Características clínicas y epidemiológicas de las muertes por dengue durante un brote en el norte del Perú / Clinical-epidemiological characteristics of dengue deaths during an outbreak in northern Peru

Con el objetivo de describir las características clínicas y epidemiológicas de los pacientes fallecidos por dengue durante el 2017 en Piura, se realizó un estudio retrospectivo de revisión de 24 historias clínicas. El 67% de los casos fueron mujeres y tres (12,5%) estaban embarazadas. La diabetes (12,5%) y la hipertensión (16,7%) fueron las comorbilidades más frecuentes. Sólo en el 12,5% se reportó dengue previo. El tiempo transcurrido desde asistencia sanitaria hasta la muerte fue de 4,10 (DE: 5,34) días. Se hicieron transfusiones de glóbulos rojos en el 45,8% de los casos, plasma en el 25%, plaquetas en el 16,8% y crioprecipitado en el 16,8%. También fueron frecuentes la terapia con cristaloides (91,7%) y el tratamiento con fármacos vasoactivos (70,8%). En conclusión, la mortalidad del dengue grave fue mayoritaria en las mujeres adultas y el tiempo de atención desde el primer establecimiento de salud hasta una unidad especializada fue prolongada.

Objective: To describe the clinical-epidemiological characteristics of patients who died from dengue during 2017. Methods: We conducted a retrospective study of the information related to cases of dengue deaths in the department of Piura. Results: We reviewed 24 medical records. Sixty-seven percent were women and 3 (12.5%) were pregnant. Diabetes (12.5%) and hypertension (16.7%) were the most frequent comorbidities. Previous dengue fever was reported in only 12.5%. The time from health care and death was 4.10 ± 5.34 days. Red blood cell transfusions were performed in 45.8%, plasma in 25%, platelets in 16.8% and cryoprecipitate in 16.8% of cases. Crystalloid therapy (91.7%) and treatment with vasoactive drugs (70.8%) were also frequent. In conclusion, mortality from severe dengue fever was predominantly in adult women, and the time of care from the first health facility to a specialized unit was prolonged.

Descripción de una cepa de Klebsiella pneumoniae con gen blaOXA-48 en Lima-Perú / Description of a Klebsiella pneumoniae strain with blaOXA-48 gene in Lima-Peru

Señor editor: La propagación de enterobacterales productoras de carbapenemasas se ha convertido en una importante amenaza para la salud mundial. El gen blaOXA-48 produce una carbapenemasa de clase "D" (según la clasificación de Ambler) que expresa un fenotipo resistente a penicilinas, penicilinas con inhibidores de beta-lactamasas, cefalosporinas de primera generación y sensibilidad reducida a los carbapenemes, sensibilidad reducida o casi nula a las cefalosporinas de amplio espectro.

Dear Editor: The spread of carbapenemase-producing Enterobacteriaceae has become a major threat to global health. The blaOXA- gene blaOXA-48 produces a class "D" carbapenemase (according to Ambler's classification) that expresses a phenotype resistant to penicillins, penicillins with beta-lactamase inhibitors, first-generation cephalosporins and reduced sensitivity to carbapenems, reduced or near-zero sensitivity to broad-spectrum cephalosporins.48 produces a class "D" carbapenemase (according to Ambler's classification) that expresses a phenotype resistant to penicillins, penicillins with beta-lactamase inhibitors, first-generation cephalosporins and reduced sensitivity to carbapenems, reduced or near-zero sensitivity to broad-spectrum cephalosporins.

Evolution of the prevalence and antimicrobial resistance among Escherichia coli isolated as a cause of infection in patients admitted to a iv-level hospital in Lima, Peru

The levels and evolution of antimicrobial resistance of Escherichia coli during 01/2009-06/2010 (Period 1), 01/2012-06-2013 (Period 2) and 07/2013-12/2014 (Period 3) were analyzed. Identification, susceptibility levels to 13 antibiotics and the presence of extendedspectrum ß-lactamases (ESBLs) were determined. Overall, 9,918 microorganisms were isolated as a cause of infection. Of these 3,016 (30.4%) were E. coli, with 1,770 (59%), 992 (33%) and 254 (8%), from the Medicine and the Surgery Departments and the Intensive Care Unit (ICU), respectively. There was a significant increase (p=0.0002) of E. coli throughout considered periods. The isolates presented high levels of resistance (>60%) to cephalosporins, ciprofloxacin and cotrimoxazole, being only susceptible to imipenem (0.3% of resistance) and tigecycline. Overall the analysis of evolution of antimicrobial resistance showed that resistance to cephalosporins and amikacin significantly increased, while, the ones of piperacillintazobactam, cotrimoxazole and gentamicin had significantly decreased. Nevertheless, the ICU isolates showed an inverse scenario for cephalosporins. These findings agree with an increase of ESBLs on the Medicine (56% to 66%; p<0.0001) and on the Surgery (54% to 62%; p=0.0197) departments, with a parallel decrease in the ICU (76% to 68%). In summary, high levels of antimicrobial resistance have been reported among E. coli, with worrisome levels of ESBL. A continuous surveillance of antimicrobial resistance levels in the area is needed.

Caracterización de Escherichia coli D7111 productora de ß-LACTAMASA TEM-176 / Characterization of Escherichia coli D7111 producing the ß-LACTAMASA TEM-176

RESUMEN El presente reporte es la descripción original de bla TEM-176. Se caracterizaron los mecanismos de resistencia a antimicrobianos de un aislamiento de Escherichia coli enterotoxigénica, determinándose la resistencia a 22 antimicrobianos categorizados en 15 grupos diferentes mediante difusión en agar, estableciéndose grupo filogenético, mecanismos de resistencia y presencia de integrones de Clase 1 y 2 mediante PCR. Integrones y genes de resistencia a β-lactámicos fueron secuenciados. El aislamiento del grupo filogenético A, mostró resistencia o sensibilidad disminuida a ampicilina, amoxicilina más ácido clavulánico, ácido nalidíxico, ciprofloxacino, estreptomicina, kanamicina, tetraciclina, trimetoprim, sulfisoxazol, cotrimoxazol, azitromicina y nitrofurantoina, detectándose la presencia de bla TEM, aadA1/2, aphA1, sul3, tet(A) y un integron de Clase 2 conteniendo un gen dfrA1. La resistencia a quinolonas se relacionó con la substitución Ser83Ala. La secuencia de TEM mostró la substitución Ala222Val, la cual a la fecha no había sido descrita, reportándose como una nueva β-lactamasa, con el nombre de bla TEM-176.

ABSTRACT The present report is the original description of bla TEM-176. The mechanisms of resistance to antimicrobial agents were determined in an enterotoxigenic Escherichia coli, determining the susceptibility to 22 antimicrobials classified in 15 different groups by agar diffusion and establishing the phylogenetic group, mechanisms of resistance and presence of Class 1 and 2 integrons. Integrons and β-lactam resistance genes were sequenced. The isolate, belonging to phylogenetic group A, showed the presence of resistance or diminished susceptibility to a ampicillin, amoxicillin plus clavulanic acid, nalidíxic acid, ciprofloxacin, streptomycin, kanamycin, tetracycline, trimethoprim, sulfisoxazole, cotrimoxazole, azithromycin and nitrofurantoin, carrying bla TEM, aadA1/2, aphA1, sul3, tet(A) and a Class 2 integron containing a dfrA1 gene. Quinolone resistance was related to the substitution Ser83Ala. The TEM sequencing showed the presence of the new substitution Ala222Val, which led to the description of the new β-lactamase bla TEM-176.

Caracterización de Escherichia coli D7111 productora de ß-LACTAMASA TEM-176 / Characterization of Escherichia coli D7111 producing the ß-LACTAMASE TEM-176

RESUMEN El presente reporte es la descripción original de bla TEM-176. Se caracterizaron los mecanismos de resistencia a antimicrobianos de un aislamiento de Escherichia coli enterotoxigénica, determinándose la resistencia a 22 antimicrobianos categorizados en 15 grupos diferentes mediante difusión en agar, estableciéndose grupo filogenético, mecanismos de resistencia y presencia de integrones de Clase 1 y 2 mediante PCR. Integrones y genes de resistencia a β-lactámicos fueron secuenciados. El aislamiento del grupo filogenético A, mostró resistencia o sensibilidad disminuida a ampicilina, amoxicilina más ácido clavulánico, ácido nalidíxico, ciprofloxacino, estreptomicina, kanamicina, tetraciclina, trimetoprim, sulfisoxazol, cotrimoxazol, azitromicina y nitrofurantoina, detectándose la presencia de bla TEM, aadA1/2, aphA1, sul3, tet(A) y un integron de Clase 2 conteniendo un gen dfrA1. La resistencia a quinolonas se relacionó con la substitución Ser83Ala. La secuencia de TEM mostró la substitución Ala222Val, la cual a la fecha no había sido descrita, reportándose como una nueva β-lactamasa, con el nombre de bla TEM-176.

ABSTRACT The present report is the original description of bla TEM-176. The mechanisms of resistance to antimicrobial agents were determined in an enterotoxigenic Escherichia coli, determining the susceptibility to 22 antimicrobials classified in 15 different groups by agar diffusion and establishing the phylogenetic group, mechanisms of resistance and presence of Class 1 and 2 integrons. Integrons and β-lactam resistance genes were sequenced. The isolate, belonging to phylogenetic group A, showed the presence of resistance or diminished susceptibility to a ampicillin, amoxicillin plus clavulanic acid, nalidíxic acid, ciprofloxacin, streptomycin, kanamycin, tetracycline, trimethoprim, sulfisoxazole, cotrimoxazole, azithromycin and nitrofurantoin, carrying bla TEM, aadA1/2, aphA1, sul3, tet(A) and a Class 2 integron containing a dfrA1 gene. Quinolone resistance was related to the substitution Ser83Ala. The TEM sequencing showed the presence of the new substitution Ala222Val, which led to the description of the new β-lactamase bla TEM-176.

Resistencia a la colistina en cepas de Klebsiella pneumoniae multidrogorresistente del período 2015-2018 en un instituto materno perinatal de Lima, Perú / Colistin resistance in multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae strains at a perinatal maternal institute in Lima, Peru, 2015-2018

RESUMEN El objetivo del estudio fue evaluar los niveles y mecanismos de resistencia a la colistina y a los carbapenémicos en cepas de Klebsiella pneumoniae multidrogorresistente aisladas durante el periodo 2015-2018 en el Instituto Materno Perinatal de Lima. Se analizó la sensibilidad mediante difusión en disco y microdilución. La presencia de genes de resistencia a los carbapenémicos y a la colistina se determinó por reacción en cadena de la polimerasa (PCR, por sus siglas en inglés) y se la relacionó con la clonalidad. Se analizaron 36 cepas de K. pneumoniae, cinco (13,8%) fueron resistentes a la colistina, pertenecían a diferentes grupos clonales. Se encontraron dos cepas con carbapenemasas (bla KPC y bla NDM) y no se detectaron genes plasmídicos para la colistina. Los niveles de resistencia al resto de antimicrobianos testados fueron elevados, a excepción de amikacina (13,9%). Los resultados destacan la presencia de cepas resistentes a la colistina (33,3% en 2018), situación preocupante por ser esta parte de las últimas alternativas de tratamiento para las infecciones causadas por patógenos multirresistentes.

ABSTRACT The objective of this study was to evaluate the presence of colistin- and carbapenemic-resistant genes in multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae strains isolated at the Instituto Materno Perinatal de Lima (2015-2018). Susceptibility levels were analyzed by disk diffusion and microdilution. The presence of colistin- and carbapenemic-resistant genes was determined by polymerase chain reaction (PCR) and was related to clonality. A total of 36 K. pneumoniae strains were analyzed, 5 (13.8%) were resistant to colistin and belonged to different clonal groups. Only 2 strains were found with carbapenemases (bla KPC and bla NDM), and no colistin plasmid genes were detected. High resistance levels to the other tested antimicrobials were observed, except for amikacin (13.9%). The results highlight the presence of colistin-resistant strains (33.3% in 2018), a worrying situation as they are part of the latest treatment alternatives for infections caused by multiresistant pathogens.

Resistencia a nitrofuranos en Salmonella enterica aisladas de carne para consumo humano / Nitrofuran resistance in Salmonella enterica isolated from meat for human consumption

RESUMEN En el presente estudio, se analizaron los mecanismos de resistencia a nitrofuranos en 18 muestras cár nicas con Salmonella enterica (15 de pollo, 2 de ternera y 1 de cerdo) de mercados de Lima (Perú). Determinaron los serotipos de los aislamientos y la sensibilidad a furazolidona y nitrofurantoina (con y sin el inhibidor de bombas de expulsión Phenyl-Arginine-β-Naphthylamide [PAβN]), las mutaciones en los genes snrA y cnr por PCR y la transferabilidad de la resistencia por conjugación. Se identificaron 15 muestras con S. infantis (13 muestras de pollo), 2 con S. enteritidis y 1 con S. anatum. Todos los aisla mientos, excepto S. anatum, fueron resistentes a ambos nitrofuranos (concentración mínima inhibidora [CMI] a furazolidona: 32-64 µg/mL, CMI a nitrofurantoina: 128-256 µg/mL), sin diferencias al adicio narse PAβN. Todos los aislamientos resistentes a nitrofuranos presentaron sustituciones en snrA y cnr (S. infantis: snrA STOP-151; cnr STOP-137; S. enteritidis: snrA STOP-180; cnr STOP-179). No se detectaron mecanismos transferibles de resistencia a nitrofuranos.

ABSTRACT The mechanisms of resistance to nitrofurans from 18 meat samples with Salmonella enterica (chicken: 15; beef: 2; pork: 1) collected in Lima (Peru) were analyzed. The isolates were serotyped and the susceptibility levels to furazolidone and nitrofurantoin [with and without the efflux pump inhibitor Phenyl-Arginine- β-naphthylamide (PAβN)], the presence of mutations in the snrA and cnr genes and the transferability of resistance by conjugation were established. Fifteen samples with S. infantis (13 from chicken samples), 2 with S. enteritidis and 1 with S. anatum were identified. All isolates except the S. anatum were resistant to both nitrofurans showing MICs (minimum inhibitory concentration) of furazolidone and nitrofurantoin of 32-64 μg/mL and 128-256 μg/mL, respectively. The addition of PAßN had no effect on the MIC levels. All nitrofuran-resistant isolates showed amino acid codon alterations at both snrA and cnr (S. infantis: snrA STOP-151; cnr STOP-137; S. enteritidis: snrA STOP-180; cnr STOP-179). No transferable mecha nisms of nitrofuran resistance were detected.

Presencia de Enterobacteriaceae y Escherichia coli multirresistente a antimicrobianos en carne adquirida en mercados tradicionales en Lima / Presence of multidrug resistant Enterobacteriaceae and Escherichia coli in meat purchased in traditional markets of Lima

RESUMEN Objetivos. El objetivo del presente estudio fue describir la presencia de Enterobacteriaceae en muestras de carne recolectadas en mercados tradicionales de Lima y establecer los niveles de resistencia a antimicrobianos y la presencia de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) y AmpC en Escherichia coli. Materiales y métodos. Se recolectaron un total de 138 muestras de carne, 64 (46,4 %) de pollo, 44 (31,9 %) de carne de res y 30 (21,7%) de carne de cerdo. Las bacterias aisladas pertenecieron a 17 géneros diferentes, y específicamente 14 fueron clasificados como Enterobacteriaceae. Se analizó la sensibilidad frente a diez agentes antimicrobianos mediante el método de difusión de disco Kirby-Bauer, se determinó la presencia de BLEE y AmpC mediante las pruebas de doble disco y de inducción de imipenem-ceftazidima, respectivamente. Resultados. Los niveles de resistencia a los antimicrobianos fueron altos frente a trimetoprima-sulfametoxazol, ampicilina, tetraciclina, ácido nalidíxico, ciprofloxacino y cloranfenicol. Existen diferencias significativas en los niveles de resistencia a los antibióticos según el tipo de carne (pollo, carne de res y cerdo) (p <0,05). Los niveles de resistencia a múltiples antimicrobianos (MDR) fueron particularmente altos en pollo y cerdo (98,2 % y 86,4 %, respectivamente). Además, la presencia de BLEE en Escherichia coli aisladas de carne de pollo fue del 59,4 %. Conclusiones. Los niveles de resistencia a los antimicrobianos fueron altos frente a los antibióticos usados frecuentemente en humanos, se destaca el pollo y la res como potenciales reservorios de Escherichia coli productoras de BLEE y pAmpC, respectivamente.

ABSTRACT Objective. The objective of this study was to describe the presence of Enterobacteriaceae in meat samples collected in traditional markets of Lima and to establish the levels of antimicrobial resistance and the presence of extended spectrum beta-lactamases (BLEE) and AmpC in Escherichia coli. Materials and Methods. A total of 138 meat samples, 64 (46.4%) chicken, 44 (31.9%) beef and 30 (21.7%) pork were collected. The isolated bacteria belonged to 17 different genera and, specifically, 14 were classified as Enterobacteriaceae. Sensitivity to ten antimicrobial agents was analyzed using the Kirby-Bauer disc diffusion method, BLEE and AmpC were determined by double disc and imipenem-ceftazidime induction tests, respectively. Results. Antimicrobial resistance levels were high against trimethoprim-sulfamethoxazole, ampicillin, tetracycline, nalidixic acid, ciprofloxacin and chloramphenicol. There are significant differences in antibiotic resistance levels depending on the type of meat (chicken, beef and pork) (p <0.05). Multiple drug resistance (MDR) levels were particularly high in chicken and pork (98.2% and 86.4%, respectively). In addition, the presence of BLEE in Escherichia coli isolated from chicken meat was 59.4%. Conclusions. Multiple drug resistance levels were high compared to antibiotics frequently used in humans; chicken and beef are highlighted as potential reservoirs of BLEE and pAmpC-producing Escherichia coli, respectively.

Niveles de resistencia a quinolonas y otros antimicrobianos en cepas de Escherichia coli comensales en niños de la zona periurbana de Lima, Perú / Levels of quinolones resistance and other antimicrobial in non-pathogenic Escherichia coli strains in children from the periurban area of Lima, Peru

El objetivo principal del estudio fue establecer el nivel de resistencia a antimicrobianos en un total de 222 cepas comensales de E. coli de origen fecal, en Perú. Las frecuencias de resistencia encontrados, frente los antimicrobianos evaluados, fueron: ampicilina (62,6 por ciento), cotrimoxazol (48,6 por ciento), tetraciclina (43,0 por ciento) y cloranfenicol (15,8 por ciento). Destacan los elevados niveles de resistencia a quinolonas: 32 por ciento al ácido nalidíxico (NAL) y 12 por ciento a ciprofloxacino (CIP). Estos elevados niveles hacia las quinolonas en cepas comensales aisladas en niños de esta franja de edad, realzan el uso extendido y el impacto de consumo de este tipo de antimicrobianos en la comunidad, mostrando el riesgo potencial de su pérdidade utilidad en el área