RESUMEN
O microbioma humano compreende material genético da microbiota de um local do corpo e tem influência direta ou indireta na manutenção da homeostase. O distúrbio da microbiota pode estar relacionado ao desenvolvimento de doenças. A população fúngica ainda é muito pouco estudada no contexto do microbioma. No presente estudo, foi desenvolvida uma metodologia para identificação de fungos por metabarcoding. A metodologia desenvolvida foi aplicada em mostras de pacientes portadores de adenocarcinoma gástrico ou carcinoma epidermoide de pênis. De modo geral, em ambos os tumores foi verificada a redução de diversidade fúngica conforme a evolução do estadiamento patológico. Também foram verificados resultados não concordantes ao analisar espécies diferencialmente abundantes em dados de sequenciamento da região ITS2 e de WGS nas amostras de lavado gástrico. Este trabalho reforça a importância em se estudar os fungos e sua associação com doenças como o câncer e incentiva próximos estudos através do desenvolvimento de uma metodologia específica para o micobioma.
The human microbiome comprises genetic material from the microbiota of a body site and has a direct or indirect influence on the maintenance of homeostasis. The disturbance of the microbiota may be related to the development of diseases. The fungal population is still very little studied in the context of the microbiome. In this study, a methodology was developed to identify fungi by metabarcoding. The methodology developed was applied to samples from patients with gastric adenocarcinoma or squamous cell carcinoma of the penis. In general, in both tumors, a reduction in fungal diversity was observed according to the evolution of the pathological staging. Discordant results were also found when analyzing differentially abundant species in sequencing data from the ITS2 region and WGS in gastric lavage samples. This work reinforces the importance of studying fungi and their association with diseases such as cancer and encourages further studies through the development of a specific methodology for the mycobiome
Asunto(s)
Neoplasias del Pene , Neoplasias Gástricas , Micobioma , Carcinoma de Células Escamosas , AdenocarcinomaRESUMEN
Resumen Introducción: los hongos hacen parte de los microorganismos que se encuentran en el ser humano y que interactúan con bacterias, virus y archaeas. El equilibrio inter e intra-especies es importante para mantener la salud en los seres humanos. La mayoría de los estudios sobre el micobioma se han relacionado con estados de enfermedad causados por hongos, siendo de relevancia la exploración de las comunidades comensales en individuos sanos. Métodos: se realizó una búsqueda bibliográfica en PubMed, ScienceDirect, Scopus y Google Scholar, usando los términos mycobiome, intestinal fungi, skin mycobiome, vaginal mycobiome, fungal microbiome. Se incluyeron artículos desde 1996 hasta 2020, de revisión y de resultados de investigación en todos los idiomas. Resultados y discusión: existe variabilidad en las comunidades fúngicas en los sitios corporales según sus características intrínsecas y la relación con el medio ambiente. El estado de salud en los seres humanos puede estar influenciado por la densidad y diversidad fúngica, a diferencia de los individuos enfermos en quienes se evidencia una disminución en la diversidad y que se asocia con el oportunismo de agentes patógenos.
Abstract Introduction: Fungi are part of the microorganisms that are found in humans and interact with bacteria, viruses and archaeas. The balance inter and intra-species is important to maintain health in humans. Most studies on mycobiota have been related to disease states caused by fungi, the exploration of commensal communities in healthy individuals being relevant. Methods: literature search in PubMed, ScienceDirect, Scopus and Google Scholar, using the terms: mycobiome, intestinal fungi, skin mycobiome, vaginal mycobiome, fungal microbiome. Articles from 1996 to 2020, review and research results in all languages were included in this review. Results: Variability in fungal communities is determinated according to body site characteristics and the contact with the environment. Health status in humans can be influenced by fungal density and diversity, unlike sick individuals where there is evidence of a decrease in diversity and that is associated with the opportunism of pathogens.