Distribution of Meloidogyne species in carrot in Brazil / Distribuição de espécies de Meloidogyne em cenoura no Brasil

ABSTRACT: Root-knot nematodes (RKN - Meloidogyne spp.) are one of the most serious threats to carrot production worldwide. In Brazil, carrots are grown throughout the year, and economic losses due to RKN are reported. Since little is known on the distribution of RKN species in carrot fields in Brazil, we collected plant and soil samples from 35 fields across six states. Based on the morphology of perineal patterns, esterase phenotypes and species-specific PCR, three Meloidogyne species were identified: 60% of the fields were infested with Meloidogyne incognita, M. javanica was reported in 42.9% of the areas, whereas M. hapla was detected in 17.1% of carrot fields. Mixed populations were reported in 20% of the areas with a predominance of M. incognita + M. javanica. The combination of morphological, biochemical, and molecular techniques is a useful approach to identify RKN species.

RESUMO: Os nematoides-das-galhas (RKN - Meloidogyne spp.) são uma das mais sérias ameaças à produção de cenoura no mundo. No Brasil, as cenouras são cultivadas ao longo do ano, e as perdas econômicas devido à RKN são frequentemente relatadas. Como pouco se sabe sobre a distribuição de espécies RKN em campos de cenoura no Brasil, coletamos amostras de plantas e solo de 35 campos em seis estados. Baseado na morfologia do padrão perineal, fenótipos de esterase e/ou PCR espécie-específica, três espécies de Meloidogyne foram identificadas: 60% dos campos estavam infestados por Meloidogyne incognita, M. javanica foi encontrada em 42,9% das áreas, enquanto M. hapla foi detectada em 17,1% dos campos de cenoura. Populações mistas foram encontradas em 20% das áreas, com predominância de M. incognita + M. javanica. A combinação de técnicas morfológicas, bioquímicas e moleculares é uma abordagem útil para identificar espécies de RKN.

Species-specific nested PCR as a diagnostic tool for Brucella ovis infection in rams / Nested PCR espécie-específica para o diagnóstico da infecção por Brucella ovis em carneiros

The aim of the present study was to evaluate a species-specific nested PCR based on a previously described species-specific PCR for detection of B. ovis in semen and urine samples of experimentally infected rams. The performance of the species-specific nested PCR was compared with the results of a genus-specific PCR. Fourteen rams were experimentally infected with the Brucella ovis REO 198 strain and samples of semen and urine were collected every week up to 180 days post infection. Out of 83 semen samples collected, 42 (50.6%) were positive for the species-specific nested PCR, and 23 (27.7%) were positive for the genus-specific PCR. Out of 75 urine samples, 49 (65.3%) were positive for the species-specific nested PCR, whereas 11 (14.6%) were genus-specific PCR positive. Species-specific nested PCR was significantly more sensitive (P<0.001) than the genus-specific PCR in semen and urine from experimentally infected rams. In conclusion, the species-specific nested PCR developed in this study may be used as a diagnostic tool for the detection of B. ovis in semen and urine samples from suspected rams.

O presente estudo objetivou avaliar uma técnica de nested PCR espécie-específica delineada a partir de PCR espécie-específica descrita anteriormente para detecção de B. ovis em sêmen e urina de carneiros infectados experimentalmente. O desempenho da nested PCR espécie-específica foi comparado com os resultados de uma PCR gênero-específica. Quatorze carneiros foram infectados experimentalmente com Brucella ovis REO 198 e amostras de sêmen e de urina foram colhidas semanalmente até 180 dias após a infecção. De 83 amostras de sêmen, 42 (50,6%) foram positivas pela nested PCR espécie-específica, e 23 (27,7%) foram positivas pela PCR gênero-específica. De 75 amostras de urina, 49 (65,3%) foram positivas pela nested PCR espécie-específica, enquanto 11 (14,6%) foram positivas em PCR gênero-específica. A técnica de nested PCR espécie-específica foi significativamente mais sensível (P<0,001) do que a PCR gênero-específica no sêmen e na urina de carneiros infectados experimentalmente. Em conclusão, a nested PCR espécie-específica desenvolvida neste estudo pode ser utilizada como ferramenta de diagnóstico para detecção de B. ovis em sêmen e urina de carneiros suspeitos.