Integridade na pesquisa: ética profissional dos cientistas - O papel do Comitê de Integridade na Pesquisa do Instituto Adolfo Lutz / Research integrity: professional ethics of scientists - The role of the Research Integrity Committee at the Adolfo Lutz Institute

O Comitê de Integridade na Pesquisa do Instituto Adolfo Lutz (CIPIAL), com o objetivo de promover a cultura da integridade científica como um dos valores fundamentais defendidos pela instituição nas suas atividades de pesquisa, considera relevante compartilhar com a comunidade científica a sua implantação, destacando o seu papel no gerenciamento deste tema na instituição. Após a publicação de seu regimento, de acordo com as suas competências primordiais, o CIPIAL elaborou e publicou o Código de Boas Práticas Científicas do IAL com o objetivo de definir as políticas de integridade para orientar os profissionais envolvidos com a pesquisa. (AU)

The Research Integrity Committee of the Adolfo Lutz Institute (CIPIAL), with the aim of promoting the culture of scientific integrity as one of the fundamental values defended by the institution in its research activities, considers it relevant to share its implementation with the scientific community, highlighting its role in managing this issue at the institution. Following the publication of its rules and regulations, in accordance with its core competencies, CIPIAL drew up and published the IAL Code of Good Scientific Practice with the aim of defining integrity policies to guide professionals involved in research. (AU)

Promoção da cultura de integridade científica nos institutos de pesquisa em saúde pública: proposta de um programa e de um plano de integridade na pesquisa institucional / Promotion of a culture of scientific integrity in public health research institutes: proposal for an integrity program and plan in institutional research

A maioria das instituições de pesquisa na área da Saúde Pública, ainda, não possui um sistema para promover a cultura da integridade na pesquisa em suas comunidades científicas. Não possui também uma estrutura para desenvolver ações educativas e preventivas e de aplicação, se necessário, de medidas disciplinares contra as más condutas científicas. Este trabalho teve como objetivo a realização de um estudo teórico de Programas de Integridade Pública e experiências em Integridade na Pesquisa nacionais e internacionais com adequações, para poder ser utilizado por pesquisadores de organizações nacionais como um Programa de Integridade na Pesquisa. A proposta se baseia em um Programa de Integridade na Pesquisa institucional na forma de um sistema estruturado, que tenha o comprometimento e apoio da alta direção institucional; que possua uma instância responsável pela gestão de integridade na pesquisa institucional; que realize ações educativas e preventivas na conduta responsável em pesquisa; que promova na instituição a cultura de integridade na pesquisa; que estabeleça diretrizes de integridade na pesquisa apoiando os pesquisadores nas tomadas de decisões; orientando quanto a responsabilidade nas práticas de pesquisa científica; que consiga monitorar e ter um acompanhamento em relação a integridade na pesquisa institucional por intermédio da gestão de riscos e de compliance na gestão de integridade na pesquisa; que estabeleça mecanismos e procedimentos referentes a comunicação, treinamentos e medidas de acompanhamento e se necessário, disciplinares referentes a má conduta em pesquisa; que promova, monitore e realize avaliação e aperfeiçoamento contínuo do próprio programa de integridade na pesquisa. Considera-se que esse instrumento irá colaborar com a gestão e com a governança institucional, por intermédio da utilização de metodologias sistematizadas para tratar da integridade na pesquisa e que consequentemente refletirá nas pesquisas realizadas em seu corpo científico podendo resultar em maior confiança pública e reconhecimento da sociedade, trazendo ganhos para a reputação institucional e principalmente contribuindo para o fortalecimento e para promoção da cultura de integridade na pesquisa nas instituições de pesquisa em Saúde Pública.

Avaliação do desempenho da PCR em tempo real para o diagnóstico de meningite por Enterovirus / Evaluation of a real-time PCR assay performance for the diagnosis of enteroviral meningitis

O gênero Enterovirus (EV) é o agente etiológico mais frequente e responsável pela ocorrência de meningite viral no mundo. O objetivo deste trabalho foi de avaliar resultados da implantação do ensaio de PCR em tempo real (RT-qPCR) para a detecção de EV. Foram selecionadas 616 amostras de líquido cefalorraquidiano (LCR) de pacientes com meningite, recebidas para realizar diagnóstico laboratorial no período de 1998-2013. Os RNAs foram extraídos diretamente do LCR pelo método QIAamp®, e o ensaio TaqMan® foi aplicado. A avaliação foi feita comparando-se resultados de RT-qPCR com os obtidos pelo método de isolamento em cultura de células. Das 616 amostras analisadas, 94 (15,2 %) foram positivas para EV no ensaio de RT-qPCR; e na cultura celular EV foi isolado de 58 (9,4 %) amostras. Valores de sensibilidade, especificidade, valor preditivo positivo e valor preditivo negativo foram de 89,70 %, 92,40 %, 55,30 % e 98,90 %, respectivamente. O RT-qPCR foi ligeiramente superior à cultura viral para a detecção de EV no LCR. O RT-qPCR TaqMan® é um ensaio rápido e sensível, facilmente exeqüível e com potencial para melhorar o diagnóstico da meningite viral na rotina do laboratório de saúde pública no Estado de São Paulo.

Enterovirus (EV) genus is the most frequent etiological agent causing viral meningitis worldwide. This study aimed at evaluating the performance of real-time reverse transcription-PCR (RT-qPCR) assay for detecting EV. A total of 616 cerebrospinal fluid (CSF) samples from patients with meningitis were selected, among those received at EV diagnosis laboratory from 1998 to 2013. RNAs were directly extracted from CSF by using QIAamp® Viral RNA Mini Kit, and TaqMan® RT-qPCR assay was applied. Evaluation was made by comparing the RT-qPCR results with those found in the cell culture for viral isolation method. Of 616 analyzed samples, 94 (15.20%) were positive for EV RNA on the RT-qPCR assay; and in the cell culture EV was isolated from 58 (9.40 %) samples. The assay showed sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value of 89.70 %, 92.40 %, 55.30 % and 98.90 %, respectively. In the present study, the RT-qPCR assay was slightly superior when compared to the viral culture technique for detecting EV from CSF samples. The TaqMan® RT-qPCR assay shows to be a fast and sensitive assay, easy to perform, and it shows a potential to improve the viral meningitis diagnosis in the public health laboratory in São Paulo State.

Avaliação do desempenho da PCR em tempo real para o diagnóstico de meningite por Enterovirus / Evaluation of a real-time PCR assay performance for the diagnosis of enteroviral meningitis

O gênero Enterovirus (EV) é o agente etiológico mais frequente e responsável pela ocorrência de meningite viral no mundo. O objetivo deste trabalho foi de avaliar resultados da implantação do ensaio de PCR em tempo real (RT-qPCR) para a detecção de EV. Foram selecionadas 616amostras de líquido cefalorraquidiano (LCR) de pacientes com meningite, recebidas para realizar período de 1998-2013. Os RNAs foram extraídos diretamente do LCR pelo método QIAamp®, e o ensaio TaqMan® foi aplicado. A avaliação foi feita comparando-se resultados de RT-qPCR com os obtidos pelo método de isolamento em cultura de células.Das 616 amostras analisadas, 94 (15,2 %) foram positivas para EV no ensaio de RT-qPCR; e na cultura celular EV foi isolado de 58 (9,4 %) amostras. Valores de sensibilidade, especificidade, valor preditivo positivo e valor preditivo negativo foram de 89,70 %, 92,40 %, 55,30 % e 98,90 %,respectivamente. O RT-qPCR foi ligeiramente superior à cultura viral para a detecção de EV no LCR. O RT-qPCR TaqMan® é um ensaio rápido e sensível, facilmente exeqüível e com potencial para melhorar o diagnóstico da meningite viral na rotina do laboratório de saúde pública noEstado de São Paulo.

The genus Enterovirus (EV) is the most frequent etiological agent responsible for the occurrence of viral meningitis in the world. The objective of this work was to evaluate the results of the implantation of the real-time PCR assay (RT-qPCR) for the detection of EV. We selected 616 samples of cerebrospinal fluid (CSF) from patients with meningitis, received for the period 1998-2013. The RNAs were extracted directly from the CSF by the QIAamp® method, and the TaqMan® assay was applied. The results of the RT-qPCR test were compared with those obtained by the cell culture isolation method. Of the 616 samples analyzed, 94 (15.2%) were positive for EV in the RT-qPCR assay; And cell culture EV was isolated from 58 (9.4%) samples. Sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive values ​​were 89.70%, 92.40%, 55.30% and 98.90%, respectively. The RT-qPCR was slightly superior to the viral culture for the detection of EV in the CSF. RT-qPCR TaqMan® is a rapid and sensitive, easily feasible and potential test to improve the diagnosis of viral meningitis in the routine of the public health laboratory in the State of São Paulo.

Echovírus 6 associado à doença exantemática / Echovirus 6 associated with exanthematic disease

Exantema viral é considerado problema comum em regiões tropicais, afetando principalmente crianças. Diversos exantemas cutâneos estão associados a infecções por Enterovirus. Amostras biológicas provenientes de uma criança apresentando exantema generalizado foram enviadas ao Laboratório de Vírus Entéricos do Instituto Adolfo Lutz para a realização do diagnóstico laboratorial. Amostra viral isolada em RD (human rhabdomyosarcoma cells) foi submetida à reação em cadeia pela polimerase apresentando um produto de 437 pares de base, característico de gênero Enterovirus. O sorotipo echovirus 6 (E-6) foi identificado por ensaio de imunofluorescência indireta. Em adição, as amostras pareadas de soro apresentaram soroconversão para E-6. Até o momento, não há relatos do envolvimento de E-6 associado a doenças exantemáticas no Brasil, enfatizando a importância da vigilância epidemiológica para essas doenças e suas complicações.

Viral exanthems are a common problem in tropical regions, particularly affecting children. Various skin rashes have been reported in acute infections caused by Enterovirus. Biological samples from a child who presented generalized rashes were sent to the Enteric Virus Laboratory of the Adolfo Lutz Institute for laboratory diagnosis to be performed. A viral sample isolated from RD (human rhabdomyosarcoma cells) was subjected to the polymerase chain reaction and showed a 437-base pair product that was characteristic of the Enterovirus genus. Echovirus 6 (E-6) serotype was identified using the indirect immunofluorescence test. In addition, paired serum samples presented seroconversion to E-6. So far, there have not been any reports of E-6 involvement in exanthematic diseases in Brazil. Thus, the importance of epidemiological surveillance for these diseases and their complications is emphasized.

Echovirus 6 associated to aseptic meningitis outbreak, in São Joaquim da Barra, São Paulo, Brazil

An aseptic meningitis outbreak occurred during a period from February to May 2004 in São Joaquim da Barra, a town in the northern region of São Paulo State. A total of 40 cases were reported to the Epidemiological Surveillance Center of São Paulo State. Cerebrospinal fluid samples obtained from 23 patients were sent to the Adolfo Lutz Institute for isolation of the virus. These samples were inoculated into RD, HEp2 and Vero cell lineages and those presenting a cytopathogenic effect were selected for analysis by indirect immunofluorescence assay (IFA), neutralization testing (Nt) and reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR). Cytopathogenic effects were observed in 52.2 percent (12/23) of these samples. All isolated viruses were identified as human enterovirus by IFA and RT-PCR and echovirus 6 was typed by IFA and Nt. Our results confirmed the participation and importance of echovirus as the etiological agent responsible for this outbreak and the serotype diversity of human enteroviruses circulating in São Paulo State.

Entre fevereiro e maio de 2004, em São Joaquim da Barra, Estado de São Paulo, foi notificado ao Centro de Vigilância Epidemiológica (CVE) um surto de meningite asséptica (MA) envolvendo 40 indivíduos. Foram enviadas ao Instituto Adolfo Lutz amostras de líquido cefalorraquidiano (LCR) de 23 pacientes com MA para tentativa de isolamento viral. Estas amostras foram inoculadas em 3 linhagens celulares: RD, HEp2 e Vero. Culturas celulares que apresentaram efeito citopático (ECP) foram submetidas a ensaio de Imunofluorescência Indireta (IFI), reação de Neutralização (Nt) e RT-PCR (Transcrição Reversa Reação em Cadeia da Polimerase). Em 52,2 por cento (12/23) das amostras foi observado ECP. Todos os vírus isolados foram identificados como gênero HEV por IFI e RT-PCR e o sorotipo echovirus 6 (E-6) por IFI e Nt. Nossos resultados confirmam a participação e importância dos echovirus como agente etiológico responsável pelo surto ocorrido e a diversidade de sorotipos circulantes no Estado de São Paulo.

Aseptic meningitis by echovirus 30 in São Paulo state, Brazil

The objective of this study was to identify and characterize the immunological and molecular aspects of Human Enterovirus (HEV) associated with aseptic meningitis cases in São Paulo State, Brazil. Clinical samples (cerebrospinal fluid CSF, stool and sera) were analyzed from 21 viral meningitis suspected cases collected in the period from 1998 to 1999. The isolated virus were identified as belonging to Enterovirus genus and specifically to echovirus serotype 30 (EV-30), using immunological techniques as Indirect Immunofluorescense Assay (IFA) and Neutralization (Nt) and by molecular technique of Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) directed to the 5' NTR and VP1 regions of viral genome. The results obtained contributed with to the surveillance system of São Paulo State and they are important due to a shortage of epidemiological data about the circulation of EV-30 associated to aseptic meningitis in this region of the world.

O objetivo deste estudo foi identificar e caracterizar quanto aos aspectos imunológicos e moleculares os Enterovirus humanos associados a casos de meningite asséptica. Amostras clínicas (líquido cefaloraquidiano, fezes e soro) originárias de 21 casos suspeitos de meningite viral, provenientes do estado de São Paulo no período de 1998 a 1999 foram analisadas. Os vírus isolados foram identificados como pertencentes ao gênero Enterovirus e mais especificamente ao sorotipo echovírus 30 (EV-30), utilizando-se técnicas imunológicas como Imunofluorescência Indireta e Neutralização e técnica molecular da transcrição reversa - reação em cadeia da polimerase (RT-PCR) direcionada para as regiões 5' não traduzida (5'NTR) e Proteína Viral 1(VP1) do genoma viral. Os resultados obtidos contribuíram com o sistema de vigilância epidemiológica do estado de São Paulo na geração de informações sobre a circulação de EV-30 associado à meningite asséptica nessa região do mundo.

Echovirus 4 associated to hand, foot and mouth disease / Echovirus 4 associado à doença de mão, pé e boca

Hand, foot and mouth disease (HFMD) is a contagious enteroviral infection occurring primarily in children and characterized by vesicular palmoplantar eruptions and erosive stomatitis. Echovirus 4 (EV-4) has been commonly associated with aseptic meningitis. The association of HFMD with EV-4 has not been reported previously. Two samples of a 14-month child who presented mild fever, sores in the mouth, rash with blisters on the palm of hands and soles of feet were sent to Enteric Viruses Laboratory of Adolfo Lutz Institute. Clinical samples were inoculated in three different cell lines, and those which presented cytopathic effect (CPE), were submitted to Indirect Immunofluorescence Assay (IFA) and "one step" RT-PCR. Agarose gel electrophoresis from RT-PCR product, showed a product with 437 bp, which is characteristic of Enterovirus group. Echovirus 4 was identified by IFA. Although HFMD is a viral infection associated mainly with Enterovirus 71 (HEV-71) and Coxsackievirus A16 (CV-A16), our results demonstrate a diversity of serotype related to HFMD and stress the importance of epidemiological surveillance to this disease and its complications.

A Doença de Mão, Pé e Boca (DMPB) é uma infecção enteroviral contagiosa que ocorre principalmente em crianças sendo caracterizada por erupções palmoplantares vesiculares e estomatite. Echovirus 4 (EV-4) é comumente associado a meningite asséptica. A associação de DMPB por EV-4 não foi descrita anteriormente. Duas amostras provenientes de uma criança de 14 meses apresentando febre, secreções na garganta e exantemas nas palmas das mãos e dos pés, foram enviadas para o Laboratório de Vírus Entéricos do Instituto Adolfo Lutz. As amostras foram inoculadas em três diferentes linhagens celulares; aquelas que apresentaram efeito citopático (ECP), foram submetidas a ensaio de imunofluorescência indireta (IFI) e "one step" RT-PCR. A eletroforese em gel de agarose realizada com o produto de PCR apresentou um produto de 437pb, característico de grupo Enterovirus. O sorotipo EV-4 foi identificado por IFI. Apesar da DMPB ser uma infecção viral associada principalmente com Enterovirus 71 (HEV-71) e Coxsackievirus A16 (CV-A16), nossos resultados enfatizam a necessidade de estudos epidemiológicos e laboratoriais direcionados ao EV-4 como agente causador de DMPB.