Chronic medical conditions associated with invasive pneumococcal diseases in inpatients in teaching hospitals in São Paulo city: Estimating antimicrobial susceptibility and serotype-coverage of pneumococcal vaccines

Background: Chronic conditions increase the risk of invasive pneumococcal diseases (IPD). Pneumococcal vaccination remarkably reduced IPD morbimortality in vulnerable populations. In Brazil, pneumococcal vaccines are included in the National Immunization Program (PNI): PCV10 for < 2 years-old, and PPV23 for high risk-patients aged ≥ 2 years and institutionalized ≥ 60 years. PCV13 is available in private clinics and recommended in the PNI for individuals with certain underlying conditions. Methods: A retrospective study was performed using clinical data from all inpatients from five hospitals with IPD from 2016 to 2018 and the corresponding data on serotype and antimicrobial-non-susceptibility of pneumococcus. Vaccine-serotype-coverage was estimated. Patients were classified according to presence of comorbidities: healthy, without comorbidities; at-risk, included immunocompetent persons with specific medical conditions; high-risk, with immunocompromising conditions and others RESULTS: 406 IPD cases were evaluated. Among 324 cases with information on medical conditions, children < 5 years were mostly healthy (55.9%), while presence of comorbidity prevailed in adults ≥ 18 years old (> 82.0%). Presence of ≥1 risk condition was reported in ≥ 34.8% of adults. High-risk conditions were more frequent than at-risk in all age groups. Among high-risk comorbidity (n = 211), cancer (28%), HIV/AIDS (25.7%) and hematological diseases (24.5%) were the most frequent. Among at-risk conditions (n = 89), asthma (16.5%) and diabetes (8.1%) were the most frequent. Among 404 isolates, 42.9% belonged to five serotypes: 19A (14.1%), 3 (8.7%), 6C (7.7%), 4 and 8 (6.2% each); 19A and 6C expressed antimicrobial-non-susceptibility. The vaccine-serotype-coverage was: PCV10, 19.1%, PCV13, 43.8%; PCV15, 47.8%; PCV20, 62.9%; PCV21, 65.8%, and PPV23, 67.3%. Information on hospital outcome was available for 283 patients, of which 28.6% died. Mortality was 54.2% for those with meningitis. Conclusion: Vaccine with expanded valence of serotypes is necessary to offer broad prevention to IPD. The present data contribute to pneumococcal vaccination public health policies for vulnerable patients, mainly those with comorbidity and the elderly. Keywords: Antimicrobial resistance; Chronic diseases; Comorbidity; Invasive pneumococcal diseases; Pneumococcal conjugate vaccine; Pneumococcal serotypes; Pneumococcal vaccine.

Chronic medical conditions associated with invasive pneumococcal diseases in inpatients in teaching hospitals in São Paulo city: Estimating antimicrobial susceptibility and serotype-coverage of pneumococcal vaccines

ABSTRACT Background: Chronic conditions increase the risk of invasive pneumococcal diseases (IPD). Pneumococcal vaccination remarkably reduced IPD morbimortality in vulnerable populations. In Brazil, pneumococcal vaccines are included in the National Immunization Program (PNI): PCV10 for < 2 years-old, and PPV23 for high risk-patients aged ≥ 2 years and institutionalized ≥ 60 years. PCV13 is available in private clinics and recommended in the PNI for individuals with certain underlying conditions. Methods: A retrospective study was performed using clinical data from all inpatients from five hospitals with IPD from 2016 to 2018 and the corresponding data on serotype and antimicrobial-non-susceptibility of pneumococcus. Vaccine-serotype-coverage was estimated. Patients were classified according to presence of comorbidities: healthy, without comorbidities; at-risk, included immunocompetent persons with specific medical conditions; high-risk, with immunocompromising conditions and others Results: 406 IPD cases were evaluated. Among 324 cases with information on medical conditions, children < 5 years were mostly healthy (55.9%), while presence of comorbidity prevailed in adults ≥ 18 years old (> 82.0%). Presence of ≥1 risk condition was reported in ≥ 34.8% of adults. High-risk conditions were more frequent than at-risk in all age groups. Among high-risk comorbidity (n = 211), cancer (28%), HIV/AIDS (25.7%) and hematological diseases (24.5%) were the most frequent. Among at-risk conditions (n = 89), asthma (16.5%) and diabetes (8.1%) were the most frequent. Among 404 isolates, 42.9% belonged to five serotypes: 19A (14.1%), 3 (8.7%), 6C (7.7%), 4 and 8 (6.2% each); 19A and 6C expressed antimicrobial-non-susceptibility. The vaccine-serotype-coverage was: PCV10, 19.1%, PCV13, 43.8%; PCV15, 47.8%; PCV20, 62.9%; PCV21, 65.8%, and PPV23, 67.3%. Information on hospital outcome was available for 283 patients, of which 28.6% died. Mortality was 54.2% for those with meningitis. Conclusion: Vaccine with expanded valence of serotypes is necessary to offer broad prevention to IPD. The present data contribute to pneumococcal vaccination public health policies for vulnerable patients, mainly those with comorbidity and the elderly.

Prevalência de sorotipos e resistência antimicrobiana de cepas invasivas do Streptococcus pneumoniae / Prevalence of serotypes and antimicrobial resistance of invasive strains of Streptococcus pneumoniae

OBJETIVO: Avaliar o perfil de sorotipos e a susceptibilidade aos antimicrobianos de cepas de Streptococcus pneumoniae obtidas em espécimes clínicos de pacientes com doença invasiva, bem como suas implicações na formulaçäo de vacinas pneumocócicas. MÉTODOS: Cepas de pneumococo isoladas no Laboratório de Análises Clínicas do Hospital de Clínicas da Universidade Federal de Uberlândia a partir de amostras clínicas de pacientes com doença invasiva foram identificadas e enviadas ao Instituto Adolfo Lutz em São Paulo para confirmaçäo da identificaçäo, sorotipagem e determinaçäo da susceptibilidade aos antimicrobianos. RESULTADOS: De abril de 1999 a março de 2003, foram isoladas 148 cepas invasivas de pneumococo, sendo 84 (56,7 por cento) provenientes de pacientes do sexo masculino. A idade variou de um dia a 88,83 anos, com média de 21,33+25,82 anos e mediana de 4,42 anos. Os diagnósticos clínicos mais comuns foram pneumonia (91 casos; 61,4 por cento), meningite (32 casos; 21,6 por cento) e bacteremia sem foco evidente (15 casos; 10,1 por cento). As principais fontes de recuperaçäo foram sangue (76 amostras; 51,3 por cento), líquido pleural (39; 26,3 por cento) e liquor (30; 20,2 por cento). No total, foram identificados 23 diferentes sorotipos entre 143 amostras testadas, sendo os mais comuns os seguintes: 14, 3, 1, 5, 6A, 6B e 18C. Dentre 30 (20,2 por cento) cepas oxacilina-resistentes, 23 (15,5 por cento) confirmaram a resistência à penicilina (12,8 por cento com nível intermediário e 2,7 por cento, com nível pleno), que esteve restrita aos sorotipos 14, 23F, 19A e 6B, predominando em indivíduos com até dois anos de idade (p = 0,0008). Foi detectada susceptibilidade diminuída ao cotrimoxazol (63,4 por cento), à eritromicina (8,3 por cento), à clindamicina (8,7 por cento) e à ofloxacina (0,8 por cento). A resistência à cefotaxima foi detectada em três das 30 cepas testadas (2 por cento das 148), todas elas com resistência confirmada à penicilina. Näo foi observada resistência a cloranfenicol, rifampicina ou vancomicina. CONCLUSÕES: A resistência à penicilina foi detectada em 15,5 por cento das cepas e predominou em crianças abaixo de dois anos de idade. Foram identificados 23 diferentes sorotipos de Streptococcus pneumoniae em pacientes internados com doença invasiva, e a maioria dos sorotipos (82,6 por cento) e das cepas (90,2 por cento) está incluída na vacina polissacarídica 23-valente

Empiemas pleurais pneumocócicos: distribuição dos sorotipos de Streptococcus pneumoniae e sensibilidade à penicilina / Pneumococcic pleural empyema: streptococcus pneumoniae serotypes and their sensitivity to penicillin

Estudo prospectivo de 50 crianças portadoras de empiema pleural pneumocócico adquirido na comunidade, hospitalizadas no Departamento de Pediatria da Santa Casa de São Paulo, no período de janeiro de 1998 a dezembro de 2000. Foram identificados os sorotipos dos Streptococcus pneumoniae e sua sensibilidade à penicilina. Observou-se que os empiemas pleurais pneumocócicos ocorreram em número significativo durante todo o ano, 50 por cento dos casos em crianças menores de 2 anos e predomínio do sexo masculino. O melhor local para o isolamento do Streptococcus pneumoniae foi o líquido pleural, sendo responsável por 86,0 por cento dos isolados. Os sorotipos de Streptococcus pneumoniae isolados foram em ordem decrescente de freqüência: 14 = 23 casos; 1 = 10 casos; 5 = 7 casos; 4 = 3 casos; 6B = 2 casos e os sorotipos 3, 8, 9V, 15A, e 23F com um caso cada. Os sorotipos 14, 1 e 5 foram responsáveis por 80,0 por cento dos isolados, dados estes que se assemelham a outros estudos realizados na cidade de São Paulo em pacientes com pneumonia. Resistência à penicilina foi identificada em oito cepas (16,0 por cento), sendo sete (14 por cento) moderadamente resistentes e uma (2 por cento) com resistência plena. Dos Streptococcus pneumoniae resistentes, 6/8 dos casos foram do sorotipo 14 e os sorotipos 1 e 6B com um caso cada.

Menigite Pneumocócica na infância: características clínicas, sorotipos mais prevalentes e prognóstico / Pneumococcal meningitis in children: clinical findings, most frequent serotypes and outcome

Objetivo: Avaliar letalidade, morbidade, resistência bacteriana e sorotipos mais freqüentes em crianças internadas por meningite bacteriana. Métodos: selecionamos crianças com meningite bacteriana com cultura positiva para S. pneumoniae, entre 1 mês e 15 anos, internadas em dois hospitais em São Paulo, e analisamos dados clínicos e microbiológicos. A identificação do S. pneumoniae foi realizada através do teste de optoquina e solubilidade em bile. Todas as cepas foram testadas com disco de oxacilina 1µg e, nas cepas que apresentaram alo de inibição <20mm, foi avaliada a concentração inibitório mínima para penicilina, cloranfenicol, eritromicina, ceftriaxona, vancomicina e trimetroprim/sulfametoxazole pelo método do E-teste. As cepas de pneumococo foram sorotipadas através da reação de Quellung. A evolução clínica dos pacientes foi analisada através de revisão retrospectiva dos prontuários, com uso de um protocolo uniforme de avaliação. Resultados: incluimos 55 pacientes com meningite pneumocócica, sendo que 52,5 por cento delas apresentava idade menor de 6 meses. Das cepas isoladas, 36 por cento apresentavam infecção por cepa com resistência intermediária à penicilina (0,1µg/ml menor ou igual CIM menor ou igual 1,0µg/ml). Das cepas com susceptibilidade diminuída à penicilina, 35 por cento era resistente à trimetoprim/sulfametoxazole. Não houve resistência aos outros antibióticos testados. A letalidade foi de 20 por cento, e houve seqüelas neurológicas em 40 por cento das crianças avaliadas. Houve correlação estatisticamente significante entre letalidade e alteração neurológica com idade abaixo de 6 meses. Os sorotipos do pneumococo mais freqüentemente encontrados foram 1, 5, 6B, 14, 19A, 23F, sendo que 70 por cento dos sorotipos encontrados estão presentes na vacina heptavalente, recentemente liberada. Conclusão: meningite pneumocócica apresenta alta letalidade e alta morbidade, e a vacina heptavalente tem utilidade potencial na sua prevenção

Community acquired Pneumonia among pediatric outpatients in Salvador, northeast Brazil, with emphasis on the role of pneumococcus

Pneumonia is one of the leading causes of hospitalization and death among children in developing counties,, and mortality due to pneumoniae has been associated with S. pneumoniae infection. This investigation was designed to describe the antimicrobial susceptibility and serotype patterns of pneumococcal strains recovered from the blood of children with community-acquired pneumonia (CAP) and to acess the clinical findings of pneumococcal bacteremic patients with pneumonia. In a 26 month prospective study, blood cultures were obtained as often as possible from children(<16 years of age) diagnosed with CAP in two emergency rooms. Antimicrobial drug susceptibility tests and serotyping were performed when pneumococcus was identified. We studied 3,431 cases and cultured blood samples from 65.5 percent of those. Pneumococcus was recovered from 0.8 percent of the blood samples. The differences in age, somnolence, wheezing and hospitalization among children with and without pneumococcal bacteremia were statistically significant. Pneumococcal bacteremia was age-related (mean 1.63 +1.55; median 0.92) and associated with somnolence and hospitalization among children with CAP. One strain was recovered from pleural fluid. Penicillin resistance was detected in 21.0 percent(4/19) of the strains at an intermediate level, whereas 63.0 percent of the strains were resistant to trimethoprim-sulfamethoxazole. The most common serotypes were 14 and 6B, and these serotypes included the resistant strains. Eight of our 18 isolates from blood were of types included in the heptavalent conjugate pneumococcal vaccine, recently licensed in the USA.

Fatal group a streptococcal toxic shock-like syndrome in a child with varicella: report of the first well documented case with detection of the genetic sequences that code for exotoxins SPE A and B, in Sao Paulo, Brazil

Crianca de sete anos, previamente higida, foi admitida na unidade de terapia intensiva por quadro de toxemia associado a varicela. Evoluiu rapidamente para choque e insuficiencia de multiplos orgaos e sistemas e, apesar do tratamento intensivo, morreu no quarto dia apos a admissao. A cultura de secrecao colhida por puncao profunda de partes moles em regiao toracica foi positiva para Streptococcus pyogenes, proteina-M nao tipavel e carreador dos genes codificadores da producao de exotoxinas pirogenicas estreptococicas A e B, preenchendo os criterios para definicao de Sindrome do choque toxico estreptococico. Os autores discutem aspectos clinicos e fisiopatologicos desta sindrome, bem como alguns aspectos incomuns relacionados a este caso