Determinacion de los factores de riesgo en sepsis por Enterococcus vancomicino resistente. Estudio de casos y controles en pacientes criticamente enfermos / Determination of risk factors in sepsis by Enterococcus vancomicyn resistant. Study of cases and control in criticall ill patients

Resumen Introducción: las infecciones causadas por Enterococcus resistente a Vancomicina (EVR) presentan mayor mortalidad en pacientes críticos, asociado a un aumento gradual en este patrón de resistencia, especialmente en el continente americano, por lo cual la adecuada terapia antimicrobiana empírica es fundamental para mejorar los desenlaces. Objetivo: determinar los factores de riesgo asociados al desarrollo de infección por EVR en pacientes sépticos en la Unidad de Cuidados Intensivos (UCI) del Hospital San José en Bogotá, Colombia. Métodos: Estudio descriptivo de casos y controles en pacientes sépticos ingresados a la UCI durante 2016 y 2017. Los casos se definieron como pacientes con infección por EVR y los controles los pacientes con infección por otro germen. Resultados: se incluyeron 32 pacientes con aislamiento de EVR y 96 controles. Los factores de riesgo asociados a infección por EVR fueron: nutrición parenteral (OR 15,7 IC 4,2-71,4), lavado peritoneal (OR 8,9 IC 3,2-24,8), cultivo polimicrobiano (OR 19,9 IC 6,0-83,4). La mortalidad fue 56,2% en casos y 33,3% en controles. Conclusiones: Los factores de riesgo hallados con mayor frecuencia fueron: múltiples lavados peritoneales, nutrición parenteral y cultivos polimicrobianos. Encontramos una correlación significativa en el uso de antibiótico empírico adecuado y la reducción en la mortalidad.

Summary Introduction: infections caused by Vancomycin-resistant Enterococcus (VRE) have higher mortality in critically ill patients, associated with increase in this pattern of resistance, especially in the Americas, which is why adequate empirical antimicrobial therapy is essential to improve outcomes Objective: to determine the risk factors associated with the development of infection by VRE in septic patients in the Intensive Care Unit (ICU) of San José Hospital in Bogotá, Colombia. Methods: Case-control study in septic patients admitted to the ICU during 2016 and 2017. The cases were defined as patients with VRE infection and the controls were patients with infection by another germ. Results: 32 patients with EVR isolation and 96 controls were included. The risk factors associated with infection by EVR were: parenteral nutrition (OR 15.7 IC 4.2-71.4), peritoneal lavage (OR 8.9 IC 3.2-24.8), polymicrobial culture (OR 19,9 IC 6.0-83.4). Mortality was 56.2% in cases and 33.3% in controls. Conclusions: The risk factors found most frequently were: multiple peritoneal lavage, parenteral nutrition and polymicrobial cultures. We found a significant correlation in the use of adequate empirical antibiotic and the reduction in mortality

Medicina de precisión en sepsis: utilidad de los en sepsis: utilidad de los biomarcadores en pacientes críticamente enfermos / Precision medicine in sepsis: usefulness of biomarkers In critically ill patientsbiomarkers In critically ill patients

Durante años la evolución del cuidado intensivo ha intentado ofrecer una atención basada en protocolos y paquetes de manejo agrupados por patologías y cuadro sindromáticos. Aunque se logró disminuir la mortalidad en diferentes patologías (sepsis y síndromes coronario agudo y de distrés respiratorio agudo), no se han resuelto por completo los problemas clínicos, en especial el diagnóstico y el manejo. Una nueva opción ha surgido en el horizonte denominada "medicina de precisión", entendida como estrategia de prevención y tratamiento que tiene en cuenta la variabilidad individual. La sepsis es un síndrome con múltiples aristas en cuanto al fenotipo y genotipo, cuyo diagnóstico temprano es relevante para los desenlaces clínicos. Hasta el momento el enfoque principal ha sido la identificación de un germen etiológico para diferenciarla del síndrome de respuesta inflamatoria sistémica (SIRS). En los últimos años el paradigma en enfermedades infecciosas ha cambiado debido a estudios que demuestran como la respuesta inmunitaria del paciente séptico tiene un papel clave en el desarrollo de la enfermedad, con implicaciones en el diagnóstico, pronóstico y tratamiento, que podrían ayudar a cambiar el abordaje en los próximos años gracias a una estrategia basada en medicina de precisión. Hoy los aislamientos microbiológicos y los cultivos siguen siendo el estándar de referencia con varias desventajas como el tiempo para obtener resultados, sobre todo en infecciones por gérmenes resistentes u hongos, que pueden retrasar el inicio de la terapia antimicrobiana. Como alternativa se ha planteado el uso de biomarcadores en sepsis que, siendo productos de la respuesta inflamatoria del individuo ante la infección, son útiles para el diagnóstico y pronóstico primordialmente en los críticamente enfermos. Decidimos realizar esta revisión narrativa acerca de la utilidad de los biomarcadores en pacientes con sepsis críticamente enfermos, para enfocarlos en un modelo de medicina personalizada.

For many years, critical care practice has been based on protocols and management guidelines categorized by pathologies or syndromes. Although mortality caused by various diseases such as sepsis, acute coronary syndrome and acute respiratory distress has decreased, clinical problems, particularly diagnosis and management, have not been completely resolved. A new option known as "precision medicine" is on the horizon, a prevention and treatment strategy based on individual variability. Sepsis is a syndrome encompassing multiple clinical phenotypes and genotypes coding and a prompt diagnosis is relevant to obtain better outcomes. To this moment the main approach has been the identification of microorganisms causing sepsis to distinguish sepsis from systemic inflammatory response (SIRS). Infectious diseases paradigm has changed during recent years due to studies demonstrating how septic patient immune response plays a key role in the development of the disease, with implications on diagnosis, prognosis and treatment, which may help change the approach in the next years thanks to a strategy based on precision medicine. Today microbiological identification and cultures continue to be the reference standard with several disadvantages such as turnaround time for test results predominantly in infections caused by resistant bacteria or fungi that may delay commencement of antibiotic therapy. The use of sepsis biomarkers determined by the individual ́s inflammatory response to infection have been proposed as a useful alternative for establishing diagnosis and prognosis mainly in critically ill patients. We decided to conduct this narrative review on the usefulness of biomarkers in critically ill septic patients using a personalized medicine model.

Description of an in vivo oral mucosa HSV-1 infection model in mice

In this work, we established an in vivo murine model of herpes simplex virus type 1 (HSV1) infection involving inoculation by scarification of the oral mucosain order to study its dissemination towards the trigeminal ganglion (TG). Both viral DNA and infectious virions were detected on the third day postinfection (p.i.). Viral proteins revealed by immunohistochemistry were mainly found at seven days p.i., when the latencyassociated transcript (LAT) was also detected. This model simulated the dissemination process of HSV1, which could be used to study herpes pathogenesis starting in the oral mucosa (AU)

Con el propósito de estudiar la dispersión de del Herpes Simplex Virus tipo 1 (HSV1) desde la mucosa oral hasta los ganglios trigeminales, en el presente trabajo se estableció un modelo de infección en ratones, haciendo inoculación por escarificación en la mucosa oral. Tanto ADN viral como viriones infecciosos se detectaron en los ganglios trigeminales al dia 3 postinfección (p.i.). Las proteínas virales se detectaron principalmente al día 7 p.i. cuando los transcritos asociados a latencia también fueron encontrados. El modelo de infección simula adecuadamente el proceso de dispersión del HSV1 y puede ser usado para el estudio de la patogénesis por herpes después de la infección primaria en la mucosa oral (AU)

Determinación de parámetros fisicoquímicos y microbiológicos de la chicha en Bogotá / Determination of physico-chemical and microbiological parameters of the "Chicha" drink in Bogota

Introducción y objetivo: En el laboratorio de salud pública de la Secretaría Distrital de salud se realizó el estudio de caracterización de la bebida fermentada denominada Chicha durante el l Festival de la Chicha, el Maíz y la Dicha, con objeto de evaluar sus parámetros fisicoquímicos y microbiológicos y determinar su inocuidad para la salud del consumidor. Método: Se colectaron 49 muestras, a las que se hicieron análisis microbiológicos y fisicoquímicos. Resultados: El análisis microbiológico arrojó un 3,9% de muestras negativas para coliformes fecales; un 93,9% negativas para Bacillus cereus; un 100% negativas para salmonella, y de un 42,9% para mohos. El pH obtuvo un valor medio de 3,44 y el grado alcohólico promedio fue de 3,35%, con valor máximo de 5,2%. En ninguna de las muestras analizadas se detectaron trazas de metanol. Discusión: El punto óptimo de fermentación de la bebida se obtiene entre 15 y 20 días de desarrollo, con contenidos de etanol alrededor de 4%. Por lo tanto, la bebida no debe expenderse para consumo antes de 15 días de proceso de fermentación. Así, la bebida es inocua para el consumidor; siempre y cuando sea elaborada, almacenada y comercializada siguiendo los procedimientos adecuados para la manipulación de alimentos, utilizando materias primas de buena calidad y educación a los productores y distribuidores. Palabras clave: bebida fermentada, grado alcohólico, pH, metanol, coliformes fecales, recuento de mohos, Bacillus cereus, detección de salmonella.

Background and objective: Bogota’s Public Health Laboratory (District Secretariat of Health) carried out a study to characterize the fermented drink called “chicha” during the Festival of Chicha, Corn and Happiness with the aim of evaluating its physicochemical and microbio- logical parameters and determining its innocuousness for consumers’ health. Materials and Methods: Physicochemical and microbiological analysis were made to 49 samples collected. Results:The Microbiological results were as follows: 93.9% of the samples were negative for fecal coliforms, 93.9% were negative for Bacillus cereus, 100% were negative for salmonella, and for molds 42.9% of the samples had higher counts of the punctual estimator as a result of highly humid storage locations and the acidity of the drink. The mean pH value was 3.44. The average alcohol content was 3.35% and the top value was 5.2%. No traces of Methanol were detected in the analyzed samples. Discussion. The optimal fermentation of the beverage is reached after 15 and 20 days, with an ethanol content of about 4.0%. Therefore, the drink should not be sold for consumption before 15 days of fermentation. The conclusion is that the drink is safe for the consumer as long as it is processed, stored, and marketed according to suitable food handling procedures, good quality raw materials and trained producers and distributors. Recommendations: This study is a technical review to be used for future regulations or rules of the drink called “Chicha”. It is also a tool to apply surveillance and control actions aimed at improving the production and marketing of that drink. Keywords: Fermented beverage, alcohol proof, pH, methanol, fecal Coliforms, fungi recount,Bacillus cereus, detection of Salmonella sp.