Prevalencia de la resistencia a macrólidos y aminoglucósidos en los complejos Mycobacterium avium y M. abscessus y en Mycobacterium chelonae identificados en el Laboratorio Nacional de Referencia de Colombia entre el 2018 y el 2022 / Prevalence of resistance to macrolides and aminoglycosides in Mycobacterium avium, M. abscessus, and M. chelonae identified in the Laboratorio Nacional de Referencia of Colombia from 2018 to 2022

Resumen Introducción. Mycobacterium chelonae y los complejos Mycobacterium avium y M. abscessus, son agentes patógenos emergentes causantes de micobacteriosis. El tratamiento de esta infección depende de la especie y la subespecie identificadas. Los fármacos de elección son los macrólidos y aminoglucósidos, contra los cuales se ha reportado resistencia; por esta razón, el determinar el perfil de sensibilidad le permite al médico tratante comprender mejor el pronóstico y la evolución de estas infecciones. Objetivo. Describir los perfiles de sensibilidad ante macrólidos y aminoglucósidos, de los cultivos identificados como complejo Mycobacterium avium, complejo M. abscessus o especie M. chelonae, en el Laboratorio Nacional de Referencia de Micobacterias durante los años 2018 a 2022. Materiales y métodos. Se llevó a cabo un estudio descriptivo del perfil de sensibilidad a macrólidos y aminoglucósidos, de los cultivos identificados como complejo M. avium, complejo M. abscessus o M. chelonae, mediante la metodología GenoType® NTM-DR. Resultados. Los cultivos del complejo M. avium fueron 159 (47,3 %), de los cuales, 154 (96,9 %) fueron sensibles y 5 (3,1 %) resistentes a los macrólidos; todos fueron sensibles a los aminoglucósidos. Del complejo M. abscessus se estudiaron 125 (37,2 %) cultivos, 68 (54,4 %) resultaron sensibles y 57 (45,6 %) resistentes a los macrólidos; solo un cultivo (0,8 %) fue resistente a los aminoglucósidos. De M. chelonae se analizaron 52 cultivos (15,5 %), todos sensibles a los macrólidos y aminoglucósidos. Conclusiones. En las tres especies de micobacterias estudiadas, la resistencia contra la amikacina fue la menos frecuente. La identificación de las subespecies y los perfiles de sensibilidad permiten instaurar esquemas de tratamiento adecuados, especialmente en las micobacteriosis causadas por M. abscessus.

Abstract Introduction. The Mycobacterium chelonae species and the M. avium and M. abscessus complexes are emerging pathogens that cause mycobacteriosis. Treatment depends on the species and subspecies identified. The drugs of choice are macrolides and aminoglycosides. However, due to the resistance identified to these drugs, determining the microbe's sensitivity profile will allow clinicians to improve the understanding of the prognosis and evolution of these pathologies. Objective. To describe the macrolide and aminoglycoside susceptibility profile of cultures identified by Colombia's Laboratorio Nacional de Referencia de Mycobacteria from 2018 to 2022, as Mycobacterium avium complex, M. abscessus complex, and M. chelonae Materials and methods. This descriptive study exposes the susceptibility profile to macrolides and aminoglycosides of cultures identified as M. avium complex, M. abscessus complex, and M. chelonae using the GenoType® NTM-DR method. Results. We identified 159 (47.3 %) cultures as M. avium complex, of which 154 (96.9 %) were sensitive to macrolides, and 5 (3.1 %) were resistant; all were sensitive to aminoglycosides. From the 125 (37.2 %) cultures identified as M. abscessus complex, 68 (54.4 %) were sensitive to macrolides, 57 (45.6 %) were resistant to aminoglycosides, and just one (0.8 %) showed resistance to aminoglycosides. The 52 cultures (15.5 %) identified as M. chelonae were sensitive to macrolides and aminoglycosides. Conclusions. The three studied species of mycobacteria have the least resistance to Amikacin. Subspecies identification and their susceptibility profiles allow the establishment of appropriate treatment schemes, especially against M. abscessus.

Enfermedad pulmonar por Mycobacterium intracellulare, un reto diagnóstico. Reporte de caso / Lung disease due to Mycobacterium intracellulare. A diagnostic challenge, Case report

La incidencia de infección por micobacterias no tuberculosas (MNT) y el número de casos han ido en aumento, especialmente en mujeres y personas mayores, teniendo en los Estados Unidos entre el 2008 y 2015 una incidencia de 4.16 a 6.69 por 100000 entre las mujeres y de 12.70 a 18.37 por 100000, entre los mayores de 65 años. "Los pacientes con compromiso estructural del parénquima pulmonar, antecedente de inmunosupresión o inmunodeficiencia tienen mayor riesgo de desarrollar infección por MNT". Sin embargo, se han presentado informes de pacientes inmunocompetentes en asociación con opacidades nodulares y bronquiectasias. Se trata de una mujer de 79 años con antecedente de tuberculosis pulmonar documentada en dos oportunidades: último proceso infeccioso en el año 2021. Recibió manejo por seis meses de esquema vigente con tetraconjugado. Actualmente acude a consulta con cuadro clínico de más de seis meses de evolución dados por pérdida de peso de más del 10 % en un año, disnea a moderados esfuerzos y tos con expectoración purulenta. Al examen físico se encontró índice de masa corporal (IMC) bajo, tórax hipoexpansible con estertores tipo crépitos en ambos hemitórax. En la tomografía de tórax se evidenciaron bronquiectasias generalizadas, algunas áreas de árbol en gemación y lesiones cavitadas. Se consideró la realización de fibrobroncoscopia con lavado broncoalveolar documentándose baciloscopias negativas, con cultivo positivo para micobacteria no tuberculosa. Se solicitó tipificación de micobacterias con coloración de Kinyoun, y pruebas bioquímicas a partir de cepas de cultivo del lavado broncoalveolar, con reporte positivo para Mycobacterium intracellulare. Se inició por lo tanto manejo con azitromicina 500 mg, rifampicina 600 mg y etambutol 975 mg diarios. Los profesionales sanitarios deben ser conscientes de la posible infección por MNT sobre todo existiendo afectación estructural pulmonar previa, basando el tratamiento en la sospecha clínica y/o las circunstancias epidemiológicas.

The incidence of non-tuberculous mycobacterial (NTM) infection and the number of cases have been increasing, especially in women and the elderly, having EE. Between 2008 and 2015 an incidence of 4.16 to 6.69 per 100,000 among women and from 12.70 to 18.37 per 100,000 among those over 65. "Patients with structural involvement of the pulmonary parenchyma, history of immunosuppression or immunodeficiency have a higher risk of developing NTM infection". However, immunocompetent patients have been reported in association with nodular opacities and bronchiectasis. This is a 79-year-old woman with a history of pulmonary tuberculosis documented on 2 occasions: the last infectious process in 2021. It received management for 6 months of the current tetraconjugate schema. He is currently in consultation with a clinical picture of more than 6 months of evolution given by weight loss of more than 10% in a year, dyspnea to moderate efforts and cough with purulent expectoration. Physical examination revealed low body mass index (BMI) and, a hypoexpandable thorax with a crescent-like sternum in both hemithorax. Chest tomography revealed widespread bronchiectasis, some groaning tree areas and cavitated lesions. Bronchoscopy fibro bronchoscopy with bronchoalveolar lavage has been reported negative bacilloscopies, positive culture for non-tuberculosis mycobacteria. Mycobacteria typing, Kinyoun coloration, and biochemical tests were requested from bronchoalveolar lavage culture strains with positive reports for Mycobacterium intracellulare. Management was therefore initiated with azithromycin 500 mg, rifampin 600 mg and ethambutol 975mg daily. Healthcare professionals should be aware of possible NTM infection especially existing prior lung structural involvement based on clinical suspicion and/or epidemiological circumstances.

Identificación de Mycobacteria no pigmenteda de crecimiento rápido por el Método Molecular de Micobacterium de Genotipo CM / Identification of Fast-Growing Non-Pigmented Mycobacteria by the Genotype® Mycobacterium CM Molecular Method

Introducción: la micobacteria no terberculosa (NTM) forma un grupo heterogéneo de microorganismos que pueden causar infección en humanos. Las micobacterias no pigmentadas de rápido crecimiento (MNPCR) son de interés clínico debido al creciente número de pacientes infectados por ellos y a la dificultad del tratamiento. Dentro de este grupo, Mycobacterium fortuitum, Mycobacterium abscessus y Mycobacterium chelonae son reconocidos como patógenos potenciales; estas especies se han aislado de infecciones pulmonares y extrapulmonares. Objetivo: el objetivo de este trabajo es encontrar la frecuencia de aislamiento de especies micobacterianas de rápido crecimiento, específicamente el complejo Mycobacterium fortuitum, de muestras clínicas utilizando la técnica molecular de diagnóstico GenoType Mycobacterium CM. Material y Método: se analizaron 249 aislados de micobacterias no tuberculosas obtenidas de muestras pulmonares y extrapulmonares de pacientes sintomáticos en el período enero 2018-diciembre de 2022. La técnica molecular GenoType Mycobacterium CM se utilizó para identificar la especie. Resultados: Se obtuvieron 77 (3,9%) aislados de especies no pigmentadas de rápido crecimiento, estas se identificaron en orden decreciente: Mycobacterium fortuitum 65 (84,41%), Mycobacterium abcessus 9 (11,68%) y Mycobacterium chelonae 3 (4%). Conclusiones: los resultados reafirman que el complejo Mycobacterium fortuitum es responsable de la mayoría de las infecciones causadas por la micobacteria en rápido crecimiento en humanos. La técnica diagnóstica GenoType Mycobacterium CM es una herramienta útil para la rápida identificación de micobacterias; proporciona resultados precisos en menos tiempo, acortando significativamente el tiempo diagnóstico, permite la aplicación temprana de tratamiento específico, evitando así la propagación de la infección.

Introduction: non-tuberculous mycobacteria (NTM) form a heterogeneous group of mi-croorganisms that can cause infection in humans. Fast-growing non-pigmented my-cobacteria (MNPCR) are of clinical interest due to the increasing number of patients infected by them and the difficulty of treatment. Within this group, Mycobacterium fortuitum, Mycobacterium abscessus and Mycobacterium chelonae are recognized as potential pathogens; these species have been isolated from both pulmonary and ex-trapulmonary infections. Objective: the objective of this work is to find the frequency of isolation of fast-growing non-pigmented mycobacterial species, specifically the Myco-bacterium fortuitum complex, from clinical samples using the GenoType® Mycobacteri-um CM diagnostic molecular technique. Material and Method: 249 isolates of non-tu-berculous mycobacteria obtained from pulmonary and extrapulmonary samples from symptomatic patients in the period January 2018-December 2022 were analyzed. The G e n oTy p e® Mycobacterium CM molecular technique was used to identify the species. Results: 77 (30.9%) isolates of fast-growing non-pigmented species were obtained, these were identified in decreasing order: Mycobacterium fortuitum 65 (84.41%), Myco-bacterium abcessus 9 (11.68%) and Mycobacterium chelonae 3 (4%). Conclusions: the results reaffirm that the Mycobacterium fortuitum complex is responsible for most in-fections caused by fast-growing mycobacteria in humans. The GenoType® Mycobacte-riumCM diagnostic technique is a useful tool for the rapid identification of mycobacte-ria; it provides accurate results in less time, significantly shortening the diagnostic time, it allows the early application of specific treatment, thus avoiding the spread of infec-tion.

Micobacteriosis atípica post mesoterapia / Atypical mycobacteriosis post mesotherapy

Resumen La utilización de procedimientos estéticos que mejoren la imagen corporal está en constante crecimiento, y también las infecciones asociadas a ellos, como las micobacteriosis atípicas. La meso terapia es un procedimiento mínimamente invasivo que consiste en la aplicación de sustancias que buscan estimular la dermis y el tejido celular subcutáneo, para el tratamiento de la celulitis y el rejuvenecimiento de la piel. Reportamos un caso de infección micobacteriana posterior a una mesoterapia en glúteos y muslos que se presentó como abscesos subcutáneos, que respondieron satisfactoriamente al tratamiento antibiótico prolonga do con claritromicina y trimetoprima-sulfametoxazol. Se han informado infecciones asociadas a mesoterapia en España, América Latina y el Caribe, que tendrían posiblemente un origen común: la falta de controles sanitarios. Destacamos la importancia de estar alertados sobre estas complicaciones infecciosas y la necesidad de reforzar las medidas de seguridad necesarias para evitarlas.

Abstract The use of aesthetic procedures that improve body image is constantly growing, as well as infections associated with them, such as atypical mycobacteriosis. Mesotherapy is a minimally invasive aesthetic procedure that consists of the application of substances that seek to stimulate the dermis and subcutaneous cellular tissue, for the treatment of cellulite and skin rejuvenation. We report a case of mycobacterial infection after mesotherapy in the buttocks and thighs that appeared as subcutaneous abscesses, they responded satisfactorily to prolonged antibiotic treatment with clarithromycin and trimethoprim-sulfamethoxazole. Infections associated with mesotherapy have been reported in Spain, Latin America and the Caribbean, all possibly related to lack of health controls. We emphasize the importance of being aware of these infectious complications and the need to reinforce the necessary security measures to avoid them.

Escrofuloderma en paciente pediátrico / Scrofuloderma in a pediatric patient

La tuberculosis (TB) cutánea es una forma rara de tuberculosis extrapulmonar y puede tener diversas manifestaciones clínicas. La afectación cutánea puede producirse como resultado de inoculación exógena, diseminación contigua desde un foco de infección, o mediante la propagación hematógena desde un foco distante 1. Las formas multibacilares de localización cutánea siguen siendo, con mucho, las más comunes en los niños 2. La tuberculosis cutánea representa sólo el 1-2% de las formas extrapulmonares de TB. Se clasifica en varias variantes, y la escrofulodermia es una forma de tuberculosis endógena. Afecta a personas de todas las edades, sin embargo, los niños, los adolescentes y los ancianos se ven muy afectados, debido a la incapacidad inmunológica para contener la infección por micobacterias. La escrofulodermia puede presentarse de forma aislada o coexistir con formas pulmonares y diseminadas de TB. Se presenta como nódulos eritematosos que se fistulizan y descargan material caseoso y purulento 3. Los exámenes patológicos revelan abscesos, necrosis y granulomas de tipo tuberculoide (3). La correlación clínica, biológica, patológica y, a veces, la progresión con el tratamiento antibacilar son la clave del diagnóstico 2

Cutaneous tuberculosis (TB) is a rare form of extrapulmonary tuberculosis that can have diverse clinical manifestations. Cutaneous involvement may occur as a result of exogenous inoculation, contiguous dissemination from a focus of infection, or by hematogenous spread from a distant focus (1). Multibacillary forms of cutaneous localization remain by far the most common in children (2). Children and the elderly are greatly affected due to immunological inability to contain the mycobacterial infection. Scrofuloderma can occur in isolation or coexist with pulmonary and disseminated forms of TB. It presents with erythematous nodules that fistulize and discharge caseous and purulent material (3). Anatomopathological examinations reveal abscesses, necrosis and tuberculoid granulomas (3). Clinical, biological, pathological correlation and sometimes progression with antibacillary treatment are the key to diagnosis (2)

Levantamento epidemiológico dos casos de tuberculose no Brasil e ações alternativas para auxiliar no tratamento / Epidemiological survey of tuberculosis cases in Brazil and alternative actions to aid in treatment / Estudio epidemiológico de los casos de tuberculosis en Brasil y acciones alternativas para ayudar al tratamiento

tuberculose é uma das doenças infectocontagiosas de maior importância no Brasil e no mundo. Afeta de forma importante populações em situação de vulnerabilidade social e econômica. O objetivo deste estudo foi realizar um levantamento do número de casos notificados de tuberculose no Brasil nos últimos 10 anos (2011 a 2021), avaliar os fatores que afetam a transmissão, bem como discutir o tratamento padrão e com fitoterápicos. O levantamento epidemiológico dos casos de tuberculose no Brasil de janeiro de 2011 a dezembro de 2021 foi realizado dentre os notificados pelo Sistema de Informação de Agravos de Notificação (SINAN). Os resultados indicaram um aumento linear de casos a partir de 2017 com 90.776 casos diagnosticados, em 2018 (94.720) e 2019 (96.655). Acredita-se que o aumento linear da tuberculose neste período pode estar relacionado principalmente com o aumento da pobreza, contudo o compartilhamento de utensílios durante o uso de narguilé podem representar fatores de risco para tuberculose. Seis plantas medicinais afetam diretamente as micobactérias (Chenopodium ambrosioides, Tetradenia riparia, Physalis angulata, Origanum vulgare, Eucalyptus globulus, Mikania glomerata) e cinco plantas com atividade antibacteriana auxiliam no trato respiratório (Nasturtium officinale, Allium sativum, Schinus terebinthifolius, Adiantum capillus-veneris, Allium cepa). Contudo, a tuberculose é uma doença reemergente sendo necessária a adoção de políticas públicas que intensifiquem e implementem medidas sócio-educativas para a implantação do uso de fitoterápicos como medida complementar.

Tuberculosis is one of the most important infectious diseases in Brazil and worldwide. It significantly affects populations in situations of social and economic vulnerability. This study aimed to survey the number of reported tuberculosis cases in Brazil in the last 10 years (2011 to 2021) to assess the factors that affect the transmission and discuss standard and herbal treatments. The epidemiological survey of tuberculosis cases in Brazil from January 2011 to December 2021 was carried out among those notified by the Notifiable Diseases Information System (SINAN). The results indicated a linear increase in cases from 2017, with 90,776 diagnosed cases, in 2018 (94,720) and 2019 (96,655). It is believed that the linear increase in tuberculosis in this period may be mainly related to the increase in poverty. However, the sharing of utensils during the use of hookah may represent risk factors for tuberculosis. Six medicinal plants directly affect mycobacteria (Chenopodium ambrosioides, Tetradenia riparia, Physalis angulata, Origanum vulgare, Eucalyptus globulus, Mikania glomerata), and five plants with antibacterial activity help in the respiratory tract (Nasturtium officinale, Allium sativum, Schinus terebinthifolius, Adiantum capillus-veneris, Allium cepa). However, tuberculosis is a re-emerging disease, and it is necessary to adopt public policies that intensify and implement socio-educational measures for using herbal medicines as a complementary measure.

La tuberculosis es una de las enfermedades infecciosas más importantes en Brasil y en el mundo. Afecta significativamente a las poblaciones en situación de vulnerabilidad social y económica. El objetivo de este estudio fue realizar una encuesta sobre el número de casos notificados de tuberculosis en Brasil en los últimos 10 años (2011 a 2021), para evaluar los factores que afectan a la transmisión, así como para discutir el tratamiento estándar y con fitoterapias. La encuesta epidemiológica de los casos de tuberculosis en Brasil desde enero de 2011 hasta diciembre de 2021 se realizó entre los notificados por el Sistema de Informação de Agravos de Notificação (SINAN). Los resultados indicaron un aumento lineal de casos desde 2017 con 90.776 casos diagnosticados, en 2018 (94.720) y 2019 (96.655). Se cree que el aumento lineal de la tuberculosis en este periodo puede estar relacionado principalmente con el aumento de la pobreza, aunque el hecho de compartir los utensilios durante el uso de la shisha puede representar factores de riesgo para la tuberculosis. Seis plantas medicinales afectan directamente a las micobacterias (Chenopodium ambrosioides, Tetradenia riparia, Physalis angulata, Origanum vulgare, Eucalyptus globulus, Mikania glomerata) y cinco plantas con actividad antibacteriana ayudan a las vías respiratorias (Nasturtium officinale, Allium sativum, Schinus terebinthifolius, Adiantum capillus-veneris, Allium cepa). Sin embargo, la tuberculosis es una enfermedad reemergente siendo necesaria la adopción de políticas públicas que intensifiquen e implementen medidas socioeducativas para la implementación del uso de fitoterápicos como medida complementaria.

Eventos de precipitación extrema aumentan la circulación de patógenos infecciosos: detección de rotavirus, norovirus, astrovirus, adenovirus entérico y micobacterias no tuberculosas en agua de las inundaciones en Asunción, Paraguay, año 2014

Las precipitaciones extremas representan uno de los eventos naturales climáticos más importantes y pueden originar inundaciones devastadoras. De junio a agosto del 2014 se registró una de las más graves inundaciones en la historia de la ciudad de Asunción. Ocasionó un incremento considerable del nivel del río Paraguay y el desplazamiento de 300.000 personas a campamentos provisionales. Debido a que el contacto directo con el agua de inundación, el consumo de agua contaminada y la congregación de los afectados en refugios provisorios son factores de riesgo para enfermedades infecciosas, el objetivo de este estudio fue la implementación de una metodología estandarizada para la concentración y detección de virus entéricos y micobacterias no tuberculosas, por PCR en tiempo real y PCR-asociada al análisis de restricción enzimática (PRA), en muestras de agua de inundaciones y el reporte de los patógenos detectados en las zonas afectadas de Asunción y en la Bahía del Río Paraguay. La metodología propuesta demostró poseer buena sensibilidad y se registró la presencia de rotavirus, norovirus (genogrupos I y II), astrovirus, adenovirus entéricos y micobacterias no tuberculosas en 50% (N=4/8) de las muestras de los barrios Sajonia, San Jerónimo y Ricardo Brugada, Chacarita. Además, reportamos datos secundarios de casos de enfermedades infecciosas, registrados en los servicios de salud de los barrios afectados durante el periodo de inundación.

Extreme rainfall represents one of the most important natural climatic events and can cause devastating floods. From June to August 2014, one of the most serious floods in the history of the city of Asunción was recorded. It caused a considerable increase in the level of the Paraguay River and the displacement of 300,000 people to temporary camps. Since direct contact with flood water, consumption of contaminated water and the congregation of those affected in temporary shelters are risk factors for infectious diseases, the objective of this study was the implementation of a standardized methodology for the concentration and detection of enteric viruses and non-tuberculous mycobacteria, by real-time PCR and PCR-associated enzyme restriction analysis (PRA), in samples of flood water and the report of the pathogens detected in the affected areas of Asunción and in the Bay of the Paraguay River. The proposed methodology proved to have good sensitivity and the presence of rotavirus, norovirus (genogroups I and II), astrovirus, enteric adenovirus and non-tuberculous mycobacteria was recorded in 50% (N=4/8) of the samples from the Sajonia, San Jeronimo and Ricardo Brugada, Chacarita neighborhoods. In addition, we report secondary data on cases of infectious diseases, registered in the health services of the affected neighborhoods during the flood period.

Contribución del uso de XPERT MTB/RIF y su costo-efectividad en el diagnóstico de tuberculosis pulmonar y la resistencia a rifampicina: una comparación con métodos diagnósticos no moleculares / Contribution of the use of xpert MTB/RIF and its cost-effectiveness in the diagnosis of pulmonary tuberculosis and resistance to rifampicin: a comparison with non molecular diagnostic methods

Resumen Introducción: La tuberculosis es un problema de salud pública; su control requiere diagnóstico temprano y tratamiento oportuno. Xpert MTB/RIF® es una tecno logía diagnóstica basada en PCR en tiempo real, detecta el Complejo Mycobacterium tuberculosis y la susceptibilidad a rifampicina. Objetivo: Determinar la contribución del Xpert MTB/RIF y su costo-efectividad en la detección de tuberculosis y la resistencia a rifampicina en muestras respirato rias al compararlo con métodos de diagnóstico no moleculares Materiales y Métodos: Se analizaron 1.574 muestras de pacientes con sospecha de tuberculosis pulmonar que fueron procesadas para microscopía con coloración fluorescente de auramina-rodamina, Xpert MTB/RIF y cultivo en BACTEC MGIT 960. Los resultados obtenidos se compararon entre los métodos no moleculares y los moleculares para la detección de M. tuberculosis y susceptibilidad a rifampicina y se realizó un análisis comparativo de costos y costo efectividad. Resultados: 19,2% de las muestras fueron positivas por alguna de las técnicas usadas. Xpert MTB/RIF detectó M. tuberculosis en 90,4% del total de muestras positivas con un índice Kappa de 0,77 (IC95%: 0,74-0,82) comparado con el cultivo. La resistencia a rifampicina por Xpert fue 8,1%, sensibilidad 94,1% (IC95%: 73,0-99,0%), especificidad 98,4% (IC95%: 95,5-99,5%) y Kappa de 0,88 (IC95%: 0,76-1,00). La razón incremental de costo efectividad (RICE) fue menor en Xpert MTB/RIF comparada con el cultivo. Conclusión: Xpert MTB/RIF es una prueba eficiente y costo efectiva en la detección de casos de M. tuberculosis en muestras pulmonares comparado con los mé todos de diagnóstico basados en cultivo, sin embargo y a diferencia del Xpert MTB/RIF, estos pueden aportar en el diagnóstico con el aislamiento de especies de micobacterias no tuberculosas y la susceptibilidad a isoniazida y otros medicamentos.

Abstract Introduction: Tuberculosis is a public health problem its control requires early diagnosis and timely treatment. Xpert MTB/RIF is a real-time PCR based diagnostic technology, detects the Mycobacterium tuberculosis complex and rifampicin resistance. Objective: To determine the contribution of Xpert MTB/RIF and its cost-effectiveness in the detection of potential positive cases for tuberculosis and resistance to rifampicin in respiratory samples comparatively with diagnostic non molecular methods Materials and Methods: From 2013 to 2015, 1.574 clinical samples of patients with suspected pulmonary tuberculosis were evaluated by smear microscopy using auramina-rodamina stain, Xpert and culture in liquid medium BACTEC MGIT 960®. Results: 19,2% of the samples were positive for any of the methods used, Xpert detected M. tuberculosis in 90,4% of the positive samples and the concordance between Xpert and cultures had a Kappa index of 0,71 (IC95%: 0,62-0,72). Xpert identified resistance to rifampicin in 8,1% of the clinical samples studied with a sensitivity 94.1% (IC95%: 73,0-99,0%), specificity 98,4% (IC95%: 95,5-99,5%) and Kappa index 0,88 (IC95%: 0,76-1,00). Xpert had an incremental cost effectiveness ratio lower than culture (RICE). Conclusion: Xpert MTB/Rif is efficient diagnostic technique and comparable with culture in cost effectiveness for pulmonary tuberculosis diagnosis. However, culture based methods, in contrast to Xpert, may allow the isolation and identification of non tuberculosis mycobacterial species and the possibility to perform susceptibility for other antituberculous drugs.

Queratitis por Mycobaterium abscessus: comunicación del primer caso en Paraguay / Keratitis due to Mycobaterium abscessus: first case report in Paraguay

Resumen Se presenta un caso clínico de queratitis por Mycobacterium abscessus en una mujer de 76 años, residente en la ciudad de Asunción, sin traumatismo ni cirugía ocular previa y con antecedente de una queratouveitis herpética. Por tratarse de una queratitis causada por un agente etiológico poco frecuente y por la importancia de un diagnóstico correcto y oportuno para la instauración del tratamiento adecuado, se comunica el primer caso de queratitis por micobacterias en Paraguay.

Abstract We present a clinical case of keratitis caused by M. abscessus in a 76-year-old female patient, resident in the city of Asunción, without trauma or previous ocular surgery and with a history of herpetic keratouveitis. Because it is a keratitis caused by a rare etiological agent and because of the importance of a correct and timely diagnosis for the establishment of appropriate treatment, the present case is reported, the first of Mycobacteria keratitis in Paraguay.

Effect of coexisting advanced extrapulmonary solid cancer on progression of Mycobacterium avium complex lung disease / Efeito da coexistência de câncer sólido extrapulmonar avançado na progressão da doença pulmonar por complexo Mycobacterium avium

ABSTRACT Objective: Although Mycobacterium avium complex (MAC) lung disease has been shown to be associated with lung cancer and hematologic malignancies, there have been few studies of its relationships with other types of cancer. The aim of this study was to assess the effect that coexisting advanced extrapulmonary solid tumors have on the progression of MAC lung disease. Methods: This was a retrospective study of patients diagnosed with MAC lung disease, on the basis of the American Thoracic Society (ATS) criteria, between October of 2005 and March of 2019. The patients were divided into three groups: those with advanced-stage cancer (A-SC group); those with early-stage cancer (E-SC group); and those without cancer (control group). Progression of MAC lung disease was defined as exacerbation seen on imaging. Patient characteristics and the time to progression were compared among the three groups. Results: A total of 286 patients met the ATS diagnostic criteria for MAC lung disease, and 128 of those were excluded. Of the remaining 158 patients, 20 (7.0%) were in the A-SC group, 36 (12.6%) were in the E-SC group, and 102 (35.7%) were in the control group. The median time to progression in the A-SC, E-SC, and control groups was 432, 3,595, and 2,829 days, respectively (p < 0.01). A proportional hazards model showed that the significant predictors of MAC lung disease progression were advanced-stage cancer (hazard ratio [HR] = 6.096; 95% CI: 2.688-13.826; p < 0.01), cavitary lesions (HR = 2.750; 95% CI: 1.306-5.791; p < 0.01), and a high Nodule-Infiltration-Cavity-Ectasis score (HR = 1.046; 95% CI: 1.004-1.091; p = 0.033). Conclusions: A coexisting advanced extrapulmonary solid tumor could hasten the progression of MAC lung disease.

RESUMO Objetivo: Embora tenha sido demonstrado que a doença pulmonar por Mycobacterium avium complex (MAC, complexo M. avium) está associada a câncer de pulmão e neoplasias hematológicas, há poucos estudos sobre sua relação com outros tipos de câncer. O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito da coexistência de tumores sólidos extrapulmonares avançados na progressão da doença pulmonar por MAC. Métodos: Estudo retrospectivo de pacientes diagnosticados com doença pulmonar por MAC, segundo os critérios da American Thoracic Society (ATS), entre outubro de 2005 e março de 2019. Os pacientes foram divididos em três grupos: grupo câncer em estágio avançado (grupo CEA), grupo câncer em estágio inicial (grupo CEI) e grupo sem câncer (grupo controle). Progressão da doença pulmonar por MAC foi definida como exacerbação observada em exame de imagem. As características dos pacientes e o tempo para progressão foram comparados entre os três grupos. Resultados: Um total de 286 pacientes preencheu os critérios diagnósticos da ATS para doença pulmonar por MAC, sendo 128 deles excluídos. Dos 158 pacientes restantes, 20 (7,0%) eram do grupo CEA, 36 (12,6%), do grupo CEI e 102 (35,7%), do grupo controle. A mediana de tempo para progressão nos grupos CEA, CEI e controle foi de 432, 3.595 e 2.829 dias, respectivamente (p < 0,01). Um modelo de riscos proporcionais demonstrou que os preditores significativos de progressão da doença pulmonar por MAC foram câncer em estágio avançado (razão de risco [RR] = 6,096; 95%IC: 2,688-13,826; p < 0,01), lesões cavitárias (RR = 2,750; 95%IC: 1,306-5,791; p < 0,01) e pontuação alta no sistema Nódulo-Infiltração-Cavidade-Ectasia (RR = 1,046; 95%IC: 1,004-1,091; p = 0,033). Conclusões: A coexistência de tumor sólido extrapulmonar avançado poderia acelerar a progressão da doença pulmonar por MAC.

Diagnóstico microbiológico en lavado broncoalveolar. Revisión de la literatura / Microbiological diagnosis in bronchoalveolar lavage. Literature review

El lavado broncoalveolar (LBA) se describió hace aproximadamente 50 años, y desde ese momento se ha venido empleando cada vez con más frecuencia, llegando a ser uno de los métodos de elección para hacer el diagnóstico microbiológico de las infecciones respiratorias bajas, pues facilita la identificación de patógenos oportunistas y no oportunistas. Su uso se incrementó paralelamente con el número de pacientes inmunocomprometidos, sobre todo a causa del SIDA y los trasplantes, situaciones en las que con frecuencia los pacientes padecen infecciones pulmonares por gérmenes oportunistas. El LBA es un procedimiento seguro que permite obtener muestras que aportan información amplia de las características celulares y microbiológicas del tracto respiratorio inferior. Para garantizar su utilidad es fundamental que la recolección, transporte, almacenamiento y procesamiento de las muestras sean óptimos. El análisis de las muestras se hace por técnicas convencionales para identificación de microorganismos, como son las tinciones y el aislamiento en medios de cultivo, y por otros métodos tales como la inmunofluorescencia, pruebas inmunológicas para la detección de antígenos y anticuerpos, y pruebas de biología molecular. En la presente revisión, se hace una actualización sobre el procedimiento de obtención, almacenamiento y transporte de las muestras de LBA, así como de las técnicas de diagnóstico microbiológico más utilizadas para identificar los principales agentes infecciosos asociados con enfermedades del tracto respiratorio inferior

Bronchoalveolar lavage (BAL) was described approximately 50 years ago and since then it has been used with increasing frequency, becoming one of the methods of choice for making the microbiological diagnosis of lower respiratory infections, as it facilitates the identification of opportunistic and non-opportunistic pathogens. Its use increased in parallel with the number of immunocompromised patients, especially due to AIDS and transplantation, situations in which patients frequently suffer from lung infections due to opportunistic germs. BAL is a safe procedure that allows obtaining samples that provide comprehensive information on the cellular and microbiological characteristics of the lower respiratory tract. Optimal collection, transport, storage and processing of samples is essential to guarantee its usefulness. Analysis of the samples is done both by conventional techniques for the identification of microorganisms, such as staining and isolation in culture media, as well as by other methods such as immunofluorescence, immunological tests for the detection of antigens and antibodies, and molecular biology assays. In this review, an update in presented on the procedure for obtaining, storing and transporting BAL samples, as well as on the most widely used microbiological diagnostic techniques to identify the main infectious agents associated with lower respiratory tract diseases

Comportamiento clínico de la infección y enfermedad causada por micobacterias no tuberculosas en Latinoamérica: Revisión de alcance / Clinical behavior of infection and disease caused by non-tuberculous mycobacteria in Latin America: scoping review

Cada vez son más frecuentes los reportes de aislamientos y enfermedades producidas por micobacterias no tuberculosas (MNT). Esta revisión de alcance describe el comportamiento epidemiológico y clínico de la infección y enfermedad por MNT en Latinoamérica. Se realizó la búsqueda en las bases de datos MEDLINE vía OVID, Embase y LILACS. Después de la depuración, se incluyeron 44 artículos que representaron una población global de 2826 sujetos, a quienes se les diagnosticó infección y enfermedad por MNT; la mayoría de las investigaciones incluyeron sujetos de Brasil y Colombia (75%); los estudios transversales fueron los más frecuentes (36,6%), el sexo masculino fue el más afectado (61,3%), mientras que la mediana de edad fue 40,1 años. En 37 artículos se reportó enfermedad por MNT, siendo la localización extrapulmonar (54%) la más frecuente; las principales comorbilidades fueron las enfermedades pulmonares, VIH/sida, fibrosis quística, diabetes y desnutrición, reportadas en 13 estudios; en 15 artículos se reportó tuberculosis previa al evento por MNT. En 12 artículos se evidenciaron procedimientos estéticos; en tres, procedimientos clínicos previos. Se reportó variedad de especies de MNT, siendo Mycobacterium avium (52%), M. abscessus (34%), M. chelonae (18%), M. fortuitum (16%) y M. kansasii (9,1%) las más frecuentes. El método más usado para diagnosticar e identificar la enfermedad por MNT fue el cultivo, recientemente se agregaron también las pruebas moleculares. La literatura científica latinoamericana sobre la infección/enfermedad por MNT es escasa. Es apremiante conducir estudios de frecuencia e impacto clínico y fortalecer la capacidad diagnóstica y las redes de organizaciones existentes enfocadas al estudio de micobacterias para conocer la verdadera morbimortalidad asociada a las MNT en Latinoamérica.

Reports of infection and/or disease caused by non-tuberculous mycobacteria (NTM) are becoming increasingly frequent. This scope review describes the epidemiological and clinical trend of infection/disease caused by NTM in Latin America. OVID MEDLINE, Embase and LILACS databases were explored for relevant articles. After filtering, we included 44 articles, representing an overall population of 2,826 subjects diagnosed with NTM infection and disease; the majority of the publications included subjects from Brazil and Colombia (75%), cross-sectional studies were the most common (36.6%), most subjects were male (61.3%) and the median age of subjects was 40.1 years. Disease by NTM was reported in 37 publications, extrapulmonary presentation was the most frequent (54%), main comorbidities were other pulmonary diseases, HIV, cystic fibrosis, diabetes and malnutrition, as reported in 13 studies; tuberculosis diagnosis previous to NTM disease was reported in 15 articles. Aesthetic procedures were reported in 12 articles while clinical procedures were reported in 3 articles. Several NTM species were reported, being Mycobacterium avium (52%), M. abscessus (34%), M. chelonae (18%), M. fortuitum (16%) and M. kansasii (9.1%) the most frequent. Culture and molecular testing were the main methods for diagnosis and identification. Scientific literature on NTM from Latin American countries is scarce. There is an urgent need to conduct studies on the frequency and clinical impact of NTM infections, in order to accurately identify the current morbidity and mortality associated with NTM in Latin American. It is also important to strengthen the local diagnostic capacity and the existing networks focused on studying NTM.

Coinfección por Mycobacterium abscessus y Mycobacterium tuberculosis en un paciente con síndrome de Cushing exógeno y otras comorbilidades / Mycobacterium abscessus and Mycobacterium tuberculosis coinfection in a patient with exogenous Cushing syndrome and other comorbilities

RESUMEN Mycobacterium abscessus es una micobacteria no tuberculosa de crecimiento rápido, que produce infección pulmonar, cutánea, diseminada y otras, sobre todo en pacientes con comorbilidades. El diagnóstico se basa en la identificación de la micobacteria por medios de cultivo o por pruebas moleculares. El tratamiento con macrólidos y amikacina continúa siendo el ideal, aunque depende de la localización y de la gravedad de la infección, sin embargo, se han identificado genes de resistencia en algunas subespecies que limitan la eficacia antibiótica. Presentamos el caso de un paciente con coinfección cutánea por Mycobacterium abscessus y Mycobacterium tuberculosis, quien presenta un síndrome de Cushing exógeno, factor predisponente para estas infecciones. Además, se identificaron hidatidosis y aspergilosis pulmonares. El tratamiento antituberculoso del paciente se ajustó para manejar ambas micobacterias, y su evolución fue favorable.

ABSTRACT Mycobacterium abscessus is a fast-growing non-tuberculous mycobacterium that causes lung, skin, disseminated and other infections, mainly in patients with comorbidities. The diagnosis is based on the identification of the mycobacterium by culture media or molecular tests. Treatment with macrolides and amikacin remains the optimal choice, although it depends on the location and severity of the infection; however, resistance genes have been identified in some subspecies that limit antibiotic efficacy. We present the case of a patient with cutaneous coinfection by Mycobacterium abscessus and Mycobacterium tuberculosis, who presented exogenous Cushing syndrome, a predisposing factor for these infections. In addition, hydatidosis and pulmonary aspergillosis were identified. The patient's anti-tuberculosis treatment was adjusted to manage both mycobacteria, resulting in a favorable evolution.

Piauí Central Laboratory of Public Health: frequency of mycobacterial species and epidemiological aspects, 2014-2015 / Laboratorio Central de Salud Pública de Piauí: frecuencia de especies micobacterianas y aspectos epidemiológicos, 2014-2015 / Laboratório Central de Saúde Pública do Piauí: frequência de espécies de micobactérias e aspectos epidemiológicos, 2014-2015

Background and Objectives: Knowledge about species diversity of non-tuberculous mycobacteria (NTM) and the frequency of tuberculosis (TB) is an important issue in rural-urban regions such as Piauí (northeast of Brazil), of low incidence rate of TB , can help to improve diagnosis and prevention strategies. The aim of this study is to examine some epidemiological aspects and the frequency of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) and NTM isolated at the central public health reference laboratory, Dr. Costa Alvarenga, Piauí (LACEN-PI). Methods: Data records of all mycobacterosis and tuberculosis cases from January 2014 to March 2015 were analyzed. Results : Of the 20% (142/706) positive growths, 70% (99) were Mtb and 10% NTM. The remainde was of inadequate clinical samples, not allowing the identification of even the suspected NTM. The most frequent clinical form was pulmonary with TB patients younger than those infected with NTM (p = 0.001), the majority living in Teresina (52%). NTMs identified were M. abscessus (36%), M. avium, M. intracellulare, Mycobacterium sp. (14% each) and M. asiaticum, M. szulgai, M. kansasii 7% (each). Mtb drug resistance (7.8%) and TB co-infection with the human immunodeficiency virus (HIV-TB) found to be high (49%, 19/39). Conclusion: The frequencies of Mtb infection, drug resistance and HIV-TB co-infection are still underestimated and failures in the identification of NTM may decrease the actual frequency of these infections. Therefore, there is a need for improvements in TB control and in the diagnosis of NTMs in Piauí.(AU)

Justificativa e Objetivos: O conhecimento da diversidade de espécies de micobactérias não tuberculosas (MNT ) e a frequência da tuberculose (TB) é uma questão importante em regiões rurais-urbanas como o Piauí (nordeste do Brasil), com baixa incidência de TB, pode ajudar a melhorar o diagnóstico e estratégias de prevenção. O objetivo deste estudo é examinar alguns aspectos epidemiológicos e a frequência de Mycobacterium tuberculosis (Mtb) e MNT isolados, no Laboratório Central de Referência em Saúde Pública, Dr. Costa Alvarenga, Piauí (LACEN-PI). Métodos: Dados de todo s os casos de micobacterioses e tuberculose de janeiro de 2014 a março de 2015 foram analisados. Resultados: Dos 20% (142/706), de amostras com crescimento positivo 70% (99) foram Mtb e 10% MNT . O restante era de amostras clínicas inadequadas, não permitindo a identificação inclusive de MNT suspeitos. A forma clínica mais frequente foi pulmonar com pacientes TB mais jovens do que os infectados com MNT (p = 0,001), a maioria morando em Teresina (52%). As MNT s identificadas foram M. abscessus (36%), M. avium , M. intracellulare , M. sp. (14%, cada) e M. asiaticum, M. szulgai , M. kansasii 7% (cada). A droga resistência de Mtb (7,8%) e a co-infecção TB e vírus da imunodeficiência humana (HIV-TB) mostraram-se altas (49%, 19/39).Conclusão: As frequências de infecção por Mtb, de resistência a medicamentos e co-infecção HIV-TB ainda são subestimadas e as falhas na identificação de MNT podem diminuir a real frequência destas infecções . Portanto, há necessidade de melhorias no controle da TB e no diagnóstico de MNT s no Piauí.(AU)

Justificacion y objetivos: Conocer la diversidad de especies de micobacterias no tuberculosas (MNT) y la frecuencia de tuberculosis (TB) es tema importante en regiones rurales-urbanas como Piauí (noreste de Brasil) con baja tasa de incidencia de TB, y puede ayudar a mejorar el diagnóstico y las estrategias de prevenció. El objetivo de este estudio es examinar algunos aspectos epidemiológicos y la frecuencia de Mycobacterium tuberculosis (Mtb) y MNT aislado, en el laboratorio central de referencia de salud pública, Dr. Costa Alvarenga, Piauí (LACEN-PI). Métodos: Se analizaron los datos de todos los casos de micobacteriosis de enero de 2014 a marzo de 2015. Resultados: Del 20% (142/706), de las muestras con crecimiento positivo el 70% (99) fueron Mtb y el 10% MNT. El resto fue de muestras clínicas inadecuadas, no permitiendo la identificación de MNT incluso sospechosas. La forma clínica más frecuente fue la pulmonar y los pacientes con TB eran más jóvenes que los infectados con MNT (p = 0.001), la mayoría viviendo en Teresina (52%).Los MNT identificados fueron M.abscessus (36%), M.avium, M.intracellulare, Mycobacterium sp. (14% cada) y M.asiaticum, M.szulgai, M.kansasii 7% (cada ). La resistencia a los medicamentos de Mtb (7,8%) y la coinfección de TB y el virus de la inmunodeficiencia humana (VIH-TB) fueron altas (49%, 19/39 )Conclusión: Las frecuencias aún subestimadas de resistencia a los medicamentos, coinfección por VIH-TB y fallas de identificaciónidentificación de MNT pueden disminuir la frecuencia real de estas infecciones. Consecuentemente, es necesario mejorar el control y diagnóstico de TB y MNT en Piauí.(AU)

Identificación de especies de micobacterias mediante espectrometría de masas (MALDI-TOF) / Identification of mycobacteria species through mass spectrometry (MALDI-TOF)

Resumen Introducción: Las enfermedades producidas por micobacterias son de gran importancia clínica y epidemiológica presentando el complejo Mycobacterium tuberculosis (MTBc) una morbi-mortalidad mayor que la producida por micobacterias no tuberculosas (MNTB). La identificación tradicional está basada en sus características fenotípicas mediante procesos laboriosos e incapaces en algunos casos de distinguir entre especies. Actualmente, la mayoría de las técnicas utilizadas se basan en métodos moleculares que tienen alta veracidad, pero son complejas y de alto costo. La espectrometría de masas con desorción/ionización láser asistida por una matriz asociada a tiempo de vuelo (MALDI-TOF MS) se basa en la comparación del espectro proteico producido con respecto al de una base de datos de referencia. Objetivo: Evaluar el rendimiento de MALDI-TOF MS en la identificación de micobacterias comparado con métodos moleculares: Material y Métodos: Se analizaron 28 aislados de nueve especies distintas mediante MALDI-TOF MS. Resultados: Se identificó correctamente 78,5% de las aislados (22/28), concordante en 100% (9/9) de MNTB de crecimiento rápido, 60% (9/15) en las MNTB de crecimiento lento y 100% (4/4) de MTBc. Todas las especies no identificadas (6/6) pertenecen al complejo M. avium/intracellulare. Conclusión: MALDI-TOD MS es una metodología rápida, fácil y de bajo costo, con adecuada veracidad respecto a los métodos moleculares.

Abstract Background: Mycobacterial diseases are very important both clinically and epidemiologically. Mycobacterium tuberculosis complex (MTBc) infections confer higher morbidity and mortality rate than non-tuberculous mycobacteria (NTM) infections. Traditional species identification techniques are based on phenotypic characteristics which take a long time by laborious processes and in occasions are no conclusive. Currently, most used techniques are based on molecular methods, which are accurate but are expensive and complex. Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) is a simple, cheap and fast identification method based on comparing protein spectra with a reference database. Aim: To assess the performance of MALDI-TOF MS in the identification of MTBc and NTM, compared with molecular methods. Methods: For that purpose, 28 isolates of 9 different species were analyzed through MALDI-TOF MS. Results: 78.5% (22/28) of isolates were correctly identified, 100% (9/9) of rapidly growers NTM, 60% (9/15) of slow growing NTM and 100% (4/4) of MTBc. Every unidentified isolate (6/6) corresponded to M. avium/intracellulare complex. Conclusion: MALDI-TOF MS is fast, simple and cheaper than molecular methods and also has adequate accuracy.

Enfermedad pulmonar por Mycobacterium intracellulare en una paciente inmunocompetente: reporte de un caso en el Perú / Pulmonary disease by mycobacterium intracellulare in an immunocompetent patient: Report of a case in Peru

RESUMEN Presentamos una paciente inmunocompetente cuya enfermedad comenzó a los 49 años con tos, seguida de esputo purulento y hemoptoico, por lo que se diagnosticó bronquiectasias. Tres años después, luego de hemoptisis, le practicaron segmentectomía medial del lóbulo medio y quedó asintomática por meses. Al encontrarse tuberculosis en el informe de patología fue tratada con 4HREZ2R2H2. Cinco años después su BK fue 2+ recibiendo un nuevo esquema de 4HREZ2R2H2, con lo que no logro negativizar declarándose el fracaso al tratamiento. Al hallar en la genotipificación de su cultivo Mycobacterium intracellulare, la paciente recibió azitromicina, moxifloxacina y etambutol, hubo mejoría, pero abandonó el tratamiento a los ocho meses; lo reinició 18 meses después, junto con tratamiento para la depresión y el reflujo gastroesofágico. Al mes la paciente estuvo asintomática, pero hizo reacción dérmica a la moxifloxacina y se la reemplazó por amikacina. Salió de alta y al año estuvo curada, a los 64 años de edad.

ABSTRACT We present the case of an immunocompetent patient whose illness began at age 49 with a cough, followed by purulent and hemoptoic sputum; bronchiectasis was diagnosed. Three years later, after hemoptysis, she underwent medial segmentectomy of the middle lobe and was asymptomatic for months. When tuberculosis was found in the pathology report, she was treated with 4HREZ2R2H2. Five years later her BK was 2+, thus receiving a new scheme of 4HREZ2R2H2, which did not succeed in obtaining negative results and the treatment was declared as a failure. After genotyping her Mycobacterium intracellulare culture, the patient received azithromycin, moxifloxacin and ethambutol. There was improvement, but she abandoned the treatment at 8 months; she restarted it 18 months later, along with treatment for depression and gastroesophageal reflux. After one month the patient was asymptomatic, but she had a dermal reaction to moxifloxacin which was replaced with amikacin. One year later, she was cured and discharged, at the age of 64.

Identificación de especies micobacterianas ambientales u oportunistas en pacientes sintomáticos y con VIH/sida / Identification of environmental or opportunistic mycobacterial species in symptomatic symptomatic and HIV/AIDS patients

El aumento de las infecciones por micobacterias ambientales u oportunistas (MAO) coincide mundialmente con el declive de la infección tuberculosa e incremento de la infección por el virus de inmunodeficiencia humana (VIH). El presente trabajo es un estudio retrospectivo realizado en el Laboratorio Nacional de Referencia-Investigaciones de Tuberculosis/Micobacterias/Lepra (LNRI-TB/Lepra/Micobacterias), del Instituto de Medicina Tropical Pedro Kourí (IPK), La Habana, Cuba, durante el período enero 2014-diciembre 2018. El objetivo de nuestro estudio fue conocer la variabilidad de especies aisladas para establecer un referente actualizado sobre las infecciones causadas por estas. En este trabajo se clasificaron-identificaron 413 cepas procedentes de pacientes sintomáticos; 162 (39.22%) eran aislamientos de pacientes con VIH/sida atendidos en nuestro Hospital Nacional de Referencia a Atención al paciente VIH/sida (IPK), y el resto (n = 251 [60.77%]), procedentes de pacientes inmunocompetentes, incluyendo aislamientos recibidos de los Centros Provinciales de Higiene, Epidemiología, y Microbiología (CPHEM). Las muestras fueron analizadas con las técnicas convencionales establecidas: las pulmonares fueron descontaminadas por el método de Petroff modificado; las extrapulmonares, por el método del ácido sulfúrico al 4%; el cultivo se realizó en medio de Löwenstein-Jensen modificado. Posteriormente se realizó la clasificación-identificación de especies según el esquema fenotípico-bioquímico establecido. Las especies con mayor porcentaje de aislamiento pertenecieron a los Grupos III y IV, complejo Mycobacterium avium-intracellulare (34.14%) y complejo M. fortuitum (20.82%), respectivamente. Estos resultados permitirán conocer la prevalencia de estas especies en nuestro país, reafirmando la importancia diagnóstica de estos microorganismos para aplicar tratamiento específico, sobre todo en pacientes con factores de riesgo, en quienes es más probable la diseminación de la infección.

The increase in infections by environmental or opportunistic mycobacteria (MAO) coincides worldwide with the decline in tuberculosis infection and an increase in infection by the human immunodeficiency virus (HIV). The present work is a retrospective study carried out at the National Reference Laboratory-Tuberculosis/Mycobacterial/Leprosy Research (LNRI-TB / Leprosy / Mycobacteria), of the Pedro Kourí Institute of Tropical Medicine (IPK), La Habana, Cuba, during the period January 2014-December 2018. The objective of our study was to know the variability of isolated species to establish an updated reference on the infections caused by MAO. In this study, 413 strains from symptomatic patients were classified and identified; 162 (39.22%) were isolates from patients with HIV/AIDS treated at our National Hospital of Reference for Attention to HIV/AIDS patients (IPK), and the remaining (n=251 [60.77%]), from immunocompetent patients, including isolates received from the Provincial Centers of Hygiene, Epidemiology, and Microbiology (CPHEM). The samples were analyzed with the established conventional techniques: the lung samples were decontaminated by the modified Petroff method; the extrapulmonary, by the 4% sulfuric acid method; the culture was carried out in modified Löwenstein-Jensen medium. Subsequently, the classification-identification of species was carried out according to the established phenotypic-biochemical scheme. The species with the highest percentage of isolation belonged to Groups III and IV, Mycobacterium avium-intracellulare complex (34.14%), and M. fortuitum complex (20.82%), respectively. These results will allow us to know the prevalence of these species in our country, emphasizing the diagnostic importance of these microorganisms and thus apply a specific treatment, especially in patients with risk factors, in whom the spread of the infection is more likely

Nontuberculous mycobacteria in patients with suspected tuberculosis and the genetic diversity of Mycobacterium avium in the extreme south of Brazil / Micobactérias não tuberculosas em pacientes com suspeita de tuberculose e a diversidade genética de Mycobacterium avium no extremo sul do Brasil

ABSTRACT Objective: Nontuberculous mycobacteria (NTM) are a heterogeneous group of bacteria that are widely distributed in nature and associated with opportunistic infections in humans. The aims of this study were to identify NTM in patients with suspected tuberculosis who presented positive cultures and to evaluate the genetic diversity of strains identified as Mycobacterium avium. Methods: We studied pulmonary and extrapulmonary samples obtained from 1,248 patients. The samples that tested positive on culture and negative for the M. tuberculosis complex by molecular identification techniques were evaluated by detection of the hsp65 and rpoB genes and sequencing of conserved fragments of these genes. All strains identified as M. avium were genotyped using the eight-locus mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem-repeat method. Results: We found that NTM accounted for 25 (7.5%) of the 332 mycobacteria isolated. Of those 25, 18 (72%) were M. avium, 5 (20%) were M. abscessus, 1 (4%) was M. gastri, and 1 (4%) was M. kansasii. The 18 M. avium strains showed high diversity, only two strains being genetically related. Conclusions: These results highlight the need to consider the investigation of NTM in patients with suspected active tuberculosis who present with positive cultures, as well as to evaluate the genetic diversity of M. avium strains.

RESUMO Objetivo: As micobactérias não tuberculosas (MNT) são um grupo heterogêneo de bactérias amplamente distribuídas na natureza e relacionadas com infecções oportunistas em seres humanos. Os objetivos deste estudo foram identificar MNT em pacientes com suspeita de tuberculose e culturas positivas e avaliar a diversidade genética de cepas identificadas como Mycobacterium avium. Métodos: Foram estudadas amostras pulmonares e extrapulmonares provenientes de 1.248 pacientes. As amostras que apresentaram resultado positivo em cultura e negativo para o complexo M. tuberculosis na identificação molecular foram avaliadas por meio da detecção dos genes hsp65 e rpoB e de sequenciamento de fragmentos conservados desses genes. Todas as cepas identificadas como M. avium foram genotipadas pelo método mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem-repeat com oito loci. Resultados: Das 332 micobactérias isoladas, 25 (7,5%) eram MNT. Dessas 25, 18 (72%) eram M. avium, 5 (20%) eram M. abscessus, 1 (4%) era M. gastri e 1 (4%) era M. kansasii. As 18 cepas de M. avium apresentaram alta diversidade, e apenas duas eram geneticamente relacionadas. Conclusões: Esses resultados mostram a necessidade de considerar a investigação de MNT em pacientes com suspeita de tuberculose ativa e culturas positivas e de avaliar a diversidade genética de cepas de M. avium.

El costo de la belleza: Comunicación de seis casos clínicos con infección por micobacterias atípicas secundario a inyecciones intradérmicas y reacción a un dermoimplante de origen desconocido / The cost of beauty: six cosmetological clinical cases due to atypical mycobacterial infection secondary to intradermal injections plus reaction to foreign dermal implant

Resumen Comunicamos seis casos de mujeres quienes, tras la aplicación mediante mesoterapia con plasma rico en plaquetas, así como de un material de relleno intradérmico de origen desconocido, desarrollaron una infección en los sitios de inyección asociada a Mycobacterium massiliense, así como granulomas con reacción a cuerpo extraño. Aunque los cultivos fueron negativos, se logró la identificación del microorganismo por extracción de ADN de tejidos blandos obtenido por biopsia y posterior secuenciación del producto obtenido. Debido a la gran similitud en los cultivos de M. massiliense con la especie relacionada Mycobacterium abscessus, y a que tienen diferente respuesta terapéutica, las técnicas moleculares de diagnóstico son una opción real a considerar para administrar en forma precoz el tratamiento específico contra el patógeno y evitar la progresión de la infección.

We report six cases of female patients who, after the application by mesotherapy with platelet-rich plasma, as well as of an intradermal filler material of unknown origin, developed infection at the injection sites associated to Mycobacterium massiliense, as well as granuloma with reaction to foreign body. Although the cultures were negative, the identification of the microorganism was achieved by extraction of soft tissue DNA obtained by biopsy and sequencing the obtained product, with which the therapy was redirected against the particular species. Due to the great similarity in the culture between M. massiliense with the related species M. abscessus, to the required time for its growth, and to the different therapeutic response of each strain, molecular diagnostic techniques are a real option to consider to administer in an early way the appropriate treatment against the pathogen and prevent infection progression.

Diversidad de especies de micobacterias no tuberculosas aisladas en ambientes acuáticos de la ciudad de General Pico, La Pampa, Argentina / Species diversity of non-tuberculous mycobacteria isolated from aquatic environments of General Pico city, Province of La Pampa (Argentina)

Las micobacterias no tuberculosas (MNT) no solo se estudian por su importancia como patógenos oportunistas, sino también por sus aplicaciones en biotecnología y biorremediación. Nuestro objetivo fue determinar la presencia de micobacterias en los distintos hábitats acuáticos de la ciudad de General Pico (provincia de La Pampa), así como su diversidad. Los porcentajes de muestras positivas a micobacterias fueron los siguientes: 37,5% en el sistema de distribución de agua de red, 32,6% en el acuífero que abastece dicho sistema, 36,8% en el agua proveniente de las precipitaciones, 53,1% en los humedales del área de influencia, 80% en los natatorios cubiertos y 33,3% en las fuentes decorativas ubicadas en plazas públicas. De los 90 aislamientos de MNT obtenidos el 8,9% no logró ser identificado a nivel de especie con los métodos utilizados, que incluyeron pruebas fenotípicas y métodos moleculares. Las especies más frecuentemente aisladas fueron Mycobacterium fortuitum y Mycobacterium gordonae. Algunas especies identificadas han sido reportadas en casos de micobacteriosis en nuestro país, entre ellas M. fortuitum, M. gordonae, M. intracellulare, M. vaccae, M. lentiflavum y M. nonchromogenicum. No se aislaron MNT en muestras de agua de red con concentraciones de cloro activo residual mayores de 0,8mg/l, mientras que en los natatorios la presencia de hasta 1,5mg/l de cloro activo residual no fue una limitante para la proliferación de estos microorganismos. Se puede considerar que la incidencia de micobacterias en los ambientes acuáticos de General Pico es cercana al 35%, y que la presencia de estos microorganismos y su diversidad se ve afectada por el contacto con el hombre y sus actividades, como así también por la existencia de vida animal.

Non-tuberculous mycobacteria (NTM) are studied not only for their importance as emerging opportunistic pathogens but also for their applications in biotechnology and bioremediation. Our aim was to determine the occurrence and diversity of mycobacteria in different aquatic habitats of General Pico city, Province of La Pampa. The percentage of samples with positive cultures for mycobacteria were the following: 37.5% recovered from the water supply distribution system; 32.6% from the aquifer that supplies water to the distribution system; 36.8% from rain water; 53.1% from the two wetlands in the area of influence; 80% from indoor swimming pools; and 33.3% from water fountains in downtown public squares. Of the 90 NTM isolates, 8.9% could not be identified at the species level with any of the used methods, phenotypic tests and molecular methods. Mycobacterium fortuitum and Mycobacterium gordonae were the most frequently isolated species. Some of the identified species such as, M. fortuitum, M. gordonae, M. intracellulare, M. vaccae, M. lentiflavum and M. nonchromogenicum, have been reported in cases of mycobacteriosis in Argentina. Mycobacteria with values higher than 0.8mg/ml of residual active chlorine were not recovered from the drinking water supply network, whereas in the swimming pools the presence of up to 1.5 mg/l was not a constraint. Based on our results, the presence of mycobacteria in aquatic environments is close to 35% and their occurrence and diversity is affected both by contact with man and his activities as well as by the existence of animal life.