Association of vitamin D receptor gene polymorphisms with type 2 diabetes mellitus in Taif population: a case-control study

Abstract Several reasons may underlie the dramatic increase in type2 diabetes mellitus. One of these reasons is the genetic basis and variations. Vitamin D receptor polymorphisms are associated with different diseases such as rheumatoid arthritis and diabetes. The aim of this study is to investigate the possible association of two identified mutations ApaI (rs7975232) and TaqI (rs731236). Eighty-nine healthy individuals and Fifty-six Type 2 Diabetic (T2D) patients were investigated using RFLP technique for genotyping and haplotyping as well. The distribution of Apal genotypes was not statistically significant among the control (P=0.65) as well as for diabetic patients (P=0.58). For Taql allele frequencies of T allele was 0.61 where of G allele was 0.39. The frequency distribution of Taql genotypes was not statistically significant among the control (P=0.26) as well as diabetic patients (P=0.17). Relative risk of the allele T of Apa1 gene is 1.28 and the odds ratio of the same allele is 1.53, while both estimates were 1.0 of the allele G. Similarly, with the Taq1 gene the relative risk and the odds ratio values for the allele T are 1.09 and 1.27 respectively and both estimates of the allele C were 0.86 for the relative risk and 0.79 for the odds ratio. The pairwise linkage disequilibrium between the two SNPs Taq1/apa1 was statistically significant in control group (D = 0.218, D' = 0.925 and P value 0.001) and similar data in diabetic groups (D = 0.2, D' = 0.875 and P value 0.001). These data suggest that the T allele of both genes Apa1 and Taq1 is associated with the increased risk of type 2 diabetes. We think that we need a larger number of volunteers to reach a more accurate conclusion.

Resumo Várias razões podem estar subjacentes ao aumento dramático da diabetes mellitus tipo 2. Um desses motivos é a base genética e variações. Os polimorfismos do receptor da vitamina D estão associados a diferentes doenças, como artrite reumatoide e diabetes. O objetivo deste estudo é investigar a possível associação de duas mutações identificadas ApaI (rs7975232) e TaqI (rs731236). Oitenta e nove indivíduos saudáveis e 56 pacientes com diabetes tipo 2 (T2D) foram investigados usando a técnica RFLP para genotipagem e haplotipagem também. A distribuição dos genótipos Apal não foi estatisticamente significativa entre o controle (P = 0,65), bem como para os pacientes diabéticos (P = 0,58). Para as frequências do alelo Taql, o alelo T foi de 0,61, onde o alelo G foi de 0,39. A distribuição de frequência dos genótipos Taql não foi estatisticamente significativa entre o controle (P = 0,26), bem como os pacientes diabéticos (P = 0,17). O risco relativo do alelo T do gene Apa1 é 1,28 e a razão de chances do mesmo alelo é 1,53, enquanto ambas as estimativas foram 1,0 do alelo G. Da mesma forma, com o gene Taq1, os valores de risco relativo e razão de chances para o alelo T são 1,09 e 1,27, respectivamente, e ambas as estimativas do alelo C foram de 0,86 para o risco relativo e 0,79 para o odds ratio. O desequilíbrio de ligação par a par entre os dois SNPs Taq1 / apa1 foi estatisticamente significativo no grupo de controle (D = 0,218, D' = 0,925 e valor P 0,001) e dados semelhantes em grupos diabéticos (D = 0,2, D' = 0,875 e valor P 0,001). Esses dados sugerem que o alelo T de ambos os genes Apa1 e Taq1 está associado ao aumento do risco de diabetes tipo 2. Achamos que precisamos de um número maior de voluntários para chegar a uma conclusão mais precisa.

Association of vitamin D receptor gene polymorphisms with type 2 diabetes mellitus in Taif population: a case-control study / Associação de polimorfismos do gene do receptor de vitamina D com diabetes mellitus tipo 2 na população Taif: um estudo de caso-controle

Abstract Several reasons may underlie the dramatic increase in type2 diabetes mellitus. One of these reasons is the genetic basis and variations. Vitamin D receptor polymorphisms are associated with different diseases such as rheumatoid arthritis and diabetes. The aim of this study is to investigate the possible association of two identified mutations ApaI (rs7975232) and TaqI (rs731236). Eighty-nine healthy individuals and Fifty-six Type 2 Diabetic (T2D) patients were investigated using RFLP technique for genotyping and haplotyping as well. The distribution of Apal genotypes was not statistically significant among the control (P=0.65) as well as for diabetic patients (P=0.58). For Taql allele frequencies of T allele was 0.61 where of G allele was 0.39. The frequency distribution of Taql genotypes was not statistically significant among the control (P=0.26) as well as diabetic patients (P=0.17). Relative risk of the allele T of Apa1 gene is 1.28 and the odds ratio of the same allele is 1.53, while both estimates were < 1.0 of the allele G. Similarly, with the Taq1 gene the relative risk and the odds ratio values for the allele T are 1.09 and 1.27 respectively and both estimates of the allele C were 0.86 for the relative risk and 0.79 for the odds ratio. The pairwise linkage disequilibrium between the two SNPs Taq1/apa1 was statistically significant in control group (D = 0.218, D' = 0.925 and P value < 0.001) and similar data in diabetic groups (D = 0.2, D' = 0.875 and P value < 0.001). These data suggest that the T allele of both genes Apa1 and Taq1 is associated with the increased risk of type 2 diabetes. We think that we need a larger number of volunteers to reach a more accurate conclusion.

Resumo Várias razões podem estar subjacentes ao aumento dramático da diabetes mellitus tipo 2. Um desses motivos é a base genética e variações. Os polimorfismos do receptor da vitamina D estão associados a diferentes doenças, como artrite reumatoide e diabetes. O objetivo deste estudo é investigar a possível associação de duas mutações identificadas ApaI (rs7975232) e TaqI (rs731236). Oitenta e nove indivíduos saudáveis ​​e 56 pacientes com diabetes tipo 2 (T2D) foram investigados usando a técnica RFLP para genotipagem e haplotipagem também. A distribuição dos genótipos Apal não foi estatisticamente significativa entre o controle (P = 0,65), bem como para os pacientes diabéticos (P = 0,58). Para as frequências do alelo Taql, o alelo T foi de 0,61, onde o alelo G foi de 0,39. A distribuição de frequência dos genótipos Taql não foi estatisticamente significativa entre o controle (P = 0,26), bem como os pacientes diabéticos (P = 0,17). O risco relativo do alelo T do gene Apa1 é 1,28 e a razão de chances do mesmo alelo é 1,53, enquanto ambas as estimativas foram < 1,0 do alelo G. Da mesma forma, com o gene Taq1, os valores de risco relativo e razão de chances para o alelo T são 1,09 e 1,27, respectivamente, e ambas as estimativas do alelo C foram de 0,86 para o risco relativo e 0,79 para o odds ratio. O desequilíbrio de ligação par a par entre os dois SNPs Taq1 / apa1 foi estatisticamente significativo no grupo de controle (D = 0,218, D' = 0,925 e valor P < 0,001) e dados semelhantes em grupos diabéticos (D = 0,2, D' = 0,875 e valor P < 0,001). Esses dados sugerem que o alelo T de ambos os genes Apa1 e Taq1 está associado ao aumento do risco de diabetes tipo 2. Achamos que precisamos de um número maior de voluntários para chegar a uma conclusão mais precisa.

Identificación de polimorfismos obesogénicos en mexicanos / Identification of obesogenic polymorphisms in Mexicans

Introducción. La obesidad es una enfermedad metabólica caracterizada por el aumento del índice de la masa corporal. El riesgo de obesidad depende de factores ambientales, del estilo de vida y de la presencia de variantes genéticas originadas por mutaciones únicas y polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs). Estudios han mostrado la importancia de la etnia en la heredabilidad de las variantes genéticas asociadas al desarrollo de la obesidad. En México, la prevalencia de sobrepeso y la obesidad es del 38.8 % y 32.4 %, respectivamente. Objetivo. El objetivo de este estudio es determinar SNPs que influyen de manera distintiva en el desarrollo de la obesidad de mexicanos. Materiales y métodos. Se realizó un estudio bibliográfico en la base de datos Pubmed con 70 artículos que estudian la asociación de diferentes SNPs con el desarrollo de la obesidad en mexicanos. Resultados. Se identifican los SNPs rs17782313 (MC4R), rs6548238 (TMEM18), rs6265 (BDNF) y rs7488665 (SH2B1) con un comportamiento diferencial respecto a los resultados obtenidos en población caucásica y el SNPs rs6232 del gen PCSK1 asociado con la aparición de la obesidad en edades juveniles en la población mexicana. Conclusiones. Concluyendo que la caracterización detallada de los genes de mayor incidencia en las distintas etnias contribuye a establecer estrategias personalizadas en particular de la población mexicana y que permitan desarrollar un sistema de alta sensibilidad para determinar la susceptibilidad a la obesidad(AU)

Introduction. Obesity is a metabolic disease characterized by an increase in the body mass index. The risk of obesity depends on environmental factors, lifestyle and the presence of genetic variants caused by single mutations and single nucleotide polymorphisms (SNPs). Studies have shown the importance of ethnicity in the heritability of genetic variants associated with the development of obesity. In Mexico, the prevalence of overweight and obesity is 38.8% and 32.4%, respectively. Objective. The objective of this study is to determine SNPs that have a distinctive influence on the development of obesity in Mexicans. Materials and Methods. A bibliographical study was carried out in the Pubmed database and 70 papers were found that study the association of different SNPs with the development of obesity in Mexicans. Results. The SNPs rs17782313 (MC4R), rs6548238 (TMEM18), rs6265 (BDNF) and rs7488665 (SH2B1) with a differential behavior with respect to the results obtained in the Caucasian population, and the SNPs rs6232 of the PCSK1 gene associated with the appearance of obesity in youth in the Mexican population. Conclusions. Concluding that the detailed characterization of the genes with the highest incidence in the different ethnic groups contributes to establish personalized strategies in particular of the Mexican population and that allow the development of a highly sensitive system to determine susceptibility to obesity(AU)

Performance of the tetra-primer PCR technique compared to PCR-RFLP in the search for rs12979860 (C/T) and rs8099917 (T/G) single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the IFNL4 gene / Desempenho da técnica tetra-primer PCR em relação a PCR-RFLP na pesquisa de polimorfismos de nucleotídeos únicos (SNPs) rs12979860 (C/T) e rs8099917 (T/G) no gene IFNL4

Single nucleotide polymorphisms (SNPs, rs12979860 e rs8099917) in the Interferon Lambda 4 gene (IFNL4, formerly IFNL3and/or IL28B) has been associated with failure in the innate immune response, sustained virological response in hepatitis C, and HTLV-1-associated myelopathy (HAM) development. To search for these polymorphisms several methodologies can be employed, such as sequencing, real-time or quantitative polymerase chain reaction (qPCR), restriction fragment length polymorphism analysis in PCR products (PCR-RFLP), and tetra-primer PCR. The present study compared the performance of the tetra-primer PCR in relation to the PCR-RFLP, both optimized in the Research HTLV Laboratory of the Center of Immunology of Instituto Adolfo Lutz in São Paulo. One hundred DNA samples obtained from patients of STD/Aids Reference Centre in São Paulo, previously analyzed for IL28B SNPs by PCR-RFLP were selected for analysis, after confirming that they represent all IL28B SNPs patterns described in the literature. The results obtained showed concordance between the PCR-RFLP and the tetra-primer PCR SNPs results, and because of the low cost, easy to perform, and minor employment of biological specimen and reagents, the tetra-primer PCR is of choice to be used in routine. (AU)

Polimorfismos de nucleotídeos únicos (single nucleotide polymorphisms, SNPs rs12979860 e rs8099917) no gene que codifica o Interferon Lambda 4 (IFNL4, antigamente IFNL3 e/ou IL28B) têm sido associados às falhas na resposta imune inata e resposta virológica sustentada na hepatite C, e a mielopatia associada ao HTLV-1 (HTLV-1-associated myelopathy, HAM). A pesquisa destes polimorfismos pode empregar diversas metodologias: sequenciamento, reação em cadeia da polimerase em tempo real ou quantitativa (quantitative polymerase chain reaction, qPCR), análise de fragmentos de restrição enzimática em produtos de PCR (restriction fragment length polymorphism in PCR products, PCR-RFLP) e a tetra-primer PCR. Este estudo comparou o desempenho da tetra-primer PCR em relação a PCR-RFLP, ambas otimizadas no Laboratório de Pesquisa em HTLV do Centro de Imunologia do Instituto Adolfo Lutz de São Paulo. Foram selecionadas 100 amostras de DNA obtidas de pacientes do Centro de Referência e Treinamento em DST/Aids de São Paulo cujos SNPs na IL28B foram anteriormente determinados por PCR-RFLP e representaram todos os perfis descritos em literatura. Os resultados obtidos mostraram concordância entre elas, e pelo fato da tetra-primer PCR ter menor custo, ser de fácil execução, empregar menos tempo, insumos e material biológico, é a técnica de escolha para uso em rotina. (AU)

Polymorphism in cytolytic pathway genes in patients with pediatric inflammatory multisystemic syndrome temporally associated with SARS-CoV-2 / Polimorfismos em genes da via citolítica em pacientes com síndrome inflamatória multissistêmica pediátrica temporariamente associada ao SARS-CoV-2

Introduction: Pediatric inflammatory multisystem syndrome temporally associated with SARS-CoV-2 (PIMS-TS) is a systemic hyperinflammatory disease that occurs in a small number of children after being infected with SARS-CoV-2. Macrophage activation syndrome, an aggressive condition characterized by the excessive inflammation and activation of well-differentiated macrophages, has been shown to occur in patients infected by SARS-CoV-2. Considering the clinical and pathophysiological similarities between these diseases, our main objective was to determine whether gene polymorphisms associated with macrophage activation syndrome were also present in patients with PIMS-TS. Methods: DNA from 10 pediatric patients with PIMS-TS (case group) and ten COVID-19 patients without PIMS-TS (control group) were genotyped by Real-time PCR analysis (TaqMan®) for single nucleotide polymorphisms (SNP) in four genes associated with macrophage activation syndrome: perforin 1 (PRF1), granzyme B (GZMB), syntaxin 11 (STX11), and syntaxin binding protein 2 (STXBP2). The SNP analysis was performed using the additive, dominant, and recessive models. Results: A significantly higher frequency of an SNP (C wild allele in rs6573910) in the GZMB gene was observed in both the additive and dominant models in the PIMS-TS group than controls. A borderline significant difference was also observed for the G allele in rs7764017 of the STX11 gene in the PIMS-TS group in the additive model. Conclusions: This study indicated the presence of two polymorphisms in genes associated with macrophage activation syndrome (GZMB and STX11) in patients who developed PIMS-TS. If the presence of these SNPs is validated in a larger number of PIMS-TS cases, they can be used as potential biomarkers for early identification of pediatric patients with a higher probability of developing PIMS-TS associated with SARS-CoV-2 infection.

Introdução: A síndrome multissistêmica inflamatória pediátrica temporariamente associada ao SARS-CoV-2 (SIMP-TS) é uma doença hiperinflamatória sistêmica que ocorre em um pequeno número de crianças após serem infectadas pelo SARS-CoV-2. A síndrome de ativação de macrófagos (SAM), uma condição agressiva caracterizada pela inflamação excessiva e ativação de macrófagos bem diferenciados, demonstrou ocorrer em pacientes infectados por SARS-CoV-2. Considerando as semelhanças clínicas e fisiopatológicas entre essas doenças, neste estudo o nosso principal objetivo foi determinar se polimorfismos gênicos associados à SAM também estavam presentes em pacientes com SIMP-TS. Métodos: DNA de dez pacientes pediátricos com SIMP (grupo caso) e dez pacientes COVID-19 sem SIMP (grupo controle) foram genotipados por análise de PCR em tempo real (tecnologia TaqMan®) para polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) em quatro genes selecionados associados com SAM: perforina 1 (PRF1), granzima B (GZMB), sintaxina 11 (STX11) e proteína de ligação de sintaxina 2 (STXBP2). A análise dos SNPs foi realizada utilizando o modelo aditivo, dominante e recessivo. Resultados: Uma frequência significativamente maior de um SNP (alelo selvagem C em rs6573910) no gene GZMB foi observada pelos modelos aditivo e dominante no grupo SIMP quando comparado aos controles. Além disso, uma significância limítrofe foi observada para o alelo G em rs7764017 do gene STX11 no grupo SIMP pelo modelo aditivo. Conclusões: Nosso estudo indicou a presença de dois polimorfismos em genes associados à SAM (GZMB e STX11) em pacientes que desenvolveram SIMP-TS. Uma vez validada a presença desses SNPs em um número maior de casos de SIMP-TS, eles podem ser usados como potenciais biomarcadores para a identificação precoce de pacientes pediátricos com maior probabilidade de desenvolver SIMP-TS associado à infecção por SARS-CoV-2.

Helicobacter pylori infection: A balance between bacteria and host / Helicobacter pylori: un balance entre bacterias y huésped

Abstract In Argentina, despite the important studies conducted on the prevalence of infection and the antibiotic resistance of Helicobacter pylori, there are no reports simultaneously analyzing a profile of virulence factors of the bacterium and polymorphisms in cytokine genes in patients with different alterations in the gastric mucosa (including intestinal metaplasia, IM). Our aim was to evaluate H. pylori genotypes in 132 adult patients with chronic gastritis presenting three different histological findings (inactive chronic gastritis, active chronic gastritis IM( and active chronic gastritis IM+) along with SNP-174 G>C in the IL-6 gene. cagA, vacA and babA2 genes were analyzed by multiplex PCR. The -174 G>C SNP IL-6 gene was analyzed by PCR-RFLP. Patients with active chronic gastritis IM+ showed the highest proportion of the cagA(+)/IL-6GG, cagA(+)/vacAm1s1/IL-6GG and cagA(+)/vacAm1s1/babA2(+)/IL-6GG combinations (p<0.05). There was 4-5 times greater probability of finding patients presenting the GG genotype for SNP-174 G>C IL-6, which in turn were infected with the most virulent H. pylori genotypes -cagA(+), cagA(+)/vacAm1s1 and cagA(+)/vacAm1s1/babA2- in the ACGIM+ group in comparison to the ICG group. Our results provide regional data to the idea that the transition towards severe alterations in the gastric mucosa would be the result of a balance between specific factors of H. pylori and inherent host factors. This fact can be useful to identify patients at greater risk and to select those individuals requiring appropriate eradication treatment to prevent progression to gastric cancer.

Resumen En Argentina, a pesar de los importantes estudios realizados sobre la prevalencia de infección y la resistencia a antibióticos de Helicobacter pylori, no existen reportes que analicen simultáneamente un perfil de factores de virulencia de la bacteria y polimorfismos en genes de citoquinas en pacientes con diferentes alteraciones en la mucosa gástrica (incluida la metaplasia intestinal [MI]). Nuestro objetivo fue evaluar genotipos de H. pylori en 132 pacientes adultos con gastritis crónica, con tres diferentes hallazgos histológicos (gastritis crónica inactiva [GCI], gastritis crónica activa [MI(] y gastritis crónica activa [MI+]), junto con el SNP-174 G>C en el gen de IL- 6. Los genes cagA, vacA y babA2 se analizaron mediante PCR multiplex. El SNP-174 G>C IL-6 se analizó mediante PCR-RFLP. Los pacientes con gastritis crónica activa MI+ mostraron la mayor proporción de combinaciones cagA(+)/IL-6GG, cagA(+)/vacAm1s1/IL-6GG y cagA(+)/vacAm1s1/babA2(+)/IL-6GG (p<0,05). Hubo 4-5 veces mayor probabilidad de encontrar pacientes con el genotipo GG en SNP-174 G>C IL-6 y a su vez infectados con los genotipos más virulentos de H. pylori-cagA(+), cagA(+)/vacAm1s1 y cagA(+)/vacAm1s1/babA2-en el grupo gastritis crónica activa MI+ en comparación con el grupo GCI. Nuestros resultados aportan datos regionales a la idea de que la transición hacia alteraciones más graves en la mucosa gástrica resultaría de un equilibrio entre factores específicos de H. pylori y factores inherentes al huésped. Esto puede ser útil para identificar pacientes con mayor riesgo y seleccionar aquellos individuos que requieran un apropiado tratamiento de erradicación para prevenir la progresión al cáncer gástrico.

Polimorfismo genético associado a doença renal crônica e periodontite: uma revisão sistemática de literatura / Genetic polymorphism associated with chronic kidney disease and periodontitis: a systematic literature review / Polimorfismo genético asociado a enfermedad renal crónica y periodontitis: una revisión sistemática de la literatura

A periodontite é uma doença infecto-inflamatória associada ao biofilme disbiótico que afeta os tecidos de proteção e de suporte dos dentes. O processo inflamatório que ocorre durante a periodontite tem sido associado à inflamação sistêmica em pacientes com doença renal crônica. Os polimorfismos genéticos são alterações no DNA que podem ter classificações diferentes dependendo da mutação gerada, e podem ser criados ou destruídos. Objetivo: O objetivo desta revisão sistemática da literatura foi elucidar a seguinte questão: os polimorfismos genéticos estão associados à doença renal crônica e à periodontite? Material e Métodos: A pesquisa foi realizada no PubMed, Biblioteca Cochrane, EMBASE, Literatura Latino-Americana e do Caribe em Ciências da Saúde (LILACS), Bibliografia Brasileira de Odontologia (BBO), Biblioteca Virtual em Saúde (BVS), SciELO, Scopus, Web of Science e bases de dados de literatura cinzenta (Google Scholar) sem restrições de data ou idioma em 28 de junho de 2021 e atualizada em 26 de janeiro de 2023. Os descritores padronizados (Medical Subject Headings, MeSH) utilizados foram: "polimorfismo genético", "doença renal crônica" e "periodontite", de acordo com o banco de dados consultado, utilizando os operadores booleanos "AND". Resultado: 25 publicações foram identificadas. Após a análise do título, do resumo e do texto completo, 6 estudos de caso-controle foram selecionados para análise. Todos incluíam artigos investigando o papel de diferentes polimorfismos genéticos em ambas as doenças. Alguns genes apresentavam uma relação próxima com o perfil inflamatório que caracteriza ambas as doenças. Conclusão: Entre os polimorfismos estudados, os polimorfismos VNTR no gene IL4 e MCP-1-2518 A/G apresentaram uma associação positiva tanto com a periodontite quanto com a doença renal crônica. Entretanto, são necessários mais estudos para melhor compreensão do papel dos polimorfismos genéticos nessas doenças.

Periodontitis is an infectious-inflammatory disease associated with dysbiotic biofilm that affects the protective and supporting tissues of the teeth. The inflammatory process that occurs during periodontitis has been associated with systemic inflammation in patients with chronic kidney disease. Genetic polymorphisms are changes in DNA that can have different classifications depending on the mutation generated, and can be created or destroyed. Objective: The aim of this systematic review of the literature was to elucidate the following question: are genetic polymorphisms associated with chronic kidney disease and periodontitis? Material and Methods: The search was conducted in PubMed, Cochrane Library, EMBASE, Latin American and Caribbean Literature on Health Sciences (LILACS), Brazilian Bibliography of Dentistry (BBO), Virtual Health Library (VHL), SciELO, Scopus, Web of Science and gray literature databases (Google Scholar) without date or language restrictions on June 28, 2021 and updated on January 26, 2023. The standardized descriptors (Medical Subject Headings, MeSH) used were: "genetic polymorphism", "chronic kidney disease" and "periodontitis", according to the database consulted, using the Boolean operators "AND". Result: 25 publications were identified. After reviewing the title, abstract, and full text, 6 case-control studies were selected for analysis. All included articles investigating the role of different genetic polymorphisms in both diseases. Some genes showed a close relationship with the inflammatory profile that characterizes both diseases. Conclusion: Among the polymorphisms studied, the VNTR polymorphisms in the IL4 gene and MCP- 1-2518 A/G showed a positive association with both periodontitis and chronic kidney disease. However, further studies are needed to better understand the role of genetic polymorphisms in these diseases.

La periodontitis es una enfermedad infeccioso-inflamatoria asociada a un biofilm disbiótico que afecta a los tejidos protectores y de soporte de los dientes. El proceso inflamatorio que se produce durante la periodontitis se ha asociado con la inflamación sistémica en pacientes con enfermedad renal crónica. Los polimorfismos genéticos son cambios en el ADN que pueden tener diferentes clasificaciones dependiendo de la mutación generada, pudiendo ser creados o destruidos. Objetivo: El objetivo de esta revisión sistemática de la literatura fue dilucidar la siguiente pregunta: ¿están asociados los polimorfismos genéticos con la enfermedad renal crónica y la periodontitis? Material y Métodos: La búsqueda fue realizada en PubMed, Cochrane Library, EMBASE, Literatura Latinoamericana y del Caribe en Ciencias de la Salud (LILACS), Bibliografía Brasileña de Odontología (BBO), Biblioteca Virtual en Salud (BVS), SciELO, Scopus, Web of Science y bases de datos de literatura gris (Google Scholar) sin restricciones de fecha o idioma el 28 de junio de 2021 y actualizada el 26 de enero de 2023. Los descriptores normalizados (Medical Subject Headings, MeSH) utilizados fueron: "polimorfismo genético", "enfermedad renal crónica" y "periodontitis", según la base de datos consultada, utilizando los operadores booleanos "AND". Resultado: Se identificaron 25 publicaciones. Tras analizar el título, el resumen y el texto completo, se seleccionaron 6 estudios de casos y controles para su análisis. Todos los trabajos incluidos investigaban el papel de diferentes polimorfismos genéticos en ambas enfermedades. Algunos genes mostraron una estrecha relación con el perfil inflamatorio que caracteriza a ambas enfermedades. Conclusión: Entre los polimorfismos estudiados, los polimorfismos VNTR en el gen IL4 y MCP-1-2518 A/G mostraron una asociación positiva tanto con la periodontitis como con la enfermedad renal crónica. Sin embargo, se necesitan más estudios para comprender mejor el papel de los polimorfismos genéticos en estas enfermedades.

Por trás da leptina: uma revisão de literatura / Behind the leptin: a literature review / Detrás de leptin: una revisión de la literatura

A obesidade é uma doença crônica, multifatorial, que afeta todas as idades e classes sociais. Esta comorbidade tem avançado em decorrência de diversos fatores e sua prevalência está ancorada em diferentes dimensões como as biológicas, sociais, históricas, comportamentais, saúde pública e política. O presente estudo tem como objetivo caracterizar o gene da leptina, seu produto e de seus receptores, assim como os mecanismos que corroboram com o desenvolvimento da obesidade e seu envolvimento com distúrbios alimentares. A leptina é uma proteína secretada principalmente nos adipócitos, ela reduz o apetite por meio da inibição da formação de neuropeptídeos relacionados ao apetite, como o neuropeptídeo Y e eleva a expressão de neuropeptídeos anorexígenos, como o hormônio liberador de corticotropina, por isso que os altos níveis de leptina reduzem a ingestão alimentar, em contraste com os níveis baixos que induzem hiperfagia. Como a leptina realiza o controle da saciedade e regulação do gasto energético, o indivíduo com disfunção neste gene não desenvolve essa função corretamente. Isso se deve aos SNPs, que de acordo com estudos aumentam a susceptibilidade à obesidade. Além do mais, a leptina pode estar envolvida com processo patológico de alguns distúrbios alimentares, predispondo o paciente às condições como anorexia nervosa e bulimia.

Obesity is a chronic, multifactorial disease that affects all ages and social classes. This comorbidity has advanced as a result of several factors and its prevalence is anchored in different dimensions such as biological, social, historical, behavioral, public health and political. The present study aims to characterize the leptin gene, its product and its receptors, as well as the mechanisms that corroborate the development of obesity and its involvement with eating disorders. Leptin is a protein secreted mainly in adipocytes, it reduces appetite by inhibiting the formation of appetite-related neuropeptides such as neuropeptide Y and elevates the expression of anorexic neuropeptides such as corticotropin-releasing hormone, so high levels of leptin reduce dietary intake, in contrast to low levels that induce hyperphagia. As leptin performs satiety control and regulation of energy expenditure, the individual with dysfunction in this gene does not develop this function properly. This is due to SNPs, which according to studies increase susceptibility to obesity. Furthermore, leptin may be involved with the pathological process of some eating disorders, predisposing the patient to conditions such as anorexia nervosa and bulimia.

La obesidad es una enfermedad crónica multifactorial que afecta a todas las edades y clases sociales. Esta comorbilidad ha avanzado como resultado de diversos factores y su prevalencia está anclada en diferentes dimensiones, como la biológica, la social, la histórica, la conductual, la salud pública y la política. El objetivo de este estudio es caracterizar el gen de la leptina, su producto y sus receptores, así como los mecanismos que corroboran el desarrollo de la obesidad y su participación en los trastornos alimentarios. La leptina es una proteína secretada principalmente en los adipocitos, reduce el apetito inhibiendo la formación de neuropéptidos relacionados con el apetito, como el neuropéptido Y y eleva la expresión de neuropéptidos anorexógenos, como la hormona que libera la corticotropina, razón por la cual los altos niveles de leptina reducen la ingesta dietética, en contraste con los bajos niveles inducir hiperagia. Como la leptina lleva a cabo el control de la saciedad y la regulación del gasto energético, el individuo con disfunción en este gen no desarrolla esta función correctamente. Esto se debe a los SNP, que según los estudios aumentan la susceptibilidad a la obesidad. Además, la leptina puede estar implicada en el proceso patológico de algunos trastornos alimentarios, predisponiéndose al paciente a condiciones tales como anorexia nerviosa y bulimia.

Cáncer colorrectal. Variantes génicas en la vía de señalización BMP y ancestría en población mexicana / Colorectal cancer. Genetic variants in BMP signaling pathway and ancestry in the Mexican population

Resumen Introducción: Variantes génicas relacionadas con la vía de señalización de las proteínas morfogenéticas óseas (BMP2, BMP4, GREM1, SMAD7) se han asociado a cáncer colorrectal, principalmente en poblaciones caucásicas. Objetivo: Describir la asociación de variantes en miembros de la vía BMP en población mexicana, caracterizada por su ancestría indoamericana y caucásica. Métodos: Se realizó el genotipado de 1000 casos de cáncer colorrectal y 1043 individuos de control reclutados en la Ciudad de México, Monterrey y Torreón mediante la plataforma Sequenom. Con análisis univariados y multivariados se estudiaron las asociaciones entre cáncer colorrectal y variantes. Resultados: Las variantes rs4444235, rs12953717 y rs4939827 replicaron la asociación con la neoplasia (p ≤ 0.05). La ascendencia caucásica mostró asociación con el tumor. Conclusiones: El estudio mostró las asociaciones entre cáncer colorrectal y las variantes SMAD7 y BMP4, así como con el componente caucásico de la mezcla étnica.

Abstract Introduction: Genetic variants related to bone morphogenetic proteins (BMP2, BMP4, GREM1, SMAD7) signaling pathway have been associated with colorectal cancer, mainly in Caucasian populations. Objective: To describe the association of variants in members of the BMP signaling pathway in a Mexican population, characterized by its indigenous American and Caucasian ancestry. Methods: Genotyping of 1,000 colorectal cancer cases and 1,043 control individuals recruited in Mexico City, Monterrey, and Torreón was carried out using the Sequenom platform. Associations between colorectal cancer and variants were studied with univariate and multivariate analyses. Results: Variants rs4444235, rs12953717 and rs4939827 replicated the association with the neoplasm (p ≤ 0.05). Caucasian ancestry showed association with the tumor. Conclusions: The study replicated the associations between colorectal cancer and SMAD7 and BMP4 variants, with an association being observed with the Caucasian component of the ethnic mix.

Variability of PDYN and OPRK1 genes in four argentinian populations and its genetic association with clinical variables related to acute postsurgical pain / Variabilidad de los genes PDYN y OPRK1 en cuatro poblaciones argentinas y su asociación con variables clínicas relacionadas al dolor agudo post-quirúrgico

ABSTRACT Several population studies showed an association between variation in pain sensitivity and genetic polymorphisms located in Prodynorphin (PDYN) and Kappa Opioid Receptor (OPRK1) human genes. We analysed polymorphisms of these two genes to characterise their variation in Argentinian populations, as well as to evaluate their association with acute pain sensitivity. We studied 11 genetic markers in individuals from four locations in Argentina (Ciudad Autónoma de Buenos Aires, La Plata, Resistencia, and Misión Nueva Pompeya), calculated the population parameters, and evaluated the possible association among pain sensitivity, clinical, and genetic variables through a Generalised Estimating Equation model. High linkage disequilibrium was observed in the four populations for both genes, and significant differences were found among frequencies of Argentinian populations and those from other continents reported in the 1000 Genomes Project. Four PDYN gene polymorphisms from 3´ untranslated region and exon 4 showed association with acute pain sensitivity. One genotype of each of these polymorphisms was associated with a higher pain sensitivity, probably related with the activation of the N-methyl-D-aspartate (NMDA) receptors. We found a strong association with acute pain for the following clinical variables: 1) time after surgery, 2) intravenous klosidol supplied every 8 h, and 3) type of incision. Our results highlight the importance of a regional study of genetic variants which influence pain sensitivity and analgesic response.

RESUMEN La asociación entre la sensibilidad al dolor y los polimorfismos que presentan los genes humanos de prodinorfina (PDYN) y receptor opioide kappa (OPRK1) se ha evidenciado en distintos estudios poblacionales. Con el objetivo de caracterizar la variación de estos genes y evaluar su asociación con dolor agudo en la población argentina, analizamos 11 polimorfismos en individuos provenientes de cuatro localidades argentinas (Ciudad Autónoma de Buenos Aires, La Plata, Resistencia, y Misión Nueva Pompeya). Calculamos los parámetros poblacionales y evaluamos la posible asociación entre sensibilidad al dolor, variables clínicas y variables genéticas a través de un modelo de ecuación generalizada de estimación. Se observó alto desequilibrio de ligamiento para ambos genes en las cuatro poblaciones analizadas, y se encontraron diferencias significativas entre las frecuencias de poblaciones argentinas y las reportadas en el Proyecto 1000 Genomes para poblaciones de otros continentes. Cuatro polimorfismos de la región 3´UTR y el exón 4 de PDYN mostraron asociación con la sensibilidad al dolor agudo. En cada uno de estos polimorfismos, un genotipo resultó asociado con alta sensibilidad al dolor, probablemente en relación con la activación de receptores N-metil-D-aspartato (NMDA). Encontramos una fuerte asociación con dolor agudo para las siguientes variables clínicas: 1) tiempo post-cirugía, 2) administración intravenosa de klosidol cada 8 h, y 3) tipo de incisión. Nuestros resultados resaltan la importancia de realizar estudios regionales de variables genéticas que influyen en la sensibilidad al dolor y la respuesta analgésica.

Avances en la genética del síndrome de ovario poliquístico

Introducción: Los primeros estudios realizados en familiares de mujeres con síndrome de ovario poliquístico demostraron un patrón de agregación familiar y por tanto, la posibilidad de un componente genético en su etiopatogenia. Desde entonces, mucho se ha investigado al respecto. Objetivo: Realizar una actualización en las evidencias según la literatura de las bases genéticas del síndrome de ovario poliquístico. Métodos: Se realizó una revisión bibliográfica de los últimos 10 años sobre aspectos de genética en el síndrome de ovario poliquístico en las bases Pubmed, Google Académico, EMBASE y MEDLINE. Conclusiones: Se demostró que en este periodo se ha avanzado en el esclarecimiento y participación de múltiples genes y loci en la patogenia del síndrome. Existe una asociación importante en diferentes poblaciones y etnias del gen DENND1A y TADHA, los cuales se localizan en los cromosomas 9 y 2, respectivamente. Además, se han realizado estudios de asociación del genoma completo (GWAS) que han identificado otros genes en cromosomas como 9q22.32, 11q22.1, 12q13.2, 19p13.3, 16 q12.1, 20q13.2, 12q14.3 (C9orf3, YAP1, RAB5B, INSR, TOX3, SUMO1P1 y HMGA2). Esta revisión permite una actualización del tema y ampliar el conocimiento sobre aspectos relacionados con el origen genético del SOP, así como concluir que el SOP tiene un origen poligénico y es de las denominadas enfermedades complejas(AU)

Introduction: Early studies in relatives of women with polycystic ovary syndrome demonstrated a pattern of familial aggregation and thus the possibility of a genetic component in its etiopathogenesis. Since then, much research has been done on this subject. Objective: To update the evidence according to the literature on the genetic basis of polycystic ovary syndrome. Methods: A literature review of the last 10 years on genetic aspects of polycystic ovary syndrome was performed in Pubmed, Google Scholar, EMBASE and MEDLINE databases. Conclusions: It was shown that in this period progress has been made in the elucidation and involvement of multiple genes and loci in the pathogenesis of the syndrome. There is a significant association in different populations and ethnicities of the DENND1A and TADHA gene, which are located on chromosomes 9 and 2, respectively. In addition, genome-wide association studies (GWAS) have been performed and have identified other genes on chromosomes such as 9q22.32, 11q22.1, 12q13.2, 19p13.3, 16 q12.1, 20q13.2, 12q14.3 (C9orf3, YAP1, RAB5B, INSR, TOX3, SUMO1P1 and HMGA2). This review allows an update of the subject and to expand the knowledge on aspects related to the genetic origin of PCOS, as well as to conclude that PCOS has a polygenic origin and is one of the so-called complex diseases(AU)

Interaction analysis of FTO and IRX3 genes with obesity and related metabolic disorders in an admixed Latin American population: a possible risk increases of body weight excess / Análisis de la interacción entre los genes FTO e IRX3 con obesidad y desórdenes metabólicos relacionados en una población mixta de América Latina: un posible aumento del riesgo de exceso de peso

Abstract Background: Fat Mass and Obesity-related (FTO) has been one of the genes consistently related to common obesity. Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in FTO have been linked with the IRX3 gene. Aim: This study was designed by testing the hypothesis that: i) common SNPs in FTO and IRX3 are associated with obesity and related disorders; ii) there is significant linkage disequilibrium between both genes. Methods: A cross-sectional study was carried out on the Colombian Caribbean Coast. Anthropometric and biochemical variables were measured, and obesity and metabolic disorders were diagnosed. Four SNPs were genotyped: 3 at FTO locus (rs17817449, rs8050136, rs9939609) and one at IRX3 locus (rs3751723). LD between these SNPs was estimated. A logistic regression model was applied to estimate associations. Results: A total of 792 subjects were included. FTO and IRX3 were not in LD (D'≤ 0.03; R2≤ 0.03). TT genotype (rs9939609) was found to be associated with waist circumference (p= 0.04; adj-p= 0.01), and IRX3 SNP with Body Weight Excess (BWE) (OR= 1.06, adj-p= 0.03). One FTO-IRX3 haplotype was associated with BWE (G-A-A-T, rs17817449-rs8050136-rs9939609-rs3751723; OR= 0.67, p= 0.04). The statistical significance of these relations continued after admixture adjustment for a three-hybrid population (p= 0.03). Conclusions: FTO was related to waist circumference, and IRX3 was associated with BWE in Latin American adults. This relation remained statistically significant after an adjustment for sex, age, and genetic ancestry was performed. Despite that these genes were not in LD, findings of a haplotype involving FTO-IRX3 suggest a gene-gene interaction associated with an increased risk of BWE.

Resumen Introducción: FTO (Fat Mass and Obesity-related) se ha relacionado de manera consistente con la obesidad. Recientemente, Polimorfismos de Nucleótido Único (SNP) en este gen se han relacionado con el gen IRX3. Objetivo: Probar la hipótesis de que: i) SNPs en FTO e IRX3 están asociados con la obesidad y trastornos relacionados; ii) existe desequilibrio de ligamiento (LD) significativo entre ambos genes. Métodos: se realizó un estudio transversal en la costa caribe colombiana. Se valoraron variables antropométricas y bioquímicas, la obesidad y trastornos metabólicos. Se genotipificaron 4 SNPs: 3 en FTO (rs17817449, rs8050136, rs9939609) y uno en IRX3 (rs3751723). Se estimó el LD entre estos SNPs. Se aplicó un modelo de regresión logística para estimar asociaciones. Resultados: Se incluyeron 792 sujetos. FTO e IRX3 no se encontraron en LD (D' ≤0.03; R2 ≤0.03). El genotipo TT (rs9939609) se encontró asociado con la circunferencia de la cintura (p= 0.04; adj-p= 0.01), y el SNP IRX3 con el Exceso de Peso (EP) (OR= 1.06, adj-p= 0.03). Se encontró un haplotipo FTO-IRX3 asociado con EP (G-A-A-T, rs17817449-rs8050136-rs9939609-rs3751723; OR= 0.67, p= 0.04). Esta asociación persistió después del ajuste para una población mixta (p= 0.03). Conclusiones: FTO se encontró asociado con la circunferencia de la cintura e IRX3 con EP en adultos latinoamericanos. Estas asociaciones persistieron tras el ajuste por sexo, edad y ascendencia genética. Aunque estos genes no estaban en LD, los hallazgos de un haplotipo entre FTO-IRX3 sugieren una interacción gen-gen asociada con un mayor riesgo de EP.

The relationship between IL-4 polymorphisms and asthma: a systematic review / A relação entre polimorfismos de IL-4 e asma: uma revisão sistemática

Asthma is a chronic and heterogeneous disease of the airways that begins in childhood and persists, in many cases, into adulthood. The disease is the result of environmental, epigenetic and genetic interactions. This work aims to review the polymorphisms described in the literature in the IL-4 gene associated with susceptibility or protection to the development of asthma. This is a systematic literature review, carried out in PubMed, MEDLINE and Science Direct databases in the time frame from 2000 to July 2021, revealing the following key points: IL-4, Polymorphisms and Asthma. The search resulted in 29 articles, all in English. Despite some divergent studies, the SNP rs2243250, which was the most studied in populations from different countries, was also the one that found the most correlations of susceptibility with the disease. It is concluded that although there is controversial data on IL-4 SNPs related to the disease, the association of pangenomic studies has brought a list of genes and their variations associated with the risk of developing asthma, such as the rs2243250 SNP that was well related in populations of several countries analyzed. (AU)

A asma é uma doença crônica e heterogênea das vias aéreas que tem início na infância e persiste em muitos casos até a vida adulta. A doença é resultado de interações ambientais, epigenéticas e genéticas. Este trabalho tem como objetivo revisar sobre os polimorfismos descritos na literatura no gene IL-4 associados à susceptibilidade ou proteção ao desenvolvimento da asma. Trata-se de uma revisão sistemática da literatura, feita nos bancos de dados PubMed, MEDLINE e Science Direct no corte temporal de 2000 a julho de 2021, ressaltando os seguintes pontos-chave: IL-4, Polimorfismos e Asma. A pesquisa resultou em 29 artigos, sendo em sua totalidade em língua inglesa. Apesar de alguns estudos divergentes, o SNP rs2243250, que foi o mais estudado em populações de diversos países, também foi o que mais encontrou correlações de susceptibilidade com a doença. Conclui-se que, apesar de haver dados controversos sobre os SNPs de IL-4 relacionados à doença, a associação dos estudos pangenômicos tem trazido uma lista de genes e variações deles associados com o risco de desenvolver a asma, como o SNP rs2243250 que foi bem relacionado em populações de vários países analisados (AU).

Polimorfismos en genes de reparación del daño al material genético y cáncer de pulmón

RESUMEN Introducción: El cáncer de pulmón es uno de los principales problemas de salud en Cuba y el mundo. Las diferencias genéticas a causa de polimorfismos de un solo nucleótido, son factores importantes involucrados en la susceptibilidad genética a esta enfermedad. En Cuba son escasos los datos disponibles sobre los polimorfismos de un solo nucleótido y su posible influencia sobre la aparición y pronóstico del cáncer. Objetivo: Exponer la importancia del estudio de los polimorfismos de un solo nucleótido en genes de la reparación del daño al ADN en el cáncer de pulmón. Desarrollo: El tabaquismo es el principal factor de riesgo para desarrollar cáncer de pulmón, sin embargo, aproximadamente el 15 % de los fumadores desarrollará la enfermedad. Los polimorfismos de un solo nucleótido son factores involucrados en la predisposición genética a las enfermedades. La presencia de variantes polimórficas puede modificar la eficacia de los sistemas de reparación, favoreciendo la aparición de genotoxicidad y/o mutagénesis. También pueden modificar la respuesta a los tratamientos oncológicos y la supervivencia de los pacientes. Por consiguiente, además de ser marcadores de susceptibilidad, los polimorfismos se consideran marcadores de pronóstico individual de respuesta a la terapia. Este trabajo enfatiza la utilidad de su evaluación como biomarcadores clínicos y de susceptibilidad genética a enfermedades en la población cubana. Conclusiones: El estudio de polimorfismos de un solo nucleótido permitirá el abordaje personalizado de enfermedades oncológicas, lo cual podría contribuir a su detección temprana y a definir grupos de individuos con alto riesgo de padecer cáncer de pulmón.

ABSTRACT Introduction: Lung cancer is one of the main health problems in Cuba and worldwide. Genetic differences due to single nucleotide polymorphisms are important factors involved in the genetic susceptibility to this disease. In Cuba, there are scarce data available on single nucleotide polymorphisms and their possible influence on the incidence and prognosis of cancer. Objective: To expose the importance of the study of single nucleotide polymorphisms in DNA damage repair genes in lung cancer. Results: Smoking is the main risk factor for developing lung cancer, however, approximately 15 % of smokers will develop the disease. Single nucleotide polymorphisms are important factors involved in genetic predisposition to diseases. The presence of polymorphic variants can modify the efficacy of repair systems, favoring the occurrence of genotoxicity and/or mutagenesis. They can also modify the response to oncological treatments and patient´s survival. Therefore, in addition to being susceptibility markers, polymorphisms are considered individual prognostic markers of response to therapy. This work emphasizes the usefulness of evaluating single nucleotide polymorphisms as clinical and susceptibility biomarkers in the Cuban population. Conclusions. The study of single nucleotide polymorphisms will allow a personalized approach to oncological diseases, which could contribute to define groups of individuals at high risk of getting lung cancer, therefore, early disease detection.

Estudo de associação entre polimorfismos genéticos e níveis plasmáticos do VEGF, FLT1, KDR e o risco para depressão / Study of association between genetic polymorphisms and plasma levels of VEGF, FLT1, KDR and the risk for depression

Introdução: a depressão é um transtorno mental comum, grave e incapacitante que afeta mais de 350 milhões de pessoas em todo o mundo. A depressão é caracterizada principalmente por sintomas como tristeza, perda de interesse, diminuição da energia, perda de confiança e autoestima, culpa inadequada, distúrbios do sono e do apetite, pensamentos de morte e suicídio. Além disso, essa patologia também tem um forte impacto na qualidade de vida dos indivíduos afetados e de suas famílias. Sabe-se que fatores genéticos interagem com as condições socioambientais de modo a influenciar a predisposição das pessoas ao adoecimento. Estudos identificaram polimorfismos de nucleotídeos simples (SNPs) que podem ser marcadores genéticos apropriados para prever inflamação sistêmica, por exemplo, e a atual tese teve como foco o efeito de SNPs na via do fator de crescimento endotelial vascular (VEGF). Esta proteína é uma potente molécula angiogênica e está envolvida na neurogênese do hipocampo, uma das principais estruturas límbicas afetadas em pessoas com depressão. O VEGF está implicado em uma das principais teorias que tentam explicar a fisiopatologia deste transtorno mental grave, a teoria neurotrófica, a qual diz que a diminuição ou desregulação da sinalização de neurotrofinas pode contribuir para a manifestação do transtorno depressivo (TD). Objetivo: avaliar se polimorfismos do VEGF e seus receptores, KDR e FLT1, estão associados à depressão e à gravidade dos sintomas, à ideação e tentativas de suicídio, independentemente tanto de um tratamento otimizado quanto da presença de estresse precoce (do inglês, early-life stress, ELS), também verificar se há efeito destes polimorfismos nas concentrações plasmáticas de proteínas expressas pelos seus respectivos genes e observar se existe correlação entre VEGF e seus inibidores, VEGF e s100ß. Metodologia: participaram do presente estudo 160 pacientes com depressão e 114 controles saudáveis. Foram aplicados durante entrevista questionários que avaliaram o perfil clínico dos pacientes como o MINI-International Neuropsychiatric Interview, GRID-HAMD21, CTQ, BSI e foi registrado o número de tentativas de suicídio. Os controles passaram por uma entrevista para serem avaliados quanto aos critérios de inclusão e exclusão do grupo. A genotipagem dos participantes foi realizada através da técnica de Real Time PCR e as mensurações de proteínas por meio do ensaio ensaio imunoenzimático (ELISA). Resultados: indivíduos com depressão, homozigotos AA do polimorfismo rs699947, apresentaram maiores concentrações plasmáticas de VEGF (P-valor= 0.006) e se associaram a um maior número de tentativas de suicídio na análise direta (P-valor= 0.041) e na análise corrigida foi observada uma tendência para a confirmação deste resultado (P-valor= 0.076). O genótipo homozigoto GG do polimorfismo rs7993418 do FLT1 se associou à severidade de sintomas (P-valor= 0.040), bem como uma tendência de associação com um aumento nas tentativas de suicídio e uma maior pontuação na escala que avaliou ideação suicida. Entre os pacientes quanto maior foram as concentrações plasmáticas de VEGF, maior foram as de KDR, FLT1 e s100ß. Conclusão: os resultados sugerem que os polimorfismos da via VEGF estão associados ao número de tentativas de suicídio e severidade dos sintomas depressivos

Introduction: Depression is a common, serious, and disabling mental disorder that affects more than 350 million people worldwide. Depression is mainly characterized by symptoms such as sadness, loss of interest, decreased energy, loss of confidence and self-esteem, inadequate guilt, sleep and appetite disturbances, thoughts of death and suicide. Furthermore, this pathology also has a strong impact on the quality of life of those affected and their families. It is known that genetic factors interact with social and environmental conditions to influence people's predisposition to illness. Studies have identified single nucleotide polymorphisms (SNPs) that may be appropriate genetic markers to predict systemic inflammation, for example, and the current thesis focused on the effect of SNPs on the vascular endothelial growth factor (VEGF) pathway. This protein is a potent angiogenic molecule and is involved in hippocampal neurogenesis, one of the main limbic structures affected in people with depression. VEGF is implicated in one of the main theories that try to explain the pathophysiology of this severe mental disorder, the neurotrophic theory, which says that the decrease or dysregulation of neurotrophin signaling can contribute to the manifestation of depressive disorder (DT). Objective: to assess whether polymorphisms of VEGF and its receptors, KDR and FLT1, are associated with depression and severity of symptoms, suicide ideation and attempts, regardless of both optimal treatment and the presence of early-life stress (ELS) in these associations. also check whether there is an effect of these polymorphisms on the plasma concentrations of proteins expressed by their respective genes and observe whether there is a correlation between VEGF and its inhibitors, VEGF and s100ß. Methodology: 160 patients with depression and 114 healthy controls participated in this study. Questionnaires that assessed the clinical profile of patients, such as the MINI-International Neuropsychiatric Interview, GRID-HAMD21, CTQ, BSI, were applied during interviews, and the number of suicide attempts was recorded. The controls underwent an interview to be evaluated regarding the inclusion and exclusion criteria. The genotyping of the participants was performed using the Real Time PCR technique and protein measurements were performed using the enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Results: individuals with depression, homozygous AA of the rs699947 polymorphism, had higher plasma concentrations of VEGF (P-value = 0.006) and a greater number of suicide attempts in the direct analysis (P-value = 0.041) and in the corrected analysis a trend towards confirmation of this result was observed (P-value = 0.076). The GG genotype of the FLT1 polymorphism rs7993418 was associated with symptom severity (P-value = 0.040), as well as with a trend for association with increase in suicide attempts and a higher score on the scale that evaluated suicidal ideation. The bigger the plasma concentrations of VEGF, the higher were those of KDR, FLT1 and s100ß. Conclusion: the results indicate that VEGF pathway polymorphisms are associated with the number of suicides and severity of depressive symptoms

Polymorphisms and avascular necrosis in patients with sickle cell disease - A systematic review / Polimorfismos e necrose avascular em pacientes com doença falciforme - Uma revisão sistemática

Abstract Objective: To systematically establish whether there is an association between polymorphisms and avascular necrosis in patients with sickle cell disease. Data source: The review, conducted according to PRISMA guidelines and registered with PROSPERO, was based on research of studies in PubMed, SciELO, LILACS, BVS databases and in the gray literature (Google Scholar and Open Gray) published until June 2020. The STROBE initiative was used to analyze the articles' quality. Data synthesis: Ten articles were selected from the databases and two were included through manual search, totaling 12 studies. All samples gathered 2,362 patients. According to STROBE, seven studies fully and/or partially covered more than 70% of the essential items and two studies reached less than 60%, with an overall variation of 86.4-54.5%. The results indicate that polymorphisms in the genes of the bone morphogenetic protein 6 (BMP6), Klotho (KL) and Annexin A2 (ANXA2) may be associated with osteonecrosis in the context of sickle cell disease. Six articles addressed the polymorphism in the MTHFR enzyme gene, but only one found a positive association. Polymorphisms associated with the DARC receptor, the ITGA4 gene, CD36 and thrombophilia protein genes were not associated in any of the studies. Conclusions: The results indicate that the polymorphisms in BMP6, Klotho and ANXA2 genes may be associated with avascular necrosis in patients with sickle cell disease. However, in order to confirm these genetic changes as risk factors, further studies with greater statistical power and methodological rigor are needed.

Resumo Objetivo: Estabelecer, de modo sistemático, se existe associação entre polimorfismos e a necrose avascular em pacientes com doença falciforme. Fontes de dados: A revisão, conduzida segundo as diretrizes Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses (PRISMA) e registrada no International Prospective Register of Systematic Reviews (PROSPERO), foi baseada na busca de estudos nas bases de dados PubMed, Scientific Electronic Library Online (SciELO), Literatura Latino-Americana e do Caribe em Ciências da Saúde (LILACS), Biblioteca Virtual em Saúde (BVS) e na literatura cinza (Google Scholar e Open Gray) até junho de 2020. A análise da qualidade dos artigos foi baseada nos critérios do Strengthening the Reporting of Observational Studies in Epidemiology (STROBE). Síntese dos dados: Dez artigos foram selecionados nas bases de dados e dois incluídos por meio da busca manual, totalizando 12 estudos elencados. As amostras resultaram em 2.362 pacientes incluídos. Com base na iniciativa STROBE, sete estudos atenderam total e/ou parcialmente mais de 70% dos itens essenciais e dois atingiram menos que 60% deles, com variação geral de 86,4-54,5%. Os resultados mostram que os polimorfismos nos genes da proteína morfogenética óssea 6 (BMP6), da Klotho (KL) e da Anexina A2 (ANXA2) podem ter associação com osteonecrose no contexto da doença falciforme. Seis artigos estudaram o polimorfismo no gene da enzima MTHFR, mas apenas um obteve associação positiva. Os polimorfismos associados ao receptor DARC, ao gene ITGA4, ao CD36 e aos genes de proteínas trombofílicas não demonstraram associação em nenhum dos estudos. Conclusões: Os polimorfismos nos genes BMP6, KL e ANXA2 estão possivelmente associados com a necrose avascular em indivíduos com doença falciforme. Entretanto, para a confirmação dessas alterações genéticas como fatores de risco, é necessário que mais estudos com maior poder estatístico e com maior rigor metodológico sejam realizados.

Abordagem da hiperplasia adrenal congênita pela deficiência da enzima 21-hidroxilase em crianças e adolescentes: revisão / Management of congenital adrenal hyperplasia due to 21-hydroxylase deficiency in children and adolescents: review

Objetivo: Descrever o diagnóstico e manejo clínico da deficiência da 21-hidroxilase (D-21OH), no contexto atual de inclusão da doença nos programas de triagem neonatal, bem como características genéticas, fisiopatológicas e manifestações na infância e adolescência. Fonte de Dados: Revisão integrativa realizada nas bases de dados MEDLINE (PubMed), LILACS (BVS), Scopus, Web of Science nos últimos vinte anos, em língua inglesa e portuguesa; população-alvo: crianças da primeira infância à adolescência; com o uso dos termos "triagem neonatal", "hiperplasia adrenal congênita", "deficiência da 21-hidroxilase", "glucocorticoide" e "polimorfismos do gene NR3C1". Síntese de Dados: A hiperplasia adrenal congênita (HAC) constitui um grupo de doenças caracterizadas por deficiências enzimáticas na esteroidogênese do córtex adrenal. A D-21OH é responsável por 95% dos casos e, se não tratada precocemente, pode levar ao óbito no período neonatal em sua forma clássica. A triagem neonatal para a HAC consiste na dosagem do precursor 17-hidroxiprogesterona (17OHP) no sangue de recém-nascidos, permitindo rápida confirmação diagnóstica e instituição da terapêutica. A implantação da triagem neonatal constitui um avanço, mas o controle dos pacientes pediátricos com D-21OH é complexo e deve ser sempre individualizado. Conclusão: A instituição dos programas de triagem neonatal para HAC tem trazido benefícios para o prognóstico das crianças com D-21OH. Seu manejo é multiprofissional, individualizado e ainda um desafio mesmo para o especialista. Ampla divulgação do conhecimento sobre a doença é desejável para permitir melhor condução dessas crianças, especialmente de meninas com a doença que apresentam genitália atípica.

Objective: To describe the diagnosis and clinical management of 21-hydroxylase deficiency (21OH-D), in the current context of including the disease in neonatal screening programs, as well as genetic, pathophysiological characteristics, and manifestations in childhood and adolescence. Data Source: Integrative review performed in MEDLINE (PubMed), LILACS (BVS), Scopus, Web of Science databases in the last twenty years, in English and Portuguese; target population: children from early childhood to adolescence; with the use of the terms "neonatal screening"; "congenital adrenal hyperplasia"; "21-hydroxylase deficiency"; "glucocorticoid"; "polymorphisms of the NR3C1 gene". Data Synthesis: Congenital adrenal hyperplasia (CAH) is a group of diseases characterized by enzyme deficiencies in adrenal cortex steroidogenesis. 21OH-D is responsible for 95% of cases and, if not treated early, can lead to death in the neonatal period in its classic form. Neonatal screening for CAH consists of measuring the precursor 17-hydroxyprogesterone (17OHP) in the blood of newborns, allowing rapid diagnostic confirmation and institution of therapy. The implementation of neonatal screening is an advance, but the control of pediatric patients with 21OH-D is complex and must always be individualized. Conclusion: The institution of newborn screening programs for CAH has benefits for the prognosis of children with 21OH-D. Its management is multi-professional, individualized and still a challenge even for the specialist. Wide dissemination of knowledge about the disease is desirable to allow better management of these children, especially girls with the disease who have atypical genitalia.

The risk of nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate and Vax1 rs7078160 polymorphisms in southern Han Chinese / Risco de fenda labial não sindrômica com ou sem fenda palatina e polimorfismo Vax1 rs7078160 em indivíduos da etnia Han do sul da China

Abstract Introduction: Non-syndromic cleft lip with or without cleft palate is a common worldwide birth defect due to a combination of environmental and genetic factors. Genome-wide association studies reported the rs7078160 of Vax1 is closely related to non-syndromic cleft lip with or without cleft palate in European populations. The following studies showed the same results in Mongolian, Japanese, Filipino, Vietnamese populations etc. However, conflicting research had been reported in Chinese population, Objective: The aim of this study was to investigate the association between the rs7078160 polymorphism and non-syndromic cleft lip with or without cleft palate in Southern Chinese patients. Methods: In this study, we investigated the polymorphism distribution of rs7078160 in 100 complete patient trios (39 patients with non-syndromic cleft lip and palate; 36 patients with non-syndromic cleft lip only; 25 had non-syndromic cleft palate only; and their parents) from Southern ethnic Han Chinese. 60 healthy trios were selected as control. Polymerase chain reaction and Sanger sequencing were used to genotype rs7078160 in Vax1; both case-control and family-based associations were analyzed. Results: The case-control analyses revealed the rs7078160 polymorphism was significant, associated with non-syndromic cleft lip with or without cleft palate (p = 0.04) and non-syndromic cleft lip and palate (p = 0.01), but not associated with non-syndromic cleft lip only and nonsyndromic cleft palate only patients. The genotype composition of rs7078160 comprises mutated homozygous AA, heterozygous AG and wild homozygous GG. Cases with AG + AA genotypes compared with GG homozygotes showed an increased risk of non-syndromic cleft lip with or without cleft palate (p = 0.04, OR = 2.05, 95% CI: 1.01-4.16) and non-syndromic cleft lip and palate (p = 0.01, OR = 3.94, 95% CI: 1.34-11.54). In addition, we did not detect any transmissiondisequilibrium in rs7078160 (p = 0.68). Conclusion: This study suggests that rs7078160 polymorphism is a risk factor of non-syndromic cleft lip with or without cleft palate, and Vax1 is strongly associated with non-syndromic cleft lip with or without cleft palate in Southern Chinese Han populations.

Resumo Introdução: A fenda labial não sindrômica, com ou sem fenda palatina, é um defeito congênito comum em todo o mundo, devido a uma combinação de fatores ambientais e genéticos. O genome-wide association studies relatou que o polimorfismo rs7078160 do Vax1 está intimamente relacionado à fenda labial não sindrômica, com ou sem fenda palatina em populações europeias. Estudos subsequentes mostraram os mesmos resultados nas populações mongol, japonesa, filipina e vietnamita etc. No entanto, pesquisas conflitantes foram relatadas na população chinesa. Objetivo: Investigar a associação entre o polimorfismo rs7078160 e fenda labial não sindrômica, com ou sem fenda palatina, em pacientes do sul da China. Método: Tentamos investigar a distribuição do polimorfismo rs7078160 em 100 trios completos de pacientes (39 pacientes com fenda labial e palatina não sindrômica; 36 pacientes com fenda labial somente, não sindrômica; 25 com fenda palatina somente, não sindrômica e seus pais), da etnia Han do sul da China, e em 60 trios saudáveis selecionados como controle. Reação de polimerase em cadeia e o sequenciamento de Sanger foram uszados para genotipar o polimorfismo rs7078160 do Vax1 e tanto os casos-controle quanto as associações baseadas na família foram analisadas. Resultados: As análises de caso-controle revelaram que o polimorfismo rs7078160 estava significativamente associado a fenda labial não sindrômica, com ou sem fenda palatina (p = 0,04) e fenda labial e palatina não sindrômica (p = 0,01), mas não estava associado a pacientes com fenda labial somente não sindrômica e fenda palatina somente não sindrômica. A composição do genótipo de rs7078160 compreende AA homozigoto mutado, AG heterozigoto e GG homozigoto selvagem. Casos com genótipos AG + AA comparados com GG homozigotos mostraram um risco aumentado de fenda labial não sindrômica, com ou sem fenda palatina (p = 0,04, OR = 2,05, IC de 95%: 1,01 ± 4,16) e fenda labial e palatina não sindrômica (p = 0,01, OR = 3,94, IC 95%: 1,34-11,54). Além disso, não detectamos desequilíbrio de transmissão em rs7078160 (p = 0,68). Conclusão: Este estudo sugere que o polimorfismo rs7078160 foi um fator de risco para fenda labial não sindrômica, com ou sem fenda palatina, e o gene Vax1 está fortemente associado com fenda labial não sindrômica, com ou sem fenda palatina em populações da etnia Han do sul da China.

Association between UGT1A1*28 gene polymorphism and severe neutropenia due to colorectal cancer treatment with irinotecan: evidence based on meta-analysis / Associação entre o polimorfismo do gene UGT1A1*28 e a neutropenia severa decorrente do tratamento do câncer colorretal com irinotecano: evidências baseadas em meta-análise

Abstract Objective The present study aimed to evaluate the relationship between UGT1A1*28 gene polymorphism and the prevalence of neutropenia in patients with colorectal cancer treated with irinotecan. Method Thirteen studies were included. These papers were selected from the Virtual Health Library, Scientific Electronic Library Online, International Health Sciences Literature and PubMed, and their data were collected and evaluated using the BioEstat 5.3 software (BioEstat, Belém, PA, Brazil). Results Three genotypes were analyzed, namely 6/6 (wild type), 6/7, and 7/7. In total, 2,146 patients were included in the present study; of these, 55.6% (n=1,193) had 6/6 genotype, 37.3% (n=801) were heterozygous (6/7), and 7.1% (n=152) had the 7/7 genotype. A total of 1,672 (77.9%) patients displayed mild neutropenia, whereas 474 (22.1%) had severe neutropenia. When contrasting the 6/7 and 7/7 genotypes with the 6/6 genotype using statistical tests for meta-analysis, patients with the 7 allele, either Conclusion The analysis of the UGT1A1*28 gene polymorphism can aid the choice of treatment for patients with colorectal cancer in personalized medicine, increasing the chances of therapeutic success.

Resumo Objetivo Avaliar a relação do polimorfismo do gene UGT1A1*28 com a prevalência de neutropenia em pacientes com câncer colorretal submetidos a tratamento com o irinotecano. Método Foram incluídos 13 estudos sobre o tema proposto, selecionados nas bases de dados da Biblioteca Virtual de Saúde, Scientific Electronic Library Online, International Health Sciences Literature e PubMed.Os dados foramcoletados dos artigos científicos selecionados e avaliados com o auxílio do software BioEstat 5.3 (BioEstat, Belém, PA, Brasil). Resultados Osgenótipos analisados foram6/6 (tipo selvagem), 6/7 e 7/7. Foramincluídos 2.146 pacientes. Destes, 55,6% (n=1.193) apresentaram genótipo 6/6, 37,3% (n=801) eramheterozigotos (6/7) e 7,1%(n=152) tinhamo genótipo 7/7.Umtotal de 1.672 (77,9%) pacientes apresentou neutropenia leve e 474 (22,1%) neutropenia severa. Ao contrastar os genótipos 6/7 e 7/7 como 6/6, percebeu-se, coma execução dos testes estatísticos demetaanálise, que os pacientes como alelo 7, emhomozigose ou heterozigose, tinhammaior risco de desenvolver neutropenia severa que pacientes com o genótipo 6/6 (razão de chances =1,559; intervalo de confiança de 95%=1,163-2,090; p=0,003). Conclusão A análise do polimorfismo do gene UGT1A1*28 pode auxiliar na escolha do tratamento do paciente comcâncer colorretal, no contexto da medicina personalizada, ampliando, assim, as chances de sucesso terapêutico.

Placental SLC38A4 gene polymorphisms 1304 G > A and 292 C > T, and their association with glucose > 95 mg/dL in normal weight full-term healthy newborns / Polimorfismos 1304 G > A y 292 C > T del gen placentario SLC38A4 y su asociación con glucosa > 95 mg/dL en recién nacidos a término, sanos y con peso normal al nacimiento

Abstract Background: The SLC38A4 gene encodes for the SNAT4 protein, which has been related to glucose metabolic alterations in human newborns. This study aimed to determine whether the 1304 G > A and 292 C > T polymorphisms of the SLC38A4 gene are associated with the presence of glucose levels > 95 mg/dL in normal weight full-term healthy newborns. Methods: We conducted a case–control study and analyzed 50 normal weight full-term healthy newborns. Groups were defined based on glucose levels: > 95 mg/dL (cases; n = 13) and < 95 mg/dL (controls; n = 37). The 1304 G > A and 292 C > T polymorphisms of the SLC38A4 gene were determined through quantitative polymerase chain reaction using placental DNA. The association between polymorphism and glucose levels > 95 mg/dL was established using multivariate logistic regression analysis. Results: No significant differences were observed either for gestational age or body weight at birth between groups. In the case group, newborns showed significantly higher homeostatic model assessment for insulin resistance than those in the control group (p < 0.0005). The odds ratio (OR) between the SLC38A4 gene 292 C > T single-nucleotide polymorphism (SNP) and glucose levels > 95 mg/dL was 7.78 (p = 0.024), whereas no significant association was found for the 1304 G > A SNP (OR 1.46; p = 0.77). Conclusions: Our results suggest that the SLC38A4 gene 292 C > T SNP is associated with glucose levels > 95 mg/dL in normal weight full-term healthy newborns.

Resumen Introducción: El gen SLC38A4 codifica la proteína SNAT4, que se ha relacionado con alteraciones en el metabolismo de la glucosa en los humanos. El objetivo de este estudio fue determinar si los polimorfismos 1304 G > A y 292 C > T del gen SLC38A4 se asocian con concentraciones de glucosa > 95 mg/dL en recién nacidos a término Métodos: Se llevó a cabo un estudio de casos y controles con 50 recién nacidos a término, sanos, con peso normal al nacimiento. Los grupos se definieron de acuerdo con las concentraciones de glucosa: > 95 mg/dL (casos; n = 13) y < 95 mg/dL (controles; n = 37). Los polimorfismos 1304 G > A y 292 C > T del gen SLC38A4 se genotipificaron por qPCR utilizando ADN de la placenta. La asociación entre los polimorfismos y la concentración de glucosa > 95 mg/dL se estableció mediante la estimación de la razón de momios (RM) en un análisis múltiple de regresión logística. Resultados: No se observaron diferencias estadísticamente significativas para la edad gestacional y el peso al nacer entre los grupos de estudio. El modelo homeostático para evaluar la resistencia a la insulina (HOMA-IR) fue significativamente más alto en los recién nacidos del grupo de casos que en el grupo control (p < 0.0005). La RM mostró asociación significativa entre el polimorfismo de nucleótido único (SNP) 292 C > T del gen SLC38A4 y la concentración de glucosa > 95 mg/dL (RM: 7.78; p = 0.024); el SNP 1304 G > A no mostró asociación significativa (RM: 1.46; p = 0.77). Conclusiones: Los resultados de este estudio sugieren que el SNP 292 C > T del gen SLC38A4 se asocia con concentraciones de glucosa > 95 mg/dL en recién nacidos a término.