Genetic variability in G2 and F2 region between biological clones of human respiratory syncytial virus with or without host immune selection pressure

Human respiratory syncytial virus (HRSV) is an important respiratory pathogens among children between zero-five years old. Host immunity and viral genetic variability are important factors that can make vaccine production difficult. In this work, differences between biological clones of HRSV were detected in clinical samples in the absence and presence of serum collected from children in the convalescent phase of the illness and from their biological mothers. Viral clones were selected by plaque assay in the absence and presence of serum and nucleotide sequences of the G2 and F2 genes of HRSV biological clones were compared. One non-synonymous mutation was found in the F gene (Ile5Asn) in one clone of an HRSV-B sample and one non-synonymous mutation was found in the G gene (Ser291Pro) in four clones of the same HRSV-B sample. Only one of these clones was obtained after treatment with the child's serum. In addition, some synonymous mutations were determined in two clones of the HRSV-A samples. In conclusion, it is possible that minor sequences could be selected by host antibodies contributing to the HRSV evolutionary process, hampering the development of an effective vaccine, since we verify the same codon alteration in absence and presence of human sera in individual clones of BR-85 sample.

Comparison between ectodomain and G2 region of G glycoprotein for genotyping of HRSV

The Human Respiratory Syncytial Virus (HRSV), isolated in 1955, is the main cause of hospitalization of babies and infants with respiratory illness. Several studies have been conducted worldwide aiming the development of a safe and effective vaccine against HRSV. The G2 region of glycoprotein G is used as genotyping default. In the present study, we performed a phylogenetic analysis of G protein and a comparative study between G2 region and ectodomain of attachment glycoprotein. Fifty-three nasal swab samples from children less than 5 years old and presenting symptoms of acute respiratory illness, assisted at the University Hospital (UH) of University of Sao Paulo (USP) in 2004, were submitted to sequencing by PCR and compared with GenBank sequences. We concluded that the G2 region is adequate for HRSV genotyping.

O vírus respiratório sincicial humano (HRSV), isolado em 1955, é a principal causa da hospitalização de bebês e crianças pequenas com sintomas de doença respiratória. No mundo inteiro, vários estudos para o desenvolvimento de uma vacina segura e eficiente contra o HRSV têm tido alta prioridade. A região G2 da glicoproteína G é usada como padrão para genotipagem do HRSV. Neste estudo, foi realizada a análise filogenética da glicoproteína G e o estudo comparativo entre a região G2 e o ectodomínio dessa glicoproteína. Cinquenta e três amostras de swab nasal de crianças com menos de cinco anos de idade, apresentando doença respiratória aguda, atendidas no Hospital Universitário (HU) da Universidade de São Paulo durante o ano de 2004, foram submetidas a sequenciamento por PCR e comparadas com seqüências do GenBank. A região G2 mostrou ser adequada para a genotipagem do HRSV.

Clinical and laboratory evaluation of measleslike rash in children and young adults

A clinical and laboratory evaluation of 11 childrens and young adults with measleslike rash was done during the measles outbreak in the Greater São Paulo Metropolitan area at the end of 1996 and spread over the country during 1997. Measles was laboratory confirmed in 07 patients by specific IgM detection in acute serum specimens using an IgM-capture EIA, by specific IgG seroconversion in serum pairs, and by reverse transcription PCR and virus isolation in peripheral blood lymphocytes. Clinical presentations were not always classic; one of the 07 cases had received measles vaccine and corresponded to modified clinical case of measles. The 4 remaining cases were negative for measles and were diagnosed as exanthem subitum (2 cases), scarlet fever and Kawasaki disease. The present study reinforces the view that clinical features alone are not sufficient for establishing an accurate diagnosis in the post-vaccine era, and a surveillance system based on sensitive laboratory results is needed so that it can confirm IgM-negative measles cases.

Rotavirus associated diarrhoea during infancy in the city of S. Luis (MA), Brazil: a two-year longitudinal study

Um total de 479 casos de diarreia aguda e de 337 criancas sem diarreia (controles) foi investigado em um estudo longitudinal de 2 anos na cidade de Sao Luis (MA) em criancas menores de 5 anos de idade, a fim de estabelecer a incidencia e a distribuicao etaria e sazonal de rotavirus, bem como determinar a severidade da doenca nesta regiao do Brasil. A incidencia de Rotavirus apresentou os maiores indices durante o primeiro ano de vida das criancas, com media anual de 25 por cento entre os pacientes atendidos nos principais hospitais pediatricos da cidade e em Unidades de Saude da periferia. O estudo mostrou que a relevancia dos rotavirus como agentes etiologicos da diarreia aguda na infancia ja acaba aos 18 meses de idade das criancas desta regiao, quando os valores de positividade caem a apenas 4 por cento, como no grupo controle. A distribuicao bimensal de rotavirus nao apresentou perfil tipicamente sazonal, ocorrendo 1 pico de incidencia no ano de 1986, durante a estacao chuvosa, e 2 picos no ano de 1987, dos quais um na estacao chuvosa e outro, durante a epoca seca do ano. O estudo tambem mostrou que a doenca diarreica e mais severa entre os casos positivos para o rotavirus do que entre negativos, apresentando maior frequencia de evacuacoes dearias, de vomitos e febre, levando ao indice acima de 2 vezes maior de casos de desidratacao moderada ou severa...

Ocorrência de astrovirus humanos na cidade de Säo Paulo, Brasil / Occurrence of human astrovirus in Säo Paulo City, Brazil

Foram detectados astrovírus humanos durante estudo longitudinal de 13 meses sobre a incidência de vírus diarréicos em 146 crianças menores de 2 anos de idade, hospitalizadas em clínica pediátrica de um hospital universitário, na cidade de Säo Paulo, SP, Brasil. Das 67 crianças internadas com diarrréia aguda, 3 por cento foram positivas para astrovírus, por ocasiäo de sua admissäo, pelo Ensaio Imunoenzimático Monoclonal Amplificado (ASTROVIRUS BIOTIN-AVIDIN ELISA, CDC, USA). As 79 crianças sem diarréia, admitidas durante o mesmo período por outra causa (controles), foram negativas para astrovírus, por ocasiäo de seu internamento. Entretanto, 4,8 por cento do total de crianças hospitalizadas sofreram infecçöes por astrovírus durante sua permanência no hospital. Este é o primeiro estudo sobre a ocorrência de astrovírus humanos no Brasil, que assim participam significativamente na etiologia da gastroenterite infantil em nosso meio