What is the proper way to apply the multiple comparison test? / 대한마취과학회지

Multiple comparisons tests (MCTs) are performed several times on the mean of experimental conditions. When the null hypothesis is rejected in a validation, MCTs are performed when certain experimental conditions have a statistically significant mean difference or there is a specific aspect between the group means. A problem occurs if the error rate increases while multiple hypothesis tests are performed simultaneously. Consequently, in an MCT, it is necessary to control the error rate to an appropriate level. In this paper, we discuss how to test multiple hypotheses simultaneously while limiting type I error rate, which is caused by α inflation. To choose the appropriate test, we must maintain the balance between statistical power and type I error rate. If the test is too conservative, a type I error is not likely to occur. However, concurrently, the test may have insufficient power resulted in increased probability of type II error occurrence. Most researchers may hope to find the best way of adjusting the type I error rate to discriminate the real differences between observed data without wasting too much statistical power. It is expected that this paper will help researchers understand the differences between MCTs and apply them appropriately.

Influence of urban area on the water quality of the Campo River basin, Paraná State, Brazil / Influência da área urbana na qualidade das águas na Bacia do Rio do Campo River, estado do Paraná, Brasil

The Campo River basin is located on the third plateau of the Paraná State or trap plateau of Paraná, at the middle portion between the rivers Ivaí and Piquiri, southern Brazil, between the coordinates 23° 53 and 24° 10’ South Latitude and 52° 15’ and 52° 31’ West Longitude. The basin has 384 Km² area, being 247 km2 in the municipality of Campo Mourão and 137 km2 in the municipality of Peabiru, in Paraná State. The Campo River is a left bank tributary of the Mourão River, which flows into the Ivaí River. The objective of this study was to monitor water quality in the Km 119 River and the Campo River, tributaries of the Mourão River, with monthly collection of water samples to determine pH, temperature, turbidity, biochemical oxygen demand, dissolved oxygen, fecal coliforms, total solids, total nitrogen, ammoniacal nitrogen, nitrite, nitrate and total phosphorus. The results obtained were compared with the indices established by the environmental legislation and applied in the determination of the Water Quality Index (WQI) used by the Water Institute of Paraná State, regulating environmental agency. Poor water quality in these rivers presents a worrying scenario for the region, since this river is the main source of water supply for the public system. Results of organic matter, fecal coliforms and total phosphorus were higher than the limits established by Resolution CONAMA 357/2005 to river class 2, specially at downstream of the Km 119 River and the Campo River, due to the significant influence of the urban anthropic activity by the lack of tertiary treatment and also rural by the lack of basic sanitation in this area. Results of WQI of Km 119 River and do Campo River indicated that water quality can be classified as average in 71% and good in 29% of the sites evaluated.

Resumo A Bacia Hidrográfica Rio do Campo está situada no terceiro planalto paranaense, na porção média entre os rios Ivaí e Piquiri, Sul do Brasil, entre as coordenadas 23° 53’ e 24°10’ de Latitude Sul e 52°15’ e 52°31’ de Longitude Oeste. A bacia ocupa área de 384 Km2, sendo 247 km2 no município de Campo Mourão e 137 km2 no município de Peabiru, no estado do Paraná. O Rio do Campo é um afluente da margem esquerda do Rio Mourão, que deságua no Rio Ivaí. O objetivo deste trabalho foi monitorar a qualidade da água do rio Km 119 e rio do Campo, afluentes do Rio Mourão, com coletas mensais de amostras de água para determinação do pH, temperatura, turbidez, demanda bioquímica de oxigênio, oxigênio dissolvido, coliformes fecais, sólidos totais, nitrogênio total, nitrogênio amoniacal, nitrito, nitrato e fósforo total. Os resultados obtidos foram comparados aos limites estabelecidos na legislação ambiental vigente para poluentes na água e aplicados na determinação do Índice de Qualidade das Águas (IQA) usado pelo Instituto das Águas do Paraná, órgão ambiental fiscalizador. A má qualidade observada nestes rios é preocupante para a região que usufruiu destas águas como principal fonte de abastecimento público. Resultados de matéria orgânica, coliformes totais e fósforo total extrapolaram os padrões estabelecidos na Resolução CONAMA 357/2005 para rio classe 2, especialmente à jusante do rio Km 119 e do Rio do Campo, devido à influência significativa da atividade antrópica urbana pela falta de tratamento terciário e rural pela falta de saneamento básico nesta área. Os resultados do IQA do Rio Km 119 e Rio do Campo indicam que as águas podem ser classificadas com qualidade média em 71% e boa em 29% nos pontos avaliados.

Influence of urban area on the water quality of the Campo River basin, Paraná State, Brazil

The Campo River basin is located on the third plateau of the Paraná State or trap plateau of Paraná, at the middle portion between the rivers Ivaí and Piquiri, southern Brazil, between the coordinates 23° 53 and 24° 10 South Latitude and 52° 15 and 52° 31 West Longitude. The basin has 384 Km² area, being 247 km2 in the municipality of Campo Mourão and 137 km2 in the municipality of Peabiru, in Paraná State. The Campo River is a left bank tributary of the Mourão River, which flows into the Ivaí River. The objective of this study was to monitor water quality in the Km 119 River and the Campo River, tributaries of the Mourão River, with monthly collection of water samples to determine pH, temperature, turbidity, biochemical oxygen demand, dissolved oxygen, fecal coliforms, total solids, total nitrogen, ammoniacal nitrogen, nitrite, nitrate and total phosphorus. The results obtained were compared with the indices established by the environmental legislation and applied in the determination of the Water Quality Index (WQI) used by the Water Institute of Paraná State, regulating environmental agency. Poor water quality in these rivers presents a worrying scenario for the region, since this river is the main source of water supply for the public system. Results of organic matter, fecal coliforms and total phosphorus were higher than the limits established by Resolution CONAMA 357/2005 to river class 2, specially at downstream of the Km 119 River and the Campo River, due to the significant influence of the urban anthropic activity by the lack of tertiary treatment and also rural by the lack of basic sanitation in this area. Results of WQI of Km 119 River and do Campo River indicated that water quality can be classified as average in 71% and good in 29% of the sites evaluated.

Resumo A Bacia Hidrográfica Rio do Campo está situada no terceiro planalto paranaense, na porção média entre os rios Ivaí e Piquiri, Sul do Brasil, entre as coordenadas 23° 53 e 24°10 de Latitude Sul e 52°15 e 52°31 de Longitude Oeste. A bacia ocupa área de 384 Km2, sendo 247 km2 no município de Campo Mourão e 137 km2 no município de Peabiru, no estado do Paraná. O Rio do Campo é um afluente da margem esquerda do Rio Mourão, que deságua no Rio Ivaí. O objetivo deste trabalho foi monitorar a qualidade da água do rio Km 119 e rio do Campo, afluentes do Rio Mourão, com coletas mensais de amostras de água para determinação do pH, temperatura, turbidez, demanda bioquímica de oxigênio, oxigênio dissolvido, coliformes fecais, sólidos totais, nitrogênio total, nitrogênio amoniacal, nitrito, nitrato e fósforo total. Os resultados obtidos foram comparados aos limites estabelecidos na legislação ambiental vigente para poluentes na água e aplicados na determinação do Índice de Qualidade das Águas (IQA) usado pelo Instituto das Águas do Paraná, órgão ambiental fiscalizador. A má qualidade observada nestes rios é preocupante para a região que usufruiu destas águas como principal fonte de abastecimento público. Resultados de matéria orgânica, coliformes totais e fósforo total extrapolaram os padrões estabelecidos na Resolução CONAMA 357/2005 para rio classe 2, especialmente à jusante do rio Km 119 e do Rio do Campo, devido à influência significativa da atividade antrópica urbana pela falta de tratamento terciário e rural pela falta de saneamento básico nesta área. Os resultados do IQA do Rio Km 119 e Rio do Campo indicam que as águas podem ser classificadas com qualidade média em 71% e boa em 29% nos pontos avaliados.

Lukasiewicz logic based Fuzzy similarity classifier for Denver group chromosomal classification / Utilizando lógica de Lukasiewicz baseada em similaridade Fuzzy na classificação de cromossomos do tipo Denver group

This paper proposes a novel P1-weighted Lukasiewicz Logic based Fuzzy Similarity Classifier for classifying Denver Group of chromosomes and compares its performance with the other classifiers under study. A chromosome is classified to one of the seven groups from A to G, based on the Denver System of classification of chromosomes. Chromosomes within a particular Denver Group are difficult to identify, possessing almost identical characteristics for the extracted features. This work evaluates the performance of supervised classifiers including Naive Bayes, Support Vector Machine with Gaussian Kernel (SVM), Multilayer perceptron (MLP) and a novel, unsupervised, P1-weighted Lukasiewicz Logic based Fuzzy Similarity Classifier, in classifying the Denver Group of chromosomes. A fundamental review on fuzzy similarity based classification is presented. Experimental results clearly demonstrates that the proposed P1-weighted Lukasiewicz Logic based Fuzzy Similarity Classifier using the generalized Minkowski mean metric, produces the best classification results, almost identical to the Ground Truth values. One-way Analysis of Variance (ANOVA) at 95% and 99% level of confidence and Tukey's post-hoc analysis is performed to validate the selection of the classifier. The proposed P1-weighted Lukasiewicz Logic based Fuzzy Similarity Classifier gives the most promising classification results and can be applied to any large scale biomedical data and other applications.

Este trabalho propõe uma nova lógica P1pondera de Lukasiewicz de acordo com o classificador de similarida fuzzy para classificar cromossomas do Grupo Denver e compara o seu desempenho com os outros classificadores em estudo. Um cromossoma é classificado com um dos sete grupos de A a G, com base no Sistema de Denver de classificação de cromossomos. Cromossomos dentro de um grupo de Denver particular são difíceis de identificar, com características quase idênticas para os recursos extraídos. Este trabalho avalia o desempenho de classificadores supervisionados, incluindo Naive Bayes, Support Vector Machine com Gaussian Kernel (SVM), perceptron multicamadas (MLP) e um novo classificador sem supervisão, P1-weighted, lógica de Lukasiewicz de acordo com o classificador de similaridade Fuzzy para a classificação do Grupo Denver de cromossomos . Apresenta-se ma revisão fundamentada na classificação de acordo com similaridade difusa. Resultados experimentais demonstram claramente que Classificador Similaridade Fuzzy proposto de acordo com a lógica de Lukasiewicz P1-weighted usando a médica métrica de Minkowski para produz melhores resultados de classificação. Estes valores foram muito similares aos valores de Ground Truth . Análise de variancia (ANOVA) com 95% de grau de confiança e análise post-hoc de Tukey 99% foram realizadas para validar a seleção do classificador. Este classificador P1-weighted de lógica de Lukasiewicz está de acordo com o classificador de similaridade difusa oferecendo resultados declassificação mais promissoras. Portanto, podendo ser aplicado a dados biomédicos em larga escala além de outras aplicações.