Uma análise dos principais diagnósticos de Sars-cov-2 disponíveis no Brasil: uma revisão de literatura / Diagnosis and main types of coronavirus in humans: a narrative review / Diagnóstico y principales tipos de coronavirus en humanos: una revisión narrativa

Introdução: Com a emergência do SARS-CoV-2 foi disponibilizado uma grande quantidade de ferramentas de diagnóstico. Neste contexto, a falta de vacina, de tratamento e o grande número de casos graves e morte, possibilitou a aprovação emergencial de diversos testes, que ainda necessitam de estudos populacionais para seu registro definitivo. Objetivo: Realizar uma revisão de literatura para avaliar as metodologias de diagnóstico disponíveis no Brasil, de acordo com a realidade local de saúde, explorando o momento epidemiológico a complexidade do teste e a finalidade da sua aplicação. Metodologia: Trata-se de um estudo bibliográfico, descritivo do tipo revisão de literatura. Foram utilizadas as seguintes bases de dados científicos para buscas: PUBMED, MEDLINE, LILACS E COCHRANE LIBRARY, através de descritores selecionados na plataforma DECS. Resultados: O cenário de diversos ensaios, baseados em diferentes metodologias, como os testes baseados em RNA viral, em detecção de antígenos virais ou de anticorpos, associados ao conhecimento da história natural do vírus, possibilita uma análise crítica do melhor diagnóstico de acordo com a clínica do paciente, os epidemiológicos, o objetivo do diagnóstico e a acurácia do ensaio. Atualmente, há mudança no padrão imunológico da população e a descrição de tipos e subtipos de SARS-CoV-2 com mudanças gênicas, que podem levar a mudanças na acurácia diagnóstica ou a re-emergência em surtos de doença grave. Conclusão: Ainda é incerto o caminho evolutivo da história natural da Covid-19 e os ensaios diagnósticos estão em diferentes estágios de desenvolvimento, validação e produção e cada tipo de teste tem suas próprias vantagens e desvantagens distintas inerentes a plataforma tecnológica de origem e uma combinação de tipos de testes usados em momentos diferentes pode ser útil para a condução clínica dos pacientes e no controle da pandemia por SARS-CoV-2.

Introduction: With the emergence of SARS-CoV-2, a large number of diagnostic tools were made available. In this context, the lack of vaccine, treatment and the large number of severe cases and death, allowed the emergency approval of several tests, which still require population studies for their definitive registration. Objective: To carry out a literature review to evaluate the diagnostic methodologies available in Brazil, according to the local health reality, exploring the epidemiological moment, the complexity of the test and the purpose of its application. Methodology: This is a bibliographic, descriptive study of the literature review type. The following scientific databases were used for searches: PUBMED, MEDLINE, LILACS AND COCHRANE LIBRARY, through selected descriptors on the DECS platform. Results: The scenario of several tests, based on different methodologies, such as tests based on viral RNA, on detection of viral antigens or antibodies, associated with knowledge of the natural history of the virus, allows a critical analysis of the best diagnosis according to the patient's clinical, epidemiological, diagnostic objective and assay accuracy. Currently, there is a change in the immune pattern of the population and the description of types and subtypes of SARS-CoV-2 with genetic changes, which can lead to changes in diagnostic accuracy or the re-emergence in outbreaks of severe disease. Conclusion: The evolutionary path of the natural history of Covid-19 is still uncertain and diagnostic assays are at different stages of development, validation and production and each type of test has its own distinct advantages and disadvantages inherent in the technology platform of origin and a combination of types of tests used at different times can be useful for the clinical management of patients and in the control of the SARS-CoV-2 pandemic.

Introducción: Con la aparición del SARS-CoV-2, se dispuso de un gran número de herramientas diagnósticas. En este contexto, la falta de vacuna, tratamiento y el gran número de casos graves y muerte, permitieron la aprobación de urgencia de varias pruebas, que aún requieren estudios poblacionales para su registro definitivo. Objetivo: Realizar una revisión bibliográfica para evaluar las metodologías diagnósticas disponibles en Brasil, de acuerdo con la realidad sanitaria local, explorando el momento epidemiológico, la complejidad de la prueba y la finalidad de su aplicación. Metodología: Se trata de un estudio bibliográfico, descriptivo, del tipo revisión de literatura. Para las búsquedas se utilizaron las siguientes bases de datos científicas PUBMED, MEDLINE, LILACS Y COCHRANE LIBRARY, a través de descriptores seleccionados en la plataforma DECS. Resultados: El escenario de varias pruebas, basadas en diferentes metodologías, como pruebas basadas en el ARN viral, en la detección de antígenos virales o anticuerpos, asociado al conocimiento de la historia natural del virus, permite un análisis crítico del mejor diagnóstico de acuerdo con la clínica del paciente, epidemiológica, objetivo diagnóstico y precisión de la prueba. Actualmente, hay un cambio en el patrón inmunológico de la población y la descripción de tipos y subtipos de SARS-CoV-2 con cambios genéticos, que pueden conducir a cambios en la precisión diagnóstica o la reaparición en brotes de enfermedad grave. Conclusiones: El camino evolutivo de la historia natural del Covid-19 es aún incierto y los ensayos de diagnóstico se encuentran en diferentes etapas de desarrollo, validación y producción y cada tipo de prueba tiene sus propias ventajas y desventajas distintas inherentes a la plataforma tecnológica de origen y una combinación de tipos de pruebas utilizadas en diferentes momentos puede ser útil para el manejo clínico de los pacientes y en el control de la pandemia de SARS- CoV-2.

Concordancia entre métodos diagnósticos de infección por SARS-CoV-2 en niños asistidos en el departamento de urgencias de un hospital pediátrico / Agreement between diagnostic methods for SARS-CoV-2 infection in children seen at the Emergency Department of a children's hospital

Introducción. Los inmunoensayos de detección rápida de antígenos (TRA) del SARS-CoV-2, son considerados adecuados para el diagnóstico en el punto de atención. El objetivo fue conocer la concordancia entre la reacción en cadena de la polimerasa en tiempo real con transcriptasa inversa (RT-qPCR, por su sigla en inglés) y los TRA en población pediátrica. Población y métodos. Se reclutaron todos los pacientes entre 1 mes y 17 años 11 meses de edad atendidos en la Unidad Febril de Urgencia de un hospital pediátrico entre el 11 de junio y el 3 de octubre de 2021. Se utilizó el TRA Panbio COVID-19 Ag® (Abbott Diagnostic) y, comométodo de referencia, la RT-qPCR (según el protocolo de los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades). Resultados. Se incluyeron 6491 pacientes. La prevalencia de COVID-19 fue del 2,8 %. El92,1 % de los sujetos presentaron síntomas. La sensibilidad, la especificidad y el índice kappa de concordancia para el TRA fueron del 71,0 %, 99,9 % y 0,813, respectivamente. El índice kappa yla sensibilidad del TRA fueron significativamentemayores en el grupo de 13 a 17 años (0,89 y 82,4 %,respectivamente) cuando se los comparó con los grupos de 0 a 5 y de 6 a 12 años. Esto podría deberse a la menor carga viral observada en los pacientes menores de 12 años. Conclusión. Si bien los TRA permiten acortar el tiempo de obtención de los resultados y mejorar la estrategia de aislamiento de pacientes con COVID-19, la sensibilidad en niños menores de 12 años o asintomáticos no se encontraría dentro de los rangos recomendados, sobre todo enperíodos de baja prevalencia de la enfermedad.

Introduction. Rapid antigen tests (RAgTs) for SARS-CoV-2 are considered adequate for diagnosis at the point of care. Our objective was to establish the agreement between reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) and RAgTs in the pediatric population. Population and methods. All patients aged 1 month to 17 years and 11 months seen at the Emergency Fever Unit of a children's hospital between 6-11-2021 and 10-3-2021 were recruited. The Panbio COVID-19 Ag® test (Abbott Diagnostic) was compared to the reference method RT-qPCR (as per the protocol suggested by the United States Centers for Disease Control and Prevention). Results. A total of 6491 patients were included. The prevalence of COVID-19 was 2.8%. Symptoms were observed in 92.1%. Sensitivity, specificity, and the kappa index of agreement for the RAgT were 71.0%, 99.9%, and 0.813, respectively. The kappa index and the RAgT sensitivity were significantly higher in the group aged 13­17 years (0.89 and 82.4%, respectively) compared to the groups aged 0­5 and 6­12 years. This may be due to the lower viral load observed in patients younger than 12 years. Conclusion. Although RAgTs shorten the time to result and improve the isolation strategy for COVID-19 patients, their sensitivity in children younger than 12 years or asymptomatic children is not within the recommended ranges, especially during periods of low disease prevalence.

COVID immunity in the Angolan population :Serological study with Abbott COVID-19 IgG/IgM Rapid Test and serological mini VIDAS BIOMERIEUX test

Background: The numbers of severe COVID cases and COVID-related deaths on the African continent are lower than expected. We hypothesize that this paradox may be due to the achieved immunity in black Africans. Materials and Methods: A prospective study was conducted on Angolan people who performed the Panbio Abbott COVID-19 IgG/IgM Rapid Test in a health unit in Luanda. One hundred randomly selected subjects in those with positive immunoglobulin G (IgG) underwent the serological mini VIDAS BIOMERIEUX test. Results: In our population study (2409 subjects), 791 (32.83%) had positive IgG at the Panbio Abbott COVID-19 test. One hundred were randomly selected. The mean age was 39.55, and 96% were males. The positivity to IgG was validated in 72 subjects at the mini VIDAS BIOMERIEUX test. Conclusion: These results support our hypothesis that in the Angolan/African population a previously achieved immunity may be one of the reasons why this continent was not affected by COVID-19 as expected.

Gestação e COVID-19: evolução dos casos no primeiro ano de pandemia no sul do Brasil / Pregnancy and COVID-19: evolution of cases in the first year of the pandemic in southern Brazil

RESUMO Inicialmente, gestantes e puérperas não foram associadas a risco maior de morbimortalidade relacionada ao Sars-Cov-2. Contudo, a evolução da pandemia tem mostrado um quadro diferente com aumento do acometimento e agravamento dos casos repercutindo em crescentes complicações materno-fetais, especialmente no terceiro trimestre. Objetivos: Este estudo tem como objetivo apresentar dados preliminares de incidência na população de gestantes, atendidas em Hospital terciário do Sul do Brasil, referência no atendimento COVID, obtidos no primeiro ano de pandemia. Resultados: entre março de 2020 e março de 2021, 1801 gestantes foram admitidas no Centro Obstétrico. Destas, 128 (7,10%) referiram alguma queixa referente à síndrome gripal da infecção por coronavírus, sendo que 46,09% (59 gestantes) apresentaram positividade (contaminação pelo Sars-Cov-2) no teste RT-PCR, com variação sazonal. Em 2020, o pico de positividade foi em junho e julho (38,46% e 54,54% respectivamente), porém o pico mais evidente ocorreu em fevereiro (83,33%) e março de 2021 (78.9%) de positividade viral, entre as gestantes sintomáticas. No primeiro ano da pandemia, 16 gestantes internaram em centro de tratamento intensivo, correspondendo a 27,1% das sintomáticas e infectadas com Sars-Cov-2. Conclusões: Importante destacar a elevação significativa de casos em março de 2021 e a importância de conhecermos a evolução da COVID-19 na gestação, uma vez que entre gestantes sintomáticas com testes positivos, 22% necessitaram de CTI. O comportamento viral pode ser diferente, conforme a população atendida, estes dados podem ser fundamentais no planejamento de estratégias de saúde e de atendimento às mulheres no ciclo gravídico-puerperal.

ABSTRACT Initially, pregnant and postpartum women were not associated with an increased risk of SARS-Cov-2-related morbidity and mortality. However, the evolution of the pandemic has shown a different picture with an increase in the number and aggravation of cases, resulting in increasing maternal-fetal complications, especially in the third trimester. Objectives: This study aims to present preliminary incidence data in the population of pregnant women treated at a tertiary Hospital in South Brazil, a reference in COVID care, obtained in the first year of the pandemic. Results: Between March 2020 and March 2021, 1801 pregnant women were admitted to the Obstetric Center. Of these, 128 (7.10%) reported some complaint regarding the flu-like syndrome of coronavirus infection, and 46.09% (59 pregnant women) were positive for Sars-Cov-2 in the RT-PCR test, with seasonal variation. In 2020 the peak of positivity was in June and July (38.46% and 54.54%, respectively), but the most evident peak of viral positivity occurred in February (83.33%) and March 2021 (78.9%) among symptomatic pregnant women. In the first year of the pandemic, 16 pregnant women were admitted to an intensive care unit, corresponding to 27.1% of symptomatic women infected with Sars-Cov-2. Conclusions: It is important to highlight the significant increase in cases in March 2021 and the importance of knowing the evolution of COVID-19 during pregnancy, since among symptomatic pregnant women with positive tests, 22% required ICU. Viral behavior can be different, depending on the population served, these data can be fundamental in the planning of health and care strategies for women in the pregnancy-puerperal cycle.