RESUMEN
Background and objectives: bacteremia is defined from the presence of bacteria in the bloodstream. Its clinical importance is associated with the high morbidity and mortality rate in the world. In severe cases, it can culminate in sepsis, with a constant increase in cases in Brazil. Therefore, this study aims to assess the main bacterial isolates in blood cultures and a possible change in their sensitivity profiles in a clinical analysis laboratory in Fortaleza, Ceará. Methods: an epidemiological, descriptive, retrospective study was carried out, with a quantitative approach of positive blood cultures, seeking to assess the main isolated microorganisms and their sensitivity profiles. The data used were obtained from the laboratory system through the EpiCenterâ software, from January 2019 to December 2020. Statistical analysis was performed using the Graphpad 7.0 software. Results: 840 microorganisms were identified from blood cultures, and the main ones were E. coli, K. pneumoniae, P. aeruginosa, S. epidermidis, S. aureus and S. haemolyticus. Some isolates show a change in the sensitivity profile, such as K. pneumoniae and P. aeruginosa, showing an increase in sensitivity to carbapenems and cephalosporins, while S. epidermidis showed a decrease in sensitivity to minocycline in the comparison between years 2019 and 2020.Conclusion: clinical isolates from blood cultures showed a change in the sensitivity profile between 2019 and 2020, taking into account that, for K. pneumoniae, P. aeruginosa, this change resulted in an increase in sensitivity, with an increase in resistance in S. epidermidis isolates.(AU)
Justificativa e objetivos: bacteremia é definida a partir da presença de bactérias na corrente sanguínea. Sua importância clínica está associada à alta taxa de morbidade e mortalidade no mundo. Nos casos graves, pode culminar em sepse, com constante aumento dos casos no Brasil. Portanto, o presente estudo tem como objetivo avaliar os principais isolados bacterianos em hemoculturas e uma possível alteração nos seus perfis de sensibilidade em um laboratório de análises clínicas de Fortaleza, Ceará. Métodos: foi realizado um estudo epidemiológico, descritivo, retrospectivo, com abordagem quantitativa de hemoculturas positivas, buscando avaliar os principais microrganismos isolados e seus perfis de sensibilidades. Os dados utilizados foram obtidos a partir do sistema laboratorial através do software EpiCenterâ, referente ao período de janeiro de 2019 a dezembro de 2020. A análise estatística foi realizada pelo software Graphpad 7.0. Resultados: foram identificados 840 microrganismos a partir das hemoculturas, sendo os principais E. coli, K. pneumoniae, P. aeruginosa, S. epidermidis, S. aureus e S. haemolyticus. Alguns isolados apresentam uma alteração no perfil de sensibilidade, como K. pneumoniae e P. aeruginosa, apresentando um aumento na sensibilidade frente aos carbapenêmicos e as cefalosporinas, enquanto o S. epidermidis apresentou uma diminuição na sensibilidade frente à minociclina na comparação entre os anos de 2019 e 2020. Conclusão: os isolados clínicos de hemocultura apresentaram uma alteração no perfil de sensibilidade entre 2019 e 2020, levando em consideração que, para K. pneumoniae e P. aeruginosa, essa alteração resultou no aumento na sensibilidade, com aumento na resistência nos isolados de S. epidermidis.(AU)
Justificación y objetivos: la bacteriemia se define por la presencia de bacterias en el torrente sanguíneo. Su importancia clínica está asociada con la alta tasa de morbimortalidad en el mundo. En casos severos, puede culminar en sepsis, con un aumento constante de casos en Brasil. Por tanto, este estudio tiene como objetivo evaluar los principales aislados bacterianos en hemocultivos y un posible cambio en sus perfiles de sensibilidad en un laboratorio de análisis clínicos en Fortaleza, Ceará. Métodos: se realizó un estudio epidemiológico, descriptivo, retrospectivo, con abordaje cuantitativo de hemocultivos positivos, buscando evaluar los principales microorganismos aislados y sus perfiles de sensibilidad. Los datos utilizados se obtuvieron del sistema de laboratorio a través del software EpiCenterâ, para el período de enero de 2019 a diciembre de 2020. El análisis estadístico se realizó mediante el software Graphpad 7.0. Resultados: se identificaron 840 microorganismos a partir de hemocultivos, siendo los principales E. coli, K. pneumoniae, P. aeruginosa, S. epidermidis, S. aureus y S. haemolyticus. Algunos aislados muestran un cambio en el perfil de sensibilidad, como K.pneumoniae y P. aeruginosa, mostrando un aumento en la sensibilidad a los carbapenémicos y cefalosporinas, mientras que S. epidermidis mostró una disminución en la sensibilidad a la minociclina, en la comparación entre los años de 2019 y 2020. Conclusiones: los aislados clínicos de hemocultivos mostraron un cambio en el perfil de sensibilidad entre 2019 y 2020, teniendo en cuenta que para K. pneumoniae, P. aeruginosa, este cambio resultó en un aumento de la sensibilidad, con un aumento de la resistencia en los aislados de S. epidermidis
Asunto(s)
Humanos , Bacteriemia , Técnicas de Laboratorio Clínico , Cultivo de Sangre , Sensibilidad y Especificidad , Farmacorresistencia BacterianaRESUMEN
Streptococcus pneumoniae sigue siendo una de las causas más importantes de morbilidad y mortalidad en niños y adultos alrededor del mundo. El objetivo del estudio fue describir la frecuencia de aislamiento de S. pneumoniae en enfermedad invasiva, distribución de serotipos y sensibilidad antimicrobiana en Paraguay (2010-2018). Se estudiaron 793 cepas de S. pneumoniae aisladas de pacientes de todas las edades con enfermedad invasiva en Paraguay, provenientes de los diferentes centros centinelas y colaboradores en el marco de la vigilancia de meningitis y neumonías, durante el periodo 2010-2018. La frecuencia general según diagnóstico resultó 74.9% de neumonías (n=594), 18.4% de meningitis (n=146) y 6.7% de sepsis (n=53). El serotipo 14 fue más frecuente con 174 aislamientos (22.0%), seguido del serotipo 19A con 84 aislamientos (10.6%), el serotipo 3 con 66 aislamientos (8.3%) y el 6A con 37 aislamientos (4.7%). En meningitis se registró una frecuencia general de resistencia a penicilina del 32,2% y de ceftriaxona del 1,4%. En los casos de no meningitis la resistencia a penicilina fue del 0,8% y ceftriaxona del 0,3%. Los resultados de serotipos y sensibilidad antimicrobiana proporcionarán información necesaria para la implementación de estrategias de prevención y tratamiento de la enfermedad neumocócica en nuestro país, por lo que es necesaria una vigilancia continua para evaluar la carga de enfermedad, los serotipos circulantes y el aumento de la resistencia a los antibióticos
Streptococcus pneumoniae remains one of the most important causes of morbidity and mortality in children and adults worldwide. The objective of the study was to describe the frequency of isolation of S. pneumoniae in invasive disease, serotype distribution and antimicrobial susceptibility in Paraguay (2010-2018). We studied 793 strains of S. pneumoniae isolated from patients of all ages with invasive disease in Paraguay, from different sentinel centers and collaborators in the framework of meningitis and pneumonia surveillance during the period 2010-2018. The general frequency according to diagnosis was 74.9% of pneumonia (n = 594), 18.4% of meningitis (n = 146) and 6.7% of sepsis (n = 53). Serotype 14 was more frequent with 174 isolates (22.0%), followed by serotype 19A with 84 isolates (10.6%), serotype 3 with 66 isolates (8.3%) and 6A with 37 isolates (4.70%). In meningitis, there was a general frequency of penicillin resistance of 32.2% and ceftriaxone of 1.4%. In cases of non-meningitis, penicillin resistance was 0.8% and ceftriaxone 0.3%. The results of serotypes and antimicrobial sensitivity will provide necessary information for the implementation of prevention strategies and treatment of pneumococcal disease in our country, therefore it is necessary to continue monitoring in order to assess the burden of the disease, circulating serotypes and increased antibiotic resistance
Asunto(s)
Humanos , Masculino , Femenino , Neumonía Neumocócica , Streptococcus pneumoniae , Meningitis NeumocócicaRESUMEN
Introducción: El uso inapropiado de los antimicrobianos está conduciendo a la disminución de la sensibilidad antimicrobiana de microorganismos que producen enfermedades infecciosas. El uso clínico de los antimicrobianos ha sido paralelo al surgimiento de bacterias resistentes a su acción. Materiales y Métodos: Se realizó un estudio observacional, descriptivo, retrospectivo de corte transversal, con muestreo no probabilístico de casos consecutivos. La selección de antibióticos incluyó solo aquellos que tienen actividad frente a bacilos gram negativos y para la interpretación de los diámetros de los halos de inhibición se tomaron en cuenta los estándares de la Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI versión 2015). Resultados: La ampicilina presentó una resistencia del 100%, en cambio la ciprofloxacina presentó una sensibilidad del 73%, la amikacina del 100% y la gentamicina del 82%. La familia de los carbapenemicos presentó una sensibilidad del 100%. Dentro del grupo de los nitrofuranos se constató una sensibilidad del 96%. El trimetoprim/ sulfametoxazol, presentó una sensibilidad del 57%. Se determinó la presencia de Beta Lactamasa de Espectro Extendido (BLEE) en 13% de las cepas de Escherichia coli estudiadas. Conclusiones: La gentamicina, la nitrofurantoína y los carbapenemes presentaron una elevada sensibilidad, por lo que en presencia de cepas con BLEE serían opciones factibles acompañados siempre de la evaluación del perfil renal y clasificando la ITU como complicada o no.
Introduction: The inappropriate use of antimicrobials is leading to a decrease in the antimicrobial sensitivity of microorganisms that cause infectious diseases. The clinical use of antimicrobials has been parallel to the emergence of bacteria resistant to its action. Materials and methods: The sensitivity profile of Escherichia coli isolated from patients with urinary tract infections (UTI) concurrent to the Regional Hospital of Villarrica in the period from 2013 to 2015 was determined. Results: Ampicillin showed a resistance of 100%, ciprofloxacin showed a sensitivity of 73%. Amikacin showed a sensitivity of 100% and gentamicin 82%. The family of carbapenem showed a sensitivity of 100%. Within the group of nitrofurans a sensitivity of 96% was found. Trimethoprim / sulfamethoxazole had a sensitivity of 57%. The presence of Extended Spectrum Beta Lactamase (ESBL) was determined in 13% of the strains of Escherichia coli studied. Conclusions: Gentamicin, nitrofurantoin and carbapenem have a high sensitivity, so in the presence of strains with ESBL they would be feasible options always accompanied by the evaluation of the renal profile and classifying the UTI as complicated or not.
RESUMEN
En los últimos años, debido a la alta demanda de los productos adicionados con probióticos y los múltiples beneficios nutricionales y terapéuticos asociados, la investigación sobre estos microorganismos ha progresado considerablemente, se han realizado avances notables en su selección y caracterización. De manera general, diversas entidades como la Organización Mundial de la Salud (OMS) y la Organización de las Naciones Unidas para la agricultura y la alimentación (FAO) recomiendan que se declare en la etiqueta del producto, tanto la especie como la cantidad de microorganismos probióticos viables presentes. En este trabajo se analizaron seis productos adicionados con probióticos, con el fin de evaluar su concentración a lo largo de la vida útil del producto, se identificaron las cepas aisladas para corroborar la información declarada en la etiqueta y se determinó su perfil de susceptibilidad a antibióticos. Como resultado del análisis se encontró que las cepas adicionadas a los productos evaluados se mantienen en concentraciones aceptables durante los 28 días de vida útil de los productos. La identificación de las cepas aisladas no coincidió, en varios casos, con la estipulada por la etiqueta, no obstante, el método utilizado se basa en la capacidad de fermentar carbohidratos y no en pruebas genotípicas. Con respecto a los perfiles de susceptibilidad encontrados para las cepas analizadas, son necesarios estudios adicionales que establezcan la naturaleza intrínseca o adquirida de los determinantes de resistencia, y que evidencien si estos están codificados en elementos transferibles entre bacterias.
In the last years, due to the high demand of food products supplemented with probiotics and the multiple nutritional and therapeutic benefits associated with them, research on these microorganisms has advanced considerably, including their selection and characterization. As a general recommendation, several entities as World Health Organization (WHO) and United Nations Organization for Agriculture and Food recommend that the specification of the alive species contained and their number shall appear in the label of the product. In the present study, six different commercially available products, supplemented with probiotics were analyzed, in order to evaluate the concentration of microorganisms through the shelf life of the product, identify the strains isolated and determine the antibiotic susceptibility pattern of these. Results demonstrated that the strains isolated kept acceptable concentrations during the 28 days of storage. Nevertheless, the identification of these strains variated from the one reported on the label on several of the products tested. This can be due to the commercial method used for the identifications, which is based in the carbohydrate fermentation pattern and not in genotypic trials. The antimicrobials susceptibility patterns found show that further research shall be performed in order to establish the intrinsic or acquired nature of the resistance determinants, and if these are codified by transferable elements among bacteria.