Formación de biopelículas por Candida parapsilosis sensu stricto y su perfil de susceptibilidad en Venezuela / Biofilm-forming of Candida parapsilosis sensu stricto and its susceptibility profile in Venezuela

Una de las principales consecuencias del desarrollo de biopelículas es la resistencia a los antifúngicos. Se determinó la formación de biopelículas por Candida parapsilosis sensu stricto aisladas de sangre y su perfil de susceptibilidad. Se evaluaron 30 cepas de C. parapsilosis sensu stricto de la Red de Candidemias del Dpto. de Micología del Instituto Nacional de Higiene Rafael Rangel-Venezuela, por el método cuantitativo en microplaca con tinción de cristal violeta y el método cualitativo en agar Sabouraud dextrosa suplementado con rojo Congo. Se utilizó el método de microdilución según el documento M-27 del Clinical and Laboratory Standards Institute. La formación de biopelículas de C. parapsilosis sensu stricto por el método cuantitativo fue de 63% y por el método cualitativo de 50%. El método cualitativo presentó valores de sensibilidad, especificidad, valores predictivos positivo y negativo de 61,1%, 23%, 78,6%, 43,8% respectivamente frente al método cuantitativo. Los aislados en forma planctónica fueron 100% sensibles a anfotericina B y caspofungina, con susceptibilidad variable a los azoles. El método cuantitativo es una técnica confiable para determinar la formación de biopelículas. El método cualitativo puede usarse como método pantalla inicial. No se encontró relación entre la susceptibilidad de las formas planctónicas y la capacidad de producción de biopelículas

One of the main consequences of biofilm development is resistance to antifungals. Biofilmforming by Candida parapsilosis sensu stricto isolated from blood and its susceptibility profile was determined. Thirty strains of C. parapsilosis sensu stricto belonging to the Candidemia Network of the Mycology Department of the Instituto Nacional de Higiene Rafael Rangel-Venezuela, were evaluated by microplate quantitative method with violet crystal staining, and Sabouraud dextrose agar supplemented with Congo red qualitative method. The microdilution method was used to determine the susceptibility, according to the Clinical and Laboratory Standards Institute M-27 document. Biofilm formation of C. parapsilosis sensu stricto by both quantitative and qualitative method was 63% and 50%, respectively. Sensitivity, specificity, and positive and negative predictive values of the qualitative method were 61.1%, 23%, 78.6%, and 43.8% respectively, when compared with quantitative method. Planktonic isolates were 100% sensitive to amphotericin B and caspofungin, with variable susceptibility to azoles. Quantitative method is a reliable assay to determine biofilm formation, while qualitative method can be used as an initial screening assay. No relationship was found between susceptibility of planktonic isolates and the ability to biofilm-forming

Identificación de levaduras mediante la técnica convencional y dos técnicas automatizadas / Yeasts identification by the conventional technique and two automated techniques

El objetivo de este trabajo fue evaluar y comparar la identificación de levaduras por los métodos automatizados VitekYBC y MicroScan RYID versus la metodología de referencia (asimilación de carbohidratos). Se diseñó un estudio de corte transversal, aleatorio, a ciegas, comparativo y experimental con 193 cepas de levaduras provenientes de muestras clínicas y 5 cepas derivadas de ATCC, las cuales fueron identificadas por la metodología de referencia, acompañada de la morfología microscópica en agar harina de maíz, y por las metodologías automatizadas. Se usaron la prueba de Mc Nemar y el índice Kappa para evaluar si las variables del estudio se relacionaban entre sí y se calcularon los valores de sensibilidad, intervalos de confianza y porcentajes de concordancia. También se calcularon los errores muy mayores (VM), errores mayores (EM) y errores menores (Em) para las metodologías automatizadas. Los sistemas VitekYBC y MicroScanRYID fueron concordantes en un 88,4% (175/198) y 85,9% (170/198) respectivamente cuando se compararon con el método de referencia, por lo tanto, ambos sistemas automatizados se pueden utilizar como métodos de identificación, ya que mostraron una asociación estadísticamente significativa al compararlos con el método de referencia (p<0,05). El sistema VitekYBC presentó EM= 7,1% y Em= 4,5%, mientras que el sistema MicroScanRYID mostró EM= 11,1% y Em= 3,0%. Los métodos automatizados comparados en este estudio tienen niveles de concordancia aceptables, pero presentan EM y Em que pueden causar que el operador de estos equipos incurra en identificaciones incorrectas. Por lo tanto, es indispensable el uso de pruebas complementarias, como la visualización microscópica de la morfología en agar harina de maíz y los medios cromogénicos, cuando se realice la identificación de levaduras mediante sistemas automatizados. Estos sistemas son una herramienta valiosa para la identificación de levaduras, sin embargo, la experiencia del microbiólogo continúa siendo una fortaleza importante para asegurar la calidad de los resultados.

The objective of this work was to evaluate and to compare yeasts identification by the automated methods Vitek YBC and MicroScan RYID versus the reference methodology (carbohydrates assimilation). A comparative, blindly, random, transverse and experimental study was designed with 193 yeasts isolated from clinical samples and 5 strains derived from the ATCC, which were identified by the reference methodology, accompanied by microscopic morphology in corn meal agar, and by the automated methodologies. Kappa index and Mc Nemar test were used to evaluate the relationship among the variables and sensitivity, confidence intervals and agreement percentages were calculated for the automated methodologies. Very major (VM), major (EM), and minor errors (Em) were also calculated. Vitek® YBC and MicroScan RYID® systems were concordant in 88,4% (175/198) and 85,9% (170/198) respectively, when compared with the reference method, therefore, both automated systems can be used as identification methods since they showed an statistically significant association when were compared with the reference method (p<0,05). The Vitek YBC® system presented EM=7,1% and Em=4,5%, while the MicroScan RYID® system showed EM=11,1% and Em = 3,0%. The automated methods compared in this study have acceptable concordant agreement levels, but the presence of EM and Em can cause that the operator of these equipments incurs in incorrect identifications. Therefore, is indispensable the use of complementary tests as morphology microscopic visualization in corn meal agar and use of chromogenic agar when performing yeasts identification by automated methods. These systems are a valuable tool for the yeasts identification, however, the microbiologist experience continues to be an important strength to assure the quality of the results.