento na produtividade que ultrapassou os valores médios internacionais. Este crescimento tem ocorrido através dos centros de excelência em pesquisa nas Universidades Públicas, as quais são responsáveis pela maior parte da produção científica do país. O presente estudo tem como objetivo avaliar a produção do Departamento de Bioquímica de uma grande universidade pública do sul do Brasil (Universidade Federal do Rio Grande do Sul - UFRGS), bem como identificar os fatores internos e externos que influenciaram este perfil crescente de produção. Foi realizada uma análise histórica da produção científica do Departamento, a qual representa uma parte considerável da produção científica da Universidade. Ao enfocar a evolução temporal do seu crescimento e o estudo das correlações entre a produção científica e eventos importantes na história do Departamento de Bioquímica e das políticas científicas brasileiras, podemos concluir que os fatores internos (como a criação de um programa de pós-graduação, a colaboração entre pesquisadores, a experiência no exterior por parte dos pesquisadores, a qualificação dos docentes) e fatores externos (como os investimentos na formação de pós-graduandos, o estabelecimento de políticas nacionais científicas, tais como estímulos financeiros para os pesquisadores produtivos e sistemas de avaliação) influenciam a produção científica no Brasil.

Pathogenesis of hepatic encephalopathy - a role for the benzodiazepine receptor?

A encefalopatia hepática (EH) é uma síndrome multifatorial, na qual a funçäo do sistema nervoso central está alterada devido às conseqüências metabólicas da disfunçäo hepática. Os dois principais componentes das doenças hepáticas que levam à EH säo a diminuiçäo no número de hepatócitos funcionantes e o rearranjo vascular, que leva à diminuiçäo na fraçäo de sangue, efetivamente detoxificado pelo fígado. Os sintomas da EH podem variar de déficits cognitivos leves até o coma profundo. Algum grau de morte neuronal pode ser observado em pacientes com EH, como conseqüência da cirrose hepática, ou, na EH avançada, da presença de edema cerebral. No entanto, a maior parte da síndrome neurológica é reversível com a compensaçäo da doença hepática. A etiologia da EH näo é totalmente conhecida e trata-se, provavelmente, de um processo multifatorial. Inicialmente, as teorias apontavam para o acúmulo de neurotoxinas que prejudicariam a funçäo neuronal. Mais recentemente, anormalidades em vários sistemas de neurotransmissäo foram propostos como causas potenciais da EH como, por exemplo, o aumento observado na neurotransmissäo GABAérgica. Existe evidência de que este aumento esteja relacionado com o aumento da potenciaçäo GABAérgica por substâncias de açäo similar aos benzodiazepínicos, as quais se encontram aumentadas na EH. Com esta evidência em mente, foi tentada a terapia desta síndrome com flumazenil, um antagonista benzodiazepínico, o qual tem mostrado eficácia clínica em uma porcentagem variável de pacientes em estudos recentes. No entanto, ainda näo há evidências conclusivas para sustentar uma relaçäo causal entre o aumento de ligantes ao receptor de benzodiazepínicos e os sintomas da EH. É possível que esta relaçäo exista em alguns, mas näo em todos os pacientes com esta síndrome.