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1.
Biomédica (Bogotá) ; 34(supl.1): 124-136, abr. 2014. ilus, tab
Artículo en Español | LILACS | ID: lil-712429

RESUMEN

Introducción. USA300 es un linaje genético que se encuentra en aislamientos de Staphylococcus aureus sensibles (SASM) y resistentes a meticilina (SARM). Actualmente, en Colombia las infecciones por SARM en hospitales y en la comunidad son causadas principalmente por un clon con genotipo comunitario (SARM-GC) relacionado genéticamente con el clon USA300. El origen de esta variante es aún desconocido. Objetivo. Identificar y caracterizar aislamientos de S. aureus resistentes y sensibles a meticilina con el fin de aportar información para establecer un posible origen de los aislamientos SARM-GC en Colombia. Materiales y métodos. Se realizó una caracterización de aislamientos SASM relacionados con el clon USA300 detectados a partir de un análisis de 184 aislamientos de S. aureus (90 SARM y 94 SASM) causantes de infecciones. La relación genética de los aislamientos se determinó por electroforesis en gel de campo pulsado (PFGE), tipificación de secuencias multilocus (MLST) y tipificación del gen de la proteína A ( spa ). Resultados. De los 184 aislamientos, 27 (14,7 %) presentaron características moleculares y relación genética con el clon USA300, y de ellos, 18 fueron SARM y nueve fueron SASM. Todos los aislamientos SARM relacionados con este clon albergaban un casete estafilocócico cromosómico mec (SCC mec ) IVc (3.1.2). En ningún aislamiento SASM se detectaron secuencias remanentes de SCC mec o una duplicación del sitio att B que evidenciaran la pérdida del casete. Conclusión. El origen de los aislamientos SARM-GC en Colombia probablemente se encuentre en la diseminación de clones SASM relacionados con el clon USA300 que adquirieron el SCC mec IVc posteriormente.


Introduction: USA300 is a genetic lineage found both in methicillin-resistant (MRSA) and methicillin-sensitive Staphylococcus aureus (MSSA) isolates. In Colombia, hospital and community MRSA infections are caused by a USA300-related community genotype MRSA (CG-MRSA) clone. The genetic origin of this clone is unknown yet. Objective: To identify and characterize methicillin-resistant (MRSA) and methicillin-sensitive S. aureus (MSSA) isolates in order to improve the information about the origin of the CG-MRSA isolates in Colombia. Materials and methods: USA300-related MSSA isolates were detected and characterized from a study of 184 S. aureus isolates (90 MRSA and 94 MSSA) recovered from infections. The genetic relatedness of the isolates was established by means of pulsed field gel electrophoresis (PFGE), multilocus sequence typing (MLST) and protein A gene typification ( spa typing). Results: Among 184 isolates, 27 (14.7%) showed molecular characteristics and genetic relationship with the USA300 clone, of which 18 were MRSA and nine were MSSA. All USA300-related MRSA harbored Staphylococcal cassette chromosome mec (SCC mec ) IVc (3.1.2). In the MSSA isolates, SCC mec remnants or att B duplicate sites were not detected. Conclusions: In Colombia, the CG-MRSA isolates probably originated in the dissemination of an USA300-related MSSA clone which later acquired SCC mec IVc.


Asunto(s)
Adolescente , Adulto , Anciano , Humanos , Persona de Mediana Edad , Adulto Joven , Infecciones Comunitarias Adquiridas/microbiología , Resistencia a la Meticilina/genética , Staphylococcus aureus Resistente a Meticilina/genética , Infecciones Estafilocócicas/microbiología , Técnicas de Tipificación Bacteriana , Proteínas Bacterianas/genética , Chile , Células Clonales , Colombia/epidemiología , Infecciones Comunitarias Adquiridas/epidemiología , Infecciones Comunitarias Adquiridas/transmisión , Farmacorresistencia Bacteriana Múltiple/genética , Electroforesis en Gel de Campo Pulsado , Genes Bacterianos , Genotipo , Staphylococcus aureus Resistente a Meticilina/clasificación , Staphylococcus aureus Resistente a Meticilina/aislamiento & purificación , Staphylococcus aureus Resistente a Meticilina/patogenicidad , Filogenia , Estudios Prospectivos , Infecciones Estafilocócicas/epidemiología , Infecciones Estafilocócicas/transmisión , Estados Unidos , Virulencia/genética
2.
Biomédica (Bogotá) ; 32(2): 214-223, abr.-jun. 2012. ilus, tab
Artículo en Inglés | LILACS | ID: lil-656830

RESUMEN

Introduction. Community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus (CA-MRSA) infections are found with increasing the frequency, both in healthy individuals in the community and in hospitalized patients. In Colombia and the Andean region, CA-MRSA isolates have a genetic background that is related to the pandemic USA300 clone. Objective. Two molecular methods are designed and standardized for the rapid differentiation of Colombian community-acquired and hospital-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus (HA-MRSA) isolates. Materials and methods. Two molecular methods were standardized for the identification of CA-MRSA isolates. The first method was based on the differential digestion of the carbamate kinase (arcC)and guanylate kinase (gmk) genes in the sequences type 5 (ST5) in the HA-MRSA isolates and 8 (ST8) in the CA-MRSA isolates. The second method was based on the PCR amplification of 5 specific virulence factors found in CA-MRSA and HA-MRSA isolates. The specificity and precision of each method were evaluated using 237 clinical MRSA isolates. Results. The first method identified 100% and 93.2% of the CA-MRSA and HA-MRSA isolates, respectively. The second method also correctly identified the two isolates types (CA-MRSA and HA-MRSA). Conclusions. These two methods are a convenient alternative for the rapid identification of the CA-MRSA isolates, compared with other techniques such as pulsed field gel electrophoresis and multilocus sequence typing, which are time-consuming and more expensive.


Introducción. Los aislamientos de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina asociado a la comunidad (SARM-AC), están aumentando la frecuencia de infecciones en personas sanas de la comunidad y en pacientes hospitalizados. En Colombia y en la región andina estos aislamientos tienen un componente genético relacionado con el clon pandémico USA300. Objetivo. Diseñar y estandarizar dos metodologías para la diferenciación rápida de aislamientos colombianos de S. aureus resistente a la meticilina asociado a la comunidad de los asociados al hospital (SARM-AH). Materiales y métodos. Se estandarizaron dos metodologías moleculares para la identificación de aislamientos de S. aureus resistente a la meticilina asociado a la comunidad. La primera se basa en la digestión diferencial con tres enzimas de restricción de los genes cinasa de carbamato (arcC)y cinasa de guanilato (gmk)para los tipos de secuencia 5 (ST5) y 8 (ST8), correspondientes a aislamientos de S. aureus resistente a la meticilina asociado al hospital y asociado a la comunidad, respectivamente. La segunda se basa en la amplificación por reacción en cadena de la polimerasa de cinco factores de virulencia que se encuentran de manera diferencial en estos aislamientos. Las dos metodologías fueron validadas en 237 aislamientos clínicos de S. aureus resistente a la meticilina. Resultados. Con la primera metodología se identificaron el 100 % y 93,2 % de los aislamientos de S. aureus resistente a la meticilina asociado a la comunidad y asociado al hospital, respectivamente. Con la segunda metodología se identificaron correctamente los dos tipos de aislamientos. Conclusiones. Estas dos metodologías son una buena alternativa en términos de ahorro en tiempo y dinero comparadas con otras técnicas, como la electroforesis en campo pulsado y la tipificación de secuencias multilocus para la rápida identificación de aislamientos de S. aureus resistente a la meticilina asociado a la comunidad en Colombia.


Asunto(s)
Humanos , Técnicas de Tipificación Bacteriana/métodos , Staphylococcus aureus Resistente a Meticilina/aislamiento & purificación , Polimorfismo de Longitud del Fragmento de Restricción , Reacción en Cadena de la Polimerasa/métodos , Infecciones Estafilocócicas/microbiología , Alelos , Proteínas Bacterianas/genética , Técnicas de Tipificación Bacteriana/normas , Colombia , Infecciones Comunitarias Adquiridas/epidemiología , Infecciones Comunitarias Adquiridas/microbiología , Infección Hospitalaria/epidemiología , Infección Hospitalaria/microbiología , Electroforesis en Gel de Campo Pulsado , Genes Bacterianos , Guanilato-Quinasas/genética , Staphylococcus aureus Resistente a Meticilina/clasificación , Staphylococcus aureus Resistente a Meticilina/genética , Fosfotransferasas (aceptor de Grupo Carboxilo)/genética , Reproducibilidad de los Resultados , Alineación de Secuencia , Análisis de Secuencia de ADN , Infecciones Estafilocócicas/epidemiología , Factores de Tiempo , Virulencia/genética
3.
Rev. colomb. ortop. traumatol ; 26(1)mar. 2012. ilus, tab, graf
Artículo en Español | LILACS | ID: lil-639114

RESUMEN

Introducción: el polimetilmetacrilato (PMMA) es el único sistema de entrega local de antibióticos aprobado por la FDA. Actualmente, este tipo de sistemas ha mejorado los resultados en el tratamiento de las infecciones asociadas con implantes ortopédicos con una seguridad biológica amplia, dada la disminución de toxicidad antibiótica sistémica. Se plantea la búsqueda de un sistema alternativo de entrega local de antibióticos debido a que en algunos casos el PMMA actúa como un cuerpo extraño, y en otros libera el antibiótico en rangos subterapéuticos actuando incluso como una superficie amigable para la formación de un biofilm por parte de las bacterias. Materiales y métodos: se diseñó un estudio in vitro, estandarizado, controlado, con el método de difusión agar, según los parámetros establecidos por el Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) en el 2007 para determinar si el gel rico en plaquetas (PRP) suplementado con antibiótico sirve como sistema de transporte y liberación local de antibiótico inhibiendo el crecimiento de una cepa conocida de S. aureus. Resultados: los antibióticos evaluados fueron transportados y liberados por el gel rico en plaquetas. Se produjo inhibición del crecimiento bacteriano a mayores concentraciones de antibióticos. La oxacilina en la dilución 32 µg/ml tuvo un halo de inhibición mayor al sensidisco; la vancomicina generó los halos de inhibición de menor diámetro, y la ciprofloxacina presentó la menor capacidad de inhibición con respecto al control. Discusión: se demostró in vitro la capacidad que tiene el PRP como transportador y liberador de antibiótico. Dado el comportamiento heterogéneo recogido en los diferentes ensayos, se supone que cada antibiótico tiene una capacidad de difusión propia, la cual debe ser tenida en cuenta si se quiere emplear el gel de PRP como sistema de entrega local de antibióticos.


Asunto(s)
Antibacterianos , Plasma Rico en Plaquetas
4.
Biomédica (Bogotá) ; 30(3): 353-361, sept. 2010. ilus
Artículo en Español | LILACS | ID: lil-616871

RESUMEN

Introducción. Staphylococcus aureus resistente a la meticilina (SARM) causa infecciones adquiridas en la comunidad y en el ámbito hospitalario. El ser portador de SARM se ha descrito como factor de riesgo para desarrollar infección clínica. Objetivo. Caracterizar la colonización por SARM en pacientes adultos de una unidad de cuidados intensivos colombiana, utilizando herramientas de biología molecular.Materiales y métodos. Entre febrero de 2007 y febrero de 2008 se tamizaron mediante hisopado nasofaríngeo, 705 pacientes al ingresar a la unidad de cuidados intensivos, de los cuales, 683 (96,9%) fueron seguidos semanalmente y al egreso de la unidad. Se determinó el perfil de sensibilidad de los aislamientos a 11 antibióticos por el método de dilución en agar; el 62,0% de los aislamientos de SARM fueron caracterizados genética y molecularmente. Resultados. Se tamizaron 705 pacientes al ingreso; 182 (25,8%) estaban colonizados por S. aureus, de los cuales, 51 (7,2%) eran resistentes a la meticilina. Se hizo el seguimiento durante la estancia en la unidad de cuidados intensivos a 683 pacientes, de los cuales, 62 (9,1%) fueron colonizados por SARM en dicha unidad. La prevalencia del clon chileno fue de 76,5% al ingreso y de 88,9% durante la estancia. El 16,0% de los pacientes colonizados desarrollaron algún tipo de infección por SARM. Se encontraron tres pacientes colonizados con SARM adquirido en la comunidad, los cuales fueron positivos para la leucocidina Panton-Valentine (Panton-Valentine leukocidin, PVL). Conclusiones. El 7,2% de los pacientes que ingresaron a la unidad de cuidados intensivos estaban colonizados con SARM. Éste es el primer reporte de colonización por aislamientos de SARM-ST8-SCCmec IVc adquirido en la comunidad y relacionado genéticamente con el clon pandémico USA300-0114 en Colombia.


Introduction. Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) cause nosocomial and community infections. MRSA colonization in hospitals has been described as an important risk factor during hospitalization. Objective. The colonization characteristics of MRSA was described using the tools of molecular biology. Materials and methods. Between February 2007 and February 2008, 705 patients entering a Colombian intensive care unit (ICU) were screened for MRSA by taking nasopharyngeal samples. For 683 of these patients, a weekly follow-up was provided after they left the ICU. The susceptibility of each S. aureus isolate was tested against 11 antibiotics using agar dilution methods. Sixty two percent (62.0%) of the MRSA isolates were characterized at genetic and molecular level with the detection of resistant genes, SCCmec typing using PCR and the genetic profile with pulsed field gel electrophoresis (PFGE). Results. Of the 705 patients screened at entry to the ICU, 182 (25.8%) were colonized by S. aureus, and of these, 51 (7.2%) were MRSA. Of the 683 patients with follow-up, 62 (9.1%) were infected by MRSA contracted in the hospital ICU. The prevalence of the Chilean clone was 76.5% at entry and 88.9% for follow-up patients. Of the 113 patients colonized with MRSA, nosocomial infection was present in 18 patients (16.0%). Three community-acquired MRSA isolates related to the USA300-0114 pandemic clone were identified. These were also positive for Panton-Valentine leucidin cytotoxin genes of S.aureus. Conclusions. This is the first report in Colombia of patients colonized with CA-MRSA-ST8-SCCmec IVc isolates, and it is a probable source of dissemination of this bacteria in Colombian hospitals.


Asunto(s)
Humanos , Cuidados Críticos , Staphylococcus aureus , Portador Sano
5.
Biomédica (Bogotá) ; 29(4): 523-530, dic. 2009. ilus
Artículo en Español | LILACS | ID: lil-544557

RESUMEN

En los últimos años se ha informado la aparición de Staphylococcus aureus resistente a la meticilina como causa de infecciones extrahospitalarias graves. En Colombia, en el 2006, se publicó el primer reporte de S. aureus como causa de infección de piel y tejidos blandos; en esta ocasión, presentamos el primer reporte de neumonía necrosante con etiología por S. aureus, en dos pacientes adultos que se caracterizaron por presentar progresión clínica rápida, estancia prolongada en cuidados intensivos y complicación de la neumonía con aparición de empiema. Ambos desarrollaron falla renal aguda, por lo que fueron manejados con linezolide, con adecuada respuesta clínica. Con la caracterización molecular de los aislamientos se confirmó la presencia del gen mecA que porta el casete SCCmec tipo IV y la producción de la toxina leucocidina Panton-Valentine.


The emergence of community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus (CA-MRSA) as a cause of severe infections has been described in the recent years. In 2006, the first report of skin and soft tissue infection by CA-MRSA was published in Colombia. Herein, two additional cases of CA-MRSA are reported with a clinical course characterized by rapid progression, prolonged stay in the intensive care unit and complication of pneumonia with the onset of empyema. Both adult patients developed acute renal failure, and were treated with linezolide; the subsequent clinical response showed adequate treatment response. Molecular characterization of the isolates indicated the presence of the mecA gene carrying the cassette SCCmec type IV and the production of the toxin panton-valentine leukocidin.


Asunto(s)
Lesión Renal Aguda , Infecciones Comunitarias Adquiridas , Farmacorresistencia Bacteriana , Resistencia a la Meticilina , Neumonía Estafilocócica , Staphylococcus aureus , Colombia , Leucocidinas
6.
Biomédica (Bogotá) ; 28(2): 284-294, jun. 2008. tab
Artículo en Español | LILACS | ID: lil-503161

RESUMEN

Introducción. Las fluoroquinolonas son antibióticos de amplio espectro comúnmente utilizados en el manejo de infecciones. Objetivo. Determinar los patrones de resistencia a fluoroquinolonas en aislamientos colombianos de Streptococcus pneumoniae, Staphylococcus aureus, estafilococos coagulasa negativa y enterococos de centros hospitalarios colombianos, recolectados entre 1994 y 2004. Materiales y métodos. Se realizó la determinación de concentraciones inhibitorias mínimas frente a ciprofloxacino, moxifloxacino y gatifloxacino a 270 aislamientos clínicos de S. pneumoniae, 348 de S. aureus, 176 de estafilococos coagulasa negativa y 123 de enterococos. Para los aislamientos de S. aureus resistentes a la meticilina se determinó la concentración inhibitoria mínima frente a levofloxacino y para aislamientos de S. pneumoniae se realizó la prueba de difusión en agar con discos de ofloxacino y levofloxacino. Resultados. Doscientos sesenta y nueve (99,6 por ciento) aislamientos de S. pneumoniae fueron susceptibles a gatifloxacino y moxifloxacino; para levofloxacino y ofloxacino la resistencia fue del 1,5 por ciento y 8,9 por ciento, respectivamente. El 15,9 por ciento de S. pneumoniae tuvo una concentración inhibitoria mínima ³ ³³ ³³4 µg/ml frente a ciprofloxacino. Las prevalencias de resistencia para ciprofloxacino, gatifloxacino y moxifloxacino en los 348 aislamientos de S. aureus fueron 55,4 por ciento, 54,9 por ciento y 52,6 por ciento, y en S. aureus resistentes a meticilina, fueron 92,3 por ciento, 91,3 por ciento y 87,5 por ciento y 91,8 por ciento para levofloxacino. En estafilococos coagulasa negativa y enterococos susceptibles a vancomicina se observaron tasas de resistencia entre 25,6 por ciento y 31,8 por ciento. Todos los aislamientos de enterococos resistente a vancomicina fueron resistentes a los compuestos evaluados. Conclusión. Los aislamientos colombianos de S. pneumoniae mantienen susceptibilidad a las fluoroquinolonas de última generación. La...


Asunto(s)
Enterococcus , Fluoroquinolonas , Cocos Grampositivos , Staphylococcus aureus , Streptococcus pneumoniae , Farmacorresistencia Microbiana
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