RESUMEN
Abstract: Soil microorganisms present a great diversity, involving taxonomically distinct groups that play a role in the decomposition of organic matter, nutrient cycling, soil aggregation, among others. In this diversity, the fungi of the genus Trichoderma have been successful plant pathogen biocontrol agents, as plant growth promoters and as inducers of plant resistance to diseases. In addition, they are important in the sustainability of natural ecosystems. Aiming to verify the population density of Trichoderma fungi in natural environments and agroecosystems, in Cerrado area, samples of soils and roots from native vegetation and agroecological production system were collected in the Federal District, Brazil. The collection points were randomly selected, and each soil or root sample was individually wrapped. The soil adhered to the roots was removed for evaluations. Serial sample dilutions and number of Colony Forming Units (CFUs) of Trichoderma isolates were performed. The results showed that the number of CFU varied depending on the plant and location evaluated. The replacement of native vegetation by organic farming systems did not result in a significant reduction in this number.
Resumo: Os microrganismos de solo apresentam uma grande diversidade, envolvendo grupos taxonomicamente distintos que desempenham papel na decomposição da matéria orgânica, ciclagem de nutrientes, agregação dos solos, dentre outros. Nesta diversidade, os fungos do gênero Trichoderma tem apresentado sucesso como agentes de biocontrole de fitopatógenos, como promotores de crescimento de plantas e, ainda, como indutores de resistência de plantas a doenças. Além disso, são importantes na sustentabilidade dos ecossistemas naturais. Com o objetivo de verificar a densidade populacional de fungos do gênero Trichoderma em ambientes naturais e agroecossistemas, em área de Cerrado, amostras de solos e raízes oriundas de vegetação nativa e de sistema de produção agroecológica foram coletadas na região do Distrito Federal, Brasil. Os pontos de coleta foram selecionados aleatoriamente, e cada amostra de solo ou raiz foi acondicionada individualmente. O solo aderido às raízes foi removido para as avaliações. Foram realizadas diluições seriadas das amostras e contagem do número de Unidades Formadoras de Colônias (UFCs) de isolados de Trichoderma. Os resultados mostraram que o número de UFC variou dependendo da planta e da localidade avaliada. A substituição da vegetação nativa por sistemas de cultivo orgânicos não resultou em importante redução neste número.
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ABSTRACT: The study was performed to examine the potential presence of biological control agents against Pythium damping-off disease of cucumber.Examining eleven bacterial strains isolated from acid lime roots and rhizosphere soil showed that the bacterial strain RB1 was the most efficient in suppressing mycelial growth of P. aphanidermatum, producing an inhibition zone of 5mm. Scanning electron microscopy study of the mycelia at the interaction zone showed that the pathogen hyphae were deformed and shriveled by the bacterial strain.In pot experiments, pretreatment with the RB1 bacterial strain reduced disease incidence significantly by 63%.The bacterial strain did not exhibit any negative significant effects on cucumber growth (plant height and root dry weight) in comparison with untreated control under growth chamber conditions. Molecular identification of strain RB1 based on the 16S rRNA gene revealed that it is Enterobacter cloacae. Findings from this study suggested that E. cloacae has a potential to be used as a biocontrol agent for suppressingcucumber damping-off disease caused by P. aphanidermatum. This is the first report of the antagonistic activity of E. cloacae against P. aphanidermatum-induced damping-off of cucumber.
RESUMO: O estudo foi realizado para examinar a presença potencial de agentes no controle biológico da doença do apodrecimento do pepino causado por Pythium. Examinando onze cepas bacterianas isoladas de raízes de cal ácida e solo da rizosfera mostraram que a cepa bacteriana RB1 foi a mais eficiente na supressão do crescimento micelial de P. aphanidermatum, produzindo uma zona de inibição de 5 mm. O estudo de microscopia eletrônica de varredura dos micélios na zona de interação mostrou que as hifas do patógeno foram deformadas e enrugadas pela cepa bacteriana. Em experimentos com vasos, o pré-tratamento com a cepa bacteriana RB1 reduziu significativamente a incidência da doença em 63%. A cepa bacteriana não exibiu nenhum efeito negativo. Efeitos significativos no crescimento do pepino (altura da planta e peso seco da raiz), em comparação com o controle não tratado sob condições da câmara de crescimento. A identificação molecular da cepa RB1 com base no gene 16S rRNA revelou que é a Enterobacter cloacae. Os resultados deste estudo sugerem que E. cloacae tem potencial para ser usado como agente de biocontrole para suprimir a doença da podridão de pepino causada por P. aphanidermatum. Este é o primeiro relato da atividade antagônica de E. cloacae contra o amortecimento induzido por P. aphanidermatum de pepino.