Diagnosis of blackleg from cattle tissue impregnated in common filter paper / Diagnóstico de carbúnculo sintomático a partir de papel filtro comum impregnado com tecido bovino

ABSTRACT: Blackleg, an acute myonecrosis caused by Clostridium chauvoei, is usually underdiagnosed since the rapid transport of adequate samples for laboratory testing is difficult. This study tested a direct polymerase chain reaction (PCR) technique using common filter paper impregnated with cattle tissue samples obtained from animals suspected with blackleg. Twenty-five samples, belonging to eleven animals from Rio Grande do Sul State, Brazil, were analyzed. The direct PCR technique identified eight positive animals corroborating with results from microbiological culture. Skeletal muscle was the most common tissue type used in this study and when the animal was positive the pathogen was always detected in this tissue. Storage time of the impregnated filter paper at room temperature did not prove to be a limiting factor for the quality of the results indicating that this procedure can be carried out in the field and samples be sent in regular mail. Our results suggested that direct PCR of common filter paper impregnated with cattle tissue is a practical and economical alternative for the diagnosis of blackleg.

RESUMO: Carbúnculo sintomático, uma mionecrose aguda causada por Clostridium chauvoei, costuma ser subdiagnosticada, pois o transporte rápido de amostras adequadas para exames laboratoriais é complicado. O objetivo deste estudo foi testar a técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR) direta, utilizando papel filtro comum impregnado com amostras de tecido bovino obtidas de animais suspeitos de carbúnculo sintomático. Foram analisadas 25 amostras, pertencentes a onze animais do estado do Rio Grande do Sul, Brasil. A técnica de PCR direta identificou oito animais positivos, corroborando com os resultados da cultura microbiológica. O músculo esquelético foi o tecido mais utilizado neste estudo e quando o animal foi positivo, o patógeno sempre foi detectado neste tecido. O tempo de armazenamento do papel filtro impregnado, à temperatura ambiente, não se mostrou um fator limitante para a qualidade dos resultados, indicando que esse procedimento pode ser realizado no local e as amostras enviadas por correio normal. Nossos resultados sugerem que a PCR direta usando papel filtro comum impregnado com tecido bovino é uma alternativa prática e econômica para o diagnóstico de carbúnculo sintomático.

Bovine genital campylobacteriosis: main features and perspectives for diagnosis and control / Campilobacteriose genital bovina: principais características e perspectivas para o diagnóstico e controle

ABSTRACT: Bovine genital campylobacteriosis (BGC) is a venereal disease caused by Campylobacter fetus subsp. venerealis. In countries with large cattle herds, such as Brazil, where the use of natural breeding as a reproductive strategy is a common practice, BGC is considered an important cause of reproductive failure and economic losses. In these cases, the bull is the asymptomatic carrier of the bacterium and the infected females can have infertility and even abortions. The techniques for the diagnosis of C. fetus are isolation in culture medium and identification by biochemical tests, immunofluorescence, immunoenzymatic assays and molecular techniques. Disease control is based on vaccination with bacterins. This review described the epidemiology, etiology, pathogenesis, and advances in the diagnosis and control of BGC.

RESUMO: A campilobacteriose genital bovina (CGB) é uma importante enfermidade de caráter venéreo causada por Campylobacter fetus subsp. venerealis. Em países com grandes rebanhos bovinos, como o Brasil, onde o uso da monta natural como estratégia reprodutiva é uma prática corrente, a CGB é considerada uma importante causa de falhas reprodutivas e perdas econômicas. Nestes casos, o touro é o portador assintomático da bactéria e as fêmeas infectadas podem apresentar infertilidade e até mesmo abortos. As técnicas para o diagnóstico de C. fetus são o isolamento em meio de cultura e identificação por testes bioquímicos; imunofluorescência; ensaios imunoenzimáticos e técnicas moleculares. O controle da doença é baseado em vacinação. Neste sentido, esta revisão consiste em uma abordagem sobre a epidemiologia, a etiologia, a patogenia, os avanços no diagnóstico e controle da CGB.

Plant essential oils against bacteria isolated from fish: an in vitro screening and in vivo efficacy of Lippia origanoides / Óleos essenciais de plantas contra bactérias isoladas de peixes: uma triagem in vitro e eficácia in vivo de Lippia origanoides

ABSTRACT: The use of natural products, such as essential oils (EOs), is a potential novel approach to treat fish bacterial infections with a lower risk of developing resistance. There has been a number of studies reporting the activity of EOs as those obtained from the species Achyrocline satureioides, Aniba parviflora, Aniba rosaeodora, Anthemis nobilis, Conobea scoparioides, Cupressus sempervirens, Illicium verum, Lippia origanoides, and Melaleuca alternifolia against bacteria. However, there are few studies investigating the effect of these EOs against fish bacteria. Therefore, the aim of this study was to evaluate the in vitro antibacterial activity of EOs against the following fish bacteria, Aeromonas hydrophila, Citrobacter freundii, and Raoultella ornithinolytica. Additionally, the in vivo antibacterial activity of the EO L. origanoides was evaluated against experimentally induced A. hydrophila infection of silver catfish (Rhamdia quelen). The EO of L. origanoides was chosen as it showed the highest in vitro antibacterial activity, with minimum inhibitory concentrations ranging from 0.2 to 0.8 mg mL-1. This EO also presented a therapeutic success of 58.33%, on a 30 day A. hydrophila infection. Therefore, we suggested that the EO of L. origanoides may be a viable alternative as a treatment for A. hydrophila infection.

RESUMO: O uso de produtos naturais, como óleos essenciais (OEs), é uma nova abordagem potencial para o tratamento de infecções bacterianas em peixes com um baixo risco de desenvolvimento de resistência. Existem estudos reportando a atividade de OEs como aqueles obtidos das espécies Achyrocline satureioides, Aniba parviflora, Aniba rosaeodora, Anthemis nobilis, Conobea scoparioides, Cupressus sempervirens, Illicium verum, Lippia origanoides e Melaleuca alternifolia contra bactérias. Porém, existem poucos estudos investigando o efeito desses OEs supracitados contra bactérias isoladas de peixes. Portanto, o objetivo desse estudo foi avaliar a atividade antibacteriana in vitro desses OEs contra bactérias isoladas de peixes (Aeromonas hydrophila, Citrobacter freundii e Raoultella ornithinolytica). Assim como avaliar a atividade antibacteriana in vivo do OE de L. origanoides contra uma infecção por A. hydrophila experimentalmente induzida em jundiá (Rhamdia quelen). O OE de L. origanoides foi escolhido porque apresentou a melhor atividade antibacteriana in vitro, com concentrações inibitórias mínimas variando de 0,2 a 0,8 mg mL-1. Esse OE apresentou sucesso terapêutico de 58,33% no dia 30 pós-infecção. Portanto, sugerimos que o OE de L. origanoides possa ser uma alternativa viável no tratamento da infecção por A. hydrophila em peixes.

Genome sequencing of two Bacillus anthracis strains: a virulent strain and a vaccinal strain

ABSTRACT Bacillus anthracis strain SPV842_15 was isolated from bovine fetus, while B. anthracis strain Brazilian vaccinal was recovered from a commercial vaccine. We report here the genome sequences of both strains. The SPV842_15 genome is composed of a single circular chromosome with a length of 5,228,664 base pairs, and comprises 5911 coding sequences. In turn, the Brazilian vaccinal genome remains in 201 contigs with 5733 coding sequences. Both genomes have an overall C + G content of 35.4%, and 11 genes encoding the ribosomal RNAs (rRNAs) 5S, 16S and 23S. Only the plasmid pX01 sequence, which carries genes for toxins synthesis, was detected and completely assembled for both strains. These plasmids have a length of 181,684 base pairs and a C + G content of 32.5%. These genomic data generate insights about vaccinal B. anthracis virulence.

Nocardia nova causing empyema necessitatis afterlung re-transplantation: a case report

Abstract: We report herein a case of thoracic infection due to Nocardia nova following lung re-transplantation performed for emphysema related to alpha-1-antitrypsin deficiency. The infection extended from the lung into the pleural space, thoracic wall, and mediastinum, presenting as pericarditis and empyema necessitatis. Nocardia nova was identified by 16S ribosomal deoxyribonucleic acid (rDNA) sequencing and phylogenetic analysis. According to a literature search of PubMed, LILACS and MEDLINE databases, we describe herein the first case of empyema necessitatis caused by N. nova species in a transplanted patient.

Pyogranulomatous dermatitis and panniculitis due to Nocardia nova in a cat / Dermatite e paniculite piogranulomatosas causadas por Nocardia nova em um gato

This report describes the clinical, pathological and microbiological findings of an uncommon infection in a cat by Nocardia nova. A 3-year-old male domestic short hair cat with an ulcerated and exudative cutaneous wound was presented for clinical examination. Samples were collected for histopathology and bacteriology diagnosis. Microscopically, the lesion was diagnosed as pyogranulomatous dermatitis and panniculitis with large and irregular colonies of branching filamentous bacterium. Skin bacteriological culture showed gram-positive rods and partially acid-fast branching filaments by gram and kinyoun staining, respectively. The identity of Nocardia novawas confirmed by 16S rDNA sequencing and phylogenetic analysis. This is the first case of pyogranulomatous dermatitis and panniculitis in a cat caused byNocardia novareported in Brazil.

Este relato descreve os achados clínicos, patológicos e microbiológicos de uma infecção incomum por Nocardia novaem um gato. Um gato macho, sem raça definida, de 3 anos de idade, apresentou ferida cutânea exsudativa e ulcerada. Amostras da lesão foram coletadas para histopatologia e bacteriologia. Histologicamente, a lesão consistiu de dermatite e paniculite piogranulomatosas associadas a colônias grandes e irregulares de bactérias filamentosas e ramificadas. O cultivo bacteriológico revelou bacilos filamentosos, gram-positivos, parcialmente ácido resistentes, visualizados pelas colorações de Gram e Kinyoun, respectivamente. A identificação da Nocardia novafoi confirmada pelo sequenciamento 16S rDNA e análise filogenética. Este é o primeiro caso de paniculite e dermatite piogranulomatosas em um gato causado por Nocardia novaregistrado no Brasil.

MOLECULAR IDENTIFICATION AND ANTIMICROBIAL RESISTANCE PATTERN OF SEVEN CLINICAL ISOLATES OF Nocardia spp. IN BRAZIL / Identificação molecular e perfil de sensibilidade a antimicrobianos de sete isolados clínicos de Nocardia spp. no Brasil

Nocardia is a ubiquitous microorganism related to pyogranulomatous infection, which is difficult to treat in humans and animals. The occurrence of the disease is on the rise in many countries due to an increase in immunosuppressive diseases and treatments. This report of cases from Brazil presents the genotypic characterization and the antimicrobial susceptibility pattern using the disk-diffusion method and inhibitory minimal concentration with E-test® strips. In summary, this report focuses on infections in young adult men, of which three cases were cutaneous, two pulmonary, one neurological and one systemic. The pulmonary, neurological and systemic cases were attributed to immunosuppressive diseases or treatments. Sequencing analysis of the 16S rRNA segments (1491 bp) identified four isolates of Nocardia farcinica, two isolates of Nocardia nova and one isolate of Nocardia asiatica. N. farcinica was involved in two cutaneous, one systemic and other pulmonary cases; N. nova was involved in one neurological and one pulmonary case; and Nocardia asiatica in one cutaneous case. The disk-diffusion antimicrobial susceptibility test showed that the most effective antimicrobials were amikacin (100%), amoxicillin/clavulanate (100%), cephalexin (100%) and ceftiofur (100%), while isolates had presented most resistance to gentamicin (43%), sulfamethoxazole/trimethoprim (43%) and ampicillin (29%). However, on the inhibitory minimal concentration test (MIC test), only one of the four isolates of Nocardia farcinica was resistant to sulfamethoxazole/trimethoprim.

Nocardia é um microorganismo ubiquitário relacionado a infecções piogranulomatosas, com difícil resolução tecidual em humanos e animais. A doença é mundialmente emergente devido ao aumento de doenças e tratamentos imunossupressores. Este relato de casos ocorridos no Brasil visa apresentar a identificação molecular dos isolados e o padrão de sensibilidade a antimicrobianos por disco-difusão e concentração inibitória mínima (CIM) através de fitas E-test®. Os casos ocorreram em homens, em idade adulta. Três quadros foram cutâneos, dois pulmonares, um neurológico e um sistêmico. O quadro respiratório, o neurológico e um sistêmico estavam associados à doença ou terapia imunossupressoras. O sequenciamento do gene 16S rRNA (1491pb) possibilitou a identificação de quatro isolados de Nocardia farcinica, dois de Nocardia nova e um de Nocardia asiatica. N. farcinica foi observada em dois casos dermatológicos, um pulmonar e um quadro sistêmico, N. nova foi isolada de um caso neurológico e outro pulmonar; e N. asiatica em um caso dermatológico. O teste de disco-difusão mostrou que amicacina (100%), amoxicilina/clavulanato (100%), cefalexina (100%) e ceftiofur (100%) foram mais efetivos; enquanto gentamicina (43%), sulfametoxazol/trimetoprim (43%) e ampicilina (29%) foram menos efetivos. No entanto, no teste de concentração inibitória mínima (CIM), apenas um dos quatro isolados da espécie Nocardia farcinica mostrou-se resistente a sulfametoxazole-trimetropina.

Adenite equina: sua etiologia, diagnóstico e controle / Strangles: etiology, diagnosis and control

A adenite equina, também conhecida como garrotilho, é uma enfermidade bacteriana contagiosa, causada por Streptococcus equi, subsp. equi, bactéria β hemolítica do grupo C de Lancefield, que afeta o trato respiratório anterior de equinos de todas as idades, com maior prevalência entre um e cinco anos de idade. Caracteriza-se por produzir secreção mucopurulenta das vias aéreas anteriores e linfadenite dos gânglios retrofaríngeos e submandibulares com formação de abscessos. Fatores de virulência de S. equi, subsp. equi, incluem cápsula de ácido hialurônico, hialuronidase, estreptolisina O, estreptoquinase, receptores para Fc de IgG, peptidoglicano e proteína M. Dentre esses fatores, a proteína M tem especial importância por ser de membrana com propriedades antifagocitárias e de aderência. A doença tem baixa letalidade e alta morbidade e seus prejuízos econômicos devem-se à perda de performance e custo do tratamento. O diagnóstico clínico e o tratamento não apresentam dificuldades, mas a profilaxia é prejudicada pela baixa eficiência das vacinas disponíveis, com índices de proteção de 50 por cento. O garrotilho pode ocorrer em todas as épocas do ano, mas o frio e a umidade facilitam a sobrevivência do agente e sua disseminação, portanto animais que vivem nos estados mais frios e úmidos do país são mais vulneráveis à infecção. Novas vacinas utilizando antígenos purificados ou de subunidades estão sendo desenvolvidas com a finalidade de incrementar sua potência e evitar efeitos indesejáveis. A comprovação de diferenças de antigenicidade, entre estirpes, alerta sobre a importância da seleção apropriada das cepas vacinais.

Strangles is a contagious disease of the respiratory tract of horses produced by Streptococcus equi subsp. equi, a Lancefield's group C β haemolytic bacterium. It produces a mucopurulent secretion of the anterior airways, as well as lymphadenitis and abscesses. The bacteria synthesizes several pathogenicity factors such a hyaluronic acid capsule, hyaluronidase, streptolisin O, streptokinase, IgG Fc receptors, peptidoglican and protein M. Among these factors, protein M deserves special importance due to its antifagocitic and adherence properties. The disease has high morbidity and low lethality, and produces economic losses due to low performance and treatment. Clinical diagnosis and treatment are done easily, but prophylaxis is hampered by the low potency of vaccines, that protect around 50 percent of vaccinated animals. Strangles may occur during all the year, but cold and humid weather favors the survival of streptococci, making animals that live in regions with those characteristics more prone to infection. New vaccines using purified or subunit antigens have been developed aiming to increase their potency and to avoid undesirable side effects. The demonstration that bacteria strains show differences in their antigenicity, called attention on the selection of appropriate strains to use as antigens.

Immunogenicity and cross reactivity indices of Streptococcus equi subsp. equi strains isolated from cases of Strangles and commercial vaccines / Imunogenicidade e índices de reatividade cruzada de cepas de Streptococcus equi subsp. equi isoladas de casos de Adenite Eqüina e vacinas comerciais

Horse Strangles appears frequently in animals vaccinated with commercial bacterins in Rio Grande do Sul, Brazil. Aiming to know the antigenic relationships of strains recovered from sick animals among them and with two vaccines profusely used in the state, bilateral cross reactivity indices (CRI) were estimated. In addition, the immunogenicity of vaccines prepared with field isolates and commercial vaccines was tested in mice. Antibody titers were measured by ELISA and expressed as seroconversions. Thirteen strains of Streptococcus equi subsp. equi, nine classified biochemically as typical and other four as atypical strains, were recovered from 35 sick horses belonging to 10 herds of Rio Grande do Sul, Brazil. The strains recovered from sick horses showed very close CRI, suggesting antigenic homogeneity among them, but not with the vaccinal strains. A vaccine produced with an atypical strain induced the highest seroconversion, 9.4, while two produced with typical strains were poorly-immunogenic. The commercial vaccines were less immunogenic than five and four vaccines produced with field strains, inducing seroconversions of 2.6 and 3.8, respectively.

A Adenite Eqüina é freqüente em animais vacinados com bacterinas comerciais no Rio Grande do Sul. Com o objetivo de determinar as relações antigênicas entre cepas isoladas de casos clínicos e duas vacinas amplamente utilizadas no Estado, foram determinados os índices de reatividade cruzada bilateral (IRC) entre elas. Também foi determinada a imunogenicidade em camundongos de vacinas preparadas com cepas de campo e de vacinas comerciais. Os títulos de anticorpos foram determinados por ELISA e expressos como soroconversão. Foram isoladas 13 cepas de Streptococcus equi subsp. equi de 35 casos clínicos de Adenite Eqüina em 10 diferentes rebanhos do Rio Grande do Sul, Brasil, das quais nove foram classificadas bioquimicamente como típicas e outras quatro como atípicas. As cepas de campo apresentaram elevada reatividade cruzada, sugerindo homogeneidade antigênica entre elas, mas não com as cepas vacinais. Uma vacina produzida com cepa atípica induziu soroconversão de 9.4, enquanto duas vacinas produzidas com cepas típicas foram pouco imunogênicas. As vacinas comerciais induziram soroconversões de 2.6 e 3.8, menores que quatro e cinco vacinas produzidas com cepas de campo, respectivamente.

Caracterização epidemiológica, molecular e perfil de resistência aos antimicrobianos de Escherichia coli isoladas de criatórios suínos do sul do Brasil / Epidemiology, molecular characterization and resistance to antimicrobials of Escherichia coli isolated from South-Brazilian pig herds

A colibacilose é a enfermidade entérica de maior impacto na suinocultura, sendo ocasionada por cepas enterotoxigênicas de Escherichia coli. Quarenta isolados clínicos de suínos com diarréia e 13 isolados ambientais foram analisados quanto ao perfil genotípico, relação genética e resistência antimicrobiana. O gene que codifica para a toxina Stb foi identificado em 50 por cento dos isolados clínicos, seguido por Sta e Lt, com 35 por cento. Dentre os fatores de adesinas pesquisados, a F18 foi encontrada em 27,5 por cento das amostras. A técnica de ERIC-PCR utilizada para caracterização epidemiológica dos isolados, não demonstrou poder discriminatório esperado, e apesar de permitir a separação dos isolados em grupos, estes não evidenciaram grupos relacionados aos fatores de virulência. No teste de susceptibilidade antimicrobiana a maior resistência foi observada à tetraciclina, em 88,6 por cento. O índice de resistência múltipla aos antimicrobianos (IRMA), variou entre 0 a 0,69.