A molecular and morphological study of Ascaris suum in a human-pig contact scenario in northeastern Brazil / Estudo molecular e morfológico de Ascaris suum em um cenário de contato entre suínos e humanos no nordeste brasileiro

The aim of the present study was to assess morphologic and genetic data on ascariasis in swine (Sus scrofa domesticus) and humans in low-resource rural and periurban communities in the state of Piauí, Brazil. Our cross-sectional survey included 100 fecal samples obtained from swine and 682 samples from humans. Fifteen pigs were necropsied. Human and porcine fecal samples were examined to identify Ascaris eggs. Parasites obtained in the swine necropsies were studied using scanning electron microscopy (SEM), and the mitochondrial gene encoding the cytochrome oxidase 1 (cox1) enzyme was partially amplified and sequenced for molecular taxonomy and phylogenetic analyses. The overall prevalence of Ascaris eggs in the swine fecal samples was 16/100 (16%). No Ascaris eggs were identified in the human fecal samples. SEM of six worms recovered from pigs demonstrated morphological characteristics of A. suum. Cox1 sequences were compatible with A. suum reference sequences. Original and reference (GenBank) nucleotide sequences were organized into clusters that did not segregate the parasites by host species or and region. The largest haplogroups were dominated by haplotypes H01, H02 and H31. In the communities studied, there was no epidemiological evidence of the zoonotic transmission of ascariasis at the human-swine interface.(AU)

O presente estudo teve como objetivo acessar dados morfológicos e genéticos sobre a ascaridíase em suínos (Sus scrofa domesticus) e humanos, em comunidades rurais e periurbanas no estado do Piauí. O estudo transversal incluiu 100 amostras fecais de suínos e 682 amostras obtidas de humanos. Quinze suínos foram necropsiados. Amostras fecais suínas e humanas foram examinadas para detecção de ovos de Ascaris. Os parasitas adultos, obtidos nas necropsias, foram estudados através de microscopia eletrônica de varredura (MEV), e o gene mitocondrial codificante da enzima citocromo oxidase 1 (cox1) foi parcialmente amplificado e sequenciado para análises filogenéticas e de taxonomia molecular. A prevalência de Ascaris em amostras fecais de suínos foi 16/100 (16%), não sendo identificado nenhum caso de infecção por este parasita em humanos. A análise por MEV de parasitas recuperados de suínos demonstrou características morfológicas de Ascaris suum. As sequências nucleotídicas de cox1 foram compatíveis com A. suum. As sequências originais e de referência (obtidas no GeneBank) foram organizadas em clusters que não segregaram os parasitas por hospedeiro ou região geográfica. Os maiores haplogrupos foram dominados pelos haplótipos H01, H02 e H31. Nas comunidades estudadas, não foi evidenciada transmissão zoonótica de A. suum na interface suíno-humana.(AU)

Análise paleogenética da tuberculose e perfil paleoparasitológico de populações do período histórico do Rio de Janeiro / Paleogenetic analysis of tuberculosis and paleoparasitological profile of populations of the historical period of Rio de Janeiro

A cidade do Rio de Janeiro foi o principal centro comercial e capital do país durante o período colonial brasileiro. A chegada de centenas de milhares de colonizadores europeus e escravos africanos à cidade desencadeou um crescimento urbano e populacional desenfreado. O objetivo do trabalho é avaliar o cenário paleoepidemiológico da tuberculose na população do Rio de Janeiro entre os séculos XVII e XIX através da análise paleogenética do complexo Mycobacteriumtuberculosis (MTC), bem como da análise do perfil paleoparasitológico e da ancestralidade humana. A infecção por bactérias do MTC foi identificada na população enterrada nos sítios arqueológicos analisados. A frequência de infecção observada foi de 53 por cento e 25 por cento em cemitérios europeu e africano, respectivamente. Os parasitos Trichuris trichiura, Ascaris sp., Taenia sp. e Enterobius vermicularis foram detectados através de técnicas paleoparasitológicas e paleoparasitológicas moleculares. O nematoide T. trichiura foi o mais comumente encontrado nos sítios arqueológicos estudados, demonstrando uma frequência de infecção de até 70 por cento.Estes dois últimos representam o registro mais antigo dessas infecções no país. A ancestralidade humana revelou uma proeminente contribuição da população europeia na dispersão da tuberculose na cidade, e confirmou a presença da infecçãoem escravos africanos recém – chegados ao país. O cenário de infecção portuberculose na cidade, assim como por parasitos intestinais, é discutido...

The city of Rio de Janeiro was the main commercial center and capital of thecountry during the Brazilian colonial period. The arrival of hundreds of thousands ofEuropean settlers and African slaves to the city triggered unbridled population andurban growth. This study aims to evaluate the paleoepidemiologic scenario oftuberculosis in Rio de Janeiro population between the seventeenth and nineteenthcenturies through paleogenetic analysis of Mycobacterium tuberculosis complex(MTC), as well as examining the paleoparasitologic profile and human ancestry. TheTB infection was identified in the individuals buried in archaeological sites. Thefrequency of infection was observed in 53 percent and 25 percent in European and Africancemeteries, respectively. The parasite Trichuris trichiura, Ascaris sp., Taenia sp. andEnterobius vermicularis were detected by paleoparasitolgical and moleculartechniques. The latter two represent the earliest record of these infections in thecountry. The nematode T. trichiura was the most commonly found in archaeologicalsites studied, showing an infection rate of up to 70 percent. The human ancestry revealed aprominent contribution of the European population in the dispersion of tuberculosis inthe city, and confirmed the presence of infection in African slaves. The scenario ofTB infection in the city, as well as intestinal parasites, is discussed...

As pequenas sequências codificantes (uORFs) na região 5 não traduzida de genes de Trypanosoma cruzi: análise comparativa nos grupos TcI, TcII e Zimodema III / Small coding sequences (uORFs) in the 5 untranslated region of genes from Trypanosoma cruzi: comparative analysis in groups TCI, TCII and Zymodeme III

Trypanossoma cruzi (T. cruzi) é o agente causador da doença de Chagas, que afeta entre 8 e 9 milhões de pessoas em todo o mundo. Este protozoário é responsável por uma variedade de manifestações clínicas em humanos, possui uma ampla gama de hospedeiros e apresenta grande diversidade genética e biológica. As pequenas regiões codificantes (uOFRs) presentes na região 5 não traduzida (5 UTR) de mRNAs maduros são conhecidas por afetar a eficiência da tradução de muitos genes eucariotos. Pouco é conhecido sobre a existência e conservação de uORFs em genes de Tripanossomatídeos. Este trabalho se propôs avaliar o grau de conservação das uORFs e seu potencial como marcador molecular das populações de T. cruzi, através da análise de sete genes contendo uORFs previamente selecionados. Oligonucleotídeos iniciadores foram desenhados e fragmentos das 5 UTRs contendo uORFs foram amplificados, através do PCR, de cepas representativas de cada um dos três grupos populacionais do parasito, TcI, TcII e ZIII. Após clonagem e sequenciamento, alto grau de conservação das uORFs foi observado de um ponto de vista populacional e a ruptura de uma uORF foi observada em apenas um gene. Isto é um forte indicativo de que em T. cruzi essas uORFs são funcionalmente ativas, pois do contrário teriam sido extintas das 5 UTRs durante o processo evolutivo sofrido pelos grupos populacionais de T. cruzi. A observação de mutações grupo-específicas nas sequências nucleotídicas das 5 UTRs de alguns genes, motivou a realização de teses para a utilização desses fragmentos como possíveis marcadores moleculares para as populações do parasito. A obtenção dos fragmentos dos genes codificantes de ATPase e Ferredoxina foi realizada em mais de 15 cepas e isolados. Verificou-se a existência de mutações grupo-específicas na 5 UTR do gene ATPase, que corroboram...